Метанококк
Метанококк | |
---|---|
Научная классификация | |
Домен: | |
Королевство: | |
Тип: | |
Сорт: | |
Заказ: | |
Семья: | |
Род: | Метанококк Клюйвер и ван Ниль, 1936 год.
|
Типовой вид | |
Метанококк Ванниеллии Штадтман и Баркер, 1951 г.
| |
Разновидность | |
Methanococcus — род метаногенов коккообразных семейства Methanococcaceae . [ 1 ] Все они мезофилы , за исключением термофильного M. thermolithotropicus и гипертермофильного M. jannaschii . Последний был обнаружен у основания дымовой трубы «белого курильщика» на 21° с.ш. на Восточно-Тихоокеанском поднятии. [ 2 ] и это был первый архей геном , который был полностью секвенирован, что выявило множество новых и эукариотоподобных элементов. [ 3 ]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [ 4 ] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). [ 5 ]
на основе 16S рРНК ДП _06_2022 [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] | 53 маркерных белка на основе GTDB 08-RS214 [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ См . веб-страницу NCBI , посвященную метанококку . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.
- ^ У. Дж. Джонс; и др. (декабрь 1983 г.). « Methanococcus jannaschii sp. nov., чрезвычайно термофильный метаноген из подводных гидротермальных источников». Арх. Микробиол . 136 (4): 254–261. дои : 10.1007/BF00425213 . S2CID 33277659 .
- ^ Си Джей Балт; и др. (август 1996 г.). «Полная последовательность генома метаногенного архея Methanococcus jannaschii ». Наука . 273 (5278): 1058–1073. Бибкод : 1996Sci...273.1058B . дои : 10.1126/science.273.5278.1058 . ПМИД 8688087 . S2CID 41481616 .
- ^ Ж. П. Эзеби. «Метанококки» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). Архивировано из оригинала 27 января 2013 г. Проверено 17 ноября 2011 г.
- ^ Сэйерс; и др. «Метанококки» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 5 июня 2011 г.
- ^ «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "ar53_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Судебная комиссия Международного комитета по систематике прокариот (2005 г.). «Номенклатурными типами порядков Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomirobiales, Planctomycetales, Prochromales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales и Verrucomicrobiales являются роды Acholeplasma, Halanaerobium, Halobacterium, Methanobacterium, Methanococcus, Methanomirobium, Planctomyces, Prochromon, Sulfolobus, Thermococcus, Thermoproteus и Verrucomicrobium соответственно . Межд. Дж. Сист. Эвол. Микробиол . 55 (Часть 1): 517–518. дои : 10.1099/ijs.0.63548-0 . ПМИД 15653928 .
- Жантон С; Л'Харидон С; Прадел Н; Приер Д. (1999). «Быстрая идентификация гипертермофильных метанококков, выделенных из глубоководных гидротермальных источников» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 49 (2): 591–594. дои : 10.1099/00207713-49-2-591 . ПМИД 10319480 .
- Кесвани Дж; Орканд С; Премачандран У; Манделько Л; и др. (1996). «Филогения и таксономия мезофильных видов Methanococcus и сравнение рРНК, гибридизации ДНК и фенотипических методов» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 46 (3): 727–735. дои : 10.1099/00207713-46-3-727 . ПМИД 8782682 .
- Уэйн, LG (1986). «Действия Судебной комиссии Международного комитета по систематической бактериологии по запросам о заключениях, опубликованным в 1983 и 1984 годах» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 36 (2): 357–358. дои : 10.1099/00207713-36-2-357 .
- Судебная комиссия Международного комитета по систематике прокариот (1986 г.). «Перенос типового вида рода Methanococcus в род Methanosarcina как Methanosarcina mazei (Barker 1936) com. nov. et emend. Mah and Kuhn 1984 и сохранение рода Methanococcus (Утвержденные списки, 1980) исправить. Mah и Kuhn 1984 с Methanococcus vannielii (утверждено Листс, 1980) как типовой вид» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 36 : 491. дои : 10.1099/00207713-36-3-491 .
- Мах РА; Кун Д.А. (1984). «Перенос типового вида рода Methanococcus в род Methanosarcina с присвоением ему названия Methanosarcina mazei (Barker 1936) com. nov. et emend. и сохранение рода Methanococcus (Утвержденные списки, 1980 г.) с Methanococcus vannielii (Утвержденные списки, 1980 г.) как типовой вид. Запрос мнения» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 34 (2): 263–265. дои : 10.1099/00207713-34-2-263 .
- Балч МЫ; Фокс Дж.Э.; Магрум ЖЖ; Восес ЧР; и др. (1979). «Метаногены: переоценка уникальной биологической группы» . Микробиол. Преподобный . 43 (2): 260–296. дои : 10.1128/MMBR.43.2.260-296.1979 . ПМК 281474 . ПМИД 390357 .
- Аллен, Кайли; Вегенер, Гюнтер; Уайт, Роберт (8 августа 2014 г.). «Обнаружение множественных модифицированных коферментов F430 в метаногенах и анаэробных метанотрофных археях предполагает возможную новую роль F430 в природе» . Прикладная и экологическая микробиология . 80 (20): 6403–6412. Бибкод : 2014ApEnM..80.6403A . дои : 10.1128/АЕМ.02202-14 . ПМЦ 4178637 . ПМИД 25107965 .
- Клюйвер А.Дж.; ван Ниль CB (1936). «Перспективы естественной системы классификации бактерий». Централбл. Бактерол. Паразитенкд. Инфектинскр. Гиг., абт. II . 94 : 369–403.