PRDX5
| PRDX5 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | PRDX5 , ACR1, AOEB166, B166, HEL-S-55, PLP, PMP20, PRDX6, PRXV, prx-V, SBBI10, пероксиредоксин 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 606583 ; МГИ : 1859821 ; Гомологен : 8076 ; Генные карты : PRDX5 ; OMA : PRDX5 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Пероксиредоксин-5 (PRDX5), митохондриальный, представляет собой белок , который у человека кодируется PRDX5 геном , расположенным на хромосоме 11. [ 5 ]
Этот ген кодирует члена шестичленного ферментов пероксиредоксина семейства антиоксидантных . Как и другие пять членов, PRDX5 широко экспрессируется в тканях, но отличается большим субклеточным распределением. [ 6 ] В клетках человека было показано, что PRDX5 может локализоваться в митохондриях , пероксисомах , цитозоле и ядре . [ 7 ] PRDX5 человека идентифицируется на основании гомологий последовательности дрожжевого пероксисомального антиоксидантного фермента PMP20. [ 6 ] [ 8 ]
Биохимически PRDX5 представляет собой пероксидазу, которая может использовать цитозольные или митохондриальные тиоредоксины для восстановления алкилгидропероксидов или пероксинитрита с высокими константами скорости в 10 6 до 10 7 М −1 с −1 диапазоне, тогда как его реакция с перекисью водорода более скромна, в диапазоне 10 5 М −1 с −1 диапазон. [ 7 ] На данный момент было показано, что PRDX5 является цитопротекторным антиоксидантным ферментом, который ингибирует накопление эндогенного или экзогенного пероксида . [ 7 ]
Структура
[ редактировать ]По своей аминокислотной последовательности этот 2-Cys-пероксиредоксин, PRDX5, является наиболее дивергентной изоформой среди пероксиредоксинов млекопитающих, обеспечивая лишь 28-30% идентичности последовательности с типичными 2-Cys и 1-Cys пероксиредоксинами. [ 9 ] Отличающаяся аминокислотная последовательность этого атипичного пероксиредоксина отражена в его уникальной кристаллической структуре. Типичный пероксиредоксин состоит из тиоредоксинового домена и C-конца, тогда как PRDX5 имеет N-концевой домен, а уникальная альфа-спираль заменяет петлеобразную структуру в типичном тиоредоксиновом домене. [ 7 ] Кроме того, типичные 2-Cys или 1-Cys пероксиредоксины связаны как антипараллельные димеры посредством связывания двух бета-7-цепей, тогда как димер PRDX5 образуется в результате тесного контакта между альфа-3-спиралью одной молекулы и альфа-5-спираль от другой молекулы. [ 7 ]
Функция
[ редактировать ]Как пероксиредоксин, PRDX5 выполняет антиоксидантные и цитопротекторные функции во время окислительного стресса. Было показано, что сверхэкспрессия человеческого PRDX5 ингибирует накопление пероксида, индуцированное TNF-альфа , PDGF и p53, в клетках NIH3T3 и HeLa , а также снижает гибель клеток под действием экзогенного пероксида во многих органеллах CHO , HT-22 и клетках сухожилий человека. [ 6 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] Между тем, снижение экспрессии PRDX5 индуцирует восприимчивость клеток к окислительному повреждению и этопозиду , доксорубицину , MPP. + , индуцированный перекисью и апоптоз . [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] Кроме того, экспрессия PRDX5 человека в других организмах или тканях, таких как дрожжи, мозг мыши и эмбрионы Xenopus, также приводит к защите от окислительного стресса. [ 18 ] [ 19 ] [ 20 ] Было показано, что PRDX5 у Drosophila melanogaster способствует долголетию в дополнение к антиоксидантной активности. [ 21 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Обследовав 98 пациентов с инсультом , Kunze et al. показали обратную корреляцию между прогрессированием инсульта и концентрацией PRDX5, что позволяет предположить, что PRDX5 в плазме может быть потенциальным биомаркером воспаления при остром инсульте. [ 22 ] В клетках рака молочной железы человека нокдаун фактора транскрипции GATA1 привел к увеличению экспрессии PRDX5 и ингибированию апоптоза. [ 10 ] Существенное увеличение экспрессии PRDX5 наблюдалось в астроцитах при рассеянном склерозе . [ 23 ] PRDX5 также был идентифицирован как кандидатный ген риска воспалительного заболевания саркоидоза . [ 24 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Белок 1, связывающий фактор транскрипции GATA, может связываться с геном PRDX5 и приводить к усилению экспрессии PRDX5. [ 10 ] Было показано, что PRDX5 физически взаимодействует с PRDX1, PRDX2, PRDX6, SOD1 и PARK7 по крайней мере в двух независимых высокопроизводительных протеомных анализах. [ 25 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000126432 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024953 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «PRDX5 пероксиредоксин 5 [Homo sapiens (человек)]» . НКБИ . Проверено 19 июля 2016 г.
- ^ Перейти обратно: а б с Чжоу Ю, Кок КХ, Чун А.С., Вонг СМ, Ву ХВ, Линь МК, Фунг ПК, Кунг Х, Джин ДЮ (февраль 2000 г.). «Мышиный пероксиредоксин V представляет собой тиоредоксинпероксидазу, которая ингибирует апоптоз, индуцированный р53». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 268 (3): 921–7. дои : 10.1006/bbrc.2000.2231 . ПМИД 10679306 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Кноупс Б., Гоэмер Дж., Ван дер Экен В., Деклерк Дж. П. (август 2011 г.). «Пероксиредоксин 5: структура, механизм и функция атипичного 2-цис-пероксиредоксина млекопитающих». Антиоксиданты и окислительно-восстановительная сигнализация . 15 (3): 817–29. дои : 10.1089/ars.2010.3584 . ПМИД 20977338 .
- ^ Ямасита Х., Авраам С., Цзян С., Лондон Р., Ван Вельдховен П.П., Субрамани С., Роджерс Р.А., Авраам Х. (октябрь 1999 г.). «Характеристика пероксисомальных белков PMP20 человека и мыши, которые проявляют антиоксидантную активность in vitro» . Журнал биологической химии . 274 (42): 29897–904. дои : 10.1074/jbc.274.42.29897 . ПМИД 10514471 .
- ^ Лейенс Г., Донней И., Кноупс Б. (декабрь 2003 г.). «Клонирование экспрессии гена бычьего пероксиредоксина в тканях крупного рогатого скота и сравнение аминокислотной последовательности с пероксиредоксинами крыс, мышей и приматов». Сравнительная биохимия и физиология. Часть B. Биохимия и молекулярная биология . 136 (4): 943–55. дои : 10.1016/S1096-4959(03)00290-2 . ПМИД 14662316 .
- ^ Перейти обратно: а б с Со М.С., Кан С.В., Ким К., Бейнс И.С., Ли Т.Х., Ри С.Г. (июль 2000 г.). «Идентификация нового типа пероксиредоксина млекопитающих, который образует внутримолекулярный дисульфид в качестве промежуточного продукта реакции» . Журнал биологической химии . 275 (27): 20346–54. дои : 10.1074/jbc.M001943200 . ПМИД 10751410 .
- ^ Зитцлер Дж., Линк Д., Шефер Р., Либетрау В., Казински М., Бонин-Дебс А., Бел С., Бакель П., Бринкманн У. (август 2004 г.). «Высокопроизводительная функциональная геномика идентифицирует гены, которые снижают токсичность, вызванную окислительным стрессом, в нейрональных клетках HT-22: GFPT2 защищает клетки от перекиси» . Молекулярная и клеточная протеомика . 3 (8): 834–40. дои : 10.1074/mcp.M400054-MCP200 . ПМИД 15181156 .
- ^ Банмейер И., Маршан С., Верхаге С., Вучич Б., Рис Дж. Ф., Кноупс Б. (январь 2004 г.). «Сверхэкспрессия человеческого пероксиредоксина 5 в субклеточных компартментах клеток яичника китайского хомячка: влияние на цитотоксичность и повреждение ДНК, вызванное пероксидами». Свободно-радикальная биология и медицина . 36 (1): 65–77. doi : 10.1016/j.freeradbiomed.2003.10.019 . ПМИД 14732291 .
- ^ Юань Дж., Мюррелл Г.А., Трикетт А., Ландтметрс М., Кноупс Б., Ван М.Х. (июль 2004 г.). «Сверхэкспрессия антиоксидантного фермента пероксиредоксина 5 защищает клетки сухожилий человека от апоптоза и потери клеточных функций во время окислительного стресса». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1693 (1): 37–45. дои : 10.1016/j.bbamcr.2004.04.006 . ПМИД 15276323 .
- ^ Avila PC, Kropotov AV, Krutilina R, Krasnodembskay A, Tomilin NV, Serikov VB (2008). "Peroxiredoxin V contributes to antioxidant defense of lung epithelial cells". Lung . 186 (2): 103–14. doi : 10.1007/s00408-007-9066-2 . PMID 18219526 . S2CID 22699804 .
- ^ Де Симони С., Гоэмере Дж., Кноупс Б. (март 2008 г.). «Замалчивание пероксиредоксина 3 и пероксиредоксина 5 раскрывает роль митохондриальных пероксиредоксинов в защите клеток нейробластомы человека SH-SY5Y от MPP. + ". Neuroscience Letters . 433 (3): 219–24. doi : 10.1016/ . PMID 18262354. . S2CID 44405952 j.neulet.2007.12.068
- ^ Кропотов А, Гогвадзе В, Шупляков О, Томилин Н, Сериков ВБ, Томилин НВ, Животовский Б (сентябрь 2006 г.). «Пероксиредоксин V необходим для защиты от апоптоза в клетках карциномы легких человека». Экспериментальные исследования клеток . 312 (15): 2806–15. doi : 10.1016/j.yexcr.2006.05.006 . ПМИД 16781710 .
- ^ Сериков В.Б., Лейтенеггер С., Крутилина Р., Кропотов А., Плескач Н., Сух Ю.Х., Томилин Н.В. (январь 2006 г.). «Экстракт сигаретного дыма ингибирует экспрессию пероксиредоксина V и увеличивает проницаемость эпителия дыхательных путей». Ингаляционная токсикология . 18 (1): 79–92. Бибкод : 2006InhTx..18...79S . дои : 10.1080/08958370500282506 . ПМИД 16326404 . S2CID 24148404 .
- ^ Тьен Нгуен-ню Н., Кноупс Б. (июнь 2003 г.). «Митохондриальная и цитозольная экспрессия человеческого пероксиредоксина 5 в Saccharomyces cerevisiae защищает дрожжевые клетки от окислительного стресса, вызванного паракватом» . Письма ФЭБС . 544 (1–3): 148–52. дои : 10.1016/s0014-5793(03)00493-9 . ПМИД 12782306 . S2CID 9007934 .
- ^ Плезант Ф., Клипп А., Вандер Стрихт Д., Кноупс Б., Грессенс П. (апрель 2003 г.). «Рекомбинантный пероксиредоксин 5 защищает от эксайтотоксических поражений головного мозга у новорожденных мышей». Свободно-радикальная биология и медицина . 34 (7): 862–72. дои : 10.1016/s0891-5849(02)01440-5 . ПМИД 12654475 .
- ^ Пэн Ю, Ян ПХ, Го Ю, Нг СС, Лю Дж, Фунг ПК, Тай Д, Ге Дж, Хэ МЛ, Кунг ХФ, Линь MC (январь 2004 г.). «Каталаза и пероксиредоксин 5 защищают эмбрионы Xenopus от вызванных алкоголем глазных аномалий» . Исследовательская офтальмология и визуальные науки . 45 (1): 23–9. дои : 10.1167/iovs.03-0550 . hdl : 10722/54210 . ПМИД 14691149 .
- ^ Радюк С.Н., Михалак К., Кличко В.И., Бенеш Дж., Ребрин И., Сохал Р.С., Орр В.К. (апрель 2009 г.). «Пероксиредоксин 5 обеспечивает защиту от окислительного стресса и апоптоза, а также способствует долголетию дрозофилы» . Биохимический журнал . 419 (2): 437–45. дои : 10.1042/BJ20082003 . ПМЦ 2842572 . ПМИД 19128239 .
- ^ Кунце А., Зират Д., Танзи П., Каин К., Беккер К. (февраль 2014 г.). «Пероксиредоксин 5 (PRX5) обратно коррелирует с системными маркерами воспаления при остром инсульте» . Гладить . 45 (2): 608–10. дои : 10.1161/СТРОКЕАХА.113.003813 . ПМЦ 3946812 . ПМИД 24385276 .
- ^ Холли Дж. Э., Ньюкомб Дж., Виньярд П.Г., Гутовски, Нью-Джерси (сентябрь 2007 г.). «Пероксиредоксин V при поражениях рассеянного склероза: преобладающая экспрессия астроцитами». Рассеянный склероз . 13 (8): 955–61. дои : 10.1177/1352458507078064 . ПМИД 17623739 . S2CID 19626529 .
- ^ Фишер А, Шмид Б, Эллингхаус Д, Нотнагель М, Геде К.И., Шюрманн М., Липински С., Розенштиль П., Зиссель Г., Хёне К., Петрек М., Колек В., Пабст С., Гроэ С., Грюневальд Дж., Роннингер М., Эклунд А. , Падюков Л., Гигер С., Вихманн Х.Э., Небель А., Франке А., Мюллер-Квернхайм Дж., Хофманн С., Шрайбер С. (ноябрь 2012 г.). «Новый локус риска саркоидоза у европейцев на хромосоме 11q13.1». Американский журнал респираторной медицины и медицины интенсивной терапии . 186 (9): 877–85. doi : 10.1164/rccm.201204-0708OC . ПМИД 22837380 .
- ^ Лаборатория МТ. «Сводка результатов PRDX5 (SBBI10) | BioGRID» . thebiogrid.org . Проверено 19 июля 2016 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Вуд З.А., Шредер Э., Робин Харрис Дж., Пул Л.Б. (январь 2003 г.). «Структура, механизм и регуляция пероксиредоксинов». Тенденции биохимических наук . 28 (1): 32–40. дои : 10.1016/S0968-0004(02)00003-8 . ПМИД 12517450 .
- Хохштрассер Д.Ф., Фрутигер С., Паке Н., Байрох А., Равье Ф., Паскуали К., Санчес Х.К., Тиссо Дж.Д., Бьелквист Б., Варгас Р. (декабрь 1992 г.). «Карта белков печени человека: справочная база данных, созданная путем микросеквенирования и сравнения гелей». Электрофорез . 13 (12): 992–1001. дои : 10.1002/elps.11501301201 . ПМИД 1286669 . S2CID 23518983 .
- Кропотов А, Седова В, Иванов В, Сазеева Н, Томилин А, Крутилина Р, Оэй С.Л, Гризенбек Дж, Бухлоу Г, Томилин Н (март 1999 г.). «Новый ДНК-связывающий белок человека со сходством последовательностей с подсемейством окислительно-восстановительных белков, который способен подавлять управляемую РНК-полимеразой-III транскрипцию ретропозонов семейства Alu in vitro» . Европейский журнал биохимии . 260 (2): 336–46. дои : 10.1046/j.1432-1327.1999.00162.x . ПМИД 10095767 .
- Ваттиз Р., Херманс С., Бернар А., Лесур О., Фальмань П. (июнь 1999 г.). «Жидкость бронхоальвеолярного лаважа человека: двумерный гель-электрофорез, микросеквенирование аминокислот и идентификация основных белков». Электрофорез . 20 (7): 1634–45. doi : 10.1002/(SICI)1522-2683(19990601)20:7<1634::AID-ELPS1634>3.0.CO;2-J . ПМИД 10424490 . S2CID 485171 .
- Чжоу Ю, Кок КХ, Чун А.С., Вонг СМ, Ву ХВ, Линь МК, Фунг ПК, Кунг Х, Джин ДЮ (февраль 2000 г.). «Мышиный пероксиредоксин V представляет собой тиоредоксинпероксидазу, которая ингибирует апоптоз, индуцированный р53». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 268 (3): 921–7. дои : 10.1006/bbrc.2000.2231 . ПМИД 10679306 .
- Со М.С., Кан С.В., Ким К., Бейнс И.С., Ли Т.Х., Ри С.Г. (июль 2000 г.). «Идентификация нового типа пероксиредоксина млекопитающих, который образует внутримолекулярный дисульфид в качестве промежуточного продукта реакции» . Журнал биологической химии . 275 (27): 20346–54. дои : 10.1074/jbc.M001943200 . ПМИД 10751410 .
- Ху RM, Хань ЗГ, Сонг HD, Пэн Ю.Д., Хуан QH, Рен SX, Гу YJ, Хуан Ч., Ли Ю.Б., Цзян CL, Фу Г, Чжан QH, Гу Б.В., Дай М, Мао Ю.Ф., Гао Г.Ф., Ронг Р. , Е М, Чжоу Дж, Сюй Ш, Гу Дж, Ши JX, Цзинь В.Р., Чжан С.К., Ву ТМ, Хуан Г.И., Чэнь Z, Чен М.Д., Чен Дж.Л. (август 2000 г.). «Профилирование экспрессии генов в системе гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и полноразмерное клонирование кДНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (17): 9543–8. Бибкод : 2000PNAS...97.9543H . дои : 10.1073/pnas.160270997 . JSTOR 123500 . ПМК 16901 . ПМИД 10931946 .
- Деклерк Дж.П., Эврард С., Клипп А., Стрихт Д.В., Бернард А., Кноупс Б. (август 2001 г.). «Кристаллическая структура пероксиредоксина человека 5, нового типа пероксиредоксина млекопитающих с разрешением 1,5 А» . Журнал молекулярной биологии . 311 (4): 751–759. CiteSeerX 10.1.1.897.4685 . дои : 10.1006/jmbi.2001.4853 . ПМИД 11518528 .
- Руье Н., Гелхай Э., Жако Дж. П. (апрель 2002 г.). «Глутаредоксин-зависимый пероксиредоксин из тополя: белок-белковое взаимодействие и каталитический механизм» . Журнал биологической химии . 277 (16): 13609–14. дои : 10.1074/jbc.M111489200 . ПМИД 11832487 .
- Ван М.Х., Вэй А., Юань Дж., Трикетт А., Кноупс Б., Мюррелл Г.А. (ноябрь 2002 г.). «Экспрессия и регуляция пероксиредоксина 5 при остеоартрите человека». Письма ФЭБС . 531 (2): 359–62. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03511-1 . ПМИД 12417342 . S2CID 35182875 .
- Лейенс Г., Донней И., Кноупс Б. (декабрь 2003 г.). «Клонирование экспрессии гена бычьего пероксиредоксина в тканях крупного рогатого скота и сравнение аминокислотной последовательности с пероксиредоксинами крыс, мышей и приматов». Сравнительная биохимия и физиология. Часть B. Биохимия и молекулярная биология . 136 (4): 943–55. дои : 10.1016/S1096-4959(03)00290-2 . ПМИД 14662316 .
- Банмейер И., Маршан С., Верхаге С., Вучич Б., Рис Дж. Ф., Кноупс Б. (январь 2004 г.). «Сверхэкспрессия человеческого пероксиредоксина 5 в субклеточных компартментах клеток яичника китайского хомячка: влияние на цитотоксичность и повреждение ДНК, вызванное пероксидами». Свободно-радикальная биология и медицина . 36 (1): 65–77. doi : 10.1016/j.freeradbiomed.2003.10.019 . ПМИД 14732291 .
- Салмон М., Дедессю Ле Мутье Дж., Вендерс Ф., Кьяриция С., Элиаерс Ф., Ремакл Дж., Ройер В., Паскаль Т., Туссен О. (январь 2004 г.). «Роль PLA2-независимой активности пероксиредоксина VI в выживании иммортализованных фибробластов, подвергшихся цитотоксическому окислительному стрессу». Письма ФЭБС . 557 (1–3): 26–32. дои : 10.1016/S0014-5793(03)01437-6 . ПМИД 14741336 . S2CID 9208097 .
- Эврар С., Капрон А., Маршан С., Клипп А., Ваттиз Р., Сумиллион П., Кноупс Б., Деклерк Дж. П. (апрель 2004 г.). «Кристаллическая структура димерной окисленной формы пероксиредоксина человека 5» . Журнал молекулярной биологии . 337 (5): 1079–90. дои : 10.1016/j.jmb.2004.02.017 . hdl : 2268/64083 . ПМИД 15046979 .
- Юань Дж., Мюррелл Г.А., Трикетт А., Ландтметрс М., Кноупс Б., Ван М.Х. (июль 2004 г.). «Сверхэкспрессия антиоксидантного фермента пероксиредоксина 5 защищает клетки сухожилий человека от апоптоза и потери клеточных функций во время окислительного стресса». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1693 (1): 37–45. дои : 10.1016/j.bbamcr.2004.04.006 . ПМИД 15276323 .
- Дюбюиссон М., Вандер Стрихт Д., Клипп А., Этьен Ф., Наузер Т., Кисснер Р., Коппенол В.Х., Рис Дж.Ф., Кноупс Б. (июль 2004 г.). «Человеческий пероксиредоксин 5 представляет собой пероксинитритредуктазу» . Письма ФЭБС . 571 (1–3): 161–5. doi : 10.1016/j.febslet.2004.06.080 . ПМИД 15280035 . S2CID 29085993 .
галерея PDB |
|---|
