Гаплогруппа R (мтДНК)

Гаплогруппа R
Гаплогруппа R
Возможное время происхождения	66,8 ± 14,2 из
Возможное место происхождения	Юго-Восточная Азия
Предок	Н
Потомки	R0 , R1, R1b , R2'JT , R3, R5, R6'7, R8, R9, R11'B , R12'21, R14, R22, R23, R30, R31, P , U
Определение мутаций	12705, 16223

Гаплогруппа R — широко распространенная гаплогруппа митохондриальной ДНК (мтДНК) человека. Гаплогруппа R связан с заселением Евразии примерно 70 000 лет назад и распространен среди современных популяций по всему миру за пределами Африки к югу от Сахары . ^{[ 4 ]}

является потомком макрогаплогруппы N. Гаплогруппа R Среди гаплогрупп-потомков клады R есть B , U (и, следовательно, K ), F , R0 (и, следовательно, HV , H и V ) и JT (предковая гаплогруппа J и T ).

Источник

Соарес и др. (2009) оценивают возраст гаплогруппы R примерно от 50 000 до 70 000 лет назад. ^{[ 1 ]}

Это согласуется с появлением в ходе прибрежной миграции из Восточной Африки в Западную, Южную и Юго-Восточную Азию. ^{[ 5 ]} Было высказано предположение, что раннее происхождение гаплогрупп M, N и R вдоль прибрежного маршрута произошло примерно от 70 000 до 60 000 лет назад. ^{[ 6 ]} Северный маршрут из Африки является еще одной возможностью, где экспансия гаплогруппы R может происходить из Юго-Восточной Азии . ^{[ 7 ]}

Гаплогруппа R имеет большое разнообразие и древность у коренного населения Южной Азии. Племена и касты Западной и Южной Индии демонстрируют более высокое разнообразие, чем другие регионы, что, возможно, указывает на их автохтонный статус. ^{[ 8 ]} Ларруга и др. (2017) обнаружили, что мтДНК R распространилась в Евразию и Австралию из основной области вдоль побережья Юго-Восточной Азии . ^{[ 4 ]}

Археогенетика

Окаменелость усть-ишимского человека из Сибири, датированная ок. Возраст 45 000 лет, принадлежит к гаплогруппе R* (ранее классифицировавшейся как U*). ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Гаплогруппа R также наблюдалась среди египетских мумий, раскопанных на археологическом участке Абусир-эль-Мелек в Северном Египте, которые датируются периодами доптолемеев/позднего Нового царства , птолемеевского и римского периодов. ^{[ 11 ]}

Субклад R2 наблюдался в останках неолитического человека из западного Ирана в Тепе Абдул Хосейне. ^{[ 12 ]}

Распределение

Гаплогруппа R и ее потомки распространены по всей Австралии , Америке , Юго-Восточной Азии , Южной Азии , Центральной Азии , Западной Азии , Восточной Азии , Европе , Северной Африке и на Африканском Роге .

Базальная клада R* встречается среди сокотри (1,2%), а также в Северо-Восточной Африке (1,5%), на Ближнем Востоке (0,8%), на Ближнем Востоке (0,8%) и на Аравийском полуострове (0,3%). . ^{[ 13 ]}

Субклады

Гаплогруппа R
- R0 или предварительное HV
  - R0a или (preHV)1: обычно встречается на Аравийском полуострове, с наибольшей частотой среди жителей Сокотри. ^{[ 14 ]} Умеренная частота встречается в Северной Африке , на Африканском Роге и в Центральной Азии .
  - Х.В.: Это западно-евразийская гаплогруппа, которая в основном встречается на Ближнем Востоке , включая Иран . ^{[ 15 ]} Он также встречается в Северной Африке , Центральной Азии и Южной Азии .
    - - V : Встречается с умеренно низкой частотой по всей Европе; самая высокая частота - у саамов 40%. ^{[ 16 ]}
    - HV1: В основном на Ближнем Востоке . ^{[ 17 ]}
    - HV2: В основном в Южной Азии . ^{[ 15 ]}
    - HV3: В основном в Восточной Европе . ^{[ 18 ]}
    - Х: В Западной Евразии . Это наиболее распространенная гаплогруппа мтДНК в Европе .
- Р1
  - - R1a* (3337): Встречается у брахманов из Уттар-Прадеша (Индия). ^{[ 6 ]}
    - R1a1: Встречается у Северо-Западного Кавказа, народов таких как кабардинцы и адыгеи . Наблюдается у восточноевропейских популяций, таких как северо-западные русские и поляки . ^{[ 18 ]}
    - R1b : Наблюден у восточного охотника-собирателя из Карелии, Россия, датируется 5500 годом до нашей эры. ^{[ 19 ]}
      - R1b1: наблюдался в Болгарии, Армении (включая древний экземпляр) и Индии.
        R1b1a: наблюдается у уйгуров.
        
        R1b1b: Наблюдается в Финляндии (включая финских шведов ).
      - Р1б2
        R1b2a: Наблюдается у якутов.
        
        R1b2b: наблюдается у уйгуров.
- пре-JT или R2'JT
  - R2 : присутствует на низких частотах на Ближнем Востоке, в Пакистане и Индии. ^{[ 5 ]} Встречается в немногочисленных популяциях в бассейне Волги . ^{[ 5 ]} Найден в Белуджистане (Пакистан). ^{[ 15 ]}
    - (13500): найден в Раджастане и Уттар-Прадеше (Индия). ^{[ 5 ]}
    - (150, 303+1С): В Иране , Грузии и Турции .
  - Джей Ти
    - Дж.: Самая высокая частота — на Ближнем Востоке (12%), 21% — в Саудовской Аравии . ^{[ 17 ]} J снижается в сторону Европы (11%), Кавказа (8%), Северной Африки ( 6%) и практически отсутствует в Восточной Азии. ^{[ 20 ]}
    - Т: Самая высокая частота – в Прикаспийском регионе ( Кавказ , Северный Иран , Туркменистан ). ^{[ 15 ]} Это важно в Европе (почти 10%), ^{[ 21 ]} Ближний Восток , Центральная Азия , Пакистан и Северная Африка . Небольшая частота на Африканском Роге и в Индии .
- R3 : Найден в Армении. ^{[ 22 ]} Также наблюдалось у древнего человека из Венгрии , датируемого 7000 лет назад. ^{[ 23 ]}
- R5 : Широко распространен на Индийском субконтиненте . Особенно в Мадхья-Прадеше ( Индия ) на уровне 17%. ^{[ 24 ]}
  - Р5а
    - R5a1: Встречается у индоевропейскоязычного населения Индии . ^{[ 25 ]}
    - R5a2: Особенно среди дравидских групп Индии и Шри-Ланки . ^{[ 25 ]}
- R6'7 (16362) Наибольшее присутствие наблюдается среди австроазиатского языка носителей из Индии (10%). ^{[ 25 ]}
  - R6 : Небольшие частоты в Индии и Пакистане широко распространены как среди тамильского , так и среди кашмирского населения. ^{[ 24 ]}
  - R7 : На Индийском субконтиненте . ^{[ 25 ]}^{[ 26 ]}
    - R7a: В основном в Восточной Индии , особенно в Санталах из Бихара и Джаркханда . ^{[ 26 ]}
    - R7b: Особенно у дравидийских племен Восточной Индии . ^{[ 26 ]}
- R8 : Самая высокая частота встречается в Восточной Индии , особенно в Ориссе (12%), и встречается среди австроазиатских племен ( говорящих на мунда и хаси ). Он также присутствует в низкой частоте среди носителей дравидского, индоевропейского и тибето-бирманского языков ( например , ньиши , чангпа , шерпы ). ^{[ 27 ]}
  - R8a: Встречается в основном в Ориссе и Андхра-Прадеше (Индия).
  - R8b: В Ориссе , Гуджарате , Андхра-Прадеше (Индия).
- Р9 (16304)
  - R9b: Встречается в основном в Юго-Восточной Азии . ^{[ 28 ]} Встречается по всей Индонезии , в Индокитае , Малайзии , у малайских аборигенов, таких как Семелай в 28% и Находка в 21%. ^{[ 29 ]}
  - (249д)
    - R9c: По всему Малайскому архипелагу и Тайваню . В основном в Батаке ( Палаван ) — 58%, ^{[ 30 ]} Цоу ( Тайваня 22,9 % ), ^{[ 31 ]} и Алор (Индонезия) – 11%. ^{[ 32 ]}
    - F: Достаточно распространен в Восточной и Юго-Восточной Азии . Более высокие частоты встречаются в некоторых регионах, таких как Никобар (50%) и Аруначал-Прадеш (31%) ( Индия ). ^{[ 24 ]} и шорцы из Сибири - 44%. ^{[ 33 ]} Также значительная частота встречается у аборигенов Тайваня , Гуандуна (Китай), Малуку (Индонезия), Таиланда и Вьетнама .
- Р11'Б (16189)
  - R11 : Встречается в Китае , в основном у народа Лаху из Юньнани в количестве 12,5%. ^{[ 34 ]} Также в Японии , Корее , ^{[ 35 ]} Чамс , ^{[ 36 ]} и Раджастан (Индия).
  - Б
    - B4: Часто встречается в Восточной Азии , Юго-Восточной Азии , Полинезии , Меланезии , Микронезии , на Мадагаскаре и у коренных народов Америки .
    - B5: Распространение в Восточной и Юго-Восточной Азии .
  - R24 : Найден на Филиппинах . ^{[ 37 ]}
- 12'21 рэндов
  - R12 : Найден в Австралии . ^{[ 38 ]}
  - R21 : У коренных народов Малайзии , таких как Джахай Негритос , 63%. ^{[ 29 ]} и сенои 37%, а также в Манике Южного Таиланда и у нескольких других жителей Таиланда и Малайзии . ^{[ 39 ]}
- R14 : найден в Папуа-Новой Гвинее. ^{[ 40 ]} и на австронезийских носителях Восточного Тимора и Лембаты . ^{[ 41 ]}
- R22 или R12: Очень часто в Шомпене (10/29 = 34,5%). ^{[ 42 ]} В других местах встречается в основном в южно-центральной Индонезии (11,4% Матарам , 8,0% Вайнгапу , 7,3% Бали , 1,9% Борнео ) и в Чаме Бинь Тхуан , Вьетнам (7/168 = 4,2%), ^{[ 43 ]} с единичными или спорадическими проявлениями в Таиланде , Суматре , Яве , Сулавеси и Алоре . ^{[ 32 ]}
- R23 : Небольшая клада, найденная на Бали и Сумбе (Индонезия). ^{[ 32 ]}
- 30 рандов
  - R30a: Встречается в Андхра-Прадеше , Уттар-Прадеше (Индия), у народа тхару из Непала. ^{[ 44 ]} и сингальцы из Шри-Ланки . ^{[ 25 ]}
  - R30b: Найден в Пенджабе . ^{[ 25 ]}
  - R30* (1598, 16189): найден в Пенджабе , Непале и Японии . ^{[ 44 ]}
- Р31
  - R31a: У браминов из Уттар-Прадеша. ^{[ 6 ]} и раджпуты из Раджастана (Индия). ^{[ 25 ]}
  - R31b: В Реддисе из Андхра-Прадеша (Индия). ^{[ 6 ]}
- Р32
  - Найден на Маврикии.
- П: Это характерно для Сахула . Встречается на Филиппинах и в Восточной Индонезии .
  - (16176)
    - P1: Широко распространен в Меланезии . Более высокие частоты встречаются в Папуа-Новой Гвинее . ^{[ 45 ]} Также встречается в Малуку , Нуса-Тенгаре и Полинезии . ^{[ 46 ]}
    - П2'10
      - P2: В Меланезии , ^{[ 45 ]} особенно в Новой Гвинее и Новой Каледонии .
      - P10: Найден на Филиппинах . ^{[ 37 ]}
    - P9 (или AuE): у австралийских аборигенов из центрального региона. ^{[ 47 ]}
  - P3: В Австралии и Меланезии . ^{[ 45 ]}
  - P4: В Австралии и Меланезии . ^{[ 48 ]}
- В
  - U1: Встречается в основном на Ближнем Востоке и на Кавказе . Встречается от Индии до Средиземноморья и остальной Европы. ^{[ 49 ]}^{[ ненадежный источник? ]}
  - U5: Примерно 11% от общего числа европейцев и 10% американцев европейского происхождения. Самая высокая частота встречается у саамского народа . ^{[ 16 ]}
  - U6: Это распространено в Северной Африке и на Африканском Роге , особенно в странах Магриба . ^{[ 50 ]} Самая высокая частота субклада встречается среди алжирских берберов (29%). ^{[ 51 ]} и египетские копты (27,6%). ^{[ 52 ]} U6 также был обнаружен среди иберомаврских экземпляров, датируемых эпипалеолитом, на доисторическом стоянке Тафоральт . ^{[ 53 ]}
  - U2'3'4'7'8'9 (1811 г.): Широко распространен в Западной Евразии и на Индийском субконтиненте .
    - U8
      - К

Дерево

Это филогенетическое древо субкладов гаплогруппы R основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое древо глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека. ^{[ 3 ]} и последующие опубликованные исследования.