✖


Jump to content

Список секвенированных геномов архей

Этот список секвенированных геномов архей содержит все известные археи , имеющие общедоступные полные последовательности генома , которые были собраны, аннотированы и помещены в общедоступные базы данных. Methanococcus jannaschii был первым археем, геном которого был секвенирован в 1996 году. [1]

В настоящее время в этом списке 39 геномов, принадлежащих видам Crenarchaeota, 105, принадлежащих Euryarchaeota, 1 геном, принадлежащий Korarchaeota и Nanoarchaeota, 3, принадлежащих Thaumarchaeota, и 1 геном, принадлежащий неклассифицированным Archaea, всего 150 геномов архей.

Кренархеота

[ редактировать ]

Ацидилобалы

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Ацидилобус сахароворанс 345-15 1,496,000 1,547 [2] CP001742 2010

Десульфорококки

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Аэропирум перникс К1 1,669,695 2,694 [3] NC_000854 (ссылочная последовательность NCBI) 1999
Десульфурококк камчатский 1221н 1,365,000 1,521 [4] CP001140 2009
Гипертермус бутилический ДСМ 5456 1,667,000 1,669 [5] CP000493 2007
Игникокк госпитальный КИН4/И, DSM 18386 1,297,000 1,496 [6] CP000816 2008
огненная сфера Агрегирующая AQ1.S1, DSM 17230 1,875,000 2,042 [7] CP002098 2010
Пиролобус фумарии 1А, ДСМ 11204 1,843,000 2,038 [8] CP002838 2011
стафилотермус элленикус П8, ДСМ 12710 1,580,000 1,716 [9] CP002051 2011
Стафилотермус морской Ф1, ДСМ 3639 1,570,000 1,659 [10] CP000575 2011
Термосферы агрегаты М11ТЛ, ДСМ 11486 1,316,000 1,457 [11] CP001939 2010

Сульфолобальные

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Ацидианус госпитальный П1 2,137,000 2,424 [12] CP002535 2011
Металлосфера куприна Ар-4 1,840,000 2,077 [13] CP002656 2011
Металлосфера седула ДСМ 5348 2,191,000 2,347 [14] CP000682 2008
Sulfolobus acidocaldarius ДСМ 639 2,225,959 2,223 [15] CP000077 2005
Сульфобус островной ХВЭ10/4 2,655,000 [16] CP002426 2011
Сульфобус островной ЛД8.5 2,722,000 2,996 [17] Хромосома CP001731

Плазмида pLD8501 CP001732

2009
Сульфобус островной ЛС2.15 2,736,000 3,068 [17] CP001399 2009
Сульфобус островной М.14.25 2,608,000 2,900 [17] CP001400 2009
Сульфобус островной М.16.27 2,692,000 2,956 [17] CP001401 2009
Сульфобус островной М.16.4 2,586,000 2,869 [17] CP001402 2009
Сульфобус островной РЕЙ15А 2,522,000 [16] CP002425 2011
Сульфобус островной YG57.14 2,702,000 3,079 [17] CP001403 2009
Сульфобус островной YN15.51 2,812,000 3,318 [17] Хромосома CP001404

Плазмида pYN01 CP001405

2009
Сульфобус островной ЛАЛ14/1 2,465,177 2,601 [18] CP003928 2013
Сульфобус сольфатарикус П2 2,992,245 2,995 [19] AE006641 2001
Сульфобус сольфатарикус 98/2 2,668,000 2,728 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP001800 2009
Sulfolobus tokodaii 7 2,694,765 2,826 [20] BA000023 2001

Термопротеалес

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Кальдивирга макилингенсис IC-167 2,077,000 2,011 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP000852 2007
Пиробакулум аэрофилум ИМ2 2,222,430 2,605 [21] AE009441 2002
Пиробакулум арсенатикум ПЗ6, ДСМ 13514 2,121,000 2,410 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP000660 2007
Пиробакулум калидифонтис ДЦМ 11548 2,009,000 2,213 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP000561 2007
Пиробакулум островикум ДСМ 4184 1,826,000 2,063 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP000504 2006
Пиробакулум сп. 1860 г. Неопубликовано [22] CP003098 2011
Термофилум пенденс час 5 1,781,000 1,930 [23] Хромосома CP000505

Плазмида pTPEN01 CP000506

2008
Термопротеус нейтрофил В24Ста 1,769,000 2,053 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP001014 2008
Термопротеус Тенакс Кра1 1,841,000 2,100 [24] FN869859 2011
Термопротеус узониенсис 768-20 1,936,000 2,229 [25] CP002590 2011
вулканизация Распространенная ДСМ 14429 2,374,000 2,592 [26] CP002100 2010
Вулканисаета мутновская 768-28 2,298,000 2,393 [27] CP002529 2011

Эвриархеота

[ редактировать ]

Археоглоби

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Археоглобус фульгидус ДСМ4304 2,178,400 2,407 [28] AE000782 1997
Археоглобус венефикус СНП6, ДСМ 11195 1,901,000 2,194 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP002588 2011
Археоглобус глубокий Av18, DSM 5631 1,563,000 1,911 [29] Хромосома CP001857

Плазмида pArcpr01 CP001858

2010
Ферроглобус плацидус АЕДИИ12ДО, ДСМ 10642 2,196,000 2,622 [30] CP001899 2011

Галобактерии

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Халялкаликокк йотгали Б3, ДСМ 18796 3,690,000 3925 [31] Хромосома I CP002062

Плазмида 1 CP002063
Плазмида 2 CP002064
Плазмида 3 CP002065
Плазмида 4 CP002066
Плазмида 5 CP002067
Плазмида 6 CP002068

2010
Галоаркула испанская КГМКК 1.2049 3,484,000 3,561 [32] Хромосома I CP002921

Хромосома II CP002922
Плазмида pHH400 CP002923

2011
Haloarcula marismortui АТСС 43049 3,131,724 3,131 [33] Хромосома I AY596297

Хромосома II AY596298
Плазмида png100 AY596290
Плазмида png200 AY596291
Плазмида png300 AY596292
Плазмида png400 AY596293
Плазмида png500 AY596294
Плазмида png600 AY596295
Плазмида png700 AY596296

2004
Галобактерия салинум Р1, ДСМ 671 2,000,000 2,801 [34] Хромосома NC_010364

Плазмида PHS1 NC_010366
Плазмида PHS2 NC_010369
Плазмида PHS3 NC_010368
Плазмида PHS4 NC_010367

2008
галобактерий Виды НРК-1 2,014,239 2,058 [35] Хромосома NC_002607

Плазмида pNRC100 NC_002607
Плазмида pNRC200 NC_002608

2000
Halobiforma lacisalsi AJ5, JCM 12983 4,320,000 4,682 [36] АГФЗ00000000 2011
Галоферакс вулканический ДС2 [37] Хромосома CP001956

Плазмида pHV1 CP001957
Плазмида pHV2 CP001954
Плазмида pHV3 CP001953
Плазмида pHV4 CP001955

2010
Галогеометрическиум боринкенсе ПР3, ДСМ 11551 3,920,000 4,059 [38] Хромосома CP001690

Плазмида pHBOR01 CP001691
Плазмида pHBOR02 CP001692
Плазмида pHBOR03 CP001693
Плазмида pHBOR04 CP001694
Плазмида pHBOR05 CP001695

2009
Галомикробий мукохатаеи арг-2, DSM 12286 3,332,000 3,475 [39] Хромосома CP001688

Плазмида pHmuk01 CP001689

2009
Галопигер xanaduensis Ш-6 3,668,000 3,685 Объединенный институт генома Министерства энергетики США Хромосома CP002839

Плазмида pHALXA01 CP002840
Плазмида pHALXA02 CP002841
Плазмида pHALXA03 CP002842

2011 (Хромосома)
Халоквадратум Уолсби С23, ДСМ 16854 3,148,000 [40] Хромосома FR746099

Плазмида PL6A FR746101
Плазмида PL6B FR746102
Плазмида PL100 FR746100

2011
Халоквадратум Уолсби HBSQ001, ДСМ 16790 3,132,000 2,914 [41] Хромосома AM180088

Плазмида PL47 AM180089

2006
Халорхабдус тиаматеа SARL4B 3,840,000 4,034 [42] АФНТ00000000 2011
Халорхабдус утахенсис АХ-2, ДСМ 12940 3116 Кб 3076 [43] CP001687 2009
Ореол глубокого озера АТСС 49239 4,300,000 3,725 Объединенный институт генома Министерства энергетики США Хромосома 1 CP001365

Хромосома 2 CP001366
Плазмида pHLAC01 CP001367

2009 (Хромосомы 1 и 2)
Халотерригена туркменика ВКМ Б-1734, ДСМ 5511 5,440,000 5,351 [44] Хромосома CP001860

Плазмида pHTUR01 CP001861
Плазмида pHTUR02 CP001862
Плазмида pHTUR03 CP001863
Плазмида pHTUR04 CP001864
Плазмида pHTUR05 CP001865
Плазмида pHTUR06 CP001866

2010
Азиатская натриалба АТСС 700177 [45] Опрос 2004
Натрий альба магадиевый АТСС 43099 3,751,000 4,364 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP001932 2010
Натрономонас фараонис ДСМ2160 2,595,221 2,675 [46] Хромосома CR936257

Плазмида PL131 CR936258
Плазмида PL23 CR936259

2005

Метанобактерии

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Метанобактерии сп. АЛ-21 2,583,000 Объединенный институт генома Министерства энергетики США,
Университет Иллинойса в Урбана-Шампейн 		CP002551 2011
Метанобактерии сп. ЛЕБЕДЬ-1 2,546,000 2,500 Объединенный институт генома Министерства энергетики США,
Университет Иллинойса в Урбана-Шампейн 		CP002772 2011
Метанобактерия термоавтотрофикум дельта-H 1,751,377 1,869 [47] AE000666 1997
Метанобревибактер руминантиум М1 2,937,000 2,283 [48] CP001719 2010
Метанобревибактер Смитии ДСМ 2375 1,704,000 1,748 Вашингтонский университет ABYW00000000 2008
Метанобревибактер Смитии Ф1, ДСМ 2374 1,707,000 1,749 Вашингтонский университет АБВ00000000 2010
Метанобревибактер Смитии ПС, АТСС 35061 1,853,000 1,841 [49] CP000678 2007
Метанобревибактер Смитии ТС94А 1,889,000 1,808 [50] АЕЛУ00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС94Б 1,886,000 1,856 [50] АЭЛВ00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС94С 1,910,000 1,812 [50] AELW00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС95А 1,992,000 1,961 [50] AELX00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС95Б 1,972,000 1,895 [50] AELY00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС95С 1,978,000 1,874 [50] АЕЛЗ00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС95Д 2,011,000 1,860 [50] АЕМА00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС96А 1,975,000 1,852 [50] АЕМБ00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС96Б 1,869,000 1,742 [50] АЕМС00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС96С 1,818,000 1,764 [50] АЕМД00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС145А 1,782,000 1,786 [50] АЕКУ00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС145Б 1,797,000 1,880 [50] AELL00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС146А 1,792,000 1,823 [50] АЕЛМ00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС146Б 1,794,000 1,814 [50] АЕЛН00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС146С 1,947,000 2,355 [50] АЕЛО00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС146Д 1,713,000 1,693 [50] АЭЛП00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС146Э 1,952,000 1,887 [50] AELQ00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС147А 2,008,000 1,969 [50] АЭЛР00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС147Б 1,965,000 1,911 [50] АЕЛС00000000 2011
Метанобревибактер Смитии ТС147С 1,973,000 2,014 [50] АЕЛТ00000000 2011
Метаносфера штаттманае ДСМ 3091 1,767,403 1,534 [51] CP000102 2005
Метанотермобактер марбургский Марбург DSM 2133 1,634,000 1,806 [52] CP001710 2010
Метанотермус фервидус В24С, ДСМ 2088 1,243,000 1,361 [53] CP002278 2010

Метанококки

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Метанокальдококк лихорадочный АГ86 1,485,000 1,663 Объединенный институт генома Министерства энергетики США Хромосома CP001696

Плазмида pMEFER01 CP001697

2009 (Хромосома)
Метанокальдококк инфернус МНЕ 1,328,000 1,513 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP002009 2010
Метанокальдококк jannaschii ДСМ 2661 1,664,970 1,715 [54] Хромосома: L77117

Большая плазмида: L77118.
Малая плазмида: L77119

1996
Метанокальдококк вулканический М7, ДСМ 12094 1,746,000 1,808 Объединенный институт генома Министерства энергетики США Хромосома CP001787

Плазмида pMETVU01 CP001788
Плазмида pMETVU02 CP001789

2009
Метанокальдококк sp. ФС406-22 1,760,000 1,893 Объединенный институт генома Министерства энергетики США Хромосома CP001901

Плазмида pFS01 CP001902

2010 (Хромосома)
Метанококк эоликус Нанкай-3 1,569,000 1,554 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP000743 2007
Метанококк марипалудис С5 1,780,000 1,896 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP000609 2007
Метанококк марипалудис С6 1,744,000 1,874 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP000867 2007
Метанококк марипалудис С7 1,772,000 1,858 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP000745 2007
Метанококк марипалудис С2 1,661,137 1,722 [55] NC_005791 (ссылочная последовательность NCBI) 2004
Метанококк марипалудис Х1 1,746,000 1,892 [56] CP002913 2011
Метанококк Ванниелии СБ 1,720,000 1,755 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP000742 2007
Метанококк вольта А3 1,936,000 1,768 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP002057 2010
Метанотермококк Окинавенсис IH1 1,662,000 1,662 Объединенный институт генома Министерства энергетики США Хромосома CP002792

Плазмида pMETOK01 CP002793

2011 (Хромосома)
Метаноторрис огненный Кол5, ДСМ 5666 1,854,000 1,843 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP002737 2011

Метаномикробия

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Кандидат Metanoregula boonei 6А8 2,542,000 2,518 Объединенный институт генома Министерства энергетики США [57] CP000780 2007
Метаноцелла сп. Рисовый кластер I (RC-I) МРЭ50 3,179,916 3103 Последовательность генома, [58] затем таксономическое размещение [59] AM114193 2005
Метаноцелла палудикола РАЗУМНЫЙ 2,957,635 3004 [60] AP011532 2011
Метаноцелла конрадии ХЗ254 1,316,380 2512 [61] CP003243 2012
Метанококкоидес буртонии ДСМ6242 2,575,032 2,273 [62] CP000300 2009
Метанокорпускулум лабреанум С 1,804,000 1,830 [63] CP000559 2009
Метанокуллеус мариснигри JR1, ДСМ 1498 2,478,000 2,560 [64] CP000562 2009
Метаногалобиум эвестигатум Z-7303 2,406,232 2,254 Объединенный институт генома Министерства энергетики США [65] Хромосома: CP002069

Плазмида pMETEV01: CP002070

2010 (Хромосома)
Метаногалофилус махии СЛП, ДСМ 5219 2,012,000 2,095 [66] CP001994 2010
Метаноплан петролеариус СЕБР 4847, ДСМ 11571 2,843,000 2,881 [67] CP002117 2011
Метаносальсум жилинае WeN5, DSM 4017 2,138,000 2,086 CP002101 2010
Метаносэты Совет ГП-6 3,008,000 [68] CP002565 2010
Methanosaeta harundinacea 6Ac 2,559,000 [22] CP003117 2011
Methanosaeta thermophila ПТ 1,879,000 1,785 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP000477 2006
Methanosarcina acetivorans C2A 5,751,492 4,540 [69] AE010299 2002
Метаносарцина баркери Фузаро, DSM 804 4,837,408 3,607 [70] Хромосома CP000099

Плазмида 1 CP000098

2006 (Хромосома)
Метаносарцина мазей Go1 4,096,345 3,371 [71] AE008384 2002
Метаносферула болотная E1-9c, ДСМ 19958 г. 2,922,000 2,859 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP001338 2008
Метаноспириллум хунгатеи JF-1 3,544,738 3,139 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP000254 2006

Метанопири

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Метанопирус кандлери AV19 1,694,969 1,691 [72] AE009439 2002

Термококки

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Пирококк абисси GE5 1,765,118 1,784 [73] NC_000868 (ссылочная последовательность NCBI) 2000
Пирококк яростный ДСМ 3638 1,908,256 2,065 [74] AE009950 1999
Пирококк хорикошии ОТ3 1,738,505 2,061 [75] NC_000961 (ссылочная последовательность NCBI) 1998
Пирококк сп. NA2 1,861,000 1,984 [22] CP002670 2011
Пирококк яяносии CH1 1,716,000 1,952 [76] CP002779 2011
Термококк барофилус МП, ДСМ 11836 2,010,000 2,196 [77] CP002372 2011
Термококк гамматолеранс EJ3 2,045,000 2,206 [78] CP001398 2009
Термококк кодакараенсис КОД1 2,088,737 2,306 [79] AP006878 2005
Термококк оннуринеус NA1 1,847,000 2,027 [80] NC_011529 (ссылочная последовательность NCBI) 2008
Термококк сибирский ММ 739 1,845,000 2,085 [81] CP001463 2009
Термококк сп. 4557 2,011,000 2,181 [82] CP002920 2011
Термококк сп. АМ4 2,086,000 2,279 [83] CP002952 2011

Термоплазматы

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Ферроплазма ацидарманус Фер1 1,865,000 1,742 [84] ААВС00000000 2007
Пикрофилус торридус ДСМ 9790 1,545,895 1,535 [85] AE017261 2004
Термоплазма ацидофилум ДСМ 1728 1,564,906 1,478 [86] NC_002578 (ссылочная последовательность NCBI) 2000
Термоплазменный вулкан ГСС1 1,584,804 1,526 [87] NC_002689 (ссылочная последовательность NCBI) 2000

Неклассифицированные эвриархеоты

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Ацидулипрофундум буней Т469 1,486,000 1,587 Объединенный институт генома Министерства энергетики США CP001941 2010

Корархеота

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Кандидат Korarchaeum cryptophilus. ОБТК8 1,590,000 1,661 [88] CP000968 2008

Наноархеота

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Наноархеум конский Кин4-М 490,885 536 [89] AE017199 2003

Таумархеота

[ редактировать ]

Ценархеальные

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Ценархеум симбиозный А 2,045,000 2,066 [90] ДП000238 2006

Нитрозопумилалес

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
Кандидат Nitrosoarchaeum limnia. SFB1 1,769,000 2,171 [91] АЕГП00000000 2011
Нитрозопумилус морской СКМ1 1,645,000 1,842 [92] CP000866 2010

Неклассифицированные археи

[ редактировать ]
Разновидность Напряжение Базовые пары Гены Ссылка генбанка Идентификатор Год публикации
галофильные археи sp. DL31 Неопубликовано [22] CP002988 2011

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Балт С.Дж., Уайт О., Олсен Г.Дж., Чжоу Л., Флейшманн Р.Д., Саттон Г.Г. и др. (август 1996 г.). «Полная последовательность генома метаногенного архея Methanococcus jannaschii». Наука . 273 (5278): 1058–73. Бибкод : 1996Sci...273.1058B . дои : 10.1126/science.273.5278.1058 . ПМИД   8688087 . S2CID   41481616 .
  2. ^ Марданов А.В., Светличный В.А., Белецкий А.В., Прокофьева М.И., Бонч-Осмоловская Е.А., Равин Н.В., Скрябин К.Г. (август 2010 г.). «Последовательность генома кренархеона Acidilobus saccharovorans поддерживает новый порядок, Acidilobales, и предполагает важную экологическую роль в наземных кислых горячих источниках» . Прикладная и экологическая микробиология . 76 (16): 5652–7. Бибкод : 2010ApEnM..76.5652M . дои : 10.1128/AEM.00599-10 . ПМЦ   2918975 . ПМИД   20581186 .
  3. ^ Каварабаяси Ю., Хино Ю., Хорикава Х., Ямазаки С., Хайкава Ю., Джин-но К. и др. (апрель 1999 г.). «Полная последовательность генома аэробной гипертермофильной кренархеи Aeropyrum pernix K1» . Исследование ДНК . 6 (2): 83–101, 145–52. дои : 10.1093/dnares/6.2.83 . ПМИД   10382966 .
  4. ^ Равин Н.В., Марданов А.В., Белецкий А.В., Кубланов И.В., Колганова Т.В., Лебединский А.В. и др. (апрель 2009 г.). «Полная последовательность генома анаэробной гипертермофильной кренархеи Desulfurococcus kamchatkensis, разлагающей белки» . Журнал бактериологии . 191 (7): 2371–9. дои : 10.1128/JB.01525-08 . ПМК   2655497 . ПМИД   19114480 .
  5. ^ Брюггер К., Чен Л., Старк М., Зибат А., Реддер П., Руепп А. и др. (май 2007 г.). «Геном Hyperthermus Butylicus: восстанавливающий серу, ферментирующий пептиды нейтрофильный кренархеот, растущий до 108 градусов Цельсия» . Архея . 2 (2): 127–35. дои : 10.1155/2007/745987 . ПМК   2686385 . ПМИД   17350933 .
  6. ^ Подар М., Андерсон И., Макарова К.С., Элкинс Дж.Г., Иванова Н., Уолл М.А. и др. (2008). «Геномный анализ архейной системы Ignicoccus Hospitalis-Nanoarchaeum equitans» . Геномная биология . 9 (11): 158 рэндов. дои : 10.1186/gb-2008-9-11-r158 . ПМК   2614490 . ПМИД   19000309 .
  7. ^ Гёкер М., Хелд Б., Лапидус А., Нолан М., Спринг С., Ясавонг М. и др. (август 2010 г.). «Полная последовательность генома штамма типа Ignisphaera agggregans (AQ1.S1)» . Стандарты в геномных науках . 3 (1): 66–75. дои : 10.4056/sigs.1072907 . ПМК   3035270 . ПМИД   21304693 .
  8. ^ Андерсон И., Гокер М., Нолан М., Лукас С., Хэммон Н., Дешпанде С. и др. (июль 2011 г.). «Полная последовательность генома гипертермофильного хемолитоавтотрофного штамма типа Pyrolobus fumarii (1A)» . Стандарты в геномных науках . 4 (3): 381–92. дои : 10.4056/sigs.2014648 . ПМК   3156397 . ПМИД   21886865 .
  9. ^ Андерсон И., Вирт Р., Лукас С., Коупленд А., Лапидус А., Ченг Дж.Ф. и др. (октябрь 2011 г.). «Полная последовательность генома Staphylothermus hellenicus P8» . Стандарты в геномных науках . 5 (1): 12–20. дои : 10.4056/sigs.2054696 . ПМК   3236042 . ПМИД   22180806 .
  10. ^ Андерсон И.Дж., Дхармараджан Л., Родригес Дж., Хупер С., Порат И., Ульрих Л.Е. и др. (апрель 2009 г.). «Полная последовательность генома Staphylothermus marinus выявляет различия в метаболизме серы среди гетеротрофных Crenarchaeota» . БМК Геномика . 10 :145. дои : 10.1186/1471-2164-10-145 . ПМЦ   2678158 . ПМИД   19341479 .
  11. ^ Спринг С., Рэйчел Р., Лапидус А., Давенпорт К., Тайс Х., Коупленд А. и др. (июнь 2010 г.). «Полная последовательность генома штамма типа Thermosphaera agggregans (M11TL)» . Стандарты в геномных науках . 2 (3): 245–59. дои : 10.4056/sigs.821804 . ПМК   3035292 . ПМИД   21304709 .
  12. ^ Ю XY, Лю С., Ван С.Ю., Цзян С.И., Шах С.А., Прангишвили Д. и др. (июль 2011 г.). «Геномный анализ хозяина Acidianus Hospitalis W1 для изучения жизненного цикла кренархейного вируса и плазмиды» . Экстремофилы . 15 (4): 487–97. дои : 10.1007/s00792-011-0379-y . ПМК   3119797 . ПМИД   21607549 .
  13. ^ Лю LJ, Ю XY, Чжэн Х, Ван С., Цзян С.И., Лю С.Дж. (июль 2011 г.). «Полная последовательность генома Metallosphaera cuprina, археи, окисляющей сульфиды металлов, из горячего источника» . Журнал бактериологии . 193 (13): 3387–8. дои : 10.1128/JB.05038-11 . ПМЦ   3133273 . ПМИД   21551305 .
  14. ^ Ауэрник К.С., Маезато Ю., Блюм П.Х., Келли Р.М. (февраль 2008 г.). «Последовательность генома мобилизующей металлы чрезвычайно термоацидофильной археи Metallosphaera sedula дает представление о метаболизме, связанном с биовыщелачиванием» . Прикладная и экологическая микробиология . 74 (3): 682–92. Бибкод : 2008ApEnM..74..682A . дои : 10.1128/АЕМ.02019-07 . ПМК   2227735 . ПМИД   18083856 .
  15. ^ Чен Л., Брюггер К., Сковгаард М., Реддер П., Ше К., Тораринссон Э. и др. (июль 2005 г.). «Геном Sulfolobus acidocaldarius, модельного организма Crenarchaeota» . Журнал бактериологии . 187 (14): 4992–9. дои : 10.1128/JB.187.14.4992-4999.2005 . ПМК   1169522 . ПМИД   15995215 .
  16. ^ Перейти обратно: а б Го Л., Брюггер К., Лю С., Шах С.А., Чжэн Х., Чжу Ю. и др. (апрель 2011 г.). «Анализ генома исландских штаммов Sulfolobus Islandicus, модельных организмов для генетических исследований и исследований взаимодействия вируса с хозяином» . Журнал бактериологии . 193 (7): 1672–80. дои : 10.1128/JB.01487-10 . ПМК   3067641 . ПМИД   21278296 .
  17. ^ Перейти обратно: а б с д и ж г Рено М.Л., Хелд Н.Л., Филдс С.Дж., Берк П.В., Уитакер Р.Дж. (май 2009 г.). «Биогеография пангенома Sulfolobus Islandicus» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (21): 8605–10. Бибкод : 2009PNAS..106.8605R . дои : 10.1073/pnas.0808945106 . ПМК   2689034 . ПМИД   19435847 .
  18. ^ Жобер С., Даниу С., Оберто Дж., Кортес Д., Бизе А., Крупович М. и др. (апрель 2013 г.). «Геномика и генетика Sulfolobus Islandicus LAL14/1, модельного гипертермофильного архея» . Открытая биология . 3 (4):130010.doi : 10.1098 /rsob.130010 . ПМЦ   3718332 . ПМИД   23594878 .
  19. ^ Ше К., Сингх Р.К., Конфалоньери Ф., Живанович Ю., Аллард Дж., Авайез М.Дж. и др. (июль 2001 г.). «Полный геном кренархеона Sulfolobus solfataricus P2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (14): 7835–40. Бибкод : 2001PNAS...98.7835S . дои : 10.1073/pnas.141222098 . ПМК   35428 . ПМИД   11427726 .
  20. ^ Каварабаяси Ю., Хино Ю., Хорикава Х., Джин-но К., Такахаси М., Секине М. и др. (август 2001 г.). «Полная последовательность генома аэробного термоацидофильного кренархея, штамм Sulfolobus tokodaii7» . Исследование ДНК . 8 (4): 123–40. дои : 10.1093/dnares/8.4.123 . ПМИД   11572479 .
  21. ^ Фитц-Гиббон ​​С.Т., Ладнер Х., Ким У.Дж., Стеттер К.О., Саймон М.И., Миллер Дж.Х. (январь 2002 г.). «Последовательность генома гипертермофильной кренархеи Pyrobaculum aerophilum» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (2): 984–9. Бибкод : 2002PNAS...99..984F . дои : 10.1073/pnas.241636498 . ПМК   117417 . ПМИД   11792869 .
  22. ^ Перейти обратно: а б с д «ЗОЛОТО» .
  23. ^ Андерсон И., Родригес Дж., Сусанти Д., Порат И., Райх С., Ульрих Л.Е. и др. (апрель 2008 г.). «Последовательность генома Thermofilum pendens демонстрирует исключительную потерю путей биосинтеза без редукции генома» . Журнал бактериологии . 190 (8): 2957–65. дои : 10.1128/JB.01949-07 . ПМЦ   2293246 . ПМИД   18263724 .
  24. ^ Зиберс Б., Запарти М., Раддац Г., Тьяден Б., Альберс С.В., Белл С.Д. и др. (2011). «Полная последовательность генома Thermoproteus tenax: физиологически универсального представителя Crenarchaeota» . ПЛОС ОДИН . 6 (10): e24222. Бибкод : 2011PLoSO...624222S . дои : 10.1371/journal.pone.0024222 . ПМК   3189178 . ПМИД   22003381 .
  25. ^ Марданов А.В., Гумеров В.М., Белецкий А.В., Прокофьева М.И., Бонч-Осмоловская Е.А., Равин Н.В., Скрябин К.Г. (июнь 2011 г.). «Полная последовательность генома термоацидофильного кренархеона Thermoproteus uzoniensis 768-20» . Журнал бактериологии . 193 (12): 3156–7. дои : 10.1128/JB.00409-11 . ПМК   3133184 . ПМИД   21478349 .
  26. ^ Мавроматис К., Сикорски Дж., Пабст Е., Тешима Х., Лапидус А., Лукас С. и др. (сентябрь 2010 г.). «Полная последовательность генома штамма типа Vulcanisaeta distributa (IC-017)» . Стандарты в геномных науках . 3 (2): 117–25. дои : 10.4056/sig.1113067 . ПМК   3035369 . ПМИД   21304741 .
  27. ^ Гумеров В.М., Марданов А.В., Белецкий А.В., Прокофьева М.И., Бонч-Осмоловская Е.А., Равин Н.В., Скрябин К.Г. (май 2011 г.). «Полная последовательность генома штамма 768-28 Vulcanisaeta moutnovskia, нового представителя гипертермофильного кренархейного рода Vulcanisaeta» . Журнал бактериологии . 193 (9): 2355–6. дои : 10.1128/JB.00237-11 . ПМК   3133093 . ПМИД   21398550 .
  28. ^ Кленк Х.П., Клейтон Р.А., Томб Дж.Ф., Уайт О., Нельсон К.Е., Кетчум К.А. и др. (ноябрь 1997 г.). «Полная последовательность генома гипертермофильной сульфатредуцирующей археи Archaeoglobus fulgidus» . Природа . 390 (6658): 364–70. Бибкод : 1997Natur.390..364K . дои : 10.1038/37052 . ПМИД   9389475 .
  29. ^ фон Ян М., Лапидус А., Дель Рио Т.Г., Коупленд А., Тайс Х., Ченг Дж.Ф. и др. (июнь 2010 г.). «Полная последовательность генома штамма типа Archaeoglobus profundus (AV18)» . Стандарты в геномных науках . 2 (3): 327–46. дои : 10.4056/sigs.942153 . ПМК   3035285 . ПМИД   21304717 .
  30. ^ Андерсон И., Риссо С., Холмс Д., Лукас С., Коупленд А., Лапидус А. и др. (октябрь 2011 г.). «Полная последовательность генома Ferroglobus placidus AEDII12DO» . Стандарты в геномных науках . 5 (1): 50–60. дои : 10.4056/sigs.2225018 . ПМК   3236036 . ПМИД   22180810 .
  31. ^ Ро С.В., Нам Ю.Д., Нам Ш., Чхве Ш., Пак Х.С., Бэ Дж.В. (сентябрь 2010 г.). «Полная последовательность генома Halalkalicoccus jeotgali B3 (T), чрезвычайно галофильного архея» . Журнал бактериологии . 192 (17): 4528–9. дои : 10.1128/JB.00663-10 . ПМЦ   2937367 . ПМИД   20601480 .
  32. ^ Лю Х, Ву З, Ли М, Чжан Ф, Чжэн Х, Хань Дж и др. (ноябрь 2011 г.). «Полная последовательность генома Haloarcula hispanica, модельного галоархея для изучения генетики, метаболизма и взаимодействия вируса с хозяином» . Журнал бактериологии . 193 (21): 6086–7. дои : 10.1128/JB.05953-11 . ПМК   3194904 . ПМИД   21994921 .
  33. ^ Балига Н.С., Бонно Р., Фаччиотти М.Т., Пан М., Глусман Г., Дойч Э.В. и др. (ноябрь 2004 г.). «Последовательность генома Haloarcula marismortui: галофильного архея из Мертвого моря» . Геномные исследования . 14 (11): 2221–34. дои : 10.1101/гр.2700304 . ПМК   525680 . ПМИД   15520287 .
  34. ^ Пфайффер Ф., Шустер С.С., Бройхер А., Фальб М., Палм П., Родевальд К. и др. (апрель 2008 г.). «Эволюция в лаборатории: геном штамма R1 Halobacterium salinarum в сравнении с геномом штамма NRC-1» . Геномика . 91 (4): 335–46. дои : 10.1016/j.ygeno.2008.01.001 . ПМИД   18313895 .
  35. ^ Нг В.В., Кеннеди С.П., Махайрас Г.Г., Берквист Б., Пан М., Шукла Х.Д. и др. (октябрь 2000 г.). «Последовательность генома видов Halobacterium NRC-1» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (22): 12176–81. Бибкод : 2000PNAS...9712176N . дои : 10.1073/pnas.190337797 . ПМК   17314 . ПМИД   11016950 .
  36. ^ Цзян X, Ван С., Ченг Х., Хо Ю, Чжан Х, Чжу Х и др. (декабрь 2011 г.). «Последовательность генома Halobiforma lacisalsi AJ5, чрезвычайно галофильного архея, несущего ген bop» . Журнал бактериологии . 193 (24): 7023–4. дои : 10.1128/JB.06282-11 . ПМЦ   3232858 . ПМИД   22123770 .
  37. ^ Хартман А.Л., Норайс С., Бэджер Дж.Х., Дельмас С., Холденби С., Мадупу Р. и др. (март 2010 г.). Фридберг I (ред.). «Полная последовательность генома Haloferax volcanii DS2, модельного архея» . ПЛОС ОДИН . 5 (3): е9605. Бибкод : 2010PLoSO...5.9605H . дои : 10.1371/journal.pone.0009605 . ПМК   2841640 . ПМИД   20333302 .
  38. ^ Малфатти С., Тиндалл Б.Дж., Шнайдер С., Фенрих Р., Лапидус А., Лабутти К. и др. (сентябрь 2009 г.). «Полная последовательность генома штамма типа Halogeometricum borinquense (PR3)» . Стандарты в геномных науках . 1 (2): 150–9. дои : 10.4056/sig.23264 . ПМК   3035229 . ПМИД   21304651 .
  39. ^ Тиндалл Б.Дж., Шнайдер С., Лапидус А., Коупленд А., Главина Дель Рио Т., Нолан М. и др. (ноябрь 2009 г.). «Полная последовательность генома штамма типа Halomicrobium mukohataei (arg-2)» . Стандарты в геномных науках . 1 (3): 270–7. дои : 10.4056/sig.42644 . ПМК   3035239 . ПМИД   21304667 .
  40. ^ Дьялл-Смит М.Л., Пфайффер Ф., Кли К., Палм П., Гросс К., Шустер С.С. и др. (2011). «Haloquadratum walsbyi: ограниченное разнообразие в глобальном пруду» . ПЛОС ОДИН . 6 (6): e20968. Бибкод : 2011PLoSO...620968D . дои : 10.1371/journal.pone.0020968 . ПМК   3119063 . ПМИД   21701686 .
  41. ^ Болхуис Х., Палм П., Венде А., Фальб М., Рампп М., Родригес-Валера Ф. и др. (июль 2006 г.). «Геном квадратного архея Haloquadratum walsbyi: жизнь в пределах активности воды» . БМК Геномика . 7 : 169. дои : 10.1186/1471-2164-7-169 . ПМЦ   1544339 . ПМИД   16820047 .
  42. ^ Антунес А., Алам И., Баич В.Б., Стингл У. (сентябрь 2011 г.). «Последовательность генома Halorhabdus tiamatea, первого архея, выделенного из глубоководного бескислородного соленого озера» . Журнал бактериологии . 193 (17): 4553–4. дои : 10.1128/JB.05462-11 . ПМК   3165509 . ПМИД   21705593 .
  43. ^ Андерсон И., Тиндалл Б.Дж., Помренке Х., Гокер М., Лапидус А., Нолан М. и др. (ноябрь 2009 г.). «Полная последовательность генома типового штамма Halorhabdus utahensis (AX-2)» . Стандарты в геномных науках . 1 (3): 218–25. дои : 10.4056/sig.31864 . ПМК   3035240 . ПМИД   21304660 .
  44. ^ Сондерс Э., Тиндалл Б.Дж., Фенрих Р., Лапидус А., Коупленд А., Дель Рио Т.Г. и др. (февраль 2010 г.). «Полная последовательность генома штамма типа Haloterrigena turkmenica (4k)» . Стандарты в геномных науках . 2 (1): 107–16. дои : 10.4056/sigs.681272 . ПМК   3035258 . ПМИД   21304683 .
  45. ^ Гу Ю.А., Роуч Дж., Глусман Г., Балига Н.С., Дойч К., Пан М. и др. (январь 2004 г.). «Низкочастотное секвенирование для сравнительной геномики микробов» . БМК Геномика . 5 (1): 3. дои : 10.1186/1471-2164-5-3 . ПМК   331400 . ПМИД   14718067 .
  46. ^ Фальб М., Пфайффер Ф., Палм П., Родевальд К., Хикманн В., Титтор Дж., Остерхельт Д. (октябрь 2005 г.). «Жизнь с двумя крайностями: выводы из последовательности генома Natronomonas pharaonis» . Геномные исследования . 15 (10): 1336–43. дои : 10.1101/гр.3952905 . ПМК   1240075 . ПМИД   16169924 .
  47. ^ Смит Д.Р., Дусетт-Стамм Л.А., Делогери С., Ли Х., Дюбуа Дж., Олдридж Т. и др. (ноябрь 1997 г.). «Полная последовательность генома Methanobacterium thermoautotropicum deltaH: функциональный анализ и сравнительная геномика» . Журнал бактериологии . 179 (22): 7135–55. дои : 10.1128/jb.179.22.7135-7155.1997 . ПМК   179657 . ПМИД   9371463 .
  48. ^ Лихи С.К., Келли В.Дж., Альтерманн Э., Ронимус Р.С., Йоман С.Дж., Пачеко Д.М. и др. (январь 2010 г.). «Последовательность генома метаногена рубца Methanobrevibacter ruminantium открывает новые возможности контроля выбросов метана у жвачных животных» . ПЛОС ОДИН . 5 (1): e8926. Бибкод : 2010PLoSO...5.8926L . дои : 10.1371/journal.pone.0008926 . ПМЦ   2812497 . ПМИД   20126622 .
  49. ^ Сэмюэл Б.С., Хансен Э.Э., Манчестер Дж.К., Коутиньо П.М., Хенриссат Б., Фултон Р. и др. (июнь 2007 г.). «Геномная и метаболическая адаптация Methanobrevibacter smithii к кишечнику человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (25): 10643–8. Бибкод : 2007PNAS..10410643S . дои : 10.1073/pnas.0704189104 . ПМК   1890564 . ПМИД   17563350 .
  50. ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т Хансен Э.Э., Лозупоне К.А., Рей Ф.Е., Ву М., Гурудж Дж.Л., Нарра А. и др. (март 2011 г.). «Пангеном доминантной человеческой археи, ассоциированной с кишечником, Methanobrevibacter smithii, изученный на близнецах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (Приложение 1): 4599–606. Бибкод : 2011PNAS..108.4599H . дои : 10.1073/pnas.1000071108 . ПМК   3063581 . ПМИД   21317366 .
  51. ^ Фрике В.Ф., Зеедорф Х., Хенне А., Крюер М., Лизеганг Х., Хеддерих Р. и др. (январь 2006 г.). «Последовательность генома Methanosphaera stadtmanae показывает, почему этот человеческий кишечный архей ограничен метанолом и H2 для образования метана и синтеза АТФ» . Журнал бактериологии . 188 (2): 642–58. дои : 10.1128/JB.188.2.642-658.2006 . ПМЦ   1347301 . ПМИД   16385054 .
  52. ^ Лизеганг Х., Кастер А.К., Визер А., Гёнрих М., Вольхерр А., Зеедорф Х. и др. (ноябрь 2010 г.). «Полная последовательность генома Methanothermobacter marburgensis, модельного организма метаноархея» . Журнал бактериологии . 192 (21): 5850–1. дои : 10.1128/JB.00844-10 . ПМЦ   2953689 . ПМИД   20802048 .
  53. ^ Андерсон И., Джао О.Д., Мисра М., Чертков О., Нолан М., Лукас С. и др. (ноябрь 2010 г.). «Полная последовательность генома штамма типа Methanothermusfervidus (V24S)» . Стандарты в геномных науках . 3 (3): 315–24. дои : 10.4056/sig.1283367 . ПМЦ   3035299 . ПМИД   21304736 .
  54. ^ Балт С.Дж., Уайт О., Олсен Г.Дж., Чжоу Л., Флейшманн Р.Д., Саттон Г.Г. и др. (август 1996 г.). «Полная последовательность генома метаногенного архея Methanococcus jannaschii». Наука . 273 (5278): 1058–73. Бибкод : 1996Sci...273.1058B . дои : 10.1126/science.273.5278.1058 . ПМИД   8688087 . S2CID   41481616 .
  55. ^ Хендриксон Э.Л., Каул Р., Чжоу Ю., Бови Д., Чепмен П., Чунг Дж. и др. (октябрь 2004 г.). «Полная последовательность генома генетически поддающегося гидрогенотрофному метаногену Methanococcus maripaludis» . Журнал бактериологии . 186 (20): 6956–69. дои : 10.1128/JB.186.20.6956-6969.2004 . ПМК   522202 . ПМИД   15466049 .
  56. ^ Ван X, Гринфилд П., Ли Д., Хендри П., Волк Х., Сазерленд Т.Д. (октябрь 2011 г.). «Полная последовательность генома некультивируемого штамма Methanococcus maripaludis, извлеченная в ходе метагеномного исследования жидкостей нефтяных пластов» . Журнал бактериологии . 193 (19): 5595. doi : 10.1128/JB.05835-11 . ПМК   3187424 . ПМИД   21914896 .
  57. ^ "Candidatum Methanoregula boonei 6A8" . http://genome.jgi-psf.org/metbo/metbo.info.html
  58. ^ Эркель С., Кубе М., Рейнхардт Р., Лисак В. (июль 2006 г.). «Геном архей рисового кластера I - основных производителей метана в ризосфере риса». Наука . 313 (5785): 370–2. Бибкод : 2006Sci...313..370E . дои : 10.1126/science.1127062 . ПМИД   16857943 . S2CID   42808519 .
  59. ^ Сакаи С., Имачи Х., Ханада С., Охаши А., Харада Х., Камагата Ю. (апрель 2008 г.). «Methanocella paludicola gen. nov., sp. nov., архея, производящая метан, первый изолят линии «Рисовый кластер I» и предложение нового порядка архей Methanocellales ord. nov» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (Часть 4): 929–36. дои : 10.1099/ijs.0.65571-0 . ПМИД   18398197 .
  60. ^ Сакаи С., Такаки Ю., Симамура С., Секине М., Тадзима Т., Косуги Х. и др. (2011). «Последовательность генома мезофильного гидрогенотрофного метаногена Methanocella paludicola, первого культивируемого представителя отряда Methanocellales» . ПЛОС ОДИН . 6 (7): e22898. Бибкод : 2011PLoSO...622898S . дои : 10.1371/journal.pone.0022898 . ПМК   3146512 . ПМИД   21829548 .
  61. ^ Лю З, Лу Ю (май 2012 г.). «Полная последовательность генома термофильного метаногена Methanocella conradii HZ254, выделенного из почвы рисового поля Китая» . Журнал бактериологии . 194 (9): 2398–9. дои : 10.1128/JB.00207-12 . ПМК   3347084 . ПМИД   22493204 .
  62. ^ Аллен М.А., Лауро Ф.М., Уильямс Т.Дж., Бург Д., Сиддики К.С., Де Франциски Д. и др. (сентябрь 2009 г.). «Последовательность генома психрофильной археи Methanococcoides burtonii: роль эволюции генома в адаптации к холоду» . Журнал ISME . 3 (9): 1012–35. дои : 10.1038/ismej.2009.45 . ПМИД   19404327 .
  63. ^ Андерсон И.Дж., Сеправска-Лупа М., Гольцман Е., Лапидус А., Коупленд А., Главина Дель Рио Т. и др. (сентябрь 2009 г.). «Полная последовательность генома штамма Z Methanocorpusculum labreanum» . Стандарты в геномных науках . 1 (2): 197–203. дои : 10.4056/sig.35575 . ПМК   3035222 . ПМИД   21304657 .
  64. ^ Андерсон И.Дж., Сеправска-Лупа М., Лапидус А., Нолан М., Коупленд А., Главина Дель Рио Т. и др. (сентябрь 2009 г.). «Полная последовательность генома Methanoculleus marisnigri Romesser et al. 1981, типовой штамм JR1» . Стандарты в геномных науках . 1 (2): 189–96. дои : 10.4056/sig.32535 . ПМК   3035220 . ПМИД   21304656 .
  65. ^ «Информация — Methanohalobium evestigatum Z-7303» . Архивировано из оригинала 30 июня 2015 г. Проверено 8 марта 2012 г.
  66. ^ Спринг С., Шойнер С., Лапидус А., Лукас С., Главина Дель Рио Т., Тайс Х. и др. (декабрь 2010 г.). «Последовательность генома Methanohalophilus mahii SLP(T) выявляет различия в энергетическом метаболизме среди представителей Methanosarcinaceae, населяющих пресноводную и соленую среду» . Архея . 2010 : 690737. doi : 10.1155/2010/690737 . ПМК   3017947 . ПМИД   21234345 .
  67. ^ Барбер Р.Д., Чжан Л., Харнак М., Олсон М.В., Каул Р., Ингрэм-Смит С., Смит К.С. (июль 2011 г.). «Полная последовательность генома Methanosaeta concilii, специалиста по ацетикластическому метаногенезу» . Журнал бактериологии . 193 (14): 3668–9. дои : 10.1128/JB.05031-11 . ПМЦ   3133334 . ПМИД   21571998 .
  68. ^ Брамбилла Э., Джао О.Д., Далиго Х., Лапидус А., Лукас С., Хэммон Н. и др. (октябрь 2010 г.). «Полная последовательность генома штамма типа Methanoplanus Petroearius (SEBR 4847)» . Стандарты в геномных науках . 3 (2): 203–11. дои : 10.4056/sig.1183143 . ПМК   3035365 . ПМИД   21304750 .
  69. ^ Галаган Дж.Э., Нусбаум С., Рой А., Эндрицци М.Г., Макдональд П., ФитцХью В. и др. (апрель 2002 г.). «Геном M. acetivorans демонстрирует обширное метаболическое и физиологическое разнообразие» . Геномные исследования . 12 (4): 532–42. дои : 10.1101/гр.223902 . ПМК   187521 . ПМИД   11932238 .
  70. ^ Мэдер Д.Л., Андерсон И., Бреттин Т.С., Брюс Д.К., Гилна П., Хан К.С. и др. (ноябрь 2006 г.). «Геном Methanosarcina barkeri: сравнительный анализ с Methanosarcina acetivorans и Methanosarcina mazei выявляет обширные перестройки в геномах метаносарцинов» . Журнал бактериологии . 188 (22): 7922–31. дои : 10.1128/JB.00810-06 . ПМЦ   1636319 . ПМИД   16980466 .
  71. ^ Деппенмайер У., Йоханн А., Харч Т., Меркл Р., Шмитц Р.А., Мартинес-Ариас Р. и др. (июль 2002 г.). «Геном Methanosarcina mazei: доказательства латерального переноса генов между бактериями и архей». Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 4 (4): 453–61. ПМИД   12125824 .
  72. ^ Слесарев А.И., Межевая К.В., Макарова К.С., Полушин Н.Н., Щербинина О.В., Шахова В.В. и др. (апрель 2002 г.). «Полный геном гипертермофила Methanopyrus kandleri AV19 и монофилия архейных метаногенов» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (7): 4644–9. Бибкод : 2002PNAS...99.4644S . дои : 10.1073/pnas.032671499 . ПМЦ   123701 . ПМИД   11930014 .
  73. ^ Гаспин С., Кавайе Дж., Эраузо Дж., Бачеллери Дж. П. (апрель 2000 г.). «Архейные гомологи метилирования эукариот управляют малыми ядрышковыми РНК: уроки геномов Pyrococcus». Журнал молекулярной биологии . 297 (4): 895–906. дои : 10.1006/jmbi.2000.3593 . ПМИД   10736225 .
  74. ^ Маедер Д.Л., Вайс Р.Б., Данн Д.М., Черри Дж.Л., Гонсалес Дж.М., ДиРуджеро Дж., Робб Ф.Т. (август 1999 г.). «Дивергенция гипертермофильных архей Pyrococcus Furiosus и P. Horikoshii, выведенная на основе полных геномных последовательностей» . Генетика . 152 (4): 1299–305. дои : 10.1093/генетика/152.4.1299 . ПМЦ   1460691 . ПМИД   10430560 .
  75. ^ Каварабаяси Ю., Савада М., Хорикава Х., Хайкава Ю., Хино Ю., Ямамото С. и др. (апрель 1998 г.). «Полная последовательность и генная организация генома гипертермофильной архебактерии Pyrococcus horikoshii OT3» . Исследование ДНК . 5 (2): 55–76. дои : 10.1093/dnares/5.2.55 . ПМИД   9679194 .
  76. ^ Цзюнь X, Лупэн Л., Миньюань Х, Огер П., Фэнпин В., Джеббар М., Сян Х. (август 2011 г.). «Полная последовательность генома облигатной пьезофильной гипертермофильной археи Pyrococcus yayanosii CH1» . Журнал бактериологии . 193 (16): 4297–8. дои : 10.1128/JB.05345-11 . ПМК   3147706 . ПМИД   21705594 .
  77. ^ Ваннье П., Мартейнссон В.Т., Фридьонссон О.Г., Огер П., Джеббар М. (март 2011 г.). «Полная последовательность генома гипертермофильных, пьезофильных, гетеротрофных и карбоксидотрофных архей Thermococcus barophilus MP» . Журнал бактериологии . 193 (6): 1481–2. дои : 10.1128/JB.01490-10 . ПМК   3067617 . ПМИД   21217005 .
  78. ^ Живанович Ю., Арменго Дж., Лагорс А., Леплат С., Герен П., Дутертр М. и др. (2009). «Анализ генома и полногеномная протеомика Thermococcus gammatolerans, самого радиорезистентного организма, известного среди архей» . Геномная биология . 10 (6): 70 рандов. дои : 10.1186/gb-2009-10-6-r70 . ПМК   2718504 . ПМИД   19558674 .
  79. ^ Фукуи Т., Атоми Х., Канаи Т., Мацуми Р., Фудзивара С., Иманака Т. (март 2005 г.). «Полная последовательность генома гипертермофильной археи Thermococcus kodakaraensis KOD1 и сравнение с геномами Pyrococcus» . Геномные исследования . 15 (3): 352–63. дои : 10.1101/гр.3003105 . ПМЦ   551561 . ПМИД   15710748 .
  80. ^ Ли Х.С., Кан С.Г., Бэ С.С., Лим Дж.К., Чо Ю., Ким Ю.Дж. и др. (ноябрь 2008 г.). «Полная последовательность генома Thermococcus onnurineus NA1 демонстрирует смешанный гетеротрофный и карбоксидотрофный метаболизм» . Журнал бактериологии . 190 (22): 7491–9. дои : 10.1128/JB.00746-08 . ПМК   2576655 . ПМИД   18790866 .
  81. ^ Марданов А.В., Равин Н.В., Светличный В.А., Белецкий А.В., Мирошниченко М.Л., Бонч-Осмоловская Е.А., Скрябин К.Г. (июль 2009 г.). «Метаболическая универсальность и аборигенное происхождение археи Thermococcus sibiricus, выделенной из сибирского нефтяного резервуара, как показал анализ генома» . Прикладная и экологическая микробиология . 75 (13): 4580–8. Бибкод : 2009ApEnM..75.4580M . дои : 10.1128/АЕМ.00718-09 . ПМК   2704819 . ПМИД   19447963 .
  82. ^ Ван X, Гао Z, Сюй X, Жуань Л (октябрь 2011 г.). «Полная последовательность генома штамма 4557 Thermococcus sp., гипертермофильного архея, выделенного из глубоководной гидротермальной зоны» . Журнал бактериологии . 193 (19): 5544–5. дои : 10.1128/JB.05851-11 . ПМК   3187469 . ПМИД   21914870 .
  83. ^ Огер П., Соколова Т.Г., Кожевникова Д.А., Черных Н.А., Бартлетт Д.Х., Бонч-Осмоловская Е.А., Лебединский А.В. (декабрь 2011 г.). «Полная последовательность генома гипертермофильного археи Thermococcus sp. штамма AM4, способного к органотрофному росту и росту за счет гидрогеногенного или сульфидогенного окисления оксида углерода» . Журнал бактериологии . 193 (24): 7019–20. дои : 10.1128/JB.06259-11 . ПМЦ   3232831 . ПМИД   22123768 .
  84. ^ Аллен Э.Э., Тайсон Г.В., Уитакер Р.Дж., Деттер Дж.К., Ричардсон П.М., Банфилд Дж.Ф. (февраль 2007 г.). «Динамика генома в естественной популяции архей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (6): 1883–8. Бибкод : 2007PNAS..104.1883A . дои : 10.1073/pnas.0604851104 . ПМК   1794283 . ПМИД   17267615 .
  85. ^ Фюттерер О, Ангелов А, Лизеганг Х, Готшалк Г, Шлепер С, Шеперс Б и др. (июнь 2004 г.). «Последовательность генома Picrophilus torridus и ее значение для жизни при pH 0» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (24): 9091–6. Бибкод : 2004PNAS..101.9091F . дои : 10.1073/pnas.0401356101 . ПМК   428478 . ПМИД   15184674 .
  86. ^ Руепп А., Грамл В., Сантос-Мартинес М.Л., Коретке К.К., Волкер С., Мьюс Х.В. и др. (сентябрь 2000 г.). «Последовательность генома термоацидофильного мусорщика Thermoplasma acidophilum» . Природа . 407 (6803): 508–13. Бибкод : 2000Natur.407..508R . дои : 10.1038/35035069 . ПМИД   11029001 .
  87. ^ Кавасима Т., Амано Н., Койке Х., Макино С., Хигучи С., Кавасима-Охья Ю. и др. (декабрь 2000 г.). «Адаптация архей к более высоким температурам, выявленная по геномной последовательности Thermoplasma volcanium» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (26): 14257–62. Бибкод : 2000PNAS...9714257K . дои : 10.1073/pnas.97.26.14257 . ЧВК   18905 . ПМИД   11121031 .
  88. ^ Элкинс Дж.Г., Подар М., Грэм Д.Е., Макарова К.С., Вольф Ю., Рандау Л. и др. (июнь 2008 г.). «Геном корархей открывает понимание эволюции архей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (23): 8102–7. Бибкод : 2008PNAS..105.8102E . дои : 10.1073/pnas.0801980105 . ПМК   2430366 . ПМИД   18535141 .
  89. ^ Уотерс Э., Хон М.Дж., Ахель И., Грэм Д.Э., Адамс М.Д., Барнстед М. и др. (октябрь 2003 г.). «Геном Nanoarchaeum equitans: понимание ранней эволюции архей и производного паразитизма» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 100 (22): 12984–8. Бибкод : 2003PNAS..10012984W . дои : 10.1073/pnas.1735403100 . ПМК   240731 . ПМИД   14566062 .
  90. ^ Халлам С.Дж., Константинидис К.Т., Патнэм Н., Шлепер С., Ватанабэ Ю., Сугахара Дж. и др. (ноябрь 2006 г.). «Геномный анализ некультивируемого морского кренархеота Cenarchaeum symbiosum» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (48): 18296–301. Бибкод : 2006PNAS..10318296H . дои : 10.1073/pnas.0608549103 . ПМЦ   1643844 . ПМИД   17114289 .
  91. ^ Блейни ПК, Мозье А.С., Потанина А., Фрэнсис К.А., Quake SR (февраль 2011 г.). «Геном низкосоленой археи, окисляющей аммиак, определенный с помощью одноклеточного и метагеномного анализа» . ПЛОС ОДИН . 6 (2): e16626. Бибкод : 2011PLoSO...616626B . дои : 10.1371/journal.pone.0016626 . ПМК   3043068 . ПМИД   21364937 .
  92. ^ Уокер С.Б., де ла Торре-младший, Клотц М.Г., Уракава Х., Пинель Н., Арп DJ и др. (май 2010 г.). «Геном Nitrosopumilus maritimus раскрывает уникальные механизмы нитрификации и автотрофии у глобально распространенных морских кренархей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (19): 8818–23. Бибкод : 2010PNAS..107.8818W . дои : 10.1073/pnas.0913533107 . ПМЦ   2889351 . ПМИД   20421470 .
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=List_of_sequenced_archaeal_genomes&oldid=1218512414"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 45401dacb66670b8cef91550cff33450__1712884860
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/45/50/45401dacb66670b8cef91550cff33450.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
List of sequenced archaeal genomes - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)