Сульфобус сольфатарикус
 | Эту статью может потребовать очистки Википедии , чтобы она соответствовала стандартам качества . Конкретная проблема заключается в том, что повсюду разбросаны проблемы грамматики и форматирования. ( сентябрь 2023 г. ) |
| Сульфобус сольфатарикус | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Тип: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Разновидность: | С. сольфатарикус |
| Биномиальное имя | |
| Сульфобус сольфатарикус Зиллиг и др. 1980 год | |
| Синонимы | |
| |
Saccharolobus — вид архей теплолюбивых . solfataricus Переведен из рода Sulfolobus в новый род Saccharolobus с описанием Saccharolobuscaldissimus в 2018 г. [1]
Впервые он был выделен и обнаружен в вулкане Сольфатара (в честь которого он впоследствии был назван) в 1980 году двумя немецкими микробиологами Карлом Сеттером и Вольфрамом Циллигом в вулкане Сольфатара (Пишарелли-Кампания, Италия). [2]
Однако эти организмы не изолированы от вулканов, а встречаются по всему миру в таких местах, как горячие источники. Лучше всего этот вид растет при температуре около 80 ° C, уровне pH от 2 до 4 и достаточном количестве серы, чтобы сольфатарикус мог метаболизироваться и получать энергию. Эти условия квалифицируют его как экстремофила , и он особенно известен как термоацидофил из-за его предпочтения к высоким температурам и низким уровням pH, а также относится к аэробным и гетеротропным категориям по своей метаболической системе. [3] Обычно он имеет сферическую форму клеток и образует частые доли. Будучи автотрофом, он получает энергию от роста на сере или даже на различных органических соединениях. [4]
В настоящее время это наиболее широко изученный организм из отдела Thermoproteota . Solfataricus исследуются на предмет их методов репликации ДНК, клеточного цикла, хромосомной интеграции, транскрипции, обработки РНК и трансляции. Все данные указывают на то, что в организме имеется большой процент специфичных для архей генов, что демонстрирует различия между тремя типами микробов: архей , бактериями и эукариями .
Геном
[ редактировать ]Sulfolobus solfataricus — наиболее изученный микроорганизм с молекулярной, генетической и биохимической точки зрения из-за его способности выживать в экстремальных условиях; его легко культивировать в лаборатории; более того, он может обмениваться генетическим материалом посредством процессов трансформации, трансдукции и конъюгации.
Основной мотивацией для секвенирования этих микроорганизмов является термостабильность белков , которые обычно денатурируют при высокой температуре . Полное секвенирование генома было S. solfataricus завершено в 2001 году. [5] В одной хромосоме имеется 2 992 245 пар оснований, которые кодируют 2 977 белков и большое количество РНК. Треть белков, кодируемых S. solfataricus, не имеют гомологов в других геномах. Что касается остальных кодируемых белков, 40% являются специфичными для Archaea , 12% являются общими для бактерий и 2,3% являются общими для Eukarya .; [6] 33% этих белков кодируются исключительно в Sulfolobus . Большое количество ORF ( открытая рамка считывания ) очень похожи у Thermoplasma . [3]
Малые ядрышковые РНК (snoRNA), уже присутствующие у эукариот, также были идентифицированы у S.Solfataricus и S.acidolcaldarius . Они уже известны своей ролью в посттранскрипционных модификациях и удалении интронов из рибосомальной РНК у эукарий. [7]
Геном Sulfolobus характеризуется наличием коротких тандемных повторов, инсерционных и повторяющихся элементов, он имеет широкий диапазон разнообразия, поскольку имеет 200 различных элементов инсерционной последовательности IS.
Термофильная обратная гираза
[ редактировать ]Стабилизация двойной спирали против денатурации у архей обусловлена присутствием особого специфического термофильного фермента - обратной гиразы. Он был обнаружен у гипертермофильных и термофильных архей и бактерий. есть два гена У Sulfolobus , каждый из которых кодирует обратную гиразу. [8] Это атипичные топоизомеразы ДНК , основная активность которых заключается в образовании положительных суперспиралей в замкнутой кольцевой ДНК. Положительная суперспирализация важна для предотвращения образования открытых комплексов. Обратные гиразы состоят из двух доменов: первый - геликазоподобный , второй - топоизомераза I. Возможная роль обратной гиразы может заключаться в использовании положительной суперспирализации для сборки хроматин-подобных структур. [9] В 1997 году ученые обнаружили еще одну важную особенность Sulfolobus : этот микроорганизм содержит топоизомеразу типа II, названную TopoVI, чья субъединица A гомологична фактору мейотической рекомбинации Spo11 , который играет преобладающую роль в инициации мейотической рекомбинации у всех эукариев. [10] [11]
S. solfataricus состоит из трех топоизомераз типа I, TopA, двух обратных гираз, TopR1 и TopR2, а также одной топоизомеразы типа II, TopoVI. [12]
ДНК-связывающие белки
[ редактировать ]В типе Thermoproteota есть три белка, которые связывают малую бороздку ДНК, подобно гистонам : Alba, Cren7 и Sso7d, которые модифицируются после процесса трансляции. Они небольшие и были обнаружены у нескольких штаммов Sulfolobus, но не в другом геноме. Белок хроматин у Sulfolobus составляет 1-5% от общего количества. Они могут выполнять как структурные, так и регуляторные функции. Они похожи на белки человеческого HMG-бокса из-за их влияния на геномы, экспрессию и стабильность, а также на эпигенетические процессы. [13] У видов, лишенных гистонов, они могут ацетилироваться и метилироваться, как эукариотические гистоны. [14] [15] [16] [17] Штаммы Sulfolobus представляют различные своеобразные ДНК-связывающие белки, такие как семейство белков Sso7d. Они стабилизируют двойную спираль, предотвращая денатурацию при высокой температуре, тем самым способствуя отжигу выше температуры плавления . [18]
Основной компонент хроматина архалей представлен белком семейства Sac10b, известным как Alba (ацетилирование снижает аффинность связывания). [19] [20] Эти белки представляют собой небольшие, основные и димерные белки, связывающие нуклеиновые кислоты. Более того, он консервативен в большинстве секвенированных архейных геномов. [21] [22] Состояние ацетилирования Alba, например, влияет на доступ к промотору и транскрипцию in vitro, тогда как состояние метилирования другого белка хроматина Sulfolobus , Sso7D, изменяется в зависимости от температуры культуры. [23] [24]
Работа группы Вольфрама Зиллига, представляющая ранние свидетельства эукариотических характеристик транскрипции у Archea, с тех пор сделала Sulfolobus идеальной модельной системой для исследований транскрипции. Недавние исследования Sulfolobus, в дополнение к другим видам архей, в основном сосредоточены на составе, функции и регуляции транскрипционного аппарата у этих организмов, а также на фундаментальных консервативных аспектах этого процесса как у Eucarya, так и у Archaea. [25]
перенос ДНК
[ редактировать ]Воздействие на Saccharolobus solfataricus агентов, повреждающих ДНК, УФ-облучения , блеомицина или митомицина С вызывает агрегацию клеток. [26] Другие физические стрессоры, такие как изменения pH или температурный сдвиг, не вызывают агрегацию, что позволяет предположить, что индукция агрегации вызвана именно повреждением ДНК. Аджон и др. [27] показали, что агрегация клеток, индуцированная УФ-излучением, с высокой частотой опосредует обмен хромосомных маркеров. Скорость рекомбинации превышала таковую в неиндуцированных культурах почти на три порядка. Фролс и др. [26] [28] и Аджон и др. [27] выдвинули гипотезу, что процесс переноса ДНК, индуцируемый УФ-излучением, и последующая гомологичная рекомбинационная репарация представляют собой важный механизм поддержания целостности хромосом. Этот ответ может быть примитивной формой полового взаимодействия, похожей на более хорошо изученную бактериальную трансформацию, которая также связана с переносом ДНК между клетками, ведущим к гомологичной рекомбинационной репарации повреждений ДНК. [29]
Метаболизм
[ редактировать ]Известно, что Sulfolobus solfataricus растет хемоорганотрофно в присутствии кислорода на различных органических соединениях, таких как сахара, спирты, аминокислоты и ароматические соединения, такие как фенол . [30]
Он использует модифицированный путь Энтнера-Дудрофа для окисления глюкозы, и образующиеся молекулы пирувата могут быть полностью минерализованы в цикле ТСА . [30]
Молекулярный кислород — единственный известный акцептор электронов на конце цепи переноса электронов . [31] Помимо органических молекул, этот вид Archea также может использовать сероводород. [6] и элементарную серу в качестве доноров электронов и фиксировать CO 2 , возможно, посредством цикла HP/HB, [30] что делает его способным жить хемоавтотрофно. Недавние исследования обнаружили также способность выращивать, хотя и медленно, окисляющий молекулярный водород. [1]
Ферредоксин
[ редактировать ]Предполагается, что ферредоксин действует как основной метаболический переносчик электронов у S. solfataricus . Это контрастирует с большинством видов бактерий и эукариев, которые обычно полагаются на НАДН как на основного переносчика электронов. S. solfataricus обладает сильными эукариотическими свойствами в сочетании со многими уникальными способностями, специфичными для архей. Результаты открытий были основаны на различных методах изучения механизмов ДНК, клеточных циклов и переходного аппарата. В целом, исследование стало ярким примером различий, обнаруженных у Thermoproteota и Euryarchaeota . [6] [32]
Экология
[ редактировать ]среда обитания
[ редактировать ]
S. solfataricus является крайне термофильным археем, как и остальные виды рода Sulfolobus, он имеет оптимальные условия роста в районах с сильной вулканической активностью, с высокой температурой и очень кислым pH. [33] эти специфические условия типичны для вулканической зоны, как гейзеры или термальные источники, фактически наиболее изученными странами, где были обнаружены микроорганизмы, являются: США (Йеллоустонский национальный парк), [34] Новая Зеландия, [35] Остров и Италия, печально известные такими вулканическими явлениями. Исследование, проведенное группой индонезийских ученых, показало наличие сообщества Sulfolobus также на Западной Яве, подтвердив, что высокие страхи, низкий уровень pH и присутствие серы являются необходимыми условиями для роста этих микробов. [36]
Закисление почвы
[ редактировать ]S. solfataricus способен окислять серу в соответствии с метаболической стратегией, одним из продуктов этих реакций является H+, что, как следствие, приводит к медленному закислению окружающей среды. Закисление почвы увеличивается там, где происходят выбросы загрязняющих веществ в результате промышленной деятельности, и этот процесс уменьшает количество гетеротрофных бактерий, участвующих в разложении, которые имеют основополагающее значение для переработки органических веществ и, в конечном итоге, для удобрения почвы. [37]
Биотехнология: использование ресурса Сульфолобус
[ редактировать ]Сегодня во многих областях применения мы заинтересованы в использовании Sulfolobus sulfataricus в качестве источника ферментов термостабильности для исследований и диагностики, а также в пищевой, текстильной и клининговой промышленности, целлюлозно-бумажной промышленности. Кроме того, этот фермент перегружен из-за его каталитического разнообразия, высокого pH и температурной стабильности, повышенной устойчивости к органическим растворителям и устойчивости к протеолизу. [38] [39]
В настоящее время все большее значение приобретают тетраэфирные липиды, мембранные везикулы с антимикробными свойствами, компоненты трегалозы и новые β-галактоолигосахариды. [40]
β-галактозидаза
[ редактировать ]Термостабильный фермент β-галактозидаза выделен из крайне термофильной архебактерии Sulfolobus solfataricus, штамм МТ-4.
Этот фермент используется во многих промышленных процессах обработки лактозосодержащих жидкостей путем очистки и определения их физико-химических свойств. [41]
Протеазы
[ редактировать ]Промышленность заинтересована в стабильных протеазах, а также во многих различных изученных сульфолобусных протеазах. [42]
активная аминопептидаза , связанная с шаперонином Описана Solfobulus solfataricus MT4 . [43]
Соммаруга и др. (2014) [44] также улучшил стабильность и выход реакции хорошо изученной карбоксипептидазы из S.solfataricus MT4 за счет магнитных наночастиц, иммобилизующих фермент.
Эстеразы /липазы
[ редактировать ]Новый термостабильный внеклеточный липолитический фермент серин -арилестераза , который первоначально был обнаружен благодаря его сильному действию при гидролизе органофосфатов термоацидофильной археи Sulfolobus solfataricus P1 . [45]
Шаперонины
[ редактировать ]В ответ на температурный шок (50,4 °C) в клетках E.Coli крошечный белок теплого оглушения (S.so-HSP20) из S.solfataricus P2 эффективно использовался для улучшения толерантности. [46]
Ввиду того, что шаперонин Ssocpn (920 кДа), включающий АТФ , К+ и Mg2+, но не продуцирующий у S.solfataricus никаких дополнительных белков для снабжения коллапсированных и динамических белков из денатурированных материалов, его хранили в ультрафильтрационной ячейке, при этом ренатурированные подложки двигались сквозь пленку. [47]
Липосомы
[ редактировать ]Благодаря тетраэфирному липидному материалу мембрана крайне термофильных архей уникальна по своему составу. Липиды архей являются многообещающим источником липосом с исключительной стабильностью температуры и pH, а также непроницаемостью для утечки растворенных веществ. Такие археосомы являются возможными инструментами доставки лекарств, вакцин и генов. [48]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Сакаи Х.Д., Куросава Н. (апрель 2018 г.). «Saccharolobus caldissimus gen. nov., sp. nov., факультативно анаэробный гипертермофильный археон, восстанавливающий железо, выделенный из кислого наземного горячего источника, и реклассификация Sulfolobus solfataricus в Saccharolobus solfataricus comb. nov. и Sulfolobus shibatae в Saccharolobus shibatae com. nov. " . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 68 (4): 1271–1278. дои : 10.1099/ijsem.0.002665 . ПМИД 29485400 . S2CID 4528286 .
- ^ «Где впервые был найден Sulfolobus solfataricus?» . www.intercept.cnrs.fr . 15 января 2019 г.
- ^ Jump up to: а б Чарамелла М., Пизани FM, Росси М. (август 2002 г.). «Молекулярная биология экстремофилов: последние достижения в области гипертермофильных архей Sulfolobus». Антони ван Левенгук . 81 (1–4): 85–97. дои : 10.1023/А:1020577510469 . ПМИД 12448708 . S2CID 8330296 .
- ^ Брок Т.Д., Брок К.М., Белли Р.Т., Вайс Р.Л. (1972). «Сульфолобус: новый род сероокисляющих бактерий, живущих при низком pH и высокой температуре». Архив микробиологии . 84 (1): 54–68. дои : 10.1007/bf00408082 . ПМИД 4559703 . S2CID 9204044 .
- ^ Шарлебуа Р.Л., Гаастерланд Т., Раган М.А., Дулиттл В.Ф., Сенсен К.В. (июнь 1996 г.). «Проект генома Sulfolobus solfataricus P2». Письма ФЭБС . 389 (1): 88–91. дои : 10.1016/s0014-5793(97)81281-1 . ПМИД 8682213 . S2CID 221414122 .
- ^ Jump up to: а б с Ше К., Сингх Р.К., Конфалоньери Ф., Живанович Ю., Аллард Дж., Авайез М.Дж. и др. (июль 2001 г.). «Полный геном кренархеона Sulfolobus solfataricus P2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (14): 7835–40. Бибкод : 2001PNAS...98.7835S . дои : 10.1073/pnas.141222098 . ПМК 35428 . ПМИД 11427726 .
- ^ Омер А.Д., Лоу Т.М., Рассел А.Г., Эбхардт Х., Эдди С.Р., Деннис П.П. (апрель 2000 г.). «Гомологи малых ядрышковых РНК у архей». Наука . 288 (5465): 517–22. Бибкод : 2000Sci...288..517O . дои : 10.1126/science.288.5465.517 . ПМИД 10775111 . S2CID 15552500 .
- ^ Кутюрье М., Бизард А.Х., Гарнье Ф., Надаль М. (сентябрь 2014 г.). «Понимание клеточного участия двух обратных гираз гипертермофильного архея Sulfolobus solfataricus» . BMC Молекулярная биология . 15 (1): 18. дои : 10.1186/1471-2199-15-18 . ПМК 4183072 . ПМИД 25200003 .
- ^ Декле АС, Марсо Ж, Конфалоньери Ф, де Ла Тур CB, Дюге М (июнь 2000 г.). «Обратная гираза, два домена тесно взаимодействуют, способствуя положительной суперспирализации» . Журнал биологической химии . 275 (26): 19498–504. дои : 10.1074/jbc.m910091199 . ПМИД 10748189 .
- ^ Бержера А, де Масси Б, Гадель Д, Варутас ПК, Николя А, Фортер П (март 1997 г.). «Атипичная топоизомераза II из архей, имеющая значение для мейотической рекомбинации». Природа . 386 (6623): 414–7. Бибкод : 1997Natur.386..414B . дои : 10.1038/386414a0 . ПМИД 9121560 . S2CID 4327493 .
- ^ Фортерре П., Бергерат А., Лопес-Гарсия П. (май 1996 г.). «Уникальная топология ДНК и ДНК-топоизомеразы гипертермофильных архей» . Обзоры микробиологии FEMS . 18 (2–3): 237–48. дои : 10.1111/j.1574-6976.1996.tb00240.x . ПМИД 8639331 .
- ^ Кутюрье М., Гадель Д., Фортер П., Надаль М., Гарнье Ф. (ноябрь 2019 г.). «Обратная гираза TopR1 отвечает за гомеостатический контроль сверхспирализации ДНК у гипертермофильных архей Sulfolobus solfataricus» . Молекулярная микробиология . 113 (2): 356–368. дои : 10.1111/mmi.14424 . ПМИД 31713907 . S2CID 207945754 .
- ^ Маларки К.С., Черчилль М.Е. (декабрь 2012 г.). «Групповой ящик высокой мобильности: лучший игрок ячейки» . Тенденции биохимических наук . 37 (12): 553–62. дои : 10.1016/j.tibs.2012.09.003 . ПМЦ 4437563 . ПМИД 23153957 .
- ^ Пейн С., Маккарти С., Джонсон Т., Норт Э., Блюм П. (ноябрь 2018 г.). «Сульфалобус сольфатарикус» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (48): 12271–12276. дои : 10.1073/pnas.1808221115 . ПМК 6275508 . ПМИД 30425171 .
- ^ Гуальярди А., Черкья Л., Мораччи М., Росси М. (октябрь 2000 г.). «Хромосомный белок sso7d кренархеона Sulfolobus solfataricus спасает агрегированные белки зависимым от гидролиза АТФ способом» . Журнал биологической химии . 275 (41): 31813–8. дои : 10.1074/jbc.m002122200 . ПМИД 10908560 .
- ^ Шехи Э, Граната В, Дель Веккьо П, Бароне Дж, Фуси П, Тортора П, Грациано Дж (июль 2003 г.). «Термическая стабильность и ДНК-связывающая активность варианта формы белка Sso7d из археона Sulfolobus solfataricus, усеченного по лейцину 54». Биохимия . 42 (27): 8362–8. дои : 10.1021/bi034520t . ПМИД 12846585 .
- ^ Бауманн Х., Кнапп С., Каршикофф А., Ладенштайн Р., Херд Т. (апрель 1995 г.). «ДНК-связывающая поверхность белка Sso7d из Sulfolobus solfataricus» . Журнал молекулярной биологии . 247 (5): 840–6. дои : 10.1006/jmbi.1995.0184 . ПМИД 7723036 .
- ^ Гуальярди А, Наполи А, Росси М, Чиарамелла М (апрель 1997 г.). «Отжиг комплементарных цепей ДНК выше температуры плавления дуплекса, которому способствует белок архей». Журнал молекулярной биологии . 267 (4): 841–8. дои : 10.1006/jmbi.1996.0873 . ПМИД 9135116 .
- ^ Фортерре П., Конфалоньери Ф., Кнапп С. (май 1999 г.). «Идентификация гена, кодирующего археоспецифичные ДНК-связывающие белки семейства Sac10b». Молекулярная микробиология . 32 (3): 669–70. дои : 10.1046/j.1365-2958.1999.01366.x . ПМИД 10320587 . S2CID 28146814 .
- ^ Сюэ Х, Го Р, Вэнь Ю, Лю Д, Хуан Л (июль 2000 г.). «Обильный ДНК-связывающий белок гипертермофильной археи Sulfolobus shibatae влияет на суперспирализацию ДНК в зависимости от температуры» . Журнал бактериологии . 182 (14): 3929–33. дои : 10.1128/JB.182.14.3929-3933.2000 . ПМЦ 94576 . ПМИД 10869069 .
- ^ Гоял М., Банерджи С., Наг С., Бандиопадхьяй У. (май 2016 г.). «Семейство белков Альба: структура и функции». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1864 (5): 570–83. дои : 10.1016/j.bbapap.2016.02.015 . ПМИД 26900088 .
- ^ Уордлворт Б.Н., Рассел Р.Дж., Белл С.Д., Тейлор Г.Л., Уайт М.Ф. (сентябрь 2002 г.). «Структура Alba: белок хроматина архей, модулируемый ацетилированием» . Журнал ЭМБО . 21 (17): 4654–62. дои : 10.1093/emboj/cdf465 . ПМК 125410 . ПМИД 12198167 .
- ^ Белл С.Д., Боттинг-СН, Уордлворт Б.Н., Джексон С.П., Уайт М.Ф. (апрель 2002 г.). «Взаимодействие Alba, консервативного белка хроматина архей, с Sir2 и его регуляция путем ацетилирования». Наука . 296 (5565): 148–51. Бибкод : 2002Sci...296..148B . дои : 10.1126/science.1070506 . ПМИД 11935028 . S2CID 27858056 .
- ^ Бауманн Х., Кнапп С., Лундбек Т., Ладенштайн Р., Херд Т. (ноябрь 1994 г.). «Структура раствора и ДНК-связывающие свойства термостабильного белка археи Sulfolobus solfataricus». Структурная биология природы . 1 (11): 808–19. дои : 10.1038/nsb1194-808 . ПМИД 7634092 . S2CID 37220619 .
- ^ Зиллиг В., Стеттер К.О., Янекович Д. (июнь 1979 г.). «ДНК-зависимая РНК-полимераза архебактерии Sulfolobus acidocaldarius» . Европейский журнал биохимии . 96 (3): 597–604. дои : 10.1111/j.1432-1033.1979.tb13074.x . ПМИД 380989 .
- ^ Jump up to: а б Фролс С., Айон М., Вагнер М., Тейхманн Д., Золгадр Б., Фолеа М. и др. (ноябрь 2008 г.). «Индуцируемая УФ-излучением клеточная агрегация гипертермофильных архей Sulfolobus solfataricus опосредована образованием пилей» (PDF) . Молекулярная микробиология . 70 (4): 938–52. дои : 10.1111/j.1365-2958.2008.06459.x . ПМИД 18990182 .
- ^ Jump up to: а б Айон М., Фролс С., ван Вольферен М., Стокер К., Тейхманн Д., Дриссен А.Дж. и др. (ноябрь 2011 г.). «Обмен ДНК, индуцируемый УФ-излучением, у гипертермофильных архей, опосредованный пилями IV типа» (PDF) . Молекулярная микробиология . 82 (4): 807–17. дои : 10.1111/j.1365-2958.2011.07861.x . ПМИД 21999488 .
- ^ Фрёльс С., Уайт М.Ф., Шлепер С. (февраль 2009 г.). «Реакция на повреждение УФ-излучением у модельного архея Sulfolobus solfataricus». Труды Биохимического общества . 37 (Часть 1): 36–41. дои : 10.1042/BST0370036 . ПМИД 19143598 . S2CID 837167 .
- ^ Бернштейн Х, Бернштейн С (2010). «Эволюционное происхождение рекомбинации во время мейоза». Бионаука. 60 (7): 498–505. doi:10.1525/bio.2010.60.7.5. S2CID 86663600
- ^ Jump up to: а б с Улас Т., Ример С.А., Запарти М., Зиберс Б., Шомбург Д. (31 августа 2012 г.). «Реконструкция генома и анализ метаболической сети гипертермофильных архей Sulfolobus solfataricus» . ПЛОС ОДИН . 7 (8): е43401. Бибкод : 2012PLoSO...743401U . дои : 10.1371/journal.pone.0043401 . ПМЦ 3432047 . ПМИД 22952675 .
- ^ Саймон Дж., Вальтер Дж., Забети Н., Комбе-Блан Ю., Аурия Р., ван дер Ост Дж., Касалот Л. (октябрь 2009 г.). «Влияние концентрации O2 на Sulfolobus solfataricus P2» . Письма FEMS по микробиологии . 299 (2): 255–60. дои : 10.1111/j.1574-6968.2009.01759.x . ПМИД 19735462 .
- ^ Зиллиг В., Стеттер КО, Вундерл С., Шульц В., Присс Х., Шольц I (апрель 1980 г.). «Группа Sulfolobus-«Caldariella»: систематика на основе строения ДНК-зависимых РНК-полимераз». Архив микробиологии . 125 (3): 259–69. дои : 10.1007/BF00446886 . S2CID 5805400 .
- ^ Гроган Д.В. (декабрь 1989 г.). «Фенотипическая характеристика архебактерий рода Sulfolobus: сравнение пяти штаммов дикого типа» . Журнал бактериологии . 171 (12): 6710–9. дои : 10.1128/jb.171.12.6710-6719.1989 . ПМК 210567 . ПМИД 2512283 .
- ^ «Сульфобус» . Микровики .
- ^ Хетцер А., Морган Х.В., Макдональд И.Р., Доуни С.Дж. (июль 2007 г.). «Микробная жизнь в бассейне с шампанским, геотермальном источнике в Вайотапу, Новая Зеландия». Экстремофилы . 11 (4): 605–14. дои : 10.1007/s00792-007-0073-2 . ПМИД 17426919 . S2CID 24239907 .
- ^ Адитиавати П., Йохандини Х., Мадаянти Ф. (2009). «Микробное разнообразие кислого горячего источника (кава худжан Б) в геотермальном поле в районе Камоджанг, западная Ява, Индонезия» . Открытый микробиологический журнал . 3 : 58–66. дои : 10.2174/1874285800903010058 . ПМЦ 2681175 . ПМИД 19440252 .
- ^ Брайант Р.Д., Горди Э.А., Лэйшли Э.Дж. (1979). «Влияние закисления почвы на почвенную микрофлору». Загрязнение воды, воздуха и почвы . 11 (4): 437. Бибкод : 1979WASP...11..437B . дои : 10.1007/BF00283435 . S2CID 96729369 .
- ^ Степанкова Вероника (14 октября 2013 г.). «Стратегии стабилизации ферментов в органических растворителях». АКС-катализ . 3 (12): 2823–2836. дои : 10.1021/cs400684x .
- ^ ДЭНИЭЛ, РМ (1982). «Корреляция между термостабильностью белка и устойчивостью к протеолизу» . Биохимический журнал . 207 (3): 641–644. дои : 10.1042/bj2070641 . ПМЦ 1153914 . ПМИД 6819862 .
- ^ Квенбергер, Джулиан (2017). «Сульлолобус – потенциальный ключевой организм в биотехнологии будущего» . Границы микробиологии . 8 : 2474. дои : 10.3389/fmicb.2017.02474 . ПМК 5733018 . ПМИД 29312184 .
- ^ М. ПИЗАНИ, Франческа (1990). «Термостабильная P-галактозидаза из архебактерии Sulfolobus solfataricus» . Европейский журнал биохимии . 187 (2): 321–328. дои : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb15308.x . ПМИД 2105216 .
- ^ Ханнер, Маркус (1990). Выделение и характеристика внутриклеточной аминопептидазы из крайне термофильной архебактерии Sulfolobus solfataricus . Том. 1033. Эльзевир Б.В., стр. 148–153. дои : 10.1016/0304-4165(90)90005-H . ISBN 0117536121 . ПМИД 2106344 .
{{cite book}}:|journal=игнорируется ( помогите ) - ^ Кондо, Ивано; Руджеро, Давиде (1998). «Новая аминопептидаза, связанная с шаперонином массой 60 кДа у термофильных архей Sulfolobus solfataricus. Мол. Микробиол» . Молекулярная микробиология . 29 (3): 775–785. дои : 10.1046/j.1365-2958.1998.00971.x . ПМИД 9723917 .
- ^ Соммаруга, Сильвия (2014). «Иммобилизация карбоксипептидазы из Sulfolobus solfataricus на магнитных наночастицах улучшает стабильность и функциональность фермента в органических средах. BMC Biotechnol» . БМК Биотехнология . 14 (1): 82. дои : 10.1186/1472-6750-14-82 . ПМК 4177664 . ПМИД 25193105 .
- ^ Пак, Ён-Джун (2016). «Очистка и характеристика нового индуцибельного термостабильного внеклеточного липолитического фермента термоацидофильной археи Sulfolobus solfataricus P1». Журнал молекулярного катализа B: Enzymatic . 124 : 11–19. дои : 10.1016/j.molcatb.2015.11.023 .
- ^ Ли, Донг-Чол (август 2011 г.). «Термотолерантность и молекулярная шаперонная функция небольшого белка теплового шока HSP20 гипертермофильной археи Sulfolobus solfataricus P2. Шапероны клеточного стресса» . Клеточные стрессы и шапероны . 17 (1): 103–108. дои : 10.1007/s12192-011-0289-z . ПМЦ 3227843 . ПМИД 21853411 .
- ^ Черкия, Лаура (7 августа 1999 г.). «Архейный реактор на основе шаперонина для ренатурации денатурированных белков. Экстремофил». Экстремофилы: жизнь в экстремальных условиях . 4 (1): 1–7. дои : 10.1007/s007920050001 . ПМИД 10741831 . S2CID 25407893 .
- ^ Б. Патель, Гиришчандра (1999). «Археобактериальные эфиролипидные липосомы (археосомы) как новые системы доставки вакцин и лекарств». Критические обзоры по биотехнологии . 19 (4): 317–357. дои : 10.1080/0738-859991229170 . ПМИД 10723627 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Фиорентино Дж., Дель Джудиче И., Петракконе Л., Бартолуччи С., Дель Веккьо П. (июнь 2014 г.). «Конформационная стабильность и свойства связывания лигандов BldR, члена семейства MarR, из Sulfolobus solfataricus». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Белки и протеомика . 1844 (6): 1167–72. дои : 10.1016/j.bbapap.2014.03.011 . ПМИД 24704039 .
- де Роза М., Бемпорад Ф., Пеллегрино С., Чити Ф., Болоньези М., Риканьо С. (сентябрь 2014 г.). «Инженерия краевой цепи предотвращает нативную агрегацию в ацилфосфатазе Sulfolobus solfataricus» . Журнал ФЭБС . 281 (18): 4072–84. дои : 10.1111/февраль 12861 . ПМИД 24893801 .
- Гамсьегер Р., Кариавасам Р., Тома С., Кван А.Х., Уайт М.Ф., Кубедду Л. (октябрь 2014 г.). «Магистральная и боковая цепь» 1 ЧАС, 13 С и 15 N-резонансные отведения домена OB одноцепочечного ДНК-связывающего белка из Sulfolobus solfataricus и картирование химического сдвига интерфейса ДНК-связывания». Biomolecular NMR Assignments . 8 (2): 243–6. doi : 10.1007/s12104-013- 9492-4 . ПМИД 23749431 .
- Ван Дж, Чжу Дж, Мин С, Ву С (май 2014 г.). «Слитая с CBD-связывающим доменом γ-лактамаза из Sulfolobus solfataricus является эффективным катализатором производства (-) γ-лактама» . БМК Биотехнология . 14:40 . дои : 10.1186/1472-6750-14-40 . ПМК 4041915 . ПМИД 24884655 .