Гаплогруппа M-P256

Гаплогруппа М-М4
Гаплогруппа М-М4
Возможное время происхождения	8200 [3800–20600] лет назад ( Кайзер 2003 )
Возможное место происхождения	Юго-Восточная Азия – Меланезия [ нужна ссылка ]
Предок	М-П256
Определение мутаций	М4, М5/П73, М106, М186, М189, М296, П35 [ нужна ссылка ]

Гаплогруппа M-P256
Гаплогруппа M-P256
Возможное время происхождения	32 000–47 000 лет назад ( Шейнфельдт, 2006 г. )
Возможное место происхождения	Уоллеса (восточная Индонезия) ; или Новая Гвинея
Предок	К2б1
Определение мутаций	Р256

Гаплогруппа M , также известная как M-P256 и гаплогруппа K2b1b (ранее K2b1d), представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы . M-P256 является потомком гаплогруппы K2b1 и, как полагают, впервые появилась между 32 000 и 47 000 лет назад ( Scheinfeldt 2006 ).

M-P256 является наиболее часто встречающейся гаплогруппой Y-хромосомы в Западном Папуа и западной части Папуа-Новой Гвинеи ( Kayser 2003 ). Он также встречается в соседних частях Меланезии , Индонезии и среди коренных австралийцев .

И M-P256, и гаплогруппа S (B254) являются единственными первичными субкладами K2b1 , также известными как гаплогруппа MS.

Филогенетическая структура

Это филогенетическое древо субкладов гаплогрупп основано в первую очередь на деревьях, опубликованных ISOGG в 2016 году ( ISOGG 2016 ) и YCC в 2008 году ( Карафет 2008 ).

М* (P256)
- М1 (М4, М5/П73, М106, М186, М189, М296, П35)
  - М1а (П34_1, П34_2, П34_3, П34_4, П34_5)
    - М1а1 (П51)
    - М1а2 (Р94)
  - М1б (Р87)
    - М1б1 (М104_1/П22_1, М104_2/П22_2)
      - М1б1а (М16)
      - М1b1b (М83)
- М2 (М353, М387)
  - М2а (M177/SRY9138)
- М3 (П117, П118)

Распределение

М* (М-П256*)

Парагруппа M-P256* встречается редко. ^{[ написание? ]} в Новой Гвинее (6,3%) и Флоресе (2,5%). ^{[ 1 ]}

М1 (М-М4)

Часто встречается в Новой Гвинее и Меланезии , умеренно распространен в соседних частях Индонезии , Микронезии и Полинезии .

100 % ( Кайзер, 2003 г. )
Кетенгбан 100% ( Кайзер, 2003 )
Воздух 100% ( Кайзер, 2003 г. )
Распечатать 86% ( Кайзер, 2003 г. )
Асмат 75% ( Кайзер 2003 )
Западное Папуа
- Низины/побережье 77,5% ( Кайзер, 2003 г. )
- Хайленд 74,5% ( Кайзер, 2003 г. )
Комбайн / Крокодил 46% ( Кайзер 2003)
Папуа-Новая Гвинея
- Побережье 29% ( Кайзер, 2003 г. )
- Хайленд 35,5% ( Кайзер, 2003 г. )
Толай (Новая Британия) 31% ( Кайзер, 2003 г.)
Острова Тробриан 30% ( Кайзер, 2003 г. )
Малуку (Молуккские острова) 21% ( Кайзер, 2003 г. )
Жители островов Торресова пролива (Австралия): до 2,0% – т.е. 0,9% выборок, при этом 45% от общего числа считались «некоренными» ( Nagle 2015 ) .

Крайнее географическое отклонение, очевидно, было выявлено в исследовании 2012 года, в котором сообщалось о хазарейце из Мазари-Шарифа , Афганистан, с M1 среди выборки из 60 мужчин из Мазари-Шарифа ( Haber 2012 ). У хазарейца был SNP M186 (который, как полагают, эквивалентен M4).

Старые имена (YCC 2002/2008)	М-М4
Джоблинг и Тайлер-Смит, 2000 г.	24
Андерхилл 2000	VIII
Хаммер 2001	1U
Карафет 2001	37
Семино 2000	ЕС16
Они в 1999 году	H17
Волосы 2001	И
YCC 2002 (от руки)	М*
YCC 2005 (от руки)	М
YCC 2008 (от руки)	М1
YCC 2010r (от руки)	М1

М1а (М-П34)

M1a (M-P34) — наиболее часто встречающаяся гаплогруппа ДНК Y-хромосомы в Западной Новой Гвинее . Он также встречается с умеренной частотой в соседних частях Индонезии ( Малуку , Нуса-Тенгара ) и по всей Папуа-Новой Гвинее , включая прибрежные острова ( Карафет, 2005 и Кайзер, 2008 ).

Старые имена (YCC 2002/2008)	М-П34
Джоблинг и Тайлер-Смит, 2000 г.	24
Андерхилл 2000	VIII
Хаммер 2001	1U
Карафет 2001	37
Семино 2000	ЕС16
Они в 1999 году	H17
Волосы 2001	И
YCC 2002 (от руки)	М1
YCC 2005 (от руки)	М1
YCC 2008 (от руки)	М1а
YCC 2010r (от руки)	М1а

М1б (М-П87)

M1b M-P87(xM104/P22) был обнаружен примерно в 18% (20/109) пула образцов из Новой Ирландии , примерно в 12% (5/43) образца Лавонгаи из Нью-Ганновера , примерно в 5%. (19/395) пула образцов из Новой Британии (и, в частности, примерно в 24% (15/63) Бейнинга из Восточной Новой Британии ), а также одна особь сапоса с севера Бугенвиля и еще одна особь с северного побережья Папуа-Новой Гвинеи ( Scheinfeldt 2006 ).

Субклад M1b1 (M104_1/P22_1, M104_2/P22_2) часто встречается в популяциях архипелага Бисмарка и острова Бугенвиль , с умеренным распространением в Новой Гвинее , Фиджи , Тонге , Восточной Футуне и Самоа . ( Кайзер 2008 и Шейнфельдт 2006 ).

Старые имена (YCC 2002/2008)	М-П22
Джоблинг и Тайлер-Смит, 2000 г.	24
Андерхилл 2000	VIII
Хаммер 2001	1U
Карафет 2001	38
Семино 2000	ЕС16
Они в 1999 году	H17
Волосы 2001	И
YCC 2002 (от руки)	М2*
YCC 2005 (от руки)	М2а
YCC 2008 (от руки)	М1б1
YCC 2010r (от руки)	М1б1

М2(М-М353)

M2 встречается с низкой частотой на Фиджи и в Восточной Футуне ( Kayser 2006 ).

Субклад M2a (M-M177, также называемый M-SRY9138) был обнаружен у одной особи насиои с восточного побережья Бугенвиля и у одной особи из провинции Малаита на Соломоновых островах ( Cox 2006 ).

Альтернативные названия субклада M2a, ранее использовавшиеся в рецензируемой литературе, перечислены ниже.

Старые имена (YCC 2002/2008)	К-SRY9138/М-SRY9138 РУЧНОЙ М-М177
Джоблинг и Тайлер-Смит, 2000 г.	23
Андерхилл 2000	VIII
Хаммер 2001	1Е
Карафет 2001	25
Семино 2000	ЕС16
Они в 1999 году	Н5
Волосы 2001	Ф
YCC 2002 (от руки)	1 квартал
YCC 2005 (от руки)	1 квартал
YCC 2008 (от руки)	М2а
YCC 2010r (от руки)	М2а

М3 (М-П117)

M3 (P117, P118) часто встречается в популяциях Новой Британии , а также иногда наблюдается на севере Бугенвиля , Фиджи и Восточной Футуне ( Kayser 2008 и Scheinfeldt 2006 ).

Предыдущая филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе использовалось по крайней мере семь различных систем наименования филогенетического дерева Y-хромосомы, что приводило к значительной путанице. Чтобы решить эту проблему, в 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC), в результате чего была опубликована совместная статья, содержащая одно новое дерево, которое все они согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть прежде всего своевременным.

В таблице ниже собрана номенклатура, использовавшаяся в исследованиях гаплогруппы M до знаменательного дерева YCC 2002 года, что позволяет исследователям, просматривающим более старую литературу, быстро переходить между различными использовавшимися номенклатурами.

YCC 2002/2008 (сокращенно)	(а)	(б)	(с)	(г)	(е)	(г)	(или)	YCC 2002 (от руки)	YCC 2005 (от руки)	YCC 2008 (от руки)	YCC 2010r (от руки)	ИСОГГ 2006 г.	ИСОГГ 2007	ИСОГГ 2008	ИСОГГ 2009	ИСОГГ 2010	ИЗОГГ 2011	ИЗОГГ 2012
М4	24	VIII	1U	37	ЕС16	H17	И	М*	М	М1	М1	-	-	-	-	-	-	-
М-П34	24	VIII	1U	37	ЕС16	H17	И	М1	М1	М1а	М1а	-	-	-	-	-	-	-
М-П22/М-М104	24	VIII	1U	38	ЕС16	H17	И	М2*	М2а	М1б1	М1б1	-	-	-	-	-	-	-
М-М16	24	VIII	1U	39	ЕС16	H17	И	М2а	М2а1	M1b1a	M1b1a	-	-	-	-	-	-	-
М-М83	24	VIII	1U	38	ЕС16	H17	И	М2б	М2а2	M1b1b	M1b1b	-	-	-	-	-	-	-
К-SRY9138/М-SRY9138	23	VIII	1Е	25	ЕС16	Н5	Ф	1 квартал	1 квартал	М2а	М2а	-	-	-	-	-	-	-

Источники

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании Дерева YCC.

α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
β Андерхилл 2000
γ Хаммер 2001
δ Графин 2001 г.
ε Семино 2000
ζ Вс 1999 г.
η Волосы 2001

В статье Карафета 2008 года был внесен ряд изменений по сравнению с предыдущим деревом ISOGG 2006 года . До открытия маркера P256 нынешняя подгруппа M-M4 (определяемая маркером M4) ранее представляла всю гаплогруппу M-P256; родительской гаплогруппы K. а подгруппы M2 и M3 ранее классифицировались как подгруппы K1 и K7 ^{[ нужна ссылка ]}

Ссылки

Сноски

^ Jump up to: ^а ^б Татьяна М. Карафет, Брайан Холлмарк, Мюррей П. Кокс, Херавати Судойо [ id ] , Шон Дауни, Дж. Стивен Лансинг и Майкл Ф. Хаммер, «Основное разделение Восток-Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии», Molecular Biological Evolution , (2010), vol. 27, нет. 8, стр. 1833-1844.

Цитируемые работы

Кокс, Мюррей П.; Мирасон Лар, Марта (2006). «Разнообразие Y-хромосом обратно пропорционально связано с языковой принадлежностью в парных австронезийских и папуасоязычных общинах Соломоновых Островов». Американский журнал биологии человека . 18 (1): 35–50. дои : 10.1002/ajhb.20459 . ПМИД 16378340 . S2CID 4824401 .
Хабер, Марк; Платт, Дэниел Э.; Ашрафиан Бонаб, Мазиар; Юханна, Соня С.; Сория-Эрнанц, Дэвид Ф.; Мартинес-Крус, Бегонья; Дуэи, Бушра; Гассибе-Саббах, Мишелла; Рафатпана, Хошанг (2012). Кайзер, Манфред (ред.). «Этнические группы Афганистана разделяют Y-хромосомное наследие, структурированное историческими событиями» . ПЛОС ОДИН . 7 (3): e34288. Бибкод : 2012PLoSO...734288H . дои : 10.1371/journal.pone.0034288 . ПМЦ 3314501 . ПМИД 22470552 .
Карафет Татьяна М.; Лансинг, Дж. С. ; Редд, Алан Дж.; Уоткинс, Джозеф К.; Сурата, СПК; Артхавигуна, Вашингтон; Майер, Лаура; Бамшад, Майкл; Джорд, Линн Б. (2005). «Балийский взгляд на Y-хромосому на заселение Индонезии: генетический вклад донеолитических охотников-собирателей, австронезийских фермеров и индийских торговцев» (PDF) . Биология человека . 77 (1): 93–114. дои : 10.1353/hub.2005.0030 . hdl : 1808/13586 . ПМИД 16114819 . S2CID 7953854 .
Карафет, ТМ; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, СЛ; Хаммер, МФ (2008). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 .
Кайзер, Манфред; Брауэр, Силке; Вайс, Гюнтер; Шифенхёвель, Вульф; Андерхилл, Питер; Шен, Пейдун; Офнер, Питер; Томмазео-Понцетта, Мила; Стоункинг, Марк (2003). «Уменьшенная Y-хромосома, но не митохондриальная ДНК, разнообразие человеческих популяций из Западной Новой Гвинеи» . Американский журнал генетики человека . 72 (2): 281–302. дои : 10.1086/346065 . ПМК 379223 . ПМИД 12532283 .
Кайзер, М.; Брауэр, С; Кордо, Р; Касто, А; Лао, О; Животовский, Л.А.; Мойс-Фори, К; Ратледж, РБ; Шифенхувел, W (2006). «Меланезийское и азиатское происхождение полинезийцев: градиенты мтДНК и Y-хромосомы в Тихом океане» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (11): 2234–44. дои : 10.1093/molbev/msl093 . hdl : 11858/00-001M-0000-0010-0145-0 . ПМИД 16923821 .
Кайзер, М.; Чой, Ю.; Ван Овен, М.; Мона, С.; Брауэр, С.; Трент, Р.Дж.; Суаркиа, Д.; Шифенховел, В.; Стоункинг, М. (2008). «Влияние австронезийской экспансии: данные о разнообразии мтДНК и Y-хромосомы на Адмиралтейских островах Меланезии» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (7): 1362–74. дои : 10.1093/molbev/msn078 . ПМИД 18390477 .
Шейнфельдт, Л.; Фридлендер, Ф; Фридлендер, Дж; Лэтэм, К; Коки, Г; Карафет, Т; Хаммер, М; Лоренц, Дж (2006). «Неожиданная хромосомная вариация NRY на Северном острове Меланезии» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (8): 1628–41. дои : 10.1093/molbev/msl028 . ПМИД 16754639 .
Нэгл, Н.; и др. (2015). «Древность и разнообразие Y-хромосом аборигенов Австралии». Американский журнал физической антропологии . 159 (3): 367–81. дои : 10.1002/ajpa.22886 . ПМИД 26515539 .
«ISOGG 2016 Гаплогруппа M Y-ДНК» . www.isogg.org .

Источники таблиц преобразования

Капелли, Кристиан; Уилсон, Джеймс Ф.; Ричардс, Мартин; Штумпф, Майкл П.Х.; и др. (февраль 2001 г.). «Отцовское наследие преимущественно коренных народов австронезийскоязычных народов островной Юго-Восточной Азии и Океании» . Американский журнал генетики человека . 68 (2): 432–443. дои : 10.1086/318205 . ПМЦ 1235276 . ПМИД 11170891 .
Хаммер, Майкл Ф.; Карафет Татьяна М.; Редд, Алан Дж.; Джарджанази, Хамди; и др. (1 июля 2001 г.). «Иерархические закономерности глобального разнообразия Y-хромосом человека» . Молекулярная биология и эволюция . 18 (7): 1189–1203. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a003906 .
Джоблинг, Марк А.; Тайлер-Смит, Крис (2000), «Новое использование новых гаплотипов», Trends in Genetics , 16 (8): 356–62, doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6 , PMID 10904265
Каладжиева, преп.; Калафель, Франческ; Джоблинг, Марк А; Ангеличева, Дора; и др. (февраль 2001 г.). «Закономерности меж- и внутригруппового генетического разнообразия у влакс-рома, выявленные с помощью Y-хромосомы и линий митохондриальной ДНК» . Европейский журнал генетики человека . 9 (2): 97–104. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200597 .
Карафет, Татьяна; Сюй, Липин; Ду, Руофу; Ван, Уильям; и др. (сентябрь 2001 г.). «История отцовского населения Восточной Азии: источники, закономерности и микроэволюционные процессы» . Американский журнал генетики человека . 69 (3): 615–628. дои : 10.1086/323299 . ПМЦ 1235490 . ПМИД 11481588 .
Семино, О.; Пассарино, Дж; Оефнер, П.Дж.; Лин, А.А.; и др. (2000), «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: хромосомная перспектива AY», Science , 290 (5494): 1155–9, Бибкод : 2000Sci...290.1155S , doi : 10.1126/science.290.5494. 1155 , ПМИД 11073453
Су, Бинг; Сяо, Цзюньхуа; Андерхилл, Питер; Дека, Ранджан; и др. (декабрь 1999 г.). «Y-хромосома свидетельствует о миграции современных людей на север в Восточную Азию во время последнего ледникового периода» . Американский журнал генетики человека . 65 (6): 1718–1724. дои : 10.1086/302680 . ПМЦ 1288383 . ПМИД 10577926 .
Андерхилл, Питер А.; Шен, Пейдун; Лин, Алиса А.; Джин, Ли; и др. (ноябрь 2000 г.). «Вариации последовательности Y-хромосомы и история человеческих популяций». Природная генетика . 26 (3): 358–361. дои : 10.1038/81685 .

Внешние ссылки

Распространение гаплогруппы M по данным National Geographic.

См. также

[karafet_2010-1] Jump up to: ^а ^б Татьяна М. Карафет, Брайан Холлмарк, Мюррей П. Кокс, Херавати Судойо [ id ] , Шон Дауни, Дж. Стивен Лансинг и Майкл Ф. Хаммер, «Основное разделение Восток-Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы в Индонезии», Molecular Biological Evolution , (2010), vol. 27, нет. 8, стр. 1833-1844.

[vanOven2014-2] Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). "Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome". Human Mutation. 35 (2): 187–91. doi:10.1002/humu.22468. PMID 24166809. S2CID 23291764.

[ISOGG2015-3] International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haplogroup Tree 2015. (Access date: 1 February 2015.)

[A0-T-4] Haplogroup A0-T is also known as A-L1085 (and previously as A0'1'2'3'4).

[A1-5] Haplogroup A1 is also known as A1'2'3'4.

[F-Y27277-6] F-Y27277, sometimes known as F2'4, is both the parent clade of F2 and F4 and a child of F-M89.

[LT-7] Haplogroup LT (L298/P326) is also known as Haplogroup K1.

[K2-8] Between 2002 and 2008, Haplogroup T-M184 was known as "Haplogroup K2". That name has since been re-assigned to K-M526, the sibling of Haplogroup LT.

[K2b-9] Haplogroup K2b (M1221/P331/PF5911) is also known as Haplogroup MPS.

[K2b1-10] Haplogroup K2b1 (P397/P399) is also known as Haplogroup MS, but has a broader and more complex internal structure.

[P-11] Haplogroup P (P295) is also klnown as K2b2.

[K-M2313-12] K-M2313*, which as yet has no phylogenetic name, has been documented in two living individuals, who have ethnic ties to India and South East Asia. In addition, K-Y28299, which appears to be a primary branch of K-M2313, has been found in three living individuals from India. See: Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, "K-M2335", and; PhyloTree, 2017, "Details of the Y-SNP markers included in the minimal Y tree" (Access date of these pages: 9 December 2017)

[S-13] Haplogroup S, as of 2017, is also known as K2b1a. (Previously the name Haplogroup S was assigned to K2b1a4.)

[M-14] Haplogroup M, as of 2017, is also known as K2b1b. (Previously the name Haplogroup M was assigned to K2b1d.)

[ 1 ]

[ х 1 ]

[ х 2 ]

[ х 3 ]

[ х 4 ]

[ х 5 ]

[ х 6 ]

[ х 7 ]

[ х 8 ]

[ х 9 ]

[ х 10 ]

[ х 11 ]

[ х 12 ]

[ х 13 ]