Jump to content

Джулиан Паркхилл

Джулиан Паркхилл
Джулиан Паркхилл в 2015 году
Рожденный
Джулиан Паркхилл

( 1964-09-23 ) 23 сентября 1964 г. (59 лет) [4]
Образование Средняя школа Вестклиффа для мальчиков
Альма-матер
Известный АРТЕМИДА [5] [6] [7]
Научная карьера
Поля
Учреждения
Диссертация Регуляция транскрипции оперона устойчивости к ртути Tn501   (1991)
Веб-сайт www .вет .камера .uk /персонал /профессор-Джулиан-Пархилл-FRS-Fmedsci

Джулиан Паркхилл (1964 г.р.) [4] ФРС ФМедНауки [8] [9] профессор бактериальной эволюции кафедры ветеринарной медицины. [10] в Кембриджском университете . Ранее он занимал должность руководителя отдела геномики патогенов в Институте Уэлкома Сэнгера . [11] [12] [13] [14] [1] [15] [16]

Образование [ править ]

Паркхилл получил образование в средней школе для мальчиков Вестклиффа . [4] Университет Бирмингема и Бристольский университет , где ему была присуждена степень доктора философии в 1991 году. [17] исследование регуляции транскрипции оперона ртутной устойчивости . за [2] [3] [18]

и исследования Карьера

Паркхилл использует высокопроизводительное секвенирование и фенотипирование для изучения патогенов , того, как они влияют на вирулентность и передачу, а также что они говорят нам об эволюции патогенности разнообразия и изменчивости и взаимодействии хозяин-патоген . [19] [20] [21] [22] [23] [24] [25] [26] [27] [28] [29] [30] [31] [ чрезмерное цитирование ] Исследования в лаборатории Паркилла финансировались Wellcome Trust , Исследовательским советом по биотехнологиям и биологическим наукам (BBSRC). [32] и Совет медицинских исследований (MRC) . [33]

Награды и почести [ править ]

Паркхилл был избран членом Академии медицинских наук (FMedSci) в 2009 году. [9] и член Американской академии микробиологии (FAAM) в 2012 году.

Доктор Джулиан Паркхилл в настоящее время является руководителем отдела геномики патогенов в Институте Wellcome Trust Sanger. За последнее десятилетие или около того его группа проанализировала геномы многих бактерий, имеющих фундаментальное значение для здоровья человека, включая возбудителей туберкулеза , чумы , брюшного тифа . , коклюша , проказы, ботулизма , дифтерии и менингита , а также внутрибольничных инфекций патогены, такие как Clostridium difficile и MRSA , и патогены пищевого происхождения, такие как Campylobacter jejuni , Salmonella Typhimurium и Yersinia enterocolitica . Их текущие исследования сосредоточены на применении методов высокопроизводительного секвенирования в микробиологии. В настоящее время они секвенируют очень большие коллекции бактериальных изолятов с широким географическим и временным охватом, связывая геномные вариации с эпидемиологией , приобретением устойчивости к лекарствам и недавней эволюцией. Кроме того, они работают с местными и национальными группами клинической микробиологии над созданием основы для передачи секвенирования микробов в клинические и клинические лаборатории. расследования общественного здравоохранения . Они также применяют технологии секвенирования для фенотипических исследований, в частности, мутагенеза насыщенных транспозонов , транскриптомики и высокопроизводительного фенотипирования. Они широко сотрудничают, особенно с группами в развивающихся странах, где инфекционные заболевания являются эндемичными . [34]

Паркхилл был избран членом Королевского общества (FRS) в 2014 году . [8] в его свидетельстве о выборах говорится:

Джулиан Паркхилл сыграл важную роль в определении эталонных последовательностей геномов многих ключевых бактериальных патогенов , включая Mycobacterium Tuberculosis , Yersinia pestis и Salmonella typhi . Помимо предоставления полных каталогов арсенала генов, переносимых каждой бактерией, работа Паркхилла привела к важному пониманию того, как эволюционируют бактериальные геномы, и к влиянию вариаций внутри предположительно однородных бактериальных популяций. Параллельно были разработаны и свободно распространяются по всему миру инструменты для понимания и визуализации геномных данных. Более десяти лет Паркхилл был в авангарде бактериальной геномики, совсем недавно он использовал новые технологии высокопроизводительного секвенирования для изучения эволюции и передачи бактериальных патогенов и обеспечения клинического использования этих подходов. [8]

Ссылки [ править ]

  1. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Публикации Джулиана Паркхилла, проиндексированные Google Scholar Отредактируйте это в Викиданных
  2. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Паркхилл, Дж; Браун, Нидерланды (1990). «Сайт-специфичные вставки и делеционные мутанты в области промотора-оператора mer Tn501; спейсер из девятнадцати пар оснований необходим для нормальной индукции промотора MerR» . Исследования нуклеиновых кислот . 18 (17): 5157–62. дои : 10.1093/нар/18.17.5157 . ПМЦ   332137 . ПМИД   2169606 .
  3. Перейти обратно: Перейти обратно: а б Браун, Нидерланды; Камакарис, Дж; Ли, Британская Колумбия; Уильямс, Т; Морби, AP; Паркхилл, Дж; Руш, Д.А. (1991). «Бактериальная устойчивость к ртути и меди». Журнал клеточной биохимии . 46 (2): 106–14. дои : 10.1002/jcb.240460204 . ПМИД   1717500 . S2CID   40277026 .
  4. Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д Анон (2015). «Паркхилл, профессор Джулиан» . Кто есть кто (онлайн- изд. Oxford University Press ). А&С Черный. дои : 10.1093/ww/9780199540884.013.U281946 . (Требуется подписка или членство в публичной библиотеке Великобритании .)
  5. ^ Резерфорд, К.; Паркхилл, Дж.; Крук, Дж.; Хорснелл, Т.; Райс, П.; Раджандрим, Массачусетс; Баррелл, Б. (2000). «Артемида: Визуализация последовательности и аннотация» . Биоинформатика . 16 (10): 944–5. дои : 10.1093/биоинформатика/16.10.944 . ПМИД   11120685 .
  6. ^ Карвер, Т; Берриман, М; Тайви, А; Патель, К; Бёме, У; Баррелл, Б.Г.; Паркхилл, Дж; Раджандрим, Массачусетс (2008). «Артемида и ACT: просмотр, аннотирование и сравнение последовательностей, хранящихся в реляционной базе данных» . Биоинформатика . 24 (23): 2672–6. doi : 10.1093/биоинформатика/btn529 . ПМК   2606163 . ПМИД   18845581 .
  7. ^ Карвер, Т.; Харрис, СР; Берриман, М.; Паркхилл, Дж.; Маккуиллан, Дж. А. (2011). «Артемида: интегрированная платформа для визуализации и анализа высокопроизводительных экспериментальных данных на основе последовательностей» . Биоинформатика . 28 (4): 464–469. doi : 10.1093/биоинформатика/btr703 . ПМЦ   3278759 . ПМИД   22199388 .
  8. Перейти обратно: Перейти обратно: а б с Анон (2014). «Профессор Джулиан Паркхилл FMedSci FRS» . Лондон: Королевское общество . Архивировано из оригинала 17 ноября 2015 года. Одно или несколько предыдущих предложений включают текст с веб-сайта royalsociety.org, где:

    «Весь текст, опубликованный под заголовком «Биография» на страницах профиля стипендиата, доступен по международной лицензии Creative Commons Attribution 4.0 ». -- «Правила, условия и политика Королевского общества» . Архивировано из оригинала 25 сентября 2015 года . Проверено 9 марта 2016 г. {{cite web}}: CS1 maint: bot: исходный статус URL неизвестен ( ссылка )

  9. Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Сотрудник | Академии медицинских наук» . Acmedsci.ac.uk . Архивировано из оригинала 18 ноября 2016 года . Проверено 18 ноября 2016 г.
  10. ^ «Профессор Джулиан Паркхилл» . www.vet.cam.ac.uk. ​4 июня 2021 г. Проверено 10 июня 2023 г.
  11. ^ «Профессор Джулиан Паркхилл, FRS, FMedSci, старший руководитель группы» . Архивировано из оригинала 15 марта 2016 года.
  12. ^ Паркхилл, Дж. (2013). «Что нам когда-либо дало высокопроизводительное секвенирование?». Обзоры природы Микробиология . 11 (10): 664–5. дои : 10.1038/nrmicro3112 . ПМИД   23979431 . S2CID   28613490 .
  13. ^ Публикации Джулиана Паркхилла, индексированные Microsoft Academic
  14. ^ Джулиан Паркхилл на DBLP библиографическом сервере Отредактируйте это в Викиданных
  15. ^ 57212237926 Публикации Джулиана Паркхилла, индексированные в библиографической базе данных Scopus . (требуется подписка)
  16. науку, лежащую в основе генома . Профессор Джулиан Паркхилл посещает коллекцию Wellcome в Лондоне, чтобы раскрыть на YouTube
  17. ^ Паркхилл, Джулиан (1991). Регуляция транскрипции ртутного оперона Tn501 (кандидатская диссертация). Бристольский университет. OCLC   931563576 . ПроКвест   301408708 . (требуется подписка)
  18. ^ Холден, MTG; Фейл, Э.; Линдси, Дж.; Пикок, С.; День, Н.; Энрайт, М.; Фостер, Т.; Мур, К.; Херст, Л .; Аткин, Р.; Бэррон, А.; Бэйсон, Н.; Бентли, Южная Дакота; Чиллингворт, К.; Чиллингворт, Т.; Черчер, К.; Кларк, Л.; Кортон, К.; Кронин, А.; Доггетт, Дж.; Дауд, Л.; Фелтуэлл, Т.; Ханс, З.; Харрис, Б.; Хаузер, Х.; Холройд, С.; Ягельс, К.; Джеймс, К.Д.; Леннард, Н.; Линия, А. (2004). «Полные геномы двух клинических штаммов золотистого стафилококка : доказательства быстрой эволюции вирулентности и лекарственной устойчивости» . Труды Национальной академии наук . 101 (26): 9786–9791. Бибкод : 2004PNAS..101.9786H . дои : 10.1073/pnas.0402521101 . ПМК   470752 . ПМИД   15213324 . Значок открытого доступа
  19. ^ Паркхилл, Дж .; Бирни, Э ; Керси, П. (2010). «Геномная информационная инфраструктура после потопа» . Геномная биология . 11 (7): 402. doi : 10.1186/gb-2010-11-7-402 . ПМЦ   2926780 . ПМИД   20670392 .
  20. ^ Коул, ST; Брош, Р.; Паркхилл, Дж.; Гарнье, Т.; Черчер, К.; Харрис, Д.; Гордон, СВ; Эйглмайер, К.; Газ, С.; Барри, CE; Текая, Ф.; Бэдкок, К.; Бэшам, Д.; Браун, Д.; Чиллингворт, Т.; Коннор, Р.; Дэвис, Р.; Девлин, К.; Фелтуэлл, Т.; Джентльс, С.; Хэмлин, Н.; Холройд, С.; Хорнсби, Т.; Ягельс, К.; Крог, А.; Маклин, Дж.; Мул, С.; Мерфи, Л.; Оливер, К.; и др. (1998). «Расшифровка биологии микобактерии туберкулеза по полной последовательности генома» . Природа . 393 (6685): 537–44. Бибкод : 1998Natur.393..537C . дои : 10.1038/31159 . ПМИД   9634230 .
  21. ^ Бентли, Южная Дакота; Чейтер, К.Ф.; Серденьо-Таррага, А.-М.; Чаллис, GL; Томсон, Северная Каролина; Джеймс, К.Д.; Харрис, Делавэр; Перепел, Массачусетс; Кизер, Х.; Харпер, Д.; Бейтман, А.; Браун, С.; Чандра, Г.; Чен, CW; Коллинз, М.; Кронин, А.; Фрейзер, А.; Гобл, А.; Идальго, Дж.; Хорнсби, Т.; Ховарт, С.; Хуан, Ч.-Х.; Кизер, Т.; Ларк, Л.; Мерфи, Л.; Оливер, К.; О'Нил, С.; Раббинович, Э.; Раджандрим, М.-А.; и др. (2002). «Полная последовательность генома модельного актиномицета Streptomyces coelicolor A3 (2)» . Природа . 417 (6885): 141–7. Бибкод : 2002Natur.417..141B . дои : 10.1038/417141a . ПМИД   12000953 . S2CID   4430218 .
  22. ^ Цинь, Дж.; Ли, Р.; Раес, Дж.; Арумугам, М.; Бургдорф, Канзас; Маничан, К.; Нильсен, Т.; Понс, Н.; Левенес, Ф.; Ямада, Т.; Менде, ДР; Ли, Дж.; Сюй, Дж.; Ли, С.; Ли, Д.; Цао, Дж.; Ван, Б.; Лян, Х.; Чжэн, Х.; Се, Ю.; Тэп, Дж.; Лепаж, П.; Берталан, М.; Батто, Дж. М.; Хансен, Т.; Ле Паслье, Д.; Линнеберг, А.; Нильсен, HBR; Пеллетье, Э.; Рено, П. (2010). «Каталог генов микробов кишечника человека, созданный с помощью метагеномного секвенирования» . Природа . 464 (7285): 59–65. Бибкод : 2010Natur.464...59. . дои : 10.1038/nature08821 . ПМЦ   3779803 . ПМИД   20203603 .
  23. ^ Паркхилл, Дж.; Рен, BW; Мунгалл, К.; Кетли, Дж. М.; Черчер, К.; Бэшам, Д.; Чиллингворт, Т.; Дэвис, РМ; Фелтуэлл, Т.; Холройд, С.; Ягельс, К.; Карлышев А.В.; Мул, С.; Паллен, MJ; Пенн, штат Вашингтон; Перепел, Массачусетс; Раджандрим, Массачусетс; Резерфорд, КМ; Ван Влит, AHM; Уайтхед, С.; Баррелл, Б.Г. (2000). «Последовательность генома пищевого патогена Campylobacter jejuni обнаруживает гипервариабельные последовательности» . Природа . 403 (6770): 665–8. Бибкод : 2000Natur.403..665P . дои : 10.1038/35001088 . ПМИД   10688204 .
  24. ^ Коул, ST; Эйглмайер, К.; Паркхилл, Дж.; Джеймс, К.Д.; Томсон, Северная Каролина; Уилер, PR; Оноре, Н.; Гарнье, Т.; Черчер, К.; Харрис, Д.; Мунгалл, К.; Бэшам, Д.; Браун, Д.; Чиллингворт, Т.; Коннор, Р.; Дэвис, РМ; Девлин, К.; Дютуа, С.; Фелтуэлл, Т.; Фрейзер, А.; Хэмлин, Н.; Холройд, С.; Хорнсби, Т.; Ягельс, К.; Лакруа, К.; Маклин, Дж.; Мул, С.; Мерфи, Л.; Оливер, К.; Перепел, Массачусетс (2001). «Массовый распад генов бациллы проказы». Природа . 409 (6823): 1007–1011. Бибкод : 2001Natur.409.1007C . дои : 10.1038/35059006 . ПМИД   11234002 . S2CID   4307207 .
  25. ^ Паркхилл, Дж .; Рен, BW; Томсон, Северная Каролина; Титболл, RW; Холден, MTG; Прентис, МБ; Себайхия, М.; Джеймс, К.Д.; Черчер, К.; Мунгалл, КЛ; Бейкер, С.; Бэшам, Д.; Бентли, Южная Дакота; Брукс, К.; Серденьо-Таррага, AM; Чиллингворт, Т.; Кронин, А.; Дэвис, РМ; Дэвис, П.; Дуган, Г.; Фелтуэлл, Т.; Хэмлин, Н.; Холройд, С.; Ягельс, К.; Карлышев А.В.; Кожа, С.; Мул, С.; Ойстон, PCF; Перепел, М.; и др. (2001). «Последовательность генома Yersinia pestis , возбудителя чумы» . Природа . 413 (6855): 523–7. Бибкод : 2001Natur.413..523P . дои : 10.1038/35097083 . ПМИД   11586360 .
  26. ^ Паркхилл, Дж .; Дуган, Г .; Джеймс, К.Д.; Томсон, Северная Каролина; Пикард, Д.; Уэйн, Дж.; Черчер, К.; Мунгалл, КЛ; Бентли, Южная Дакота; Холден, MTG; Себайхия, М.; Бейкер, С.; Бэшам, Д.; Брукс, К.; Чиллингворт, Т.; Коннертон, П.; Кронин, А.; Дэвис, П.; Дэвис, РМ; Дауд, Л.; Уайт, Н.; Фаррар, Дж.; Фелтуэлл, Т.; Хэмлин, Н.; Хак, А.; Хиен, ТТ; Холройд, С.; Ягельс, К.; Крог, А.; и др. (2001). «Полная последовательность генома серовара Salmonella enterica Typhi CT18 с множественной лекарственной устойчивостью» . Природа . 413 (6858): 848–52. Бибкод : 2001Natur.413..848P . дои : 10.1038/35101607 . ПМИД   11677608 .
  27. ^ Паркхилл, Дж .; Ахтман, М .; Джеймс, К.Д.; Бентли, Южная Дакота; Черчер, К.; Клее, СР; Морелли, Г.; Бэшам, Д.; Браун, Д.; Чиллингворт, Т.; Дэвис, РМ; Дэвис, П.; Девлин, К.; Фелтуэлл, Т.; Хэмлин, Н.; Холройд, С.; Ягельс, К.; Кожа, С.; Мул, С.; Мунгалл, К.; Перепел, Массачусетс; Раджандрим, М.-А.; Резерфорд, КМ; Симмондс, М.; Скелтон, Дж.; Уайтхед, С.; Спратт, Б.Г.; Баррелл, Б.Г. (2000). «Полная последовательность ДНК серогруппы штамма Neisseria meningitidis Z2491». Природа . 404 (6777): 502–6. Бибкод : 2000Natur.404..502P . дои : 10.1038/35006655 . ПМИД   10761919 . S2CID   4430718 .
  28. ^ Паркхилл, Дж.; Рен, BW (2011). «Бактериальная эпидемиология и биология – уроки секвенирования генома» . Геномная биология . 12 (10): 230. doi : 10.1186/gb-2011-12-10-230 . ПМЦ   3333767 . ПМИД   22027015 .
  29. ^ Гарнье, Т.; Эйглмайер, К.; Камю, Ж.-К.; Медина, Н.; Мансур, Х.; Прайор, М.; Дютуа, С.; Грондин, С.; Лакруа, К.; Монсемпе, К.; Саймон, С.; Харрис, Б.; Аткин, Р.; Доггетт, Дж.; Мэйс, Р.; Китинг, Л.; Уилер, PR; Паркхилл, Дж.; Баррелл, Б.Г.; Коул, ST; Гордон, СВ; Хьюинсон, Р.Г. (2003). «Полная последовательность генома Mycobacterium bovis » . Труды Национальной академии наук . 100 (13): 7877–82. Бибкод : 2003PNAS..100.7877G . дои : 10.1073/pnas.1130426100 . ПМК   164681 . ПМИД   12788972 .
  30. ^ Паркхилл, Дж .; Себайхия, М.; Престон, А.; Мерфи, LD; Томсон, Н.; Харрис, Делавэр; Холден, MTG; Черчер, CM; Бентли, Южная Дакота; Мунгалл, КЛ; Серденьо-Таррага, AM; Темпл, Л.; Джеймс, К.; Харрис, Б.; Перепел, Массачусетс; Ахтман, М .; Аткин, Р.; Бейкер, С.; Бэшам, Д.; Бэйсон, Н.; Черевач И.; Чиллингворт, Т.; Коллинз, М.; Кронин, А.; Дэвис, П.; Доггетт, Дж.; Фелтуэлл, Т.; Гобл, А.; Хэмлин, Н.; и др. (2003). «Сравнительный анализ последовательностей генома Bordetella pertussis , Bordetella parapertussis и Bordetella bronchiseptica » . Природная генетика . 35 (1): 32–40. дои : 10.1038/ng1227 . ПМИД   12910271 .
  31. ^ Филд, Д.; Гаррити, Дж.; Грей, Т.; Моррисон, Н.; Селенгут, Дж.; Стерк, П.; Татусова Т.; Томсон, Н.; Аллен, MJ; Ангиуоли, СВ; Эшбернер, М.; Аксельрод, Н.; Балдауф, С.; Баллард, С.; Бур, Дж.; Кокрейн, Г.; Коул, Дж.; Давиндт, П.; Де Вос, П.; Депамфилис, К.; Эдвардс, Р.; Фарук, Н.; Фельдман, Р.; Гилберт, Дж.; Гилна, П.; Глекнер, Ф.О.; Гольдштейн, П.; Гуральник, Р.; Хафт, Д.; и др. (2008). «Минимальная информация о спецификации последовательности генома (MIGS)» . Природная биотехнология . 26 (5): 541–7. дои : 10.1038/nbt1360 . ПМК   2409278 . ПМИД   18464787 .
  32. ^ Анон (2014). «Гранты, предоставленные Джулиану Паркхиллу от BBSRC» . ББСРК. Архивировано из оригинала 4 марта 2016 года.
  33. ^ Анон (2014). «Гранты правительства Великобритании предоставлены Джулиану Пархиллу» . Суиндон: Исследовательские советы Великобритании . Архивировано из оригинала 21 апреля 2015 года.
  34. ^ «Джулиан Паркхилл» . Академия.asm.org . Архивировано из оригинала 16 февраля 2016 года . Проверено 18 ноября 2016 г.
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 8dbb2727d0e23b172a6082d6aa72fbda__1710034980
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/8d/da/8dbb2727d0e23b172a6082d6aa72fbda.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Julian Parkhill - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)