S100 белок

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1yutB:9-52 1yuuA:9-52 1yusB:9-52 1yurA:9-52 1k8uA:5-50 1k9pA:5-50 1k96A:5-50 1k9kA:5-50 1cnpB:5-50 1a03A:5-50 2cnpB:5-50 1jwdB:5-50 1m31A:5-48 1k2hB:5-48 1cfpB:4-47 1psbA:4-47 1mho :4-47 1uwoA:4-47 1mq1B:4-47 1b4cB:4-47 1symA:4-47 1qlkB:4-47 1xydB:4-47 1dt7B:4-47 1mwnA:4-47 1j55A:4-47 1ozoA:4-47 1ksoA:5-48 1irjH:8-51 1xk4K:8-51 1gqmI:4-47 1odbD:4-47 1e8aB:4-47 1clb :5-46 1ig5A:5-46 2bca :5-46 1qx2B:5-46 1bod :5-46 1b1gA:5-46 1kcyA:5-46 1ht9A:5-46 2bcb :5-46 1n65A:5-46 1boc :5-46 3icb :5-46 1kqvA:5-46 1ksmA:5-46 1cdn :5-46 4icb :5-46 1igvA:5-46 1d1oA:5-46 1cb1 :4-46 1a4pB:5-45 1bt6A:5-45 1nshB:7-50 1v4zA:10-19 1v50A:10-19 1qlsA:8-51 1mr8B:5-48 1psrB:6-46 2psr :6-46 3psrA:6-46

Кальций-связывающий домен типа S100/ICaBP
Кальций-связывающий домен типа S100/ICaBP
	Структура белка S100B. На основе PyMOL-рендеринга PDB 1b4c.
Идентификаторы
Символ	S_100
Пфам	PF01023
ИнтерПро	ИПР013787
PROSITE	PDOC00275
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1cnp / SCOPe / СУПФАМ
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary
PDB	1yutB:9-52 1yuuA:9-52 1yusB:9-52 1yurA:9-52 1k8uA:5-50 1k9pA:5-50 1k96A:5-50 1k9kA:5-50 1cnpB:5-50 1a03A:5-50 2cnpB:5-50 1jwdB:5-50 1m31A:5-48 1k2hB:5-48 1cfpB:4-47 1psbA:4-47 1mho :4-47 1uwoA:4-47 1mq1B:4-47 1b4cB:4-47 1symA:4-47 1qlkB:4-47 1xydB:4-47 1dt7B:4-47 1mwnA:4-47 1j55A:4-47 1ozoA:4-47 1ksoA:5-48 1irjH:8-51 1xk4K:8-51 1gqmI:4-47 1odbD:4-47 1e8aB:4-47 1clb :5-46 1ig5A:5-46 2bca :5-46 1qx2B:5-46 1bod :5-46 1b1gA:5-46 1kcyA:5-46 1ht9A:5-46 2bcb :5-46 1n65A:5-46 1boc :5-46 3icb :5-46 1kqvA:5-46 1ksmA:5-46 1cdn :5-46 4icb :5-46 1igvA:5-46 1d1oA:5-46 1cb1 :4-46 1a4pB:5-45 1bt6A:5-45 1nshB:7-50 1v4zA:10-19 1v50A:10-19 1qlsA:8-51 1mr8B:5-48 1psrB:6-46 2psr :6-46 3psrA:6-46

Белки S100 представляют собой семейство низкомолекулярных белков, обнаруженных у позвоночных, характеризующихся двумя сайтами связывания кальция , имеющими конформацию спираль-петля-спираль (« EF-рука -тип»). Известен по меньшей мере 21 различный белок S100. ^{[ 1 ]} Они кодируются семейством генов , символы которых используют префикс S100 , например, S100A1 , S100A2 , S100A3 . Их также считают молекулами молекулярного паттерна, связанными с повреждением (DAMP), а нокдаун арильного углеводородного рецептора подавляет экспрессию белков S100 в клетках THP-1. ^{[ 2 ]}

Структура

Большинство белков S100 состоят из двух идентичных полипептидов (гомодимерных), скрепленных нековалентными связями. Структурно они сходны с кальмодулином . Однако они отличаются от кальмодулина и другими особенностями. Например, характер их экспрессии специфичен для клеток, т.е. они экспрессируются в определенных типах клеток. Их выраженность зависит от факторов окружающей среды. Напротив, кальмодулин является вездесущим и универсальным внутриклеточным кальцием. ²⁺ Рецептор широко экспрессируется во многих клетках.

Нормальная функция

Белки S100 обычно присутствуют в клетках нервного гребня ( шванновские клетки и меланоциты ), хондроцитах , адипоцитах , миоэпителиальных клетках , макрофагах , клетках Лангерганса , ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} дендритные клетки , ^{[ 5 ]} и кератиноциты . Они могут присутствовать в некоторых молочной железы эпителиальных клетках .

Белки S100 участвуют во множестве внутриклеточных и внеклеточных функций. ^{[ 6 ]} такие как регуляция фосфорилирования белков, факторы транскрипции, Ca ²⁺ гомеостаз, динамика компонентов цитоскелета, активность ферментов, рост и дифференцировка клеток, а также воспалительная реакция. Было обнаружено, что S100A7 (псориазин) и S100A15 действуют как цитокины при воспалении, особенно при аутоиммунных заболеваниях кожи, таких как псориаз. ^{[ 7 ]}

Патология

Некоторые члены семейства белков S100 полезны в качестве маркеров определенных опухолей и эпидермальной дифференцировки. Их можно обнаружить в меланомах . ^{[ 8 ]} 100% шванном , 100% нейрофибром (более слабых, чем шванномы), 50% злокачественных опухолей оболочек периферических нервов (могут быть слабыми и/или очаговыми), стромально-клеточные параганглиомы, гистиоцитомы и светлоклеточные саркомы . Кроме того, белки S100 являются маркерами воспалительных заболеваний, могут опосредовать воспаление и действовать как противомикробные средства. ^{[ 9 ]} Белки S100 использовались в лаборатории в качестве клеточных маркеров анатомической патологии .

Человеческие гены

S100A1 , S100A2 , S100A3 , S100A4 , S100A5 , S100A6 , S100A7 (псориазин), S100A7A (кебнеризин), S100A8 ( кальгранулин А), S100A9 (кальгранулин B), S100A10 , S100A11 , S100A12 (кальгранулин С), S100A13 , S100A14 , S100A16
С100Б , С100Г , С100П , ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} С100З ( С100З )
CRNN , FLG , FLG2 , HRNR , RPTN , TCHH , THHL1

Номенклатура

Префикс символа «S100» означает, что эти белки растворимы в 100%, то есть насыщенном, сульфате аммония при нейтральном pH . Символ часто писался через дефис. ^{[ 12 ]} но текущая номенклатура генов и белков , такая как номенклатура Комитета генной номенклатуры HUGO , не использует дефисы в символах.

См. также

Ссылки

^ Маренхольц И., Хейцманн К.В., Фриц Г. (2004). «Белки S100 у мыши и человека: от эволюции к функции и патологии (включая обновление номенклатуры)». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 322 (4): 1111–22. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.096 . ПМИД 15336958 .
^ Мемари Б., Бутье М., Димитров В., Уэллетт М., Бер М.А., Фриц Дж.Х., Уайт Дж.Х. (2015). «Взаимодействие арильного углеводородного рецептора в макрофагах, инфицированных микобактериями туберкулеза, оказывает плейотропное действие на передачу сигналов врожденного иммунитета» . Журнал иммунологии . 195 (9): 4479–91. doi : 10.4049/jimmunol.1501141 . ПМИД 26416282 .
^ Уилсон, Эй Джей; Мэддокс, штат Пенсильвания; Дженкинс, Д. (январь 1991 г.). «Экспрессия антигенов CD1a и S100 в клетках Лангерганса кожи у пациентов с раком молочной железы». Журнал патологии . 163 (1): 25–30. дои : 10.1002/путь.1711630106 . ПМИД 2002421 . S2CID 70911084 .
^ Коппола Д., Фу Л., Никосия С.В., Кунелис С., Джонс М. (1998). «Прогностическое значение белков-положительных клеток Лангерганса p53, bcl-2, виментина и S100 при карциноме эндометрия». Патология человека . 29 (5): 455–62. дои : 10.1016/s0046-8177(98)90060-0 . ПМИД 9596268 .
^ Синдзато М, Шамото М, Хосокава С, Канеко С, Осада А, Симидзу М, Ёсида А (1995). «Дифференциация клеток Лангерганса от встречных клеток с использованием антител к белкам CD1a и S-100». Биотехника и гистохимия . 70 (3): 114–8. дои : 10.3109/10520299509108327 . ПМИД 7548432 .
^ Донато Р. (2003). «Внутриклеточная и внеклеточная роль белков S100» . Микроскопические исследования и техника . 60 (6): 540–51. дои : 10.1002/jemt.10296 . ПМИД 12645002 . S2CID 37798037 .
^ Вольф Р., Ховард О.М., Донг Х.Ф., Воскопулос С., Боэшанс К., Уинстон Дж., Диви Р., Гансиор М., Голдсмит П., Ахвази Б., Чавакис Т., Оппенгейм Дж.Дж., Юспа Ш.Х. (2008). «Хемотаксическая активность S100A7 (псориазина) опосредуется рецептором конечных продуктов гликирования и усиливает воспаление с помощью высоко гомологичного, но функционально отличающегося S100A15» . Журнал иммунологии . 181 (2): 1499–506. дои : 10.4049/jimmunol.181.2.1499 . ПМЦ 2435511 . ПМИД 18606705 .
^ Нонака Д., Чирибога Л., Рубин Б.П. (2008). «Дифференциальная экспрессия подтипов белка S100 при злокачественной меланоме, а также доброкачественных и злокачественных опухолях оболочек периферических нервов». Журнал кожной патологии . 35 (11): 1014–9. дои : 10.1111/j.1600-0560.2007.00953.x . ПМИД 18547346 . S2CID 22907221 .
^ Вольф Р., Ружичка Т., Юспа Ш. (июль 2010 г.). «Новое подсемейство S100A7 (псориазин)/S100A15 (кебнеризин): в высокой степени гомологичны, но различаются по регуляции и функциям» . Аминокислоты . 41 (4): 789–96. дои : 10.1007/s00726-010-0666-4 . ПМК 6410564 . ПМИД 20596736 .
^ Пенумутчу, Шриниваса Р.; Чжоу, Руи-Хван; Ю, Чин (01 августа 2014 г.). «Структурные данные о связанном с кальцием S100P и V-домене комплекса RAGE» . ПЛОС ОДИН . 9 (8): e103947. Бибкод : 2014PLoSO...9j3947P . дои : 10.1371/journal.pone.0103947 . ISSN 1932-6203 . ПМК 4118983 . ПМИД 25084534 .
^ Пенумутчу, Шриниваса Р.; Чжоу, Руи-Хван; Ю, Чин (17 октября 2014 г.). «Взаимодействие S100P с противоаллергическим препаратом кромолином». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 454 (3): 404–409. дои : 10.1016/j.bbrc.2014.10.048 . ISSN 1090-2104 . ПМИД 25450399 .
^ Elsevier , Иллюстрированный медицинский словарь Дорланда , Elsevier.

Дальнейшее чтение

Вольф Р., Воскопулос С.Дж., Фитцджеральд ПК, Голдсмит П., Катаиссон С., Гунсиор М., Уолц М., Ружичка Т., Юспа Ш.Х. (2006). «Мышиный ортолог S100A15 аналогичен геномной организации, структуре, экспрессии генов и характеру обработки белков человеческого подсемейства S100A7/A15 во время эпидермального созревания» . Журнал исследовательской дерматологии . 126 (7): 1600–8. дои : 10.1038/sj.jid.5700210 . ПМИД 16528363 .
Вольф Р., Ховард О.М., Донг Х.Ф., Воскопулос С., Боэшанс К., Уинстон Дж., Диви Р., Гансиор М., Голдсмит П., Ахвази Б., Чавакис Т., Оппенгейм Дж.Дж., Юспа Ш.Х. (2008). «Хемотаксическая активность S100A7 (псориазина) опосредуется рецептором конечных продуктов гликирования и усиливает воспаление с помощью высоко гомологичного, но функционально отличающегося S100A15» . Журнал иммунологии . 181 (2): 1499–506. дои : 10.4049/jimmunol.181.2.1499 . ПМЦ 2435511 . ПМИД 18606705 .
Вольф Р., Воскопулос С., Уинстон Дж., Дхарамси А., Голдсмит П., Гунсиор М., Вондерхаар Б.К., Олсон М., Уотсон П.Х., Юспа Ш.Х. (2009). «Высокомологичные белки hS100A15 и hS100A7 отчетливо экспрессируются в нормальной ткани молочной железы и раке молочной железы» . Раковые письма . 277 (1): 101–7. дои : 10.1016/j.canlet.2008.11.032 . ПМК 2680177 . ПМИД 19136201 .
Вольф Р., Массия Ф, Дхарамси А, Ховард О.М., Катассон С., Блишковски В., Уинстон Дж., Фейгенбаум Л., Лихти У., Ружичка Т., Чавакис Т., Юспа Ш.Х. (2010). «Ген из локуса предрасположенности к псориазу подготавливает кожу к воспалению» . Наука трансляционной медицины . 2 (61): 61ра90. doi : 10.1126/scitranslmed.3001108 . ПМК 6334290 . ПМИД 21148126 .

Внешние ссылки

S100 + Белки Национальной медицинской библиотеки США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[pmid15336958-1] Маренхольц И., Хейцманн К.В., Фриц Г. (2004). «Белки S100 у мыши и человека: от эволюции к функции и патологии (включая обновление номенклатуры)». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 322 (4): 1111–22. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.07.096 . ПМИД 15336958 .

[2] Мемари Б., Бутье М., Димитров В., Уэллетт М., Бер М.А., Фриц Дж.Х., Уайт Дж.Х. (2015). «Взаимодействие арильного углеводородного рецептора в макрофагах, инфицированных микобактериями туберкулеза, оказывает плейотропное действие на передачу сигналов врожденного иммунитета» . Журнал иммунологии . 195 (9): 4479–91. doi : 10.4049/jimmunol.1501141 . ПМИД 26416282 .

[pmid2002421-3] Уилсон, Эй Джей; Мэддокс, штат Пенсильвания; Дженкинс, Д. (январь 1991 г.). «Экспрессия антигенов CD1a и S100 в клетках Лангерганса кожи у пациентов с раком молочной железы». Журнал патологии . 163 (1): 25–30. дои : 10.1002/путь.1711630106 . ПМИД 2002421 . S2CID 70911084 .

[pmid9596268-4] Коппола Д., Фу Л., Никосия С.В., Кунелис С., Джонс М. (1998). «Прогностическое значение белков-положительных клеток Лангерганса p53, bcl-2, виментина и S100 при карциноме эндометрия». Патология человека . 29 (5): 455–62. дои : 10.1016/s0046-8177(98)90060-0 . ПМИД 9596268 .

[5] Синдзато М, Шамото М, Хосокава С, Канеко С, Осада А, Симидзу М, Ёсида А (1995). «Дифференциация клеток Лангерганса от встречных клеток с использованием антител к белкам CD1a и S-100». Биотехника и гистохимия . 70 (3): 114–8. дои : 10.3109/10520299509108327 . ПМИД 7548432 .

[pmid12645002-6] Донато Р. (2003). «Внутриклеточная и внеклеточная роль белков S100» . Микроскопические исследования и техника . 60 (6): 540–51. дои : 10.1002/jemt.10296 . ПМИД 12645002 . S2CID 37798037 .

[pmid18606705-7] Вольф Р., Ховард О.М., Донг Х.Ф., Воскопулос С., Боэшанс К., Уинстон Дж., Диви Р., Гансиор М., Голдсмит П., Ахвази Б., Чавакис Т., Оппенгейм Дж.Дж., Юспа Ш.Х. (2008). «Хемотаксическая активность S100A7 (псориазина) опосредуется рецептором конечных продуктов гликирования и усиливает воспаление с помощью высоко гомологичного, но функционально отличающегося S100A15» . Журнал иммунологии . 181 (2): 1499–506. дои : 10.4049/jimmunol.181.2.1499 . ПМЦ 2435511 . ПМИД 18606705 .

[pmid18547346-8] Нонака Д., Чирибога Л., Рубин Б.П. (2008). «Дифференциальная экспрессия подтипов белка S100 при злокачественной меланоме, а также доброкачественных и злокачественных опухолях оболочек периферических нервов». Журнал кожной патологии . 35 (11): 1014–9. дои : 10.1111/j.1600-0560.2007.00953.x . ПМИД 18547346 . S2CID 22907221 .

[pmid20596736-9] Вольф Р., Ружичка Т., Юспа Ш. (июль 2010 г.). «Новое подсемейство S100A7 (псориазин)/S100A15 (кебнеризин): в высокой степени гомологичны, но различаются по регуляции и функциям» . Аминокислоты . 41 (4): 789–96. дои : 10.1007/s00726-010-0666-4 . ПМК 6410564 . ПМИД 20596736 .

[10] Пенумутчу, Шриниваса Р.; Чжоу, Руи-Хван; Ю, Чин (01 августа 2014 г.). «Структурные данные о связанном с кальцием S100P и V-домене комплекса RAGE» . ПЛОС ОДИН . 9 (8): e103947. Бибкод : 2014PLoSO...9j3947P . дои : 10.1371/journal.pone.0103947 . ISSN 1932-6203 . ПМК 4118983 . ПМИД 25084534 .

[11] Пенумутчу, Шриниваса Р.; Чжоу, Руи-Хван; Ю, Чин (17 октября 2014 г.). «Взаимодействие S100P с противоаллергическим препаратом кромолином». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 454 (3): 404–409. дои : 10.1016/j.bbrc.2014.10.048 . ISSN 1090-2104 . ПМИД 25450399 .

[Dorlands-12] Elsevier , Иллюстрированный медицинский словарь Дорланда , Elsevier.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

v т и Белок : белок нервной ткани.
Synuclein	Alpha-synuclein Beta-synuclein Gamma-synuclein
Other	Agrin Chimerin Granin Chromogranin A B FMR1 Gap-43 protein GLUT3 Myelin Brain natriuretic peptide Nerve growth factor SCG5 Neurogranin Neuronal calcium sensor Neuropeptide Olfactory marker protein S100 protein Calgranulin Synapsin 1 2 3 Synaptophysin Tubulin GPM6A