Метанокальдококк

Метанокальдококк
Научная классификация
Домен:	Архея
Королевство:	Эвриархеота
Тип:	Эвриархеота
Сорт:	Метанококки
Заказ:	Метанококки
Семья:	Метанокальдококковые
Род:	Метанокальдококк ; Уитмен 2002
Типовой вид
	Метанокальдококк jannaschii ; (Джонс и др., 1984 г.) Уитмен, 2002 г.
Разновидность
	М. батоардесценс ; М. кипение ; М. Индикус ; М. Ад ; М. jannaschii ; М. виллозус ; М. Вулканиус ;

Methanocaldococcus ранее известный как Methanococcus, представляет собой род кокковидных , метаногенных архей. ^{[ 1 ]} Все они мезофилы , за исключением термофильного M. thermolithotropicus и гипертермофильного M. jannaschii . Последний был обнаружен у основания дымовой трубы « белого курильщика » на 21° с.ш. на Восточно-Тихоокеанском поднятии. ^{[ 2 ]} и это был первый архей геном , который был полностью секвенирован, что выявило множество новых и эукариотоподобных элементов. ^{[ 3 ]}

Номенклатура

Название Methanocaldococcus имеет латинские и греческие корни: метан — метан , кальдо — горячий и греческий коккос — сферическую форму клеток. В целом название означает сферическую ячейку, производящую метан при высоких температурах . ^{[ 4 ]}

Метаболизм

Все виды Methanocaldococcus являются облигатными метаногенами . Они используют водород для уменьшения выбросов углекислого газа . В отличие от многих других видов Euryarchaeota, они не могут использовать формиат , ацетат , метанол или метиламины в качестве субстратов . ^{[ 4 ]}

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). ^{[ 5 ]} и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). ^{[ 6 ]}

на основе 16S рРНК ДП _06_2022 ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

53 маркерных белка на основе GTDB 08-RS214 ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Метанокальдококковые

M. villosus Bellack et al. 2011 год

	M. indicus L'Haridon et al. 2003 г.

	M. infernus (Жантон и др., 1998 г.) Уитмен, 2002 г.

М. vulcanius (Жантон и др., 1999) Уитмен, 2002 г.

M. jannaschii (Jones et al. 1984) Whitman 2002 (тип sp.)

М. Фервенс (Жантон и др., 1999 г.) Уитмен, 2002 г.

	М. Bathoardescens Stewart et al. 2015 год

	M. lauensis L'Haridon et al. 2023 год

Метанокальдококк

Метанокальдококковые

	М. виллозус

	М. Ад

М. кипение

М. батоардесценс

	М. jannaschii

	М. Вулканиус

Метанокальдококк

См. также

Ссылки

^ См . веб-страницу NCBI , посвященную метанокальдококку . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.
^ У. Дж. Джонс; и др. (декабрь 1983 г.). « Methanococcus jannaschii sp. nov., чрезвычайно термофильный метаноген из подводных гидротермальных источников». Арх. Микробиол . 136 (4): 254–261. дои : 10.1007/BF00425213 . S2CID 33277659 .
^ Си Джей Балт; и др. (август 1996 г.). «Полная последовательность генома метаногенного архея Methanococcus jannaschii ». Наука . 273 (5278): 1058–1073. Бибкод : 1996Sci...273.1058B . дои : 10.1126/science.273.5278.1058 . ПМИД 8688087 . S2CID 41481616 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Дэвид Р. Бун; Ричард В. Кастенхольц, ред. (13 января 2012 г.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 1 (2-е изд.). Нуэва-Йорк: Springer Science and Business Media. п. 243. дои : 10.1007/978-0-387-21609-6 . ISBN 978-1-4419-3159-7 . S2CID 41426624 . Проверено 27 июля 2016 г.
^ Ж. П. Эзеби. «Метанококки» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). Архивировано из оригинала 27 января 2013 г. Проверено 17 ноября 2011 г.
^ Сэйерс; и др. «Метанококки» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 5 июня 2011 г.
^ «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

Дальнейшее чтение

Уитмен, ВБ (2001). «Род I. Methanocaldococcus gen. nov.». В Докторе Буне; Р.В. Кастенхольц (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Springer Verlag . ISBN 978-0-387-98771-2 .
Уитмен ВБ; Бун Д.Р.; Кога Ю. (2001). «Семейство II. Methanocaldococcaceae, сем. Ноябрь». В Докторе Буне; Р.В. Кастенхольц (ред.). Руководство Берджи по систематической бактериологии, том 1: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии (2-е изд.). Нью-Йорк: Издательство Springer. ISBN 978-0-387-98771-2 .

Внешние ссылки

Эта эвриархеотами статья, связанная с , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] См . веб-страницу NCBI , посвященную метанокальдококку . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.

[2] У. Дж. Джонс; и др. (декабрь 1983 г.). « Methanococcus jannaschii sp. nov., чрезвычайно термофильный метаноген из подводных гидротермальных источников». Арх. Микробиол . 136 (4): 254–261. дои : 10.1007/BF00425213 . S2CID 33277659 .

[3] Си Джей Балт; и др. (август 1996 г.). «Полная последовательность генома метаногенного архея Methanococcus jannaschii ». Наука . 273 (5278): 1058–1073. Бибкод : 1996Sci...273.1058B . дои : 10.1126/science.273.5278.1058 . ПМИД 8688087 . S2CID 41481616 .

[Bergey-4] Перейти обратно: ^а ^б Дэвид Р. Бун; Ричард В. Кастенхольц, ред. (13 января 2012 г.). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Том. 1 (2-е изд.). Нуэва-Йорк: Springer Science and Business Media. п. 243. дои : 10.1007/978-0-387-21609-6 . ISBN 978-1-4419-3159-7 . S2CID 41426624 . Проверено 27 июля 2016 г.

[5] Ж. П. Эзеби. «Метанококки» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). Архивировано из оригинала 27 января 2013 г. Проверено 17 ноября 2011 г.

[6] Сэйерс; и др. «Метанококки» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 5 июня 2011 г.

[7] «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.

[8] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.

[9] «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.

[about-10] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-11] "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-12] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]