Кари Стефанссон

Кари Стефанссон
Кари Стефанссон
Рожденный	6 апреля 1949 г. (75 лет) ; Рейкьявик , Исландия
Альма-матер	Университет Исландии
Известный	Популяционная генетика
Супруг	Валгердур Олафсдоттир ( м. 1970; умер 2021 )
Дети	4
Веб-сайт	www .декодировать .с

Кари Стефанссон ^{[ а ]} (родился 6 апреля 1949 г.) ^{[ 1 ]} — исландский невролог из Рейкьявика , основатель и генеральный директор биофармацевтической компании deCODE Genetics . В Исландии он первым применил популяционную генетику для понимания изменений в последовательности человеческого генома. Его работа была сосредоточена на том, как создается геномное разнообразие, и на открытии вариантов последовательностей, влияющих на восприимчивость к распространенным заболеваниям. Этот популяционный подход послужил моделью для национальных геномных проектов по всему миру и способствовал реализации нескольких аспектов точной медицины. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Биография

Кари Стефанссон родилась в 1949 году в Рейкьявике , Исландия . ^{[ 4 ]} Он был вторым младшим из пяти детей Сольвейг Халлдорсдоттир и Стефана Йонссона, радиоведущего, писателя и члена парламента от демократических социалистов. ^{[ 5 ]} Он получил среднее образование в колледже Рейкьявика и получил степень доктора медицины в 1976 году и степень доктора медицины. в 1986 году из Исландского университета . Он был женат на Валгердур Олафсдоттир с 1970 года до ее смерти 11 ноября 2021 года. ^{[ 6 ]} В июне 2012 года его дочь Сольвейг «Сола» Карадоттир вышла замуж за Дхани Харрисона , сына покойного Джорджа Харрисона и его жены Оливии Харрисон . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Стефанссон говорит, что он многим обязан своему брату, страдающему шизофренией. Первоначально он думал о том, чтобы стать писателем, и свидетельствует о том, что был ненасытным читателем. Его любимый автор — Исаак Башевис Зингер . ^{[ 9 ]}

Академическая карьера

После стажировки в Национальной больнице Исландии он отправился в Чикагский университет, чтобы работать под руководством Барри Арнасона (по совпадению канадца исландского происхождения ). Там он закончил ординатуру по неврологии и невропатологии и в 1983 году поступил на факультет. В 1993 году он был назначен профессором неврологии, невропатологии и нейробиологии Гарвардского университета и заведующим отделением невропатологии бостонской больницы Бет Исраэль . Находясь в Бостоне , он и его коллега Джеффри Галчер решили вернуться в Исландию, чтобы провести генетические исследования, чтобы определить риск рассеянного склероза . ^{[ 10 ]} Стефанссон оставил обе должности в 1997 году после основания deCODE и возвращения в Рейкьявик. ^{[ 11 ]} С 2010 года он занимает должность профессора медицины в Университете Исландии. ^{[ 12 ]} Он является сертифицированным неврологом и невропатологом в Исландии и США. ^{[ 13 ]}

От биологии к генетике

Академическая работа Стефанссона была сосредоточена на нейродегенеративных заболеваниях. ^{[ 14 ]} Подход белковой биологии к этому исследованию заключался в попытке картировать сложные процессы с использованием ограниченных образцов, в основном ткани мозга умерших пациентов. Несмотря на стабильные публикации, Стефанссон был разочарован темпами прогресса и часто не знал, участвуют ли белки, которые он характеризует, в возникновении заболеваний или являются продуктом патологического процесса. ^{[ 15 ]} Он и его коллеги поставили под сомнение даже общепринятое определение рассеянного склероза (РС) как аутоиммунного заболевания. ^{[ 16 ]}

Когда его перевели из Чикаго в Гарвард, Стефанссон начал думать, что геном может стать лучшей отправной точкой, чем биология. Гены кодируют белки, поэтому выявление генов и конкретных генетических вариаций, которые пациенты имеют чаще, чем здоровые люди, должно обеспечить точку опоры в патогенезе заболеваний. ^{[ 17 ]} При этом они могут указать на биологически значимые цели для новых лекарств и прогностической диагностики. ^{[ 18 ]}

Однако в середине 1990-х годов инструменты для чтения последовательности генома были примитивными. Данных было мало, и их генерирование было дорогостоящим, и основной целью проекта «Геном человека» на раннем этапе была разработка более совершенных методов. ^{[ 19 ]} Тем временем одним из решений было использование генетики – того, как геном смешивается и передается от одного поколения к другому – как средства получения большего количества информации из имеющихся данных. ^{[ 20 ]} Братья и сестры имеют общую половину своих геномов; но один восьмой двоюродный брат, один тридцать второй двоюродный брат и т. д. Таким образом, изучение пациентов, связанных расширенной генеалогией, должно позволить более эффективно находить наследственный компонент любого фенотипа или признака , даже с использованием маркеров низкого разрешения.

Вернуться в Исландию

Важный вопрос заключался в том, можно ли найти такие расширенные генеалогии и если да, то где. Многим ведущим генетикам не приходило в голову задаться этим вопросом относительно распространенных заболеваний. ^{[ 21 ]} Будучи исландцем, Стефанссон знал о страсти страны к генеалогии не понаслышке, он вырос и прошел обучение в национальной системе здравоохранения. В 1995 году он и его коллега и бывший аспирант Джеффри Галчер решили поехать в Исландию, чтобы изучать рассеянный склероз. Работая с врачами национальной системы здравоохранения, они выявили сотни пациентов и родственников, которые сдали им образцы крови, чтобы начать исследование. Как исландцы, они были родственниками почти по определению, и благодаря национальному занятию генеалогии эти отношения могли быть установлены.

Когда Стефанссон и Галчер вернулись в Бостон, их предложение о предоставлении гранта было отклонено Национальным институтом здравоохранения (NIH) , у которого было мало опыта финансирования работ с использованием пациентов, являющихся дальними родственниками. Но Стефанссон увидел в Исландии потенциал использования того же подхода для обнаружения генетического компонента практически любого распространенного заболевания. ^{[ 22 ]} Это выходило за рамки академической лаборатории, и он связался с фирмами венчурного капитала, чтобы выяснить, можно ли финансировать такое предприятие как частную компанию. Летом 1996 года он привлек 12 миллионов долларов от нескольких американских венчурных фондов на создание генетики deCODE. ^{[ 23 ]} Он и Галчер переехали в Исландию, чтобы начать свою деятельность, и в следующем году оставили свои должности в Гарварде. ^{[ 24 ]}

deCODE и популяционный подход

Стефанссон задумал deCODE как предприятие промышленного масштаба по генетике человека. В отличие от преобладающей академической модели, согласно которой ученые реализуют отдельные проекты в своих отдельных лабораториях, он предложил собирать и генерировать как можно больше генеалогических, медицинских и геномных данных от всего населения. Используя биоинформатику и статистику, deCODE мог бы затем объединить и проанализировать все эти данные для выявления корреляций между вариациями в последовательности и любым заболеванием или признаком практически без гипотез. ^{[ 25 ]} Бизнес-модель заключалась в том, чтобы финансировать эти усилия посредством партнерства с фармацевтическими компаниями, которые будут использовать открытия для разработки новых лекарств. ^{[ 26 ]}

Исландия располагала источниками данных, необходимыми для такого «демографического подхода»: высококачественная система здравоохранения с единым плательщиком; относительно однородная популяция, что облегчит поиск вариантов заболевания; ^{[ 27 ]} образованные граждане, готовые предоставить ДНК, а также медицинскую и медицинскую информацию для исследований; и, что самое уникальное, всеобъемлющие национальные генеалогии. ^{[ 28 ]} Мэри Клэр Кинг , которая использовала семейные родословные для идентификации BRCA1 при раке молочной железы, была среди ученых, осознавших потенциал этих записей. Как она рассказала журналу New Yorker, «возможность проследить генеалогию целой нации на протяжении тысячи лет… и получить образцы крови и тканей здоровых людей… могла бы стать одним из сокровищ современной медицины». " ^{[ 29 ]}

С самого начала стратегия Стефанссона вызывала споры. Сообщество геномистов было еще далеко от создания первой последовательности человеческого генома; он предлагал систему данных для анализа сотен тысяч геномов. Гены, связанные с более редкими синдромами, были идентифицированы в изолированных семьях на Сардинии, Ньюфаундленде, Финляндии и в других местах, а вариант BRCA2 был обнаружен в Исландии, но он хотел изучить наиболее распространенные проблемы общественного здравоохранения. ^{[ 30 ]} The Wall Street Journal назвала это предприятие «большой авантюрой», сославшись на то, что известные ученые «на сегодняшний день не имеют научных доказательств того, что исследователи могут расшифровать генетику сложного заболевания среди населения Исландии – или любой другой страны». ^{[ 31 ]} А deCODE была частной компанией, которая взяла за единицу исследования целую нацию, что повлекло за собой беспрецедентный уровень участия общественности.

Больше всего споров вызвало предложение Стефанссона в 1997 году создать базу данных копий медицинских записей национальной службы здравоохранения для корреляции с генеалогическими и геномными данными. ^{[ 32 ]} При поддержке подавляющего большинства общественности и членов парламента в 1998 году был принят Закон о базе данных сектора здравоохранения, разрешающий создание такой базы данных и ее лицензирование для коммерческого использования. Но против него яростно выступила группа местных ученых и врачей. а также многие международные специалисты по биоэтике. ^{[ 33 ]} Противники базы данных сектора здравоохранения Исландии (IHD) возражали против использования общедоступных данных частным предприятием и против предполагаемого согласия в качестве модели использования медицинских записей в исследованиях. Они утверждали, что проект поставит под угрозу конфиденциальность данных людей, задушит научную свободу, и в целом не одобряли новую модель биомедицинских инноваций, финансируемую венчурным капиталом, которую представляет собой deCODE. ^{[ 34 ]}

Стефанссон подвергся нападкам из-за ИБС и его более широкого подхода. ^{[ 35 ]} Он утверждал, что deCODE не вытесняет традиционные источники данных и исследователей, а создает новый масштаб ресурсов и возможностей, в том числе для служб здравоохранения; приносить пользу обществу путем репатриации и трудоустройства исландских ученых в передовых областях; и следование международным нормам согласия при установлении новых стандартов в крупномасштабных исследованиях под надзором со стороны государственных органов по биоэтике и защите данных и новых протоколов защиты данных и конфиденциальности. ^{[ 36 ]} Критики в то время остались неубежденными. Стэнфордский специалист по биоэтике Хэнк Грили просто пришел к выводу, что «исландская модель не является хорошим прецедентом для аналогичных исследований в других местах». ^{[ 37 ]}

Научный вклад

Целесообразность популяционной генетики и национальных геномных проектов

Одним из фундаментальных вкладов Стефанссона как архитектора, научного лидера и публичного лица deCODE была демонстрация того, что геномикой можно заниматься в национальном масштабе, и предоставление реального примера того, как это сделать. ^{[ 38 ]} К тому времени, когда проект «Геном человека» и Селера опубликовали черновой вариант последовательностей человеческого генома в 2001 году, его видение популяционной генетики уже сформировалось и привело к ранним открытиям вариаций последовательностей, связанных с болезнями, эволюцией человека и историей популяций. ^{[ 39 ]}^{[ 40 ]} В 2002 году deCODE использовала свои возможности в Исландии для публикации генетической карты генома, которая использовалась для завершения окончательной сборки эталонной последовательности генома человека. ^{[ 41 ]} К середине десятилетия даже бывшие критики признали, что то, что Стефанссон строил в Исландии посредством полного индивидуального участия и сбора данных, действительно было важным примером для перспективных проектов генома в Великобритании, США, Канаде, Швеции, Эстонии и других странах, а также для фонда. новых институтов, таких как Институт Броуда. ^{[ 42 ]}^{[ 43 ]}

Одним из столпов успеха стратегии Стефанссона стала его способность убедить десятки тысяч людей добровольно принять участие в исследованиях deCODE, а также объединить и проанализировать их данные с помощью генеалогий. В результате раннего партнерства с местным разработчиком программного обеспечения Фридриком Скуласоном была создана компьютеризированная национальная генеалогическая база данных, которая связала всех ныне живущих исландцев и включила большинство людей, когда-либо живших в Исландии за последние одиннадцать столетий. ^{[ 44 ]} В 2003 году одна из версий этой базы данных, названная Íslendingabók, стала бесплатно доступна в Интернете для всех, у кого есть исландский национальный идентификационный номер, и ею ежедневно пользуются тысячи граждан. ^{[ 45 ]} Версия, использованная в исследовании, заменяет имена зашифрованными личными идентификаторами, контролируемыми Исландской комиссией по защите данных. Это дает возможность создавать родословные, связывающие генетические и фенотипические данные любой группы людей в анонимной форме. Стефанссон и Галчер опубликовали структуру этой системы защиты данных для использования в других геномных проектах. ^{[ 46 ]}

Основным способом набора участников для исследования deCODE было сотрудничество с врачами всех служб здравоохранения, которые составляли списки пациентов с различными заболеваниями, которых затем приглашали принять участие. Участие предполагает не только письменное информированное согласие, но и заполнение анкет о состоянии здоровья; прохождение детального клинического обследования и измерений; и сдача крови для выделения ДНК; все это происходит в специальной клинике и требует от участников нескольких часов на выполнение. ^{[ 47 ]} IHD так и не был создан, его научное и деловое обоснование в значительной степени вытеснено желанием исландцев предоставлять свои данные один за другим. ^{[ 48 ]} К 2003 году, когда около 95% людей, принявших участие в исследовании, согласились это сделать, более 100 000 человек принимали участие в изучении одного или нескольких из трех дюжин заболеваний. ^{[ 49 ]} К 2007 году это число выросло до 130 000; ^{[ 50 ]} а к 2018 году — более 160 000. Это примерно 70% всех взрослых граждан, у 60 000 из которых полностью секвенированы геномы. ^{[ 51 ]}

На каждом последующем этапе технологии чтения генома – от микросателлитных маркеров до SNP и полногеномного секвенирования – это участие уникально для доли населения и постоянно составляет одну из крупнейших коллекций геномных данных в мире в абсолютном выражении. условия. ^{[ 52 ]} Используя генеалогии deCODE, можно импонировать данные о последовательностях всей популяции, получая единый зашифрованный, пригодный для анализа набор данных, содержащий более 300 000 полных геномов. ^{[ 53 ]}

Открытия и публикации

Под руководством своих коллег по deCODE постоянно создавать и повторно запрашивать эти наборы популяционных данных, Стефанссон вносит постоянный вклад в понимание того, как генерируются вариации в последовательности генома и их влияние на здоровье и болезни. Майлс Экстон, давний редактор журнала Nature Genetics , отметил на праздновании 20-летия deCODE, что это руководство поставило deCODE и Исландию «в авангарде революции, которая принесла большую часть того, что было обещано в картировании человеческого генома». ^{[ 54 ]}

Эти открытия, инструменты и наблюдения были представлены научному сообществу в сотнях научных публикаций. Стефанссон руководит и контролирует все исследования в deCODE и является старшим автором ее статей, а лидеры проектов и групп являются первыми авторами и соавторами, привлеченными из сотен местных и международных учреждений и организаций, с которыми deCODE сотрудничает. ^{[ 55 ]} Многие из них являются заслуживающим внимания вкладом в эту область, а Стефанссон и несколько его коллег по deCODE неизменно входят в число наиболее цитируемых ученых в области генетики и молекулярной биологии. ^{[ 56 ]}

Поколение человеческого разнообразия и механизмы эволюции

В более чем дюжине крупных статей, опубликованных за почти двадцать лет, Стефанссон и его коллеги использовали свой целостный взгляд на всю популяцию, чтобы построить новую картину генома человека как системы передачи информации. Они предоставили подробное представление о том, как геном использует рекомбинацию , de novo мутации и конверсию генов для продвижения и создания собственного разнообразия, но в определенных пределах.

В 2002 году deCODE опубликовала свою первую рекомбинационную карту генома человека. Он был построен с использованием 5000 микросателлитных маркеров и выявил 104 исправления к черновой сборке генома Проекта «Геном человека», что сразу же увеличило точность черновика с 93 до 99%. Но с точки зрения эволюционной биологии оно с новыми подробностями продемонстрировало неслучайное расположение рекомбинаций – перетасовку генома, которая идет на образование яйцеклеток и сперматозоидов – и то, что женщины рекомбинируют в 1,6 раза чаще, чем мужчины. ^{[ 57 ]}

Затем они показали, что пожилые женщины рекомбинируют больше, чем молодые; что более высокая рекомбинация коррелирует с более высокой рождаемостью; ^{[ 58 ]} и что большая инверсия 17-й хромосомы в настоящее время находится под положительным эволюционным отбором в европейских популяциях, причем носители имеют более высокие показатели рекомбинации и фертильности, чем неносители. ^{[ 59 ]} Вторая карта рекомбинации, опубликованная в 2010 году, использовала 300 000 SNP и выявила различные горячие точки рекомбинации между женщинами и мужчинами, а также новые генетические вариации, которые влияют на скорость рекомбинации и которые действуют по-разному в европейских и африканских популяциях. ^{[ 60 ]}

Эта карта также показала, что, хотя женщины ответственны за большую часть рекомбинаций, мужчины генерируют большую часть мутаций de novo . В широко обсуждаемой статье 2012 года они продемонстрировали, что количество таких мутаций — вариантов, которые появляются в геномах детей, но не наследуются ни от одного из родителей — увеличивается с возрастом отца и представляет собой основной источник редких заболеваний детского возраста. ^{[ 61 ]} Подробный анализ различных типов и распределения материнских и отцовских мутаций de novo был опубликован в 2017 году. ^{[ 62 ]} а последующая статья продемонстрировала, как мутации de novo у родителей могут передаваться дальше. ^{[ 63 ]}

Третий источник геномного разнообразия — генные конверсии — трудно обнаружить, кроме как путем изучения очень больших генеалогий. deCODE объединила геномные и генеалогические данные примерно 150 000 человек, чтобы продемонстрировать, что этот процесс, как и перекрестная рекомбинация, чаще встречается у женщин; зависит от возраста; и что конверсии мужских и женских генов имеют тенденцию быть взаимодополняющими по типу, так что они сдерживают друг друга. ^{[ 64 ]} В 2019 году deCODE использовал генеалогии, большое количество полногеномных последовательностей (WGS), которые он выполнил за предыдущие годы, и данные генотипирования большей части населения, чтобы опубликовать третью рекомбинационную карту генома. Это первая карта, созданная с использованием данных WGS, и, как и предыдущие карты, она открыта для мирового научного сообщества. ^{[ 65 ]}

Вклад в популяционную историю и генетическую антропологию включает новаторские работы по изучению скорости и механизмов мутаций в митохондриях и Y-хромосоме; ^{[ 66 ]} сравнение древней и современной ДНК; ^{[ 67 ]} характеристика соответствующих норвежских и кельтских корней митохондрий и Y-хромосом в исландском населении; ^{[ 68 ]} наблюдения за феноменом генетического дрейфа, когда изолированная популяция с течением времени расходится с исходными популяциями; ^{[ 69 ]} связь между родством и плодовитостью; ^{[ 70 ]} влияние структуры популяции на варианты, связанные с заболеванием, и наоборот, ^{[ 71 ]} и общепопуляционный каталог людей с нокаутом, людей, у которых отсутствуют определенные гены. ^{[ 72 ]}

В 2018 году deCODE использовала свои возможности для реконструкции генома Ханса Джонатана , одного из первых исландцев африканского происхождения. Он иммигрировал в Исландию в 1802 году, и его геном был реконструирован из фрагментов геномов 180 из почти 800 его ныне живущих потомков, прослеживаемых через Ислендингабока . ^{[ 73 ]}

Генетика распространенных заболеваний и признаков

Стефанссон, вероятно, наиболее известен благодаря вкладу, который он и его коллеги из deCODE внесли в открытие генетических вариаций, связанных с риском заболеваний и рядом других черт. Популяционный подход — масштаб и широта ресурсов, а также сосредоточение внимания на перекрестном анализе разрозненных наборов данных — стал ключом к этой продуктивности. Это позволяет использовать как широкие, так и строгие определения фенотипов, быстро проверять идеи, а ученым deCODE следить за тем, куда ведут данные, а не за своими собственными гипотезами. ^{[ 74 ]} Это привело к ряду открытий, которые связывают болезни и иногда используют генетику даже для необычного переопределения фенотипов, и Стефанссон потратил много времени на объяснение этих открытий и их полезности для научных и непрофессиональных средств массовой информации. Обычно открытия, сделанные в Исландии, публикуются одновременно с их проверкой на других популяциях. И наоборот, deCODE часто использовала свои ресурсы для проверки открытий, сделанных в других местах. Среди наиболее примечательных из этих открытий по заболеваниям и признакам:

болезнь Альцгеймера

вариант гена APP В 2012 году был обнаружен , который защищает носителей от болезни Альцгеймера (БА) и пожилых людей от снижения когнитивных функций. Его широко цитировали и использовали для разработки ингибиторов BACE1 в качестве потенциальных методов лечения. ^{[ 75 ]} Стефанссон и команда deCODE также обнаружили варианты генов TREM2 и ABCA7 , которые повышают риск развития болезни Альцгеймера. ^{[ 76 ]}

Шизофрения, другие психические расстройства, когнитивные функции

Стефанссон и его команда использовали обширные наборы данных компании и связи между заболеваниями и чертами характера, чтобы обнаружить новые варианты риска психических заболеваний, а также улучшить понимание нарушений, которые определяют эти состояния и природу самого познания. Исследования начала 2000-х годов выявили участие гена нейрегулина 1 в развитии шизофрении, что привело к масштабным исследованиям этого нового пути. ^{[ 77 ]} В течение следующих пятнадцати лет они использовали стандартный GWAS и снижали плодовитость в качестве промежуточного фенотипа, чтобы сосредоточиться на SNP и вариациях числа копий (CNV), связанных с риском шизофрении и других расстройств; ^{[ 78 ]} они продемонстрировали, что генетические факторы риска шизофрении и аутизма вызывают когнитивные нарушения даже у контрольной группы; ^{[ 79 ]} они связали шизофрению и биполярное расстройство как с творческими способностями, так и с риском зависимости; ^{[ 80 ]} они определили генетические варианты, связанные с уровнем образования и когнитивными способностями в детстве; ^{[ 81 ]} и продемонстрировали, что эти варианты в настоящее время находятся под негативным эволюционным отбором. ^{[ 82 ]} Рассматривая распространенные психические расстройства, а также когнитивные процессы и особенности среди населения, эта работа способствовала нынешнему пониманию этих состояний не как отдельных фенотипов, а как связанных с нарушением фундаментальных когнитивных функций.

Рак

Стефанссон и его коллеги сделали множество новаторских открытий вариантов генома, обуславливающих риск развития многих распространенных видов рака. Они сыграли роль в формировании ныне общепринятой новой парадигмы понимания рака: его следует определять, по крайней мере, в такой же степени в молекулярных терминах, как и в том, где он возникает в организме. Компания deCODE опубликовала целостные доказательства этого на основе семейной совокупности всех видов рака, диагностированных у жителей Исландии старше пятидесяти лет, а также других совокупных исследований. ^{[ 83 ]} С помощью базовой генетики они продемонстрировали, что, хотя некоторые виды рака локализуются в семьях, другие группируются неспецифическим образом, что указывает на общие молекулярные причины. Они обнаружили, что локус хромосомы 8q24 содержит варианты риска для многих типов рака. ^{[ 84 ]} и варианты генов TERT, TP53 и LG24 как факторы риска развития множественных видов рака. ^{[ 85 ]}

deCODE обнаружил ряд вариантов последовательностей, связанных с риском рака простаты (а также защитный вариант), ^{[ 86 ]} рак молочной железы, ^{[ 87 ]} меланома и базальноклеточный рак, ^{[ 88 ]} рак щитовидной железы, ^{[ 89 ]} рак мочевого пузыря, ^{[ 90 ]} рак яичников, ^{[ 91 ]} рак почки, ^{[ 92 ]} рак желудка, ^{[ 93 ]} рак яичек, ^{[ 94 ]} рак легких, ^{[ 95 ]} и клональный гемопоэз. ^{[ 96 ]} Три исследования, продолжавшиеся почти десять лет, продемонстрировали силу наборов данных о населении Исландии, показав, что как распространенные, так и редкие варианты, связанные с усилением никотиновой зависимости и количеством выкуриваемых сигарет в день, также являются фактором риска рака легких и заболеваний периферических артерий; то есть генетическая предрасположенность к курению была в то же время фактором риска заболеваний, связанных с курением. ^{[ 97 ]}

Сердечно-сосудистые заболевания

Стефанссон и его группа исследователей сердечно-сосудистых заболеваний работали с коллегами по всему миру, чтобы обнаружить распространенные и редкие варианты, связанные с риском фибрилляции предсердий. ^{[ 98 ]} ишемическая болезнь сердца (ИБС), ^{[ 99 ]} гладить, ^{[ 100 ]} заболевания периферических артерий, ^{[ 101 ]} синдром слабости синусового узла, ^{[ 102 ]} аортальная и внутричерепная аневризма. ^{[ 103 ]} Среди их примечательных недавних открытий — редкий вариант гена ASGR1 , который обеспечивает существенную защиту от ишемической болезни сердца, основной причины смерти в развитом мире. ^{[ 104 ]} Это открытие используется при открытии и разработке лекарств в Amgen . ^{[ 105 ]} Другое очень крупное исследование, в котором анализировались клинические данные и данные полногеномных последовательностей примерно 300 000 человек, выявило более дюжины относительно редких вариантов, соответствующих повышенному уровню холестерина. Однако генетическая связь с риском ИБС позволила по-новому взглянуть на то, как холестерин связан с болезнями сердца. Они сообщили, что измерение холестерина не-ЛПВП лучше отражает риск, чем измерение холестерина ЛПНП, что является стандартной практикой в настоящее время. ^{[ 106 ]}

Диабет и другие особенности и состояния

deCODE обнаружила связь между диабетом 2 типа (СД2) и вариантами гена TCF7L2. ^{[ 107 ]} наиболее важный общеизвестный генетический фактор риска, а также варианты CDKAL1 и других генов, связанных с реакцией на инсулин, а также повышающими и понижающими риск СД2. ^{[ 108 ]} Команда deCODE внесла вклад в понимание генетических вариаций, влияющих на ряд других заболеваний и признаков, включая глаукому; ^{[ 109 ]} менархе; ^{[ 110 ]} эссенциальный тремор; ^{[ 111 ]} предрасположенность к туберкулезу; ^{[ 112 ]} высота; ^{[ 113 ]} экспрессия генов; ^{[ 114 ]} пигментация волос, глаз и кожи; ^{[ 115 ]} стеноз аортального клапана; ^{[ 116 ]} риносинусит; ^{[ 117 ]} и десятки других.

В 2014 году Стефанссон встретил Дэвида Альтшулера, тогдашнего заместителя директора Института Броуда, который остановился в deCODE на обратном пути из Финляндии и Швеции. Альтшулер руководил исследованием СД2 и обнаружил редкий вариант, который, по-видимому, защищал от развития заболевания даже тех, у кого были общие факторы риска в образе жизни. Стефанссон искал связь в данных deCODE, которая подтвердила, что у исландцев не было точного варианта, обнаруженного командой Альтшулера, но был другой вариант в том же гене, который явно защищал от СД2. ^{[ 118 ]} Затем команда deCODE добавила свой вариант к статье, опубликованной в журнале Nature Genetics. ^{[ 119 ]}

Государственно-частное сотрудничество и развитие точной медицины

Хотя deCODE является первым и наиболее комплексным национальным проектом по геному в мире, он никогда не финансировался государством. Это всегда был бизнес, который опирался на добровольное участие граждан и врачей национальной системы здравоохранения в качестве партнеров в научных открытиях. Эти отношения между гражданами и частным предпринимательством, которые Стефанссону казались логичными, другим противоречили и не нравились некоторым, становятся все более распространенными. ^{[ 120 ]} Одним из факторов, лежащих в основе ее успеха и движущей силы участия в Исландии, является, очевидно, национальная гордость, превращающая небольшой размер страны и историческую изоляцию в уникальное преимущество в важной области. Другая причина заключается в том, что открытия применяются при попытках создать и продать реальные продукты для улучшения медицины и здоровья. В интервью 2017 года бывший президент Исландии Вигдис Финнбогадоттир выразил общую точку зрения: «Если исландцы могут внести свой вклад в здоровье мира, я более чем горжусь. Я благодарен». ^{[ 121 ]}

Персональная геномика и диагностика риска заболеваний

Стефанссон работал над тем, чтобы превратить открытия своей компании в полезные с медицинской точки зрения и коммерчески успешные продукты. Некоторые из них были весьма инновационными и проложили путь новым отраслям и рынкам. Спустя годы после того, как Ислендингабок разместил генеалогии исландцев в Интернете, Генографический проект и такие компании, как MyHeritage , FamilyTreeDNA и Ancestry, запустили веб-сайты, чтобы люди повсюду могли попытаться использовать генетику для построения своих генеалогий. ^{[ 122 ]} В ноябре 2007 года компания deCODE запустила deCODEme, первый персональный сервис геномики, за которым на следующий день последовал Google поддерживаемый 23andMe . ^{[ 123 ]} deCODEme включила в себя полигенные оценки риска, основанные главным образом на своих открытиях для оценки индивидуальной предрасположенности к десяткам распространенных заболеваний. Этот подход использовали 23andMe и другие. Опубликованные маркеры риска deCODE обеспечили наиболее тщательно проверенную основу для всех подобных услуг. ^{[ 124 ]}

Стефанссон также курировал вывод deCODE на рынок клинических тестов полигенного риска диабета 2 типа, сердечного приступа, рака простаты, фибрилляции предсердий и инсульта. ^{[ 125 ]} Маркетинг этих продуктов и deCODEme прекратился из-за финансовых проблем компании в 2011 году, но недавние громкие исследования, проведенные в Массачусетской больнице общего профиля, возродили интерес к тестированию полигенного риска с медицинской точки зрения. В этих тестах используется больше маркеров и новые алгоритмы, основанные на вариантах риска и подходе, впервые примененном в Исландии для тех же самых заболеваний. ^{[ 126 ]}

Открытие лекарств

Однако главной целью Стефанссона всегда было использование генома для разработки более эффективных лекарств. За годы до того, как термин «прецизионная медицина» стал общепринятым, он хотел заложить ее основу: находить и проверять цели лекарств, коренящиеся в путях развития заболеваний, а не полагаться на метод проб и ошибок в медицинской химии. ^{[ 127 ]} и иметь возможность тестировать и назначать лекарства пациентам, которые, скорее всего, будут хорошо реагировать. ^{[ 128 ]} Это решает давние проблемы производительности при разработке лекарств, и Стефанссон финансировал компанию в основном за счет партнерства с фармацевтическими компаниями. Сделка с компанией Roche по открытию генов и мишеней стоимостью 200 миллионов долларов, заключенная в 1998 году, стала ранним признаком интереса отрасли к геномике для создания более эффективных лекарств. ^{[ 129 ]} Другие партнерские отношения были сформированы с Merck, Pfizer, Astra Zeneca и другими. В середине 2000-х годов компания запустила в клинические разработки несколько собственных препаратов, но не имела финансовых ресурсов для продолжения их разработки после своей неплатежеспособности и реструктуризации в 2009 году. ^{[ 130 ]}

Безусловно, самым продолжительным, глубоким и продуктивным партнерством было сотрудничество с Amgen. В 2012 году Amgen купила deCODE за 415 миллионов долларов. С тех пор она действует как полностью принадлежащая ей, но вполне независимая дочерняя компания, применяя свои возможности в рамках разработки лекарств Amgen, сохраняя при этом местный контроль над своими данными и научными исследованиями. ^{[ 131 ]} При полной поддержке Amgen компания продолжает публиковать как коммерчески значимые открытия в области генов и лекарств, так и информацию о человеческом разнообразии и эволюции, предоставляя яркий пример того, как коммерческие цели, фундаментальная наука и публичное распространение результатов могут быть взаимовыгодными. ^{[ 132 ]}

Интеграция с Amgen совпала с началом крупномасштабного полногеномного секвенирования в deCODE и вменением этих данных по всему набору данных компании в Исландии. Благодаря этим данным Стефанссон и его коллеги из Amgen полагали, что геномика может изменить разработку лекарств так, как это было невозможно, используя только данные SNP-чипа и GWAS. ^{[ 133 ]} Важно отметить, что они смогли идентифицировать редкие, высокоэффективные мутации, влияющие на общие фенотипы — короче говоря, на самые крайние версии распространенных заболеваний — создавая мишени для лекарств с потенциально более подтвержденным и более управляемым терапевтическим потенциалом. Этому «редкому для общего» подходу сейчас следуют многие фармацевтические компании. ^{[ 134 ]} Идентификация ASGR1 была примером этого и была использована при открытии новых лекарств для борьбы с холестерином. ^{[ 135 ]}

В более широком смысле, давний главный научный сотрудник Amgen Шон Харпер заявил в 2018 году, что «с приобретением deCODE мы получили промышленные возможности для популяционной генетики», которая может обеспечить генетическую проверку человека для любой цели или соединения. Компания deCODE провела оценку всего клинического портфолио Amgen в течение месяца после приобретения, предоставив информацию, которая помогла избежать клинических неудач, а также расставить приоритеты и провести исследования. Харпер утверждает, что эта модель «разработки лекарств в первую очередь» позволила компании решить собственную версию хронической проблемы производительности в отрасли. По его оценкам, «просто имея сильную генетическую поддержку половины вашего проекта, вы можете повысить норму прибыли от инвестиций в НИОКР примерно на 50%». ^{[ 136 ]}

Общественное здравоохранение: скрининг BRCA2

В 2018 году компания deCODE запустила веб-сайт , который позволяет исландцам запрашивать анализ данных о их последовательностях, чтобы определить, несут ли они SNP в гене BRCA2 , связанный со значительно повышенным риском рака молочной железы и простаты у исландцев. ^{[ 137 ]} Это был первый случай, когда deCODE, которая в первую очередь является исследовательской организацией, вернула участникам информацию из своих исследовательских данных. Стефанссон в течение многих лет пытался убедить Министерство здравоохранения Исландии в том, что это серьезная проблема общественного здравоохранения, которую данные deCODE могут решить практически бесплатно, и это было лишь одним из наиболее ярких примеров возможных применений точной медицины в здравоохранении. в Исландии. ^{[ 138 ]}

Не получив ответа от системы здравоохранения, Стефанссон пошел дальше и передал этот вопрос в руки граждан. По состоянию на конец 2018 года около 40 000 человек, более десяти процентов населения, использовали этот сайт, чтобы узнать свой статус BRCA2. Сотни людей смогли узнать, что они являются носителями, и Национальная больница создала свои консультационные и другие услуги, чтобы помочь людям решить, как они хотят использовать эту информацию для защиты своего здоровья. ^{[ 139 ]} Учитывая уровень заболеваемости и смертности от рака молочной железы и простаты, связанного с BRCA2, доступность этой информации должна позволить предотвратить и раннее выявление сотен видов рака и спасти десятки жизней. ^{[ 140 ]}

Подход к населению Исландии как глобальная модель

Представляя Стефанссона на лекции, посвященной премии Уильяма Аллана , на ежегодной конференции Американского общества генетики человека 2017 года , Марк Дейли , в то время содиректор Института Броуда , сказал:

«Невозможно упустить из виду широко распространенную парадигму, включающую биобанки, набранные при полном участии населения, исторические данные медицинских регистров, инвестиции в крупномасштабный сбор генетических данных и статистическую методологию, а также совместные последующие действия, пересекающие академические и отраслевые границы. Часто упускают из виду то, что что Кари и его коллеги из deCODE предоставили шаблон для этого механизма открытий. Более того, легко забыть, что, когда Кари основал deCODE Genetics 21 год назад, эти концепции считались весьма радикальными и вряд ли имели успех. находился в прямом и переносном смысле на своем маленьком острове. Как выразился Питер Доннелли , «количество стран, инвестирующих сейчас миллионы в аналогичные ресурсы, является поразительным свидетельством проницательности его видения». ^{[ 141 ]}

Вслед за успехом Исландии в число стран, которые сейчас реализуют или планируют национальные геномные проекты различного масштаба, охвата и обоснования, входят Великобритания (через Британский биобанк, а также Genomics England и Шотландское геномное партнерство отдельно); США ( Все мы, а также Программа «Миллион ветеранов»). ^{[ 142 ]}), Австралия, ^{[ 143 ]} Канада, ^{[ 144 ]} Дубай, ^{[ 145 ]} Эстония , Финляндия, ^{[ 146 ]} Франция, ^{[ 147 ]} Гонконг, ^{[ 148 ]} Япония, ^{[ 149 ]} Нидерланды, ^{[ 150 ]} Катар, ^{[ 151 ]} Саудовская Аравия, ^{[ 152 ]} Сингапур, ^{[ 153 ]} Южная Корея, ^{[ 154 ]} Швеция, ^{[ 155 ]} и Турция. ^{[ 156 ]} Проекты, финансируемые в значительной степени или частично фармацевтическими компаниями для информирования об обнаружении целевых лекарств, включают FinnGen (частично возглавляемый Марком Дейли), Regeneron/Geisinger, ^{[ 157 ]} и геномная медицина Ирландии. ^{[ 158 ]}

В апреле 2019 года Стефанссон был назначен первым президентом Северного общества генетики человека и точной медицины, созданного для создания общескандинавской структуры для исследований в области генетики человека и применения геномики в здравоохранении во всем регионе с целью создания и интеграции геномные и медицинские данные из Исландии, Норвегии, Швеции, Дании, Финляндии и Эстонии.

Награды и почести

Стефанссон получил высокие награды в области биомедицинских исследований и генетики, в том числе Премию Андерса Яреса за медицинские исследования , Премию Уильяма Аллана , ^{[ 159 ]} и медаль Ганса Кребса . ^{[ 160 ]}

Его работа была признана пациентскими и исследовательскими организациями, такими как Американское общество борьбы с болезнью Альцгеймера, а также крупными международными изданиями и организациями, включая Time, ^{[ 161 ]} Newsweek, ^{[ 162 ]} Форбс, ^{[ 163 ]} БизнесНеделя ^{[ 164 ]} и Всемирный экономический форум. ^{[ 165 ]}

Он также получил высшую награду Исландии — Орден Сокола . ^{[ 166 ]}

В 2019 году он был избран иностранным членом Национальной академии наук США и получил Международную премию KFJ от Rigshospitalet , одного из старейших и престижнейших медицинских учреждений Дании. ^{[ 167 ]}^{[ 168 ]}

Примечания

^ Это исландское имя . Фамилия является отчеством , а не фамилией ; в Исландии его называют Кари , но на международном уровне его могут называть Стефанссоном .

Ссылки

^ Гуннлаугур Харальдссон, изд. (2000). Læknar á Íslandia [ Краткие биографии исландских врачей ]. Фольклор. п. 963.
^ Маркс, Вивьен (27 августа 2015 г.). «ДНК нации» . Природа . 524 (7566): 503–505. Бибкод : 2015Natur.524..503M . дои : 10.1038/524503а . ISSN 0028-0836 . ПМИД 26310768 .
^ Ан, Джун Ён (16 октября 2017 г.). «Национальные проекты генома человека: обновленная информация и повестка дня» . Эпидемиология и здоровье . 39 : e2017045. дои : 10.4178/epih.e2017045 . ISSN 2092-7193 . ПМК 5675980 . ПМИД 29056031 .
^ «Биографии делегатов С.Ю.» . Имперский колледж Лондона. Архивировано из оригинала 21 октября 2004 года.
↑ Уведомление о некрологе Стефана Йонссона, Morgunblaðið , 18 сентября 1990 г., доступно по адресу http://timarit.is/view_page_init.jsp?pageId=1729310.
^ «Смерть: Валгердур Олафсдоттир» . Morgunblaðið (на исландском языке). 12 ноября 2021 г. Проверено 12 ноября 2021 г.
^ «Сольвейг Карадоттир разводится с Дхани Харрисон» . ДВ (на исландском языке). 22 ноября 2016 года . Проверено 7 мая 2019 г.
^ «Самое примечательное в моей дочери Сольвейге то, что она жена сына Джорджа Харрисона» . nutimmin.is 23 августа 2015 г. Архивировано из оригинала 23 сентября 2019 г. . Проверено 7 мая 2019 г.
^ «Что, если бы вы знали, когда умрете?» Гаарец
^ Профиль руководителя из BusinessWeek журнала [1] ^{[ мертвая ссылка ]}
^ «Страница управления сайтом компании» . 6 февраля 2013 года . Проверено 2 мая 2019 г.
^ «Страница сотрудников Исландского университета» . Проверено 2 мая 2019 г.
^ «Биография спикера собрания генома человека 2019» . Архивировано из оригинала 2 мая 2019 года . Проверено 2 мая 2019 г.
^ Его особое внимание уделялось дегенерации миелина при рассеянном склерозе. Подборку его публикаций этого периода можно найти в Google Scholar .
↑ Адам Пиоре, «Принесите нам свои гены: поиски ученого-викинга, чтобы победить болезнь», Наутилус , 2 июля 2015 г.
^ Гулчер, Дж. Р., Вартанян, Т. и Стефанссон К., «Является ли рассеянный склероз аутоиммунным заболеванием?» Клиническая неврология 2(3-4):246-52 (1994)
^ Современные взгляды на этот потенциал: М. С. Гайер и Ф. С. Коллинз, «Проект генома человека и будущее медицины», Американский журнал болезней детей , 147 (11): 1145-52 (ноябрь 1993 г.)
^ Авторитетный взгляд середины 1990-х годов на перспективность генетики в диагностике, Мин Дж. Хури и Дайан К. Вагенер, «Эпидемиологическая оценка использования генетики для улучшения прогностической ценности факторов риска заболеваний», Американский журнал генетики человека , 56: 835-844, 5 января 1995 г.
^ Ф.С. Коллинз и др., «Новые цели американского проекта генома человека: 1998–2003 гг.», Science , Vol. 282, стр. 682-689, 23 октября 1998 г.
^ Влиятельное раннее (и в то время все еще в основном теоретическое) обсуждение различных возможных подходов к распространенным, а не редким заболеваниям - это ES Lander и NJ Schork, «Генетическое рассечение сложных признаков», Science , Vol. 265, выпуск 5181, стр. 2037–2048, 30 сентября 1994 г.
^ Это было неочевидно. Даже выдающиеся эксперты, предсказавшие будущую мощь популяционной генетики и исследований ассоциаций, похоже, не учли, что анализ сцепления можно распространить на распространенные заболевания и помочь в исследованиях ассоциаций посредством генеалогии всего населения. Нил Риш и Кэтлин Мерикангас , «Будущее генетических исследований сложных заболеваний человека», Science , Vol. 273, № 5281, стр. 1516–1517, 13 сентября 1996 г.; Аравинда Чакраварти, «Популяционная генетика: поиск смысла вне последовательности», Nature Genetics 21, страницы 56–60, 1 января 1999 г.
↑ Николас Уэйд, «УЧЕНЫЙ В РАБОТЕ / Кари Стефанссон; Охота за генами болезней в генеалогиях Исландии», New York Times , 18 июня 2002 г.
^ от Alta Venture Partners , Polaris Venture Partners , ARCH Venture Partners , Atlas Venture и других. Полный список первых инвесторов можно найти в исландской деловой газете Frjals Verslun от 1 марта 1998 г., стр. 37
↑ Объявление о начале операций deCODE на первой странице Morgunblaðið , 31 мая 1996 г.
^ Раннее описание модели и процесса открытия Стефанссона и Галчера, когда они еще планировали создать ИБС, в «Популяционной геномике: закладывая основу для моделирования и нацеливания генетических заболеваний», Клиническая химия и лабораторная медицина (требуется подписка) 36 ( 8):523-7, 1 августа 1998 г.
↑ Хорошее раннее описание видения Стефанссона и бизнес-модели Стивена Д. Мура: «Биотехнологическая фирма превращает Исландию в гигантскую генетическую лабораторию», Wall Street Journal (требуется подписка) , 3 июля 1997 г.
^ Гулчер, Дж., Хельгасон А., Стефанссон, К., «Генетическая однородность исландцев», Nature Genetics (требуется подписка) , том 26, стр. 395, декабрь 2000 г. Одним из примеров относительной генетической однородности, но глобальной полезности изучения исландской популяции является рак молочной железы. Во всем мире существует множество вариантов гена BRCA2, которые, как известно, значительно повышают риск рака молочной железы, но в Исландии, по сути, существует один вариант, связанный с заболеванием, который был опубликован накануне запуска deCODE в Исландии: Steinnun Thorlacius et al. ., «Одна мутация BRCA2 в семьях мужчин и женщин с раком молочной железы из Исландии с различными фенотипами рака», Nature Genetics (требуется подписка) , том 13, страницы 117–119, 1 мая 1996 г. У deCODE теперь есть веб-сайт, который позволяет исландцам узнать, являются ли они носителями мутации.
↑ Ресурсы и их полезность для открытия генов кратко изложены в первом пресс-релизе deCODE: «Исландская компания по геномике определяет местоположение гена, вызывающего эссенциальный тремор», 25 августа 1997 г., на веб-сайте компании.
↑ Цитируется по Майклу Спектру, «Расшифровка Исландии», The New Yorker (требуется подписка) , 18 января 1999 г.
^ См., например, Франческо Кука и др., «Распределение гаплотипов DR4 на Сардинии предполагает первичную связь диабета I типа с локусами DRB1 и DQB1», Human Immunology , Volume 43, Issue 4, стр. 301-308, август 1995 г., ; Э.М. Петти и др. , «Картирование гена наследственного гиперпаратиреоза и пролактиномы (MEN1Burin) на хромосоме 11q: доказательства эффекта основателя у пациентов из Ньюфаундленда», American Journal of Human Genetics , 54(6): 1060–1066, июнь 1994 г.; Мелани М Махтани и др. , «Картирование гена диабета 2 типа, связанного с дефектом секреции инсулина, с помощью сканирования генома в финских семьях», Nature Genetics (требуется подписка) , том 14, стр. 90–94, 1 сентября 1996 г.; Стейннун Торлациус и др. , «Одиночная мутация BRCA2», op. цит.
^ Стивен Д. Мур, «Биотехнологическая фирма превращает Исландию», op. цит.
^ Гулчер и Стефанссон, «Популяционная геномика: закладываем основу», op. цит.
^ Стефанссон и Гулчер цитируют опросы, показывающие общественную поддержку ИБС на уровне 75%, в «Исландской саге о централизованной базе данных здравоохранения и демократическом принятии решений», Nature Biotechnology (требуется подписка) (требуется подписка), том 17, стр. 620, июль. 1999. Исландские противники ИБС создали организацию под названием «Манвернд», чтобы бороться с ней и поощрять людей осуществлять свое право на отказ. Число отказов является одним из конкретных показателей противостояния этой идее, а также, наоборот, показателем того, сколько людей либо поддержали эту идею, либо не придерживались твердого мнения. Согласно архивному снимку веб-сайта Манвернда за сентябрь 2003 года , за пять лет после принятия закона, разрешающего ИГД, от участия отказались чуть более 20 000 человек, или 7% от населения 2003 года, составившего 288 000 человек.
^ Книги и основные исследовательские статьи специалистов по биоэтике на эти темы включают: Майк Фортун, Многообещающая геномика: Исландия и генетика декодирования в мире спекуляций (Беркли: University of California Press, 2008); Дэвид Виникофф, «Геном и нация: база данных сектора здравоохранения Исландии и ее наследие», Innovations: Technology Governance Globalization 1(2):80-105, февраль 2006 г.; Генри Т. Грили , «План Исландии по исследованиям в области геномики: факты и последствия» », Jurimetrics (требуется подписка) 40, № 2, стр. 153–91, зима 2000 г.; и Джон Мерц, «Iceland, Inc?: Об этике коммерческой популяционной геномики», Social Science & Medicine 58(6):1201-9, апрель 2004 г. Помимо Mannvernd's, еще один веб-сайт в Беркли, Калифорния, был посвящен антропологическим последствия deCODE и генетических исследований в Исландии: http://www.lib.berkeley.edu/iceland/
^ Стефанссон и Гулчер подсчитали, что к 1999 году было опубликовано более 700 статей и интервью. За это и за их мнение о преимуществах того, что делала deCODE: «Исландская сага о централизованной базе данных здравоохранения», op. цит. Частичное представление о количестве, характере и источниках статей можно увидеть в архивном просмотре веб-сайта Mannvernd за май 1999 года , исландской организации, созданной для борьбы с ИБС, а также в очень подробной библиографии, заархивированной 7 мая 2019 года в Wayback. Машина создана доктором Скули Сигурдссоном, ведущим сотрудником Mannvernd.
^ Дж. Гулчер, К. Кристьянссон, Х. Гудбьяртссон, К. Стефанссон, «Защита конфиденциальности с помощью стороннего шифрования в генетических исследованиях в Исландии», Европейский журнал генетики человека (требуется подписка) , том 8, стр. 739–742, 3 октября 2000 г.
^ Генри Т. Грили, «План Исландии по исследованиям в области геномики», op. цит.
^ Как популяционная стратегия Стефанссона изменила мышление в этой области и открытие генов к середине 2000-х годов в Ли Сильвере , «Возрождение биологии: прорыв в генетической науке», Newsweek , 9 октября 2007 г.
^ Черновой вариант проекта «Геном человека» был опубликован в журнале Nature ; журнале Черновик Селеры в Science , оба от 15 февраля 2001 г.
^ Список ключевых публикаций deCODE, практически во всех из которых Стефанссон является старшим автором, указан по годам на веб-сайте компании по адресу https://www.decode.com/publications/.
^ Дж. Л. Вебер, «Карта Исландии» и А. Конг и др. , «Карта рекомбинации человеческого генома с высоким разрешением», Nature Genetics (требуется подписка) , том 31, стр. 225–226 и 241–247 соответственно, 10 июня 2002 г. О том, как карта улучшила точность эталонной последовательности, см. Николас Уэйд: «Учёные говорят, что последовательность генома человека содержит ошибки», New York Times , 11 июня 2002 г.
^ В 1999 году исландский антрополог Гисли Палссон уже отметил успех модели deCODE: Гисли Палссон и Пол Рабинов, «Исландия: случай национального геномного проекта», Anthropology Today Vol. 15, № 5, стр. 14-18, 5 октября 1999 г. В отчете организации по надзору за генетической этикой GeneWatch за 2009 г. , ярого противника ИБС и использования данных медицинских записей в исследованиях без явного согласия, deCODE отмечается как главный источник вдохновения. для Биобанка Великобритании. В 2000 году специалист по биоэтике Джордж Аннас уже отметил эмуляцию подхода deCODE, New England Journal of Medicine (требуется подписка) , 342:1830-1833, 15 июня 2000 г.; Дэвид Виникофф, «Геном и нация», op. цит. О первых успехах deCODE и их значении в качестве примера для других проектов биобанков и в этой области в целом см. также Николас Уэйд, «Ученый за работой/Кари Стефанссон: Охота за генами болезней в генеалогиях Исландии», New York Times , 18 июня 2002 г.
^ Джоселин Кайзер, «Бум демографических баз данных от Исландии до США», Science (требуется подписка), Vol. 298, выпуск 5596, стр. 1158–1161, 8 ноября 2002 г. Ни у кого больше не было сопоставимых генеалогий, но Эрик Ландер был вдохновлен масштабом и подходом, основанным на данных в Исландии, и основал Институт Броуда с идеей использования быстро развивающихся технологий. для генерации большего количества данных – чипов SNP и последующего секвенирования – для обеспечения открытий. Ли Сильвер, «Возрождение биологии: прорыв в генетической науке», Newsweek , 9 октября 2007 г.
^ Эта база данных в подавляющем большинстве полна, начиная с исландской переписи 1703 года , первой в мире полной национальной переписи населения и теперь являющейся частью зарегистрированного всемирного наследия ЮНЕСКО , и восходит к временам до прибытия первых жителей в 9 веке.
↑ Номера использования указаны на вики-странице Íslendingabok . Более подробное обсуждение давнего наблюдателя, антрополога Гисли Палссона, в книге «Сеть родственников: онлайн-генеалогическая машина» в книге Сандры К. Бэмфорд, под ред., « Родство и за его пределами: пересмотренная генеалогическая модель» (Нью-Йорк: Berghahn Books, 2009), стр. 84–110.
^ Подробная информация о том, как работает система защиты конфиденциальности в Gulcher et al. , «Защита конфиденциальности с помощью стороннего шифрования», указ. цит.
^ Хорошее предварительное описание того, как людей просят принять участие и как их данные используются в исследованиях, находится на стр. 7-9 годового отчета deCODE за 2002 год, поданного в SEC.
↑ К 2004 году правительство и deCODE фактически прекратили все работы над ИБС и двинулись дальше. На странице 10 годового отчета deCODE за 2003 год, поданного в SEC , компания описала взаимное отсутствие активности: «По состоянию на март 2004 года санкционированная правительством проверка протоколов шифрования и защиты данных IHD, которая началась в апреле 2000 года, не имела результатов. Когда и если эта проверка и выдача соответствующего сертификата безопасности будут завершены, мы оценим, стоит ли и когда вообще продолжать разработку IHD. Учитывая наши текущие бизнес-планы и приоритеты, мы не ожидаем, что IHD станет существенным аспектом нашего бизнеса в ближайшем будущем».
^ Хелен Пирсон, «Профиль: Кари Стефанссон», Nature Medicine , том 9, страница 1099, 1 сентября 2003 г.; уровень участия в годовом отчете deCODE за 2002 год, поданном в SEC, стр. 8.
↑ Джеймс Батчер, «Кари Стефанссон, генерал генетики», The Lancet , 27 января 2007 г.
↑ Анна Азволинская, «Мастер-декодер: профиль Кари Стефанссона», The Scientist , 1 марта.
^ В 2018 году самые передовые национальные усилия по изучению генома все еще стремились создать и собрать 100 000 полных последовательностей генома в одном месте. См. Алекс Филлипидис, «10 стран в клубе 100 тысяч геномов», Clinical Omics , 30 августа 2018 г.
^ Новаторская ранняя методология поэтапного определения и вменения содержится в книге A Kong et al. , «Обнаружение совместного использования по происхождению, фазировка на большие расстояния и вменение гаплотипов», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, страницы 1068–1075, 17 августа 2008 г. Первое опубликованное вменение последовательности датируется 2015 годом: DF Gudbjartsson et al. , «Крупномасштабное полногеномное секвенирование исландского населения», опубликованное в рамках специального выпуска «Геномы исландцев», Nature Genetics (требуется подписка) , 47, стр. 435–444, 25 мая 2015 г.
↑ Экстон также отметил, что, несмотря на сотни публикаций ученых deCODE в других местах, 111 статей, или пять процентов статей, опубликованных во время его работы в журнале за предыдущие двенадцать лет, были опубликованы из deCODE. Комментарии Экстона взяты из его выступлений на конференции, посвященной 20-летию deCODE, состоявшейся в Рейкьявике 30 сентября 2016 года. Видео доступно на веб-сайте компании по адресу https://www.decode.com/20-years/ .
^ Список всех основных публикаций deCODE с 1997 года находится на веб-сайте компании https://www.decode.com/publications/ .
^ Недавние списки наиболее цитируемых ученых на https://hcr.clarivate.com/resources/archived-lists/. Архивировано 20 апреля 2019 г. в Wayback Machine.
^ Конг и др. , «Карта рекомбинации человеческого генома с высоким разрешением», Nature Genetics (требуется подписка) , том 31, стр. 241–247, 10 июня 2002 г.
^ Конг и др. , «Скорость воспроизводства и репродуктивный успех», Nature Genetics (требуется подписка) , том 36, стр. 1203–1206, 3 октября 2004 г.
^ H Стефанссон и др. , «Обычная инверсия при отборе у европейцев», Nature Genetics (требуется подписка) , том 37, страницы 129–137, 16 января 2005 г.
^ Конг и др. , «Различия в скорости мелкомасштабной рекомбинации между полами, популяциями и отдельными людьми», Nature (требуется подписка) , том 467, стр. 1099–1103, 28 октября 2010 г.
^ Конг и др. , «Скорость мутаций de novo и важность возраста отца для риска заболевания», Nature , том 488, стр. 471–475, 23 августа 2012 г.
^ Х. Йонссон и др. , «Родительское влияние на мутации de novo зародышевой линии человека в 1548 трио из Исландии», Nature (требуется подписка) , том 549, стр. 519–522, 28 сентября 2017 г.
^ А. Йонссон и др. , «Множественная передача мутаций de novo в семьях», Nature Genetics (требуется подписка) , том 50, стр. 1674-1680, 5 ноября 2018 г.
^ Б.В. Халлдорссон и др. , «Скорость мейотической конверсии генов зависит от пола и возраста», Nature Genetics (требуется подписка) , том 48, стр. 1377–1384, 19 сентября 2016 г.
^ Б.В. Халлдорссон и др. , «Характеристика мутагенных эффектов рекомбинации с помощью генетической карты на уровне последовательности», Science , Vol. 363, Выпуск 6425, eaau1043, 25 января 2019 г.
^ Хельгасон и др. , «Частота точечных мутаций Y-хромосомы у людей», Nature Genetics , (требуется подписка) , том 47, стр. 453–457, 25 марта 2015 г.
^ Хельгасон и др. , «Последовательности первых поселенцев показывают быструю эволюцию пула исландской мтДНК», PLoS Genetics , 16 января 2009 г.
^ Хельгасон и др. , «Оценка скандинавского и гэльского происхождения мужчин-поселенцев Исландии», Американский журнал генетики человека , 67 (3): 697–717, 7 августа 2000 г.; и Хелгасон и др. , «МтДНК и происхождение исландцев: расшифровка сигналов недавней истории населения», Американский журнал генетики человека , 66 (3): 999-1016, 23 февраля 2000 г.
^ SS Ebenesersdottir et al ., «Древние геномы из Исландии раскрывают формирование человеческой популяции», Science (требуется подписка) , Vol. 360, выпуск 6392, стр. 1028-1032, 1 июня 2018 г.
^ Хельгасон и др. , «Связь между родством и плодовитостью человеческих пар», Science (требуется подписка) , Vol. 319, выпуск 5864, стр. 813–816, 8 февраля 2008 г.
^ А. Хельгасон и др., «Исландский пример влияния структуры популяции на исследования ассоциаций», Nature Genetics (требуется подписка) , том 37, страницы 90–95, 19 декабря 2004 г.
^ П. Сулем и др., «Идентификация большого набора редких полных нокаутов человека», Nature Genetics (требуется подписка) , том 47, страницы 448–452, 25 марта 2015 г.
^ Джагадисан и др. , «Реконструкция африканского гаплоидного генома XVIII века», Nature Genetics (требуется подписка) , том 50, стр. 199–205, 15 января 2018 г. Ханс Джонатан является героем книги исландского антрополога Гисли Палссон « Человек, который украл самого себя». (Чикаго: University of Chicago Press, 2016) и Стефанссон обратились к реконструкции Ганса Геном Джонатана в New York Times , The Atlantic , Newsweek , Der Spiegel и других изданиях.
^ Стефанссон представил раннее объяснение «широкого, но строгого» подхода к определению фенотипов, основанного на сборе данных, на конференции Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) в Барселоне в 2000 году; это также обсуждается во многих публикациях. См., например, S. Gretarsdottir et al. , «Локализация гена предрасположенности к распространенным формам инсульта по 5q12», Американский журнал генетики человека , том 70, выпуск 3, стр. 593-603, март 2002 г.
^ Т. Йонссон и др. , «Мутация в APP защищает от болезни Альцгеймера и возрастного снижения когнитивных функций», Nature , 488, стр. 96–99, 11 июня 2012 г.; Майкл Спектер, «Хорошие новости о болезни Альцгеймера», The New Yorker , 11 июля 2012 г.; Юэн Каллауэй, «Мутация гена защищает от болезни Альцгеймера», Nature , 11 июля 2012 г.
^ Т. Йонссон и др. , «Вариант TREM2, связанный с риском болезни Альцгеймера», New England Journal of Medicine , 368(2):107-16, 10 января 2013 г.; С. Стейнберг и др. , «Варианты потери функции в ABCA7 повышают риск болезни Альцгеймера», Nature Genetics , 47(5):445-7, 25 марта 2015 г.
^ H Стефанссон и др. , «Нейрегулин 1 и предрасположенность к шизофрении», Американский журнал генетики человека , том 71, выпуск 4, стр. 877-892, октябрь 2002 г. Как и многие ранние открытия, основанные на сцеплении, эта связь сама по себе не оказалась плодотворной, но более поздняя работа оказалась существенной. было сделано на пути. См., например, А. Буонанно, «Сигнальный путь нейрегулина и шизофрения: от генов к синапсам и нервным цепям», Brain Research Bulletin , Volume 83, Issues 3–4, стр. 122–131, 30 сентября 2010 г.
^ H Стефанссон и др. , «Крупные рецидивирующие микроделеции, связанные с шизофренией», Nature (требуется подписка) , том 455, стр. 232-6, 11 сентября 2008 г.; Х. Стефанссон и др. , Nature (требуется подписка) , «Распространенные варианты, повышающие риск шизофрении», Nature, том 460, стр. 744-7, 6 августа 2009 г.; Ниам Маллинз и др. , «Репродуктивная пригодность и генетический риск психических расстройств среди населения в целом», Nature Communications , том 8, номер статьи 15833, 13 июня 2017 г.
^ H Стефанссон и др. , «CNV, повышающие риск развития аутизма или шизофрении, влияют на когнитивные способности контрольной группы», Nature , том 505, стр. 361-6, 18 декабря 2013 г.
^ RA Power et al. , «Полигенные оценки риска шизофрении и биполярного расстройства предсказывают творческие способности», Nature Neuroscience (требуется подписка) , том 18, стр. 953–955, 8 июня 2015 г.; Г. В. Регинссон и др., «Полигенные оценки риска шизофрении и биполярного расстройства, связанные с зависимостью», «Биология зависимости » , том 23, выпуск 1, стр. 485-492, 25 февраля 2017 г.
^ Б. Гуннарссон и др. , «Вариант последовательности, связанный с уровнем образования, также влияет на познавательные способности детей», Nature Scientific Reports , том 6, номер статьи 36189.
^ А. Конг и др., «Отбор против вариантов генома, связанных с уровнем образования», Труды Национальной академии наук , 114 (5) E727-E732, 17 января 2017 г.
^ LT Амундадоттир и др. , «Рак как сложный фенотип: закономерности распространения рака внутри и за пределами нуклеарной семьи», PLoS Medicine , 1(3):e65, 28 декабря 2004 г.; Т. Гудмундссон и др. «Популяционный семейный агрегационный анализ указывает на генетический вклад в большинстве почечно-клеточных карцином», International Journal of Cancer , 100(4):476-9, 13 июня 2002 г.; С. Йонссон и др. , «Семейный риск рака легких у населения Исландии», Журнал Американской медицинской ассоциации (JAMA) , 292(24):2977-83, 22 декабря 2004 г.
^ Дж. Гудмундссон и др. , «Полногеномное исследование ассоциации идентифицирует второй вариант предрасположенности к раку простаты в 8q24», Nature Genetics (требуется подписка) , том 39, стр. 631–637, 1 апреля 2007 г.; Л.А. Кимени и др. , «Вариант последовательности 8q24 обуславливает предрасположенность к раку мочевого пузыря», Nature Genetics , 40(11):1307-12, 14 сентября 2008 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Исследование, основанное на полногеномном секвенировании, выявило редкий вариант 8q24, связанный с раком простаты», Nature Genetics (требуется подписка) , том 44, страницы 1326–1329, 28 октября 2012 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Распространенный вариант 8q24.21 связан с почечно-клеточным раком», Nature Communications , Том 4, Номер статьи: 2776, 13 ноября 2013 г.
^ Т. Рафнар и др. , «Варианты последовательности локуса TERT-CLPTM1L ассоциированы со многими типами рака», Nature Genetics , (требуется подписка) , 41(2):221-7, 18 января 2009 г.; С.Н. Стейси и др. , «Зародышевый вариант сигнала полиаденилирования TP53 придает предрасположенность к раку», Nature Genetics , 43(11):1098-103, 25 сентября 2011 г.; У Стиркарсдоттир и др. , «Нонсенс-мутация в гене LGR4 связана с несколькими заболеваниями и другими признаками человека», Nature (требуется подписка) , том 497, стр. 517–520, 5 мая 2013 г.
^ LT Амундадоттир и др. , «Общий вариант, связанный с раком простаты в популяциях Европы и Африки», Nature Genetics (требуется подписка) , 38(6):652-8, 27 мая 2006 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Общие варианты последовательностей 2p15 и Xp11.22 придают предрасположенность к раку простаты», Nature Genetics (требуется подписка) , 40(3):281-3, 10 февраля 2008 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Полногеномные исследования ассоциации и репликации идентифицируют четыре варианта, связанных с предрасположенностью к раку простаты», Nature Genetics , 41 (10): 1122-6, 20 сентября 2009 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Исследование, основанное на полногеномном секвенировании, выявило редкий вариант 8q24, связанный с раком простаты», Nature Genetics (требуется подписка) , том 44, страницы 1326–1329, 28 октября 2012 г.; С.Н. Стейси и др. , «Вставка ретротранспозона SVA-E в ген CASP8 связана с защитой от рака простаты», Human Molecular Genetics , 25(5):1008-18, 1 марта 2016 г.; Дж. Гудмундссон и др. «Общегеномные ассоциации доброкачественной гиперплазии предстательной железы обнаруживают генетическую корреляцию с уровнем ПСА в сыворотке крови», Nature Communications , Том 9, Артикульный номер: 4568, 8 ноября 2018 г.
^ С. Н. Стейси и др. , «Вариант Cys557Ser BARD1 и риск рака молочной железы в Исландии», PLoS Medicine , 20 июня 2006 г.; С.Н. Стейси и др. , «Общие варианты хромосом 2q35 и 16q12 обуславливают предрасположенность к раку молочной железы, положительному по рецептору эстрогена», Nature Genetics (требуется подписка) , том 39, стр. 865–869, 27 мая 2007 г.; С.Н. Стейси и др. , «Распространенные варианты хромосомы 5p12 обусловливают предрасположенность к раку молочной железы, положительному по рецептору эстрогена», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, стр. 703–706, 27 апреля 2008 г.
^ DF Gudbjartsson et al. , «Варианты пигментации ASIP и TYR связаны с меланомой кожи и базальноклеточной карциномой», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, стр. 886–891, 18 мая 2008 г.; С.Н. Стейси и др. «Общие варианты 1p36 и 1q42 связаны с базальноклеточной карциномой кожи, но не с меланомой или признаками пигментации», Nature Genetics , Volume 40, стр. 1313–1318, 12 октября 2008 г.; С.Н. Стейси и др. , «Новые распространенные варианты, влияющие на предрасположенность к базальноклеточной карциноме», Nature Genetics , том 41, стр. 909–914, 5 июля 2009 г.; С.Н. Стейси и др. , «Варианты зародышевой последовательности в TGM3 и RGS22 повышают риск базальноклеточной карциномы», Human Molecular Genetics , Volume 23, Issue 11, стр. 3045–3053, 1 июня 2014 г.; С.Н. Стейси и др. , «Новые локусы восприимчивости к базальноклеточной карциноме», Nature Communications, том 6, номер статьи 6825, 9 апреля 2015 г.
^ Дж. Гудмундссон и др. , «Распространенные варианты 9q22.33 и 14q13.3 предрасполагают к раку щитовидной железы в европейском населении», Nature Genetics (требуется подписка) , том 41, стр. 460–464, 6 февраля 2009 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Обнаружение распространенных вариантов, связанных с низким уровнем ТТГ и риском рака щитовидной железы», Nature Genetics (требуется подписка) , том 44, стр. 319–322, 22 января 2012 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Полногеномное исследование ассоциации выявило пять новых локусов риска рака щитовидной железы», Nature Communications , том 8, номер статьи 14517, 14 февраля 2017 г.
^ Л. Кимни и др. , «Вариант последовательности 8q24 обуславливает предрасположенность к раку мочевого пузыря», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, стр. 1307–1312, 14 сентября 2008 г.; Л. Кимени и др. , «Вариант последовательности 4p16.3 придает предрасположенность к раку мочевого пузыря», Nature Genetics (требуется подписка) , том 42, стр. 415–419, 28 марта 2010 г.; Т. Рафнар и др. , «Европейское общегеномное исследование ассоциации идентифицирует SLC14A1 как новый ген предрасположенности к раку мочевого пузыря», Human Molecular Genetics , Volume 20, Issue 21, стр. 4268–428, 11 ноября 2011 г.; Т. Рафнар и др. , «Полногеномное исследование ассоциации выявило варианты 20p12.2, которые связаны с раком мочевого пузыря», Молекулярная генетика человека , том 23, выпуск 20, страницы 5545–5557, 15 октября 2014 г.
^ Т. Рафнар и др. , «Мутации в BRIP1 повышают риск рака яичников», Nature Genetics (требуется подписка) , том 43, стр. 1104–1107, 2 октября 2011 г.
^ Т. Гудбьартссон и др. , «Популяционный семейный агрегационный анализ указывает на генетический вклад в большинстве почечно-клеточных карцином», International Journal of Cancer , 13 июня 2002 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Распространенный вариант 8q24.21 связан с почечно-клеточным раком», Nature Communications , том 4, номер статьи: 2776, 13 ноября 2013 г.
^ H Helgason et al. , «Варианты потери функции в АТМ повышают риск рака желудка», Nature Genetics (требуется подписка) , том 47, страницы 906–910, 22 июня 2015 г.
^ JT Bergthorsson et al. , «Полногеномное исследование аллельного дисбаланса в опухолях зародышевых клеток яичек человека с использованием микросателлитных маркеров», Cancer Genetics and Cytogenetics , Volume 164, Issue 1, pp 1-91, 1 января 2006 г.
^ С. Йонссон и др. , «Семейный риск рака легких у населения Исландии», Журнал Американской медицинской ассоциации (JAMA) , том 292 (24), стр. 2977-2983, 22 декабря 2004 г.; Т.Э. Торгейрссон и др. , «Вариант, связанный с никотиновой зависимостью, раком легких и заболеванием периферических артерий», Nature , том 452, стр. 638–642, 3 апреля 2008 г.
^ Ф. Зинк и др., «Клональный гемопоэз с мутациями-кандидатами в драйверы и без них часто встречается у пожилых людей», Blood , Volume 130, стр. 742-752, февраль 2002 г.
^ TE Thorgeirsson et al ., «Вариант, связанный с никотиновой зависимостью, раком легких и заболеванием периферических артерий», Nature (требуется подписка) , том 452, стр. 638–6423, 3 апреля 2008 г.; Т.Э. Торгейрссон и др. , «Варианты последовательностей CHRNB3–CHRNA6 и CYP2A6 влияют на поведение при курении», Nature Genetics (требуется подписка) , том 42, стр. 448–453, 25 апреля 2010 г.; Т.Э. Торгейрссон и др. , «Редкая миссенс-мутация в CHRNA4 связана с курением и его последствиями», Molecular Psychiatry , том 21, стр. 594–600, 8 марта 2016 г. Меган Брукс, «Гены влияют на курение, риск рака легких», Reuters , 26 апреля 2010 год
^ DF Gudbjartsson et al. , «Варианты, вызывающие риск фибрилляции предсердий на хромосоме 4q25», Nature (требуется подписка) , том 448, стр. 353–357, 19 июля 2007 г.; Д.Ф. Гудбьартссон и др. , «Делегация сдвига рамки считывания в гене саркомера MYL4 вызывает раннюю семейную фибрилляцию предсердий», European Heart Journal , том 38, выпуск 1, страницы 27–34, 1 января 2017 г.; РБ Торольфсдоттир и др. , «Миссенс-вариант PLEC увеличивает риск фибрилляции предсердий», Журнал Американского колледжа кардиологов , том 70, выпуск 17, стр. 2157-2168, 24 октября 2017 г.; РБ Торольфсдоттир и др. , «Варианты кодирования в RPL3L и MYZAP повышают риск фибрилляции предсердий», Communication Biology , Том 1, статья № 68, 12 июня 2018 г.
^ См. примечания 101 и 102 ниже и: A Helgadottir et al. , «Редкие мутации SCARB1 связаны с холестерином липопротеинов высокой плотности, но не с ишемической болезнью сердца», European Heart Journal , том 39, выпуск 23, стр. 2172–2178, 14 июня 2018 г.; E. Bjornsson et al., «Редкая донорская мутация сплайсинга в гене гаптоглобина связана с уровнем липидов в крови и ишемической болезнью сердца», Human Molecular Genetics , Volume 26, Issue 12, стр. 2364–2376, 15 июня 2017 г.; С. Гретарсдоттир и др., «Вариант области сплайсинга в LDLR снижает уровень холестерина в липопротеинах невысокой плотности и защищает от ишемической болезни сердца», PLoS Genetics , 1 сентября 2015 г.; Э Бьернссон и др. , «Общие варианты последовательности, связанные с ишемической болезнью сердца, коррелируют со степенью коронарного атеросклероза», «Артериосклероз, тромбоз и сосудистая биология» , том 35, стр. 1526–1531, 1 июня 2015 г.; А. Хелгадоттир и др., «Распространенный вариант хромосомы 9p21, влияющий на риск инфаркта миокарда», Science (требуется подписка) , Том. 316, выпуск 5830, стр. 1491–1493, 8 июня 2007 г.; Хельгадоттир и др. , «Ген, кодирующий белок, активирующий 5-липоксигеназу, повышает риск инфаркта миокарда и инсульта», Nature Genetics , том 36, стр. 233–239, 8 февраля 2004 г.
^ DF Gudbjartsson et al. , «Вариант последовательности ZFHX3 на 16q22 ассоциируется с фибрилляцией предсердий и ишемическим инсультом», Nature Genetics (требуется подписка) , том 41, стр. 876–878, 13 июля 2009 г.; С. Гретарсдоттир и др. , «Ген, кодирующий фосфодиэстеразу 4D, повышает риск ишемического инсульта», Nature Genetics (требуется подписка) , том 35, стр. 131–138, 21 сентября 2003 г.; С. Гретарсдоттир и др. , «Локализация гена предрасположенности к распространенным формам инсульта на 5q12», Американский журнал генетики человека , том 70, выпуск 3, стр. 593-603, март 2002 г.
^ TE Thorgeirsson et al., «Вариант, связанный с никотиновой зависимостью, раком легких и заболеванием периферических артерий», op. цит. ; G Гудмундссон и др. , «Локализация гена окклюзионного заболевания периферических артерий на хромосоме 1p31», Американский журнал генетики человека , том 70, выпуск 3, стр. 586-592, март 2002 г.
^ Х. Холм и др. , «Редкий вариант MYH6 связан с высоким риском синдрома слабости синусового узла», Nature Genetics (требуется подписка) , том 43, стр. 316–320, 6 марта 2011 г.
^ Хельгадоттир и др. , «Один и тот же вариант последовательности 9p21 связан с инфарктом миокарда, аневризмой брюшной аорты и внутричерепной аневризмой», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, стр. 217–224, 6 января 2008 г.; С. Гретарсдоттир и др. , «Полногеномное исследование ассоциации идентифицирует вариант последовательности в гене DAB2IP, обусловливающий предрасположенность к аневризме брюшной аорты», Nature Genetics (требуется подписка) , том 42, стр. 692–697, 11 июля 2010 г.
^ П Ниой и др. , «Вариант ASGR1, связанный со снижением риска развития ишемической болезни сердца», Медицинский журнал Новой Англии , том 374, стр. 2131-2141, 2 июня 2016 г.
^ Это открытие привлекло значительное внимание науки и средств массовой информации. См., например, Мэтта Херпера, «Исследователи Amgen обнаружили ген, который снижает риск сердечного приступа», Forbes , 18 мая 2016 г.; Антонио Регаладо, «Amgen обнаружила ген против сердечного приступа», MIT Technology Review , 18 мая 2016 г.; Юэн Каллауэй, «Защитный ген дает надежду на создание следующего блокбастера для сердца», Nature , 19 мая 2016 г.
^ Хельгадоттир и др. , «Варианты с сильным влиянием на липиды крови и роль холестерина и триглицеридов при ишемической болезни сердца», Nature Genetics (требуется подписка) , том 48, страницы 634–639, 2 мая 2016 г.
^ SFA Grant et al ., «Вариант гена транскрипционного фактора 7, подобного 2 (TCF7L2), повышает риск развития диабета 2 типа», Nature Genetics (требуется подписка) , том 38, стр. 320–323, 15 января 2006 г.; А. Хелгасон и др., «Уточнение влияния вариантов гена TCF7L2 на диабет 2 типа и адаптивную эволюцию», Nature Genetics (требуется подписка) , том 39, стр. 218–225, 7 января 2007 г.
^ V Steinthorsdottir et al. , «Вариант CDKAL1 влияет на реакцию инсулина и риск развития диабета 2 типа», Nature Genetics (требуется подписка) , том 39, стр. 770–775, 26 апреля 2007 г.; V Steinthorsdottir et al. , «Идентификация низкочастотных и редких вариантов последовательностей, связанных с повышенным или пониженным риском развития диабета 2 типа», Nature Genetics (требуется подписка) , том 46, стр. 294–298, 26 января 2014 г.; EV Ivarsdottir et al., «Влияние вариантов последовательностей на дисперсию уровней глюкозы предсказывает риск диабета 2 типа и учитывает наследственность», Nature Genetics (требуется подписка) , том 49, стр. 1398–1402, 7 августа 2017 г.; Дж. Гудмундссон и др., «Два варианта хромосомы 17 повышают риск рака простаты, а вариант TCF2 защищает от диабета 2 типа», op. цит.
^ Г. Торлейфссон и др. , «Распространенные варианты рядом с CAV1 и CAV2 связаны с первичной открытоугольной глаукомой», Nature Genetics (требуется подписка) , том 42, стр. 906–909, 12 сентября 2010 г.; Дж. Торлейфссон и др. , «Общие варианты последовательностей гена LOXL1, обуславливающие предрасположенность к эксфолиативной глаукоме», Science (требуется подписка) , том 317, выпуск 5843, стр. 1397-1400, 7 сентября 2007 г.
^ П. Сулем и др., «Полногеномное исследование ассоциации определяет варианты последовательности 6q21, связанные с возрастом менархе», Nature Genetics (требуется подписка) , том 41, стр. 734–738, 17 мая 2009 г.
^ Х. Стефанссон и др., «Вариант последовательности гена LINGO1 увеличивает риск эссенциального тремора», Nature Genetics (требуется подписка) , том 41, стр. 277–279, 1 февраля 2009 г.
^ G Sveinbjornsson et al., «Варианты последовательности HLA класса II влияют на риск туберкулеза в популяциях европейского происхождения», Nature Genetics (требуется подписка) , том 48, стр. 318–322, 1 февраля 2016 г.
^ DF Gudbjartsson et al. , «Многие варианты последовательностей, влияющие на разнообразие роста взрослого человека», Nature Genetics , том 40, стр. 609–615, 6 апреля 2008 г.; С. Бенонисдоттир и др. , «Эпигенетические и генетические компоненты регуляции роста», Nature Communications , том 7, номер статьи 13490, 16 ноября 2016 г.
^ В. Эмильссон и др. , «Генетика экспрессии генов и ее влияние на заболевания», Nature (требуется подписка) , том 452, стр. 423–428, 27 марта 2008 г.
^ П. Сулем и др., «Два недавно выявленных генетических детерминанта пигментации у европейцев», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, стр. 835–837, 18 мая 2008 г.; П. Сулем и др., «Генетические детерминанты пигментации волос, глаз и кожи у европейцев», Nature Genetics (требуется подписка) , том 39, стр. 1443–1452, 12 октября 2007 г.
^ Хельгадоттир и др. , «Полногеномный анализ выявил новые локусы, связанные со стенозом аортального клапана», Nature Communications , том 9, номер статьи 987, 7 марта 2018 г.
^ Р.П. Кристьянссон и др. , «Вариант с потерей функции ALOX15 защищает от полипов носа и хронического риносинусита», Nature Genetics (требуется подписка) , том 51, стр. 267–276, 14 января 2019 г.
↑ История, рассказанная Джиной Колата: «Редкая мутация убивает ген, ответственный за диабет», New York Times , 2 марта 2014 г.
^ Дж. Фланник и др. , «Мутации потери функции в SLC30A8 защищают от диабета 2 типа», Nature Genetics (требуется подписка) , том 46, стр. 357–363, 2 марта 2014 г.
↑ В 2006 году один житель Рейкьявика и участник исследования deCODE сказал, что около 90% людей считают, что участие в исследованиях, финансируемых фармацевтическими компаниями, имеет смысл, тогда как около 10% были против этого, что примерно отражает уровень участия опрошенных. Майкл Д. Лемомик, «Исландский эксперимент: как крошечное островное государство захватило лидерство в геномной революции», Time , 12 февраля 2006 г. Те, кто не согласен, продолжают высказываться, даже несмотря на то, что эмуляция модели deCODE распространяется: см., например, Эмму Джейн. Кирби, «ДНК Исландии: самые ценные гены в мире?», BBC News , 19 июня 2014 г.
↑ Широта воздействия модели и цитата Финнбогадоттира в Кэтрин Оффорд, «Изучение исландской модели генетических исследований», The Scientist , 1 июня 2017 г.
^ Дэвид П. Гамильтон, «Генетическая генеалогия достигла большого успеха», VentureBeat , 17 октября 2007 г.
^ Николас Уэйд, «Компания предлагает оценку генома», New York Times , 16 ноября 2007 г.; Дэвид П. Гамильтон, «23andMe позволяет вам искать и делиться своим геномом — уже сегодня», VentureBeat , 17 ноября 2007 г.
^ deCODEme и другие тесты, кроме 23andMe, больше не предлагаются, но современные примеры открытий deCODE, лежащих в основе личного сканирования генома, исследующего подтвержденный риск диабета 2 типа и ишемической болезни сердца, можно увидеть в G Palomaki et al., «Use of genomic панели для определения риска развития диабета 2 типа среди населения в целом: целевой обзор фактических данных», « Генетика в медицине» , том 15, стр. 600–611, август 2013 г.; Рабочая группа по оценке применения генома в практике и профилактике (EGAPP), «Рекомендации рабочей группы EGAPP: геномное профилирование для оценки сердечно-сосудистого риска для улучшения сердечно-сосудистого здоровья», Генетика в медицине , том 12, стр. 839-43, декабрь 2010 г.
^ Пример тестов полигенного риска deCODE и других, которые они предложили в пресс-релизе компании: « deCODE обнаруживает генетические маркеры, которые повышают эффективность тестирования ПСА для выявления рака простаты », 15 декабря 2010 г.
^ Амит В. Кера и др., «Генетический риск, приверженность здоровому образу жизни и ишемическая болезнь сердца», Медицинский журнал Новой Англии , том 375, стр. 2349-2358 (декабрь 2016 г.); Амит В. Кера, «Полигенные оценки распространенных заболеваний по всему геному выявляют людей с риском, эквивалентным моногенным мутациям», Nature Genetics (требуется подписка) , том 50, стр. 1219–1224, 13 августа 2018 г. Освещение этих статей в Нью-Йорке Times , Nature , Forbes и MIT Technology Review возобновили почти дословные дискуссии десятилетней давности о ценности таких тестов. а также пробелы в понимании врачами и широкой общественностью того, что означают результаты.
^ См. Стивена Д. Мура, «Биотехнологическая фирма превращает остров в гигантскую генетическую лабораторию», op. цит. О появлении термина «прецизионная медицина», Люк Тиммерман, «Что в названии? Очень многое, когда дело доходит до «точной медицины», Xconomy , 4 февраля 2013 г.
^ Один из примеров взгляда Стефанссона на роль генетики в разработке лекарств и в контексте растущей индустрии геномики у Энн Тейер, «Эволюция геномики: мелкие поставщики технологий и крупные фармацевтические фирмы становятся союзниками, чтобы найти причины болезней, подтвердить цели и понять реакцию на лекарства», « Новости химии и инженерии» , 8 декабря 2003 г.
^ О мышлении, лежащем в основе сделки с Рош, с лишь скромной дозой лихорадочных гипербол и инсинуаций того времени, см. Элиот Маршалл, «Белокурые амбиции Исландии», Mother Jones , май/июнь 1998 г.
^ Эмили Сингер, «DeCODE отказывается от разработки лекарств», MIT Technology Review , 22 января 2010 г.
^ О приобретении и его обосновании в широком контексте, а также о том, что deCODE остается независимым контролем над своими данными, см. Мэтт Херпер, «Благодаря сделке с DeCode Amgen стремится открывать лекарства, как мы намеревались в 1999 году», Forbes , 10 декабря 2012 г.
^ На научной странице веб-сайта Amgen представлено множество публикаций и проектов deCODE.
^ А. Камб, С. Харпер и К. Стефанссон, «Генетика человека как основа для разработки инновационных лекарств», Nature Biotechnology (требуется подписка) , том 31, стр. 975–978, ноябрь 2013 г.
^ Самый известный пример — ингибиторы PCSK9 , выявленные в семьях с редкой гиперхолестеринемией, а затем получившие более широкое распространение для снижения уровня холестерина и снижения риска сердечных заболеваний.
↑ Обсуждение прогресса в реализации этой стратегии содержится в книге Мэг Тиррелл, «Генетическая золотая жила Исландии и человек, стоящий за ней», CNBC , 6 апреля 2017 г.
^ Цитируется по Ашеру Малларду, «Аудиенция с… Шоном Харпером», Nature Reviews Drug Discovery (требуется подписка) , том 17, стр. 10–11, январь 2018 г.
↑ Пресс-релиз компании об открытии сайта Arfgerd.is (только на исландском языке), 15 мая 2018 г.
↑ Об отсутствии реакции со стороны правительства см. Энди Коглан, «Предупредите людей о генетических рисках для здоровья, говорит руководитель deCODE», New Scientist , 25 марта 2015 г.
^ Статистика в: Северный альянс по клинической геномике, « Отчет о 6-м клиническом семинаре NACG. Архивировано 10 мая 2019 г. в Wayback Machine », 21 ноября 2018 г., стр. 9.
^ США По оценкам Национального института рака , около 75% женщин с мутацией риска BRCA2 разовьют рак молочной железы в возрасте до 80 лет. О худшем прогнозе для носителей вариантов BRCA2 с раком простаты см. MR Akhbari et al. , «Влияние мутации BRCA2 на смертность от рака простаты, выявленного при скрининге», British Journal of Cancer , том 111, стр. 1238–1240, 9 сентября 2014 г.
^ М. Дейли, «Введение в премию Уильяма Аллана 2017: Кари Стефанссон», Американский журнал генетики человека , том 102, выпуск 3, стр. 350, 1 марта 2018 г.
^ «Программа миллиона ветеранов (MVP)» . 29 апреля 2022 г.
^ «Бюджеты» . 30 октября 2018 г.
^ "Геном Канады |" .
^ «Дубай Геномикс» . Архивировано из оригинала 10 мая 2019 года . Проверено 10 мая 2019 г.
^ «Финские геномы способствуют персонализированному и прогнозируемому здоровью | FIMM» . Архивировано из оригинала 2 июня 2016 года.
^ "Добро пожаловать" . France Génomique (на французском языке) . Проверено 12 июня 2024 г.
^ «Гонконгский проект ДНК по секвенированию десятков тысяч геномов» . 16 января 2019 г.
^ «Инициатива по редким и недиагностированным заболеваниям (IRUD)» .
^ «Геном Нидерландов» .
^ «Главная | Катарская программа генома» .
^ «Общественный портал — Саудовская программа генома человека» . Архивировано из оригинала 10 мая 2019 года.
^ «Институт генома Сингапура (ГИС)» .
^ «UNIST принимает участие в запуске проекта «Геном Кореи в Ульсане» » . 23 мая 2023 г.
^ «СайЛайфЛаб» . Архивировано из оригинала 10 мая 2019 года.
^ «ТУРЕЦКИЙ ИНСТИТУТ ЗДРАВООХРАНЕНИЯ» . Архивировано из оригинала 10 мая 2019 года.
^ «Центр генетики Регенерон (RGC): Секвенирование ДНК человека» .
^ «Архивная копия» . Архивировано из оригинала 10 мая 2019 года . Проверено 10 мая 2019 г. {{cite web}}: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка )
^ Пресс-релиз Американского общества генетики человека, « ASHG удостоил Кари Стефанссона премией Уильяма Аллана: генетик получит награду на ежегодном собрании ASHG 2017 », 12 июля 2017 г.
^ Пресс-релиз Исландского университета, «Исландец получает премию Уильяма Аллана», 9 августа 2016 г.
^ «The Time 100: Кари Стефанссон», Time , 3 мая 2007 г.
^ «Эйнштейны 21 века», Newsweek , 9 октября 2007 г.
↑ Боб Лангрет, «Чудеса медицины: E-банда», Forbes , 9 февраля 2002 г.
↑ «Звезды Европы», Businessweek , 12 июня 2000 г., также в Morgunblaðið , 6 июня 2000 г.
^ См. архивное издание Morgunblaðið от 26 января 2000 г., стр. 2.
↑ Уведомление в Morgunblaðið , 3 января 2002 г.
^ «Выборы НАН 2019» . Национальная академия наук. 30 апреля 2019 г.
^ «Исландский пионер генетических исследований получил престижную награду» . Сайт Rigshospitalet . 8 ноября 2019 года . Проверено 11 ноября 2019 г.
^ Рейкьявик: JPV, 2016.
^ Эйнар Кари Йоханнссон, « Национальная история Сьона: политическая трансформация коллективных воспоминаний исландцев в исторической художественной литературе Сьона » (неопубликованная магистерская диссертация, Университет Исландии, 2018), стр. 67.
^ Литературная критика этих ссылок в Люси Берк, «Генетика на месте преступления: расшифровка испорченной крови», Журнал литературных и культурных исследований инвалидности , том 6, номер 2, стр. 193-208.
^ «Бобби Фишер против всего мира, IMDB» . IMDB .
^ Фил Дайс-Ньюджент (6 июня 2011 г.). «Обзор AV/TV клуба» .
^ Халлдорссон, Йон Палл; Бьярнар, Якоб; Бьёрнсдоттир, Бирта (12 апреля 2020 г.). «Один Алвитри и Кари Стефанс сливаются в одно» . Индикатор . Проверено 28 января 2023 г.

Внешние ссылки

У Схолии есть авторский профиль Кари Стефанссона .

[1] Это исландское имя . Фамилия является отчеством , а не фамилией ; в Исландии его называют Кари , но на международном уровне его могут называть Стефанссоном .

[2] Гуннлаугур Харальдссон, изд. (2000). Læknar á Íslandia [ Краткие биографии исландских врачей ]. Фольклор. п. 963.

[3] Маркс, Вивьен (27 августа 2015 г.). «ДНК нации» . Природа . 524 (7566): 503–505. Бибкод : 2015Natur.524..503M . дои : 10.1038/524503а . ISSN 0028-0836 . ПМИД 26310768 .

[4] Ан, Джун Ён (16 октября 2017 г.). «Национальные проекты генома человека: обновленная информация и повестка дня» . Эпидемиология и здоровье . 39 : e2017045. дои : 10.4178/epih.e2017045 . ISSN 2092-7193 . ПМК 5675980 . ПМИД 29056031 .

[5] «Биографии делегатов С.Ю.» . Имперский колледж Лондона. Архивировано из оригинала 21 октября 2004 года.

[6] Уведомление о некрологе Стефана Йонссона, Morgunblaðið , 18 сентября 1990 г., доступно по адресу http://timarit.is/view_page_init.jsp?pageId=1729310.

[7] «Смерть: Валгердур Олафсдоттир» . Morgunblaðið (на исландском языке). 12 ноября 2021 г. Проверено 12 ноября 2021 г.

[8] «Сольвейг Карадоттир разводится с Дхани Харрисон» . ДВ (на исландском языке). 22 ноября 2016 года . Проверено 7 мая 2019 г.

[9] «Самое примечательное в моей дочери Сольвейге то, что она жена сына Джорджа Харрисона» . nutimmin.is 23 августа 2015 г. Архивировано из оригинала 23 сентября 2019 г. . Проверено 7 мая 2019 г.

[10] «Что, если бы вы знали, когда умрете?» Гаарец

[11] Профиль руководителя из BusinessWeek журнала [1] ^{[ мертвая ссылка ]}

[12] «Страница управления сайтом компании» . 6 февраля 2013 года . Проверено 2 мая 2019 г.

[13] «Страница сотрудников Исландского университета» . Проверено 2 мая 2019 г.

[14] «Биография спикера собрания генома человека 2019» . Архивировано из оригинала 2 мая 2019 года . Проверено 2 мая 2019 г.

[15] Его особое внимание уделялось дегенерации миелина при рассеянном склерозе. Подборку его публикаций этого периода можно найти в Google Scholar .

[16] Адам Пиоре, «Принесите нам свои гены: поиски ученого-викинга, чтобы победить болезнь», Наутилус , 2 июля 2015 г.

[17] Гулчер, Дж. Р., Вартанян, Т. и Стефанссон К., «Является ли рассеянный склероз аутоиммунным заболеванием?» Клиническая неврология 2(3-4):246-52 (1994)

[18] Современные взгляды на этот потенциал: М. С. Гайер и Ф. С. Коллинз, «Проект генома человека и будущее медицины», Американский журнал болезней детей , 147 (11): 1145-52 (ноябрь 1993 г.)

[19] Авторитетный взгляд середины 1990-х годов на перспективность генетики в диагностике, Мин Дж. Хури и Дайан К. Вагенер, «Эпидемиологическая оценка использования генетики для улучшения прогностической ценности факторов риска заболеваний», Американский журнал генетики человека , 56: 835-844, 5 января 1995 г.

[20] Ф.С. Коллинз и др., «Новые цели американского проекта генома человека: 1998–2003 гг.», Science , Vol. 282, стр. 682-689, 23 октября 1998 г.

[21] Влиятельное раннее (и в то время все еще в основном теоретическое) обсуждение различных возможных подходов к распространенным, а не редким заболеваниям - это ES Lander и NJ Schork, «Генетическое рассечение сложных признаков», Science , Vol. 265, выпуск 5181, стр. 2037–2048, 30 сентября 1994 г.

[22] Это было неочевидно. Даже выдающиеся эксперты, предсказавшие будущую мощь популяционной генетики и исследований ассоциаций, похоже, не учли, что анализ сцепления можно распространить на распространенные заболевания и помочь в исследованиях ассоциаций посредством генеалогии всего населения. Нил Риш и Кэтлин Мерикангас , «Будущее генетических исследований сложных заболеваний человека», Science , Vol. 273, № 5281, стр. 1516–1517, 13 сентября 1996 г.; Аравинда Чакраварти, «Популяционная генетика: поиск смысла вне последовательности», Nature Genetics 21, страницы 56–60, 1 января 1999 г.

[23] Николас Уэйд, «УЧЕНЫЙ В РАБОТЕ / Кари Стефанссон; Охота за генами болезней в генеалогиях Исландии», New York Times , 18 июня 2002 г.

[24] от Alta Venture Partners , Polaris Venture Partners , ARCH Venture Partners , Atlas Venture и других. Полный список первых инвесторов можно найти в исландской деловой газете Frjals Verslun от 1 марта 1998 г., стр. 37

[25] Объявление о начале операций deCODE на первой странице Morgunblaðið , 31 мая 1996 г.

[26] Раннее описание модели и процесса открытия Стефанссона и Галчера, когда они еще планировали создать ИБС, в «Популяционной геномике: закладывая основу для моделирования и нацеливания генетических заболеваний», Клиническая химия и лабораторная медицина (требуется подписка) 36 ( 8):523-7, 1 августа 1998 г.

[27] Хорошее раннее описание видения Стефанссона и бизнес-модели Стивена Д. Мура: «Биотехнологическая фирма превращает Исландию в гигантскую генетическую лабораторию», Wall Street Journal (требуется подписка) , 3 июля 1997 г.

[28] Гулчер, Дж., Хельгасон А., Стефанссон, К., «Генетическая однородность исландцев», Nature Genetics (требуется подписка) , том 26, стр. 395, декабрь 2000 г. Одним из примеров относительной генетической однородности, но глобальной полезности изучения исландской популяции является рак молочной железы. Во всем мире существует множество вариантов гена BRCA2, которые, как известно, значительно повышают риск рака молочной железы, но в Исландии, по сути, существует один вариант, связанный с заболеванием, который был опубликован накануне запуска deCODE в Исландии: Steinnun Thorlacius et al. ., «Одна мутация BRCA2 в семьях мужчин и женщин с раком молочной железы из Исландии с различными фенотипами рака», Nature Genetics (требуется подписка) , том 13, страницы 117–119, 1 мая 1996 г. У deCODE теперь есть веб-сайт, который позволяет исландцам узнать, являются ли они носителями мутации.

[29] Ресурсы и их полезность для открытия генов кратко изложены в первом пресс-релизе deCODE: «Исландская компания по геномике определяет местоположение гена, вызывающего эссенциальный тремор», 25 августа 1997 г., на веб-сайте компании.

[30] Цитируется по Майклу Спектру, «Расшифровка Исландии», The New Yorker (требуется подписка) , 18 января 1999 г.

[31] См., например, Франческо Кука и др., «Распределение гаплотипов DR4 на Сардинии предполагает первичную связь диабета I типа с локусами DRB1 и DQB1», Human Immunology , Volume 43, Issue 4, стр. 301-308, август 1995 г., ; Э.М. Петти и др. , «Картирование гена наследственного гиперпаратиреоза и пролактиномы (MEN1Burin) на хромосоме 11q: доказательства эффекта основателя у пациентов из Ньюфаундленда», American Journal of Human Genetics , 54(6): 1060–1066, июнь 1994 г.; Мелани М Махтани и др. , «Картирование гена диабета 2 типа, связанного с дефектом секреции инсулина, с помощью сканирования генома в финских семьях», Nature Genetics (требуется подписка) , том 14, стр. 90–94, 1 сентября 1996 г.; Стейннун Торлациус и др. , «Одиночная мутация BRCA2», op. цит.

[32] Стивен Д. Мур, «Биотехнологическая фирма превращает Исландию», op. цит.

[33] Гулчер и Стефанссон, «Популяционная геномика: закладываем основу», op. цит.

[34] Стефанссон и Гулчер цитируют опросы, показывающие общественную поддержку ИБС на уровне 75%, в «Исландской саге о централизованной базе данных здравоохранения и демократическом принятии решений», Nature Biotechnology (требуется подписка) (требуется подписка), том 17, стр. 620, июль. 1999. Исландские противники ИБС создали организацию под названием «Манвернд», чтобы бороться с ней и поощрять людей осуществлять свое право на отказ. Число отказов является одним из конкретных показателей противостояния этой идее, а также, наоборот, показателем того, сколько людей либо поддержали эту идею, либо не придерживались твердого мнения. Согласно архивному снимку веб-сайта Манвернда за сентябрь 2003 года , за пять лет после принятия закона, разрешающего ИГД, от участия отказались чуть более 20 000 человек, или 7% от населения 2003 года, составившего 288 000 человек.

[35] Книги и основные исследовательские статьи специалистов по биоэтике на эти темы включают: Майк Фортун, Многообещающая геномика: Исландия и генетика декодирования в мире спекуляций (Беркли: University of California Press, 2008); Дэвид Виникофф, «Геном и нация: база данных сектора здравоохранения Исландии и ее наследие», Innovations: Technology Governance Globalization 1(2):80-105, февраль 2006 г.; Генри Т. Грили , «План Исландии по исследованиям в области геномики: факты и последствия» », Jurimetrics (требуется подписка) 40, № 2, стр. 153–91, зима 2000 г.; и Джон Мерц, «Iceland, Inc?: Об этике коммерческой популяционной геномики», Social Science & Medicine 58(6):1201-9, апрель 2004 г. Помимо Mannvernd's, еще один веб-сайт в Беркли, Калифорния, был посвящен антропологическим последствия deCODE и генетических исследований в Исландии: http://www.lib.berkeley.edu/iceland/

[36] Стефанссон и Гулчер подсчитали, что к 1999 году было опубликовано более 700 статей и интервью. За это и за их мнение о преимуществах того, что делала deCODE: «Исландская сага о централизованной базе данных здравоохранения», op. цит. Частичное представление о количестве, характере и источниках статей можно увидеть в архивном просмотре веб-сайта Mannvernd за май 1999 года , исландской организации, созданной для борьбы с ИБС, а также в очень подробной библиографии, заархивированной 7 мая 2019 года в Wayback. Машина создана доктором Скули Сигурдссоном, ведущим сотрудником Mannvernd.

[37] Дж. Гулчер, К. Кристьянссон, Х. Гудбьяртссон, К. Стефанссон, «Защита конфиденциальности с помощью стороннего шифрования в генетических исследованиях в Исландии», Европейский журнал генетики человека (требуется подписка) , том 8, стр. 739–742, 3 октября 2000 г.

[38] Генри Т. Грили, «План Исландии по исследованиям в области геномики», op. цит.

[39] Как популяционная стратегия Стефанссона изменила мышление в этой области и открытие генов к середине 2000-х годов в Ли Сильвере , «Возрождение биологии: прорыв в генетической науке», Newsweek , 9 октября 2007 г.

[40] Черновой вариант проекта «Геном человека» был опубликован в журнале Nature ; журнале Черновик Селеры в Science , оба от 15 февраля 2001 г.

[41] Список ключевых публикаций deCODE, практически во всех из которых Стефанссон является старшим автором, указан по годам на веб-сайте компании по адресу https://www.decode.com/publications/.

[42] Дж. Л. Вебер, «Карта Исландии» и А. Конг и др. , «Карта рекомбинации человеческого генома с высоким разрешением», Nature Genetics (требуется подписка) , том 31, стр. 225–226 и 241–247 соответственно, 10 июня 2002 г. О том, как карта улучшила точность эталонной последовательности, см. Николас Уэйд: «Учёные говорят, что последовательность генома человека содержит ошибки», New York Times , 11 июня 2002 г.

[43] В 1999 году исландский антрополог Гисли Палссон уже отметил успех модели deCODE: Гисли Палссон и Пол Рабинов, «Исландия: случай национального геномного проекта», Anthropology Today Vol. 15, № 5, стр. 14-18, 5 октября 1999 г. В отчете организации по надзору за генетической этикой GeneWatch за 2009 г. , ярого противника ИБС и использования данных медицинских записей в исследованиях без явного согласия, deCODE отмечается как главный источник вдохновения. для Биобанка Великобритании. В 2000 году специалист по биоэтике Джордж Аннас уже отметил эмуляцию подхода deCODE, New England Journal of Medicine (требуется подписка) , 342:1830-1833, 15 июня 2000 г.; Дэвид Виникофф, «Геном и нация», op. цит. О первых успехах deCODE и их значении в качестве примера для других проектов биобанков и в этой области в целом см. также Николас Уэйд, «Ученый за работой/Кари Стефанссон: Охота за генами болезней в генеалогиях Исландии», New York Times , 18 июня 2002 г.

[44] Джоселин Кайзер, «Бум демографических баз данных от Исландии до США», Science (требуется подписка), Vol. 298, выпуск 5596, стр. 1158–1161, 8 ноября 2002 г. Ни у кого больше не было сопоставимых генеалогий, но Эрик Ландер был вдохновлен масштабом и подходом, основанным на данных в Исландии, и основал Институт Броуда с идеей использования быстро развивающихся технологий. для генерации большего количества данных – чипов SNP и последующего секвенирования – для обеспечения открытий. Ли Сильвер, «Возрождение биологии: прорыв в генетической науке», Newsweek , 9 октября 2007 г.

[45] Эта база данных в подавляющем большинстве полна, начиная с исландской переписи 1703 года , первой в мире полной национальной переписи населения и теперь являющейся частью зарегистрированного всемирного наследия ЮНЕСКО , и восходит к временам до прибытия первых жителей в 9 веке.

[46] Номера использования указаны на вики-странице Íslendingabok . Более подробное обсуждение давнего наблюдателя, антрополога Гисли Палссона, в книге «Сеть родственников: онлайн-генеалогическая машина» в книге Сандры К. Бэмфорд, под ред., « Родство и за его пределами: пересмотренная генеалогическая модель» (Нью-Йорк: Berghahn Books, 2009), стр. 84–110.

[47] Подробная информация о том, как работает система защиты конфиденциальности в Gulcher et al. , «Защита конфиденциальности с помощью стороннего шифрования», указ. цит.

[48] Хорошее предварительное описание того, как людей просят принять участие и как их данные используются в исследованиях, находится на стр. 7-9 годового отчета deCODE за 2002 год, поданного в SEC.

[49] К 2004 году правительство и deCODE фактически прекратили все работы над ИБС и двинулись дальше. На странице 10 годового отчета deCODE за 2003 год, поданного в SEC , компания описала взаимное отсутствие активности: «По состоянию на март 2004 года санкционированная правительством проверка протоколов шифрования и защиты данных IHD, которая началась в апреле 2000 года, не имела результатов. Когда и если эта проверка и выдача соответствующего сертификата безопасности будут завершены, мы оценим, стоит ли и когда вообще продолжать разработку IHD. Учитывая наши текущие бизнес-планы и приоритеты, мы не ожидаем, что IHD станет существенным аспектом нашего бизнеса в ближайшем будущем».

[50] Хелен Пирсон, «Профиль: Кари Стефанссон», Nature Medicine , том 9, страница 1099, 1 сентября 2003 г.; уровень участия в годовом отчете deCODE за 2002 год, поданном в SEC, стр. 8.

[51] Джеймс Батчер, «Кари Стефанссон, генерал генетики», The Lancet , 27 января 2007 г.

[52] Анна Азволинская, «Мастер-декодер: профиль Кари Стефанссона», The Scientist , 1 марта.

[53] В 2018 году самые передовые национальные усилия по изучению генома все еще стремились создать и собрать 100 000 полных последовательностей генома в одном месте. См. Алекс Филлипидис, «10 стран в клубе 100 тысяч геномов», Clinical Omics , 30 августа 2018 г.

[54] Новаторская ранняя методология поэтапного определения и вменения содержится в книге A Kong et al. , «Обнаружение совместного использования по происхождению, фазировка на большие расстояния и вменение гаплотипов», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, страницы 1068–1075, 17 августа 2008 г. Первое опубликованное вменение последовательности датируется 2015 годом: DF Gudbjartsson et al. , «Крупномасштабное полногеномное секвенирование исландского населения», опубликованное в рамках специального выпуска «Геномы исландцев», Nature Genetics (требуется подписка) , 47, стр. 435–444, 25 мая 2015 г.

[55] Экстон также отметил, что, несмотря на сотни публикаций ученых deCODE в других местах, 111 статей, или пять процентов статей, опубликованных во время его работы в журнале за предыдущие двенадцать лет, были опубликованы из deCODE. Комментарии Экстона взяты из его выступлений на конференции, посвященной 20-летию deCODE, состоявшейся в Рейкьявике 30 сентября 2016 года. Видео доступно на веб-сайте компании по адресу https://www.decode.com/20-years/ .

[56] Список всех основных публикаций deCODE с 1997 года находится на веб-сайте компании https://www.decode.com/publications/ .

[57] Недавние списки наиболее цитируемых ученых на https://hcr.clarivate.com/resources/archived-lists/. Архивировано 20 апреля 2019 г. в Wayback Machine.

[58] Конг и др. , «Карта рекомбинации человеческого генома с высоким разрешением», Nature Genetics (требуется подписка) , том 31, стр. 241–247, 10 июня 2002 г.

[59] Конг и др. , «Скорость воспроизводства и репродуктивный успех», Nature Genetics (требуется подписка) , том 36, стр. 1203–1206, 3 октября 2004 г.

[60] H Стефанссон и др. , «Обычная инверсия при отборе у европейцев», Nature Genetics (требуется подписка) , том 37, страницы 129–137, 16 января 2005 г.

[61] Конг и др. , «Различия в скорости мелкомасштабной рекомбинации между полами, популяциями и отдельными людьми», Nature (требуется подписка) , том 467, стр. 1099–1103, 28 октября 2010 г.

[62] Конг и др. , «Скорость мутаций de novo и важность возраста отца для риска заболевания», Nature , том 488, стр. 471–475, 23 августа 2012 г.

[63] Х. Йонссон и др. , «Родительское влияние на мутации de novo зародышевой линии человека в 1548 трио из Исландии», Nature (требуется подписка) , том 549, стр. 519–522, 28 сентября 2017 г.

[64] А. Йонссон и др. , «Множественная передача мутаций de novo в семьях», Nature Genetics (требуется подписка) , том 50, стр. 1674-1680, 5 ноября 2018 г.

[65] Б.В. Халлдорссон и др. , «Скорость мейотической конверсии генов зависит от пола и возраста», Nature Genetics (требуется подписка) , том 48, стр. 1377–1384, 19 сентября 2016 г.

[66] Б.В. Халлдорссон и др. , «Характеристика мутагенных эффектов рекомбинации с помощью генетической карты на уровне последовательности», Science , Vol. 363, Выпуск 6425, eaau1043, 25 января 2019 г.

[67] Хельгасон и др. , «Частота точечных мутаций Y-хромосомы у людей», Nature Genetics , (требуется подписка) , том 47, стр. 453–457, 25 марта 2015 г.

[68] Хельгасон и др. , «Последовательности первых поселенцев показывают быструю эволюцию пула исландской мтДНК», PLoS Genetics , 16 января 2009 г.

[69] Хельгасон и др. , «Оценка скандинавского и гэльского происхождения мужчин-поселенцев Исландии», Американский журнал генетики человека , 67 (3): 697–717, 7 августа 2000 г.; и Хелгасон и др. , «МтДНК и происхождение исландцев: расшифровка сигналов недавней истории населения», Американский журнал генетики человека , 66 (3): 999-1016, 23 февраля 2000 г.

[70] SS Ebenesersdottir et al ., «Древние геномы из Исландии раскрывают формирование человеческой популяции», Science (требуется подписка) , Vol. 360, выпуск 6392, стр. 1028-1032, 1 июня 2018 г.

[71] Хельгасон и др. , «Связь между родством и плодовитостью человеческих пар», Science (требуется подписка) , Vol. 319, выпуск 5864, стр. 813–816, 8 февраля 2008 г.

[72] А. Хельгасон и др., «Исландский пример влияния структуры популяции на исследования ассоциаций», Nature Genetics (требуется подписка) , том 37, страницы 90–95, 19 декабря 2004 г.

[73] П. Сулем и др., «Идентификация большого набора редких полных нокаутов человека», Nature Genetics (требуется подписка) , том 47, страницы 448–452, 25 марта 2015 г.

[74] Джагадисан и др. , «Реконструкция африканского гаплоидного генома XVIII века», Nature Genetics (требуется подписка) , том 50, стр. 199–205, 15 января 2018 г. Ханс Джонатан является героем книги исландского антрополога Гисли Палссон « Человек, который украл самого себя». (Чикаго: University of Chicago Press, 2016) и Стефанссон обратились к реконструкции Ганса Геном Джонатана в New York Times , The Atlantic , Newsweek , Der Spiegel и других изданиях.

[75] Стефанссон представил раннее объяснение «широкого, но строгого» подхода к определению фенотипов, основанного на сборе данных, на конференции Европейской лаборатории молекулярной биологии (EMBL) в Барселоне в 2000 году; это также обсуждается во многих публикациях. См., например, S. Gretarsdottir et al. , «Локализация гена предрасположенности к распространенным формам инсульта по 5q12», Американский журнал генетики человека , том 70, выпуск 3, стр. 593-603, март 2002 г.

[76] Т. Йонссон и др. , «Мутация в APP защищает от болезни Альцгеймера и возрастного снижения когнитивных функций», Nature , 488, стр. 96–99, 11 июня 2012 г.; Майкл Спектер, «Хорошие новости о болезни Альцгеймера», The New Yorker , 11 июля 2012 г.; Юэн Каллауэй, «Мутация гена защищает от болезни Альцгеймера», Nature , 11 июля 2012 г.

[77] Т. Йонссон и др. , «Вариант TREM2, связанный с риском болезни Альцгеймера», New England Journal of Medicine , 368(2):107-16, 10 января 2013 г.; С. Стейнберг и др. , «Варианты потери функции в ABCA7 повышают риск болезни Альцгеймера», Nature Genetics , 47(5):445-7, 25 марта 2015 г.

[78] H Стефанссон и др. , «Нейрегулин 1 и предрасположенность к шизофрении», Американский журнал генетики человека , том 71, выпуск 4, стр. 877-892, октябрь 2002 г. Как и многие ранние открытия, основанные на сцеплении, эта связь сама по себе не оказалась плодотворной, но более поздняя работа оказалась существенной. было сделано на пути. См., например, А. Буонанно, «Сигнальный путь нейрегулина и шизофрения: от генов к синапсам и нервным цепям», Brain Research Bulletin , Volume 83, Issues 3–4, стр. 122–131, 30 сентября 2010 г.

[79] H Стефанссон и др. , «Крупные рецидивирующие микроделеции, связанные с шизофренией», Nature (требуется подписка) , том 455, стр. 232-6, 11 сентября 2008 г.; Х. Стефанссон и др. , Nature (требуется подписка) , «Распространенные варианты, повышающие риск шизофрении», Nature, том 460, стр. 744-7, 6 августа 2009 г.; Ниам Маллинз и др. , «Репродуктивная пригодность и генетический риск психических расстройств среди населения в целом», Nature Communications , том 8, номер статьи 15833, 13 июня 2017 г.

[80] H Стефанссон и др. , «CNV, повышающие риск развития аутизма или шизофрении, влияют на когнитивные способности контрольной группы», Nature , том 505, стр. 361-6, 18 декабря 2013 г.

[81] RA Power et al. , «Полигенные оценки риска шизофрении и биполярного расстройства предсказывают творческие способности», Nature Neuroscience (требуется подписка) , том 18, стр. 953–955, 8 июня 2015 г.; Г. В. Регинссон и др., «Полигенные оценки риска шизофрении и биполярного расстройства, связанные с зависимостью», «Биология зависимости » , том 23, выпуск 1, стр. 485-492, 25 февраля 2017 г.

[82] Б. Гуннарссон и др. , «Вариант последовательности, связанный с уровнем образования, также влияет на познавательные способности детей», Nature Scientific Reports , том 6, номер статьи 36189.

[83] А. Конг и др., «Отбор против вариантов генома, связанных с уровнем образования», Труды Национальной академии наук , 114 (5) E727-E732, 17 января 2017 г.

[84] LT Амундадоттир и др. , «Рак как сложный фенотип: закономерности распространения рака внутри и за пределами нуклеарной семьи», PLoS Medicine , 1(3):e65, 28 декабря 2004 г.; Т. Гудмундссон и др. «Популяционный семейный агрегационный анализ указывает на генетический вклад в большинстве почечно-клеточных карцином», International Journal of Cancer , 100(4):476-9, 13 июня 2002 г.; С. Йонссон и др. , «Семейный риск рака легких у населения Исландии», Журнал Американской медицинской ассоциации (JAMA) , 292(24):2977-83, 22 декабря 2004 г.

[85] Дж. Гудмундссон и др. , «Полногеномное исследование ассоциации идентифицирует второй вариант предрасположенности к раку простаты в 8q24», Nature Genetics (требуется подписка) , том 39, стр. 631–637, 1 апреля 2007 г.; Л.А. Кимени и др. , «Вариант последовательности 8q24 обуславливает предрасположенность к раку мочевого пузыря», Nature Genetics , 40(11):1307-12, 14 сентября 2008 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Исследование, основанное на полногеномном секвенировании, выявило редкий вариант 8q24, связанный с раком простаты», Nature Genetics (требуется подписка) , том 44, страницы 1326–1329, 28 октября 2012 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Распространенный вариант 8q24.21 связан с почечно-клеточным раком», Nature Communications , Том 4, Номер статьи: 2776, 13 ноября 2013 г.

[86] Т. Рафнар и др. , «Варианты последовательности локуса TERT-CLPTM1L ассоциированы со многими типами рака», Nature Genetics , (требуется подписка) , 41(2):221-7, 18 января 2009 г.; С.Н. Стейси и др. , «Зародышевый вариант сигнала полиаденилирования TP53 придает предрасположенность к раку», Nature Genetics , 43(11):1098-103, 25 сентября 2011 г.; У Стиркарсдоттир и др. , «Нонсенс-мутация в гене LGR4 связана с несколькими заболеваниями и другими признаками человека», Nature (требуется подписка) , том 497, стр. 517–520, 5 мая 2013 г.

[87] LT Амундадоттир и др. , «Общий вариант, связанный с раком простаты в популяциях Европы и Африки», Nature Genetics (требуется подписка) , 38(6):652-8, 27 мая 2006 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Общие варианты последовательностей 2p15 и Xp11.22 придают предрасположенность к раку простаты», Nature Genetics (требуется подписка) , 40(3):281-3, 10 февраля 2008 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Полногеномные исследования ассоциации и репликации идентифицируют четыре варианта, связанных с предрасположенностью к раку простаты», Nature Genetics , 41 (10): 1122-6, 20 сентября 2009 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Исследование, основанное на полногеномном секвенировании, выявило редкий вариант 8q24, связанный с раком простаты», Nature Genetics (требуется подписка) , том 44, страницы 1326–1329, 28 октября 2012 г.; С.Н. Стейси и др. , «Вставка ретротранспозона SVA-E в ген CASP8 связана с защитой от рака простаты», Human Molecular Genetics , 25(5):1008-18, 1 марта 2016 г.; Дж. Гудмундссон и др. «Общегеномные ассоциации доброкачественной гиперплазии предстательной железы обнаруживают генетическую корреляцию с уровнем ПСА в сыворотке крови», Nature Communications , Том 9, Артикульный номер: 4568, 8 ноября 2018 г.

[88] С. Н. Стейси и др. , «Вариант Cys557Ser BARD1 и риск рака молочной железы в Исландии», PLoS Medicine , 20 июня 2006 г.; С.Н. Стейси и др. , «Общие варианты хромосом 2q35 и 16q12 обуславливают предрасположенность к раку молочной железы, положительному по рецептору эстрогена», Nature Genetics (требуется подписка) , том 39, стр. 865–869, 27 мая 2007 г.; С.Н. Стейси и др. , «Распространенные варианты хромосомы 5p12 обусловливают предрасположенность к раку молочной железы, положительному по рецептору эстрогена», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, стр. 703–706, 27 апреля 2008 г.

[89] DF Gudbjartsson et al. , «Варианты пигментации ASIP и TYR связаны с меланомой кожи и базальноклеточной карциномой», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, стр. 886–891, 18 мая 2008 г.; С.Н. Стейси и др. «Общие варианты 1p36 и 1q42 связаны с базальноклеточной карциномой кожи, но не с меланомой или признаками пигментации», Nature Genetics , Volume 40, стр. 1313–1318, 12 октября 2008 г.; С.Н. Стейси и др. , «Новые распространенные варианты, влияющие на предрасположенность к базальноклеточной карциноме», Nature Genetics , том 41, стр. 909–914, 5 июля 2009 г.; С.Н. Стейси и др. , «Варианты зародышевой последовательности в TGM3 и RGS22 повышают риск базальноклеточной карциномы», Human Molecular Genetics , Volume 23, Issue 11, стр. 3045–3053, 1 июня 2014 г.; С.Н. Стейси и др. , «Новые локусы восприимчивости к базальноклеточной карциноме», Nature Communications, том 6, номер статьи 6825, 9 апреля 2015 г.

[90] Дж. Гудмундссон и др. , «Распространенные варианты 9q22.33 и 14q13.3 предрасполагают к раку щитовидной железы в европейском населении», Nature Genetics (требуется подписка) , том 41, стр. 460–464, 6 февраля 2009 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Обнаружение распространенных вариантов, связанных с низким уровнем ТТГ и риском рака щитовидной железы», Nature Genetics (требуется подписка) , том 44, стр. 319–322, 22 января 2012 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Полногеномное исследование ассоциации выявило пять новых локусов риска рака щитовидной железы», Nature Communications , том 8, номер статьи 14517, 14 февраля 2017 г.

[91] Л. Кимни и др. , «Вариант последовательности 8q24 обуславливает предрасположенность к раку мочевого пузыря», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, стр. 1307–1312, 14 сентября 2008 г.; Л. Кимени и др. , «Вариант последовательности 4p16.3 придает предрасположенность к раку мочевого пузыря», Nature Genetics (требуется подписка) , том 42, стр. 415–419, 28 марта 2010 г.; Т. Рафнар и др. , «Европейское общегеномное исследование ассоциации идентифицирует SLC14A1 как новый ген предрасположенности к раку мочевого пузыря», Human Molecular Genetics , Volume 20, Issue 21, стр. 4268–428, 11 ноября 2011 г.; Т. Рафнар и др. , «Полногеномное исследование ассоциации выявило варианты 20p12.2, которые связаны с раком мочевого пузыря», Молекулярная генетика человека , том 23, выпуск 20, страницы 5545–5557, 15 октября 2014 г.

[92] Т. Рафнар и др. , «Мутации в BRIP1 повышают риск рака яичников», Nature Genetics (требуется подписка) , том 43, стр. 1104–1107, 2 октября 2011 г.

[93] Т. Гудбьартссон и др. , «Популяционный семейный агрегационный анализ указывает на генетический вклад в большинстве почечно-клеточных карцином», International Journal of Cancer , 13 июня 2002 г.; Дж. Гудмундссон и др. , «Распространенный вариант 8q24.21 связан с почечно-клеточным раком», Nature Communications , том 4, номер статьи: 2776, 13 ноября 2013 г.

[94] H Helgason et al. , «Варианты потери функции в АТМ повышают риск рака желудка», Nature Genetics (требуется подписка) , том 47, страницы 906–910, 22 июня 2015 г.

[95] JT Bergthorsson et al. , «Полногеномное исследование аллельного дисбаланса в опухолях зародышевых клеток яичек человека с использованием микросателлитных маркеров», Cancer Genetics and Cytogenetics , Volume 164, Issue 1, pp 1-91, 1 января 2006 г.

[96] С. Йонссон и др. , «Семейный риск рака легких у населения Исландии», Журнал Американской медицинской ассоциации (JAMA) , том 292 (24), стр. 2977-2983, 22 декабря 2004 г.; Т.Э. Торгейрссон и др. , «Вариант, связанный с никотиновой зависимостью, раком легких и заболеванием периферических артерий», Nature , том 452, стр. 638–642, 3 апреля 2008 г.

[97] Ф. Зинк и др., «Клональный гемопоэз с мутациями-кандидатами в драйверы и без них часто встречается у пожилых людей», Blood , Volume 130, стр. 742-752, февраль 2002 г.

[98] TE Thorgeirsson et al ., «Вариант, связанный с никотиновой зависимостью, раком легких и заболеванием периферических артерий», Nature (требуется подписка) , том 452, стр. 638–6423, 3 апреля 2008 г.; Т.Э. Торгейрссон и др. , «Варианты последовательностей CHRNB3–CHRNA6 и CYP2A6 влияют на поведение при курении», Nature Genetics (требуется подписка) , том 42, стр. 448–453, 25 апреля 2010 г.; Т.Э. Торгейрссон и др. , «Редкая миссенс-мутация в CHRNA4 связана с курением и его последствиями», Molecular Psychiatry , том 21, стр. 594–600, 8 марта 2016 г. Меган Брукс, «Гены влияют на курение, риск рака легких», Reuters , 26 апреля 2010 год

[99] DF Gudbjartsson et al. , «Варианты, вызывающие риск фибрилляции предсердий на хромосоме 4q25», Nature (требуется подписка) , том 448, стр. 353–357, 19 июля 2007 г.; Д.Ф. Гудбьартссон и др. , «Делегация сдвига рамки считывания в гене саркомера MYL4 вызывает раннюю семейную фибрилляцию предсердий», European Heart Journal , том 38, выпуск 1, страницы 27–34, 1 января 2017 г.; РБ Торольфсдоттир и др. , «Миссенс-вариант PLEC увеличивает риск фибрилляции предсердий», Журнал Американского колледжа кардиологов , том 70, выпуск 17, стр. 2157-2168, 24 октября 2017 г.; РБ Торольфсдоттир и др. , «Варианты кодирования в RPL3L и MYZAP повышают риск фибрилляции предсердий», Communication Biology , Том 1, статья № 68, 12 июня 2018 г.

[100] См. примечания 101 и 102 ниже и: A Helgadottir et al. , «Редкие мутации SCARB1 связаны с холестерином липопротеинов высокой плотности, но не с ишемической болезнью сердца», European Heart Journal , том 39, выпуск 23, стр. 2172–2178, 14 июня 2018 г.; E. Bjornsson et al., «Редкая донорская мутация сплайсинга в гене гаптоглобина связана с уровнем липидов в крови и ишемической болезнью сердца», Human Molecular Genetics , Volume 26, Issue 12, стр. 2364–2376, 15 июня 2017 г.; С. Гретарсдоттир и др., «Вариант области сплайсинга в LDLR снижает уровень холестерина в липопротеинах невысокой плотности и защищает от ишемической болезни сердца», PLoS Genetics , 1 сентября 2015 г.; Э Бьернссон и др. , «Общие варианты последовательности, связанные с ишемической болезнью сердца, коррелируют со степенью коронарного атеросклероза», «Артериосклероз, тромбоз и сосудистая биология» , том 35, стр. 1526–1531, 1 июня 2015 г.; А. Хелгадоттир и др., «Распространенный вариант хромосомы 9p21, влияющий на риск инфаркта миокарда», Science (требуется подписка) , Том. 316, выпуск 5830, стр. 1491–1493, 8 июня 2007 г.; Хельгадоттир и др. , «Ген, кодирующий белок, активирующий 5-липоксигеназу, повышает риск инфаркта миокарда и инсульта», Nature Genetics , том 36, стр. 233–239, 8 февраля 2004 г.

[101] DF Gudbjartsson et al. , «Вариант последовательности ZFHX3 на 16q22 ассоциируется с фибрилляцией предсердий и ишемическим инсультом», Nature Genetics (требуется подписка) , том 41, стр. 876–878, 13 июля 2009 г.; С. Гретарсдоттир и др. , «Ген, кодирующий фосфодиэстеразу 4D, повышает риск ишемического инсульта», Nature Genetics (требуется подписка) , том 35, стр. 131–138, 21 сентября 2003 г.; С. Гретарсдоттир и др. , «Локализация гена предрасположенности к распространенным формам инсульта на 5q12», Американский журнал генетики человека , том 70, выпуск 3, стр. 593-603, март 2002 г.

[102] TE Thorgeirsson et al., «Вариант, связанный с никотиновой зависимостью, раком легких и заболеванием периферических артерий», op. цит. ; G Гудмундссон и др. , «Локализация гена окклюзионного заболевания периферических артерий на хромосоме 1p31», Американский журнал генетики человека , том 70, выпуск 3, стр. 586-592, март 2002 г.

[103] Х. Холм и др. , «Редкий вариант MYH6 связан с высоким риском синдрома слабости синусового узла», Nature Genetics (требуется подписка) , том 43, стр. 316–320, 6 марта 2011 г.

[104] Хельгадоттир и др. , «Один и тот же вариант последовательности 9p21 связан с инфарктом миокарда, аневризмой брюшной аорты и внутричерепной аневризмой», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, стр. 217–224, 6 января 2008 г.; С. Гретарсдоттир и др. , «Полногеномное исследование ассоциации идентифицирует вариант последовательности в гене DAB2IP, обусловливающий предрасположенность к аневризме брюшной аорты», Nature Genetics (требуется подписка) , том 42, стр. 692–697, 11 июля 2010 г.

[105] П Ниой и др. , «Вариант ASGR1, связанный со снижением риска развития ишемической болезни сердца», Медицинский журнал Новой Англии , том 374, стр. 2131-2141, 2 июня 2016 г.

[106] Это открытие привлекло значительное внимание науки и средств массовой информации. См., например, Мэтта Херпера, «Исследователи Amgen обнаружили ген, который снижает риск сердечного приступа», Forbes , 18 мая 2016 г.; Антонио Регаладо, «Amgen обнаружила ген против сердечного приступа», MIT Technology Review , 18 мая 2016 г.; Юэн Каллауэй, «Защитный ген дает надежду на создание следующего блокбастера для сердца», Nature , 19 мая 2016 г.

[107] Хельгадоттир и др. , «Варианты с сильным влиянием на липиды крови и роль холестерина и триглицеридов при ишемической болезни сердца», Nature Genetics (требуется подписка) , том 48, страницы 634–639, 2 мая 2016 г.

[108] SFA Grant et al ., «Вариант гена транскрипционного фактора 7, подобного 2 (TCF7L2), повышает риск развития диабета 2 типа», Nature Genetics (требуется подписка) , том 38, стр. 320–323, 15 января 2006 г.; А. Хелгасон и др., «Уточнение влияния вариантов гена TCF7L2 на диабет 2 типа и адаптивную эволюцию», Nature Genetics (требуется подписка) , том 39, стр. 218–225, 7 января 2007 г.

[109] V Steinthorsdottir et al. , «Вариант CDKAL1 влияет на реакцию инсулина и риск развития диабета 2 типа», Nature Genetics (требуется подписка) , том 39, стр. 770–775, 26 апреля 2007 г.; V Steinthorsdottir et al. , «Идентификация низкочастотных и редких вариантов последовательностей, связанных с повышенным или пониженным риском развития диабета 2 типа», Nature Genetics (требуется подписка) , том 46, стр. 294–298, 26 января 2014 г.; EV Ivarsdottir et al., «Влияние вариантов последовательностей на дисперсию уровней глюкозы предсказывает риск диабета 2 типа и учитывает наследственность», Nature Genetics (требуется подписка) , том 49, стр. 1398–1402, 7 августа 2017 г.; Дж. Гудмундссон и др., «Два варианта хромосомы 17 повышают риск рака простаты, а вариант TCF2 защищает от диабета 2 типа», op. цит.

[110] Г. Торлейфссон и др. , «Распространенные варианты рядом с CAV1 и CAV2 связаны с первичной открытоугольной глаукомой», Nature Genetics (требуется подписка) , том 42, стр. 906–909, 12 сентября 2010 г.; Дж. Торлейфссон и др. , «Общие варианты последовательностей гена LOXL1, обуславливающие предрасположенность к эксфолиативной глаукоме», Science (требуется подписка) , том 317, выпуск 5843, стр. 1397-1400, 7 сентября 2007 г.

[111] П. Сулем и др., «Полногеномное исследование ассоциации определяет варианты последовательности 6q21, связанные с возрастом менархе», Nature Genetics (требуется подписка) , том 41, стр. 734–738, 17 мая 2009 г.

[112] Х. Стефанссон и др., «Вариант последовательности гена LINGO1 увеличивает риск эссенциального тремора», Nature Genetics (требуется подписка) , том 41, стр. 277–279, 1 февраля 2009 г.

[113] G Sveinbjornsson et al., «Варианты последовательности HLA класса II влияют на риск туберкулеза в популяциях европейского происхождения», Nature Genetics (требуется подписка) , том 48, стр. 318–322, 1 февраля 2016 г.

[114] DF Gudbjartsson et al. , «Многие варианты последовательностей, влияющие на разнообразие роста взрослого человека», Nature Genetics , том 40, стр. 609–615, 6 апреля 2008 г.; С. Бенонисдоттир и др. , «Эпигенетические и генетические компоненты регуляции роста», Nature Communications , том 7, номер статьи 13490, 16 ноября 2016 г.

[115] В. Эмильссон и др. , «Генетика экспрессии генов и ее влияние на заболевания», Nature (требуется подписка) , том 452, стр. 423–428, 27 марта 2008 г.

[116] П. Сулем и др., «Два недавно выявленных генетических детерминанта пигментации у европейцев», Nature Genetics (требуется подписка) , том 40, стр. 835–837, 18 мая 2008 г.; П. Сулем и др., «Генетические детерминанты пигментации волос, глаз и кожи у европейцев», Nature Genetics (требуется подписка) , том 39, стр. 1443–1452, 12 октября 2007 г.

[117] Хельгадоттир и др. , «Полногеномный анализ выявил новые локусы, связанные со стенозом аортального клапана», Nature Communications , том 9, номер статьи 987, 7 марта 2018 г.

[118] Р.П. Кристьянссон и др. , «Вариант с потерей функции ALOX15 защищает от полипов носа и хронического риносинусита», Nature Genetics (требуется подписка) , том 51, стр. 267–276, 14 января 2019 г.

[119] История, рассказанная Джиной Колата: «Редкая мутация убивает ген, ответственный за диабет», New York Times , 2 марта 2014 г.

[120] Дж. Фланник и др. , «Мутации потери функции в SLC30A8 защищают от диабета 2 типа», Nature Genetics (требуется подписка) , том 46, стр. 357–363, 2 марта 2014 г.

[121] В 2006 году один житель Рейкьявика и участник исследования deCODE сказал, что около 90% людей считают, что участие в исследованиях, финансируемых фармацевтическими компаниями, имеет смысл, тогда как около 10% были против этого, что примерно отражает уровень участия опрошенных. Майкл Д. Лемомик, «Исландский эксперимент: как крошечное островное государство захватило лидерство в геномной революции», Time , 12 февраля 2006 г. Те, кто не согласен, продолжают высказываться, даже несмотря на то, что эмуляция модели deCODE распространяется: см., например, Эмму Джейн. Кирби, «ДНК Исландии: самые ценные гены в мире?», BBC News , 19 июня 2014 г.

[122] Широта воздействия модели и цитата Финнбогадоттира в Кэтрин Оффорд, «Изучение исландской модели генетических исследований», The Scientist , 1 июня 2017 г.

[123] Дэвид П. Гамильтон, «Генетическая генеалогия достигла большого успеха», VentureBeat , 17 октября 2007 г.

[124] Николас Уэйд, «Компания предлагает оценку генома», New York Times , 16 ноября 2007 г.; Дэвид П. Гамильтон, «23andMe позволяет вам искать и делиться своим геномом — уже сегодня», VentureBeat , 17 ноября 2007 г.

[125] CODEme и другие тесты, кроме 23andMe, больше не предлагаются, но современные примеры открытий deCODE, лежащих в основе личного сканирования генома, исследующего подтвержденный риск диабета 2 типа и ишемической болезни сердца, можно увидеть в G Palomaki et al., «Use of genomic панели для определения риска развития диабета 2 типа среди населения в целом: целевой обзор фактических данных», « Генетика в медицине» , том 15, стр. 600–611, август 2013 г.; Рабочая группа по оценке применения генома в практике и профилактике (EGAPP), «Рекомендации рабочей группы EGAPP: геномное профилирование для оценки сердечно-сосудистого риска для улучшения сердечно-сосудистого здоровья», Генетика в медицине , том 12, стр. 839-43, декабрь 2010 г.

[126] Пример тестов полигенного риска deCODE и других, которые они предложили в пресс-релизе компании: « deCODE обнаруживает генетические маркеры, которые повышают эффективность тестирования ПСА для выявления рака простаты », 15 декабря 2010 г.

[127] Амит В. Кера и др., «Генетический риск, приверженность здоровому образу жизни и ишемическая болезнь сердца», Медицинский журнал Новой Англии , том 375, стр. 2349-2358 (декабрь 2016 г.); Амит В. Кера, «Полигенные оценки распространенных заболеваний по всему геному выявляют людей с риском, эквивалентным моногенным мутациям», Nature Genetics (требуется подписка) , том 50, стр. 1219–1224, 13 августа 2018 г. Освещение этих статей в Нью-Йорке Times , Nature , Forbes и MIT Technology Review возобновили почти дословные дискуссии десятилетней давности о ценности таких тестов. а также пробелы в понимании врачами и широкой общественностью того, что означают результаты.

[128] См. Стивена Д. Мура, «Биотехнологическая фирма превращает остров в гигантскую генетическую лабораторию», op. цит. О появлении термина «прецизионная медицина», Люк Тиммерман, «Что в названии? Очень многое, когда дело доходит до «точной медицины», Xconomy , 4 февраля 2013 г.

[129] Один из примеров взгляда Стефанссона на роль генетики в разработке лекарств и в контексте растущей индустрии геномики у Энн Тейер, «Эволюция геномики: мелкие поставщики технологий и крупные фармацевтические фирмы становятся союзниками, чтобы найти причины болезней, подтвердить цели и понять реакцию на лекарства», « Новости химии и инженерии» , 8 декабря 2003 г.

[130] О мышлении, лежащем в основе сделки с Рош, с лишь скромной дозой лихорадочных гипербол и инсинуаций того времени, см. Элиот Маршалл, «Белокурые амбиции Исландии», Mother Jones , май/июнь 1998 г.

[131] Эмили Сингер, «DeCODE отказывается от разработки лекарств», MIT Technology Review , 22 января 2010 г.

[132] О приобретении и его обосновании в широком контексте, а также о том, что deCODE остается независимым контролем над своими данными, см. Мэтт Херпер, «Благодаря сделке с DeCode Amgen стремится открывать лекарства, как мы намеревались в 1999 году», Forbes , 10 декабря 2012 г.

[133] На научной странице веб-сайта Amgen представлено множество публикаций и проектов deCODE.

[134] А. Камб, С. Харпер и К. Стефанссон, «Генетика человека как основа для разработки инновационных лекарств», Nature Biotechnology (требуется подписка) , том 31, стр. 975–978, ноябрь 2013 г.

[135] Самый известный пример — ингибиторы PCSK9 , выявленные в семьях с редкой гиперхолестеринемией, а затем получившие более широкое распространение для снижения уровня холестерина и снижения риска сердечных заболеваний.

[136] Обсуждение прогресса в реализации этой стратегии содержится в книге Мэг Тиррелл, «Генетическая золотая жила Исландии и человек, стоящий за ней», CNBC , 6 апреля 2017 г.

[137] Цитируется по Ашеру Малларду, «Аудиенция с… Шоном Харпером», Nature Reviews Drug Discovery (требуется подписка) , том 17, стр. 10–11, январь 2018 г.

[138] Пресс-релиз компании об открытии сайта Arfgerd.is (только на исландском языке), 15 мая 2018 г.

[139] Об отсутствии реакции со стороны правительства см. Энди Коглан, «Предупредите людей о генетических рисках для здоровья, говорит руководитель deCODE», New Scientist , 25 марта 2015 г.

[140] Статистика в: Северный альянс по клинической геномике, « Отчет о 6-м клиническом семинаре NACG. Архивировано 10 мая 2019 г. в Wayback Machine », 21 ноября 2018 г., стр. 9.

[141] США По оценкам Национального института рака , около 75% женщин с мутацией риска BRCA2 разовьют рак молочной железы в возрасте до 80 лет. О худшем прогнозе для носителей вариантов BRCA2 с раком простаты см. MR Akhbari et al. , «Влияние мутации BRCA2 на смертность от рака простаты, выявленного при скрининге», British Journal of Cancer , том 111, стр. 1238–1240, 9 сентября 2014 г.

[142] М. Дейли, «Введение в премию Уильяма Аллана 2017: Кари Стефанссон», Американский журнал генетики человека , том 102, выпуск 3, стр. 350, 1 марта 2018 г.

[143] «Программа миллиона ветеранов (MVP)» . 29 апреля 2022 г.

[144] «Бюджеты» . 30 октября 2018 г.

[145] "Геном Канады |" .

[146] «Дубай Геномикс» . Архивировано из оригинала 10 мая 2019 года . Проверено 10 мая 2019 г.

[147] «Финские геномы способствуют персонализированному и прогнозируемому здоровью | FIMM» . Архивировано из оригинала 2 июня 2016 года.

[148] "Добро пожаловать" . France Génomique (на французском языке) . Проверено 12 июня 2024 г.

[149] «Гонконгский проект ДНК по секвенированию десятков тысяч геномов» . 16 января 2019 г.

[150] «Инициатива по редким и недиагностированным заболеваниям (IRUD)» .

[151] «Геном Нидерландов» .

[152] «Главная | Катарская программа генома» .

[153] «Общественный портал — Саудовская программа генома человека» . Архивировано из оригинала 10 мая 2019 года.

[154] «Институт генома Сингапура (ГИС)» .

[155] «UNIST принимает участие в запуске проекта «Геном Кореи в Ульсане» » . 23 мая 2023 г.

[156] «СайЛайфЛаб» . Архивировано из оригинала 10 мая 2019 года.

[157] «ТУРЕЦКИЙ ИНСТИТУТ ЗДРАВООХРАНЕНИЯ» . Архивировано из оригинала 10 мая 2019 года.

[158] «Центр генетики Регенерон (RGC): Секвенирование ДНК человека» .

[159] «Архивная копия» . Архивировано из оригинала 10 мая 2019 года . Проверено 10 мая 2019 г. {{cite web}}: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка )

[160] Пресс-релиз Американского общества генетики человека, « ASHG удостоил Кари Стефанссона премией Уильяма Аллана: генетик получит награду на ежегодном собрании ASHG 2017 », 12 июля 2017 г.

[161] Пресс-релиз Исландского университета, «Исландец получает премию Уильяма Аллана», 9 августа 2016 г.

[162] «The Time 100: Кари Стефанссон», Time , 3 мая 2007 г.

[163] «Эйнштейны 21 века», Newsweek , 9 октября 2007 г.

[164] Боб Лангрет, «Чудеса медицины: E-банда», Forbes , 9 февраля 2002 г.

[165] «Звезды Европы», Businessweek , 12 июня 2000 г., также в Morgunblaðið , 6 июня 2000 г.

[166] См. архивное издание Morgunblaðið от 26 января 2000 г., стр. 2.

[167] Уведомление в Morgunblaðið , 3 января 2002 г.

[168] «Выборы НАН 2019» . Национальная академия наук. 30 апреля 2019 г.

[169] «Исландский пионер генетических исследований получил престижную награду» . Сайт Rigshospitalet . 8 ноября 2019 года . Проверено 11 ноября 2019 г.

[170] Рейкьявик: JPV, 2016.

[171] Эйнар Кари Йоханнссон, « Национальная история Сьона: политическая трансформация коллективных воспоминаний исландцев в исторической художественной литературе Сьона » (неопубликованная магистерская диссертация, Университет Исландии, 2018), стр. 67.

[172] Литературная критика этих ссылок в Люси Берк, «Генетика на месте преступления: расшифровка испорченной крови», Журнал литературных и культурных исследований инвалидности , том 6, номер 2, стр. 193-208.

[173] «Бобби Фишер против всего мира, IMDB» . IMDB .

[174] Фил Дайс-Ньюджент (6 июня 2011 г.). «Обзор AV/TV клуба» .

[175] Халлдорссон, Йон Палл; Бьярнар, Якоб; Бьёрнсдоттир, Бирта (12 апреля 2020 г.). «Один Алвитри и Кари Стефанс сливаются в одно» . Индикатор . Проверено 28 января 2023 г.

[ а ]

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

[ 47 ]

[ 48 ]

[ 49 ]

[ 50 ]

[ 51 ]

[ 52 ]

[ 53 ]

[ 54 ]

[ 55 ]

[ 56 ]

[ 57 ]

[ 58 ]

[ 59 ]

[ 60 ]

[ 61 ]

[ 62 ]

[ 63 ]

[ 64 ]

[ 65 ]

[ 66 ]

[ 67 ]

[ 68 ]

[ 69 ]

[ 70 ]

[ 71 ]

[ 72 ]

[ 73 ]

[ 74 ]

[ 75 ]

[ 76 ]

[ 77 ]

[ 78 ]

[ 79 ]

[ 80 ]

[ 81 ]

[ 82 ]

[ 83 ]

[ 84 ]

[ 85 ]

[ 86 ]

[ 87 ]

[ 88 ]

[ 89 ]

[ 90 ]

[ 91 ]

[ 92 ]

[ 93 ]

[ 94 ]

[ 95 ]

[ 96 ]

[ 97 ]

[ 98 ]

[ 99 ]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ВИАФ
Национальный	Швеция
академики	Google Академика ОРЦИД