Международный консорциум генома рака

Международный консорциум генома рака ( ICGC ) — это добровольная научная организация, которая предоставляет форум для сотрудничества между ведущими мировыми исследователями рака и геномики. ICGC был создан в 2008 году для координации крупномасштабных исследований генома рака в опухолях 50 типов и/или подтипов рака, которые имеют первостепенное значение во всем мире.

Систематические исследования более 25 000 раковых геномов на геномном , эпигеномном и транскриптомном уровнях позволят выявить репертуар онкогенных мутаций, выявить следы мутагенных влияний, определить клинически значимые подтипы для прогноза и терапевтического лечения, а также позволят разработать новые методы лечения рака. ^[1]

ICGC включает данные из Атласа генома рака (TCGA) и проекта генома рака Сэнгера.

Профессор Эндрю Бианкин А.О., региональный профессор и директор Онкологического исследовательского центра Вольфсона-Воля при Университете Глазго, является исполнительным директором и председателем с 2018 года. ^[2]

Цели

ICGC является одним из самых амбициозных проектов биомедицинских исследований со времен проекта «Геном человека» . Консорциум поможет координировать текущие и будущие крупномасштабные проекты, чтобы понять геномные изменения, связанные с раком, вызывающим глобальную обеспокоенность. Каталоги, подготовленные членами ICGC, будут быстро и бесплатно доступны квалифицированным исследователям, что позволит ученым всего мира использовать новую информацию для разработки более эффективных способов диагностики, лечения и профилактики многих видов рака. ^{[ нужна ссылка ]}

Целью ICGC является предоставление всестороннего описания соматических (ненаследственных) геномных аномалий, присутствующих в широком спектре опухолей человека. Учитывая наши текущие знания о гетерогенности типов и подтипов опухолей, ICGC поставил перед собой цель координировать примерно 50 проектов, каждый из которых будет проводить геномный анализ примерно 500 образцов рака каждого класса. Однако общепризнано, что рак весьма гетерогенен и можно выделить сотни типов/подтипов. Таким образом, заявленная цель 50 проектов ICGC не предназначена и не может исчерпывающе охватить весь спектр типов рака. ^{[ нужна ссылка ]}

Члены отдела финансирования и исследований ICGC, предлагающие проект, должны согласиться с политикой ICGC, которая включает требования к быстрому выпуску данных, строгим стандартам качества и защите участников исследования. ^{[ нужна ссылка ]}

Структура и финансирование

ICGC финансируется странами-участницами, каждая из которых занимается одной или несколькими формами рака с целью картирования геномов как минимум 50 типов рака. ^[3] Секретариат консорциума находится в Институте исследований рака Онтарио в Торонто , Канада. ^[4] который также будет управлять центром координации данных. Правительство провинции Онтарио предоставило финансирование в размере 40 миллионов долларов США, и ожидается, что каждый участвующий финансирующий член внесет 20 миллионов долларов США в каждый проект. В 2009 году немецкая организация по борьбе с раком поддержала один проект ICGC на сумму 7,9 миллиона евро. Это была самая большая сумма, предоставленная частной организацией. Деньги пожертвованы немцами. ^{[ нужна ссылка ]}

Членство в ICGC открыто для всех организаций, которые согласны следовать его принципам и руководящим принципам. ICGC получил обязательства от финансирующих организаций в Азии, Австралии, Европе и Северной Америке для 47 проектных групп в 15 юрисдикциях по изучению более 21 000 геномов опухолей. Проекты, которые в настоящее время финансируются, исследуют опухоли, поражающие мочевой пузырь, кровь, кости, мозг, грудь, шейку матки, толстую кишку, голову и шею, почки, печень, легкие, полость рта, яичники, поджелудочную железу, простату, прямую кишку, кожу, мягкие ткани, желудок, щитовидная железа и матка. Ожидается, что со временем к ICGC присоединятся новые страны и организации. Геномные анализы опухолей, проведенные членами ICGC в Австралии и Канаде (рак поджелудочной железы), Китае (рак желудка), Франции (рак печени), Германии (рак головного мозга), Японии (рак печени), Испании (рак крови), Великобритании (рак крови, молочной железы, легких и кожи) и США (рак крови, головного мозга, молочной железы, толстой кишки, почек, легких, яичников, прямой кишки, желудка и матки) теперь доступны через Центр координации данных, расположенный на веб-сайте ICGC. ^{[ нужна ссылка ]}

Члены исполнительного комитета

Австралия: Уорвик Андерсон, Национальный совет по здравоохранению и медицинским исследованиям.
Канада: Томас Хадсон , Институт исследования рака Онтарио , Сьюзан Ланглуа, Канадский рак простаты и Синди Белл, Геном, Канада.
Китай: Генри Ян и Юён Лу, Китайский консорциум генома рака
Европейская комиссия: Жак Ремакль, Патрик Колар и Ииро Ээрола
Франция: Фабьен Кальво, Национальный институт рака (INCa)
Германия: Аксель Арец и Франк Лаплас, Федеральное министерство образования и исследований . Герд Неттековен , Deutsche Krebshilfe ( Немецкая помощь больным раком ), основанная Милдред Шеель в Бонне и Берлине .
Индия: М.К. Бхан и Т.С. Рао, Министерство науки и технологий , Департамент биотехнологии.
Италия: Мария Кристина Фальвелла, Министерство образования, университетов и исследований Италии (MIUR) и Веронский университет Джампаоло Тортора.
Япония: Соноко Ватанабэ, RIKEN , Тацухиро Сибата, Национальный онкологический центр Сатико Суэмацу, Рие Цучида и Хидео Ино, Национальный институт биомедицинских инноваций.
Мексика: Институт здоровья Мигеля Бетанкура Карлоса Слима
Саудовская Аравия: Султана бин Турки Аль Седайри имени короля Фейсала Специализированная больница и исследовательский центр имени
Южная Корея: Национальный центр геномики рака Хюнг-Лэ Ким , Национальный проект персонализированной геномной медицины, Министерство здравоохранения и социального обеспечения Южной Кореи.
Испания: Элиас Кампо и Роза Родригес Бернабе, Министерство науки и инноваций Испании
Великобритания: Майкл Данн и Майкл Стрэттон , The Wellcome Trust Sanger Institute
Великобритания: Дэвид Скотт и Ник Джонс, Cancer Research UK
США: Жан-Клод Зенклузен и Луи Стаудт, Национальный институт рака, Эрик Грин и Кэролин Хаттер, Национальный институт исследования генома человека .

Великобритания: Розалинд Илес, Институт исследования рака.
США: Оливер Элементо, Институт точной медицины Англии , Weill Cornell Medicine.
Южная Корея: Кю-Сунг Ли, Исследовательский медицинский центр Samsung , Медицинский факультет Университета Сунгюнкван
Южная Корея: Ын Сук Ли, Национальный онкологический центр
Китай: Хуанмин Ян, BGI Genomics
Южная Корея: Больница Сеульского национального университета Сунг-Су Юн , Медицинский колледж Сеульского национального университета
Такаюки Ёсино Япония: Восточная больница Национального онкологического центра
Китай: Центр медицинских наук Пекинского университета Циминь Чжан

Представители со статусом наблюдателя:

Гонконг: Джозеф Ли, Гонконгский университет науки и технологий

Текущие исследовательские проекты

В каждой стране-участнице в качестве основной цели исследования указан определенный тип опухоли: ^[5]

Австралия: рак поджелудочной железы – протоковая аденокарцинома и рак яичников – серозная цистаденокарцинома ^[6]
Канада: рак поджелудочной железы – протоковая аденокарцинома и рак предстательной железы – аденокарцинома.
Китай: Рак желудка – кишечного и диффузного типа.
Европейский Союз /Франция: Рак почки – Почечноклеточная карцинома (Особое внимание, помимо прочего, подтипу светлых клеток)
Европейский Союз/Великобритания: Рак молочной железы – ER+ve, HER2-ve
Франция: Рак молочной железы – подтип, определяемый амплификацией HER2 . гена
Франция: Рак печени – гепатоцеллюлярная карцинома (вторичная по отношению к алкоголю и ожирению)
Германия: детские опухоли головного мозга – медуллобластома , пилоцитарная астроцитома у детей , злокачественная лимфома и рак простаты. ^[7]
Индия: Рак полости рта – деснево-буккальный.
Италия: Редкие опухоли поджелудочной железы – Энтеропанкреатические эндокринные опухоли и редкие экзокринные опухоли поджелудочной железы.
Япония: рак печени – гепатоцеллюлярная карцинома (вирус-ассоциированная).
Испания: Хронический лимфоцитарный лейкоз – ХЛЛ с мутированными и немутированными IgVH
Великобритания: рак молочной железы – тройной негативный/дольковый/другой
Соединенные Штаты: плоскоклеточный рак легкого , папиллярный рак почки , светлоклеточный рак почки , проток молочной железы , рак шейки почечно-клеточный рак , матки (плоскоклеточный), аденокарцинома толстой кишки , аденокарцинома желудка , рак прямой кишки , гепатоцеллюлярный рак , плоскоклеточный рак головы и шеи (оральный). клеточная карцинома, рак щитовидной железы , уротелиальный рак мочевого пузыря – непапиллярный, тело матки ( карцинома эндометрия ), аденокарцинома протоков поджелудочной железы , острый миелолейкоз , аденокарцинома простаты , аденокарцинома легких , меланома кожи , дольковый рак молочной железы и глиома нижней степени злокачественности , карцинома пищевода , серозная киста яичника нокарцинома , плоскоклеточная карцинома легких , адренокортикальная карцинома , диффузная крупноклеточная В-клеточная лимфома , параганглиома и феохромоцитома , холангиокарцинома , карциносаркома матки , увеальная меланома , тимома , саркома , мезотелиома и рак половых клеток яичка.

Будущая работа

ICGCmed

В контексте масштабных международных усилий по секвенированию и в преддверии новой эры точной медицины Международный медицинский консорциум генома рака (ICGCmed) объединит богатство уже накопленных геномных данных, а также новые генерируемые геномные данные, чтобы клиническая и медицинская информация, включая образ жизни, историю болезни пациентов, данные диагностики рака, а также реакцию на терапию и выживаемость после нее по всему спектру рака. Используя эти крупномасштабные интегрированные данные, исследователи, ученые, политики и врачи смогут работать с пациентами, поставщиками медицинских услуг и другими лицами над разработкой профилактических стратегий, маркеров для раннего выявления заболеваний, более конкретных критериев и методов диагностики и прогнозирования, а также разработки более конкретных критериев и методов диагностики и прогнозирования. вмешательства, основанные на сопоставлении молекулярного подтипа заболевания пациента с наиболее эффективными комбинациями методов лечения.

Это приведет к открытию новых терапевтических целей, более точным определениям заболеваний и усовершенствованным стратегиям предотвращения лекарственной устойчивости.

См. также

Ссылки

^ Хадсон Т.Дж. и др. (апрель 2010 г.). «Международная сеть проектов генома рака» . Природа . 464 (7291): 993–8. Бибкод : 2010Natur.464..993T . дои : 10.1038/nature08987 . ПМЦ 2902243 . ПМИД 20393554 .
^ «Объявление на домашней странице ICGC от 16 мая 2018 г.» .
^ «Ученые создают Международный консорциум генома рака» . Национальные институты здравоохранения . 29 апреля 2008 г. Проверено 29 апреля 2008 г.
^ Огилви М (29 апреля 2008 г.). «Консорциум из Торонто по поиску генетического происхождения рака» . Торонто Стар . Архивировано из оригинала 2 мая 2008 г. Проверено 29 апреля 2008 г.
^ «Международный консорциум генома рака объявляет о запуске 8 проектов генома рака» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 26 июля 2011 г. Проверено 26 июня 2010 г.
↑ Объявление Национального совета по здравоохранению и медицинским исследованиям Австралии. Архивировано 23 марта 2009 г. в Wayback Machine.
^ Веб-сайт проекта ICGC

Внешние ссылки

Портал данных ICGC

[Hudson_2010-1] Хадсон Т.Дж. и др. (апрель 2010 г.). «Международная сеть проектов генома рака» . Природа . 464 (7291): 993–8. Бибкод : 2010Natur.464..993T . дои : 10.1038/nature08987 . ПМЦ 2902243 . ПМИД 20393554 .

[2] «Объявление на домашней странице ICGC от 16 мая 2018 г.» .

[NIH-3] «Ученые создают Международный консорциум генома рака» . Национальные институты здравоохранения . 29 апреля 2008 г. Проверено 29 апреля 2008 г.

[secretariat-4] Огилви М (29 апреля 2008 г.). «Консорциум из Торонто по поиску генетического происхождения рака» . Торонто Стар . Архивировано из оригинала 2 мая 2008 г. Проверено 29 апреля 2008 г.

[5] «Международный консорциум генома рака объявляет о запуске 8 проектов генома рака» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 26 июля 2011 г. Проверено 26 июня 2010 г.

[6] Объявление Национального совета по здравоохранению и медицинским исследованиям Австралии. Архивировано 23 марта 2009 г. в Wayback Machine.

[7] Веб-сайт проекта ICGC

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]