Глицинамид рибонуклеотид

Глицинамид рибонуклеотид
Имена
	Название ИЮПАК (1R ) -1,4-Ангидро-1-глицинамидо- D -рибитол 5-(дигидрофосфат)
	Систематическое название ИЮПАК [(2R , 3S , 4R , 5R ) -5-(2-аминоацетамидо)-3,4-дигидроксиоксолан-2-ил]метилдигидрофосфат
	Другие имена глицинамид риботид, ; ДАЖЕ
Идентификаторы
Номер CAS	10074-18-7 ;
3D model ( JSmol )	Интерактивное изображение ;
ЧЭБИ	ЧЕБИ: 143019 ;
ХимическийПаук	141370 ;
КЕГГ	C03838 ;
ПабХим CID	160913 ;
НЕКОТОРЫЙ	К343ГЗ6ПУЙ ;
Панель управления CompTox ( EPA )	DTXSID70143478 ;
	показывать ИнЧИ
	показывать УЛЫБКИ
Характеристики
Химическая формула	С 7 Н 15 Н 2 О 8 П
Молярная масса	286.177 g·mol −1
	Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа). Ссылки на инфобоксы

Глицинамидрибонуклеотид (или GAR ) представляет собой биохимический промежуточный продукт в образовании пуриновых нуклеотидов посредством инозин -5-монофосфата и, следовательно, является строительным блоком для ДНК и РНК . ^[1]^[2]^[3] Витамины тиамин ^[4] и кобаламин ^[5] также содержат фрагменты, полученные из GAR. ^[6]

GAR является продуктом фермента фосфорибозиламина — глицинлигазы, действующего на фосфорибозиламин (PRA), объединяя его с глицином в процессе, управляемом АТФ . Реакция EC 6.3.4.13 образует амидную связь: ^[7]

ПРА + глицин + АТФ → ГАР + АДФ + Пи

Далее в ходе биосинтеза к GAR добавляется формильная группа из 10-формилтетрагидрофолата , что катализируется фосфорибозилглицинамидформилтрансферазой в реакции EC 2.1.2.2 и приводит к образованию формилглицинамидриботида (FGAR): ^[7]

ГАР + 10-формилтетрагидрофолат → ФГАР + тетрагидрофолат

См. также

Ссылки

^ Р. Каспи (13 января 2009 г.). «Путь: биосинтез 5-аминоимидазолрибонуклеотида I» . База данных метаболических путей MetaCyc . Проверено 2 февраля 2022 г.
^ Чжан, Ю.; Морар, М.; Илик, SE (2008). «Структурная биология пути биосинтеза пуринов» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 65 : 3699–3724. дои : 10.1007/s00018-008-8295-8 . ПМК 2596281 . ПМИД 18712276 .
^ Гупта, Рани; Гупта, Намита (2021). «Биосинтез и регуляция нуклеотидов». Основы бактериальной физиологии и обмена веществ . стр. 525–554. дои : 10.1007/978-981-16-0723-3_19 . ISBN 978-981-16-0722-6 . S2CID 234897784 .
^ Чаттерджи, Абхишек; Хазра, Амрита Б.; Абдельвахед, Самех; Хилми, Дэвид Г.; Бегли, Тадг П. (2010). «Радикальный танец» в биосинтезе тиамина: механистический анализ бактериальной гидроксиметилпиримидинфосфатсинтазы» . Angewandte Chemie, международное издание . 49 (46): 8653–8656. дои : 10.1002/anie.201003419 . ПМК 3147014 . ПМИД 20886485 .
^ Р. Каспи (23 сентября 2019 г.). «Путь: биосинтез 5-гидроксибензимидазола (анаэробный)» . База данных метаболических путей MetaCyc . Проверено 10 февраля 2022 г.
^ Мехта, Ангад П.; Абдельвахед, Самех Х.; Фенвик, Майкл К.; Хазра, Амрита Б.; Тага, Мичико Э.; Чжан, Ян; Илик, Стивен Э.; Бегли, Тадг П. (2015). «Анаэробное образование 5-гидроксибензимидазола из риботида аминоимидазола: непредвиденное пересечение биосинтеза тиамина и витамина B12» . Журнал Американского химического общества . 137 (33): 10444–10447. дои : 10.1021/jacs.5b03576 . ПМЦ 4753784 . ПМИД 26237670 .
^ Jump up to: ^а ^б Велин, Мартин; Гроссманн, Йорг Гюнтер; Флодин, Сюзанна; Найман, Томас; Стенмарк, Пол; Тресог, Лионель; Котенёва Татьяна; Йоханссон, Ида; Нордлунд, Пяр; Лехтио, Лари (2010). «Структурные исследования трифункциональной GART человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (20): 7308–7319. дои : 10.1093/nar/gkq595 . ПМЦ 2978367 . ПМИД 20631005 .

[IMP-1] Р. Каспи (13 января 2009 г.). «Путь: биосинтез 5-аминоимидазолрибонуклеотида I» . База данных метаболических путей MetaCyc . Проверено 2 февраля 2022 г.

[2] Чжан, Ю.; Морар, М.; Илик, SE (2008). «Структурная биология пути биосинтеза пуринов» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 65 : 3699–3724. дои : 10.1007/s00018-008-8295-8 . ПМК 2596281 . ПМИД 18712276 .

[3] Гупта, Рани; Гупта, Намита (2021). «Биосинтез и регуляция нуклеотидов». Основы бактериальной физиологии и обмена веществ . стр. 525–554. дои : 10.1007/978-981-16-0723-3_19 . ISBN 978-981-16-0722-6 . S2CID 234897784 .

[Dance-4] Чаттерджи, Абхишек; Хазра, Амрита Б.; Абдельвахед, Самех; Хилми, Дэвид Г.; Бегли, Тадг П. (2010). «Радикальный танец» в биосинтезе тиамина: механистический анализ бактериальной гидроксиметилпиримидинфосфатсинтазы» . Angewandte Chemie, международное издание . 49 (46): 8653–8656. дои : 10.1002/anie.201003419 . ПМК 3147014 . ПМИД 20886485 .

[HBI-5] Р. Каспи (23 сентября 2019 г.). «Путь: биосинтез 5-гидроксибензимидазола (анаэробный)» . База данных метаболических путей MetaCyc . Проверено 10 февраля 2022 г.

[Begley2015-6] Мехта, Ангад П.; Абдельвахед, Самех Х.; Фенвик, Майкл К.; Хазра, Амрита Б.; Тага, Мичико Э.; Чжан, Ян; Илик, Стивен Э.; Бегли, Тадг П. (2015). «Анаэробное образование 5-гидроксибензимидазола из риботида аминоимидазола: непредвиденное пересечение биосинтеза тиамина и витамина B12» . Журнал Американского химического общества . 137 (33): 10444–10447. дои : 10.1021/jacs.5b03576 . ПМЦ 4753784 . ПМИД 26237670 .

[GART-7] Jump up to: ^а ^б Велин, Мартин; Гроссманн, Йорг Гюнтер; Флодин, Сюзанна; Найман, Томас; Стенмарк, Пол; Тресог, Лионель; Котенёва Татьяна; Йоханссон, Ида; Нордлунд, Пяр; Лехтио, Лари (2010). «Структурные исследования трифункциональной GART человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (20): 7308–7319. дои : 10.1093/nar/gkq595 . ПМЦ 2978367 . ПМИД 20631005 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]