Джейкоб

Джейкоб
	Четыре вида якобидов с бороздками и жгутиками: Jakoba libera (вид снизу), Stygiella incarcerata (вид снизу), Reclinomonas americana (вид сверху) и Histiona aroides (вид снизу).
Научная классификация
Домен:	Эукариоты
(без рейтинга):	Раскопки
Сорт:	Якобинец
Заказ:	Якобит
Семья:	Якобиды ; Паттерсон 1990 г.
Род:	Джейкоб ; Паттерсон 1990 г.
Типовой вид
	Якоб Либера ; (Руины, 1938 г.) Паттерсон, 1990 г.
Разновидность
	Дж. Багамский ; Дж. бесплатно ;

Jakoba — род таксона Excavata . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} и в настоящее время имеет единственный описанный вид, Jakoba libera, описанный Паттерсоном в 1990 году. ^{[ 3 ]} и назван в честь голландского ботаника (альгологии, миологии и лихенологии) Якобы Руинена. ^{[ 4 ]} (Ранее описанный Jakoba incarcerata был переименован в Andalucia incarcerata , а Jakoba bahamensis / Jakoba bahamiensis официально не описана.) ^{[ 5 ]}

Jakoba libera, фазово-контрастная световая микрофотография живой клетки из типовой культуры

Внешний вид и характеристики

Якоба — мелкие бактериоядные зоофлагелляты ( якобиды ), обитающие в морских ^{[ 6 ]} и гиперсоленой среды. ^{[ 5 ]} Это свободно плавающие трофические клетки с двумя жгутиками , длина которых составляет от пяти до десяти микрометров. Клетки вращаются вдоль своей продольной оси, что позволяет плавать по прямым линиям. ^{[ 6 ]} если только не произойдет деформация и «извивание» из-за сжатия обломков. Во время питания бактерии удаляются из толщи воды током, создаваемым задним жгутиком . Этот ток заставляет бактерии собираться в канавке. ^{[ 7 ]} на правой вентральной стороне клетки ^{[ 6 ]} – помощь в проглатывании и создании пищевых вакуолей . ^{[ 7 ]}

Ультраструктура

Клеточные компоненты Якобы не являются чем-то особенным. Они содержат одно ядро, расположенное рядом с основаниями жгутиков , одно тельце Гольджи , а митохондриальные кристы уплощены, что позволяет предположить родство с другими таксонами платикристатов. Митохондрии уникальных Якобы их представляют особый эволюционный интерес из- бактериоподобных митохондриальных за геномов . Было обнаружено, что их митохондриальные геномы содержат значительно больше функциональных генов, чем геномы других групп эукариот , и, по-видимому, они сохранили предковую эубактериальную РНК-полимеразу , которая была заменена полимеразой вирусного типа у всех других митохондриальных эукариот. В целом, якобидов митохондриальные геномы примитивно сложны и напоминают своих протеобактериальных предков больше, чем любые другие митохондрии . ^{[ 8 ]}

Жизненный цикл

Якоба размножаются бесполым путем бинарным делением . Полового размножения или образования цист не наблюдалось. ^{[ 6 ]}

Данные молекулярной последовательности

«Кольцевой митохондриальный геном штамма Jakoba libera ATCC 50422 имеет размер 96,6 кб. Секвенирование почти завершено. В настоящее время идентифицировано 77 генов, ни один из которых не содержит интрона. Межгенные участки составляют ~30% генома и содержат кластеры тандемных повторов, длина единицы которых составляет ~20 п.н. Транскрибируемые гены находятся на обеих цепях ДНК . стандартный генетический код используется Для трансляции . Кодируемые гены включают те, которые обычно встречаются в мтДНК , включая кодирующие белки гены nad1,2,3,4,4L,5,6, cob, cox1,2,3 и atp6,8,9, а также большую субъединицу ( rnl) и гены малых субъединиц (rns) рРНК и >22 генов тРНК . Также присутствует ряд белковых генов, типичных для мтДНК простейших, но не животных или грибов . К ним относятся nad7,9,11, atp1, rpl2,5,6,14,16 и rps2-4,11-14,19. также кодирует ряд уникальных ORF J. libera МтДНК ». «Ряд митохондриальных генов J. libera редки или отсутствуют в других митохондриальных геномах, но присутствуют у бактерий . Среди этих редких или уникальных Гены, кодируемые мтДНК, — это dpo, rpoB,C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W и несколько генов рибосомальных белков». «Сравнение порядка генов в мтДНК J. libera …» показывает «кластеры, которые в остальном не встречаются у бактерий , но которые, очевидно, появились в ходе эволюции митохондриального генома после отделения протомитохондрий от бактериальной линии. Примерами являются кластеры от sdh3 до nad5 (содержащие 5 генов), atp8-[trn]-rps4-atp9 и nad11-nad1-cox11-cox3-tufA». ^{[ 9 ]}

Культуры

В настоящее время для культивирования доступны три штамма Jakoba libera . Их нельзя выращивать аксенически , но их легко выращивать в минимальной среде с добавлением бактерий ( Klebsiella aerogenes ). ^{[ 6 ]}

Ссылки

^ Родригес-Эспелета, Найара; Хеннер Бринкманн; Гертрауд Бургер; Эндрю Дж. Роджер; Майкл В. Грей; Эрве Филипп; Б. Франц Ланг (август 2007 г.). «К разгадке эукариотического дерева: филогенетическое положение якобидов и церкозоев» . Современная биология . 17 (16): 1420–1425. дои : 10.1016/j.cub.2007.07.036 . ПМИД 17689961 .
^ Симпсон, AGB и Паттерсон, DJ 2001. О якобидах ядра и раскопанных таксонах: ультраструктура Jakoba incarcerata. Дж. Юк. Микроб., 48: 480-492. https://doi.org/10.1111/j.1550-7408.2001.tb00183.x
^ Паттерсон, DJ 1990. Jakoba libera (Ruinen, 1938) — гетеротрофный жгутиконосец из глубоких океанических отложений. Журнал Морской биологической ассоциации, Великобритания 70: 381-393.
^ Буркхардт, Лотте (2022). Энциклопедия одноименных названий растений [ Энциклопедия одноименных названий растений ] (pdf) (на немецком языке). Берлин: Ботанический сад и Ботанический музей, Свободный университет Берлина. дои : 10.3372/epolist2022 . ISBN 978-3-946292-41-8 . Проверено 27 января 2022 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Якоба либера» . Веб-проект «Древо жизни». Архивировано из оригинала 27 сентября 2011 года . Проверено 3 апреля 2012 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж «Якоба» . База данных изображений протистов. Архивировано из оригинала 22 сентября 2006 года . Проверено 3 апреля 2012 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Иаков освобожден» . Энциклопедия жизни . Проверено 3 апреля 2012 г.
^ «Якобида» . Веб-проект «Древо жизни». Архивировано из оригинала 29 ноября 2019 г. Проверено 13 апреля 2012 г.
^ «Jakoba libera Организация генома митохондрий, содержание генов, генетический код» . Проверено 3 апреля 2012 г.
^ «Знакомство с жгутиковыми якобидами» . База данных изображений протистов . Проверено 12 апреля 2012 г.

[1] Родригес-Эспелета, Найара; Хеннер Бринкманн; Гертрауд Бургер; Эндрю Дж. Роджер; Майкл В. Грей; Эрве Филипп; Б. Франц Ланг (август 2007 г.). «К разгадке эукариотического дерева: филогенетическое положение якобидов и церкозоев» . Современная биология . 17 (16): 1420–1425. дои : 10.1016/j.cub.2007.07.036 . ПМИД 17689961 .

[2] Симпсон, AGB и Паттерсон, DJ 2001. О якобидах ядра и раскопанных таксонах: ультраструктура Jakoba incarcerata. Дж. Юк. Микроб., 48: 480-492. https://doi.org/10.1111/j.1550-7408.2001.tb00183.x

[3] Паттерсон, DJ 1990. Jakoba libera (Ruinen, 1938) — гетеротрофный жгутиконосец из глубоких океанических отложений. Журнал Морской биологической ассоциации, Великобритания 70: 381-393.

[4] Буркхардт, Лотте (2022). Энциклопедия одноименных названий растений [ Энциклопедия одноименных названий растений ] (pdf) (на немецком языке). Берлин: Ботанический сад и Ботанический музей, Свободный университет Берлина. дои : 10.3372/epolist2022 . ISBN 978-3-946292-41-8 . Проверено 27 января 2022 г.

[Jakoba_libera_-Tree_Life-5] Jump up to: ^а ^б «Якоба либера» . Веб-проект «Древо жизни». Архивировано из оригинала 27 сентября 2011 года . Проверено 3 апреля 2012 г.

[Jakoba._Protist_Image_Database-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж «Якоба» . База данных изображений протистов. Архивировано из оригинала 22 сентября 2006 года . Проверено 3 апреля 2012 г.

[Jakoba_libera-Encyclopedia_of_Life-7] Jump up to: ^а ^б «Иаков освобожден» . Энциклопедия жизни . Проверено 3 апреля 2012 г.

[April_3,_2012-8] «Якобида» . Веб-проект «Древо жизни». Архивировано из оригинала 29 ноября 2019 г. Проверено 13 апреля 2012 г.

[9] «Jakoba libera Организация генома митохондрий, содержание генов, генетический код» . Проверено 3 апреля 2012 г.

[10] «Знакомство с жгутиковыми якобидами» . База данных изображений протистов . Проверено 12 апреля 2012 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]