ЦБ РФ1
| ЦБ РФ1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | CBR1 , CBR, SDR21C1, карбонилредуктаза 1, PG-9-KR | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 114830 ; МГИ : 88284 ; Гомологен : 37524 ; GeneCards : CBR1 ; OMA : CBR1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Номер ЕС | 1.1.1.197 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Карбонилредуктаза 1 , также известная как CBR1 , представляет собой фермент , который у человека кодируется CBR1 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству короткоцепочечных дегидрогеназ/редуктаз (SDR) , которые функционируют как НАДФН -зависимые оксидоредуктазы, обладающие широкой специфичностью к карбонильным соединениям, таким как хиноны , простагландины и различные ксенобиотики . Для этого гена были обнаружены альтернативно сплайсированные варианты транскрипта. [ 5 ]
Функция
[ редактировать ]Карбонилредуктаза — одна из нескольких мономерных НАДФН -зависимых оксидоредуктаз, обладающих широкой специфичностью к карбонильным соединениям. Этот фермент широко распространен в тканях человека. Другой ген карбонилредуктазы, CBR3 , расположен рядом с этим геном на хромосоме 21q22.12. [ 5 ] CBR1 метаболизирует многие токсичные хиноны из окружающей среды и фармакологически важные субстраты, такие как противораковый доксорубицин . [ 8 ] Несколько исследований показали, что CBR1 играет защитную роль при окислительном стрессе , нейродегенерации и апоптозе . [ 9 ] Кроме того, CBR1 инактивирует липидные альдегиды во время окислительного стресса в клетках. Следовательно, CBR1 может играть полезную роль в защите клеток от повреждения, вызванного окислительным стрессом. [ 10 ]
Полиморфизмы
[ редактировать ]два несинонимичных полиморфизма CBR1 На сегодняшний день идентифицированы . Полиморфизм CBR1 V88I кодирует замену валина на изолейцин в положении 88 аминокислотной цепи. Исследования in vitro с рекомбинантными белками показывают, что изоформа CBR1 V88 имеет более высокий Vmax по отношению к субстратам менадиону (витамин К 3 ) и даунорубицину . [ 11 ] Недавние исследования цитозолей печени человека показали, что нетранслируемый полиморфизм в области 3'UTR гена CBR1 (rs9024) [ 12 ] связано с более высокими уровнями кардиотоксичного метаболита доксорубицинола. [ 13 ]
Структура
[ редактировать ]Ген
[ редактировать ]Ген CBR1 человека включает 8 экзонов . [ 5 ]
Белок
[ редактировать ]Фермент состоит из 277 аминокислотных остатков и широко распространен в тканях человека, таких как печень , эпидермис , желудок , тонкий кишечник , почки , нейрональные клетки и гладкомышечные волокна . [ 14 ] Лучшими субстратами CBR1 являются хиноны , в том числе убихинон-1 и токоферолхинон ( витамин Е ). Убихиноны ( коэнзим Q ) являются составными частями дыхательной цепи , а токоферолхинон защищает липиды биологических мембран от перекисного окисления липидов , что указывает на то, что CBR1 может играть важную роль в качестве окислительно-восстановительного катализатора в биологических процессах. [ 15 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Сообщалось, что CBR1 связан с прогрессированием опухоли . [ 16 ] Подавление экспрессии CBR1 было связано с плохим прогнозом при раке эндометрия матки и плоскоклеточном раке шейки матки . [ 16 ] Предыдущие исследования показали, что снижение экспрессии CBR1 связано с метастазами в лимфатические узлы и плохим прогнозом при раке яичников , а индукция экспрессии CBR1 в опухолях яичников приводит к спонтанному уменьшению размера опухоли. [ 17 ]
Недавнее исследование показывает, что CBR1 ослабляет апоптоз и способствует выживанию клеток в линиях β-клеток поджелудочной железы в глюкотоксических и глюколипотоксических условиях за счет снижения образования АФК . Их данные показывают, что уровень экспрессии CBR1 и активность фермента снижаются в островках поджелудочной железы, изолированных от мышей db/db , животной модели диабета 2 типа . Эти результаты позволяют предположить, что CBR1 может играть роль в защите β-клеток поджелудочной железы от окислительного стресса в условиях глюкотоксичности или глюколипотоксичности, а его снижение экспрессии или активности может способствовать дисфункции β-клеток у мышей db/db или диабета 2 типа у человека. [ 14 ]
Кроме того, CBR1 может играть решающую роль в синтезе простагландина F 2α (PGF 2α ) в амниона фибробластах человека , а кортизол способствует превращению PGE2 в PGF 2α через опосредованную глюкокортикоидным рецептором (GR) индукцию CBR1 в амниона фибробластах человека . Этот стимулирующий эффект кортизола на экспрессию CBR1 может частично объяснить одновременное повышение уровня кортизола и PGF 2α в тканях амниона человека во время родов, и эти данные могут объяснить увеличение производства PGF 2α в плодных оболочках перед началом родов. [ 18 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что CBR1 взаимодействует с кортизолом . [ 18 ] Домен C2 , [ 19 ] и флавоноиды . [ 20 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000159228 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000051483 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Перейти обратно: а б с д «Ген Энтрез: карбонилредуктаза 1 CBR1» .
- ^ Лемье Н., Малфой Б., Форрест Г.Л. (январь 1993 г.). «Карбонилредуктаза человека (CBR), локализованная в полосе 21q22.1 с помощью флуоресцентной гибридизации in situ с высоким разрешением, демонстрирует эффекты дозировки гена в клетках с трисомией 21». Геномика . 15 (1): 169–72. дои : 10.1006/geno.1993.1024 . ПМИД 8432528 .
- ^ Перссон Б, Каллберг Ю, Брэй Дж., Бруфорд Э, Деллапорта С.Л., Фавиа А.Д., Дуарте Р.Г., Йорнвалл Х., Кавана К.Л., Кедишвили Н., Кисиела М., Мазер Э., Минднич Р., Орчард С., Пеннинг Т.М., Торнтон Дж.М., Адамски Дж. , Опперманн Ю (март 2009 г.). «Инициатива по номенклатуре SDR (короткоцепочечная дегидрогеназа/редуктаза и родственные ферменты)» . Химико-биологические взаимодействия . 178 (1–3): 94–8. Бибкод : 2009CBI...178...94P . дои : 10.1016/j.cbi.2008.10.040 . ПМЦ 2896744 . ПМИД 19027726 .
- ^ Вермут Б., Платтс К.Л., Зайдель А., Ош Ф. (апрель 1986 г.). «Карбонилредуктаза обеспечивает ферментативную основу детоксикации хинонов у человека». Биохимическая фармакология . 35 (8): 1277–82. дои : 10.1016/0006-2952(86)90271-6 . ПМИД 3083821 .
- ^ Исмаил Э., Аль-Мулла Ф., Цучида С., Суто К., Мотли П., Харрисон П.Р., Бирни Г.Д. (март 2000 г.). «Карбонилредуктаза: новая функция, модулирующая метастазирование». Исследования рака . 60 (5): 1173–6. ПМИД 10728668 .
- ^ Мазер Э (февраль 2006 г.). «Нейропротекторная роль карбонилредуктазы?». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 340 (4): 1019–22. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.12.113 . ПМИД 16406002 .
- ^ Гонсалес-Коваррубиас В., Гош Д., Лахман С.С., Пендяла Л., Бланко Дж.Г. (июнь 2007 г.). «Функциональный генетический полиморфизм карбонилредуктазы 1 человека (CBR1 V88I) влияет на каталитическую активность и аффинность связывания НАДФН» . Метаболизм и распределение лекарств . 35 (6): 973–80. дои : 10.1124/dmd.107.014779 . ПМК 2442771 . ПМИД 17344335 .
- ^ «Справочный отчет кластера SNP: rs9024» . Энтрез СНП . Национальный центр биотехнологической информации/Национальные институты здравоохранения.
- ^ Гонсалес-Коваррубиас В., Чжан Дж., Калабус Дж.Л., Реллинг М.В., Бланко Дж.Г. (февраль 2009 г.). «Фармакогенетика карбонилредуктазы человека 1 (CBR1) в печени черных и белых доноров» . Метаболизм и распределение лекарств . 37 (2): 400–7. дои : 10.1124/dmd.108.024547 . ПМК 2680526 . ПМИД 19022938 .
- ^ Перейти обратно: а б Рашид М.А., Ли С., Так Э, Ли Дж., Чой Т.Г., Ли Дж.В., Ким Дж.Б., Юн Дж.Х., Кан И, Ха Дж., Ким С.С. (ноябрь 2010 г.). «Карбонилредуктаза 1 защищает β-клетки поджелудочной железы от апоптоза, вызванного окислительным стрессом, при глюкотоксичности и гликолипотоксичности». Свободно-радикальная биология и медицина . 49 (10): 1522–33. doi : 10.1016/j.freeradbiomed.2010.08.015 . ПМИД 20728534 . (Ошибка: doi : 10.1016/j.freeradbiomed.2018.07.011 , PMID 30076001 , часы втягивания )
- ^ Вермут Б (февраль 1981 г.). «Очистка и свойства НАДФН-зависимой карбонилредуктазы из мозга человека. Связь с простагландин-9-кеторедуктазой и ксенобиотической кетонредуктазой» . Журнал биологической химии . 256 (3): 1206–13. дои : 10.1016/S0021-9258(19)69950-3 . ПМИД 7005231 .
- ^ Перейти обратно: а б Мураками А., Якабе К., Ёсидоми К., Суеока К., Навата С., Ёкояма Ю., Цучида С., Аль-Мулла Ф., Сугино Н. (1 октября 2012 г.). «Снижение экспрессии карбонилредуктазы 1 способствует злокачественному поведению за счет индукции эпителиально-мезенхимального перехода и его клиническое значение». Письма о раке . 323 (1): 69–76. дои : 10.1016/j.canlet.2012.03.035 . ПМИД 22542806 .
- ^ Осава Ю., Ёкояма Ю., Сигето Т., Футагами М., Мизунума Х. (март 2015 г.). «Снижение экспрессии карбонилредуктазы 1 способствует росту и распространению рака яичников» . Международный журнал онкологии . 46 (3): 1252–8. дои : 10.3892/ijo.2014.2810 . hdl : 10129/5591 . ПМИД 25572536 .
- ^ Перейти обратно: а б Го С., Ван В., Лю С., Мятт Л., Сунь К. (август 2014 г.). «Индукция синтеза PGF2α кортизолом посредством GR-зависимой индукции CBR1 в фибробластах амниона человека» . Эндокринология . 155 (8): 3017–24. дои : 10.1210/en.2013-1848 . ПМК 4098009 . ПМИД 24654784 .
- ^ Яги Х., Конрой П.Дж., Люнг Э.В., Лоу Р.Х., Трапани Дж.А., Воскобойник И., Уиссток Дж.К., Нортон Р.С. (16 октября 2015 г.). «Структурные основы Ca2+-опосредованного взаимодействия домена перфорина C2 с липидными мембранами» . Журнал биологической химии . 290 (42): 25213–26. дои : 10.1074/jbc.m115.668384 . ПМК 4646173 . ПМИД 26306037 .
- ^ Нельсон С.Х., Грюнебаум Х. (апрель 1971 г.). «Последующее исследование наручных рубашек». Американский журнал психиатрии . 127 (10): 1345–9. дои : 10.1176/ajp.127.10.1345 . ПМИД 5549925 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- человека CBR1 Расположение генома и страница сведений о гене CBR1 в браузере генома UCSC .
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P16152 (Карбонилредуктаза [НАДФН] 1) в PDBe-KB .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Вирт Х., Вермут Б. (декабрь 1992 г.). «Иммуногистохимическая локализация карбонилредуктазы в тканях человека» . Журнал гистохимии и цитохимии . 40 (12): 1857–63. дои : 10.1177/40.12.1453004 . ПМИД 1453004 .
- Иназу Н., Руепп Б., Вирт Х., Вермут Б. (март 1992 г.). «Карбонилредуктаза из семенников человека: очистка и сравнение с карбонилредуктазой из мозга человека и семенников крысы». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Общие предметы . 1116 (1): 50–6. дои : 10.1016/0304-4165(92)90127-г . ПМИД 1540623 .
- Форрест Г.Л., Акман С., Дорошоу Дж., Ривера Х., Каплан В.Д. (октябрь 1991 г.). «Геномная последовательность и экспрессия клонированного гена карбонилредуктазы человека с активностью даунорубицинредуктазы». Молекулярная фармакология . 40 (4): 502–7. ПМИД 1921984 .
- Форрест Г.Л., Акман С., Круцик С., Пакстон Р.Дж., Спаркс Р.С., Дорошоу Дж., Фелстед Р.Л., Гловер С.Дж., Мохандас Т., Бачур Н.Р. (апрель 1990 г.). «Индукция гена карбонилредуктазы человека, расположенного на хромосоме 21». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1048 (2–3): 149–55. дои : 10.1016/0167-4781(90)90050-c . ПМИД 2182121 .
- Вермут Б., Платтс К.Л., Зайдель А., Ош Ф. (апрель 1986 г.). «Карбонилредуктаза обеспечивает ферментативную основу детоксикации хинонов у человека». Биохимическая фармакология . 35 (8): 1277–82. дои : 10.1016/0006-2952(86)90271-6 . ПМИД 3083821 .
- Вермут Б., Борен К.М., Хайнеманн Г., фон Вартбург Дж.П., Габбай К.Х. (ноябрь 1988 г.). «Карбонилредуктаза человека. Анализ нуклеотидной последовательности кДНК и аминокислотной последовательности кодируемого белка» . Журнал биологической химии . 263 (31): 16185–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)37576-8 . ПМИД 3141401 .
- Борен К.М., фон Вартбург Дж.П., Вермут Б. (май 1987 г.). «Кинетика карбонилредуктазы мозга человека» . Биохимический журнал . 244 (1): 165–71. дои : 10.1042/bj2440165 . ПМЦ 1147968 . ПМИД 3311025 .
- Вермут Б (февраль 1981 г.). «Очистка и свойства НАДФН-зависимой карбонилредуктазы из мозга человека. Связь с простагландин-9-кеторедуктазой и ксенобиотической кетонредуктазой» . Журнал биологической химии . 256 (3): 1206–13. дои : 10.1016/S0021-9258(19)69950-3 . ПМИД 7005231 .
- Вермут Б., Мэдер-Хейнеманн Г., Эрнст Э. (март 1995 г.). «Клонирование и экспрессия карбонилредуктазы из семенников крысы». Европейский журнал биохимии . 228 (2): 473–9. дои : 10.1111/j.1432-1033.1995.tb20286.x . ПМИД 7705364 .
- Крук М., Гош Д., Стрёмберг Р., Карлквист М., Йорнвалл Х. (январь 1993 г.). «Карбоксиэтиллизин в белке: нативная карбонилредуктаза / НАДФ (+)-зависимая простагландиндегидрогеназа» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 90 (2): 502–6. Бибкод : 1993PNAS...90..502K . дои : 10.1073/pnas.90.2.502 . ПМЦ 45691 . ПМИД 8421682 .
- Лемье Н., Малфой Б., Форрест Г.Л. (январь 1993 г.). «Карбонилредуктаза человека (CBR), локализованная в полосе 21q22.1 с помощью флуоресцентной гибридизации in situ с высоким разрешением, демонстрирует эффекты дозировки гена в клетках с трисомией 21». Геномика . 15 (1): 169–72. дои : 10.1006/geno.1993.1024 . ПМИД 8432528 .
- Ватанабэ К., Сугавара К., Оно А., Фукузуми Ю., Итакура С., Ямадзаки М., Таширо Х., Осоэгава К., Соэда Э., Номура Т. (август 1998 г.). «Картирование новой карбонилредуктазы человека, CBR3, и рибосомальных псевдогенов на хромосоме человека 21q22.2». Геномика . 52 (1): 95–100. дои : 10.1006/geno.1998.5380 . ПМИД 9740676 .
- Тэнгли Дж. Н., Вермут Б (февраль 1999 г.). «Идентификация реактивного остатка цистеина (Cys227) в карбонилредуктазе человека». Европейский журнал биохимии . 260 (1): 9–14. дои : 10.1046/j.1432-1327.1999.00089.x . ПМИД 10091578 .
- Финк С., Аталла А., Нагель Г., Стиннер Б., Мазер Э. (январь 2001 г.). «Экспрессия и снижение активности NNK карбонилредуктазы и 11бета-гидроксистероиддегидрогеназы типа 1 в легких человека». Химико-биологические взаимодействия . 130–132 (1–3): 761–73. Бибкод : 2001CBI...130..761F . дои : 10.1016/S0009-2797(00)00306-9 . ПМИД 11306092 .
- Бальч Б., Киршнер Л., Кэрнс Н., Фунтулакис М., Любец Г. (2002). «Повышение уровня карбонилредуктазы и алкогольдегидрогеназы в мозговых белках при синдроме Дауна и болезни Альцгеймера». Экспрессия белка в мозге с синдромом Дауна . стр. 193–201. дои : 10.1007/978-3-7091-6262-0_15 . ISBN 978-3-211-83704-7 . ПМИД 11771743 .
{{cite book}}:|journal=игнорируется ( помогите ) - Скалова Л., Нобилис М., Шотакова Б., Кондрова Е., Савлик М., Всол В., Пишар-Гарсия Л., Мазер Э. (июль 2002 г.). «Карбонильное восстановление потенциальных цитостатических препаратов бенфлурона и 3,9-диметоксибенфлурона у человека in vitro». Биохимическая фармакология . 64 (2): 297–305. дои : 10.1016/S0006-2952(02)01068-7 . ПМИД 12123751 .
- Чеон М.С., Шим К.С., Ким Ш., Хара А., Любец Г. (июль 2003 г.). «Уровни белка в генах, закодированных на хромосоме 21 в мозге плода с синдромом Дауна: оспаривание гипотезы эффекта дозировки генов (Часть IV)». Аминокислоты . 25 (1): 41–7. дои : 10.1007/s00726-003-0009-9 . ПМИД 12836057 . S2CID 52799223 .
галерея PDB |
|---|
