Гаплогруппа К2
| Гаплогруппа К2 | |
|---|---|
 | |
| Возможное время происхождения | 47 000–50 000 лет назад. [ 1 ] |
| Возможное место происхождения | Юго-Восточная Азия [ 2 ] [ 3 ] |
| Предок | К |
| Потомки | К2а (М2308); К2б (МПС); К2с ; К2д ; К2е . |
| Определение мутаций | рс2033003 (М526) |
Гаплогруппа K2 , также известная как K-M526 и ранее известная как K(xLT) и MNOPS , [ 4 ] человека — гаплогруппа Y-ДНК .
Относительно возраста внутренняя структура K2 чрезвычайно сложна, и его субклады передаются мужчинами, выходцами из таких регионов, как Австралазия , Океания , Юго-Восточная Азия , Южная Азия , Восточная Азия , Центральная Азия , Америка , Европа и Рог. Африки . Многие из его ветвей очень распространены, наиболее численно важными являются R в Европе и Южной Азии и O в Восточной и Юго-Восточной Азии (а также недавние иммигранты на другие континенты). Гаплогруппы N и Q , хотя в целом они менее распространены, также очень широко распространены в Северной Евразии и Америке соответственно. M и S почти полностью ограничены Океанией и восточной Индонезией , где они встречаются с высокой частотой.
Редкие субклады за пределами этих основных линий известны в основном на островах Юго-Восточной Азии (включая Андаманские острова и Филиппины ).
Базальная парагруппа К2* выявлена у коренных австралийцев, около 27% из них являются носителями базальной К-М526*. [ 5 ]
К2а* обнаружен только в верхнепалеолитических остатках Западной Сибири и Балкан , известных соответственно как « Усть-Ишимский человек » и « Оазис-1 ». [ 6 ] Единственная первичная ветвь K2a, известная как K-M2313*, была зарегистрирована у двух живых людей, имеющих этнические связи с Южной Азией и Юго-Восточной Азией соответственно: телугу из Индии и этнического малайца из Сингапура. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является первичной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии . [ 7 ] Другой субклад, NO (M214)*, который какое-то время считался синонимом K2a (M2308)*, не был идентифицирован у живых особей или останков.
Базальная парагруппа K2b* не выявлена среди ныне живущих самцов, но обнаружена у верхнепалеолитического человека Тяньюань из Китая. [ 8 ] K2b1 (P397/P399), ранее известная как гаплогруппа MS , и гаплогруппа P (P-P295), также известная как K2b2 , являются единственными первичными кладами K2b.
По мнению генетика Спенсера Уэллса , гаплогруппа K, от которой происходит гаплогруппа P, возникла на Ближнем Востоке или в Центральной Азии . Вполне вероятно, что где-то в Южной Азии гаплогруппа P разошлась в P1, которая распространилась на Сибирь и Северную Евразию, и на P2, которая распространилась на Океанию и Юго-Восточную Азию. [ 9 ]
Популяционный генетик Татьяна Карафет и другие исследователи (2014) отмечают, что как K2b1, так и P* практически географически ограничены Юго-Восточной Азией и Океанией . [ 2 ] Принимая во внимание, что, что разительно контрастирует, P1 (P-M45) и его основные субклады Q и R теперь составляют «наиболее распространенную гаплогруппу в Европе , Америке , Центральной Азии и Южной Азии ». По мнению Карафета и др., предполагаемые даты разветвления K, K2, K2b и P указывают на «быструю диверсификацию» внутри K2, «которая, вероятно, произошла в Юго-Восточной Азии», с последующим «расширением на запад» P *, P1. , В и Р. [ 2 ] Однако эти авторы также предположили, что гаплогруппа K могла возникнуть в Евразии, а затем вымереть там, и что любая гипотеза происхождения «одинаково экономна». [ 10 ]
Структура
[ редактировать ]Прямой потомок гаплогруппы K , K2 является родным братом базальной/парагруппы K* и гаплогруппы LT (также известной как K1).
По состоянию на 2017 год филогения гаплогруппы K2 выглядит следующим образом:
K-M526 ( K2 ) M526 - ранее известный как K (xLT) и MNOPS
- К-М2308 ( К2а ) М2308 – встречается только в древних останках; смотри выше) [ 6 ]
- К-М2313 ( К2а1 ) М2313 [ 6 ]
- NO-F549 ( NO* ) или K-M2335 F549/S22380/M2335/V4208; М2335/З4952/М2339/Е482; CTS11667 [ 7 ] [ 6 ]
- K-Y28299 ( первичный субклад K2a; по состоянию на 2017 год нет филогенетического названия ) Y28299/Y28355; Y28357; Y28412 - обнаружен у одного живого человека в Индии. [ 7 ]
- K-Y28301 ( первичный субклад K2a; по состоянию на 2017 год нет филогенетического названия ) Y28301/Y28328; Y28358; Y28410 - обнаружен у двух живых людей в Индии. [ 7 ]
- К-М2313 ( К2а1 ) М2313 [ 6 ]
- K-P331 ( K2b ) M1221/P331/PF5911, CTS2019/M1205, PF5990/L405, PF5969 – субклады K2b включают основные гаплогруппы M ; С , П , К и Р
- К-П261 ( К2с ) П261
- К-П402 ( К2д ) П402
- К-М147 ( К2е ) М147
Распределение
[ редактировать ]На уровне высокоразвитых субкладов K2 почти универсален в некоторых современных евразийских, австралазийских и индейских популяциях. Гаплогруппа NO (M214) , как потомок K2a (M2308) , включает большинство мужчин среди населения Юго-Восточной Азии , Восточной Азии и финно-угорского населения. [ 6 ] Точно так же прямые потомки K2b включают основные гаплогруппы M ; С , П , Кью и Р. В настоящее время они численно доминируют в: Океании , Средней Азии , Сибири , среди индейского населения, Европе и Южной Азии .
О быстрой диверсификации внутри и из K2 (M526), скорее всего, в Юго-Восточной Азии, свидетельствуют оценки момента времени, когда K2 отделился от K* (M9). Аналогичным образом, ответвление от K2 от K2b (P331) и гаплогруппы P (K2b2 P295) от K2b, а также гаплогрупп Q и R от P (K2b2) и их последующее распространение на запад в Европе, [ 2 ] и на восток в Америку.
K2c, K2d и K2e — чрезвычайно редкие субгаплогруппы, встречающиеся в определенных частях Южной и Юго-Восточной Азии. [ 2 ] K2c (P261) зарегистрирован только среди мужчин на Бали , а K2d (P402) — только на Яве . K2e (M147), который был обнаружен в двух современных случаях из Южной Индии , [ 2 ] был предварительно назван «пре-NO» (среди других названий), поскольку первоначально считалось, что он является предком K2a (NO). Однако позже выяснилось, что это первичная ветвь гаплогруппы K2 (K-M526) и брат K2a; новая клада была переименована в K2e.
Исследования, опубликованные в 2014 и 2015 годах, показали, что до 27% мужчин -аборигенов Австралии являются носителями K-M526*, который в то время нельзя было отнести к известному субкладу, а еще 27%, вероятно, имеют K2b1a1 (P60, P304, P308; также известный как «S-P308») и, возможно, 2,0% имеют гаплогруппу M1 , также известную как M-M4 (или «М-М186») и К2b1d1 . [ 12 ] [ 2 ]
Мы
[ редактировать ]Название K2 было введено в 2014 году из-за недовольства предыдущими названиями.
K(xLT), название, предложенное Консорциумом Y-хромосомы в 2012 году для замены MNOPS, вызвало споры. Согласно предыдущей методологии, такой термин, как «K(xLT)», обозначал все клады и субклады, которые принадлежали K, но не принадлежали к гаплогруппе LT ; гаплогруппы, подчиненные MNOPS, вероятно, были бы переименованы в «U», «V», «W» и «X», и поэтому MNOPS стал бы «MNOPSUVWX». Это создавало проблему, поскольку не было возможности устранить неоднозначность между «K(xLT)» в широком и узком значениях этого термина.
Сноски
[ редактировать ]- ^ Фу, Цяомэй; Ли, Хэн; Мурджани, Прия; Джей, Флора; Слепченко Сергей М.; Бондарев Алексей А.; Джонсон, Филип Л.Ф.; Ачиму-Петри, Айнуэр; Прюфер, Кей; де Филиппо, Чезаре; Мейер, Матиас; Цвинс, Николас; Саласар-Гарсия, Доминго К.; Кузьмин Ярослав Васильевич; Китс, Сьюзен Г.; Косинцев Павел А.; Ражев Дмитрий Иванович; Ричардс, Майкл П.; Перистов Николай Владимирович; Лахманн, Майкл; Дука, Катерина; Хайэм, Томас Ф.Г.; Слаткин, Монтгомери; Юблин, Жан-Жак; Райх, Дэвид; Келсо, Джанет; Виола, Т. Бенс; Паабо, Сванте (октябрь 2014 г.). «Последовательность генома современного человека возрастом 45 000 лет из Западной Сибири» . Природа . 514 (7523): 445–449. Бибкод : 2014Nature.514..445F . дои : 10.1038/nature13810 . ПМЦ 4753769 . ПМИД 25341783 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Карафет Татьяна М; Мендес, Фернандо Л; Судойо, Херавати; Лансинг, Дж. Стивен; Хаммер, Майкл Ф. (март 2015 г.). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии» . Европейский журнал генетики человека . 23 (3): 369–373. дои : 10.1038/ejhg.2014.106 . ПМЦ 4326703 . ПМИД 24896152 .
- ^ Халласт, Таблетки; Дорогая, Анастасия; Балановский Олег; Сюэ, Он был; Тайлер-Смит, Крис (2021). «Происхождение современного неафриканского человека и хромосом из Юго-Восточной Азии» . Генетика человека . 140 (2): 299–307. дои : 10.1007/ s00439-020-02204-9 ПМЦ 7864842 . ПМИД 32666166 .
- ^ Кьярони, Жак; Андерхилл, Питер А.; Кавалли-Сфорца, Лука Л. (2009). «Разнообразие Y-хромосомы, человеческая экспансия, дрейф и культурная эволюция» . ПНАС . 106 (48): 20174–9. Бибкод : 2009PNAS..10620174C . дои : 10.1073/pnas.0910803106 . ПМЦ 2787129 . ПМИД 19920170 .
- ^ Бергстрем, Андерс; Нэгл, Нано; Чен, Юань; Маккарти, Шейн; Поллард, Мартин О.; Аюб, Касим; Уилкокс, Стивен; Уилкокс, Лия; ван Ооршот, Роланд А.Х.; Макаллистер, Питер; Уильямс, Лесли; Сюэ, Яли; Митчелл, Р. Джон; Тайлер-Смит, Крис (21 марта 2016 г.). «Глубокие корни Y-хромосом аборигенов Австралии» . Современная биология . 26 (6): 809–813. дои : 10.1016/j.cub.2016.01.028 . ПМЦ 4819516 . ПМИД 26923783 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж Позник, Г. Дэвид; Сюэ, Яли; Мендес, Фернандо Л; Виллемс, Томас Ф; Домохозяйка Андреа; Уилсон Сейрес, Мелисса А.; Аюб, Касим; Маккарти, Шейн А; Наречанья, Апурва; Кашин, Сева; Чен, Юань; Банерджи, Руби; Родригес-Флорес, Хуан Л.; Сересо, Мария; Шао, Хаоцзин; Гимрек, Мелисса; Малхотра, Анкит; Лузада, Сандра; Десаль, Роб; Ричи, Грэм Р.С.; Сервейра, Элиза; Фицджеральд, Томас В.; Гаррисон, Эрик; Маркетта, Энтони; Миттельман, Дэвид; Романович, Мэллори; Чжан, Чэншэн; Чжэн-Брэдли, Сянцюнь; Абекасис, Гонсалу Р.; МакКэрролл, Стивен А; Фличек, Пол; Андерхилл, Питер А; Монета, Лахлан; Зербино, Дэниел Р.; Ян, Фэнтан; Ли, Чарльз; Кларк, Лаура; Аутон, Адам; Эрлих, Янив; Рукодельник, Роберт Э; Бустаманте, Карлос Д; Тайлер-Смит, Крис (июнь 2016 г.). «Периодические всплески демографии мужского пола, выявленные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру» . Природная генетика . 48 (6): 593–599. дои : 10.1038/ng.3559 . ПМЦ 4884158 . ПМИД 27111036 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г YFull YTree v5.08 , 2017, «K-M2335» (9 декабря 2017 г.); PhyloTree , 2017, «Подробная информация о маркерах Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (9 декабря 2017 г.); GeneticHomeland.com , 2016, Индекс ДНК-маркера хромосомы Y V4208 (9 декабря 2017 г.).
- ^ «Загружаемые генотипы современных и древних данных ДНК (составлены на основе опубликованных статей) | Лаборатория Дэвида Райха» . reich.hms.harvard.edu . Архивировано из оригинала 2 ноября 2019 года . Проверено 11 сентября 2019 г.
- ^ Уэллс, Спенсер (20 ноября 2007 г.). Глубокая родословная: эпохальный поиск ДНК для расшифровки нашего далекого прошлого . Национальные географические книги. п. 79. ИСБН 978-1-4262-0211-7 . «Учитывая широкое распространение К, он, вероятно, возник где-то на Ближнем Востоке или в Центральной Азии, возможно, в районе Ирана или Пакистана».
- ^ Карафет и др. 2015 «Эта закономерность заставляет нас выдвинуть гипотезу о происхождении P-P295 из Юго-Восточной Азии и более поздней экспансии предка подгаплогрупп R и Q в материковую Азию. Альтернативное объяснение могло бы включать в себя событие исчезновения предковых хромосом P-P295 * повсюду в Азии. Эти сценарии одинаково экономны. Они включают либо событие миграции (хромосом P* из Индонезии в материковую Азию), либо событие исчезновения P-P295*. парагруппа в Евразии».
- ^ «Ствол дерева гаплогруппы Y-ДНК ISOGG 2018» . www.isogg.org .
- ^ Нэгл, Нано; Баллантайн, Кэй Н.; ван Овен, Маннис; Тайлер-Смит, Крис; Сюэ, Яли; Тейлор, Дункан; Уилкокс, Стивен; Уилкокс, Лия; Туркалов, Руст; ван Ооршот, Роланд А.Х.; Макаллистер, Питер; Уильямс, Лесли; Кайзер, Манфред; Митчелл, Роберт Дж.; Генографический, Консорциум. (март 2016 г.). «Древность и разнообразие Y-хромосом аборигенов Австралии: Y-хромосомы аборигенов Австралии». Американский журнал физической антропологии . 159 (3): 367–381. дои : 10.1002/ajpa.22886 . ПМИД 26515539 .
