Форманы

Формин гомологический регион 1
Формин гомологический регион 1
Идентификаторы
Символ	Drf_fh1
Pfam	PF06346
InterPro	IPR009408
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Форма 1
Форма 1
Идентификаторы
Символ	FMN1
Альт. символы	LD, FMN
Ген NCBI	342184
HGNC	3768
Омим	136535
Refseq	NM_001103184
Uniprot	Q68DA7
Другие данные
Локус	Хр. 15 Q13-Q14
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Формин гомология 2 домен

Кристаллические структуры домена гомологии-гомологии-2 выявляют архитектуру привязанного димера

Идентификаторы

Символ

FH2

1ux5 / scope / supfam

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Диафанный домен FH3

Кристаллическая структура MDIA1 GBD-FH3 в комплексе с RHOC-GMPPNP

Идентификаторы

Символ

Drf_fh3

PFAM клан

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

DRF Autoregulatoration Domain

Кристаллическая структура N-терминальной области MDIA1-повторной области и домена димеризации в комплексе с ауторегуляторным доменом MDIA1 (папа)

Идентификаторы

Символ

Drf_dad

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Диафан-домен связывающего GTPase

Кристаллическая структура MDIA1 GBD-FH3 в комплексе с RHOC-GMPPNP

Идентификаторы

Символ

DRF_GBD

PFAM клан

Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Форманы (белки гомологии фирма) представляют собой группу белков которые участвуют в полимеризации актина , и ассоциируются с быстрорастущим конец (колючий конец) актиновых филаментов. ^{[ 2 ]} Большинство фирминов-это эффекторные белки Rho-GTPase . актина и микротрубочек Формины регулируют цитоскелет ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} и участвуют в различных клеточных функциях, таких как полярность клеток , цитокинез , миграция клеток и SRF транскрипционная активность . ^{[ 5 ]} Форманы представляют собой мультидоменные белки, которые взаимодействуют с различными сигнальными молекулами и цитоскелетными белками, хотя некоторые формины были назначены функциями в ядре .

Разнообразие

Форманы были обнаружены во всех изученных эукариотах . ^{[ 1 ]} У людей присутствуют 15 различных белков формина, которые были классифицированы в 7 подгруппах. ^{[ 6 ]} Напротив, дрожжи содержат только 2-3 формами. ^{[ 7 ]}

Структура и взаимодействия

Форманы характеризуются наличием трех доменов гомологии формами (FH) (FH1, FH2 и FH3), хотя члены семейства Formin не обязательно содержат все три домены. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Кроме того, обычно присутствуют другие домены, такие как домены PDZ , DAD, WH2 или FHA.

Пролиновой , домен FH1 опосредует взаимодействие с различными белками, включая актин -связывающий белок профилин , ^{[ 10 ]} SH3 (SRC гомология 3) доменные белки, ^{[ 11 ]} и белки домена WW . Актино-пропоказы, способствующая, способствуя активации Formins S. cerevisiae была локализована в домене FH2. ^{[ 4 ]} Домен FH2 необходим для самооседания белков форман посредством способности доменов FH2 напрямую связывать друг друга, а также может действовать для ингибирования актиновой полимеризации. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} Домен FH3 менее хорошо консервативный и необходим для направления формах в правильное внутриклеточное местоположение, такое как митотический шпиндель , или наконечник проекции во время конъюгации . ^{[ 14 ]}^{[ 15 ]} Кроме того, некоторые Формины могут содержать домен-связывание GTPase (GBD), необходимый для связывания с небольшими GTPases Rho , и C-концевой консервативный диаграмму-ауторегуляторный домен (папа). GBD является бифункциональным автоингибиторным доменом, который взаимодействует и регулируется активированными членами семейства RHO. DRF3 млекопитающего , похожий на криб, содержит мотив внутри его GBD для связывания с CDC42 , который необходим для CDC42 для активации и направления DRF3 к клеточной коре , где он реконструирует скелет актина. ^{[ 16 ]} Папа связывает N-концевой GBD; Эта связь нарушается, когда GTP-связанный Rho связывается с GBD и активирует белок. Добавление папы к млекопитающих клеткам вызывает образование актиновых филаментов , стабилизирует микротрубочки и активирует опосредованную SRF транскрипцию . ^{[ 16 ]} Другим часто встречающимся доменом является область повторного разряда Armadillo (ARR), расположенная в домене FH3.

Домен FH2 был показан рентгеновской кристаллографией, чтобы иметь удлиненную, полумесячную форму, содержащую три спиральные субдомины. ^{[ 17 ]}^{[ 18 ]}

Форманы также напрямую связываются с микротрубочками через их домен FH2. Это взаимодействие важно для стимулирования захвата и стабилизации подмножества микротрубочек, ориентированных на передний край мигрирующих клеток. Форманы также способствуют захвату микротрубочек кинетохором во время митоза и для выравнивания микротрубочек вдоль актиновых филаментов. ^{[ 19 ]}^{[ 20 ]}

Смотрите также

Форман-2

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} Chalkia D, Nikolaidis N, Makalowski W, Klein J, Nei M (декабрь 2008 г.). «Происхождение и эволюция семейства мультиплана формами, которая участвует в формировании актиновых филаментов» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (12): 2717–33. doi : 10.1093/molbev/msn215 . PMC 2721555 . PMID 18840602 .
^ Evangelista M, Zigmond S, Boone C (июль 2003 г.). «Форманы: сигнальные эффекторы для сборки и поляризации актиновых филаментов» . Журнал сотовой науки . 116 (Pt 13): 2603–11. doi : 10.1242/jcs.00611 . PMID 12775772 .
^ Gunning PW, Ghoshdastider U, Whitaker S, Popp D, Robinson RC (июнь 2015 г.). «Эволюция композиционно и функционально различных актиновых филаментов» . Журнал сотовой науки . 128 (11): 2009–19. doi : 10.1242/jcs.165563 . PMID 25788699 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Гуд Бл, Эк М.Дж. (2007). «Механизм и функция формах в контроле артиновой сборки». Ежегодный обзор биохимии . 76 : 593–627. doi : 10.1146/annurev.biochem.75.103004.142647 . PMID 17373907 .
^ Faix J, Grosse R (июнь 2006 г.). «Оставаться в форме с формами» . Ячейка развития . 10 (6): 693–706. doi : 10.1016/j.devcel.2006.05.001 . PMID 16740473 .
^ Хиггс Х.Н., Петерсон К.Дж. (январь 2005 г.). «Филогенетический анализ домена гомологии формана 2» . Молекулярная биология клетки . 16 (1): 1–13. doi : 10.1091/mbc.e04-07-0565 . PMC 539145 . PMID 15509653 .
^ Baarlink C, Brandt D, Grosse R (июль 2010 г.). «Снимок: форманы» . Клетка . 142 (1): 172–172.e1. doi : 10.1016/j.cell.2010.06.030 . PMID 20603022 . S2CID 2914004 .
^ Китайама С, Уйеда Т. К. (февраль 2003 г.). «FORC, новый тип белка семейства Formin, в котором отсутствует домен FH1, участвует в многоклеточном развитии при дикорете диктиостелия» . Журнал сотовой науки . 116 (Pt 4): 711–23. doi : 10.1242/jcs.00265 . PMID 12538772 .
^ Wallar BJ, Alberts As (август 2003 г.). «Форманы: активные каркасы, которые реконструируют цитоскелет». Тенденции в клеточной биологии . 13 (8): 435–46. doi : 10.1016/s0962-8924 (03) 00153-3 . PMID 12888296 .
^ Uetz P (1997). Биохимические исследования белка деформации конечности позвоночных: инаугурационная диссертация для получения докторского достоинства научно-математического общего факультета Университета Рупрохт-Карлс Гейдельберг . Биология развития, Европейская лаборатория молекулярной биологии. Гейдельберг: Европейская лаборатория молекулярной биологии.
^ Uetz P, Fumagalli S, James D, Zeller R (декабрь 1996 г.). «Молекулярное взаимодействие между белками деформации конечностей (форманы) и киназами семейства SRC» . Журнал биологической химии . 271 (52): 33525–30. doi : 10.1074/jbc.271.52.33525 . PMID 8969217 .
^ Takeya R, Sumimoto H (ноябрь 2003 г.). «FHOS, форман млекопитающего, напрямую связывается с F-актином через регион N-терминал с доменом FH1 и образует гомотипический комплекс через домен FH2, чтобы способствовать формированию актиновых волокон» . Журнал сотовой науки . 116 (Pt 22): 4567–75. doi : 10.1242/jcs.00769 . PMID 14576350 .
^ Shimada A, Nyitrai M, Vetter IR, Kühlmann D, Bugyi B, Narumiya S, Geeves MA, Wittinghofer A (февраль 2004 г.). «Основным доменом FH2 с диафанными формами является удлиненный актин-связывающий белок, который ингибирует полимеризацию» . Молекулярная клетка . 13 (4): 511–22. doi : 10.1016/s1097-2765 (04) 00059-0 . PMID 14992721 .
^ Като Т., Ватанабе Н., Моришим Ю., Фудзита А., Ишизаки Т., Нарумия С (февраль 2001 г.). «Локализация гомолога млекопитающего дипонового, MDIA1, к митотическому веретке в клетках HeLa» Журнал сотовой науки 114 (Pt 4): 775–8 Doi : 10.1242/ jcs.114.4.7 HDL : 2433/150544 11171383PMID
^ Петерсен Дж., Нильсен О., Эгель Р., Хаган Им (июнь 1998 г.). «FH3, домен, обнаруженный в формах, нацелен на делярный дрожжевой форман Fus1 до кончика проекции во время спряжения» . Журнал клеточной биологии . 141 (5): 1217–28. doi : 10.1083/jcb.141.5.1217 . PMC 2137179 . PMID 9606213 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Пенг Дж., Валлар Б.Дж., Фландерс А., Свитек П.Дж., Альбертс А.С. (апрель 2003 г.). «Разрушение гена Formin DRF1, связанного с диафунией, кодирующего MDIA1, выявляет роль DRF3 в качестве эффектора для CDC42» . Текущая биология . 13 (7): 534–45. Bibcode : 2003cbio ... 13..534p . doi : 10.1016/s0960-9822 (03) 00170-2 . PMID 12676083 . S2CID 13902104 .
^ Xu Y, Moseley JB, Sagot I, Poy F, Pellman D, Goode BL, Eck MJ (март 2004 г.). «Кристаллические структуры домена гомологии-гомологии-2 показывают привязанную архитектуру димера» . Клетка . 116 (5): 711–23. doi : 10.1016/s0092-8674 (04) 00210-7 . PMID 15006353 . S2CID 15855545 .
^ Thompson ME, Heimsath EG, Gauvin TJ, Higgs HN, Kull FJ (январь 2013 г.). «Структура FMNL3-ACTIN дает представление о нуклеации и удлинении актина, опосредованного форманом» . Природа структурная и молекулярная биология . 20 (1): 111–8. doi : 10.1038/nsmb.2462 . PMC 3876896 . PMID 23222643 .
^ Palazzo AF, Cook TA, Alberts AS, Gundersen GG (август 2001 г.). «MDIA опосредует Rho-регулируемое образование и ориентацию стабильных микротрубочек». Природная клеточная биология . 3 (8): 723–9. doi : 10.1038/35087035 . PMID 11483957 . S2CID 7374170 .
^ Bartolini F, Gundersen GG (февраль 2010 г.). «FOV и микротрубочки» . Biochemica et Biophysica Acta (BBA) - исследования молекулярных клеток . 1803 (2): 164–73. Doi : 10.1016/j . PMC 2856479 . PMID 19631698 .

Внешние ссылки

MBINFO - опосредованная формами зародышеобразования актина

Эта статья включает текст из общественного достояния PFAM и InterPro : IPR010472

Эта статья включает текст из общественного достояния PFAM и InterPro : IPR015425

Эта статья включает текст из общественного достояния PFAM и InterPro : IPR010465

Эта статья включает текст из общественного достояния PFAM и InterPro : IPR010473

[Chalkia-1] Jump up to: ^а ^{беременный} Chalkia D, Nikolaidis N, Makalowski W, Klein J, Nei M (декабрь 2008 г.). «Происхождение и эволюция семейства мультиплана формами, которая участвует в формировании актиновых филаментов» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (12): 2717–33. doi : 10.1093/molbev/msn215 . PMC 2721555 . PMID 18840602 .

[2] Evangelista M, Zigmond S, Boone C (июль 2003 г.). «Форманы: сигнальные эффекторы для сборки и поляризации актиновых филаментов» . Журнал сотовой науки . 116 (Pt 13): 2603–11. doi : 10.1242/jcs.00611 . PMID 12775772 .

[pmid25788699-3] Gunning PW, Ghoshdastider U, Whitaker S, Popp D, Robinson RC (июнь 2015 г.). «Эволюция композиционно и функционально различных актиновых филаментов» . Журнал сотовой науки . 128 (11): 2009–19. doi : 10.1242/jcs.165563 . PMID 25788699 .

[pmid17373907-4] Jump up to: ^а ^{беременный} Гуд Бл, Эк М.Дж. (2007). «Механизм и функция формах в контроле артиновой сборки». Ежегодный обзор биохимии . 76 : 593–627. doi : 10.1146/annurev.biochem.75.103004.142647 . PMID 17373907 .

[pmid16740473-5] Faix J, Grosse R (июнь 2006 г.). «Оставаться в форме с формами» . Ячейка развития . 10 (6): 693–706. doi : 10.1016/j.devcel.2006.05.001 . PMID 16740473 .

[6] Хиггс Х.Н., Петерсон К.Дж. (январь 2005 г.). «Филогенетический анализ домена гомологии формана 2» . Молекулярная биология клетки . 16 (1): 1–13. doi : 10.1091/mbc.e04-07-0565 . PMC 539145 . PMID 15509653 .

[Baarlink-7] Baarlink C, Brandt D, Grosse R (июль 2010 г.). «Снимок: форманы» . Клетка . 142 (1): 172–172.e1. doi : 10.1016/j.cell.2010.06.030 . PMID 20603022 . S2CID 2914004 .

[pmid12538772-8] Китайама С, Уйеда Т. К. (февраль 2003 г.). «FORC, новый тип белка семейства Formin, в котором отсутствует домен FH1, участвует в многоклеточном развитии при дикорете диктиостелия» . Журнал сотовой науки . 116 (Pt 4): 711–23. doi : 10.1242/jcs.00265 . PMID 12538772 .

[9] Wallar BJ, Alberts As (август 2003 г.). «Форманы: активные каркасы, которые реконструируют цитоскелет». Тенденции в клеточной биологии . 13 (8): 435–46. doi : 10.1016/s0962-8924 (03) 00153-3 . PMID 12888296 .

[10] Uetz P (1997). Биохимические исследования белка деформации конечности позвоночных: инаугурационная диссертация для получения докторского достоинства научно-математического общего факультета Университета Рупрохт-Карлс Гейдельберг . Биология развития, Европейская лаборатория молекулярной биологии. Гейдельберг: Европейская лаборатория молекулярной биологии.

[Uetz-11] Uetz P, Fumagalli S, James D, Zeller R (декабрь 1996 г.). «Молекулярное взаимодействие между белками деформации конечностей (форманы) и киназами семейства SRC» . Журнал биологической химии . 271 (52): 33525–30. doi : 10.1074/jbc.271.52.33525 . PMID 8969217 .

[pmid14576350-12] Takeya R, Sumimoto H (ноябрь 2003 г.). «FHOS, форман млекопитающего, напрямую связывается с F-актином через регион N-терминал с доменом FH1 и образует гомотипический комплекс через домен FH2, чтобы способствовать формированию актиновых волокон» . Журнал сотовой науки . 116 (Pt 22): 4567–75. doi : 10.1242/jcs.00769 . PMID 14576350 .

[pmid14992721-13] Shimada A, Nyitrai M, Vetter IR, Kühlmann D, Bugyi B, Narumiya S, Geeves MA, Wittinghofer A (февраль 2004 г.). «Основным доменом FH2 с диафанными формами является удлиненный актин-связывающий белок, который ингибирует полимеризацию» . Молекулярная клетка . 13 (4): 511–22. doi : 10.1016/s1097-2765 (04) 00059-0 . PMID 14992721 .

[pmid11171383-14] Като Т., Ватанабе Н., Моришим Ю., Фудзита А., Ишизаки Т., Нарумия С (февраль 2001 г.). «Локализация гомолога млекопитающего дипонового, MDIA1, к митотическому веретке в клетках HeLa» Журнал сотовой науки 114 (Pt 4): 775–8 Doi : 10.1242/ jcs.114.4.7 HDL : 2433/150544 11171383PMID

[pmid9606213-15] Петерсен Дж., Нильсен О., Эгель Р., Хаган Им (июнь 1998 г.). «FH3, домен, обнаруженный в формах, нацелен на делярный дрожжевой форман Fus1 до кончика проекции во время спряжения» . Журнал клеточной биологии . 141 (5): 1217–28. doi : 10.1083/jcb.141.5.1217 . PMC 2137179 . PMID 9606213 .

[pmid12676083-16] Jump up to: ^а ^{беременный} Пенг Дж., Валлар Б.Дж., Фландерс А., Свитек П.Дж., Альбертс А.С. (апрель 2003 г.). «Разрушение гена Formin DRF1, связанного с диафунией, кодирующего MDIA1, выявляет роль DRF3 в качестве эффектора для CDC42» . Текущая биология . 13 (7): 534–45. Bibcode : 2003cbio ... 13..534p . doi : 10.1016/s0960-9822 (03) 00170-2 . PMID 12676083 . S2CID 13902104 .

[pmid15006353-17] Xu Y, Moseley JB, Sagot I, Poy F, Pellman D, Goode BL, Eck MJ (март 2004 г.). «Кристаллические структуры домена гомологии-гомологии-2 показывают привязанную архитектуру димера» . Клетка . 116 (5): 711–23. doi : 10.1016/s0092-8674 (04) 00210-7 . PMID 15006353 . S2CID 15855545 .

[18] Thompson ME, Heimsath EG, Gauvin TJ, Higgs HN, Kull FJ (январь 2013 г.). «Структура FMNL3-ACTIN дает представление о нуклеации и удлинении актина, опосредованного форманом» . Природа структурная и молекулярная биология . 20 (1): 111–8. doi : 10.1038/nsmb.2462 . PMC 3876896 . PMID 23222643 .

[PMID11483957-19] Palazzo AF, Cook TA, Alberts AS, Gundersen GG (август 2001 г.). «MDIA опосредует Rho-регулируемое образование и ориентацию стабильных микротрубочек». Природная клеточная биология . 3 (8): 723–9. doi : 10.1038/35087035 . PMID 11483957 . S2CID 7374170 .

[PMID19631698-20] Bartolini F, Gundersen GG (февраль 2010 г.). «FOV и микротрубочки» . Biochemica et Biophysica Acta (BBA) - исследования молекулярных клеток . 1803 (2): 164–73. Doi : 10.1016/j . PMC 2856479 . PMID 19631698 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]