Основная лейциновая молния и домен W2, содержащий белок 2
| BZW2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | BZW2 , MST017, MSTP017, HSPC028, Основная домены на молнии и W2 Leucine и W2, 5MP1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | MGI : 1914162 ; Гомологен : 8530 ; GeneCards : BZW2 ; OMA : BZW2 - Ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викидид | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Основная лейциновая молния и домен W2-домен, содержащий белок 2, является белком , который кодируется BZW2 геном . [ 5 ] [ 6 ] Это эукариотический фактор перевода [ нечеткий ] найдено у видов до бактерий. У животных он локализуется в цитоплазме и экспрессируется повсеместно по всему организму. Сердце , демонстрируют более высокую плацента , скелетные мышцы и гиппокамп экспрессию. При различных раковых заболеваниях активация имеет тенденцию привести к более высокой серьезности и смертности. Было обнаружено, что он взаимодействует с SARS-COV-2 .
Ген
[ редактировать ]BZW2 известен как базовый лейциновой молнии, содержащий домен W2, белок 2, MST017, MSTP017, 5MP1, эукариотический фактор трансляции 5 и HSPC028. [ 7 ] Он расположен на хромосоме 7 на P21.1 на плюс. Ген охватывает 60 389 пар оснований, в координатах 16 583 248 - 16 804 999. Есть 12 экзонов.
Белок
[ редактировать ]Есть две известные изоформы BZW2. Изоформа 1 составляет 419 аминокислот длиной и является наиболее распространенной формой. Изоформа 2-225 аминокислот, содержащих только 11 экзонов и более короткий N-конец . [ 7 ]
Кодированный белок составляет 419 аминокислот длиной и весит 48,3 кДа. [ 8 ] Как описано в названии, белок содержит мотив лейцина-зрителя . Вначале присутствуют четыре повторения «L ……», что приводит к характеристической спирали лейциновой молнии в трехмерной структуре. Домен EIF5C следует за лейциновым мотивом, который является частью белков, которые важны для строгой регуляции клеточных процессов. [ 9 ]
Аминокислотный состав BZW2 имеет более высокое количество лизинов и меньшее количество пролинов у людей, но более высокий состав глутаминовой кислоты в его ортологах. [ 10 ] Человеческий белок BZW2 имеет общий заряд -3, который может снизиться до -9 в ортологах. Там нет значительных кластеров заряда. Существует также повтор kelq, который оставался консервативным у животных.
Вторичная структура содержит большинство альфа -спиралей . [ 11 ] В всех ортологах есть 19 альфа -спиралей, за исключением двух дополнительных бета -листов , которые отсутствуют у людей. Третичная структура образует повторяющуюся складку альфа-спирали, структуру, которая сохраняется через бактерии.
Регулирование
[ редактировать ]Уровень генов
[ редактировать ]Есть три известных промоутеров для BZW2. [ 12 ] Он регулируется многочисленными факторами транскрипции , включая фактор транскрипции рецептора эстрогена ( ESR2 , ES3), фактор транскрипции лейциновой молнии (RRFIP1) и Y-определяющие по полу факторы транскрипции ( SRY ). С этими факторами транскрипции BZW2 имеет регулируемую экспрессию в органах, которые способствуют клеточным функциям. Транскрипционный фактор, определяющий по полу, работает для регулирования экспрессии BZW2 в яичке . По всему телу BZW2 повсеместно экспрессируется в тканях. наблюдается повышение численности мРНК В сердце , плаценту и скелетные мышцы .
Уровень стенограммы
[ редактировать ]Существует четыре основных петли STEM в 5 'нетранслируемых и четырех в 3' нетранслируемой области, которые функционируют в регулировании уровня транскрипта. [ 13 ]
Уровни белка
[ редактировать ]BZW2 имеет множественные места фосфорилирования , ацетилирования , гликозилирования , сумоилирования и гликирования для регуляции. [ 14 ] Поскольку повышенная регуляция BZW2 приводит к нарушению клеточных процессов и тяжелым формам рака, посттрансляционные модификации для поддержания высококвалифицированного гена необходимы . Белок локализуется в цитоплазме и не имеет вероятных или подтвержденных ядерных или митохондриальных целевых пептидов .
Эволюция
[ редактировать ]BZW2 имеет один паралог, BZW1 , который сохраняется до растений. [ 15 ] Существуют ортологи BZW2 до пары видов бактерий. Самым отдаленным ортологом был микробактерий -серых . BZW2 содержит домен EIF5C, который также присутствует в EIF2BE , EIF4G , EIF5 и белка GAP, специфичный для EIF2. [ 16 ]
По сравнению с цитохромом C , быстро расходящимися белком и фибриногеном , медленно распределяющим белком, BZW2 имеет медленную скорректированную дивергенцию с течением времени, иллюстрируя сохранение и важность белка.
Взаимодействия
[ редактировать ]Известно, что BZW2 взаимодействует:
EIF2S2 и ORF4 работают над синтезом и воспроизведением BZW2. [ 17 ] PSTPIP1 и NEK4 являются регуляторными белками, которые помогают в функциональности BZW2. [ 18 ] [ 19 ] SNW1, белок сплайсосом, варианты мРНК Splices BZW2. [ 20 ] Белковый реп является частью вируса SARS-COV-2 и ингибирует трансляцию BZW2. [ 21 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Рак
[ редактировать ]BZW2 был изучен, чтобы определить его роль в нескольких раковых заболеваниях. В целом, все исследования показали, что активация BZW2 приводит к более тяжелым формам рака, более высокой скорости смертности и повышению вероятности повторения.
Исследование 2019 года было сосредоточено на влиянии BZW2 на колоректальный рак . [ 22 ] Он обнаружил, что активация BZW2 способствовала росту опухоли и оказывала последующую активацию на C-Myc , протоонкоген . Второе исследование с 2020 года определено, что эта активация также оказала положительное влияние на активацию пути ERK/MAPK . [ 23 ]
При гепатоцеллюлярной карциноме , остеосаркоме , аденокарциноме легких и раке мочевого пузыря , сверхэкспрессия BZW2 приводит к переоценке сигнального пути AKT/mTOR путем увеличения фосфорилирования AKT и mTOR . [ 24 ] [ 25 ] [ 26 ] [ 27 ] Путь AKT/mTOR является важным внутриклеточным сигнальным путем, который регулирует клеточный цикл . Когда активность пути увеличивается, клетки пролиферировались с более высокой скоростью, а апоптоз уменьшается, что приводит к росту опухоли.
SARS-Done-2
[ редактировать ]BZW2 взаимодействует с белком NSP8 SARS-COV-2 . NSP8 димеризует и образует суперкомплекс, который работает для подавления перевода BZW2.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000136261 - ENSEMBL , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000020547 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, et al. (Октябрь 2000). «Клонирование и функциональный анализ кДНК с открытыми кадрами считывания для 300 ранее неопределенных генов, экспрессируемых в CD34+ гемопоэтических стволовых/клетках -предшественниках» . Исследование генома . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
- ^ «Ген Entrez: BZW2 Основная лейциновая молния и домены W2» 2 » .
- ^ Jump up to: а беременный «BZW2 Basic Leucine Zipper и W2 -домены 2 [Homo sapiens (Human)] - ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2020-07-31 .
- ^ «Антитело BZW2 (PA5-21808)» . www.thermofisher.com . Получено 2020-07-31 .
- ^ "InterPro" . www.ebi.ac.uk. Получено 2020-08-01 .
- ^ Мадейра Ф., Парк Ю.М., Ли Дж, Бусто Н., Гур Т., Мадхусуданан Н. и др. (Июль 2019). «EMBL-EBI поиск и инструменты анализа последовательности API в 2019 году» . Исследование нуклеиновых кислот . 47 (W1): W636 - W641. doi : 10.1093/nar/gkz268 . PMC 6602479 . PMID 30976793 .
- ^ Келли Л.А., Мезулис С., Йейтс С.М., Васс М.Н., Стернберг М.Дж. (июнь 2015 г.). «Веб -портал Phyre2 для моделирования, прогнозирования и анализа белка» . Природные протоколы . 10 (6): 845–58. doi : 10.1038/nprot.2015.053 . PMC 5298202 . PMID 25950237 .
- ^ «Genomatix - анализ данных NGS и персонализированная медицина» . www.genomatix.de . Архивировано из оригинала 2001-02-24 . Получено 2020-07-31 .
- ^ Zuker M (июль 2003 г.). «Mfold Web Server для прогнозирования складывания нуклеиновых кислот и гибридизации» . Исследование нуклеиновых кислот . 31 (13): 3406–15. doi : 10.1093/nar/gkg595 . PMC 169194 . PMID 12824337 .
- ^ «Bzw2 (человек)» . www.phosphosite.org . Получено 2020-07-31 .
- ^ «Белковое взрыв: базы данных поиска белков с использованием белкового запроса» . blast.ncbi.nlm.nih.gov . Получено 2020-07-31 .
- ^ Koonin EV (август 1995). «Многодоменная организация эукариотических гуаниновых нуклеотидных переводов фактора инициации инициации EIF-2B выявлена путем анализа консервативных мотивов последовательности» . Белковая наука . 4 (8): 1608–17. doi : 10.1002/pro.5560040819 . PMC 2143190 . PMID 8520487 .
- ^ «Эукариотический фактор инициации трансляции 2 субъединица 2» . Uniprot . Архивировано из оригинала 2011-05-03.
- ^ «Пролин-серино-треонин-фосфатаза-взаимодействующий белок 1» . Uniprot . Архивировано из оригинала на 2009-09-25.
- ^ «Серин/треонин-белкотеинкиназа Nek4» . Uniprot . Архивировано из оригинала 2011-04-11.
- ^ "SNW-домен, содержащий белок 1" . Uniprot . Архивировано из оригинала 2011-04-12.
- ^ «Полипротеин 1 -й репликаз» . Uniprot . Архивировано из оригинала 2020-05-16.
- ^ Сато К., Масуда Т., Ху К, Тобо Т, Гилласпи С., Ниида А. и др. (Июнь 2019). «Новый онкоген 5MP1 перепрограммирует инициацию трансляции C-Myc для стимулирования злокачественных фенотипов при колоректальном раке» . ebiomedicine . 44 : 387–402. doi : 10.1016/j.ebiom.2019.05.058 . PMC 6606960 . PMID 31175057 .
- ^ Huang L, Chen S, Fan H, Ai F, Sheng W (май 2020). «BZW2 способствует злокачественному прогрессированию колоректального рака посредством активации пути ERK/MAPK». Журнал клеточной физиологии . 235 (5): 4834–4842. doi : 10.1002/jcp.29361 . PMID 31643092 . S2CID 204850013 .
- ^ Ченг Д.Д., Ли С.Дж., Чжу Б., Юань Т., Ян К.К., Фан -Си (октябрь 2017 г.). «Понижающая регуляция BZW2 ингибирует рост клеток остеосаркомы, инактивируя сигнальный путь AKT/mTOR» . Онкологические отчеты . 38 (4): 2116–2122. doi : 10.3892/или.2017.5890 . PMC 5652953 . PMID 28791373 .
- ^ Jin X, Liao M, Zhang L, Yang M, Zhao J (февраль 2019 г.). «Роль нового гена BZW2 в развитии гепатоцеллюлярной карциномы». Журнал клеточной физиологии . 234 (9): 16592–16600. doi : 10.1002/jcp.28331 . PMID 30805927 . S2CID 73473337 .
- ^ Dong Y, Liu Y, Bai H, Jiao S (апрель 2019 г.). «Систематическая оценка клинико -патологической прогностической значимости экспрессии тканевых цитокинов для аденокарциномы легких на основе интегративного анализа данных TCGA» . Научные отчеты . 9 (1): 6301. Bibcode : 2019natsr ... 9.6301d . doi : 10.1038/s41598-019-42345-0 . PMC 6474906 . PMID 31004093 .
- ^ Gao H, Yu G, Zhang X, Yu S, Sun Y, Li Y (июнь 2019). «Нокдаун гена BZW2 индуцирует ингибирование роста клеток, остановку G1 и апоптоз при раке мочевого пузыря мышц: анализ пути микрочипа» . Журнал клеточной и молекулярной медицины . 23 (6): 3905–3915. doi : 10.1111/jcmm.14266 . PMC 6533564 . PMID 30932331 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (январь 2005 г.). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005natur.433 ... 77a . doi : 10.1038/nature03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (ноябрь 2006 г.). «Глобальная динамика фосфорилирования в Global, in vivo и сайт в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .
- Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х, Тейлор П., Клили С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование взаимодействия белка белка человека с помощью масс-спектрометрии» . Биология молекулярных систем . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- человека BZW2 Расположение генома BZW2 и страница генов в браузере UCSC Genome .
 | Эта статья о гене о хромосоме человека 7 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |