Лигнинпероксидаза
| диарилпропанпероксидаза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 1.11.1.14 | ||
| Номер CAS. | 93792-13-3 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
В энзимологии лигнинпероксидаза КФ ( , 1.11.1.14 ) — фермент катализирующий реакцию химическую .
- 1,2-бис(3,4-диметоксифенил)пропан-1,3-диол + H 2 O 2 3,4-диметоксибензальдегид + 1-(3,4-диметоксифенил)этан-1,2-диол + H 2 O
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются 1,2-бис(3,4-диметоксифенил)пропан-1,3-диол и H 2 O 2 , тогда как тремя его продуктами являются 3,4-диметоксибензальдегид , 1-(3, 4-диметоксифенил)этан-1,2-диол и H 2 O .
Этот фермент принадлежит к семейству оксидоредуктаз , особенно тех, которые действуют на пероксид в качестве акцептора (пероксидазы), и может быть включен в широкую категорию лигниназ . Систематическое название этого класса ферментов — 1,2-бис(3,4-диметоксифенил)пропан-1,3-диол:перекись водорода оксидоредуктаза . Другие широко используемые названия включают диарилпропаноксигеназу , лигниназу I , диарилпропанпероксидазу , LiP , диарилпропан:кислород, оксидоредуктазу перекиси водорода (расщепляющую связь CC) . Он использует один кофактор , гем .
Фон
[ редактировать ]Лигнин обладает высокой устойчивостью к биоразложению, и только высшие грибы и некоторые бактерии способны разлагать полимер посредством окислительного процесса. Этот процесс широко изучался в течение последних двадцати лет, но механизм до сих пор полностью не выяснен.
Обнаружено, что лигнин разлагается ферментом лигнинпероксидазой, продуцируемым некоторыми грибами, такими как Phanerochaete chrysosporium . Механизм взаимодействия лигнинпероксидазы (LiP) с полимером лигнина включает вератроловый спирт , который является вторичным метаболитом грибов белой гнили и действует как кофактор для фермента.
Структурные исследования
[ редактировать ]По состоянию на конец 2007 года 3 структуры для этого класса ферментов были решены PDB с кодами доступа 1B80 , 1B82 и 1B85 .
Ссылки
[ редактировать ]- КЕЛ Эрикссон; Р. А. Бланшетт; П. Андер (1990). Микробная и ферментативная деградация древесины и ее компонентов . Спрингер-Верлаг.
- Ханс Э. Шумейкер; Клаус Пионтек (1996). «О взаимодействии лигнинпероксидазы с лигнином» . Чистая и прикладная химия . 68 (11): 2089–96. дои : 10.1351/pac199668112089 . S2CID 34951982 .
- Пащинский А; Хюнь В.Б.; Кроуфорд Р. (1986). «Сравнение лигниназы-I и пероксидазы-М2 гриба белой гнили Phanerochaete chrysosporium». Арх. Биохим. Биофиз . 244 (2): 750–65. дои : 10.1016/0003-9861(86)90644-2 . ПМИД 3080953 .
- Ренганатан V; Мики К; Золото МХ (1985). «Множественные молекулярные формы диарилпропаноксигеназы, требующего H2O2 фермента, разлагающего лигнин, из Phanerochaete chrysosporium». Арх. Биохим. Биофиз . 241 (1): 304–14. дои : 10.1016/0003-9861(85)90387-X . ПМИД 4026322 .
- Тянь М; Кирк Т.Т. (1984). «Разлагающий лигнин фермент из Phanerochaete chrysosporium. Очистка, характеристика и каталитические свойства уникальной H2O2-требующей оксигеназы» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 81 (8): 2280–2284. Бибкод : 1984PNAS...81.2280T . дои : 10.1073/pnas.81.8.2280 . ПМК 345042 . ПМИД 16593451 .
- Дойл В.А., Блодиг В., Вейтч Н.К., Пионтек К., Смит А.Т. (1998). «Два сайта взаимодействия субстрата в лигнинпероксидазе, выявленные с помощью сайт-направленного мутагенеза». Биохимия . 37 (43): 15097–105. дои : 10.1021/bi981633h . ПМИД 9790672 .
- Варииси Х., Маркес Л., Данфорд Х.Б., Голд М.Х. (1990). «Соединения лигнинпероксидазы II и III. Спектральная и кинетическая характеристика реакций с пероксидами» . Ж. Биол. Хим . 265 (19): 11137–42. дои : 10.1016/S0021-9258(19)38568-0 . ПМИД 2162833 .
- Цай Д.Ю., Тьен М. (1990). «Характеристика оксикомплекса лигнинпероксидаз Phanerochaete chrysosporium: исследования равновесия и кинетики». Биохимия . 29 (8): 2085–91. дои : 10.1021/bi00460a018 . ПМИД 2328240 .
- Тянь М, Ту КП (1987). «Клонирование и секвенирование кДНК лигниназы Phanerochaete chrysosporium». Природа . 326 (6112): 520–3. Бибкод : 1987Natur.326..520T . дои : 10.1038/326520a0 . ПМИД 3561490 . S2CID 4321253 .
- Ренганатан В., Мики К., Голд М.Х. (1986). «Роль молекулярного кислорода в реакциях лигнинпероксидазы». Арх. Биохим. Биофиз . 246 (1): 155–61. дои : 10.1016/0003-9861(86)90459-5 . ПМИД 3754412 .
- Керстен П.Дж., Тьен М., Кальянараман Б., Кирк Т.К. (1985). «Лигиназа Phanerochaete chrysosporium генерирует катион-радикалы из метоксибензолов» . Ж. Биол. Хим . 260 (5): 2609–12. дои : 10.1016/S0021-9258(18)89401-7 . ПМИД 2982828 .
- Кирк Т.К., Фаррелл Р.Л. (1987). «Ферментативное «горение»: микробная деградация лигнина» . Анну. Преподобный Микробиол . 41 : 465–505. дои : 10.1146/annurev.mi.41.100187.002341 . ПМИД 3318677 .
