TCF21 (ген)
| TCF21 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | TCF21 , POD1, bHLHa23, фактор транскрипции 21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 603306 ; МГИ : 1202715 ; Гомологен : 2414 ; Генные карты : TCF21 ; OMA : TCF21 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Фактор транскрипции 21 (TCF21), также известный как pod-1, капсулирующий или эпикардин, представляет собой белок , который у человека кодируется TCF21 геном на хромосоме 6 . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Он повсеместно экспрессируется во многих тканях и типах клеток и в значительной степени экспрессируется в легких и плаценте . [ 8 ] TCF21 имеет решающее значение для развития ряда типов клеток во эмбриогенеза сердца время . [ 9 ] легкое, [ 10 ] почка , [ 10 ] и селезенка . [ 11 ] TCF21 также дерегулируется при некоторых типах рака и, таким образом, известен как супрессор опухоли . [ 12 ] Ген TCF21 также содержит один из 27 SNP , связанных с повышенным риском развития ишемической болезни сердца . [ 13 ]
Открытие
[ редактировать ]TCF21 был обнаружен в 1998 году при поиске новых белков bHLH, специфичных для клеточного типа, экспрессируемых в почках человека и мыши, путем выполнения поиска в базах данных меток экспрессируемых последовательностей (EST). [ 6 ] Поскольку обнаруженный ими транскрипт был высоко экспрессирован в эпителиальных клетках висцерального клубочка ( подоцитах ), TCF21 получил название Pod-1. Сравнение Pod-1 с ранее охарактеризованными белками bHLH идентифицировало Pod-1 как нового члена подсемейства белков bHLH, играющих важную роль в мезодермальном развитии. [ 6 ] Хромосомное расположение Pod-1 у мышей затем определяли с использованием панели межвидового обратного скрещивания вместе с геномным Саузерн-блот-анализом для идентификации полиморфизмов длины рестрикционных фрагментов (RFLP) между инбредными линиями мышей. Анализ показал, что Pod-1 картируется в области мышиной хромосомы 10, которая является синтенной с человеческой хромосомой 6q23-q24. [ 6 ]
Распределение Pod-1 в тканях определяли путем гибридизации нозерн-блоттинга множества тканей человека с кДНК Pod-1. Зонд, лишенный домена bHLH, использовали для минимизации перекрестной реактивности наряду с гибридизацией и промывкой в строгой форме. Результаты показали, что у людей и мышей Pod-1 наиболее высоко экспрессируется в почках, легких и сердце, с избирательной экспрессией в местах эпителиально-мезенхимального взаимодействия в почках, легких, кишечнике и поджелудочной железе развивающихся эмбрионов мыши. [ 6 ] Гибридизация РНК in situ с использованием 33 Рибозонды, меченные P, использовали для идентификации типов клеток, экспрессирующих Pod-1 в развивающихся почках и других тканях. Это выявило экспрессию Pod-1 в мезенхимальных клетках и подоцитах, причем экспрессия совпадает с началом дифференцировки подоцитов. [ 6 ] Было обнаружено, что экспрессия Pod-1 в эксплантатах эмбриональных почек ингибируется антисмысловыми олигонуклеотидами. Это ингибирование привело к уменьшению конденсации мезенхимальных клеток вокруг зачатка мочеточника и значительному уменьшению ветвления мочеточника. Pod-1 был первым тканеограниченным белком bHLH, который был идентифицирован в развивающейся почке и связан с регуляцией морфогенетических событий. [ 6 ]
В попытке идентифицировать новые факторы bHLH, связанные с dHAND и eHAND (новый подкласс факторов bHLH, ограниченных типом клеток, которые, как показано, играют важную роль в сердечном морфогенезе), они проверили базы данных экспрессируемых последовательностей (EST) на наличие последовательностей, гомологичных с bHLH. регионы действия этих факторов. [ 14 ] Новый белок bHLH, который они выявили в ходе поиска, также назывался Pod-1, но они использовали название «капсулин».
Гибридизация транскриптов капсулина in situ была использована для определения сайтов экспрессии, которые оказались специфичными для мезодермальных клеток-предшественников, которые окружают эпителий развивающихся желудочно-кишечных, мочеполовых и дыхательных систем во время эмбриогенеза мышей. [ 15 ] Характер экспрессии мРНК капсулина в тканях взрослых мышей с помощью нозерн-блоттинга выявил самые высокие уровни в легких и более низкие уровни в почках, сердце и селезенке. Также было обнаружено, что транскрипты капсулина отмечают спиральную перегородку сердца и клетки-предшественники, которые дают начало перикарду и коронарным артериям. [ 15 ]
Капсулин транслировали в лизате ретикулоцитов кролика в присутствии и в отсутствие широко экспрессируемого белка E12 bHLH и проводили анализы сдвига подвижности в геле с использованием нескольких последовательностей E-box в качестве зондов для проверки ДНК-связывающей активности белка. [ 15 ] Капсулин сам по себе не смог связать ни одну из протестированных последовательностей. Однако в присутствии E12 плюс капсулин с зондом образовывался комплекс ДНК, который мигрировал быстрее, чем один только гомодимерный комплекс E12, что представляет собой связывание гетеродимеров капсулин/E12. [ 15 ] Был сделан вывод, что капсулин гетеродимеризуется с E12 и связывает специфическую консенсусную последовательность E-box (CANNTG), хотя и не активирует транскрипцию через эту последовательность самостоятельно. Его ограниченный характер экспрессии и активность связывания ДНК идентифицировали капсулин как регулятор экспрессии генов в определенных подтипах висцеральных мезодермальных клеток, участвующих в органогенезе, и в клетках-предшественниках, которые вносят вклад в перикард, коронарные артерии и области сердца. [ 15 ]
Структура
[ редактировать ]Ген
[ редактировать ]Ген TCF21 расположен на хромосоме 6 в участке 6q23.2 и включает 3 экзона . [ 7 ] Эти три экзона связаны с CpG-островками CGI1, CGI2 и CGI3. Анализ метилирования ДНК выявил гиперметилирование CGI1 и CGI3, но не CGI2 в образцах из различных раковых тканей. [ 16 ] люциферазы Репортерные анализы с использованием конструкций, охватывающих последовательности CGI3 в смысловой и антисмысловой ориентации, показали, что CGI3 содержит промотор , который направляет синтез ранее неизвестных длинных некодирующих РНК (днРНК) в антисмысловой ориентации по отношению к TCF21. Эта днРНК была названа TARID (от антисмысловой РНК TCF21, вызывающей деметилирование). [ 17 ]
Белок
[ редактировать ]TCF21 является членом bHLH (основная спираль-петля-спираль) семейства транскрипционных факторов . [ 18 ] Предполагается, что этот белок будет состоять из 179 аминокислотных остатков и содержит домен bHLH и богатую аргинином последовательность, которая может способствовать связыванию ДНК. [ 19 ]
Функция
[ редактировать ]
TCF21 кодирует транскрипционный фактор семейства «спираль-петля-спираль » (bHLH), который управляет спецификацией, детерминацией и дифференцировкой клеточной судьбы в различных клеточных линиях во время развития. [ 9 ] Продукт TCF21 специфичен для мезодермы и экспрессируется в эмбриональном эпикарде , мезенхимальных тканях легких, кишечника, гонад, а также в мезенхимальных и гломерулярных эпителиальных клетках почек. [ 7 ]
TCF21 необходим для регулирования свойств мезенхимы, которые критически важны для некоторых аспектов морфогенеза легких и почек. [ 10 ] TCF21 также важен для судьбы клеток сердечных фибробластов , о чем свидетельствует неудачное развитие сердечных фибробластов у мышей, лишенных TCF21. [ 9 ] В отсутствие TCF21 эти клетки-предшественники фибробластов не подвергаются эпителиально-мезенхимальному переходу (EMT). Хотя эпикардиальные клетки, экспрессирующие TCF21, изначально мультипотентны, со временем они становятся привязанными к линии фибробластов. Те клетки, экспрессирующие TCF21, которые не связаны с линией фибробластов, теряют эту экспрессию и остаются недифференцированными эпикардиальными клетками или гладкомышечными клетками коронарных сосудов. [ 9 ] TCF21 экспрессируется в мезодермальных клетках проэпикардиального органа, которые дают начало коронарной артерии гладкомышечным клеткам (SMC), а потеря TCF21 приводит к усилению экспрессии гладкомышечных маркеров клетками на поверхности сердца, что соответствует преждевременной дифференцировке SMC. Это предполагает, что ранняя экспрессия TCF21 важна для расширения компартмента SMC коронарного кровообращения, при этом постоянная экспрессия TCF21 необходима для развития сердечных фибробластов. [ 20 ]
Активация TCF21 направляется антисмысловой длинной некодирующей РНК TARID (антисмысловая РНК TCF21, индуцирующая деметилирование). TARID активирует экспрессию TCF21, индуцируя деметилирование промотора, и влияет на уровни экспрессии генов-мишеней, действуя в качестве эпигенетических регуляторов структуры хроматина посредством взаимодействия с модификаторами гистонов , комплексами ремоделирования хроматина , регуляторами транскрипции и/или механизмом метилирования ДНК . [ 17 ]
Роль в развитии
[ редактировать ]После выявления значимости Tcf21 в различных клеточных линиях дальнейшие исследования расширили понимание важной роли этого гена.
TCF21 необходим для регулирования свойств мезенхимы, которые критически важны для некоторых аспектов морфогенеза легких и почек. Мыши с нулевой мутацией TCF21 рождаются, но вскоре умирают из-за серьезной гипоплазии легких и почек, в которых отсутствуют альвеолы и зрелые клубочки. [ 10 ] Хотя TCF21 экспрессируется исключительно в мезенхиме и подоцитах, основные дефекты наблюдаются в прилегающем эпителии мышей с мутантом TCF21. В почках TCF21 необходим для превращения конденсирующейся мезенхимы в эпителий нефрона, морфогенеза ветвления и терминальной дифференцировки канальцевого эпителия. В легких TCF21 необходим для правильного формирования проксимодистальной оси эпителия дыхательных путей и для возникновения нормального ветвления. [ 10 ]
Мыши с нулевым TCF21 также не способны формировать селезенку, поскольку TCF21 действует после спецификации селезенки, чтобы контролировать морфогенетическое расширение зачатка селезенки, а в его отсутствие клетки-предшественники селезенки подвергаются апоптозу. [ 11 ] Поскольку этот фенотип селезенки напоминает таковой у мышей, лишенных гомеобоксных генов Hox11 и Bapx1, возможно, что TCF21 вместе с Hox11 и Bapx1 контролируют общую важную раннюю стадию онтогенетического пути органогенеза селезенки. [ 11 ]
TCF21 важен для судьбы клеток сердечных фибробластов, о чем свидетельствует неудачное развитие сердечных фибробластов у мышей, лишенных TCF21. [ 9 ] В отсутствие TCF21 эти клетки-предшественники фибробластов не подвергаются эпителиально-мезенхимальному переходу (ЕМТ). Хотя эпикардиальные клетки, экспрессирующие TCF21, изначально мультипотентны, со временем они становятся привязанными к линии фибробластов. Те клетки, экспрессирующие TCF21, которые не связаны с линией фибробластов, теряют эту экспрессию и остаются недифференцированными эпикардиальными клетками или гладкомышечными клетками коронарных сосудов. [ 9 ] TCF21 экспрессируется в мезодермальных клетках проэпикардиального органа, которые дают начало гладкомышечным клеткам коронарной артерии (SMC), а потеря TCF21 приводит к усилению экспрессии гладкомышечных маркеров клетками на поверхности сердца, что соответствует преждевременной дифференцировке SMC. Это предполагает, что ранняя экспрессия TCF21 важна для расширения компартмента SMC коронарного кровообращения, при этом постоянная экспрессия TCF21 необходима для развития сердечных фибробластов. [ 20 ]
Сообщается, что самцы мышей с нокаутом TCF21, которые умирают при рождении из-за дыхательной недостаточности, имеют феминизированные гениталии, что указывает на участие TCF21 в развитии/дифференцировке гонад у мышей. [ 21 ] TCF21 транскрипционно репрессирует стероидогенный фактор 1 (Sf1), регулятор экспрессии гена, который опосредует половую дифференцировку и участвует в координации решений судьбы клеток в предшественниках гонад. [ 21 ] Без TCF21 нормальное развитие гонад нарушается в результате эктопической экспрессии Sf1, что приводит к аномальной коммитации урогенитальных клеток-предшественников к судьбам стероидогенных клеток. В гонаде XY это нарушение организации способствует изменениям в структуре яичек и сосудистой сети. [ 21 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]В качестве супрессора рака
[ редактировать ]У людей TCF21 был идентифицирован как кандидатный ген-супрессор опухоли, и его часто эпигенетически подавляют при различных видах рака человека.
Геномное сканирование рестрикционных ориентиров (RLGS) вдоль области рецидивирующей потери гетерозиготности (LOH) на хромосоме 6q23-q24 для определения профиля метилирования ДНК использовалось для проверки гипотезы о том, что аномальное метилирование промотора может помочь точно определить местоположение кандидата-супрессора опухоли в областях ЛОХ. 6q23-q24 была выбрана хромосомная область из-за часто описываемого LOH при плоскоклеточном раке головы и шеи человека (HNSCC) и немелкоклеточном раке легких (НМРЛ), а также в других типах опухолей, но без идентифицированного опухолевого супрессора. [ 12 ] Было обнаружено, что гиперметилирование часто происходит в одних и тех же локусах RLGS при HNSCC и NSCLC. Секвенирование бисульфита натрия дополнительно выявило опухолеспецифическое метилирование TCF21 по сравнению с нормальным контролем. Образцы РНК были выделены из опухолевых тканей и проанализированы для корреляции количества мРНК TCF21 и метилирования ДНК в образцах. В целом, образцы опухолей с более высокими уровнями гиперметилирования CpG-островков снижали экспрессию TCF21, чем нормальный контроль. [ 12 ] Экзогенная экспрессия TCF21 в клетках с молчащими эндогенными локусами TCF21 приводила к снижению свойств опухоли как in vitro, так и in vivo. На основании этих результатов был сделан вывод, что TCF21 является геном-супрессором опухоли, который часто подавляется гиперметилированием при раке. [ 12 ]
TCF21 также связан с метастатическим прогрессированием меланомы посредством ингибирования гена-супрессора метастазов KISS1. [ 22 ] Анализ метилирования ДНК в биоптатах пациентов с меланомой продемонстрировал снижение уровня TCF21 из-за гиперметилирования промотора, что также коррелирует со снижением выживаемости у пациентов, страдающих метастатической меланомой кожи. [ 22 ] TCF21 вместе с E12 и TCF12 связывается с промотором KISS1, поддерживая его активность. Без взаимодействия TCF21 с промотором KISS1 экспрессия KISS1 теряется. Также было обнаружено, что клетки меланомы, сверхэкспрессирующие TCF21, демонстрируют пониженную подвижность по сравнению с контрольными клетками, содержащими только вектор. [ 22 ]
Исследования рака легких, вызванного табакокурением, показали, что TCF21 входит в число генов, идентифицированных как сильно метилированные как при высоких, так и при низких концентрациях конденсата сигаретного дыма (CSC). В присутствии генистеина, одного из биоактивных изофлавонов, полученных из сои, метилирование TCF21 значительно снижается. [ 23 ] Известно, что генистеин влияет на онкогенез посредством эпигенетической регуляции, такой как конфигурация хроматина и метилирование ДНК, активируя другие гены-супрессоры опухолей, которые влияют на выживаемость раковых клеток. [ 24 ] Эти данные подтверждают гипотезу о том, что увеличение количества гиперметилированных генов-супрессоров опухолей, таких как TCF21, является потенциальным химиопрофилактическим путем при раке легких, вызванном табакокурением. [ 23 ]
TCF21 может также иметь терапевтический потенциал для лечения рака молочной железы, поскольку снижение уровня TCF21 участвует в онкогенезе и пролиферации рака молочной железы. [ 15 ] Экспрессия мРНК TCF21 в клетках рака молочной железы очень низкая по сравнению с нормальными эпителиальными клетками молочной железы. Эта низкая экспрессия также связана с большим размером опухоли и метастазами в лимфатические узлы. В тканях рака молочной железы наблюдается значительно сниженная экспрессия мРНК TCF21, а сверхэкспрессия мРНК TCF21, как было обнаружено, ингибирует пролиферацию раковых клеток. [ 15 ]
Клинический маркер
[ редактировать ]Метилирование TCF21 рассматривается как потенциальный клинический маркер при диагностике почечно-клеточного рака. [ 25 ] Соответственно, уровни метилирования TCF21 в образцах мочи могут быть полезным средством диагностики почечно-клеточного рака. Кроме того, полиморфизм rs12190287 TCF21 может регулировать экспрессию TCF21 и может служить потенциальным маркером генетической предрасположенности к раку молочной железы. [ 26 ]
Кроме того, мультилокусное исследование оценки генетического риска, основанное на комбинации 27 локусов, включая ген TCF21, выявило лиц с повышенным риском как возникновения, так и рецидивов ишемической болезни сердца, а также увеличило клиническую пользу от терапии статинами. Исследование было основано на групповом исследовании на уровне сообщества (исследование «Диета Мальмё и рак») и четырех дополнительных рандомизированных контролируемых исследованиях когорт первичной профилактики (JUPITER и ASCOT) и когорт вторичной профилактики (CARE и PROVE IT-TIMI 22). [ 27 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000118526 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000045680 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Лотфи К.Ф., Пассайя Б.С., Кремер Дж.Л. (2021). «Роль транскрипционного фактора bHLH TCF21 в развитии и онкогенезе» . Бразильский журнал медицинских и биологических исследований . 54 (5): e10637. дои : 10.1590/1414-431X202010637 . ПМЦ 7959166 . ПМИД 33729392 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Кваггин С.Е., Ванден Хеувел ГБ, Игараси П. (февраль 1998 г.). «Pod-1, специфичный для мезодермы белок «основная спираль-петля-спираль», экспрессируемый в мезенхимальных и гломерулярных эпителиальных клетках развивающейся почки» . Механизмы развития . 71 (1–2): 37–48. дои : 10.1016/S0925-4773(97)00201-3 . ПМИД 9507058 . S2CID 17400923 .
- ^ Jump up to: а б с «Ген Энтрез: транскрипционный фактор 21 TCF21» .
- ^ «BioGPS – ваша генная портальная система» . biogps.org . Проверено 11 октября 2016 г.
- ^ Jump up to: а б с д и ж Ачарья А, Бэк С.Т., Хуанг Г., Эскиокак Б., Гетч С., Сунг С.И., Банфи С., Зауэр М.Ф., Олсен Г.С., Даффилд Дж.С., Олсон Э.Н., Талквист М.Д. (июнь 2012 г.). «Транскрипционный фактор bHLH Tcf21 необходим для специфической для линии ЭМП предшественников сердечных фибробластов» . Разработка . 139 (12): 2139–49. дои : 10.1242/dev.079970 . ПМК 3357908 . ПМИД 22573622 .
- ^ Jump up to: а б с д и Кваггин С.Е., Шварц Л., Куи С., Игараси П., Даймлинг Дж., Пост М., Россант Дж. (декабрь 1999 г.). «Белок pod1 основная спираль-петля-спираль критически важен для органогенеза почек и легких». Разработка . 126 (24): 5771–83. дои : 10.1242/dev.126.24.5771 . ПМИД 10572052 .
- ^ Jump up to: а б с Лу Дж., Чанг П., Ричардсон Дж.А., Ган Л., Вейлер Х., Олсон Э.Н. (август 2000 г.). «Основной фактор транскрипции спираль-петля-спираль капсулулин контролирует органогенез селезенки» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (17): 9525–30. дои : 10.1073/pnas.97.17.9525 . ПМК 16898 . ПМИД 10944221 .
- ^ Jump up to: а б с д Смит Л.Т., Лин М., Брена Р.М., Ланг Дж.К., Шуллер Д.Е., Оттерсон Г.А., Моррисон КД, Смираглия DJ, Пласс С (январь 2006 г.). «Эпигенетическая регуляция гена-супрессора опухоли TCF21 на 6q23-q24 при раке легких, головы и шеи» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (4): 982–7. Бибкод : 2006PNAS..103..982S . дои : 10.1073/pnas.0510171102 . ПМК 1348006 . ПМИД 16415157 .
- ^ Мега Дж.Л., Ститциел Н.О., Смит Дж.Г., Чесман Д.И., Колфилд М.Дж., Девлин Дж.Дж. и др. (июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза терапии статинами: анализ исследований первичной и вторичной профилактики» . Ланцет . 385 (9984): 2264–71. дои : 10.1016/S0140-6736(14)61730-X . ПМЦ 4608367 . ПМИД 25748612 .
- ^ Лу Дж., Ричардсон Дж. А., Олсон Э. Н. (апрель 1998 г.). «Капсулин: новый фактор транскрипции bHLH, экспрессируемый в эпикардиальных предшественниках и мезенхиме висцеральных органов». Механизмы развития . 73 (1): 23–32. дои : 10.1016/s0925-4773(98)00030-6 . ПМИД 9545521 . S2CID 14075581 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Ван Дж, Гао X, Ван М, Чжан Дж (ноябрь 2015 г.). «Клинико-патологическое значение и биологическая роль мРНК TCF21 при раке молочной железы». Биология опухолей . 36 (11): 8679–83. дои : 10.1007/s13277-015-3476-1 . ПМИД 26044559 . S2CID 24587856 .
- ^ Араб К., Парк Ю.Дж., Линдрот А.М., Шефер А., Оукс К., Вайхенхан Д., Луканова А., Лундин Е., Риш А., Мейстер М., Динеманн Х., Дюкхофф Г., Херольд-Менде К., Груммт И., Ньерс К., Пласс К. ( август 2014 г.). «Длинная некодирующая РНК TARID направляет деметилирование и активацию супрессора опухоли TCF21 через GADD45A» . Молекулярная клетка . 55 (4): 604–14. doi : 10.1016/j.molcel.2014.06.031 . ПМИД 25087872 .
- ^ Jump up to: а б Ринн Дж.Л., Чанг ХИ (2012). «Регуляция генома длинными некодирующими РНК» . Ежегодный обзор биохимии . 81 : 145–66. doi : 10.1146/annurev-biochem-051410-092902 . ПМЦ 3858397 . ПМИД 22663078 .
- ^ «TCF21 - Транскрипционный фактор 21 - Homo sapiens (Человек) - ген и белок TCF21» . www.uniprot.org . Проверено 11 октября 2016 г.
- ^ Хидай Х., Бардалес Р., Гудвин Р., Квертермус Т., Квертермус Э.Э. (апрель 1998 г.). «Клонирование капсулина, основного фактора спираль-петля-спираль, экспрессируемого в клетках-предшественниках перикарда и коронарных артерий». Механизмы развития . 73 (1): 33–43. дои : 10.1016/s0925-4773(98)00031-8 . ПМИД 9545526 . S2CID 18884227 .
- ^ Jump up to: а б Сазонова О, Чжао Ю, Нюрнберг С, Миллер С, Пьянич М, Кастано ВГ, Ким Дж. Б., Сальфати Э. Л., Кундадже А.Б., Беджерано Г, Ассимес Т, Ян Х, Квертермус Т (май 2015 г.). «Характеристика нижестоящих целевых областей TCF21 идентифицирует транскрипционную сеть, связывающую множество независимых локусов ишемической болезни сердца» . ПЛОС Генетика . 11 (5): e1005202. дои : 10.1371/journal.pgen.1005202 . ПМЦ 4447360 . ПМИД 26020271 .
- ^ Jump up to: а б с Куи С., Росс А., Столлингс Н., Паркер К.Л., Кэпел Б., Кваггин С.Е. (август 2004 г.). «Нарушение гонадогенеза и смена пола от мужского к женскому у мышей с нокаутом Pod1». Разработка . 131 (16): 4095–105. дои : 10.1242/dev.01266 . ПМИД 15289436 . S2CID 42709581 .
- ^ Jump up to: а б с Араб К., Смит Л.Т., Гаст А., Вайченхан Д., Хуанг Дж.П., Клаус Р., Хильшер Т., Эспиноза А.В., Рингель М.Д., Моррисон К.Д., Шадендорф Д., Кумар Р., Пласс С. (октябрь 2011 г.). «Эпигенетическая дерегуляция TCF21 ингибирует супрессор метастазирования KISS1 при метастатической меланоме» . Канцерогенез . 32 (10): 1467–73. дои : 10.1093/carcin/bgr138 . ПМК 3179423 . ПМИД 21771727 .
- ^ Jump up to: а б Лин-Кук Л., Ворд Б., Джордж Н., Лин-Кук Б., Хэммонс Дж. (2014). «Влияние конденсата сигаретного дыма на метилирование промотора гена в клетках легких человека» . Заболевания, вызванные табакокурением . 12 (1): 15. дои : 10.1186/1617-9625-12-15 . ПМК 4160916 . ПМИД 25214829 .
- ^ Чжан Ю, Чен Х (июль 2011 г.). «Генистеин, модификатор эпигенома при профилактике рака» . Эпигенетика . 6 (7): 888–91. дои : 10.4161/epi.6.7.16315 . ПМИД 21610327 .
- ^ Синь Дж, Сюй Р, Линь С, Синь М, Цай В, Чжоу Дж, Фу С, Чжэнь Г, Лай Дж, Ли Ю, Чжан П (август 2016 г.). «Клинический потенциал метилирования TCF21 в диагностике почечно-клеточного рака» . Письма об онкологии . 12 (2): 1265–1270. дои : 10.3892/ol.2016.4748 . ПМЦ 4950740 . ПМИД 27446425 .
- ^ Гао X, Ян Дж, Ван М, Чжан Дж (июнь 2016 г.). «Генетический полиморфизм TCF21 и риск рака молочной железы у китайских женщин» . Онкотаргет . 7 (34): 55757–55764. дои : 10.18632/oncotarget.9825 . ПМК 5342451 . ПМИД 27270650 .
- ^ Мега Дж.Л., Ститциел Н.О., Смит Дж.Г., Чесман Д.И., Колфилд М.Дж., Девлин Дж.Дж., Нордио Ф., Хайд КЛ., Кэннон КП, Сакс Ф.М., Поултер Н.Р., Север П.С., Ридкер П.М., Браунвальд Э., Меландер О, Катиресан С., Сабатин М.С. (июнь 2015 г.). «Генетический риск, события ишемической болезни сердца и клиническая польза терапии статинами: анализ исследований первичной и вторичной профилактики» . Ланцет . 385 (9984): 2264–71. дои : 10.1016/S0140-6736(14)61730-X . ПМЦ 4608367 . ПМИД 25748612 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Сазонова О, Чжао Ю, Нюрнберг С, Миллер С, Пьянич М, Кастано ВГ, Ким Дж. Б., Сальфати Э. Л., Кундадже А.Б., Беджерано Г, Ассимес Т, Ян Х, Квертермус Т (май 2015 г.). «Характеристика нижестоящих целевых областей TCF21 идентифицирует транскрипционную сеть, связывающую множество независимых локусов ишемической болезни сердца» . ПЛОС Генетика . 11 (5): e1005202. дои : 10.1371/journal.pgen.1005202 . ПМЦ 4447360 . ПМИД 26020271 .
- Литтлвуд Т.Д., Эван Дж.И. (1995). «Факторы транскрипции 2: спираль-петля-спираль». Белковый профиль . 2 (6): 621–702. ПМИД 7553065 .
- Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
- Хидай Х., Бардалес Р., Гудвин Р., Квертермус Т., Квертермус Э.Э. (апрель 1998 г.). «Клонирование капсулина, основного фактора спираль-петля-спираль, экспрессируемого в клетках-предшественниках перикарда и коронарных артерий». Механизмы развития . 73 (1): 33–43. дои : 10.1016/S0925-4773(98)00031-8 . ПМИД 9545526 . S2CID 18884227 .
- Робб Л., Мифсуд Л., Хартли Л., Бибен С., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Харви Р.П. (сентябрь 1998 г.). «Эпикардин: новый базовый ген транскрипционного фактора спираль-петля-спираль, экспрессируемый в эпикарде, миобластах жаберных дуг и мезенхиме развивающихся легких, кишечника, почек и гонад» . Динамика развития . 213 (1): 105–13. doi : 10.1002/(SICI)1097-0177(199809)213:1<105::AID-AJA10>3.0.CO;2-1 . ПМИД 9733105 . S2CID 25946118 .
- Сузуки Х, Фукуниси Ю, Кагава И, Сайто Р, Ода Х, Эндо Т, Кондо С, Боно Х, Оказаки Ю, Хаясидзаки Ю (октябрь 2001 г.). «Панель белок-белкового взаимодействия с использованием полноразмерных кДНК мыши» . Геномные исследования . 11 (10): 1758–65. дои : 10.1101/гр.180101 . ПМК 311163 . ПМИД 11591653 .
- Фунато Н., Охяма К., Курода Т., Накамура М. (февраль 2003 г.). «Основной фактор транскрипции спираль-петля-спираль эпикардин/капсулин/Pod-1 подавляет дифференцировку за счет негативной регуляции транскрипции» . Журнал биологической химии . 278 (9): 7486–93. дои : 10.1074/jbc.M212248200 . ПМИД 12493738 .
- Колланд Ф, Жак Икс, Труплен В, Мужен С, Гроазело С, Гамбургер А, Мейл А, Войчик Дж, Легрен П, Готье ЖМ (июль 2004 г.). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека» . Геномные исследования . 14 (7): 1324–32. дои : 10.1101/гр.2334104 . ПМК 442148 . ПМИД 15231748 .