УДФ-N-ацетилмурамоил-L-аланин-D-глутаматлигаза
УДФ- N -ацетилмурамоил- L -аланин- D -глутаматлигаза | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Номер ЕС. | 6.3.2.9 | ||
Номер CAS. | 9023-59-0 | ||
Базы данных | |||
ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
КЕГГ | КЕГГ запись | ||
МетаЦик | метаболический путь | ||
ПРЯМОЙ | профиль | ||
PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
|
В энзимологии УДФ - N -ацетилмурамоил- L -аланин -D -глутаматлигаза ( КФ 6.3.2.9 ) представляет собой фермент химическую , катализирующий реакцию .
- АТФ + УДФ-N-ацетилмурамоил-L-аланин + D-глутамат АДФ + фосфат + УДФ-N-ацетилмурамоил-L-аланил-D-глутамат
Тремя субстратами этого фермента являются АТФ , УДФ-N-ацетилмурамоил-L-аланин и D-глутамат , тогда как тремя его продуктами являются АДФ , фосфат и УДФ-N-ацетилмурамоил-L-аланил-D-глутамат .
Этот фермент принадлежит к семейству лигаз , в частности тех, которые образуют связи углерод-азот в виде лигаз кислота-D-аминокислота (пептидсинтазы). Систематическое название этого класса ферментов — УДФ-N-ацетилмурамоил-L-аланин:D-глутаматлигаза (АДФ-образующая) . Другие широко используемые названия включают MurD-синтетазу , UDP-N-ацетилмурамоил-L-аланил-D-глутаматсинтетазу , уридиндифосфо-N-ацетилмурамоилаланил-D-глутаматсинтетазу , фермент, добавляющий D-глутамат , D-глутаматлигазу , UDP- Mur-NAC-L-Ala:D-Glu лигаза , UDP-N-ацетилмурамоил-L-аланин:глутаматлигаза (АДФ-образующая) и UDP-N-ацетилмурамоилаланин-D-глутаматлигаза . Этот фермент участвует в метаболизме d-глутамина и d-глутамата, а также в биосинтезе пептидогликана .
Структурные исследования
[ редактировать ]По состоянию на конец 2007 года 9 структур для этого класса ферментов было решено PDB с кодами доступа 1E0D , 1EEH , 1UAG , 2JFF , 2JFG , 2JFH , 2UAG , 3UAG и 4UAG .
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- Ито, Э; Строминджер Дж. Л. (1962). «Ферментативный синтез пептида в бактериальных уридиннуклеотидах I. Ферментативное добавление L-аланина, D-глутаминовой кислоты и L-лизина». Ж. Биол. Хим . 237 : 2689–2695.
- ван Хейеноорт Дж. (октябрь 2001 г.). «Последние достижения в образовании мономерной единицы бактериального пептидогликана». Отчеты о натуральных продуктах . 18 (5): 503–19. дои : 10.1039/a804532a . ПМИД 11699883 .