bioRxiv
Тип сайта | Наука |
---|---|
Доступно в | Английский |
Владелец | Лаборатория Колд-Спринг-Харбор |
URL-адрес | биорксив |
Коммерческий | Нет |
Запущен | ноябрь 2013 г |
Текущий статус | Онлайн |
bioRxiv (произносится как «биоархив» [1] [2] ) — с открытым доступом препринтов хранилище по биологическим наукам, основанное Джоном Инглисом и Ричардом Севером в ноябре 2013 года. [3] [4] Его принимает Лаборатория Колд-Спринг-Харбор (CSHL). [5]
В качестве препринтов статьи, размещенные на bioRxiv, не рецензируются , а проходят базовую проверку и проверку на плагиат. Однако рецензии из других источников могут быть размещены вместе с препринтами. Кроме того, читатели могут оставлять комментарии.
Было подсчитано, что две трети статей, опубликованных в bioRxiv, позже публикуются в рецензируемых журналах. [6] BioRxiv и его дочерний сайт medRxiv стали основными источниками распространения исследований COVID-19 . [7] [8]
История [ править ]
BioRxiv был вдохновлен и намерен дополнить репозиторий arXiv , который в основном посвящен математике , физике и смежным дисциплинам, запущенный в 1991 году Полом Гинспаргом (который также входит в консультативный совет bioRxiv). Он получил поддержку как от CSHL, так и от Фонда Лури . [9] Дополнительное финансирование в рамках Инициативы Чана Цукерберга было подтверждено в апреле 2017 года. [10] [11]
До создания bioRxiv мнения ученых-биологов разделились по вопросу о наличии специального хранилища препринтов с открытым доступом . [3] Многие опасались, что их исследования будут перехвачены конкурентами и они потеряют право на открытие . Однако несколько генетиков подали статьи в раздел « количественной биологии » репозитория arXiv (запущенного в 2003 году) и больше не испытывали подобных опасений, поскольку могли указать на препринты в подтверждение своих заявлений об открытии. [3] [12]
Скорость подачи [ править ]
Джоселин Кайзер из Science сказала, что в первый год работы хранилище «привлекло скромный, но растущий поток статей», в нем было размещено 824 препринта. [13] более 20 000 твитов . В 2015 году о препринтах, размещенных на bioRxiv, было написано [9]
В феврале 2016 года количество заявок в bioRxiv неуклонно увеличивалось с ≈60 до ≈200 в месяц. [9] В 2017 году количество ежемесячных заявок выросло с более чем 800 в марте. [14] до более 1000 в июле [15] Общее количество докладов, поданных в 2017 году, составило 10 722. [16]
В 2018 году было подано в общей сложности 20 000 рукописей, что составляет в среднем 1600 статей в месяц. [17]
В 2019 году было подано более 31 000 рукописей, в результате чего в среднем ежемесячно поступает 2600 статей (в последнем квартале 2019 года этот показатель увеличился до чуть более 3000 статей в месяц). [18]
Количество ежегодных рукописей выросло до 38 088 в 2020 году, затем немного увеличилось до 40 223 в 2021 году, а затем в 2022 году было опубликовано 36 417 рукописей. По состоянию на 31 декабря 2022 года всего было принято почти 180 000 препринтов. [19]
Поля [ править ]
bioRxiv принимает препринты по следующим дисциплинам:
- Поведение и познание животных
- Биохимия
- Биоинженерия
- Биоинформатика
- Биофизика
- рака Биология
- Клеточная биология
- Клинические испытания
- Биология развития
- Экология
- Эпидемиология
- Эволюционная биология
- Генетика
- Геномика
- Иммунология
- Микробиология
- Молекулярная биология
- Нейронаука
- Палеонтология
- Патология
- Фармакология и токсикология
- Физиология
- Биология растений
- Научная коммуникация и образование
- Синтетическая биология
- Системная биология
- Зоология
bioRxiv, журналы и открытое рецензирование [ править ]
В результате популярности bioRxiv многие биологические журналы обновили свою политику в отношении препринтов. [9] [13] уточняя, что они не считают препринты «предшествующей публикацией» для целей правила Ингельфингера .
Инициатива bioRxiv to Journals (B2J) позволяет авторам отправлять свои рукописи непосредственно в систему подачи журнала через bioRxiv. По состоянию на май 2020 года в инициативе участвуют 177 журналов. [1]
В 2019 году BioRxiv начал разрешать публикацию обзоров рядом с препринтами, а также комментировать препринты. Обзоры могут поступать из журналов или с таких платформ, как Review Commons. [20]
См. также [ править ]
Ссылки [ править ]
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Содействие обмену результатами исследований в области наук о жизни» . биоRxiv . Проверено 12 декабря 2018 г.
- ^ Север, Ричард; Редер, Тед; Хиндл, Саманта; Сассман, Линда; Блэк, Кевин-Джон; Аргентинка, Джанет; Манос, Уэйн; Инглис, Джон Р. (6 ноября 2019 г.). «bioRxiv: сервер препринтов по биологии» . bioRxiv : 833400. doi : 10.1101/833400 . S2CID 209580681 . Проверено 23 апреля 2022 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с Каллауэй, Юэн (12 ноября 2013 г.). «Препринты оживают» . Природа . 503 (7475): 180. Бибкод : 2013Natur.503..180C . дои : 10.1038/503180a . ПМИД 24226869 .
- ^ Лаборатория Колд-Спринг-Харбор. «Препринты bioRxiv теперь можно отправлять напрямую в ведущие исследовательские журналы» . ФизОрг . Проверено 17 марта 2018 г.
- ^ «О bioRxiv» . биоRxiv . Лаборатория Колд-Спринг-Харбор . Проверено 7 сентября 2016 г.
- ^ Абдилл, Ричард Дж. (24 апреля 2019 г.). «Мета-исследование, отслеживание популярности и результатов всех препринтов bioRxiv» . электронная жизнь . 8 : е45133. doi : 10.7554/eLife.45133 . ПМК 6510536 . ПМИД 31017570 . S2CID 129944106 .
- ^ Ян, Удань (14 апреля 2020 г.). «Коронавирус проверяет потребность науки в ограничении скорости» . Нью-Йорк Таймс . ISSN 0362-4331 . Проверено 1 мая 2020 г.
- ^ Керт, Мэгги (08 июля 2021 г.). «Как наука вышла за рамки экспертной оценки во время пандемии» . ПятьТридцатьВосемь . Проверено 7 августа 2021 г.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б с д Инглис, Джон Р.; Север, Ричард (12 февраля 2016 г.). «bioRxiv: отчет о ходе работы» . Как можно скорее био . Проверено 11 сентября 2016 г.
- ^ Каллауэй, Юэн (2017). «Сервер препринтов BioRxiv получает финансовую поддержку от Инициативы Чана Цукерберга» . Природа . 545 (7652): 18. Бибкод : 2017Natur.545...18C . дои : 10.1038/nature.2017.21894 . ПМИД 28470210 .
- ^ Кайзер, Джоселин (26 апреля 2017 г.). «Сервер препринтов BioRxiv получает финансирование от Инициативы Чана Цукерберга» . Наука . дои : 10.1126/science.aal1117 .
- ^ Каллауэй, Юэн (31 июля 2012 г.). «Генетики видят потенциал arXiv» . Природа . 488 (7409): 19. Бибкод : 2012Natur.488...19C . дои : 10.1038/488019а . ПМИД 22859182 .
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б Кайзер, Джоселин (11 ноября 2014 г.). «BioRxiv в возрасте 1 года: многообещающее начало» . Наука . Проверено 7 сентября 2016 г.
- ^ «Джон Инглис в Твиттере» . Твиттер . Проверено 01 марта 2017 г.
- ^ Инглис, Джон (30 июня 2017 г.). «Важная веха #preprint в области науки о жизни: первый месяц @biorxivpreprint > 1000 мс. Спасибо авторам, филиалам и сотрудникам за то, что это произошло» . @ДжонРИнглис . Проверено 2 июля 2017 г.
- ^ «Результаты поиска | bioRxiv» . biorxiv.org . Проверено 22 октября 2018 г.
- ^ «Результаты поиска | bioRxiv» .
- ^ «Результаты поиска | bioRxiv» .
- ^ «Результаты поиска | bioRxiv» . biorxiv.org . Проверено 21 января 2020 г.
- ^ Брейнард, Джеффри (10 октября 2019 г.). «Стремясь повысить прозрачность, bioRxiv начинает публиковать рецензии рядом с препринтами». Наука . Американская ассоциация содействия развитию науки (AAAS). дои : 10.1126/science.aaz8160 . ISSN 0036-8075 . S2CID 211766434 .
Дальнейшее чтение [ править ]
- Янсен, Жаклин (12 ноября 2013 г.). «CSHL запускает bioRxiv, свободно доступный и цитируемый сервер препринтов по биологии» . Лаборатория Колд-Спринг-Харбор . Архивировано из оригинала 20 декабря 2016 года . Проверено 11 сентября 2016 г.
- Кайзер, Джоселин (12 ноября 2013 г.). «Новый сервер препринтов призван стать ответом биологов на arXiv физиков» . Наука . Проверено 30 октября 2016 г.
- «Запущен сервер препринтов BioRxiv» . Новости библиотеки Калифорнийского университета в Беркли . 15 ноября 2013 года . Проверено 11 сентября 2016 г. [ постоянная мертвая ссылка ]
- Каллауэй, Юэн; Пауэлл, Кендалл (16 февраля 2016 г.). «Биологи призвали обнять препринт» . Природа . 530 (7590): 265. Бибкод : 2016Natur.530..265C . дои : 10.1038/530265а . ПМИД 26887471 .
- Инглис, Джон (22 сентября 2016 г.). «Служба препринтов bioRxiv» (PDF) . КОАСП 2016 .