Флавобактерии

Флавобактерии
	Elizabethkingia meningoseptica на кровяном агаре
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Бактероидота
Сорт:	Флавобактерии ; Бернарде 2012
Заказы
	Флавобактерии Бернарде 2012 ; Роды, не отнесенные к отряду или семейству « Candidatus Walczuchella monophlebidarum» Розас-Перес и др . 2014 год ; ;

Класс среды . Flavobacteriia состоит из одного класса бактерий окружающей ^[3] Он содержит семейство Flavobacteriaceae , которое является крупнейшим семейством в типе Bacteroidota . ^[4] Этот класс широко распространен в почвенных, пресных и морских местообитаниях. ^[5] Название часто пишется как Flavobacteria, но в 2012 году оно было официально названо Flavobacteriia. ^[6]^[7]

Флавобактерии представляют собой грамотрицательные аэробные палочки длиной 2–5 мкм, шириной 0,1–0,5 мкм, с закругленными или заостренными концами. ^[6] Они образуют на агаре круглые колонии кремового или оранжевого цвета, и их, как правило, легко успешно культивировать. ^[5] Флавобактерии являются хемоорганотрофами и известны своей способностью минерализовать или разлагать растворенные органические вещества с высокой молекулярной массой и частицы растительного материала. ^[8]

Флавобактерии оказывают воздействие как на окружающую среду, так и на человеческое общество, поскольку они способны вызывать заболевания у многих организмов. Они играют важную роль в разложении органических веществ и загрязняющих веществ и являются ключевыми участниками формирования морских биопленок. ^[9] Также известно, что они вызывают заболевания у некоторых видов животных, в частности, бактериальную болезнь холодной воды и колумнарис. ^[10]^[11]

Таксономия

Флавобактерии — самый крупный из четырех классов типа Bacteroidota. Это класс одного порядка, а его крупнейшее семейство — Flavobacteriaceae . ^[4] Flavobacteriaceae — самое крупное семейство в типе Bacteroidota . Семейство насчитывает более 90 родов и сотни видов. ^[4] Род Flavobacterium чаще всего используется в исследованиях Flavobacteriia. Этот род насчитывает 100 классифицированных видов и множество дополнительных неклассифицированных видов. ^[12] Недавние таксономические обновления переклассифицировали несколько видов Flavobacterium в новые роды, такие как Microbacterium , Salegentibacter и Planococcus . ^[13]

Доменные бактерии
- Тип Бактероидота
  - Класс Флавобактерии ^[12]
    - Заказать флавобактерии ^[12]
      - Семейство Кроцинитомовые. ^[12]
      - Семейство криоморфные. ^[12]
      - Семейство флавобактериевые. ^[12]
        Род Флавобактерии.
        Роды Microbacterium , Salegentibacter и Planococcus . ^[13]
      - Семейство Ихтиобактерии. ^[12]
      - Семейство Лютейбакуловые. ^[12]
      - Семейство Парвицелловые. ^[12]
      - Семейство Салибактериевые. ^[12]
      - Семейство Шлейфериевые. ^[12]
      - Семейство Висинговые. ^[12]
      - Семейство Weeksellaceae. ^[12]
      - Семейство Flavobacteriales неопределенного происхождения. ^[12]
      - Кроме того, неклассифицированные Flavobacteriales ^[12]

История

Род Flavobacterium был создан в 1889 году. ^[13] Впервые о нем было написано в 1923 году в руководстве Берджи по детерминирующей бактериологии , и он содержал один из первых из 46 обсуждаемых видов. ^[14] В инструкции флавобактерии определяются как грамотрицательные, неспорообразующие, аэробные, нескользящие палочки. ^[14] В 1999 году было обнаружено, что у Flavobacteriia в колониях имеется желтый пигмент. Было также установлено, что они передвигаются путем скольжения и растут только в присутствии кислорода. ^[15]

В 1922 году в реке Миссисипи была обнаружена Flavobacterium columnsare , возбудитель столбчатой болезни, оказывающий значительное воздействие на рыб, что сделало ее одним из самых ранних известных заболеваний такого рода. ^[11] Первоначально болезнь была обозначена как миксобактерия в 1944 году, но в 1996 году была переименована в Flavobacterium columnsare и насчитывала 10 видов. ^[16]^[4] Раньше флавобактерии содержали множество неродственных видов желтых палочковидных бактерий, но таксономия изменилась и стабилизировалась благодаря секвенированию рРНК для установления филогенетических связей. ^[4]

среда обитания

Флавобактерии широко распространены и имеют высокую численность в водных системах. ^[5] Они обнаружены в больных рыбах, микробных матах, пресноводных и речных отложениях, морской воде и морских отложениях, почве, ледниках и антарктических озерах. ^[18]^[5] Увеличение численности наблюдается в районах с высоким содержанием органических субстратов из-за их роли в поглощении, деградации и разложении органического вещества и может привести к доминированию бактерий. ^[13] Флавобактерии широко распространены в океанических отложениях, их количество уменьшается с увеличением глубины и они предпочитают отложения, лишенные растительности. ^[19]

Эти бактерии также широко распространены в талых прудах, кернах твердого льда, морском льду и рассоле , а также в фотозоне . ^[18] В частности, эти фотозоны показывают, что флавобактерии широко распространены в продуктивных средах, таких как цветение фитопланктона и зоны апвеллинга . ^[19] Флавобактерии являются видными представителями морских биопленок . ^[9] Они оказывают большое влияние на функционирование морских биопленок, однако считается, что их численность сильно недооценена. ^[9]

Флавобактерии также можно найти в неморских системах и наиболее распространены в азиатских регионах, особенно в Корее и Китае, а также в Японии и Индии. ^[13]

Морфология

Флавобактерии представляют собой тип грамотрицательных палочковидных бактерий, размеры которых обычно варьируются от 0,1 до 0,5 мкм в ширину и от 2 до 5 мкм в длину. ^[6]^[20] В зависимости от вида флавобактерий размер генома может варьироваться от 1,85x10 ⁹ дальтон до 3,9x10 ⁹ дальтоны. ^[21] Флавобактерии также не способны образовывать эндоспоры . ^[20] Они классифицируются как грамотрицательные из-за состава их клеточной стенки, которая состоит из тонкого слоя пептидогликана, окруженного внешней мембраной, состоящей из липополисахаридов . ^[22] Палочковидная форма этих бактерий обычно имеет прямые или слегка изогнутые параллельные стороны с закругленными или слегка суженными концами. ^[6]^[8] Общая морфология колоний Flavobacteriia имеет круглую форму, выпуклую или слегка выпуклую, с гладкой поверхностью. ^[8] Эти колонии обычно кажутся слегка полупрозрачными и могут иметь цвет от бледно-желтого/кремового до оранжевого из-за присутствия таких пигментов, как каротиноиды или флексирубин . ^[5]^[8]

Флавобактерии не имеют жгутиков и осуществляют либо скользящее движение, либо неподвижны. ^[21]^[23] Скользящее движение позволяет им перемещаться по влажным поверхностям, например, по предметному стеклу или чашке с агаром . ^[23]^[24] Флавобактерии демонстрируют преимущественно скользящее движение вперед, но могут также менять направление и демонстрировать кувыркающиеся движения. ^[24] Исследования показывают, что скользящему движению способствует градиент протонов через цитоплазматическую мембрану . ^[23]^[24]

Метаболизм

Бактерии класса Flavobacteriia имеют разнообразный метаболизм . Флавобактерии являются хемоорганотрофами , то есть используют органические молекулы в качестве источника энергии. ^[8] Большинство видов имеют облигатно аэробный тип дыхания, а некоторые виды могут расти в условиях от слабых микроаэробных до анаэробных . ^[8] Некоторые виды флавобактерий обладают способностью использовать широкий спектр углеводов в качестве источников энергии, в то время как другие обладают ограниченной способностью или вообще не используют ее вообще и вместо этого предпочитают использовать аминокислоты и белки . ^[8] Примерно половина видов, принадлежащих к Flavobacteriia, способны расщеплять углеводы до кислот и расщеплять тирозин и твиновые соединения. ^[8] Лишь несколько видов способны разлагать мочевину и ДНК . ^[8] Многие виды играют также значительную роль в минерализации органического вещества как в водной, так и в почвенной среде благодаря своей способности расщеплять различные типы биомакромолекул . ^[8]

Флавобактерии не фотосинтезируют, но некоторые морские виды используют протеородопсин для получения энергии за счет сбора света. ^[4] Протеородопсин (PR) — это протонный насос, использующий свет, однако виды, использующие PR, должны адаптироваться к различным средам, чтобы бороться с повреждением ультрафиолетом (УФ), и приобрести способность восстанавливать ДНК , поврежденную ультрафиолетом. ^[25]

Протеородопсин полезен для активного транспорта протонов через клеточную мембрану. Это полезно для создания АТФ в качестве энергии во флавобактериях. На диаграмме справа показано, как протеородопсин используется в клетках флавобактерий, и приводятся подробности его использования в бактериях. ^[25]

Культура

Для выделения флавобактерий используются типичные методы культивирования, такие как простые разведения. Методы различаются в зависимости от вида из-за большого разнообразия класса, однако многие из них культивируются на простых средах с использованием дрожжевого экстракта и гидролизата белка . ^[4] Для морских видов может потребоваться добавление сахара или определенных солей. К патогенам рыб и птиц могут предъявляться дополнительные требования к методологии культивирования. ^[4]

Морские флавобактерии культивируют на морском агаре или цитофаговом агаре. Неморские флавобактерии культивируются на богатых питательных средах, включая питательный агар , агар с касситоновым экстрактом дрожжей, агар PYG и агар TYES, или на средах с низким содержанием питательных веществ, таких как агар AO, агар PY2 и агар R2A. ^[4] Виды Flavobacteriia, обитающие в холодных условиях, демонстрируют оптимальный рост при температуре от 15 °C до 20 °C, тогда как виды, обитающие в умеренной среде, демонстрируют оптимальный рост при температурах от 20 °C до 30 °C. ^[8] Таким образом, температура культивирования составляет от 20°C до 30°C, а оптимальная температура составляет 37°C. ^[4]

Многие психрофильные и психротрофные виды выделены культуральными методами, главным образом из полярных регионов. ^[4] Были выделены дополнительные мезофильные виды, а также несколько термофилов , тогда как крайние галофилы еще не идентифицированы. ^[4]

Воздействие на окружающую среду

Хотя большинство флавобактерий безвредны, некоторые из них заражают оппортунистически или вызывают тяжелые заболевания. Это означает, что они могут вызывать заболевания у многих типов организмов, таких как растения или рыбы. ^[13] В них есть белки, которые выделяют факторы, способные вызвать развитие заболевания. ^[26] Патогенные микроорганизмы рыб распространены на рыбе или в ней, а также в окружающей воде. Птичьи патогены вызывают вспышки среди домашней и дикой птицы. ^[4]

Одним из возможных заболеваний является бактериальная болезнь холодной воды, вызываемая Flavobacterium psychrophilum у радужной форели, которая может вызывать эрозию тканей, изъязвления челюстей, воспаления и поведенческие проблемы. ^[10] Это также может вызвать острую гибель молоди радужной форели, известную как синдром мальков радужной форели. ^[27] В 2005 году Национальный центр аквакультуры прохладной и холодной воды установил, что выживаемость от этих болезней составила 29,3%. ^[27]

Кроме того, Flavobacterium columare вызывает заболевание колумнарис у пресноводных видов рыб. Болезнь Columnaris вызывает поражение кожи, эрозию плавников и некроз жабр, что приводит к смертности. ^[11]

Морские биопленки — это биологический элемент, который существенно влияет на продуктивность и функционирование морской среды обитания, способствуя основным микробным процессам, таким как фотосинтез, круговорот азота и разложение органических веществ и загрязняющих веществ. ^[9] На ранней стадии формирования морских биопленок флавобактерии колонизируются и образуют микроколонии, которые служат основой для создания других микроорганизмов в сообществе. В сообществе биопленок Flavobacteriia также участвуют в различных совместных взаимодействиях с другими микробами, а не в конкуренции, включая ощущение кворума , разделение питательных веществ и очистку. В целом, эти взаимодействия необходимы для создания и поддержания сложных микробных сообществ в морских биопленках. ^[9]

Человеческое воздействие

Еда

Флавобактерии связаны с порчей продуктов питания и пищевых продуктов. Относительная влажность помещения, где находится товар, влияет на рост психрофильных или психротрофных микроорганизмов. ^[13] Из-за образования побочных продуктов метаболизма порча сырой красной мякоти вызывает неприятный запах, потенциальное образование слизи, локальное изменение цвета и нежелательный вкус. Аналогичным образом, хотя флавобактерии являются постоянным компонентом исходной флоры колбасных изделий и птицы, они не способны конкурировать с псевдомонадами во время консервации. ^[13] В птице значительно больше флавобактерий, чем в другом свежем мясе. ^[13]

Флавобактерии создают устойчивые к пастеризации внеклеточные ферменты, что вызывает психротрофическую порчу молока и молочных продуктов. ^[13] Из-за создания фосфолипазы С они также виноваты в уменьшении выхода сыра чеддер и горечи молока. Учитывая, что фосфолипазы обладают способностью разрушать фосфолипиды , составляющие мембрану глобул молочного жира, и тем самым повышают уязвимость молочного жира ( триглицеридов ) к липолитическому воздействию, они могут иметь важное значение в молоке и молочных продуктах. ^[13]

Болезнь

Члены Flavobacteriia также вызывают заболевания у людей. ^[13] Однако по мере реклассификации штаммов Flavobacterium многие штаммы, вызывающие заболевания человека, были переведены в новые или другие роды. ^[28] такие как Chryseobacterium , Myroides , Empedobacter и Sphingobacterium . ^[29] Их основная инфицированная популяция — новорожденные и люди с иммунодефицитами. Неонатальные инфекции обычно проявляются как менингит , а уровень смертности от неонатального менингита высок. Менингит также может вызывать бактериемию и пневмонию . У взрослых инфекции могут проявляться по-разному, включая пневмонию, сепсис , менингит, эндокардит , послеоперационный и послеожоговый период. ^[29] На данный момент существующие патогенные флавобактерии в настоящее время очень редки и их трудно обнаружить, но они по-прежнему вызывают беспокойство, поскольку они устойчивы ко многим противомикробным препаратам. ^[28]

Промышленное использование

Способность флавобактерий к разложению также используется на благо людей. Бактерии обычно встречаются на очистных сооружениях. Их используют для очистки сточных вод из-за их способности переваривать химические вещества и другие молекулы, включая полициклические ароматические углеводороды . ^[4]

Флавобактерии используются для стимулирования роста растений в сельскохозяйственном секторе. Бактерии способны солюбилизировать неорганический фосфат и производить дополнительные полезные элементы, такие как индол-3-уксусная кислота (ключевой растительный гормон IAA) и 1-аминоциклопропан-1-карбоксилатдезаминаза (гидролаза), которые могут поглощаться и использоваться растениями. или изменить их сигнализацию. ^[30] Он может действовать как микробный агент для защиты растений от других болезней и даже полезен при разработке противомикробных лекарств. ^[4]

Ссылки

^ Бернарде Ж.Ф. (2010). «Класс II. Класс флавобактерий . Ноябрь». В Криг Н.Р., Стейли Дж.Т., Браун Д.Р., Хедлунд Б.П., Пастер Б.Дж., Уорд Н.Л., Людвиг В., Уитмен В.Б. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 4 (2-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Спрингер. п. 105.
^ Эузеби Ж.П., Парте AC. « Флавобактерии » . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 29 июня 2021 г.
^ Бун Д.Р., Кастенхольц Р.В., ред. (2001). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 1 (Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии) (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer-Verlag. стр. 465–466. ISBN 978-0-443-05615-4 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот Макбрайд М (2014). «Семейство флавобактерий». Прокариоты . стр. 643–676. дои : 10.1007/978-3-642-38954-2_130 . ISBN 978-3-642-38953-5 – через SpringerLink.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Бьюкен А., Леклер Г.Р., Гульвик К.А., Гонсалес Х.М. (октябрь 2014 г.). «Мастер-переработчики: особенности и функции бактерий, связанных с цветением фитопланктона». Обзоры природы. Микробиология . 12 (10): 686–698. дои : 10.1038/nrmicro3326 . ПМИД 25134618 . S2CID 26684717 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Бернарде Дж. Ф., Боуман Дж. П. (июль 2013 г.). «Подкомитет Международного комитета по систематике прокариот по таксономии флавобактерий и цитофагоподобных бактерий: протоколы заседаний, 7 сентября 2011 г., Саппоро, Япония» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 63 (Часть 7): 2752–2754. дои : 10.1099/ijs.0.053926-0 . ПМИД 23825377 .
^ «Класс флавобактерий» . allmicrobes.com . Архивировано из оригинала 1 ноября 2014 года . Проверено 1 ноября 2014 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Уитмен В.Б., Рейни Ф., Кемпфер П., Трухильо М., Чун Дж., ДеВос П. и др., ред. (17 апреля 2015 г.). Руководство Берги по систематике архей и бактерий (1-е изд.). Уайли. дои : 10.1002/9781118960608.gbm00312 . ISBN 978-1-118-96060-8 . S2CID 242820836 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Полле Т., Берджеб Л., Гарнье С., Дюрье Г., Ле Пупон С., Миссон Б., Жан-Франсуа Б. (июнь 2018 г.). «Сукцессии и взаимодействия прокариотических сообществ в морских биопленках: ключевая роль флавобактерий» . ФЭМС Микробиология Экология . 94 (6). дои : 10.1093/femsec/fiy083 . ПМИД 29733333 .
^ Jump up to: ^а ^б Барнс МЭ (2011). «Обзор биологии Flavobacterium Psychrophilum, клинических признаков, профилактики и лечения бактериальных заболеваний, вызванных холодной водой» (PDF) . Открытый научный журнал о рыбе . 4 (1): 40–48. дои : 10.2174/1874401X01104010040 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Деклерк А.М., Хезебрук Ф., Ван ден Брук В., Боссье П., Декостер А. (апрель 2013 г.). «Болезнь Columnaris у рыб: обзор с акцентом на взаимодействие бактерии с хозяином» . Ветеринарное исследование . 44 (1): 27. дои : 10.1186/1297-9716-44-27 . ПМЦ 3648355 . ПМИД 23617544 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот «Флавобактерии» . Таксономическая база данных NCBI . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 7 марта 2023 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л Васкевич А, Ижиковска Л (2014). «Flavobacterium spp. – Характеристики, распространенность и токсичность». Энциклопедия пищевой микробиологии : 938–942. дои : 10.1016/B978-0-12-384730-0.00126-9 . ISBN 978-0-12-384733-1 .
^ Jump up to: ^а ^б Лох Т.П., Фейсал М. (май 2015 г.). «Новые флавобактериальные инфекции у рыб: обзор» . Журнал перспективных исследований . 6 (3): 283–300. дои : 10.1016/j.jare.2014.10.009 . ПМЦ 4522593 . ПМИД 26257926 .
^ «Виды Flavobacterium aquatile» . ЛПСН . Проверено 25 марта 2023 г.
^ Кайзер Д. (2009). «Миксококк». Энциклопедия микробиологии (Третье изд.): 220–244. дои : 10.1016/B978-012373944-5.00018-3 . ISBN 978-0-12-373944-5 .
^ Догри И., Родригес С., Базир А., Дюфур А., Акбар Д., Шопена В., Сабле С., Ланнелюк I (октябрь 2015 г.). «Морские бактерии с французского атлантического побережья, демонстрирующие высокие способности к образованию биопленок и различную трехмерную архитектуру биопленок» . БМК Микробиология . 15 : 231. дои : 10.1186/s12866-015-0568-4 . ПМЦ 4619314 . ПМИД 26498445 .
^ Jump up to: ^а ^б Фернандес-Гомес Б., Диес Б., Польц М.Ф., Арройо Х.И., Альфаро Ф.Д., Маршандон Г. и др. (февраль 2019 г.). «Структура бактериального сообщества в симпатической среде обитания, расширяющейся с глобальным потеплением: солоноватый ледяной рассол на 85-90 ° с.ш.» . Журнал ISME . 13 (2): 316–333. Бибкод : 2019ISMEJ..13..316F . дои : 10.1038/s41396-018-0268-9 . ПМК 6331608 . ПМИД 30228379 .
^ Jump up to: ^а ^б Клири Д.Ф., Коэльо Ф.Дж., Оливейра В., Гомес, Северная Каролина, Полония, Ар. (2017). «Глубина отложений и среда обитания как предсказатели разнообразия и состава донных бактериальных сообществ в приливно-отливной среде эстуария». Морская экология . 38 (2): e12411. Бибкод : 2017MarEc..38E2411C . дои : 10.1111/maec.12411 .
^ Jump up to: ^а ^б Самора Л., Вела А.И., Санчес-Порро С., Паласиос М.А., Домингес Л., Мур Э.Р., Вентоса А., Фернандес-Гарайсабаль Х.Ф. (декабрь 2013 г.). «Характеристика флавобактерий, возможно, связанных с рыбой и средой рыбоводческих ферм. Описание трех новых видов Flavobacterium: Flavobacterium Collinsii sp. Nov., Flavobacterium Branchiarum Sp. Nov. и Flavobacterium Branchiicola Sp. Nov.». Аквакультура . 416–417: 346–353. Бибкод : 2013Aquac.416..346Z . doi : 10.1016/j.aquacultural.2013.09.019 .
^ Jump up to: ^а ^б Шеван Дж. М., МакМикин Т. А. (октябрь 1983 г.). «Таксономия (и экология) Flavobacterium и родственных родов». Ежегодный обзор микробиологии . 37 (1): 233–252. дои : 10.1146/annurev.mi.37.100183.001313 . ПМИД 6357052 .
^ Людериц О., Фрейденберг М.А., Галанос К., Леманн В., Ритшель Э.Т., Шоу Д.Х. (январь 1982 г.). «Липополисахариды грамотрицательных бактерий». Актуальные темы мембран и транспорта . Том. 17. Эльзевир. стр. 79–151. дои : 10.1016/s0070-2161(08)60309-3 . ISBN 978-0-12-153317-5 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Шривастава А., Берг Х.К. (декабрь 2015 г.). «К модели скольжения флавобактерий» . Современное мнение в микробиологии . 28 : 93–97. дои : 10.1016/j.mib.2015.07.018 . ПМЦ 4688146 . ПМИД 26476806 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Макбрайд MJ, Чжу Ю (январь 2013 г.). «Гены скользящей подвижности и системы секреции Por широко распространены среди представителей типа bacteroidetes» . Журнал бактериологии . 195 (2): 270–278. дои : 10.1128/JB.01962-12 . ПМЦ 3553832 . ПМИД 23123910 .
^ Jump up to: ^а ^б Олсон Д.К., Ёсидзава С., Бёф Д., Ивасаки В., Делонг Э.Ф. (апрель 2018 г.). «Изменчивость и распределение протеородопсина в субтропическом круговороте северной части Тихого океана» . Журнал ISME . 12 (4): 1047–1060. Бибкод : 2018ISMEJ..12.1047O . дои : 10.1038/s41396-018-0074-4 . ПМЦ 5864233 . ПМИД 29476140 .
^ «Последние достижения в области флавобактерий: механизмы патогенеза, новые генетические и физиологические особенности и взаимодействие с хозяевами» . Микробная физиология и метаболизм – через границы.
^ Jump up to: ^а ^б Сильверстайн Дж.Т., Вальехо Р.Л., Палти Ю., Лидс Т.Д., Рексроуд CE, Уэлч Т.Дж. и др. (март 2009 г.). «Устойчивость радужной форели к бактериальному заболеванию холодной воды умеренно наследуется и не имеет отрицательной корреляции с ростом» (PDF) . Журнал зоотехники . 87 (3): 860–867. дои : 10.2527/jas.2008-1157 . ПМИД 19028851 .
^ Jump up to: ^а ^б Гарсия-Лопес М., Сантос Дж., Отеро А. (январь 1999 г.), «FLAVOBACTERIUM», в Робинсоне Р.К. (ред.), Энциклопедия пищевой микробиологии , Оксфорд: Elsevier, стр. 820–826, doi : 10.1006/rwfm.1999.0660 , ISBN 978-0-12-227070-3
^ Jump up to: ^а ^б Бут Дж. (январь 2007 г.), Энна С.Дж., Байлунд Д.Б. (ред.), «Chryseobacterium и инфекции родственных родов», xPharm: Комплексный справочник по фармакологии , Нью-Йорк: Elsevier, стр. 1–4, doi : 10.1016/b978-008055232 -3.62958-7 , ISBN 978-0-08-055232-3
^ Нисиока Т., Эльшаркави М.М., Суга Х., Кагеяма К., Хякумати М., Симидзу М. (июнь 2016 г.). «Разработка питательной среды для выделения флавобактерий и хризеобактерий из ризосферной почвы» . Микробы и окружающая среда . 31 (2): 104–10. дои : 10.1264/jsme2.ME15144 . ПМЦ 4912144 . ПМИД 27098502 .

Внешние ссылки

[1] Бернарде Ж.Ф. (2010). «Класс II. Класс флавобактерий . Ноябрь». В Криг Н.Р., Стейли Дж.Т., Браун Д.Р., Хедлунд Б.П., Пастер Б.Дж., Уорд Н.Л., Людвиг В., Уитмен В.Б. (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 4 (2-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Спрингер. п. 105.

[LPSN-2] Эузеби Ж.П., Парте AC. « Флавобактерии » . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 29 июня 2021 г.

[3] Бун Д.Р., Кастенхольц Р.В., ред. (2001). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 1 (Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии) (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer-Verlag. стр. 465–466. ISBN 978-0-443-05615-4 .

[McBride-4] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот Макбрайд М (2014). «Семейство флавобактерий». Прокариоты . стр. 643–676. дои : 10.1007/978-3-642-38954-2_130 . ISBN 978-3-642-38953-5 – через SpringerLink.

[Buchan_2014-5] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Бьюкен А., Леклер Г.Р., Гульвик К.А., Гонсалес Х.М. (октябрь 2014 г.). «Мастер-переработчики: особенности и функции бактерий, связанных с цветением фитопланктона». Обзоры природы. Микробиология . 12 (10): 686–698. дои : 10.1038/nrmicro3326 . ПМИД 25134618 . S2CID 26684717 .

[Bernardet_2013-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Бернарде Дж. Ф., Боуман Дж. П. (июль 2013 г.). «Подкомитет Международного комитета по систематике прокариот по таксономии флавобактерий и цитофагоподобных бактерий: протоколы заседаний, 7 сентября 2011 г., Саппоро, Япония» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 63 (Часть 7): 2752–2754. дои : 10.1099/ijs.0.053926-0 . ПМИД 23825377 .

[7] «Класс флавобактерий» . allmicrobes.com . Архивировано из оригинала 1 ноября 2014 года . Проверено 1 ноября 2014 г.

[Wiley_2015-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к Уитмен В.Б., Рейни Ф., Кемпфер П., Трухильо М., Чун Дж., ДеВос П. и др., ред. (17 апреля 2015 г.). Руководство Берги по систематике архей и бактерий (1-е изд.). Уайли. дои : 10.1002/9781118960608.gbm00312 . ISBN 978-1-118-96060-8 . S2CID 242820836 .

[Pollet_2018-9] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Полле Т., Берджеб Л., Гарнье С., Дюрье Г., Ле Пупон С., Миссон Б., Жан-Франсуа Б. (июнь 2018 г.). «Сукцессии и взаимодействия прокариотических сообществ в морских биопленках: ключевая роль флавобактерий» . ФЭМС Микробиология Экология . 94 (6). дои : 10.1093/femsec/fiy083 . ПМИД 29733333 .

[Barnes_2011-10] Jump up to: ^а ^б Барнс МЭ (2011). «Обзор биологии Flavobacterium Psychrophilum, клинических признаков, профилактики и лечения бактериальных заболеваний, вызванных холодной водой» (PDF) . Открытый научный журнал о рыбе . 4 (1): 40–48. дои : 10.2174/1874401X01104010040 .

[Declercq_2013-11] Jump up to: ^а ^б ^с Деклерк А.М., Хезебрук Ф., Ван ден Брук В., Боссье П., Декостер А. (апрель 2013 г.). «Болезнь Columnaris у рыб: обзор с акцентом на взаимодействие бактерии с хозяином» . Ветеринарное исследование . 44 (1): 27. дои : 10.1186/1297-9716-44-27 . ПМЦ 3648355 . ПМИД 23617544 .

[NCBI_taxonomy_database-12] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот «Флавобактерии» . Таксономическая база данных NCBI . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 7 марта 2023 г.

[Waśkiewicz_2014-13] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л Васкевич А, Ижиковска Л (2014). «Flavobacterium spp. – Характеристики, распространенность и токсичность». Энциклопедия пищевой микробиологии : 938–942. дои : 10.1016/B978-0-12-384730-0.00126-9 . ISBN 978-0-12-384733-1 .

[Loch_2015-14] Jump up to: ^а ^б Лох Т.П., Фейсал М. (май 2015 г.). «Новые флавобактериальные инфекции у рыб: обзор» . Журнал перспективных исследований . 6 (3): 283–300. дои : 10.1016/j.jare.2014.10.009 . ПМЦ 4522593 . ПМИД 26257926 .

[15] «Виды Flavobacterium aquatile» . ЛПСН . Проверено 25 марта 2023 г.

[16] Кайзер Д. (2009). «Миксококк». Энциклопедия микробиологии (Третье изд.): 220–244. дои : 10.1016/B978-012373944-5.00018-3 . ISBN 978-0-12-373944-5 .

[pmid26498445-17] Догри И., Родригес С., Базир А., Дюфур А., Акбар Д., Шопена В., Сабле С., Ланнелюк I (октябрь 2015 г.). «Морские бактерии с французского атлантического побережья, демонстрирующие высокие способности к образованию биопленок и различную трехмерную архитектуру биопленок» . БМК Микробиология . 15 : 231. дои : 10.1186/s12866-015-0568-4 . ПМЦ 4619314 . ПМИД 26498445 .

[Fernández-Gómez_2019-18] Jump up to: ^а ^б Фернандес-Гомес Б., Диес Б., Польц М.Ф., Арройо Х.И., Альфаро Ф.Д., Маршандон Г. и др. (февраль 2019 г.). «Структура бактериального сообщества в симпатической среде обитания, расширяющейся с глобальным потеплением: солоноватый ледяной рассол на 85-90 ° с.ш.» . Журнал ISME . 13 (2): 316–333. Бибкод : 2019ISMEJ..13..316F . дои : 10.1038/s41396-018-0268-9 . ПМК 6331608 . ПМИД 30228379 .

[Cleary_2017-19] Jump up to: ^а ^б Клири Д.Ф., Коэльо Ф.Дж., Оливейра В., Гомес, Северная Каролина, Полония, Ар. (2017). «Глубина отложений и среда обитания как предсказатели разнообразия и состава донных бактериальных сообществ в приливно-отливной среде эстуария». Морская экология . 38 (2): e12411. Бибкод : 2017MarEc..38E2411C . дои : 10.1111/maec.12411 .

[Zamora_2013-20] Jump up to: ^а ^б Самора Л., Вела А.И., Санчес-Порро С., Паласиос М.А., Домингес Л., Мур Э.Р., Вентоса А., Фернандес-Гарайсабаль Х.Ф. (декабрь 2013 г.). «Характеристика флавобактерий, возможно, связанных с рыбой и средой рыбоводческих ферм. Описание трех новых видов Flavobacterium: Flavobacterium Collinsii sp. Nov., Flavobacterium Branchiarum Sp. Nov. и Flavobacterium Branchiicola Sp. Nov.». Аквакультура . 416–417: 346–353. Бибкод : 2013Aquac.416..346Z . doi : 10.1016/j.aquacultural.2013.09.019 .

[Shewan_1983-21] Jump up to: ^а ^б Шеван Дж. М., МакМикин Т. А. (октябрь 1983 г.). «Таксономия (и экология) Flavobacterium и родственных родов». Ежегодный обзор микробиологии . 37 (1): 233–252. дои : 10.1146/annurev.mi.37.100183.001313 . ПМИД 6357052 .

[22] Людериц О., Фрейденберг М.А., Галанос К., Леманн В., Ритшель Э.Т., Шоу Д.Х. (январь 1982 г.). «Липополисахариды грамотрицательных бактерий». Актуальные темы мембран и транспорта . Том. 17. Эльзевир. стр. 79–151. дои : 10.1016/s0070-2161(08)60309-3 . ISBN 978-0-12-153317-5 .

[Shrivastava_2015-23] Jump up to: ^а ^б ^с Шривастава А., Берг Х.К. (декабрь 2015 г.). «К модели скольжения флавобактерий» . Современное мнение в микробиологии . 28 : 93–97. дои : 10.1016/j.mib.2015.07.018 . ПМЦ 4688146 . ПМИД 26476806 .

[McBride_2013-24] Jump up to: ^а ^б ^с Макбрайд MJ, Чжу Ю (январь 2013 г.). «Гены скользящей подвижности и системы секреции Por широко распространены среди представителей типа bacteroidetes» . Журнал бактериологии . 195 (2): 270–278. дои : 10.1128/JB.01962-12 . ПМЦ 3553832 . ПМИД 23123910 .

[Olson-2018-25] Jump up to: ^а ^б Олсон Д.К., Ёсидзава С., Бёф Д., Ивасаки В., Делонг Э.Ф. (апрель 2018 г.). «Изменчивость и распределение протеородопсина в субтропическом круговороте северной части Тихого океана» . Журнал ISME . 12 (4): 1047–1060. Бибкод : 2018ISMEJ..12.1047O . дои : 10.1038/s41396-018-0074-4 . ПМЦ 5864233 . ПМИД 29476140 .

[26] «Последние достижения в области флавобактерий: механизмы патогенеза, новые генетические и физиологические особенности и взаимодействие с хозяевами» . Микробная физиология и метаболизм – через границы.

[Silverstein_2009-27] Jump up to: ^а ^б Сильверстайн Дж.Т., Вальехо Р.Л., Палти Ю., Лидс Т.Д., Рексроуд CE, Уэлч Т.Дж. и др. (март 2009 г.). «Устойчивость радужной форели к бактериальному заболеванию холодной воды умеренно наследуется и не имеет отрицательной корреляции с ростом» (PDF) . Журнал зоотехники . 87 (3): 860–867. дои : 10.2527/jas.2008-1157 . ПМИД 19028851 .

[García-López_1999-28] Jump up to: ^а ^б Гарсия-Лопес М., Сантос Дж., Отеро А. (январь 1999 г.), «FLAVOBACTERIUM», в Робинсоне Р.К. (ред.), Энциклопедия пищевой микробиологии , Оксфорд: Elsevier, стр. 820–826, doi : 10.1006/rwfm.1999.0660 , ISBN 978-0-12-227070-3

[Booth_2007-29] Jump up to: ^а ^б Бут Дж. (январь 2007 г.), Энна С.Дж., Байлунд Д.Б. (ред.), «Chryseobacterium и инфекции родственных родов», xPharm: Комплексный справочник по фармакологии , Нью-Йорк: Elsevier, стр. 1–4, doi : 10.1016/b978-008055232 -3.62958-7 , ISBN 978-0-08-055232-3

[pmid27098502-30] Нисиока Т., Эльшаркави М.М., Суга Х., Кагеяма К., Хякумати М., Симидзу М. (июнь 2016 г.). «Разработка питательной среды для выделения флавобактерий и хризеобактерий из ризосферной почвы» . Микробы и окружающая среда . 31 (2): 104–10. дои : 10.1264/jsme2.ME15144 . ПМЦ 4912144 . ПМИД 27098502 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]

[25]

[26]

[27]

[28]

[29]

[30]