Ассоциация предприятий биомолекулярных ресурсов

Ассоциация предприятий биомолекулярных ресурсов
Формирование	1989
Штаб-квартира	Лексингтон, Кентукки
Расположение	Соединенные Штаты ;
Членство	2500 (май 2023 г.)
Официальный язык	Английский
Президент	Кевин Кнудтсон
Веб-сайт	http://www.abrf.org/

Ассоциация предприятий по биомолекулярным ресурсам (ABRF) занимается развитием основных и исследовательских биотехнологических лабораторий посредством исследований, коммуникации и образования. ^{[ 1 ]} Членами ABRF являются более 2000 ученых, представляющих 340 различных основных лабораторий в 41 стране, в том числе в промышленности, правительстве, академических и исследовательских учреждениях.

История

В 1986 году совместно с Шестой Международной конференцией по методам анализа белковых последовательностей было проведено сателлитное совещание Исследовательского центра. ^{[ нужна ссылка ]} В следующем году образцы белков и аминокислот были отправлены на обследование в 103 основных учреждения. К 1989 году ABRF был официально организован и зарегистрирован. Ежегодное собрание Белкового общества проводилось в качестве дополнительного собрания до 1996 года, когда начались отдельные собрания. ^{[ 2 ]}

Исследовательские группы ABRF

Исследовательские группы создаются для достижения двух целей Ассоциации предприятий по биомолекулярным ресурсам. Во-первых, обеспечить механизмы самооценки и повышения процедурной и оперативной точности, точности и эффективности в ресурсных учреждениях и исследовательских лабораториях. Во-вторых, способствовать обучению персонала ресурсных учреждений и исследовательских лабораторий, пользователей, администраторов и заинтересованных членов научного сообщества. ^{[ 3 ]} Результаты исследований ABRF Research Group опубликованы в научных статьях. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Результаты исследований исследовательской группы ABRF неоднократно использовались в других исследованиях. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Группа секвенирования следующего поколения ABRF (ABRF-NGS)
технологий антител (ARG) Группа исследования
Биомедицинская исследовательская группа Omics (BORG)
секвенирования ДНК (DSRG) Группа исследований
проточной цитометрии (FCRG) Группа исследований
геномики (GVRG) Группа исследований
гликопротеинов (gPRG) Группа исследования
Исследовательская группа световой микроскопии (LMRG)
метаболомных исследований (MRG) Группа
метагеномики (MGRG) Группа исследований
Группа исследования молекулярных взаимодействий (МИРГ)
Группа исследования нуклеиновых кислот (NARG)
экспрессии белка (PERG) Группа исследования
Исследовательская группа по секвенированию белков (PSRG)
протеомики (PRG) Группа исследований
протеомной информатики (iPRG) Группа исследований
Группа исследований стандартов протеомики (sPRG)

Ресурсные технологии

Члены ABRF участвуют в широком спектре биомолекулярных технологий, которые реализуются на основных объектах:

Автоматизация: высокопроизводительный досмотр, LIMS , робототехника .
Химия белков/пептидов : анализ аминокислот, N- и C-концевое секвенирование, синтез пептидов, массивы пептидов/белков.
Биофизика : калориметрия , КД, флуоресценция , светорассеяние , ППР , ультрацентрифугирование .
Проточная цитометрия, флуоресценция, активация сортировки клеток
Экспрессия белка , идентификация и профилирование: дифференциальная флуоресценция, обычный 2-D гель-электрофорез , открытие биомаркеров заболеваний.
Экспрессия генов в реальном времени и профилирование: генные массивы, ПЦР .
Масс-спектрометрия : качественный, количественный и структурный анализ белков, углеводов , олигонуклеотидов и липидов .
Микроскопия, световая микроскопия и визуализация, конфокальная микроскопия
нуклеиновых кислот Химия : секвенирование ДНК , синтез ДНК , синтез РНК , генотипирование .
Разделения: 1- и 2-D PAGE, капиллярный электрофорез , хроматография .
Контроль качества : GLP, GMP, качество и соответствие.
Универсальный стандарт протеомики (UPS), смесь белков, используемая в качестве эталонного стандарта в протеомике, введенная вышеупомянутой sPRG. ^{[ 10 ]} Сюда входят два набора: исходный (UPS1, где все 48 белков имеют концентрацию 48 пмоль) и динамический диапазон концентраций (называемый UPS2), варьирующийся от 500 амоль до 50 пмоль. ^{[ 11 ]}
Прочее: биоинформатика , углеводов анализ рекомбинантных белков . , дифференциальный дисплей, производство

Ежегодная конференция

Ежегодная конференция Ассоциации предприятий по биомолекулярным ресурсам проводится весной в разных городах Северной Америки. Эта международная конференция используется для ознакомления участников с новыми и появляющимися биотехнологиями посредством лекций, круглых столов, презентаций исследовательских групп, стендовых сессий, семинаров и технических выставок.

ABRF 2023, 7-10 мая 2023 г., Бостон, Массачусетс
ABRF 2022, 27–30 марта 2022 г., Палм-Спрингс, Калифорния.
ABRF 2021, 7–11 марта 2021 г., виртуальное собрание в связи с COVID-19.
ABRF 2020, 29 февраля – 3 марта 2020 г., Палм-Спрингс, Калифорния
ABRF 2019, 23–26 марта, Сан-Антонио , Техас; 30 лет преодоления ограничений науки и технологий, открывая двери в будущее
ABRF 2018, 22–25 апреля, Миртл-Бич, Южная Каролина ; Премьер-конференция по основным услугам
ABRF 2017, 25–28 марта, Сан-Диего , Калифорния; Форум по развитию сегодняшних основных технологий для обеспечения инноваций завтрашнего дня
ABRF 2016, 20–23 февраля, Ft. Лодердейл , Флорида; Инновационные технологии, ускоряющие открытия
ABRF 2015, 28–31 марта, Сент-Луис , Миссури; Интеграционные технологии для развития научных ядер
ABRF 2014, 23–25 марта, Альбукерке , Нью-Мексико; Командная наука и большие данные: ядра на переднем крае
ABRF 2013, 2–5 марта, Палм-Спрингс, Калифорния; Инструменты для развития науки о конвергенции
ABRF 2012, 17–20 марта, Орландо, Флорида; Обучение на биомолекулах
ABRF 2011, 19–22 февраля, Сан-Антонио, Техас; Технологии для персонализированной медицины
ABRF 2010, 20–23 марта, Сакраменто, Калифорния; Трансляция фундаментальных исследований с достижениями в области биомолекулярных технологий
ABRF 2009, 7–10 февраля, Мемфис, Теннесси; Применение и оптимизация существующих и новых биотехнологий
ABRF 2008, 9–12 февраля, Солт-Лейк-Сити, Юта; Использование технологий в науках о жизни
ABRF 2007, 31 марта – 3 апреля, Тампа, Флорида; Создание биологической дорожной карты
ABRF 2006, 11–14 февраля, Лонг-Бич, Калифорния; Интеграция науки, инструментов и технологий с системной биологией
ABRF 2005, 5–8 февраля, Саванна, Джорджия; Биомолекулярные технологии: от открытия к гипотезе
ABRF 2004, 28 февраля – 2 марта, Портленд, Орегон; Интеграция технологий в протеомике и геномике
ABRF 2003, 10–13 февраля, Денвер, Колорадо; Перевод биологии с помощью протеомики и функциональной геномики
ABRF 2002, 9–12 марта, Остин, Техас; Биомолекулярные технологии: инструменты для открытий в области протеомики и геномики
ABRF 2001, 24–27 февраля, Сан-Диего, Калифорния; Новая биология: технология разрешения макромолекулярных связей
ABRF 2000, 19–22 февраля, Белвью, Вашингтон; От единичного к глобальному анализу биологических систем
ABRF 1999, 19–22 марта, Дарем, Северная Каролина; Биоинформатика и биомолекулярные технологии: связь геномов, протеомов и биохимии
ABRF 1998, 21–24 марта, Сан-Диего, Калифорния; От геномов к функциям: технические проблемы постгеномной эры
ABRF 1997, 9–12 февраля, Балтимор, Мэриленд; Методы интерфейса геном-протеом
ABRF 1996, 30 марта – 2 апреля, Сан-Франциско, Калифорния; Биомолекулярные методы

Премия АБРФ

Премия ABRF вручается на ежегодном собрании ABRF за выдающийся вклад в биомолекулярные технологии. Лауреаты прошлых наград (годы относятся к ежегодной конференции, на которой была вручена награда): ^{[ 12 ]}

2023 г. Кристи Г. Энке и Ричарду Йосту за разработку тройного квадрупольного масс-спектрометра и огромное влияние тройного квадруполя на широкий спектр биомедицинских исследований.
2022 Дженнифер Липпинкотт-Шварц
2021 -
2020 Джордж Чёрч за новаторские исследования в области геномного секвенирования и лидерство в области генной терапии и технологий синтетической биологии.
2019 Ричард М. Каприоли за открытие временной и пространственной обработки данных в биологических системах с помощью масс-спектрометрии.
2018 г. — Амос Байрох за разработку ресурсов сообщества, таких как база знаний UniProtKB/Swiss-Prot , PROSITE , ENZYME и neXtProt .
2017 г. Сэр Шанкар Баласубраманян и Дэвид Кленерман за изобретение метода секвенирования ДНК нового поколения, который сегодня широко известен как «секвенирование путем синтеза».
2016 Эммануэль Шарпантье и Дженнифер Дудна за разработку технологий редактирования генома CRISPR/Cas9.
2015 Джон Г. Уайт и Уильям Брэдшоу Амос за разработку конфокального лазерного сканирующего микроскопа высокого разрешения.
2014 Патрик Х. О'Фаррелл — за разработку двумерного гель-электрофореза.
2013 Леонард Герценберг и Леонора Герценберг за разработку технологии сортировки клеток, активируемой потоком (FACS).
2012 Алан Г. Маршалл за разработку масс-спектрометрии с преобразованием Фурье ионно-циклотронного резонанса (FT-ICR).
2011 Сэр Алек Джон Джеффрис : Разработка методов снятия отпечатков пальцев ДНК и ДНК. профилирования
2010 Пэт Браун : Новаторская работа в области разработки микрочипов и разнообразных применений этой технологии в генетических исследованиях.
2009 Матиас Улен
2008 Руди Эберсольд
2007 Дональд Ф. Хант
2006 Роджер Тен
2005 Стивен Фодор
2004 Эдвин Саузерн
2003 Франц Хилленкамп и Михаэль Карас
2002 Джон Фенн
2001 Чаба Хорват
2000 Лерой Худ
1999 Марвин Х. Карутерс за новаторский вклад в химический синтез ДНК и РНК.
1998 Брюс Меррифилд
1997 Ллойд М. Смит
1996 Дэвид Липман
1995 Клаус Биманн
1994 Фредерик Сингер

Журнал биомолекулярных методов

ABRF является издателем журнала биомолекулярных технологий. Журнал рецензируемый и выходит ежеквартально. ^{[ 13 ]} Основное направление журнала — публикация научных обзоров и статей, посвященных биомолекулярным ресурсам. Опубликованные отчеты Исследовательской группы включают ежегодные исследования. Также включены новости и события, а также обзор статей, посвященных методам, используемым в типичных условиях основных объектов. В настоящее время главным редактором является Рон Орландо, Университет Джорджии .

Исполнительный совет АБРФ

Кевин Кнудтсон, президент ABRF, отдел геномики, Университет Айовы
Жюстин Кигени, казначей, Медицинский центр КУ
Мари Адамс, Институт Ван Анделя
Роксана Эшворт, Университет Джонса Хопкинса
Ким Дельвенталь, Институт медицинских исследований Стоуэрса
Шридар Читтур, SUNY в Олбани
Ник Амбулос, Медицинский факультет Университета Мэриленда
Сью Вайнтрауб, Центр медицинских наук Техасского университета в Сан-Антонио
Магнус Палмблад, Медицинский центр Лейденского университета
Кен Шоппманн, исполнительный директор ABRF

Ссылки

^ «Заявление о миссии» . Ассоциация предприятий биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинала 1 апреля 2019 года . Проверено 4 марта 2020 г.
↑ Крэбб, JW: «ABRF; Краткая история» ABRF News, июнь 1995 г.
^ «Руководство исследовательской группы» (PDF) . Ассоциация предприятий биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинала (PDF) 31 января 2012 года . Проверено 15 апреля 2009 г.
^ Чой, Мина; Эрен-Догу, Зейнеп Ф.; Коланджело, Кристофер; Коттрелл, Джон; Хупманн, Майкл Р.; Капп, Юджин А.; Ким, Сангте; Лам, Генри; Нойберт, Томас А.; Палмблад, Магнус; Финни, Бретт С.; Вайнтрауб, Сьюзен Т.; Маклин, Брендан; Витек, Ольга (2017). «Исследование группы ABRF по протеомной информатике (iPRG) 2015: обнаружение дифференциально содержащихся белков в экспериментах по количественной ЖХ-МС/МС без меток». Журнал исследований протеома . 16 (2): 945–957. doi : 10.1021/acs.jproteome.6b00881 . ПМИД 27990823 . S2CID 4578078 .
^ Чалкли, Роберт Дж.; Бандейра, Нуно; Чемберс, Мэтью С.; Клаузер, Карл Р.; Коттрелл, Джон С.; Дойч, Эрик В.; Капп, Юджин А.; Лам, Генри Х.Н.; Макдональд, В. Хейс; Нойберт, Томас А.; Сунь, Жуй-Сян (2014). «Исследовательская группа по протеомной информатике (iPRG)_2012: исследование по обнаружению модифицированных пептидов в сложной смеси» . Молекулярная и клеточная протеомика . 13 (1): 360–371. дои : 10.1074/mcp.M113.032813 . ПМЦ 3879627 . ПМИД 24187338 . Проверено 5 ноября 2018 г.
^ Беннетт, Кейрин Л.; Ван, Ся; Быстром, Кори Э.; Чемберс, Мэтью С.; Андахт, Трейси М.; Данготт, Ларри Дж.; Элорца, Феликс; Лешик, Джон; Молина, Хенрик; Мориц, Роберт Л.; Финни, Бретт С.; Томпсон, Дж. Уилл; Бангер, Морин К.; Табб, Дэвид Л. (2015). «Исследование группы протеомных исследований ABRF 2012/2013: оценка продольной внутрилабораторной изменчивости в рутинных пептидных жидкостных хроматографических анализах с тандемной масс-спектрометрией» . Молекулярная и клеточная протеомика . 14 (12): 3299–3309. дои : 10.1074/mcp.O115.051888 . ПМЦ 4762617 . ПМИД 26435129 . Проверено 5 ноября 2018 г.
^ Нгуен, Трунг Хай; Рустенбург, Ариен С.; Криммер, Стефан Г.; Чжан, Хэси; Кларк, Джон Д.; Новик, Пол А.; Брэнсон, Ким; Панде, Виджай С.; Чодера, Джон Д.; Минь, Дэвид Д.Л. (2018). «Байесовский анализ изотермической титровальной калориметрии для термодинамики связывания» . ПЛОС ОДИН . 13 (9): e0203224. Бибкод : 2018PLoSO..1303224N . дои : 10.1371/journal.pone.0203224 . ПМК 6136728 . ПМИД 30212471 .
^ Мэтью; Эдфорс, Фредрик; Перес-Ривероль, Яссет; Пейн, Сэмюэл Х.; Хупманн, Майкл Р.; Палмблад, Магнус; Форсстрём, Бьёрн; Келл, Лукас (2018). «Стандарт белка, который имитирует гомологию для характеристики алгоритмов вывода белков» . Журнал исследований протеома . 17 (5): 1879–1886. doi : 10.1021/acs.jproteome.7b00899 . ПМК 6474350 . ПМИД 29631402 .
^ У, Гуаньин; Ван, Сян; Сюй, Баохуа (2018). «Новая оценка частоты ложных открытий на уровне белка» . БМК Геномика . 19 (Приложение 6): 567. doi : 10.1186/s12864-018-4923-3 . ПМК 6101079 . ПМИД 30367581 .
^ «Универсальные стандарты протеомики – подтверждение будущего протеомики» . Проверено 22 августа 2016 г. .
^ «Протеомные стандарты UPS1 и UP2» . Проверено 22 августа 2016 г. .
^ «Премия АБРФ» . Ассоциация предприятий биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинала 30 января 2012 года . Проверено 22 августа 2016 г. .
^ «JBT: Журнал биомолекулярных методов» . Ассоциация предприятий биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинала 10 сентября 2022 года . Проверено 16 октября 2022 г.

Внешние ссылки

[1] «Заявление о миссии» . Ассоциация предприятий биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинала 1 апреля 2019 года . Проверено 4 марта 2020 г.

[2] Крэбб, JW: «ABRF; Краткая история» ABRF News, июнь 1995 г.

[3] «Руководство исследовательской группы» (PDF) . Ассоциация предприятий биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинала (PDF) 31 января 2012 года . Проверено 15 апреля 2009 г.

[4] Чой, Мина; Эрен-Догу, Зейнеп Ф.; Коланджело, Кристофер; Коттрелл, Джон; Хупманн, Майкл Р.; Капп, Юджин А.; Ким, Сангте; Лам, Генри; Нойберт, Томас А.; Палмблад, Магнус; Финни, Бретт С.; Вайнтрауб, Сьюзен Т.; Маклин, Брендан; Витек, Ольга (2017). «Исследование группы ABRF по протеомной информатике (iPRG) 2015: обнаружение дифференциально содержащихся белков в экспериментах по количественной ЖХ-МС/МС без меток». Журнал исследований протеома . 16 (2): 945–957. doi : 10.1021/acs.jproteome.6b00881 . ПМИД 27990823 . S2CID 4578078 .

[5] Чалкли, Роберт Дж.; Бандейра, Нуно; Чемберс, Мэтью С.; Клаузер, Карл Р.; Коттрелл, Джон С.; Дойч, Эрик В.; Капп, Юджин А.; Лам, Генри Х.Н.; Макдональд, В. Хейс; Нойберт, Томас А.; Сунь, Жуй-Сян (2014). «Исследовательская группа по протеомной информатике (iPRG)_2012: исследование по обнаружению модифицированных пептидов в сложной смеси» . Молекулярная и клеточная протеомика . 13 (1): 360–371. дои : 10.1074/mcp.M113.032813 . ПМЦ 3879627 . ПМИД 24187338 . Проверено 5 ноября 2018 г.

[6] Беннетт, Кейрин Л.; Ван, Ся; Быстром, Кори Э.; Чемберс, Мэтью С.; Андахт, Трейси М.; Данготт, Ларри Дж.; Элорца, Феликс; Лешик, Джон; Молина, Хенрик; Мориц, Роберт Л.; Финни, Бретт С.; Томпсон, Дж. Уилл; Бангер, Морин К.; Табб, Дэвид Л. (2015). «Исследование группы протеомных исследований ABRF 2012/2013: оценка продольной внутрилабораторной изменчивости в рутинных пептидных жидкостных хроматографических анализах с тандемной масс-спектрометрией» . Молекулярная и клеточная протеомика . 14 (12): 3299–3309. дои : 10.1074/mcp.O115.051888 . ПМЦ 4762617 . ПМИД 26435129 . Проверено 5 ноября 2018 г.

[7] Нгуен, Трунг Хай; Рустенбург, Ариен С.; Криммер, Стефан Г.; Чжан, Хэси; Кларк, Джон Д.; Новик, Пол А.; Брэнсон, Ким; Панде, Виджай С.; Чодера, Джон Д.; Минь, Дэвид Д.Л. (2018). «Байесовский анализ изотермической титровальной калориметрии для термодинамики связывания» . ПЛОС ОДИН . 13 (9): e0203224. Бибкод : 2018PLoSO..1303224N . дои : 10.1371/journal.pone.0203224 . ПМК 6136728 . ПМИД 30212471 .

[8] Мэтью; Эдфорс, Фредрик; Перес-Ривероль, Яссет; Пейн, Сэмюэл Х.; Хупманн, Майкл Р.; Палмблад, Магнус; Форсстрём, Бьёрн; Келл, Лукас (2018). «Стандарт белка, который имитирует гомологию для характеристики алгоритмов вывода белков» . Журнал исследований протеома . 17 (5): 1879–1886. doi : 10.1021/acs.jproteome.7b00899 . ПМК 6474350 . ПМИД 29631402 .

[9] У, Гуаньин; Ван, Сян; Сюй, Баохуа (2018). «Новая оценка частоты ложных открытий на уровне белка» . БМК Геномика . 19 (Приложение 6): 567. doi : 10.1186/s12864-018-4923-3 . ПМК 6101079 . ПМИД 30367581 .

[10] «Универсальные стандарты протеомики – подтверждение будущего протеомики» . Проверено 22 августа 2016 г. .

[11] «Протеомные стандарты UPS1 и UP2» . Проверено 22 августа 2016 г. .

[12] «Премия АБРФ» . Ассоциация предприятий биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинала 30 января 2012 года . Проверено 22 августа 2016 г. .

[13] «JBT: Журнал биомолекулярных методов» . Ассоциация предприятий биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинала 10 сентября 2022 года . Проверено 16 октября 2022 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ВИАФ
Национальный	Израиль Чешская Республика