Foxred1

Foxred1
Идентификаторы
Псевдонимы	Foxred1 , H17, FP634, FAD-зависимый домен оксидоредуктазы, содержащий 1, FAD-зависимый домен оксидоредуктазы, содержащий 1, MC1DN19
Внешние идентификаторы	Омим : 613622 ; MGI : 2446262 ; Гомологен : 9712 ; GeneCards : Foxred1 ; OMA : Foxred1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	126,278,131 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	35,122,351 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; right frontal lobe; ; Brodmann area 9; ; right lobe of liver; ; cingulate gyrus; ; anterior cingulate cortex; ; apex of heart; ; prefrontal cortex; ; C1 segment; ; hypothalamus;
	Top expressed in
	spermatocyte; ; brown adipose tissue; ; right kidney; ; proximal tubule; ; interventricular septum; ; ectoderm; ; myocardium of ventricle; ; otic vesicle; ; otic placode; ; saccule;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	oxidoreductase activity;
Cellular component	respirasome; membrane; integral component of membrane; mitochondrial inner membrane; mitochondrion; mitochondrial respiratory chain complex I; cytoplasm;
Biological process	mitochondrial respiratory chain complex I assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	55572
	235169
	ENSG00000110074
	Ensmusg00000039048
	Q96CU9
	Q3TQB2
	NM_017547
	NM_001291448 ; NM_001291449 ; NM_172291 ; NM_001359815
	NP_060017
	NP_001278377 ; NP_001278378 ; NP_758495 ; NP_001346744
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

FAD-зависимый домен-домен-оксидоредуктазный белок 1 (Foxred1), также известный как H17 , или FP634, является ферментом , который у людей кодируется Foxred1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Foxred1-это оксидоредуктаза и сложный I-специфический молекулярный шаперон , участвующий в сборке и стабилизации NADH-дегидрогеназы (убиквинон), также известный как комплекс I , который расположен в митохондриальной внутренней мембране и является крупнейшим из пяти комплексов транспортной цепи электронов Полем ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Мутации в Foxred1 были связаны с синдромом Ли ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} и инфантило-начальная митохондриальная энцефалопатия . ^{[ 8 ]}

Структура

Foxred1 расположен на руке Q хромосомы 11 в позиции 14.2 и имеет 12 экзонов . ^{[ 5 ]} Ген Foxred1 производит белок 53,8 кДа, состоящий из 486 аминокислот . ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]} Альтернативно для этого гена наблюдались варианты транскрипта. ^{[ 5 ]}

Foxred1 содержит домен FAD-связывающего оксидоредуктазы и является гомологичен FAD-связывающим белкам диметилглицинедегидрогеназы , саркозиндегидрогеназы , оксидазы L-пипеколовой кислоты, пероксисомальной саркозинсидазы и регуляторной субониты пирвоватной дегидрогеназы . Структурное сходство Foxred1 с саркозинсидазой (MSOX) предсказывает, что остатки тирозина Y410 и Y411 составляют место ковалентного прикрепления FAD. Кроме того, фенильная часть на с. 359 считается критическим для функции. ^{[ 8 ]}^{[ 10 ]} Наконец, Foxred1-это матричный белок, который, как полагают, импортируется посредством присутствия потенциала митохондриальной мембраны, а не посредством расщепляемого нацеливающего сигнала. ^{[ 10 ]} Тем не менее, другие предполагают, что он содержит 23-аминокислотную N-концевую последовательность митохондриальной локализации и что эта последовательность расщепляется при входе, образуя зрелый белок. ^{[ 8 ]}

Функция

Ген Foxred1 кодирует фермент, который локализуется в митохондриях и помогает в сборке и стабилизации NADH: убихинон-оксидоредуктазы, большого мульти-субъединичного фермента в митохондриальной дыхательной цепи . ^{[ 5 ]}^{[ 10 ]} NADH: убихинон -оксидоредуктаза (комплекс I) участвует в нескольких физиологических активности в клетке, включая транспорт метаболита и синтез АТФ . Комплекс I катализирует перенос электронов от NADH в убихинон (коэнзим Q) на первом этапе митохондриальной дыхательной цепи, что приводит к транслокации протонов через внутреннюю митохондриальную мембрану . ^{[ 14 ]} Кодированный белок Foxred1 является оксидоредуктазой и сложным I-специфическим молекулярным шапероном . Он играет роль на средних и поздних этапах промежуточной сборки комплекса I и важна для сборки, стабилизации и функции комплекса I. Предполагается, что функции Foxred1 в комплексе с основной субъединицей NDUFS3, а также в подъездных субъединицах NDUFA5 , NDUFA10 , NDUFB10 и NDUFS5 . ^{[ 10 ]}

Клиническое значение

Мутации в Foxred1 могут привести к дефицитам митохондрий и связанным с ним расстройствам. Расстройство митохондриальной респираторной цепи может вызвать широкий спектр клинических проявлений от летальных заболеваний новорожденных до нейродегенеративных расстройств , вызванных взрослыми . Фенотипы включают макроцефалию с прогрессирующей лейкодистрофией , неспецифической энцефалопатией , кардиомиопатией , миопатией , заболеванием печени , синдромом Ли , наследственной невропатией Лебера и некоторыми формами болезни Паркинсона . ^{[ 9 ]} Патогенные мутации Foxred1 включали C.1054C> T; P.R352W, C.694C> T; P.Q232X и C.1289A> G; P.N430S. Симптомы, вызванные этими мутациями, включали лактоцидоз , гипертрофическую кардиомиопатию и зрительную атрофию . Клинически эти варианты были связаны с синдромом Ли ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} и инфантило-начальная митохондриальная энцефалопатия. ^{[ 8 ]} Выживаемость с мутациями Foxred1, по -видимому, является чаще, чем в других недостатках Iscome I, и сверхэкспрессия мутантных форм может привести к спасению активности комплекса I, указывающей на то, что активность Foxred1 может быть компенсирована в некоторой степени. ^{[ 10 ]}

Взаимодействия

FOXRED1 совместно с иммунопреципитатами с субъединицами Complex I NDUFB10 , NDUFS5 , NDUFA10 , NDUFA8 , NDUFS3 и NDUFA5 и может быть связан с импортным механизмом Tom20, TOM22 и MPP, а также с Chaperones MTHSP70, HSP60 и HSP10 . ^{[ 10 ]} В дополнение к совместному сочетаниям и потенциальным ассоциациям Foxred1, как было подтверждено, взаимодействие белкового белка с EXOSC10 . ^{[ 15 ]}

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000110074 - Ensembl , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000039048 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} «Ген Entrez: FAD-зависимый домен оксидоредуктазы, содержащий 1» .
^ OH JJ, Grosshans DR, Wong SG, Slamon DJ (октябрь 1999). «Идентификация дифференциально экспрессируемых генов, связанных с сверхэкспрессией HER-2/Neu в клетках рака молочной железы человека» . Исследование нуклеиновых кислот . 27 (20): 4008–17. doi : 10.1093/nar/27.20.4008 . PMC 148668 . PMID 10497265 .
^ Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). "18". Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4 -е изд.). Хобокен, Нью -Джерси: Уайли. С. 581–620. ISBN 9780470547847 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Fassone E, Duncan AJ, Taanman JW, Pagnamenta AT, Sadowski MI, Holand T, Qasim W, Rutland P, Calvo SE, Mootha VK, Bitner-Glindzicz M, Rahman S (декабрь 2010 г.). «Foxred1, кодирующий FAD-зависимый оксидоредуктазный комплекс-I-специфический молекулярный шаперон, мутируется в митохондриальной энцефалопатии с инфантильно-началом» . Молекулярная генетика человека . 19 (24): 4837–47. doi : 10.1093/hmg/ddq414 . PMC 4560042 . PMID 20858599 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «FOXRED1 - FAD -зависимый домен -домен -оксидоредуктаза, содержащий белок 1 - Homo Sapiens (Human) - Foxred1 Gene & Protein» . Uniprot.org . Получено 2018-07-27 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Формоза Л.Е., Мимаки М., Фрейзер А.Е., Маккензи М., Стейт Т.Л., Торберн Д.Р., Страуд Д.А., Райан М.Т. (май 2015). «Характеристика митохондриального Foxred1 в сборке комплекса дыхательной цепи I» . Молекулярная генетика человека . 24 (10): 2952–65. doi : 10.1093/hmg/ddv058 . HDL : 10536/dro/du: 30112237 . PMID 25678554 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Calvo SE, Tucker EJ, Compton AG, Kirby DM, Crawford G, Burtt NP, Rivas M, Guiducci C, Bruno DL, Goldberger OA, Redman MC, Wiltshire E, Wilson CJ, Altshuler D, Gabriel SB, Daly MJ, Thorburn Dr, Dr , Mootha VK (октябрь 2010 г.). «Высокопроизводительное, объединенное секвенирование идентифицирует мутации в NUBPL и Foxred1 в дефиците комплекса человека I» . Природа генетика . 42 (10): 851–8. doi : 10.1038/ng.659 . PMC 2977978 . PMID 20818383 .
^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, J, J, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Odeberg. , Duan H, Ulen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома специализированной базой знаний» . Исследование циркуляции . 113 (9): 1043–53. doi : 10.1161/circresaha.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 .
^ Яо, Даниэль. «База знаний по атласу сердечного белка (Copakb) - информация о белке» . Amino.HeartProteom.org . Получено 2018-07-27 . ^{[ Постоянная мертвая ссылка ]}
^ Ссылка, генетика дома. "Ndufaf1 ген" . Генетика дома ссылка . Получено 2018-07-27 .
^ «7 бинарных взаимодействий, найденных для поиска Foxred1» . База данных интактного молекулярного взаимодействия . Embl-Ebi . Получено 2018-08-25 .

Дальнейшее чтение

Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием специфической для сайта рекомбинации in vitro» . Исследование генома . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Симпсон JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных крупномасштабным секвенированием кДНК» . Embo сообщает . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Lehner B, Sanderson CM (июль 2004 г.). «Структура взаимодействия белка для деградации мРНК человека» . Исследование генома . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
Whoman S, Art D, Houberg W, WomenRerer R, Skrle A, Beregan H, Plultlus H, Plultcaker H, Postlok A (Octmary 2004). «От Orfeomom до Bioloy: в функциональной Gipomics Pillinine» . Исследование генома . 14 (10b): 2136-44. Doi : 10.1101 / gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, Del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (январь 2006 г.). «База данных LIFEDB в 2006 году» . Исследование нуклеиновых кислот . 34 (проблема базы данных): D415-8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .

Эта статья включает в себя текст из Национальной медицины Соединенных Штатов , которая находится в общественном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000110074 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000039048 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[entrez-5] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} «Ген Entrez: FAD-зависимый домен оксидоредуктазы, содержащий 1» .

[pmid10497265-6] OH JJ, Grosshans DR, Wong SG, Slamon DJ (октябрь 1999). «Идентификация дифференциально экспрессируемых генов, связанных с сверхэкспрессией HER-2/Neu в клетках рака молочной железы человека» . Исследование нуклеиновых кислот . 27 (20): 4008–17. doi : 10.1093/nar/27.20.4008 . PMC 148668 . PMID 10497265 .

[Biochem-7] Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). "18". Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4 -е изд.). Хобокен, Нью -Джерси: Уайли. С. 581–620. ISBN 9780470547847 .

[:0-8] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Fassone E, Duncan AJ, Taanman JW, Pagnamenta AT, Sadowski MI, Holand T, Qasim W, Rutland P, Calvo SE, Mootha VK, Bitner-Glindzicz M, Rahman S (декабрь 2010 г.). «Foxred1, кодирующий FAD-зависимый оксидоредуктазный комплекс-I-специфический молекулярный шаперон, мутируется в митохондриальной энцефалопатии с инфантильно-началом» . Молекулярная генетика человека . 19 (24): 4837–47. doi : 10.1093/hmg/ddq414 . PMC 4560042 . PMID 20858599 .

[:1-9] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «FOXRED1 - FAD -зависимый домен -домен -оксидоредуктаза, содержащий белок 1 - Homo Sapiens (Human) - Foxred1 Gene & Protein» . Uniprot.org . Получено 2018-07-27 .

[:2-10] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час Формоза Л.Е., Мимаки М., Фрейзер А.Е., Маккензи М., Стейт Т.Л., Торберн Д.Р., Страуд Д.А., Райан М.Т. (май 2015). «Характеристика митохондриального Foxred1 в сборке комплекса дыхательной цепи I» . Молекулярная генетика человека . 24 (10): 2952–65. doi : 10.1093/hmg/ddv058 . HDL : 10536/dro/du: 30112237 . PMID 25678554 .

[:3-11] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} Calvo SE, Tucker EJ, Compton AG, Kirby DM, Crawford G, Burtt NP, Rivas M, Guiducci C, Bruno DL, Goldberger OA, Redman MC, Wiltshire E, Wilson CJ, Altshuler D, Gabriel SB, Daly MJ, Thorburn Dr, Dr , Mootha VK (октябрь 2010 г.). «Высокопроизводительное, объединенное секвенирование идентифицирует мутации в NUBPL и Foxred1 в дефиците комплекса человека I» . Природа генетика . 42 (10): 851–8. doi : 10.1038/ng.659 . PMC 2977978 . PMID 20818383 .

[12] Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, J, J, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Odeberg. , Duan H, Ulen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома специализированной базой знаний» . Исследование циркуляции . 113 (9): 1043–53. doi : 10.1161/circresaha.113.301151 . PMC 4076475 . PMID 23965338 .

[13] Яо, Даниэль. «База знаний по атласу сердечного белка (Copakb) - информация о белке» . Amino.HeartProteom.org . Получено 2018-07-27 . ^{[ Постоянная мертвая ссылка ]}

[14] Ссылка, генетика дома. "Ndufaf1 ген" . Генетика дома ссылка . Получено 2018-07-27 .

[15] «7 бинарных взаимодействий, найденных для поиска Foxred1» . База данных интактного молекулярного взаимодействия . Embl-Ebi . Получено 2018-08-25 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]