Гаплогруппа R (Y-ДНК)

Гаплогруппа R
Гаплогруппа R
Возможное время происхождения	около 27 000 лет назад
Возможное место происхождения	Средняя Азия , или Северная Азия
Предок	P-M45 (P1c, ранее P1), одна из трех основных клад P * (P-F5850)
Потомки	Р1 (Р-М173), Р2 (Р-М479) (Р2)
Определение мутаций	M207/Page37/UTY2, CTS207/M600/PF5992, CTS2426/M661/PF6033, CTS2913/M667, CTS3229/M672/PF6036/YSC0001265, CTS3622/PF6037, CTS5815/M696, CTS6417/Y4 80, CTS7876/PF6052, CTS7880/M725/ PF6053, CTS8311/M732, CTS9005/M741, CTS10663/M788, CTS11075/M795/P6078, CTS11647/Y369, F33/M603/PF6013, F63/M614/PF6016, F82/M620, F154/M63 6, Ф295 /М685, Ф356/ M703/PF5919, F370/M708/Y479, F459/Y482, F652/M805, F765, FGC1168, L248.3/M705.3, L747/M702/PF5918/YSC0000287, L760/M642/PF5877/YSC0000286 , Л1225/М789/ YSC0000232, L1347/M792/PF6077/YSC0000233, M613, M628/PF5868, M651/Y296, M718, M734/PF6057/S4/YSC0000201, M760/Y506, M764/PF5953, M799, 0, П227, П229/ПФ6019, П232, П280, П285, ПФ5938, ПФ6014/С9

Гаплогруппа R , или R-M207 , представляет собой гаплогруппу ДНК Y-хромосомы . Он многочисленн и широко распространен среди современного населения.

Некоторые субклады- потомки были обнаружены с доисторических времен в Европе , Центральной Азии и Южной Азии . Другие уже давно присутствуют на более низких уровнях в некоторых частях Западной Азии и Африки . Некоторые авторитетные источники также предположили, что более спорно, что R-M207 уже давно присутствует среди коренных американцев в Северной Америке – теория, которая еще не получила широкого признания. ^[5]

По мнению генетика Спенсера Уэллса , гаплогруппа К возникла на Ближнем Востоке или в Центральной Азии . ^[6] Однако Карафет и др. (2014) предположили, что «быстрая диверсификация… K-M526 », также известного как K2, вероятно, произошла в Юго-Восточной Азии (около Индонезии ), а затем распространилась на материковую Азию, хотя они не могли исключить, что она могла возникнуть в Евразия и позже там вымерли, и что любой из этих сценариев «одинаково экономен». ^[7] По данным Бергсторма и др., гаплогруппа K2b1 (Y-гаплогруппа S/M), обнаруженная у коренных австралийцев , и предки гаплогрупп R и Q (Y-гаплогруппа K2b2 / корень P) разделились в Юго-Восточной Азии недалеко от Сахула. ^[8]

Структура

Филогенетическое древо Y-ДНК человека

Гаплогруппа R

М207 ( клавиша R)

М173 (Р1)

М420 (Р1а)

М459	(Р1а1)

	(Р1а*)

М343(Р1б)

Л278	(R1b1)

	(Р1б*)

М479(Р2)

М124 (Р2а)

Л263	(Р2а1)

F1092	(Р2а2)

Y12100	(Р2а3)

(Р2*)

Происхождение

Генетик Спенсер Уэллс предполагает, что гаплогруппа K, вероятно, возникла на Ближнем Востоке или в Центральной Азии , возможно, в регионе Ирана или Пакистана . ^[6] По данным Бергсторма и др., глубоко укоренившаяся гаплогруппа K2b1 (Y-гаплогруппа S/M), обнаруженная у коренных австралийцев и предков гаплогрупп R и Q (Y-гаплогруппа K2b2 / корень P), разделилась в Юго-Восточной Азии недалеко от Сахула. ^[8] Гаплогруппа P1 могла возникнуть в Юго-Восточной Азии, однако, по мнению Карафета и др. эта гипотеза «экономна», и столь же вероятно, что она возникла где-то в Евразии. ^[7] M207 Считается , что SNP , определяющий гаплогруппу R, возник в эпоху верхнего палеолита , около 27 000 лет назад. ^[2]^[1]

Только один подтвержденный пример базального R* был обнаружен в останках возрастом 24 000 лет, известных как MA1 , найденных в мальтийско-буретской культуре недалеко от озера Байкал в Сибири . ^[2] (Хотя о живом примере R-M207(xM17,M124) сообщалось в 2012 году, он не проверялся на SNP M478; рассматриваемый мужчина – среди выборки из 158 мужчин этнических таджиков из Бадахшана , Афганистан – поэтому может принадлежать к R2 .)

Возможно, что ни одна из первичных ветвей R-M207, а именно R1 (R-M173) и R2 (R-M479), до сих пор не существует в своих базальных, первоначальных формах, т.е. R1* и R2*. В научной литературе не зарегистрировано ни одного подтвержденного случая заболевания ни живым, ни мертвым. (Хотя в случае R2* проведено сравнительно мало исследований.)

Несмотря на редкость R* и R1*, часто отмечается относительно быстрое расширение – географическое и численное – субкладов из R1, в частности: «и R1a, и R1b представляют собой молодые звездообразные расширения» ( Karafet 2008 ).

В частности, отмечено также широкое географическое распространение R1b. Халласт и др. (2014) упомянули, что живые примеры, обнаруженные в Центральной Азии, включают:

«самый глубокий субклад» R-M269 (R1b1a1a2) – самая многочисленная ветвь R1b в Западной Европе, а;
редкий субклад R-PH155 (R1b1b) обнаружен только у одного жителя Бутана и одного таджика.

(Хотя Халласт и др. предположили, что R-PH155 «почти так же стар, как и раскол R1a/R1b», позже было обнаружено, что R-PH155 является субкладом R-L278 (R1b1) и получил филогенетическое название R1b1b. )

Распределение

Y-гаплогруппа R-M207 распространена по всей Европе , Южной Азии и Центральной Азии ( Kayser 2003 ). Встречается также на Кавказе и в Сибири . Некоторые меньшинства в Африке также несут субклады R-M207 с высокой частотой.

Хотя некоторые коренные народы Америки и Австралазии также имеют высокие уровни R-M207, неясно, являются ли они глубокими корнями или результатом европейской колонизации в эпоху раннего Нового времени .

Р (Р-М207)

Гаплогруппа R* Y-ДНК (xR1,R2) была обнаружена в останках возрастом 24 000 лет с Мальты в Сибири недалеко от озера Байкал. ^[11] В 2013 году R-M207 был обнаружен у одного из 132 мужчин кыргызов Восточного Кыргызстана. ^[12]

Р1 (Р-М173)

Существует множество последующих мутаций гаплогруппы R ( Семино 2000 и Россер 2000 ).

Первоначально шли споры о происхождении гаплогруппы R1b у коренных американцев. Два ранних исследования показали, что эта гаплогруппа могла быть одной из основополагающих сибирских линий коренных американцев, однако сейчас это считается маловероятным, поскольку линии R1b, обычно встречающиеся у коренных американцев, в большинстве случаев идентичны линиям у западных европейцев, и ее самая высокая концентрация наблюдается среди множества культурно не связанных племен в восточной части Северной Америки. ^[13]

Таким образом, по мнению ряда авторов, R1b, скорее всего, был занесен в результате примеси во время европейского заселения Северной Америки после 1492 года. ^[14]^[15]^[16]

Р2 (Р-М479)

Гаплогруппа R-M479 определяется наличием маркера M479. Парагруппа линии R-M479 встречается преимущественно в Южной Азии, хотя глубоко укоренившиеся примеры также были обнаружены среди португальского, испанского, татарского (Башкортостан, Россия) и осетинского (Кавказ) населения ( Myres 2010 ).

Один редкий субклад может встречаться только среди евреев-ашкенази , возможно, в результате эффекта основателя .

См. также

Генетика

Субклады Y-ДНК R-M207

Основополагающее дерево Y-ДНК

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ISOGG , гаплогруппа R Y-ДНК и ее субклады – 2016 г. (12 декабря 2016 г.).
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Рагхаван М. и др. 2014. Геном Сибири эпохи верхнего палеолита обнаруживает двойное происхождение коренных американцев, Nature , 505, 87–91.
^ Дрим, Джордж Л. ван (25 мая 2021 г.). Этнолингвистическая предыстория: заселение мира с точки зрения языка, генов и материальной культуры . БРИЛЛ. п. 204. ИСБН 978-90-04-44837-7 .
^ Махал, Дэвид Г.; Мацукас, Янис Г. (2018). «Географическое происхождение этнических групп на Индийском субконтиненте: исследование древних следов с помощью гаплогрупп Y-ДНК» . Границы генетики . 9 :4. дои : 10.3389/fgene.2018.00004 . ISSN 1664-8021 . ПМЦ 5787057 . ПМИД 29410676 . Это одна из крупнейших гаплогрупп Индии и Пакистана. Это также самая крупная гаплогруппа в наборе данных, использованном в этом исследовании. Он возник в Северной Азии около 27 000 лет назад (ISOGG, 2016). Это одна из самых распространенных гаплогрупп в Европе, ее ветви в некоторых регионах достигают 80 процентов населения (Eupedia, 2017). Откуда-то из Центральной Азии некоторые потомки человека, несущего мутацию M207 в Y-хромосоме, направились на юг и прибыли в Индию около 10 000 лет назад (Wells, 2007).
^ Чжао, Чжунмин; Хан, Фейсал; Боркар, Минал; Эррера, Рене; Агравал, Суракша (2009). «Наличие трех разных отцовских линий среди жителей Северной Индии: исследование 560 Y-хромосом» . Анналы биологии человека . 36 (1): 46–59. дои : 10.1080/03014460802558522 . ISSN 0301-4460 . ПМЦ 2755252 . ПМИД 19058044 . Рисунок 3
^ Перейти обратно: ^а ^б Уэллс, Спенсер (20 ноября 2007 г.). Глубокая родословная: эпохальный поиск ДНК для расшифровки нашего далекого прошлого . Национальные географические книги. п. 79. ИСБН 978-1-4262-0211-7 . «Учитывая широкое распространение К, он, вероятно, возник где-то на Ближнем Востоке или в Центральной Азии, возможно, в районе Ирана или Пакистана».
^ Перейти обратно: ^а ^б Карафет Т.М., Мендес Ф.Л., Судойо Х., Лансинг Дж.С., Хаммер М.Ф. (март 2015 г.). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии» . Европейский журнал генетики человека . 23 (3): 369–73. дои : 10.1038/ejhg.2014.106 . ПМЦ 4326703 . ПМИД 24896152 . «Эта закономерность заставляет нас выдвинуть гипотезу о юго-восточном азиатском происхождении P-P295 и более поздней экспансии предка подгаплогрупп R и Q в материковую Азию. Альтернативное объяснение могло бы включать в себя событие исчезновения предковых хромосом P-P295* повсюду в Азии. Эти сценарии одинаково экономны. Они включают либо событие миграции (хромосом P* из Индонезии в материковую Азию), либо событие вымирания парагруппы P-P295* в Евразии».
^ Перейти обратно: ^а ^б Бергстрем, Андерс; Нэгл, Нано; Чен, Юань; Маккарти, Шейн; Поллард, Мартин О.; Аюб, Касим; Уилкокс, Стивен; Уилкокс, Лия; ван Оршот, Роланд А.Х.; Макаллистер, Питер; Уильямс, Лесли; Сюэ, Яли; Митчелл, Р. Джон; Тайлер-Смит, Крис (март 2016 г.). «Глубокие корни Y-хромосом аборигенов Австралии» . Современная биология . 26 (6): 809–813. Бибкод : 2016CBio...26..809B . дои : 10.1016/j.cub.2016.01.028 . ПМЦ 4819516 . ПМИД 26923783 . «Применяя частоту точечных мутаций 0,76 × 10-9 на сайт в год, полученную на основе количества недостающих мутаций в Y-хромосоме евразийского образца возрастом около 45 тысяч лет, датированного радиоуглеродом [18], мы делаем вывод о времени дивергенции 54,3 тыс. лет (95% доверительный интервал [ДИ]: 48,0–61,6 тыс. лет) между хромосомами K∗/M у Сахула и их ближайших родственников в гаплогруппах R и Q (рис. 1B)» - (рис. 1B): «Филогения Y хромосомы в гаплогруппах K∗ и M. Этот подробный вид части большего дерева, показанного на (A), фокусируется на хромосомах в гаплогруппах K∗ и M. Гаплогруппы Q и R, которые являются ближайшими родственниками K∗ и M в филогения представлены схематически, поскольку содержат очень большое количество образцов австралийских и папуасских аборигенов, окрашенных в два разных оттенка красного цвета для облегчения визуального разделения».
^ Лбова, Людмила (2021). «Сибирский палеолитический памятник Мальта: уникальный источник для изучения детской археологии» . Эволюционные гуманитарные науки . 3 :8, рис. 6-1. дои : 10.1017/ehs.2021.5 . ПМЦ 10427291 . ПМИД 37588521 .
^ Ван CC, Ли Х (июнь 2013 г.). «Выводы об истории человечества в Восточной Азии на основе Y-хромосом» . Исследовательская генетика . 4 (1): 11. дои : 10.1186/2041-2223-4-11 . ПМЦ 3687582 . ПМИД 23731529 .
^ Рагхаван М., Скоглунд П., Граф К.Э., Метспалу М., Альбрехцен А., Мольтке И. и др. (январь 2014 г.). «Геном Сибири верхнего палеолита свидетельствует о двойном происхождении коренных американцев» . Природа . 505 (7481): 87–91. Бибкод : 2014Natur.505...87R . дои : 10.1038/nature12736 . ПМК 4105016 . ПМИД 24256729 .
^ Ди Кристофаро Дж., Пеннарун Э., Мазьер С., Майрес Н.М., Лин А.А., Темори С.А. и др. (18 октября 2013 г.). «Афганский Гиндукуш: место, где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента» . ПЛОС ОДИН 8 (10): е76748. Бибкод : 2013PLoSO... 876748D дои : 10.1371/journal.pone.0076748 . ПМЦ 3799995 . ПМИД 24204668 .
^ Болник, Дебора; Больник, Дэниел; Смит, Дэвид (2006). «Асимметричные мужские и женские генетические истории среди коренных американцев восточной части Северной Америки» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (11): 2161–2174. дои : 10.1093/molbev/msl088 . ПМИД 16916941 . «В большинстве случаев существует широко распространенное согласие относительно того, представляет ли конкретная гаплогруппа древнюю индейскую линию или примесь после 1492 года, но статус гаплогруппы R-M173 недавно стал предметом некоторых дискуссий. Некоторые авторы утверждают, что эта гаплогруппа представляет собой основополагающая линия коренных американцев (Лелл и др., 2002; Бортолини и др., 2003), тогда как другие предполагают, что она вместо этого отражает недавнюю европейскую примесь (Тарасона-Сантос и Сантос, 2002; Бош и др., 2003; Зегура и др., 2004). В восточной части Северной Америки характер вариаций гаплотипов внутри этой гаплогруппы подтверждает последнюю гипотезу: гаплотипы R-M173 не группируются по популяциям или культурным территориям, как это делают гаплотипы в других гаплогруппах-основателях, и большинство из них соответствуют или тесно связаны с R- Гаплотипы M173, которые распространены в Европе, но редки в Азии. Эта закономерность противоположна ожидаемой, если гаплотипы R-M173 коренных американцев произошли от азиатских гаплотипов, и предполагает, что недавняя европейская примесь ответственна за присутствие гаплогруппы R-M173 на востоке Севера. Америка."
^ Болник, Дебора Энн (2005). Генетическая предыстория восточной части Северной Америки: данные древней и современной ДНК . Калифорнийский университет в Дэвисе. п. 83. «Гаплогруппа R - M173, вероятно, представляет собой недавнюю (после 1492 г.) европейскую примесь, как и P-M45* (Tarazona-Santos and Santos 2002; Bosch et al. 2003...»
^ Рафф, Дженнифер (8 февраля 2022 г.). Происхождение: Генетическая история Америки . Издательство Гранд Сентрал. стр. 59–60. ISBN 978-1-5387-4970-8 . «Гаплогруппы-основатели Y-хромосомы у коренных американцев включают Q-M3 (и ее субгаплогруппы, Q-CTS1780) и C3-MPB373 (потенциально C-P39-Z30536). Другие гаплогруппы, обнаруженные [sic] в популяциях коренных американцев, такие как R1b, вероятно, были результатом постевропейской контактной примеси (44)».
^ Малхи, Рипан Сингх; Гонсалес-Оливер, Анжелика; Шредер, Кэри Бритт; и др. (декабрь 2008 г.). «Распределение Y-хромосом среди коренных жителей Северной Америки: исследование истории населения Атапаски» . Американский журнал физической антропологии . 137 (4): 412–424. дои : 10.1002/ajpa.20883 . ПМЦ 2584155 . ПМИД 18618732 . «Все особи, которые не принадлежали к гаплогруппам Q и C, были исключены из набора данных гаплотипов, поскольку эти гаплотипы, вероятно, являются результатом неместной примеси (Tarazona-Santos and Santos, 2002; Zegura et al., 2004; Bolnick et al. , 2006)...Частота гаплогруппы C наиболее высока на северо-западе Северной Америки, а частота гаплогруппы R, присутствие которой приписывают европейской примеси, достигает максимума на северо-востоке Северной Америки».

Дальнейшее чтение

Майрес Н.М., Роотси С., Лин А.А., Ярве М., Кинг Р.Дж., Кутуев И. и др. (январь 2011 г.). «Эффект основателя основной гаплогруппы Y-хромосомы R1b эпохи голоцена в Центральной и Западной Европе» . Европейский журнал генетики человека . 19 (1): 95–101. дои : 10.1038/ejhg.2010.146 . ПМК 3039512 . ПМИД 20736979 .
Лелл Дж.Т., Сукерник Р.И., Стариковская Ю.Б., Су Б., Джин Л., Шурр Т.Г., Андерхилл П.А., Уоллес Д.К. (январь 2002 г.). «Двойное происхождение и сибирское сходство Y-хромосом коренных американцев» . Американский журнал генетики человека . 70 (1): 192–206. дои : 10.1086/338457 . ПМЦ 384887 . ПМИД 11731934 .
Сингх Малхи, Рипан; Гонсалес-Оливер, Анжелика; Шредер, Кэри Бритт; Кемп, Брайан М.; Гринберг, Джонатан А.; Добровский, Соломон З.; Смит, Дэвид Гленн; Ресендес, Андрес; Карафет, Татьяна; Хаммер, Майкл; Зегура, Стивен; Бровко, Татьяна (декабрь 2008 г.). «Распределение Y-хромосом среди коренных жителей Северной Америки: исследование истории населения Атапаски» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 137 (4): 412–424. дои : 10.1002/ajpa.20883 . ПМЦ 2584155 . ПМИД 18618732 . Архивировано из оригинала (PDF) 17 июня 2010 года.
Кивисилд Т., Роотси С., Метспалу М., Мастана С., Калдма К., Парик Дж. и др. (февраль 2003 г.). «Генетическое наследие первых поселенцев сохраняется как в индийских племенах, так и в кастах» . Американский журнал генетики человека . 72 (2): 313–32. дои : 10.1086/346068 . ПМК 379225 . ПМИД 12536373 .
Уэллс Р.С., Юлдашева Н., Рузибакиев Р., Андерхилл П.А., Евсеева И., Блю-Смит Дж. и др. (август 2001 г.). «Центр Евразии: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (18): 10244–9. Бибкод : 2001PNAS...9810244W . дои : 10.1073/pnas.171305098 . ПМК 56946 . ПМИД 11526236 .
Андерхилл П.А., Майрес Н.М., Руци С., Мецпалу М., Животовский Л.А., Кинг Р.Дж. и др. (апрель 2010 г.). «Разделение постледникового происхождения европейских и азиатских Y-хромосом в пределах гаплогруппы R1a» . Европейский журнал генетики человека . 18 (4): 479–84. дои : 10.1038/ejhg.2009.194 . ПМЦ 2987245 . ПМИД 19888303 .
Кивисилд, Т.; Роотси, С.; Метспалу, М.; Мастана, С.; Калдма, К.; Парик, Дж.; Метспалу, Э.; Адоджаан, М.; Толк, Х.-В.; Степанов В.; Гёльге, М.; Усанга, Э.; Папиха, СС; Чинниоглу, К.; Кинг, Р.; Кавалли-Сфорца, Л.; Андерхилл, Пенсильвания; Виллемс, Р. (февраль 2003 г.). «Генетическое наследие первых поселенцев сохраняется как в индийских племенных, так и в кастовых популяциях» (PDF) . Американский журнал генетики человека . 72 (2): 313–332. дои : 10.1086/346068 . ПМК 379225 . ПМИД 12536373 . S2CID 951358 . Архивировано из оригинала (PDF) 27 июня 2007 года . Проверено 6 сентября 2011 г.
Луиджи Лука Кавалли-Сфорца (1994). История и география человеческих генов . Издательство Принстонского университета. ISBN 978-0-691-08750-4 .
Карафет Т.М., Мендес Ф.Л., Мейлерман М.Б., Андерхилл П.А., Зегура С.Л., Хаммер М.Ф. (май 2008 г.). «Новые бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 .
Семино О., Пассарино Г., Офнер П.Дж., Лин А.А., Арбузова С., Бекман Л.Е. и др. (ноябрь 2000 г.). «Генетическое наследие палеолитического Homo sapiens sapiens у современных европейцев: взгляд на Y-хромосому». Наука . 290 (5494): 1155–9. Бибкод : 2000Sci...290.1155S . дои : 10.1126/science.290.5494.1155 . ПМИД 11073453 .
Уэллс Р.С., Юлдашева Н., Рузибакиев Р., Андерхилл П.А., Евсеева И., Блю-Смит Дж. и др. (август 2001 г.). «Центр Евразии: континентальный взгляд на разнообразие Y-хромосомы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 98 (18): 10244–9. Бибкод : 2001PNAS...9810244W . дои : 10.1073/pnas.171305098 . ПМК 56946 . ПМИД 11526236 .
Пассарино Дж., Каваллери Г.Л., Лин А.А., Кавалли-Сфорца Л.Л., Борресен-Дейл А.Л., Андерхилл, Пенсильвания (сентябрь 2002 г.). «Различные генетические компоненты норвежской популяции, выявленные с помощью анализа полиморфизмов мтДНК и Y-хромосомы» . Европейский журнал генетики человека . 10 (9): 521–9. дои : 10.1038/sj.ejhg.5200834 . ПМИД 12173029 .
Бехар Д.М., Томас М.Г., Скорецкий К., Хаммер М.Ф., Булыгина Е., Розенгартен Д. и др. (октябрь 2003 г.). «Множественное происхождение ашкеназских левитов: свидетельства Y-хромосомы как ближневосточного, так и европейского происхождения» . Американский журнал генетики человека . 73 (4): 768–79. дои : 10.1086/378506 . ПМК 1180600 . ПМИД 13680527 .
Саха А., Шарма С., Бхат А., Пандит А., Бамезай Р. (2005). «Генетическая близость между пятью различными группами населения в Индии, отражающая поток генов Y-хромосомы» . Журнал генетики человека . 50 (1): 49–51. дои : 10.1007/s10038-004-0219-3 . ПМИД 15611834 .
Сенгупта С., Животовский Л.А., Кинг Р., Мехди С.К., Эдмондс К.А., Чоу К.Э. и др. (февраль 2006 г.). «Полярность и временность распределения Y-хромосомы в Индии с высоким разрешением определяют как местное, так и экзогенное распространение и выявляют незначительное генетическое влияние скотоводов Центральной Азии» . Американский журнал генетики человека . 78 (2): 202–21. дои : 10.1086/499411 . ПМЦ 1380230 . ПМИД 16400607 .
Чинниоглу (2004). «Раскопки слоев гаплотипов Y-хромосомы в Анатолии» (PDF) . Генетика человека . 114 (2): 127–48. дои : 10.1007/s00439-003-1031-4 . ПМИД 14586639 . S2CID 10763736 . Архивировано из оригинала (PDF) 19 июня 2006 года.
Андерхилл П.А., Майрес Н.М., Руци С., Мецпалу М., Животовский Л.А., Кинг Р.Дж. и др. (апрель 2010 г.). «Разделение постледникового происхождения европейских и азиатских Y-хромосом в пределах гаплогруппы R1a» . Европейский журнал генетики человека . 18 (4): 479–84. дои : 10.1038/ejhg.2009.194 . ПМЦ 2987245 . ПМИД 19888303 .
Кайзер М., Брауэр С., Вайс Г., Шифенхёвель В., Андерхилл П., Шен П. и др. (февраль 2003 г.). «Снижение разнообразия Y-хромосомы, но не митохондриальной ДНК, в человеческих популяциях из Западной Новой Гвинеи» . Американский журнал генетики человека . 72 (2): 281–302. дои : 10.1086/346065 . ПМК 379223 . ПМИД 12532283 .
Фирасат С., Халик С., Мохьюддин А., Папайоанну М., Тайлер-Смит С., Андерхилл П.А. и др. (январь 2007 г.). «Y-хромосомные доказательства ограниченного вклада греков в патанское население Пакистана» . Европейский журнал генетики человека . 15 (1): 121–6. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201726 . ПМЦ 2588664 . ПМИД 17047675 .
Кран, Томас. «Проект дерева Y-ДНК FTDNA (AKA YTree)» . ДНК генеалогического древа . Архивировано из оригинала 15 августа 2015 года.
Россер Ж.Х., Зержал Т., Хёрлес М.Е., Адохаан М., Алавантик Д., Аморим А., Амос В., Арментерос М. и др. (2000). «Разнообразие Y-хромосомы в Европе является клинальным и зависит в первую очередь от географии, а не от языка» . Американский журнал генетики человека . 67 (6): 1526–1543. дои : 10.1086/316890 . ПМЦ 1287948 . ПМИД 11078479 .

Внешние ссылки

Обсуждение и проекты

[vanOven2014-17] Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). "Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome". Human Mutation. 35 (2): 187–91. doi:10.1002/humu.22468. PMID 24166809. S2CID 23291764.

[ISOGG2015-18] International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haplogroup Tree 2015. (Access date: 1 February 2015.)

[A0-T-19] Haplogroup A0-T is also known as A-L1085 (and previously as A0'1'2'3'4).

[A1-20] Haplogroup A1 is also known as A1'2'3'4.

[F-Y27277-21] F-Y27277, sometimes known as F2'4, is both the parent clade of F2 and F4 and a child of F-M89.

[LT-22] Haplogroup LT (L298/P326) is also known as Haplogroup K1.

[K2-23] Between 2002 and 2008, Haplogroup T-M184 was known as "Haplogroup K2". That name has since been re-assigned to K-M526, the sibling of Haplogroup LT.

[K2b-24] Haplogroup K2b (M1221/P331/PF5911) is also known as Haplogroup MPS.

[K2b1-25] Haplogroup K2b1 (P397/P399) is also known as Haplogroup MS, but has a broader and more complex internal structure.

[P-26] Haplogroup P (P295) is also klnown as K2b2.

[K-M2313-27] K-M2313*, which as yet has no phylogenetic name, has been documented in two living individuals, who have ethnic ties to India and South East Asia. In addition, K-Y28299, which appears to be a primary branch of K-M2313, has been found in three living individuals from India. See: Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, "K-M2335", and; PhyloTree, 2017, "Details of the Y-SNP markers included in the minimal Y tree" (Access date of these pages: 9 December 2017)

[S-28] Haplogroup S, as of 2017, is also known as K2b1a. (Previously the name Haplogroup S was assigned to K2b1a4.)

[M-29] Haplogroup M, as of 2017, is also known as K2b1b. (Previously the name Haplogroup M was assigned to K2b1d.)

[isogg2016-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ISOGG , гаплогруппа R Y-ДНК и ее субклады – 2016 г. (12 декабря 2016 г.).

[Raghavan-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с Рагхаван М. и др. 2014. Геном Сибири эпохи верхнего палеолита обнаруживает двойное происхождение коренных американцев, Nature , 505, 87–91.

[3] Дрим, Джордж Л. ван (25 мая 2021 г.). Этнолингвистическая предыстория: заселение мира с точки зрения языка, генов и материальной культуры . БРИЛЛ. п. 204. ИСБН 978-90-04-44837-7 .

[4] Махал, Дэвид Г.; Мацукас, Янис Г. (2018). «Географическое происхождение этнических групп на Индийском субконтиненте: исследование древних следов с помощью гаплогрупп Y-ДНК» . Границы генетики . 9 :4. дои : 10.3389/fgene.2018.00004 . ISSN 1664-8021 . ПМЦ 5787057 . ПМИД 29410676 . Это одна из крупнейших гаплогрупп Индии и Пакистана. Это также самая крупная гаплогруппа в наборе данных, использованном в этом исследовании. Он возник в Северной Азии около 27 000 лет назад (ISOGG, 2016). Это одна из самых распространенных гаплогрупп в Европе, ее ветви в некоторых регионах достигают 80 процентов населения (Eupedia, 2017). Откуда-то из Центральной Азии некоторые потомки человека, несущего мутацию M207 в Y-хромосоме, направились на юг и прибыли в Индию около 10 000 лет назад (Wells, 2007).

[5] Чжао, Чжунмин; Хан, Фейсал; Боркар, Минал; Эррера, Рене; Агравал, Суракша (2009). «Наличие трех разных отцовских линий среди жителей Северной Индии: исследование 560 Y-хромосом» . Анналы биологии человека . 36 (1): 46–59. дои : 10.1080/03014460802558522 . ISSN 0301-4460 . ПМЦ 2755252 . ПМИД 19058044 . Рисунок 3

[Wells2007-6] Перейти обратно: ^а ^б Уэллс, Спенсер (20 ноября 2007 г.). Глубокая родословная: эпохальный поиск ДНК для расшифровки нашего далекого прошлого . Национальные географические книги. п. 79. ИСБН 978-1-4262-0211-7 . «Учитывая широкое распространение К, он, вероятно, возник где-то на Ближнем Востоке или в Центральной Азии, возможно, в районе Ирана или Пакистана».

[Karafet2014-7] Перейти обратно: ^а ^б Карафет Т.М., Мендес Ф.Л., Судойо Х., Лансинг Дж.С., Хаммер М.Ф. (март 2015 г.). «Улучшенное филогенетическое разрешение и быстрая диверсификация гаплогруппы Y-хромосомы K-M526 в Юго-Восточной Азии» . Европейский журнал генетики человека . 23 (3): 369–73. дои : 10.1038/ejhg.2014.106 . ПМЦ 4326703 . ПМИД 24896152 . «Эта закономерность заставляет нас выдвинуть гипотезу о юго-восточном азиатском происхождении P-P295 и более поздней экспансии предка подгаплогрупп R и Q в материковую Азию. Альтернативное объяснение могло бы включать в себя событие исчезновения предковых хромосом P-P295* повсюду в Азии. Эти сценарии одинаково экономны. Они включают либо событие миграции (хромосом P* из Индонезии в материковую Азию), либо событие вымирания парагруппы P-P295* в Евразии».

[Bergstorm-8] Перейти обратно: ^а ^б Бергстрем, Андерс; Нэгл, Нано; Чен, Юань; Маккарти, Шейн; Поллард, Мартин О.; Аюб, Касим; Уилкокс, Стивен; Уилкокс, Лия; ван Оршот, Роланд А.Х.; Макаллистер, Питер; Уильямс, Лесли; Сюэ, Яли; Митчелл, Р. Джон; Тайлер-Смит, Крис (март 2016 г.). «Глубокие корни Y-хромосом аборигенов Австралии» . Современная биология . 26 (6): 809–813. Бибкод : 2016CBio...26..809B . дои : 10.1016/j.cub.2016.01.028 . ПМЦ 4819516 . ПМИД 26923783 . «Применяя частоту точечных мутаций 0,76 × 10-9 на сайт в год, полученную на основе количества недостающих мутаций в Y-хромосоме евразийского образца возрастом около 45 тысяч лет, датированного радиоуглеродом [18], мы делаем вывод о времени дивергенции 54,3 тыс. лет (95% доверительный интервал [ДИ]: 48,0–61,6 тыс. лет) между хромосомами K∗/M у Сахула и их ближайших родственников в гаплогруппах R и Q (рис. 1B)» - (рис. 1B): «Филогения Y хромосомы в гаплогруппах K∗ и M. Этот подробный вид части большего дерева, показанного на (A), фокусируется на хромосомах в гаплогруппах K∗ и M. Гаплогруппы Q и R, которые являются ближайшими родственниками K∗ и M в филогения представлены схематически, поскольку содержат очень большое количество образцов австралийских и папуасских аборигенов, окрашенных в два разных оттенка красного цвета для облегчения визуального разделения».

[9] Лбова, Людмила (2021). «Сибирский палеолитический памятник Мальта: уникальный источник для изучения детской археологии» . Эволюционные гуманитарные науки . 3 :8, рис. 6-1. дои : 10.1017/ehs.2021.5 . ПМЦ 10427291 . ПМИД 37588521 .

[10] Ван CC, Ли Х (июнь 2013 г.). «Выводы об истории человечества в Восточной Азии на основе Y-хромосом» . Исследовательская генетика . 4 (1): 11. дои : 10.1186/2041-2223-4-11 . ПМЦ 3687582 . ПМИД 23731529 .

[10.1038_nature12736-11] Рагхаван М., Скоглунд П., Граф К.Э., Метспалу М., Альбрехцен А., Мольтке И. и др. (январь 2014 г.). «Геном Сибири верхнего палеолита свидетельствует о двойном происхождении коренных американцев» . Природа . 505 (7481): 87–91. Бибкод : 2014Natur.505...87R . дои : 10.1038/nature12736 . ПМК 4105016 . ПМИД 24256729 .

[Cristofaro-12] Ди Кристофаро Дж., Пеннарун Э., Мазьер С., Майрес Н.М., Лин А.А., Темори С.А. и др. (18 октября 2013 г.). «Афганский Гиндукуш: место, где сходятся потоки генов Евразийского субконтинента» . ПЛОС ОДИН 8 (10): е76748. Бибкод : 2013PLoSO... 876748D дои : 10.1371/journal.pone.0076748 . ПМЦ 3799995 . ПМИД 24204668 .

[13] Болник, Дебора; Больник, Дэниел; Смит, Дэвид (2006). «Асимметричные мужские и женские генетические истории среди коренных американцев восточной части Северной Америки» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (11): 2161–2174. дои : 10.1093/molbev/msl088 . ПМИД 16916941 . «В большинстве случаев существует широко распространенное согласие относительно того, представляет ли конкретная гаплогруппа древнюю индейскую линию или примесь после 1492 года, но статус гаплогруппы R-M173 недавно стал предметом некоторых дискуссий. Некоторые авторы утверждают, что эта гаплогруппа представляет собой основополагающая линия коренных американцев (Лелл и др., 2002; Бортолини и др., 2003), тогда как другие предполагают, что она вместо этого отражает недавнюю европейскую примесь (Тарасона-Сантос и Сантос, 2002; Бош и др., 2003; Зегура и др., 2004). В восточной части Северной Америки характер вариаций гаплотипов внутри этой гаплогруппы подтверждает последнюю гипотезу: гаплотипы R-M173 не группируются по популяциям или культурным территориям, как это делают гаплотипы в других гаплогруппах-основателях, и большинство из них соответствуют или тесно связаны с R- Гаплотипы M173, которые распространены в Европе, но редки в Азии. Эта закономерность противоположна ожидаемой, если гаплотипы R-M173 коренных американцев произошли от азиатских гаплотипов, и предполагает, что недавняя европейская примесь ответственна за присутствие гаплогруппы R-M173 на востоке Севера. Америка."

[14] Болник, Дебора Энн (2005). Генетическая предыстория восточной части Северной Америки: данные древней и современной ДНК . Калифорнийский университет в Дэвисе. п. 83. «Гаплогруппа R - M173, вероятно, представляет собой недавнюю (после 1492 г.) европейскую примесь, как и P-M45* (Tarazona-Santos and Santos 2002; Bosch et al. 2003...»

[15] Рафф, Дженнифер (8 февраля 2022 г.). Происхождение: Генетическая история Америки . Издательство Гранд Сентрал. стр. 59–60. ISBN 978-1-5387-4970-8 . «Гаплогруппы-основатели Y-хромосомы у коренных американцев включают Q-M3 (и ее субгаплогруппы, Q-CTS1780) и C3-MPB373 (потенциально C-P39-Z30536). Другие гаплогруппы, обнаруженные [sic] в популяциях коренных американцев, такие как R1b, вероятно, были результатом постевропейской контактной примеси (44)».

[Malhi-16] Малхи, Рипан Сингх; Гонсалес-Оливер, Анжелика; Шредер, Кэри Бритт; и др. (декабрь 2008 г.). «Распределение Y-хромосом среди коренных жителей Северной Америки: исследование истории населения Атапаски» . Американский журнал физической антропологии . 137 (4): 412–424. дои : 10.1002/ajpa.20883 . ПМЦ 2584155 . ПМИД 18618732 . «Все особи, которые не принадлежали к гаплогруппам Q и C, были исключены из набора данных гаплотипов, поскольку эти гаплотипы, вероятно, являются результатом неместной примеси (Tarazona-Santos and Santos, 2002; Zegura et al., 2004; Bolnick et al. , 2006)...Частота гаплогруппы C наиболее высока на северо-западе Северной Америки, а частота гаплогруппы R, присутствие которой приписывают европейской примеси, достигает максимума на северо-востоке Северной Америки».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[х 1]

[х 2]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]