Река

Река
	Capsaspora Sheepdogs
Научная классификация
Домен:	Эукариота
(не вмешательство):	Opisthokonta
(не вмешательство):	Голозоа
(не вмешательство):	Филосоа
Сорт:	Река ; Salchian-Tabrizi, 2008
Семьи и роды
	Capsasporidae Каппора ; ; Министерство Министерства ; Пирораптор ; ; Txikusporidae Itispora ; ;

Filasterea представляет собой предложенную базальную филозоанскую кладу одноклеточных амебоидных эукариот, которые включают министр и капсаспору . ^{[ 1 ]} Это сестра клада для Choanozoa , в котором появились Choanoflagellatea и животные , первоначально предложенные Shalchian-Tabrizi et al. в 2008 году, основанный на филогеномном анализе с 78 генами. Было обнаружено, что Filasterea является сестринской группой клады, состоящей из Metazoa и Choanoflagellata в рамках Opisthokonta, что было дополнительно подтверждено дополнительными, более богатыми таксонами, филогенетическими анализами. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Этимология

Из латинской филам, означающий « нить » и Греческая астема , означающая « звезда », указывает на основные морфологические особенности, разделяемые всеми их интегрантами: небольшие округлые амебоиды с мононуклетным клеточным телом, покрытым длинными и излучающими клеточными выстрелами, известными как филоподия. Эти филоподии могут участвовать в адгезии субстрата и захвата добычи.

Приложения

В настоящее время есть культуры от двух видов Filasteran: Capsaspora Owczarzaki и министр Vibrans , первые изолированные изнутри улитки с новой водой, второй морской, свободноживущий бактериовор. Полные последовательности генома C. owczarzaki , ^{[ 5 ]} Маркус Вибран Пилораптор вьетнамский и пилораптор чилиан ^{[ 6 ]} были получены. Сравнительный анализ показал, что филастера являются ключом к раскрытию генетического репертуара одноклеточного предка животных и для того, чтобы дать представление о происхождении метазоа. Метабаркорновая анализ рибосомной РНК 18S в морских средах не смог восстановить другие представители филастера, ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Предполагая, что эта клада не может быть особенно распространенной в природных экосистемах.

Таксономия

Поле класса выбранная Шалхиан-Табризи и соавт. 2008 ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 4 ]}
- Заказ Министр Иида Кавалер-Смит 1997 ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}
  - Семейный министр ^{[ 1 ]}
    - Класс Министерство Patterson et al. 1993
      - Министерство Марисолы Паттерсон и соавт. 1993
      - Министерство Vibrans Tong 1997
  - Семейство txikisporidae urrutia, feist & bass 2021
    - Род Txikispora urrutia, Feist & Bass 2021
      - Txikispora philomaios urrutia, Feist & Bass 2021
  - Семейство Capsasporidae Cavalier-Smith 2008 ^{[ 1 ]}
    - Класс Capsaspora Hertel et al. 2002
      - Capsaspora Shepherd Hertel et al. 2002
    - Genus Pigoraptor Tikhonenkov et al. 2017 ^{[ 4 ]}
      - Pigoraptor Chileana Tikhonenkov et al. 2017 ^{[ 4 ]}
      - Пигораптор Вьетнамская Тихоненков и др. 2017 ^{[ 4 ]}

В некоторых исследованиях Capsaspora обнаружено более тесно связано с Choanozoa, чем министр. ^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Shalchian-Tabrizi K, Minge MA, Espellun M, et al. (7 мая 2008 г.). Arayo R (ред.). «Многогенная филогения хоанозоиа и происхождение животных » Plos один 3 (5): E2 Bibcode : 2008 Plose ... 3.2098s Doi : 10.1371/ journal.pone.0 PMC 2346548 PMID 18461162
^ Торруэлла, Гифре; Derelle, Romain; Папс, Джорди; Ланг, Б. Франц; Роджер, Эндрю Дж.; Шалчиан-Табризи, Камран; Руис-Трилло, Иьяки (февраль 2012 г.). «Филогенетические взаимосвязки в пределах Opisthokonta на основе филогеномного анализа консерватовых доменов белкового белка консервации» . Молекулярная биология и эволюция . 29 (2): 531–544. Doi : 10.1093/molbev/msr185 . ISSN 1537-1719 . PMC 3350318 . PMID 21771718 .
^ Башня, Гифре; Мендоса, Алекс; Степень-бов, Ксавье; Затем, Meritxell; Чаплин, Марк А.; поля, Хавьер; ЭМЕ, Лаура; Перес-Коордон, Грегори; Уиппс, Кристофер М. (2015-09-21). животных Близкие родственники Биология ток . 25 (18): 2404–2410. два 10.1016/j.cub.2015.07.053: ISSN 1879-0 26365255PMID
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Хеэнбергер, Элизабет; Тихоненков, Денис В.; Колиско, Мартин; Кампо, Хавьер дель; Эсалов, Антон с.; Милников, Александр П.; Килинг, Патрик Дж. (2017). «Новые хищники изменяют филогения голоозой и выявляют присутствие двухкомпонентной сигнальной системы у предка животных» . Текущая биология . 27 (13): 2043–2050.e6. doi : 10.1016/j.cub.2017.06.006 . PMID 28648822 .
^ Суга, Хироши; Чен, Зехуа; Мендоса, Алекс де; Sebé-Pedrós, Arnau; Браун, Мэтью В.; Крамер, Эрик; Карр, Мартин; Кернер, Пьер; Vervoort, Michel (2013-08-14). «Геном Capsaspora выявляет сложную одноклеточную предысторию животных» . Природная связь . 4 : NCOMMS3325. Bibcode : 2013natco ... 4.2325s . doi : 10.1038/ncomms3325 . PMC 3753549 . PMID 23942320 .
^ Ocaña-Pellars, Eduard; Уильямс, Том А.; Lopes-e снаружи, Дэвид; Arroyo, Alica S.; Pathmanathan, Jananan S.; Паптсест, Эрик; Tickonencov, Denis v.; Килинг, Патрик Дж.; Szölla, Gergely J.; Трилло, Иьяка (2022-09-22). «Хорошая геномная геномика проповедовала. Природа . 609 : 747–753. doi : 10.1038/s41586-022-0510-4 . HDL : 10261/28
^ Дель Кампо, Хавьер; Ruiz-Trillo, Iñaki (2013-04-01). «Мета-анализ окружающей среды выявляет скрытое разнообразие среди одноклеточных опишхоконтов» . Молекулярная биология и эволюция . 30 (4): 802–805. doi : 10.1093/molbev/mst006 . ISSN 0737-4038 . PMC 3603316 . PMID 23329685 .
^ Дель Кампо, Хавьер; Малло, Диего; Массана, Рамон; де Варгас, Колумбан; Ричардс, Томас А.; Руис-Трильо, Иьяки (сентябрь 2015 г.). «Разнообразие и распределение одноклеточных опишхоконтов вдоль европейского побережья проанализировано с использованием высокопроизводительного секвенирования» . Экологическая микробиология . 17 (9): 3195–3207. doi : 10.1111/1462-2920.12759 . ISSN 1462-2920 . PMC 4500835 . PMID 25556908 .
^ Adl; и др. (28 сентября 2012 г.), «Пересмотренная классификация эукариот» (PDF) , журнал эукариотической микробиологии , 59 (5): 429–493, doi : 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x , PMC 3483872 , PMID 23020233 , архивировано из оригинала (PDF) на 2013-12-16
^ Silar, Philippe (2016), «Протисты эукариоты: происхождение, эволюция и биология эукариотических микробов» , HAL Archives-Open : 1–462
^ Ondřej Zicha (1999), «Министерство» , Biolib.cz , Получено 2016-04-21
^ Руджеро; и др. (29 апреля 2015 г.), «Классификация более высокого уровня всех живых организмов», PLOS One , 10 (4): E0119248, Bibcode : 2015ploso..1019248R , doi : 10.1371/Journal.pone.0119248 , PMC 4418965 , PMID 2592352111 .
^ Рейнольдс, Николь К.; Смит, Мэтью Э.; Треттер, Эрик Д.; Гауз, Джастин; Хини, Дастин; Cafaro, Matías J.; Смит, Джеймс Ф.; Новак, Стивен Дж.; Bourland, William A. (2017). «Устранение отношений в рамках животных дивергенции: молекулярное филогенетическое исследование протистских трихомицетов (ichthyosporea, eccrinida)» . Молекулярная филогенетика и эволюция . 109 : 447–464. doi : 10.1016/j.ympev.2017.02.007 . ISSN 1055-7903 . PMID 28219758 .

[pmid18461162-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Shalchian-Tabrizi K, Minge MA, Espellun M, et al. (7 мая 2008 г.). Arayo R (ред.). «Многогенная филогения хоанозоиа и происхождение животных » Plos один 3 (5): E2 Bibcode : 2008 Plose ... 3.2098s Doi : 10.1371/ journal.pone.0 PMC 2346548 PMID 18461162

[2] Торруэлла, Гифре; Derelle, Romain; Папс, Джорди; Ланг, Б. Франц; Роджер, Эндрю Дж.; Шалчиан-Табризи, Камран; Руис-Трилло, Иьяки (февраль 2012 г.). «Филогенетические взаимосвязки в пределах Opisthokonta на основе филогеномного анализа консерватовых доменов белкового белка консервации» . Молекулярная биология и эволюция . 29 (2): 531–544. Doi : 10.1093/molbev/msr185 . ISSN 1537-1719 . PMC 3350318 . PMID 21771718 .

[3] Башня, Гифре; Мендоса, Алекс; Степень-бов, Ксавье; Затем, Meritxell; Чаплин, Марк А.; поля, Хавьер; ЭМЕ, Лаура; Перес-Коордон, Грегори; Уиппс, Кристофер М. (2015-09-21). животных Близкие родственники Биология ток . 25 (18): 2404–2410. два 10.1016/j.cub.2015.07.053: ISSN 1879-0 26365255PMID

[Hehenberger2017-4] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Хеэнбергер, Элизабет; Тихоненков, Денис В.; Колиско, Мартин; Кампо, Хавьер дель; Эсалов, Антон с.; Милников, Александр П.; Килинг, Патрик Дж. (2017). «Новые хищники изменяют филогения голоозой и выявляют присутствие двухкомпонентной сигнальной системы у предка животных» . Текущая биология . 27 (13): 2043–2050.e6. doi : 10.1016/j.cub.2017.06.006 . PMID 28648822 .

[5] Суга, Хироши; Чен, Зехуа; Мендоса, Алекс де; Sebé-Pedrós, Arnau; Браун, Мэтью В.; Крамер, Эрик; Карр, Мартин; Кернер, Пьер; Vervoort, Michel (2013-08-14). «Геном Capsaspora выявляет сложную одноклеточную предысторию животных» . Природная связь . 4 : NCOMMS3325. Bibcode : 2013natco ... 4.2325s . doi : 10.1038/ncomms3325 . PMC 3753549 . PMID 23942320 .

[6] Ocaña-Pellars, Eduard; Уильямс, Том А.; Lopes-e снаружи, Дэвид; Arroyo, Alica S.; Pathmanathan, Jananan S.; Паптсест, Эрик; Tickonencov, Denis v.; Килинг, Патрик Дж.; Szölla, Gergely J.; Трилло, Иьяка (2022-09-22). «Хорошая геномная геномика проповедовала. Природа . 609 : 747–753. doi : 10.1038/s41586-022-0510-4 . HDL : 10261/28

[7] Дель Кампо, Хавьер; Ruiz-Trillo, Iñaki (2013-04-01). «Мета-анализ окружающей среды выявляет скрытое разнообразие среди одноклеточных опишхоконтов» . Молекулярная биология и эволюция . 30 (4): 802–805. doi : 10.1093/molbev/mst006 . ISSN 0737-4038 . PMC 3603316 . PMID 23329685 .

[8] Дель Кампо, Хавьер; Малло, Диего; Массана, Рамон; де Варгас, Колумбан; Ричардс, Томас А.; Руис-Трильо, Иьяки (сентябрь 2015 г.). «Разнообразие и распределение одноклеточных опишхоконтов вдоль европейского побережья проанализировано с использованием высокопроизводительного секвенирования» . Экологическая микробиология . 17 (9): 3195–3207. doi : 10.1111/1462-2920.12759 . ISSN 1462-2920 . PMC 4500835 . PMID 25556908 .

[9] Adl; и др. (28 сентября 2012 г.), «Пересмотренная классификация эукариот» (PDF) , журнал эукариотической микробиологии , 59 (5): 429–493, doi : 10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x , PMC 3483872 , PMID 23020233 , архивировано из оригинала (PDF) на 2013-12-16

[10] Silar, Philippe (2016), «Протисты эукариоты: происхождение, эволюция и биология эукариотических микробов» , HAL Archives-Open : 1–462

[11] Ondřej Zicha (1999), «Министерство» , Biolib.cz , Получено 2016-04-21

[12] Руджеро; и др. (29 апреля 2015 г.), «Классификация более высокого уровня всех живых организмов», PLOS One , 10 (4): E0119248, Bibcode : 2015ploso..1019248R , doi : 10.1371/Journal.pone.0119248 , PMC 4418965 , PMID 2592352111 .

[13] Рейнольдс, Николь К.; Смит, Мэтью Э.; Треттер, Эрик Д.; Гауз, Джастин; Хини, Дастин; Cafaro, Matías J.; Смит, Джеймс Ф.; Новак, Стивен Дж.; Bourland, William A. (2017). «Устранение отношений в рамках животных дивергенции: молекулярное филогенетическое исследование протистских трихомицетов (ichthyosporea, eccrinida)» . Молекулярная филогенетика и эволюция . 109 : 447–464. doi : 10.1016/j.ympev.2017.02.007 . ISSN 1055-7903 . PMID 28219758 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]