Jump to content

Карпедиемонас

(Перенаправлено с Carpediemonadida )

Карпедиемонас
Научная классификация Изменить эту классификацию
Домен: Эукариоты
Тип: Метамонада
Подтип: блудливый
Суперкласс: Карпедимонадия
Кавалер-Смит
Сорт: Карпедиемонадея
Кавалер-Смит
Заказ: Карпедиемонадида
Кавалер-Смит
Семья: Карпедимонадиды
Род: Карпедиемонас
Экебом, Паттерсон и Вёрс, 1996 г. [ 1 ]
Типовой вид
Карпедиемонас мембранифера
(Ларсен и Паттерсон, 1990 г.) Экебом, Паттерсон и Вёрс, 1996 г.
Разновидность
  • К. Фризия
  • С. мембранифера

Carpediemonas — род Metamonada , принадлежит к группе Excavata . Этот организм представляет собой одноклеточный жгутиковый эукариот, впервые обнаруженный в образцах субстрата с Большого Барьерного рифа . [ 2 ] Carpediemonas можно найти в анаэробных приливных отложениях, где они питаются бактериями. Особенностью этого вида является наличие характерной для раскопок питающей канавки. Как и большинство других метамонад, Carpediemonas не использует аэробные митохондрии для производства энергии. Вместо этого он содержит гидрогеносомы , которые используются для производства АТФ. [ 3 ] Этот организм имеет два жгутика: [ 3 ] задний используется для питания субстратом, а передний движется более медленными выметающими движениями. [ 2 ] Carpediemonas относят к блуду, где подобные Carpediemonas организмы используются при исследовании эволюции в раскопках. [ 4 ] Хотя Carpediemonas и относится к метамонадам, он необычен в том смысле, что является свободноживущим и имеет три базальных тела. [ 5 ]

Этимология

[ редактировать ]

Название Carpediemonas происходит от трех латинских корней: carpe означает «схватить», die означает «день» и суффикс monas , обозначающий одноклеточный организм. Организм был назван в честь carpe diem , что означает «ловить момент», в честь недавно умершей жены одного из авторов. [ 6 ]

История обучения

[ редактировать ]

Carpediemonas был впервые обнаружен Ларсеном и Паттерсоном (1990), которые идентифицировали его как ранее неопознанный Percolomonas и дали название Percolomonas membranifera . Ларсен и Паттерсон рассматривали этот организм как гетеролобозный , потому что иногда он имел четыре жгутика и продольную бороздку. Однако у них не было никаких доказательств того, что у неделящихся организмов было более двух жгутиков. У этого вида также был мешочек с нитями, которые трудно отличить от жгутиков. Экебом и др. (1996) затем переименовали этот организм в Carpediemonas membranifera , когда он был обнаружен в образцах субстрата на Большом Барьерном рифе, и классифицировали его как метамонаду. [ 2 ] была обнаружена метаболическая связь Carpediemonas с прокариотическим сообществом Кроме того, у Carpediemonas frisia . Было обнаружено, что C. frisia выделяет предварительно переваренные биомолекулы. Прокариотические сообщества будут полагаться на C. frisia для неполного переваривания органического материала и окисления различных биомолекул. С другой стороны, C. frisia опирается на прокариотический организм Deltaproteobacteria в своей активности по окислению водорода . [ 7 ]

Среда обитания и экология

[ редактировать ]

Carpediemonas можно найти в анаэробных приливных отложениях, где они питаются бактериями. [ 3 ] Его можно обнаружить вместе с Cafeteria marsupialis в анаэробной среде. [ 2 ]

Описание

[ редактировать ]

Экебом и др. (1996) описывает Carpediemonas как организмы размером примерно 5 мкм в длину (с диапазоном 4–7,5 мкм). Carpediemonas имеет продольное углубление, охватывающее почти всю вентральную сторону клетки. Он часто имеет два неравных жгутика, прикрепляющихся к передней стороне вентральной борозды, но иногда может иметь три или четыре жгутика. Задний акронематический жгутик используется для питания и прикрепления к субстрату, тогда как передний жгутик бьется медленнее и совершает медленные выметающие движения. [ 2 ] Дальнейшие исследования Симпсона и Паттерсона (1999) более детально изучают жгутики и описывают жгутиковый аппарат как имеющий третье, бесплодное базальное тело. Дорсальную сторону клетки поддерживает микротрубчатый веер с микротрубчатым корешком на переднем конце. На вентральной стороне микротрубочки, отходящие от разных жгутиковых корешков, поддерживают вентральную бороздку. Передний жгутик имеет аксонему «9+2». Симпсон и Паттерсон описали, что в дополнение к аксонеме «9 + 2» задний жгутик также имеет «три расходящихся пластинки из электронно-плотного материала, которые образуют центральные компоненты лопастей». Первая пластинка возникает после прикрепления жгутика и направлена ​​вентрально. Вторая пластинка начинается напротив первой пластинки. Третья пластинка поддерживает третью лопатку, которая расположена дистальнее и перпендикулярна двум другим лопаткам или пластинкам. Все три ламели имеют бороздки, если смотреть в продольном разрезе, и эти бороздки перпендикулярны аксонеме «9+2». Carpediemonas содержит одно яйцевидное ядро, расположенное в передней части клетки. Ядрышко также можно найти субцентрально внутри ядра. У Carpediemonas также нет митохондрий, что характерно для метамонад. Вместо этого у него есть гидрогеносомы, вероятно, полученные из анаэробных митохондрий. Он также содержит одну диктиосому Гольджи, расположенную спереди, дорсально и слева от жгутикового аппарата. [ 3 ] Эндоплазматический ретикулум этого рода в основном находится на периферии клетки. Вокруг цитоплазмы можно обнаружить пищевые вакуоли, содержащие бактериальное содержимое. [ 3 ] присутствуют три центриоли Также у Carpediemonas . [ 8 ]

Таксономия

[ редактировать ]

Carpediemonas классифицируется как выкопанный, поскольку имеет характерную для этой группы питающую бороздку. В раскопках Карпедиемон отнесен к блудникам. У блудоподобных организмов, подобных Carpediemonas (CLO), удалось лучше понять эволюцию анаэробных раскопок путем изучения особенностей их цитоскелета и модифицированных митохондрий. Примером Carpediemonas -подобного организма, который использовался для изучения истории эволюции в раскопках, является Kipferlia bialata . [ 4 ] Согласно недавним исследованиям [ 9 ] этот организм способен размножаться без каких-либо ключевых белков для репликации ДНК.

Репликация ДНК, сегрегация хромосом и пол

[ редактировать ]

Недавнее исследование с использованием сравнительной геномики [ 10 ] выявил обширную потерю белковых комплементов репликации и сегрегации ДНК в Metamonada и подчеркнул, что геномы C. membranifera и C. frisia еще больше редуцированы. В этих геномах отсутствуют белки репликации ДНК комплекса распознавания происхождения (ORC), Cdc6, некоторые компоненты комплекса GINS и некоторые субъединицы полимераз дельта и эпсилон, а также большинство структурных субъединиц кинетохор, комплекс отслеживания плюс-концов микротрубочек и все субъединицы комплекса Ndc80, участвующие в сегрегации хромосом. ORC и Cdc6 являются белками, отвечающими за инициацию и лицензирование репликации у эукариот, и их отсутствие, по-видимому, указывает на существование нестандартного и еще не описанного механизма запуска репликации. Отсутствие белков комплекса Ndc80 также указывает на то, что может существовать нестандартный механизм прикрепления хромосом к микротрубочкам для сегрегации хромосом. Carpediemonas — первый известный эукариот, обладающий столь радикально измененными механизмами репликации и сегрегации ДНК. С Carpediemonas размножаются, очевидно, что они реплицируют свою ДНК, и исследователи предложили гипотезу о том, как начинается репликация. Эта гипотеза использует элементы процессов, наблюдаемых у других видов, но принимает во внимание специфические белковые дополнения, обнаруженные у Carpediemonas . Вкратце: предполагается, что репликация протекает с помощью Dmc1-зависимого механизма гомологичной рекомбинации, который не требует начала репликации и опосредован гибридами РНК:ДНК. Эта гипотеза еще нуждается в экспериментальном подтверждении. Половое или парасексуальное размножение у Метамонады напрямую не наблюдалось. Тем не менее, исследование подтверждает сохранение ключевых мейотических белков в группе с дополнительным открытием, что виды Carpediemonas имеют гомологи из семейства tmcB и субъединицы специфичных для сперматозоидов каналов, о последних ранее сообщалось только у Opisthokonta и трех других простейших. Наличие таких белков означает, что необходимы дальнейшие исследования, чтобы понять, имеет ли место секс, действительно ли эти белки участвуют во время секса и какова может быть их роль. Суммируя, Carpediemonas — интересные микробные эукариоты.

  1. ^ Дж. Экебом; диджей Паттерсон; Н. Вёрс (1996). «Гетеротрофные жгутиконосцы из отложений коралловых рифов (Большой Барьерный риф, Австралия)». Архив для защиты . 146 (3–4): 251–272. дои : 10.1016/S0003-9365(96)80013-3 .
  2. ^ Jump up to: а б с д и Экебом, Дж.; Паттерсон, диджей; Вёрс, Н. (1996). «Гетеротрофные жгутиконосцы из отложений коралловых рифов (Большой Барьерный риф, Австралия)». Архив для защиты . 146 (3–4): 251–272. дои : 10.1016/s0003-9365(96)80013-3 . ISSN   0003-9365 .
  3. ^ Jump up to: а б с д и Симпсон, Аластер ГБ; Паттерсон, Дэвид Дж. (1999). «Ультраструктура Carpediemonas membranifera (Eukaryota) со ссылкой на «гипотезу раскопок» ». Европейский журнал протистологии . 35 (4): 353–370. дои : 10.1016/s0932-4739(99)80044-3 . ISSN   0932-4739 .
  4. ^ Jump up to: а б Юбуки, Наоджи; Симпсон, Аластер ГБ; Леандер, Брайан С. (2013). «Комплексная ультраструктура Kipferlia bialata доказывает эволюцию признаков внутри Fornicata (Excavata)». Протист . 164 (3): 423–439. дои : 10.1016/j.protis.2013.02.002 . ISSN   1434-4610 . ПМИД   23517666 .
  5. ^ «КАРПЕДИЕМОНАДА» . comenius.susqu.edu . Проверено 22 апреля 2019 г.
  6. ^ «Таксономия – она пришла из пруда» . Проверено 22 апреля 2019 г.
  7. ^ Хаманн, Эммо; Тегетмейер, Халина Э; Ридель, Дитмар; Литтманн, Стен; Ахмеркамп, Серен; Чен, Цзяньвэй; Хач, Филипп Ф; Строус, Марк (17 февраля 2017 г.). «Синтрофическая связь между хищными Carpediemonas и специфическими популяциями прокариот» . Журнал ISME . 11 (5): 1205–1217. дои : 10.1038/ismej.2016.197 . ISSN   1751-7362 . ПМЦ   5437931 . ПМИД   28211847 .
  8. ^ Кавалер-Смит, Т. (1 ноября 2003 г.). «Раскопанные типы простейших Metamonada Grasse emend. (Anaeromonadea, Parabasalia, Carpediemonas, Eopharyngia) и Loukozoa emend. (Jakobea, Malawimonas): их эволюционное сходство и новые высшие таксоны» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 53 (6): 1741–1758. дои : 10.1099/ijs.0.02548-0 . ISSN   1466-5026 . ПМИД   14657102 .
  9. ^ «Микроб каким-то образом выживает без ключевых белков для репликации своей ДНК» .
  10. ^ Салас-Лейва, Даяна Э.; Тромер, Элко К.; Кертис, Брюс А.; Йерлстрем-Хультквист, Йон; Колиско, Мартин; Йи, Чжэньчжэнь; Салас-Лейва, Джоан С.; Галло-Лавалле, Люси; Уильямс С., Уильямс С.; Копс, Герт JPL; Арчибальд, Джон М.; Симпсон, Аластер ГБ; Роджер, Эндрю Дж. (2021). «Геномный анализ не обнаружил никаких доказательств существования канонических эукариотических комплексов обработки ДНК у свободноживущих простейших» . Природные коммуникации . 12 (1): 6003. Бибкод : 2021NatCo..12.6003S . дои : 10.1038/s41467-021-26077-2 . ПМЦ   8516963 . ПМИД   34650064 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 0ecb91e55da884c2bf85a1b4c0a79b76__1714156020
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/0e/76/0ecb91e55da884c2bf85a1b4c0a79b76.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Carpediemonas - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)