Methanocaldococcus

Methanocaldococcus
Научная классификация
Домен:	Археи
Королевство:	Erycharchaet
Филум:	Erycharchaet
Сорт:	Метанококки
Заказ:	Метанококка
Семья:	Methanocaldococcaceae
Род:	Methanocaldococcus ; Уитмен 2002
Тип видов
	Methanocaldococcus jannaschii ; (Jones et al. 1984) Whitman 2002
Разновидность
	М. Баттардесокс ; М. Горячий ; Маркус Индика ; М. Ад ; М. Джаннаший ; М. Виллос ; Маркус Вулканий ;

Methanocaldococcus ранее известный как Methanococcus, является родом коккоидной , метаногенной археи. ^{[ 1 ]} Все это мезофилы , за исключением термофильного M. thermolithotrophicus и гипертермофильного M. jannaschii . Последний был обнаружен у основания дымохода « белый курильщик 21 с.ш. » при ° ^{[ 2 ]} И это был первый архейский геном , который был полностью секвенирован, выявляя множество новых и эукариот -подобных элементов. ^{[ 3 ]}

Номенклатура

Название Methanocaldococcus имеет латинские и греческие корни, метано для метана , Caldo для горячих и греческих кокко для сферической формы клеток. В целом, название означает сферическую клетку, которая производит метатан при горячих температурах . ^{[ 4 ]}

Метаболизм

Все виды в метанокальдококке являются облигационными метаногенами . Они используют водород для уменьшения углекислого газа . В отличие от многих других видов в Euryarchaeota, они не могут использовать формиат , ацетат , метанол или метиламины в качестве субстратов . ^{[ 4 ]}

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на списке прокариотических имен в номенклатуре (LPSN) ^{[ 5 ]} и Национальный центр информации о биотехнологии (NCBI). ^{[ 6 ]}

16S RRNA на основе LTP _06_2022 ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

53 маркерные белки на основе GTDB 08-RS214 ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}

Methanocaldococcaceae

M. Villosus Bellack et al. 2011 год

	M. Indicus L'haridon et al. 2003

	M. Hell (Jeanthon et al. 1998) Whitman 2002

Маркус Вулканий (Jeanthon et al. 1999) Whitman 2002

M. Jannaschii (Jones et al. 1984) Whitman 2002 (Type sp.)

М. Хот (Jeanthon et al. 1999) Whitman 2002

	M. Bathoardescens Stewart et al. 2015

	M. lauensis l'aridon et al. 2023

Methanocaldococcus

Methanocaldococcaceae

	М. Виллос

	М. Ад

М. Горячий

М. Баттардесокс

	М. Джаннаший

	Маркус Вулканий

Methanocaldococcus

Смотрите также

Ссылки

^ См . Веб -страницу NCBI на Methanocaldococcus . Данные, извлеченные из «NCBI таксономия ресурсов» . Национальный центр информации о биотехнологии . Получено 2007-03-19 .
^ WJ Jones; и др. (Декабрь 1983). « Methanococcus jannaschii sp. Nov., Чрезвычайно термофильный метаноген из подводного гидротермального вентиляционного отверстия». Архи Микробиол . 136 (4): 254–261. doi : 10.1007/bf00425213 . S2CID 33277659 .
^ CJ Bult; и др. (Август 1996). «Полная последовательность генома метаногенного археона, метанококка Jannaschii ». Наука . 273 (5278): 1058–1073. Bibcode : 1996sci ... 273.1058b . doi : 10.1126/science.273.5278.1058 . PMID 8688087 . S2CID 41481616 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Дэвид Р. Бун; Ричард В. Кастенхольц, ред. (2012-01-13). Руководство по систематической бактериологии Берджи . Тол. 1 (2 изд.). Nueva York: Springer Science и Business Media. п. 243. doi : 10.1007/978-0-387-21609-6 . ISBN 978-1-4419-3159-7 Полем S2CID 41426624 . Получено 2016-07-27 .
^ JP Euzéby. «Метанококкалы» . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN). Архивировано с оригинала 2013-01-27 . Получено 2011-11-17 .
^ Sayers; и др. «Метанококкалы» . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2011-06-05 .
^ "LTP" . Получено 10 мая 2023 года .
^ «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 10 мая 2023 года .
^ «LTP_06_2022 Notes» (PDF) . Получено 10 мая 2023 года .
^ "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
^ "AR53_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

Дальнейшее чтение

Уитмен, WB (2001). «Род I. Methanocaldococcus Gen. Nov.». В докторе Бун; RW Castenholz (Eds.). Руководство Берджи по систематической бактериологии Том 1: Археи и глубоко разветвленные и фототрофные бактерии (2 -е изд.). Нью -Йорк: Springer Verlag . ISBN 978-0-387-98771-2 .
Уитмен WB; Бун Др; KO Y (2001). Ноябрь В докторе Бун; RW Castenolz (ред.). Полем Нью -Йорк: Spupinger Verlag. ISBN 978-0-387-98771-2 .

Внешние ссылки

Эта статья, связанная с Euryarchaeota, является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] См . Веб -страницу NCBI на Methanocaldococcus . Данные, извлеченные из «NCBI таксономия ресурсов» . Национальный центр информации о биотехнологии . Получено 2007-03-19 .

[2] WJ Jones; и др. (Декабрь 1983). « Methanococcus jannaschii sp. Nov., Чрезвычайно термофильный метаноген из подводного гидротермального вентиляционного отверстия». Архи Микробиол . 136 (4): 254–261. doi : 10.1007/bf00425213 . S2CID 33277659 .

[3] CJ Bult; и др. (Август 1996). «Полная последовательность генома метаногенного археона, метанококка Jannaschii ». Наука . 273 (5278): 1058–1073. Bibcode : 1996sci ... 273.1058b . doi : 10.1126/science.273.5278.1058 . PMID 8688087 . S2CID 41481616 .

[Bergey-4] Jump up to: ^а ^{беременный} Дэвид Р. Бун; Ричард В. Кастенхольц, ред. (2012-01-13). Руководство по систематической бактериологии Берджи . Тол. 1 (2 изд.). Nueva York: Springer Science и Business Media. п. 243. doi : 10.1007/978-0-387-21609-6 . ISBN 978-1-4419-3159-7 Полем S2CID 41426624 . Получено 2016-07-27 .

[5] JP Euzéby. «Метанококкалы» . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN). Архивировано с оригинала 2013-01-27 . Получено 2011-11-17 .

[6] Sayers; и др. «Метанококкалы» . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2011-06-05 .

[7] "LTP" . Получено 10 мая 2023 года .

[8] «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 10 мая 2023 года .

[9] «LTP_06_2022 Notes» (PDF) . Получено 10 мая 2023 года .

[about-10] "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[tree-11] "AR53_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[taxon_history-12] «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]