Молекула клеточной адгезии 1

CADM1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	3BIN, 4H5S
Идентификаторы
Псевдонимы	CADM1 , BL2, IGSF4, IGSF4A, NECL2, NECL-2, RA175, ST17, SYNCAM, TSLC1, STSLC-1, SGIGSF, SYNCAM1, молекула клеточной адгезии 1
Внешние идентификаторы	Омим : 605686 ; MGI : 1889272 ; Гомологен : 8641 ; GeneCards : CADM1 ; OMA : CADM1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	115,504,957 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	47,858,115 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	paraflocculus of cerebellum; ; pons; ; periodontal fiber; ; Achilles tendon; ; caput epididymis; ; corpus callosum; ; visceral pleura; ; islet of Langerhans; ; spinal ganglia; ; beta cell;
	Top expressed in
	epithelium of lens; ; otic placode; ; ciliary body; ; subiculum; ; otic vesicle; ; iris; ; CA3 field; ; saccule; ; neural layer of retina; ; amygdala;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	PDZ domain binding; protein homodimerization activity; protein binding; signaling receptor binding; cell adhesion molecule binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; cell-cell junction; synapse; integral component of plasma membrane; cell junction; basolateral plasma membrane; plasma membrane;
Biological process	cell differentiation; heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; activated T cell proliferation; immune system process; multicellular organism development; cell adhesion; spermatogenesis; adherens junction organization; T cell mediated cytotoxicity; homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; apoptotic process; susceptibility to natural killer cell mediated cytotoxicity; positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity; detection of stimulus; cell recognition; viral process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	23705
	54725
	ENSG00000182985
	Ensmusg00000032076
	Q9by67
	Q8R5M8
	NM_001098517 ; NM_001301043 ; NM_001301044 ; NM_001301045 ; NM_014333
	NM_001025600 ; NM_018770 ; NM_207675 ; NM_207676 ; NM_001310841
	NP_001091987 ; NP_001287972 ; NP_001287973 ; NP_001287974 ; NP_055148
	NP_001020771 ; NP_00129770 ; NP_061240 ; NP_997558 ; NP_997559
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Молекула 1 клеточной адгезии 1 - это белок , который у людей кодируется CADM1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что молекула клеточной адгезии 1 взаимодействует с EPB41L3 . ^{[ 7 ]}

Ассоциационные исследования

Исследования ассоциации по всему геному выявили связь между индексом массы тела и двумя локусами вблизи гена CADM1 и CADM2 . ^{[ 8 ]} Экспериментальные результаты другого исследования показали, что мыши с ожирением имели чрезмерную экспрессию генов CADM1 и CADM2 , и что потеря CADM1 защищенных мышей от ожирения, способствуя негативному энергетическому балансу и потерь веса. ^{[ 9 ]} Кроме того, исследование GWAS 2019 года выявило связь между нервной анорексией и CADM1 . ^{[ 10 ]} В мозге эти гены опосредуют синаптическую сборку, а мутации в CADM1 также связаны с расстройством аутистического спектра . ^{[ 11 ]}

Смотрите также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000182985 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000032076 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Gomyo H, Arai Y, Tanigami Y, Hattori M, Sisoda F, Arai K, Aikiwa Y, Tsuda H, Hirohashi S, Asawa S, Shimizu N, Soeda E, Sakaki Y, Ohki M (февраль 2000 г.). «Контигская карта, готовая к последовательности, и новая суперсемейство иммуноглобулина суперсемейства IGSF4 в области LOH хромосомы 11q23. Геномика 62 (2): 139–4 Doi : 10.1006/geno.1999.6001 . PMID 10610705
^ «Ген Entrez: молекула адгезии клеток CADM1 1» .
^ , Мика; Ягета Res .
^ Speliotes EK, Willer CJ, Berndt SI, Monda KL, Thorleifsson G, Jackson AU, et al. (Ноябрь 2010). «Анализ ассоциации 249 796 человек выявляет 18 новых локусов, связанных с индексом массы тела» . Природа генетика . 42 (11): 937–48. doi : 10.1038/ng.686 . PMC 3014648 . PMID 20935630 .
^ Rathjen T, Yan X, Kononenko NL, Ku MC, Song K, Ferrarese L, et al. (Август 2017). «Регуляция массы тела и гомеостаза энергии с помощью молекулы 1 -клеточной адгезии нейрональных клеток» . Nature Neuroscience . 20 (8): 1096–1103. doi : 10.1038/nn.4590 . PMC 5533218 . PMID 28628102 .
^ Watson HJ, Yilmaz Z, Thornton LM, Hübel C, Coleman JR, Gaspar HA, et al. (Август 2019). «Исследование ассоциации по всему геному идентифицирует восемь локусов риска и включает в себя метабопсихиатрическое происхождение для нервной анорексии» . Природа генетика . 51 (8): 1207–1214. doi : 10.1038/s41588-019-0439-2 . PMC 6779477 . PMID 31308545 .
^ Fujita E, Tanabe Y, Imhof Ba, Momoi My, Momoi T (декабрь 2012 г.). «Комплекс синаптической молекулы адгезии CADM1, молекула, связанная с расстройством аутистического спектра, с MUPP1 в мозжечке» . J Нейрохим . 123 (5): 886–94. doi : 10.1111/jnc.12022 . PMID 22994563 .

Дальнейшее чтение

Watabe K, Ito A, Koma Yi, Kitamura Y (2004). «IGSF4: новая межклеточная молекула адгезии, которая называется тремя именами: TSLC1, Sgigsf и Syncam, в силу своей разнообразной функции». Гистол Гистопатол . 18 (4): 1321–9. PMID 12973698 .
Kuramochi M, Fukuhara H, Nobukuni T, et al. (2001). «TSLC1 является геном опухоли-супрессора при немелкоклеточном раке легких человека» (PDF) . НАТ Генет . 27 (4): 427–30. doi : 10.1038/86934 . HDL : 2241/1028 . PMID 11279526 . S2CID 9773234 .
Масуда М., Ягета М., Фукухара Х. и др. (2002). «Белок-супрессор опухоли TSLC1 участвует в клеточной адгезии» . Дж. Биол. Химический 277 (34): 31014–9. doi : 10.1074/jbc.m203620200 . PMID 12050160 .
Fukuhara H, Kuramochi M, Fukami T, et al. (2003). «Метилирование промотора TSLC1 и подавление опухоли своим геном продуктом при раке простаты человека» . JPN. J. Cancer Res . 93 (6): 605–9. doi : 10.1111/j.1349-7006.2002.tb01297.x . PMC 5927049 . PMID 12079507 .
Allinen M, Peri L, Kujala S, et al. (2002). «Анализ 11q21-24 Потеря генов гетерозиготности кандидатов-мишеней при раке молочной железы: показания гиперметилирования промотора TSLC1». Гены хромосомы рак . 34 (4): 384–9. doi : 10.1002/gcc.10079 . PMID 12112527 . S2CID 396701 .
Бидерер Т., Сара Ю., Мозайева М. и др. (2002). «Syncam, молекула синаптической адгезии, которая стимулирует сборку синапса». Наука . 297 (5586): 1525–31. Bibcode : 2002sci ... 297.1525b . doi : 10.1126/science.1072356 . PMID 12202822 . S2CID 14529914 .
Ягета М., Курамочи М., Масуда М. и др. (2002). «Прямая ассоциация TSLC1 и DAL-1, два различных белка-супрессора опухоли при раке легких». Рак . 62 (18): 5129–33. PMID 12234973 .
Янсен М., Фукусима Н., Рости С. и соавт. (2003). «Аберрантное метилирование 5-дюймового острова CPG TSLC1 распространено при аденокарциноме протоков поджелудочной железы и первым проявляется в высококлассных панлерах» . Рак биол. Существующий 1 (3): 293–6. doi : 10.4161/cbt.84 . PMID 12432281 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Генерация и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002pnas ... 9916899m . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Honda T, Tamura G, Waki T, et al. (2003). «Гиперметилирование промотора гена TSLC1 при первичном раке желудка и клеточных линиях желудка» . JPN. J. Cancer Res . 93 (8): 857–60. doi : 10.1111/j.1349-7006.2002.tb01329.x . PMC 5927103 . PMID 12716461 .
Shingai T, Ikeda W, Kakunaga S, et al. (2003). «Последствия нектин-подобного молекулу-2/IGSF4/RA175/SGIGSF/TSLC1/SYNCAM1 в клеточной адгезии и локализации трансмембранного белка в эпителиальных клетках » Дж. Биол. Химический 278 (37): 35421–7 Doi : 10.1074/ jbc.m305387200 12826663PMID
Ito A, Okada M, Uchino K, et al. (2003). «Экспрессия молекулы адгезии TSLC1 в легочном эпителии и его подавляющая регуляция при легочной аденокарциноме, отличной от бронхиолвеолярной карциномы» . Лаборатория Инвестировать 83 (8): 1175–83. doi : 10.1097/01.lab.0000081391.28136.80 . PMID 12920246 .
Фуками Т., Фукухара Х., Курамочи М. и др. (2003). «Промоторное метилирование гена TSLC1 в усовершенствованных опухолях легких и различных раковых клеточных линиях» . Инт. Дж. Рак . 107 (1): 53–9. doi : 10.1002/ijc.11348 . PMID 12925956 . S2CID 26363429 .
Uchino K, Ito A, Wakayama T, et al. (2003). «Клиническое значение и прогностическая значимость гена TSLC1 -супрессора опухоли, обнаруженного при аденокарциноме легких» . Рак . 98 (5): 1002–7. doi : 10.1002/cncr.11599 . PMID 12942568 . S2CID 35242800 .
Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). «Секретированная инициатива по обнаружению белка (SPDI), крупномасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики» . Геном Res . 13 (10): 2265–70. doi : 10.1101/gr.1293003 . PMC 403697 . PMID 12975309 .
Fukuhara H, Masuda M, Yageta M, et al. (2003). «Ассоциация супрессора опухоли легких TSLC1 с MPP3, человеческим гомологом Dlg Dlg Dlg Dlg Dlg Dlg» . Онкоген . 22 (40): 6160–5. doi : 10.1038/sj.onc.1206744 . PMID 13679854 .
Ito T, Shimada Y, Hashimoto Y, et al. (2003). «Участие TSLC1 в прогрессировании плоскоклеточного рака пищевода». Рак . 63 (19): 6320–6. PMID 14559819 .
Mao X, Seidlitz E, Ghosh K, et al. (2004). «Цитоплазматический домен является критическим для активности супрессора опухоли TSLC1 при немелкоклеточном раке легких». Рак . 63 (22): 7979–85. PMID 14633730 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000182985 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000032076 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid10610705-5] Gomyo H, Arai Y, Tanigami Y, Hattori M, Sisoda F, Arai K, Aikiwa Y, Tsuda H, Hirohashi S, Asawa S, Shimizu N, Soeda E, Sakaki Y, Ohki M (февраль 2000 г.). «Контигская карта, готовая к последовательности, и новая суперсемейство иммуноглобулина суперсемейства IGSF4 в области LOH хромосомы 11q23. Геномика 62 (2): 139–4 Doi : 10.1006/geno.1999.6001 . PMID 10610705

[entrez-6] «Ген Entrez: молекула адгезии клеток CADM1 1» .

[pmid12234973-7] , Мика; Ягета Res .

[Speliotes-8] Speliotes EK, Willer CJ, Berndt SI, Monda KL, Thorleifsson G, Jackson AU, et al. (Ноябрь 2010). «Анализ ассоциации 249 796 человек выявляет 18 новых локусов, связанных с индексом массы тела» . Природа генетика . 42 (11): 937–48. doi : 10.1038/ng.686 . PMC 3014648 . PMID 20935630 .

[Rethjen-9] Rathjen T, Yan X, Kononenko NL, Ku MC, Song K, Ferrarese L, et al. (Август 2017). «Регуляция массы тела и гомеостаза энергии с помощью молекулы 1 -клеточной адгезии нейрональных клеток» . Nature Neuroscience . 20 (8): 1096–1103. doi : 10.1038/nn.4590 . PMC 5533218 . PMID 28628102 .

[WatsonYilmaz2019-10] Watson HJ, Yilmaz Z, Thornton LM, Hübel C, Coleman JR, Gaspar HA, et al. (Август 2019). «Исследование ассоциации по всему геному идентифицирует восемь локусов риска и включает в себя метабопсихиатрическое происхождение для нервной анорексии» . Природа генетика . 51 (8): 1207–1214. doi : 10.1038/s41588-019-0439-2 . PMC 6779477 . PMID 31308545 .

[Fujita-11] Fujita E, Tanabe Y, Imhof Ba, Momoi My, Momoi T (декабрь 2012 г.). «Комплекс синаптической молекулы адгезии CADM1, молекула, связанная с расстройством аутистического спектра, с MUPP1 в мозжечке» . J Нейрохим . 123 (5): 886–94. doi : 10.1111/jnc.12022 . PMID 22994563 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]