Система данных «Штрих-код жизни»
Система данных « Штрих -код жизни» (широко известная как BOLD или BOLDSystems ) — это веб-платформа, специально предназначенная для штрих-кодирования ДНК . [ 1 ] [ 2 ] Это облачная платформа для хранения и анализа данных, разработанная в Центре геномики биоразнообразия в Канаде. Он состоит из четырех основных модулей: портала данных, образовательного портала, реестра BIN (предполагаемых видов) и инструмента сбора и анализа данных , который представляет собой онлайн-платформу для анализа последовательностей ДНК . [ 2 ] С момента своего запуска в 2005 году BOLD был расширен и теперь предоставляет ряд функций, включая организацию данных, проверку, визуализацию и публикацию. Самая последняя версия системы, версия 4, выпущенная в 2017 году, содержит ряд улучшений, поддерживающих сбор и анализ данных, а также включает новые функции, улучшающие распространение данных, цитирование и аннотирование. [ 3 ] До 16 ноября 2020 года BOLD уже содержал последовательности штрих-кодов для 318 105 официально описанных видов, включая животных, растения, грибы и простейших (около 8,9 миллионов экземпляров). [ 4 ]
BOLD доступен бесплатно любому исследователю, интересующемуся штрих-кодированием ДНК . Предоставляя специализированные услуги, он помогает публиковать записи, соответствующие стандартам, необходимым для получения обозначения ШТРИХ-КОДА в международных базах данных нуклеотидных последовательностей. Благодаря своей веб-доставке и гибкой модели безопасности данных, он также имеет хорошие возможности для поддержки проектов, в которых участвуют широкие исследовательские альянсы. [ 3 ]
Выпуск данных BOLD в основном произошел из проекта BARCODE 500K. [ 5 ] выполненный Международным консорциумом по штрих-коду жизни (iBOL) с 2010 по 2015 год. Он был направлен на сбор данных о записях штрих-кодов ДНК для 5 миллионов образцов, представляющих 500 тысяч видов. Весь сбор образцов, распределение последовательностей, сортировка информации осуществляется большим количеством ученых, сотрудников и учреждений из стран по всему миру. Накопление данных повышает точность идентификации штрих-кода ДНК и облегчает достижение штрих-кодирования жизни.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ратнасингем, Судживан; Хеберт, Пол Д.Н. (2013). «Реестр всех видов животных на основе ДНК: система индексных номеров штрих-кода (BIN)» . ПЛОС ОДИН . 8 (7): e66213. Бибкод : 2013PLoSO...866213R . дои : 10.1371/journal.pone.0066213 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 3704603 . ПМИД 23861743 .
- ^ Перейти обратно: а б РАТНАСИНГЕМ, СУДЖИВАН; ХЕБЕРТ, ПОЛ Д.Н. (24 января 2007 г.). «ШТРИХ-КОДИРОВАНИЕ: жирный шрифт: Система данных о штрих-коде жизни (http://www.barcodinglife.org)» . Заметки по молекулярной экологии . 7 (3): 355–364. дои : 10.1111/j.1471-8286.2007.01678.x . ISSN 1471-8278 . ПМК 1890991 . ПМИД 18784790 .
- ^ Перейти обратно: а б «Справочник по печати BOLD для BOLD v4» . www.boldsystems.org . Проверено 16 ноября 2020 г.
- ^ «Царства жизни со штрих-кодом | BOLDSYSTEMS» . www.boldsystems.org . Проверено 16 ноября 2020 г.
- ^ «ШТРИХ-КОД 500К» . ibol.org . Архивировано из оригинала 16 августа 2021 г. Проверено 16 ноября 2020 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]
