Митохондриальный код дрожжей
Митохондриальный код дрожжей (таблица перевода 3 ) представляет собой генетический код , используемый митохондриальным геномом дрожжей, особенно Saccharomyces cerevisiae , Candida glabrata , Hansenula saturnus и Kluyveromyces thermotolerans . [ 1 ]
Код
[ редактировать ]AAs = FFLLSSSSYY**CCWWTTTTPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSRRVVVVAAAADDEEGGGGStarts = ---M---------------M---------------M---------------M------------Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGBase2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGBase3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG
Основания: аденин (А), цитозин (С), гуанин (G) и тимин (Т) или урацил (U).
Аминокислоты: аланин (Ala, A), аргинин (Arg, R), аспарагин (Asn, N), аспарагиновая кислота (Asp, D), цистеин (Cys, C), глутаминовая кислота (Glu, E), глутамин (Gln). , Q), глицин (Gly, G), гистидин (His, H), изолейцин (Ile, I), лейцин (Leu, L), лизин (Lys, K), метионин (Met, M), фенилаланин (Phe, F), пролин (Pro, P), серин (Ser, S), треонин (Thr, T), триптофан (Trp, W), тирозин ( Тир, Ю), Валин (Вал, В).
Отличия от стандартного кода
[ редактировать ]| Кодоны ДНК | Кодоны РНК | Этот код (3) | Стандартный код (1) | |
|---|---|---|---|---|
| МИНУТЫ | НЕ | С (М) | Кожа (Я) | |
| СТТ | КУУ | Тр (Т) | Лео (L) | |
CTC |
CUC |
Thr (T) |
Leu (L)
| |
CTA |
CUA |
Thr (T) |
Leu (L)
| |
CTG |
CUG |
Thr (T) |
Leu (L)
| |
TGA |
UGA |
Trp (W) |
STOP = Ter (*)
| |
CGA |
CGA |
Absent |
Arg (R)
| |
CGC |
CGC |
Absent |
Arg (R)
|
- Остальные кодоны CGN у Saccharomyces cerevisiae встречаются редко. [ 2 ] и отсутствует у Candida glabrata .
- Кодон AUA часто встречается в гене var1, кодирующем одиночный митохондриальный рибосомальный белок , но редко встречается в генах, кодирующих ферменты.
- Кодирующие назначения AUA (Met или Ile) и CUU (возможно, Leu, а не Thr) у Hansenula saturnus неясны .
- неясно Отнесение кодирования Thr к CUN у Kluyveromyces thermotolerans .
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе . [ 3 ]
- ^ Кларк-Уокер, Грузия; Вейллер, Г.Ф. (1994). «Структура небольшой митохондриальной ДНК Kluyveromyces thermotolerans , вероятно, отражает порядок наследственных генов грибов». Журнал молекулярной эволюции . 38 (6): 593–601. Бибкод : 1994JMolE..38..593C . дои : 10.1007/bf00175879 . ПМИД 8083884 . S2CID 10510397 .
- ^ Сьюзен Г. Бониц, Роберта Берлани, Глория Коруцци, Мэй Ли, Джузеппе Мачино, Франсиско Г. Нобрега, Марина П. Нобрега, Арбара Э. Таленфельд и Александр Цаголов (июнь 1980 г.). «Правила распознавания кодонов в митохондриях дрожжей» (PDF) . Учеб. Натл. акад. наук. США . 77 (6): 3167–3170. Бибкод : 1980PNAS...77.3167B . дои : 10.1073/pnas.77.6.3167 . ПМК 349575 . ПМИД 6997870 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Эльжановский А., Остелл Дж., Лейпе Д., Суссов В. «Генетические коды» . Браузер таксономии . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), Национальная медицинская библиотека США . Проверено 30 апреля 2015 г.