Термоанаэробактер
| Термоанаэробактер | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Бациллота |
| Сорт: | Клостридии |
| Заказ: | Термоанаэробактерии |
| Семья: | Термоанаэробактерии |
| Род: | Термоанаэробактер Вигель и Юнгдал, 1982 г. |
| Типовой вид | |
| Термоанаэробактер этаноликус Вигель и Юнгдал, 1982 г. | |
| Разновидность | |
Посмотреть текст | |
| Синонимы | |
| |
Thermoanaerobacter — род Bacillota ( бактерии ). [1] Представители этого рода термофильны и анаэробны , некоторые из них ранее были описаны как виды Clostridium и представители ныне устаревших родов Acetogenium и Thermobacteroides. [2] [3]
Этимология
[ редактировать ]Название Thermoanaerobacter происходит от:
Греческое прилагательное термос (θερμός) , горячий; Греческий префикс ан (ἄν) , не; Греческое существительное aer, эрос (ἀήρ, ἀέρος) , воздух; Неолатинское мужского рода существительное , bacter , номинально означающее «палочка», но фактически означающее бактерию, стержень; Неолатинское мужского рода существительное Thermoanaerobacter , палочка, которая растет в отсутствие воздуха при повышенных температурах. [4]
Разновидность
[ редактировать ]Род включает 15 видов, а именно [4]
- T. acetoeticus (Ben-Bassat and Zeikus 1983) Rainey and Stackebrandt 1993 ( латинское существительное acetum , уксус; неолатинское прилагательное eticicus , относящееся к этиловому спирту; неолатинское мужского рода прилагательное acetoeticus , предназначенное для обозначения производства уксусной кислоты и этанола. ) Этот вид, ранее известный как Thermobacteroides acetoeticus , раньше был типовым видом Thermobacteroides , но был переведен в род Thermoanaerobacter , в то время как другой представитель рода Thermobacteroides , Thermobacteroides proteolyticus, был реклассифицирован как Coprothermobacter proteolyticus. [3]
- T. brockii (Zeikus et al ., 1983) Lee et al . 1993 ( неолатинский родительный падеж существительного brockii , Брока, назван в честь Томаса Дейла Брока, который был пионером исследований физиологии и экологии термофилов .) этот вид ранее был известен как Thermoanaerobium brockii. [5] [6]
- T. этаноликус Вигель и Люнгдал 1982 (Типовой вид рода; неолатинское существительное этанол , этанол; латинский суффикс мужского рода - icus , суффикс, используемый в смысле относящегося к; неолатинское прилагательное мужского рода этаноликус ) , указывающее на производство этанола.) [7]
- « Т. inferii » Орлигссон и Бек, 2007 г.
- T. italicus Kozianowski et al . 1998 ( латинское мужского рода прилагательное курсив , относящееся к Италии, где организм был изолирован.) [8]
- « T. keratinophilus » Ризен и Антраникян, 2001 г.
- T. kivui (Leigh and Wolfe 1983) Collins et al . 1994 ( неолатинский родительный падеж существительного kivui , относящийся к Киву, названному в честь его источника, озера Киву.) Этот вид раньше был известен как Acetogenium kivui (единственный представитель первого рода), прежде чем был переведен в этот род. [9]
- Т. mathranii Larsen et al . 1998 ( неолатинский родительный падеж существительного mathranii , Матрани, в честь покойного Индры М. Матрани, который за свою короткую карьеру внес свой вклад в понимание термофильных анаэробов из горячих источников). [10] [11]
- T. pentosaceus Томас, Каракашев и Ангелидаки 2013 г. [12]
- T. pseudэтанолicus Onyenwoke et al . 2007 ( греческое прилагательное pseudēs , ложный; нео-латинское прилагательное этаноликус , эпитет, специфичный для бактерий; нео-латинское мужского рода прилагательное pseudэтанолicus , ложный ( Thermoanaerobacter ) этаноликус .) [13]
- T.siderophilus Слободкин и др . 1999 ( греческое существительноеsideros , означающее , железо; неолатинское прилагательное philus от греческого прилагательного philos (φίλος) друг, любящий; неолатинское мужского прилагательное родаsiderophilus , любящий железо.) [14]
- T.ulfurigignens Lee et al . 2007 ( Латинское существительное сера , сера; латинское причастие прилагательное gignens , производящее; неолатинское причастие прилагательноеulfurigignens , производящее серу.) [15]
- T.ulfurophilus Бонч-Осмоловская 1998 ( латинское существительное сера , сера; неолатинское прилагательное philus от греческого прилагательного philos (φίλος), означающее друг, любящий; неолатинское мужского прилагательное родаulfurophilus , любящий элементарную серу.) [16]
- T. thermocopriae (Jin, Yamasato & Toda 1988) Collins et al . 1994 ( греческое существительное thermē (θέρμη) тепло; греческое существительное kopria , навозная куча; неолатинский родительный падеж существительного thermocopriae , тепловой компост.) , [9]
- T. thermo Hydrosulfuricus (Klaushofer and Parkkinen 1965) Lee et al . 1993 ( греческое прилагательное thermos (θερμός) , горячий; неолатинское прилагательное мужского рода , Hydrosulfuricus относящееся к сероводороду; неолатинское мужского рода прилагательное thermoгидроsulfuricus , указывающее на то, что организм растет при высоких температурах и восстанавливает сульфит до H 2 S.), раньше этот вид также назывался Clostridium thermodrivesulfuricum. [6]
- T. uzonensis Wagner et al . 2008 ( неолатинское мужского рода прилагательное uzonensis , принадлежащее кальдере Узон, Камчатка, Дальний Восток России.) [17]
- Т. wiegelii Cook et al . 1996 ( неолатинский родительный падеж существительного wiegelii , Юргена Вигеля, в знак признания его вклада в изучение термофильных анаэробов.) [18]
Три бывших представителя этого рода, T. subterraneus , T. tengcongensis и T. yonseiensis , были реклассифицированы как подвиды Caldanaerobacter subterraneus. [19]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [20] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) [21]
| на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [22] [23] [24] | 120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [25] [26] [27] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Классификация рода Thermoanaerobacter в LPSN ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .
- ^ Коллинз, доктор медицины; Лоусон, Пенсильвания; Виллемс, А; и др. (1994). «Филогения рода Clostridium: предложение пяти новых родов и одиннадцати новых комбинаций видов» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 44 (4): 812–26. дои : 10.1099/00207713-44-4-812 . ПМИД 7981107 .
- ^ Jump up to: а б Рейни, ФА; Стакебрандт, Э. (1993). «Перенос типового вида рода Thermobacteroides в род Thermoanaerobacter как Thermoanaerobacter acetoeticus (Ben-Bassat and Zeikus 1981) com. nov., описание Coprothermobacter gen. nov. и реклассификация Thermobacteroides proteolyticus в Coprothermobacter proteolyticus (Ollivier et al.) .1985) гребенка ноя» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 43 (4): 857–859. дои : 10.1099/00207713-43-4-857 .
- ^ Jump up to: а б Термоанаэробактер в ЛПСН ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .
- ^ Зейкус, Дж.Г.; Хегге, П.В.; Андерсон, Массачусетс (1979). «Thermoanaerobium brockii gen. nov. и sp. nov., новая хемоорганотрофная кальдоактивная анаэробная бактерия». Архив микробиологии . 122 (1): 41–48. дои : 10.1007/BF00408044 .
- ^ Jump up to: а б Ли, Ю.В.; Джайн, МК; Ли, К.; Лоу, ЮВ; Зейкус, Дж. Г. (1993). «Таксономическое различие сахаролитических термофильных анаэробов: описание Thermoanaerobacterium xylanolyticum gen. nov., sp. nov. и Thermoanaerobacterium saccharolyticum gen. nov., sp. nov.; реклассификация Thermoanaerobium brockii, Clostridium thermosulfurogenes и Clostridium thermodrivesulfuricum E100-69 как Thermoanaerobacter brockii com. nov., Thermoanaerobacterium thermosulfurigenes com. nov. и Thermoanaerobacter thermodrivesulfuricus com. nov. соответственно и перенос Clostridium thermodrivesulfuricum 39E на Thermoanaerobacter этаноликус». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 43 (1): 41–51. дои : 10.1099/00207713-43-1-41 .
- ^ Вигель, младший; Люнгдал, Л.Г. (1981). «Thermoanaerobacter этаноликус ген. Ноябрь, спец. Ноябрь, новая чрезвычайно термофильная анаэробная бактерия». Архив микробиологии . 128 (4): 343–348. дои : 10.1007/BF00405910 .
- ^ Козяновский Г.; Канганелла, Ф.; Рейни, ФА; Хиппе, Х.; Антраникян, Г. (1997). «Очистка и характеристика термостабильных пектатлиаз из недавно выделенной термофильной бактерии Thermoanaerobacter italicus sp. Nov». Экстремофилы . 1 (4): 171–182. дои : 10.1007/s007920050031 . ПМИД 9680298 .
- ^ Jump up to: а б Коллинз, доктор медицины; Лоусон, Пенсильвания; Виллемс, А.; Кордова, Джей-Джей; Фернандес-Гарайсабаль, Дж.; Гарсия, П.; Кай, Дж.; Хиппе, Х.; Фэрроу, Джей (1994). «Филогения рода Clostridium: предложение пяти новых родов и одиннадцати новых комбинаций видов» . Международный журнал систематической бактериологии . 44 (4): 812–826. дои : 10.1099/00207713-44-4-812 . ISSN 0020-7713 . ПМИД 7981107 .
- ^ Ларсен, Л.; Нильсен, П.; Аринг, Б.К. (1997). «Thermoanaerobacter mathranii sp. nov., производящая этанол, чрезвычайно термофильная анаэробная бактерия из горячего источника в Исландии». Архив микробиологии . 168 (2): 114–119. дои : 10.1007/s002030050476 . ПМИД 9238102 .
- ^ «Список новых названий и новых комбинаций, ранее эффективно, но недействительно опубликованный» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 57 (Часть 1): 1. 2007. doi : 10.1099/ijs.0.64923-0 . ПМИД 17220429 .
- ^ Томас, А.Ф.; Каракашев Д.; Ангелидаки, И. (2013). «Thermoanaerobacter pentosaceus sp. nov., анаэробная, чрезвычайно термофильная бактерия с высоким выходом этанола, выделенная из бытовых отходов». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 63 (7): 2396–2404. дои : 10.1099/ijs.0.045211-0 . ПМИД 23178727 .
- ^ Оньенвок, RU; Кевбрин В.В.; Лысенко А.М.; Вигель, Дж. (2007). «Thermoanaerobacter pseudэтанолicus sp. nov., термофильный гетеротрофный анаэроб из Йеллоустонского национального парка» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 57 (10): 2191–2193. дои : 10.1099/ijs.0.65051-0 . ПМИД 17911280 .
- ^ Слободкин А.И.; Турова, Т.П.; Кузнецов Б.Б.; Кострикина, Н.А.; Черных, Н.А.; Бонч-Осмоловская Е.А. (1999). «Thermoanaerobactersiderophilus sp. nov., новая диссимиляционная Fe(III)-редуцирующая анаэробная термофильная бактерия» . Международный журнал систематической бактериологии . 49 (4): 1471–1478. дои : 10.1099/00207713-49-4-1471 . ПМИД 10555328 .
- ^ Ли, Ю.-Дж.; Дашти, М.; Прейндж, А.; Рейни, ФА; Роде, М.; Уитмен, ВБ; Вигель, Дж. (2007). «Thermoanaerobacterulfurigignens sp. nov., анаэробная термофильная бактерия, которая восстанавливает 1 М тиосульфата до элементарной серы и переносит 90 мМ сульфита» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 57 (7): 1429–1434. дои : 10.1099/ijs.0.64748-0 . ПМИД 17625170 .
- ^ Бонч-Осмоловская Е.А.; Мирошниченко, М.Л.; Черных, Н.А.; Кострикина, Н.А.; Пикута, Е.В.; Рейни, Ф.А. (1997). «Восстановление элементарной серы умеренно термофильными органотрофными бактериями и описание Thermoanaerobacterulfurophilus sp. nov». Микробиология . 66 : 483–489.
- ^ Вагнер, ID; Чжао, В.; Чжан, CL; Романек, CS; Роде, М.; Вигель, Дж. (2008). «Thermoanaerobacter uzonensis sp. nov., анаэробная термофильная бактерия, выделенная из горячего источника в кальдере Узон, Камчатка, Дальний Восток России» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (11): 2565–2573. дои : 10.1099/ijs.0.65343-0 . ПМИД 18984694 .
- ^ Кук, генеральный директор; Рейни, ФА; Патель, БКС; Морган, HW (1996). «Характеристика нового облигатно анаэробного термофила Thermoanaerobacter wiegelii sp. nov» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 46 (1): 123–127. дои : 10.1099/00207713-46-1-123 . ПМИД 8573487 .
- ^ Фардо, М.; Салинас, М.; Л'Харидон, С.; Жантон, К.; Вере, Ф.; Кайол, Дж.; Патель, Б.; Гарсия, Дж.; Оливье, Б. (2004). «Выделение из нефтяных резервуаров новых термофильных анаэробов, филогенетически связанных с Thermoanaerobacter subterraneus: отнесение T. subterraneus, Thermoanaerobacter yonseiensis, Thermoanaerobacter tengcongensis и Carboxydibrachium pacificum к Caldanaerobacter subterraneus gen. nov., sp. nov., Comb. nov. как четыре новых подвида. " . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 54 (2): 467–474. дои : 10.1099/ijs.0.02711-0 . ПМИД 15023962 .
- ^ Ж. П. Эзеби. «Термоанаэробактер» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2022 г.
- ^ Сэйерс; и др. «Термоанаэробактер» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2022 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.