Mthanoloulous aahii
Mthanoloulous aahii | |
---|---|
![]() | |
Сканирующее изображение электронного микроскопа MHP. Mahii Slp | |
Научная классификация | |
Домен: | |
Королевство: | |
Филум: | |
Сорт: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | |
Разновидность: | М. Махии
|
Биномиальное название | |
Mthanoloulous aahii Paterek and Smith (1988)
|
Methananohabinalis Hina ( MHP будет как . [ 1 ] метилотрофический , [ 2 ] метаногенный [ 1 ] Cocci -форма [ 2 ] Археон рода метанохалофилс [ 2 ] Это можно найти в высокой солености кватической среды . [ 1 ] Говорят, что название метанохалофил получено из метана, означающего « метан » на латыни ; ореол, означающий « соль » на греческом ; и махии, означающий «мах» в латыни после Ра, который провел значительные исследования аэробных и метаногенных микробов . [ 2 ] Правильное слово в древнем греческом для «соли», однако, является Hals (ἅλς). [ 3 ] Конкретный тип деформации был обозначен SLP (= ATCC 35705) и в настоящее время является единственным идентифицированным штаммом этого вида. [ 2 ]
Филогения
[ редактировать ]В общей сложности четыре вида в роде Methanohalophilus , включая Methanohalophilus mahii , Methanohalophilus halophilus , Methanohalophilus portucalensis и Methanohalophilus euhalobius. [ 1 ] Ближайший родственник, метанохалофил, портокаленсис , имеет 99,8% сходство по последовательности по всему геному с метанохалофилом Mahii . [ 1 ] Другие виды метанохалофила имеют менее чем 94,7% сходство с метанохалофилом Mahii . [ 1 ] Все виды в роде представляют собой галофильные метаногены , которые способствуют морской экосистемы велосипеде минералов . [ 1 ]
Открытие
[ редактировать ]В 1988 году Роберт Патерк и Пол Смит искали метаногенные бактерии в Большом Соленое озеро в Юте , когда они впервые обнаружили археона метанохалофилуса махии в его аноксических отложениях . [ 2 ] Образцы отложений собирали и хранили в плексигласных трубках, а подкоры, взятые с помощью латунного пробка и переноса в пятьдесят миллилитр сывороточных бутылок. [ 4 ] Все образцы были обработаны в течение сорока восьми часов сбора. [ 4 ] Среды, используемые для выделения колоний Methanohalophilus mahii, были получены с использованием методики Hungate для правильной выделения анаэробных микробов. [ 4 ] Серийные разведения готовили в соотношении 1:10, [ 4 ] и агаровые рулоны инокулировали и инкубировали при 30 ° C в течение восьми недель. [ 4 ] Изолированные метаногенные колонии были выбраны путем выявления тех, у кого пена текстура, обозначающая газа , высвобождение [ 1 ] и неоднократно разбавляли и инокулировали на агаровых рулонных трубках, пока не останется только один тип морфологии колоний . [ 4 ] Эти колонии появились в виде до бледно -желтых колоний пенистыми с общей кремовых текстурами из -за выброса газа. [ 2 ]
Клеточная культура
[ редактировать ]Несколько анализов были проведены для определения характеристик клеток . [ 4 ] Methanohalophilus mahii классифицируется как умеренный галофил или организм, который может расти в среде высокой солености , поскольку он может расти от 0,5 до 3,5 . м [ 1 ] с оптимальной концентрацией роста при 2,0 М NaCl, [ 1 ] но с 1,2 М концентрацией NaCl, дающей самую высокую плотность культуры. [ 1 ] Он также может расти в различных уровнях рН в диапазоне от 6,5 до 8,2, [ 1 ] с оптимальным рН 7,5. [ 1 ] Methanohalophilus mahii - это мезофил , или организм, который процветает при умеренных температурах, и лучше всего вырастет при температуре 37 ° C. [ 2 ]
Клеточная структура
[ редактировать ]mahii клетки окрашивают грамма Methanohalophilus [ 1 ] и не мотильные, [ 2 ] нерегулярный кокси [ 2 ] Приблизительно от 0,8 до 1,8 микрометра в диаметре. [ 2 ] Кроме того, клетки флуореска под 420 нанометровым светом. [ 2 ] Мембранные фосфолипиды состоят из ядра β-гидроксирхеол, глюкозы гликолипидов и этаноламин , глицерина и мио-инозитола полярных головных групп. [ 1 ]
Метаболизм
[ редактировать ]Methanohalophilus mahii является обязательно анаэробным [ 1 ] метилотрофный [ 2 ] и метаногенный химитеротроф , способный уменьшить одноуглеродные соединения и многоуглеродные соединения, учитывая, что нет двухуглеродных двойных связей . [ 1 ] Следы Mg 2 + К. + , Ca 2+ и Fe 2+ Ионы необходимы для метаногенного роста. [ 1 ] Метанол может использоваться независимо в качестве источника углерода, а путь эмбден-майерхоф-паннаса ( EMP ) гликолитический может быть использован для катаболических процессов. [ 1 ] Возможные доноры электронов включают метанол , метиламины , диметиламины и триметиламины . [ 1 ] Methanohalophilus mahii способен использовать несколько метаболических путей для уменьшения или окисления метильных групп , создавая метановый или углекислый диоксид в процессе. [ 1 ] В восстановительном метилотрофном метиногенном пути метанохалофил Mahii может в конечном итоге уменьшить метильную группу до метана, который высвобождается. [ 1 ] В окислительном метилотрофическом пути метильная группа вместо этого окисляется до углекислого газа и высвобождается. [ 1 ] Этот процесс напрямую способствует минерализации углерода в морских экосистемах. [ 1 ]
Геном
[ редактировать ]Геном Methanohalophilus mahii был секвенирован посредством секвенирования дробовика 6,8 килобазы с использованием библиотеки ДНК Sanger . [ 1 ] Полный размер генома был определен как 2 012 424 пары оснований , с 2906 общим геном и 2 032 фактическими генами кодирования белка . [ 1 ] Последовательность , и были 42,6% имела содержание GC обнаружены сорок пять псевдогенов . [ 1 ]
Значение
[ редактировать ]Methanohalophilus mahii имеет уникальную супрессовую тРНК с модифицированным пирролизином , аминокислотой , которая чаще всего обнаруживается в прокариотах , которая может распознавать и связываться с янтарным стоп -кодоном (UAG), который также кодируется генами, используемыми для метилтрансферазы метилтрансферазы . [ 1 ] Этот вид также был первым членом, который полностью секвенировал свой в роде метинохалофилс [1] , который включает в себя мягко галофильные метилотрофные геном метаногены . [ 1 ] Известно, что эти археи в целом значительно способствуют процессу минерализации углерода в морских экосистемах. [ 1 ] В частности, используется окислительный метилотрофный путь, использующий метанохалофилус Mahii, позволяет видам окислить метатан до углекислого газа , который, в свою очередь, используется другими растениями и организмами . [ 1 ] Этот минеральный процесс езды на велосипеде обеспечивает больший рост и разнообразие в океане . [ 1 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k л м не а п Q. ведущий с Т в v В х и С аа Аб и объявление Но из Весна, с.; Scheuner, C.; Lapidus, A.; Лукас, с.; Рио, TGD; Tice, H.; Copeland, A.; Cheng, J.; Чен, Ф. (2010-12-23). «Последовательность генома Methanohalophilus mahii Slpt выявляет различия в энергетическом метаболизме среди членов метаносарцинацеи, обитающих в пресной и физиологической среде» . Археи . 2010 : 690737. DOI : 10.1155/2010/690737 . ISSN 1472-3646 . PMC 3017947 . PMID 21234345 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час я Дж k л м Патерк, младший; Смит, PH (1988-01-01). Ноябрь Международный 38 (1): 122–1 doi : 10.1099/ 00207713-38-1
- ^ Liddell, Hg & Scott, R. (1940). Грек-английский лексика пересмотрен и дополнен сэром Генри Стюартом Джонсом с помощью. Родерик Маккензи. Оксфорд: Clarendon Press.
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин Патерк, Дж. Роберт; Смит, Пол Х. (1985-10-01). «Выделение и характеристика галофильного метаногена из Великого Соленого озера» . Прикладная и экологическая микробиология . 50 (4): 877–881. doi : 10.1128/aem.50.4.877-881.1985 . ISSN 0099-2240 . PMC 291763 . PMID 16346919 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Dworkin, Martin и Stanley Falkow, Eds. Прокариоты: вып. 3: Архея. Springer, 2006.
- Весна, Стефан; Лапидус, Алла; Scheuner, Carmen; и др. (2010). «Последовательность генома Methanohalophilus mahii Slpt выявляет различия в энергетическом метаболизме среди членов метаносарцинацеи, обитающих в пресной и физиологической среде» . Археи . 2010 : 16. doi : 10.1155/2010/690737 . PMC 3017947 . PMID 21234345 .