НДУФАФ3

НДУФАФ3
Идентификаторы
Псевдонимы	NDUFAF3 , 2P1, C3orf60, E3-3, фактор сборки комплекса NADH:убихиноноксидоредуктаза 3, MC1DN18
Внешние идентификаторы	Опустить : 612911 ; МГИ : 1913956 ; Гомологен : 32460 ; GeneCards : NDUFAF3 ; OMA : NDUFAF3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	49,023,495 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	108,444,633 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	left testis; ; right testis; ; apex of heart; ; right auricle; ; C1 segment; ; right adrenal gland; ; anterior pituitary; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; right adrenal cortex;
	Top expressed in
	left ventricle; ; interventricular septum; ; spermatocyte; ; adrenal gland; ; proximal tubule; ; right kidney; ; striatum of neuraxis; ; white adipose tissue; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; testicle;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding;
Cellular component	mitochondrial inner membrane; membrane; mitochondrion; nucleus;
Biological process	mitochondrial respiratory chain complex I assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	25915
	66706
	ENSG00000178057
	ENSMUSG00000070283
	Q9BU61
	Q9JKL4
	НМ_199417 ; НМ_199069 ; НМ_199070 ; НМ_199073 ; НМ_199074
	НМ_023247
	НП_951032 ; НП_951033 ; НП_951047 ; НП_951056
	НП_075736
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор сборки субкомплекса 3 НАДН-дегидрогеназы [убихинон] 1 альфа , также известный как 2P1 , E3-3 или C3orf60 , представляет собой белок , который у человека кодируется NDUFAF3 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} NDUFAF3 представляет собой белок сборки митохондрий, участвующий в сборке НАДН-дегидрогеназы (убихинона), также известной как комплекс I , который расположен во внутренней мембране митохондрий и является крупнейшим из пяти комплексов цепи переноса электронов . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Мутации в этом гене связаны с тяжелым дефицитом комплекса I и синдромом Ли . ^{[ 5 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Структура

NDUFAF3 расположен на плече хромосомы экзонов и имеет 7 3 в положении 21,31 . ^{[ 5 ]} Ген NDUFAF3 производит белок массой 20,4 кДа, состоящий из 184 аминокислот . ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} NDUFAF3 кодирует две изоформы , имеющие общий домен DUF498 . последовательность из 35 аминокислот Прогнозы показывают, что изоформа A содержит дополнительную N-концевую и, следовательно, длиннее, чем изоформа B. Дополнительная последовательность может участвовать в нацеливании на митохондрии , поддерживая функцию NDUFAF3 в сборке митохондрий. ^{[ 9 ]}

Функция

НАДН:убихиноноксидоредуктаза (комплекс I) катализирует перенос электронов от НАДН к убихинону (коэнзим Q) на первом этапе дыхательной цепи митохондрий , что приводит к перемещению протонов через внутреннюю мембрану митохондрий. ^{[ 13 ]} Ген NDUFAF3 кодирует белок сборки митохондриального комплекса I, который локализуется на внутренней мембране митохондрий, взаимодействует с субъединицами комплекса I и важен для правильного функционирования дыхательной цепи митохондрий. ^{[ 5 ]}^{[ 9 ]}

NDUFAF3 колокализуется , мигрирует в несколько промежуточных продуктов сборки и является созависимым с NDUFAF4 от ранних до поздних стадий сборки комплекса I. Помимо их тесного взаимодействия друг с другом, NDUFAF3 и NDUFAF4 взаимодействуют с NDUFS2 , NDUFS3 , NDUFS8 и NDUFA5 в рамках трансляционно -зависимого механизма ранней сборки. Предполагается также, что NDUFAF3 участвует в сочетании трансляции митохондрий со вставкой в мембрану в процессе сборки комплекса I. ^{[ 9 ]}

Клиническое значение

Мутации в NDUFAF3 связаны с дефицитом комплекса I и митохондриальными заболеваниями . Эти нарушения являются результатом дисфункции дыхательной цепи митохондрий и могут вызывать широкий спектр клинических проявлений от летальных неонатальных заболеваний до нейродегенеративных расстройств, возникающих во взрослом возрасте . Фенотипы включают макроцефалию с прогрессирующей лейкодистрофией , неспецифическую энцефалопатию , кардиомиопатию , миопатию , заболевание печени , синдром Лея , наследственную оптическую нейропатию Лебера и некоторые формы болезни Паркинсона . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Мутации включали гомозиготные варианты c.494C > T; п.(Ала165Вал), ^{[ 10 ]} c.365 G→C, приводящий к R122P, и c.2 T→C, приводящий к M1T. ^{[ 9 ]} Клинически мутации NDUFAF3 связаны с синдромом Лея. ^{[ 10 ]} и тяжелый дефицит комплекса I. ^{[ 9 ]} Некоторые общие признаки и симптомы включают лактоацидоз , нистагм , гипотонию и поражения головного мозга . ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Взаимодействия

Помимо кокомплексов, NDUFAF3 имеет белок-белковые взаимодействия с NDUFAF4. ^{[ 14 ]} и СНРПА . ^{[ 15 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000178057 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070283 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д «NDUFAF3 НАДН: фактор сборки комплекса убихинон оксидоредуктаза 3 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 25 июля 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б «NDUFAF3 - НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-субкомплекс фактор сборки 3 - Homo sapiens (человек) - ген и белок NDUFAF3» . www.uniprot.org . Проверено 25 июля 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б «UniProt: универсальная база знаний о белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (Д1): Д158–Д169. Январь 2017 г. doi : 10.1093/nar/gkw1099 . ПМК 5210571 . ПМИД 27899622 .
^ Дональд Воэт; Джудит Г. Воэт; Шарлотта В. Пратт (2013). "18" Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 100-1 581–620. ISBN 9780470547847 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Саада А., Фогель Р.О., Хофс С.Дж., ван де Бранд М.А., Весселс Х.Дж., Виллемс П.Х., Венселаар Х., Шааг А., Баргути Ф., Рейш О., Шохат М., Хюйнен М.А., Смитинк Дж.А., ван де Хеувел Л.П., Нейтманс Л.Г. (июнь) 2009). «Мутации в NDUFAF3 (C3ORF60), кодирующем белок сборки комплекса I, взаимодействующий с NDUFAF4 (C6ORF66), вызывают фатальные митохондриальные заболевания новорожденных» . Американский журнал генетики человека . 84 (6): 718–27. дои : 10.1016/j.ajhg.2009.04.020 . ПМК 2694978 . ПМИД 19463981 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Бартлинг Ф., Санчес-Кабальеро Л., Тимал С., ван ден Бранд М.А., Нгу Л.Х., Дистельмайер Ф., Роденбург Р.Дж., Нейтманс Л.Г. (март 2017 г.). «Мутации в факторе сборки митохондриального комплекса I NDUFAF3 вызывают синдром Лея». Молекулярная генетика и обмен веществ . 120 (3): 243–246. дои : 10.1016/j.ymgme.2016.12.005 . ПМИД 27986404 .
^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
^ Яо, Дэниел. «Атлас знаний сердечных органелларных белков (COPaKB) — информация о белках» . www.amino.heartproteome.org . Проверено 25 июля 2018 г.
^ Справочник, Дом генетики. «Ген NDUFAF1» . Домашний справочник по генетике . Проверено 25 июля 2018 г.
^ «ндуфаф3-ндуфаф4» . Нетронутый . ЭМБЛ-ЭБИ.
^ "ndufaf3-snrpa-1" . Нетронутый . ЭМБЛ-ЭБИ.

Дальнейшее чтение

Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Е., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Ленер Б., Сандерсон К.М. (июль 2004 г.). «Схема взаимодействия белков для деградации мРНК человека» . Геномные исследования . 14 (7): 1315–23. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Симпсон Дж.К., Велленройтер Р., Пустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, выявленная с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК» . Отчеты ЭМБО . 1 (3): 287–92. дои : 10.1093/embo-reports/kvd058 . ПМЦ 1083732 . ПМИД 11256614 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .

Внешние ссылки

Расположение генома человека NDUFAF3 и NDUFAF3 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000178057 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000070283 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[:0-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д «NDUFAF3 НАДН: фактор сборки комплекса убихинон оксидоредуктаза 3 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 25 июля 2018 г.

[:1-6] Перейти обратно: ^а ^б «NDUFAF3 - НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-субкомплекс фактор сборки 3 - Homo sapiens (человек) - ген и белок NDUFAF3» . www.uniprot.org . Проверено 25 июля 2018 г.

[:4-7] Перейти обратно: ^а ^б «UniProt: универсальная база знаний о белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (Д1): Д158–Д169. Январь 2017 г. doi : 10.1093/nar/gkw1099 . ПМК 5210571 . ПМИД 27899622 .

[Biochem-8] Дональд Воэт; Джудит Г. Воэт; Шарлотта В. Пратт (2013). "18" Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 100-1 581–620. ISBN 9780470547847 .

[:5-9] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Саада А., Фогель Р.О., Хофс С.Дж., ван де Бранд М.А., Весселс Х.Дж., Виллемс П.Х., Венселаар Х., Шааг А., Баргути Ф., Рейш О., Шохат М., Хюйнен М.А., Смитинк Дж.А., ван де Хеувел Л.П., Нейтманс Л.Г. (июнь) 2009). «Мутации в NDUFAF3 (C3ORF60), кодирующем белок сборки комплекса I, взаимодействующий с NDUFAF4 (C6ORF66), вызывают фатальные митохондриальные заболевания новорожденных» . Американский журнал генетики человека . 84 (6): 718–27. дои : 10.1016/j.ajhg.2009.04.020 . ПМК 2694978 . ПМИД 19463981 .

[:2-10] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д Бартлинг Ф., Санчес-Кабальеро Л., Тимал С., ван ден Бранд М.А., Нгу Л.Х., Дистельмайер Ф., Роденбург Р.Дж., Нейтманс Л.Г. (март 2017 г.). «Мутации в факторе сборки митохондриального комплекса I NDUFAF3 вызывают синдром Лея». Молекулярная генетика и обмен веществ . 120 (3): 243–246. дои : 10.1016/j.ymgme.2016.12.005 . ПМИД 27986404 .

[11] Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .

[12] Яо, Дэниел. «Атлас знаний сердечных органелларных белков (COPaKB) — информация о белках» . www.amino.heartproteome.org . Проверено 25 июля 2018 г.

[13] Справочник, Дом генетики. «Ген NDUFAF1» . Домашний справочник по генетике . Проверено 25 июля 2018 г.

[14] «ндуфаф3-ндуфаф4» . Нетронутый . ЭМБЛ-ЭБИ.

[15] "ndufaf3-snrpa-1" . Нетронутый . ЭМБЛ-ЭБИ.

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]