Гаплогруппа R0
Гаплогруппа R0 | |
---|---|
Возможное время происхождения | От 23 600 до 54 900 английских фунтов [ 1 ] |
Возможное место происхождения | Средний Восток |
Предок | Р |
Потомки | R0a, ВН |
Определение мутаций | 73, 11719 [ 2 ] |
Гаплогруппа R0 (ранее известная как гаплогруппа pre-HV [ 3 ] ) — гаплогруппа митохондриальной ДНК (мтДНК) человека.
Источник
[ редактировать ]Гаплогруппа R0 происходит от макрогаплогруппы R. Это предковая клада субклада R0a и гаплогруппы HV , следовательно, является предшественником гаплогрупп H и V. и
Большое разнообразие субкладов R0 на Аравийском полуострове предполагает, что клада возникла и распространилась оттуда.
Считается, что R0a возник в оазисах ледникового периода в Южной Аравии около 22 000 лет назад. Затем субклад распространился оттуда с наступлением позднего ледникового периода около 15 000 лн. [ 4 ]
Распределение
[ редактировать ]Гаплогруппа R0 обнаружена примерно в 55% остеологических останков, принадлежащих энеолитической трипольской культуре. [ 5 ]
Клада R0 также была обнаружена среди иберомаврских образцов в доисторических стоянках Тафоральт и Афалу , датируемых эпипалеолитом . Среди особей Тафоральта около 17% наблюдаемых гаплотипов принадлежали к различным субкладам R0, включая R0a1a (3/24; 13%) и R0a2c (1/24; 4%). Среди особей Афалу выявлен один гаплотип R0a1a (1/9; 11%). [ 6 ]
R0 также наблюдался среди мумий, раскопанных на археологическом участке Абусир-эль-Мелек в Среднем Египте, которые датируются периодами доптолемеев /позднего Нового царства , птолемеев и римлян . [ 7 ]
III века нашей эры Святой католической церкви Фортунато из Серракаприолы также был носителем субклада Роаб. [ нужна ссылка ]
Сегодня R0 обычно встречается на Аравийском полуострове, причем его самая высокая частота наблюдается вблизи Сокотри (40,7%). [ 8 ] Сокотри также имеют наибольшее разнообразие субкладов R0. [ 9 ] Клада также часто встречается среди калашей в Южной Азии (23%). [ 10 ] Кроме того, умеренная частота R0 встречается в Северо-Восточной Африке , Анатолии , Иранском нагорье и Далмации . Гаплогруппа наблюдалась среди арабов Чада (19%), [ 11 ] Суданские копты (13,8%), [ 12 ] Тигры (13,6%), [ 8 ] сомалийцы (13,3%), [ 8 ] Оромос (13,3%), [ 8 ] Афар (12,5%), [ 8 ] Амхара (11,5%), [ 8 ] Гураж (10%), [ 8 ] Регибате Сахарави (9,26%; 0,93% R0a и 8,33% R0a1a), [ 13 ] Галлы (9%), [ 12 ] Бежа (8,3%), [ 12 ] нубийцы (8%), [ 8 ] Аракиен (5,9%), [ 12 ] йеменцы (5,1–27,7%), [ 8 ] Иракцы (4,8%), [ 8 ] Друзы (4,3%), [ 8 ] Палестинцы (4%), [ 8 ] Алжирцы (1,67%), [ 13 ] и саудовцы (0–25%). [ 8 ]
Субклады
[ редактировать ]Дерево
[ редактировать ]Это филогенетическое древо субкладов гаплогруппы R0 основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое древо глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека. [ 2 ] и последующие опубликованные исследования.
- Р
- R0 (или до HV )
- R0a'b - Албания
- R0a (или (до HV)1 )
- R0a1 или (до HV)1a
- R0a-60.1T – Италия, Армяне Турции, [ 17 ] Калаш Пакистана [ 18 ]
- R0a2'3 - Иран, Ливан
- R0a2 или (до HV)1b
- R0a2a – Португалия, Испания, Италия
- R0a2a1 – Италия, Алжир
- R0a2b - Эфиопия [ 4 ]
- R0a2c – Саудовская Аравия, [ 19 ] Катар, Кувейт, йеменские евреи [ 4 ]
- R0a2d
- R0a2e
- R0a2f – арабы из Чада, [ 14 ] Объединенные Арабские Эмираты, [ 20 ] Саудовская Аравия
- R0a2f1
- R0a2f1a — Оман, Саудовская Аравия, Йемен.
- R0a2f1b – Йемен, Объединенные Арабские Эмираты
- R0a2f1
- R0a2g
- R0a2h – Объединенные Арабские Эмираты [ 23 ]
- R0a2i – Йемен [ 25 ]
- R0a2-T195C! - Саудовская Аравия
- R0a2j – Йемен, [ 26 ] Оман, Объединенные Арабские Эмираты
- R0a2k – Сардиния [ 27 ]
- R0a2k1 — Саудовская Аравия, Йемен
- R0a2l – Йемен [ 28 ]
- R0a2m – евреи-ашкенази , [ 29 ] Сюэта из Испании, [ 30 ] Гитанос Испании, [ 31 ] Мексика, [ 32 ] Эквадор, [ 33 ] [ 34 ] Марокко [ 35 ]
- R0a2n – друзы Ливана, [ 36 ] ассирийцы , [ 37 ] Италия, Бельцы Пакистана [ 38 ]
- R0a2q – Лучшее из R0a2q, [ 39 ] Сахо или Эритрея [ 40 ]
- R0a2r – Южная Европа (Румыния, Болгария), [ 4 ] Друзы [ 4 ]
- R0a2a – Португалия, Испания, Италия
- R0a3 – Йемен, [ 41 ] персы [ 42 ]
- R0a2 или (до HV)1b
- R0a4 – Испания, Португалия, евреи-ашкенази , [ 45 ] Ирак [ 4 ]
- R0a2'3 - Иран, Ливан
- R0b – Италия, [ 46 ] Азербайджан [ 47 ]
- R0a (или (до HV)1 )
- Х.В.
- R0a'b - Албания
- R0 (или до HV )
См. также
[ редактировать ]- Генеалогический ДНК-тест
- Генетическая генеалогия
- Митохондриальная генетика человека
- Популяционная генетика
Филогенетическое древо гаплогрупп митохондриальной ДНК (мтДНК) человека | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Митохондриальная Ева ( L ) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Л0 | Л1–6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Л1 | Л2 | Л3 | Л4 | Л5 | Л6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||
М | Н | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Чехия | Д | И | Г | вопрос | ТО | А | С | Р | я | В | Х | И | |||||||||||||||||||||||||||
С | С | Б | Ф | Р0 | до JT | П | В | ||||||||||||||||||||||||||||||||
Х.В. | Джей Ти | К | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ЧАС | V | Дж | Т |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Соарес, П; Эрмини, Л; Томсон, Н.; Мормина, М; Рито, Т; Рёль, А; Салас, А; Оппенгеймер, С; и др. (2009). «Поправка на очищающий отбор: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека» . Американский журнал генетики человека . 84 (6): 740–59. дои : 10.1016/j.ajhg.2009.05.001 . ПМК 2694979 . ПМИД 19500773 .
- ^ Jump up to: а б ван Овен, Маннис; Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое древо глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Человеческая мутация . 30 (2): E386–E394. дои : 10.1002/humu.20921 . ПМИД 18853457 . S2CID 27566749 .
- ^ Субклады гаплогруппы H , ДНК генеалогического древа
- ^ Jump up to: а б с д и ж г Франческа Гандини; Алессандро Ачилли; Мария Пала; Мартин Боднер; Стефания Брандини; Габриэла Хубер; Балаж Эгед; Лука Ферретти; Альберто Гомес-Карбалья; Антонио Салас; Розария Скоццари; Фульвио Кручиани; Альфредо Коппа; Уолтер Парсон; Орнелла Семино; Педро Соарес; Антонио Торрони; Мартин Б. Ричардс; Анна Оливьери (5 мая 2016 г.). «Картирование расселения людей на Африканском Роге из рефугиумов Аравийского ледникового периода с использованием митогеномов» . Научные отчеты . 6 : 25472. Бибкод : 2016NatSR...625472G . дои : 10.1038/srep25472 . ПМЦ 4857117 . ПМИД 27146119 .
- ^ Никитин Алексей Георгиевич; Сохацкий Михаил П.; Ковалюх Николай М.; Видейко, Михаил Ю. (14 апреля 2011 г.). «Комплексная хронология памятников и анализ древней митохондриальной ДНК из пещеры Вертеба - памятника трипольской культуры энеолитической Украины» (PDF) . Interdisciplinaria Archaeologica - Естественные науки в археологии (1–2). Археологический центр Оломоуца, Бюджетная организация: 9–18. дои : 10.24916/iansa.2011.1.1 . Проверено 14 мая 2013 г.
- ^ Кефи, Рим; и др. (2018). «О происхождении иберомавров: новые данные, основанные на древней митохондриальной ДНК и филогенетическом анализе популяций афалу и тафоральта». Митохондриальная ДНК Часть А. 29 (1): 147–157. дои : 10.1080/24701394.2016.1258406 . ПМИД 28034339 . S2CID 4490910 .
- ^ Шунеманн, Верена Дж.; и др. (2017). «Геномы древнеегипетских мумий предполагают увеличение африканского происхождения к югу от Сахары в постримские периоды» . Природные коммуникации . 8 : 15694. Бибкод : 2017NatCo...815694S . дои : 10.1038/ncomms15694 . ПМЦ 5459999 . ПМИД 28556824 .
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м Нет, Эми (2010). Анализ генетических данных в рамках междисциплинарной структуры для исследования недавней эволюционной истории человека и сложных заболеваний (PDF) (кандидатская диссертация). Университет Флориды . Проверено 6 апреля 2023 г.
- ^ Черный, Виктор; и др. (2009). «За пределами Аравии - поселение на острове Сокотра, что видно по генетическому разнообразию митохондрий и Y-хромосомы» (PDF) . Американский журнал физической антропологии . 138 (4): 439–447. дои : 10.1002/ajpa.20960 . ПМИД 19012329 . Архивировано из оригинала (PDF) 6 октября 2016 года . Проверено 12 июня 2016 г.
- ^ Кинтана-Мурси Л. и др. (2004). «Там, где Запад встречается с Востоком: сложный ландшафт мтДНК юго-западного и центральноазиатского коридора» (PDF) . Американский журнал генетики человека . 74 (5): 827–45. дои : 10.1086/383236 . ПМК 1181978 . ПМИД 15077202 . Архивировано из оригинала (PDF) 23 ноября 2009 г. Проверено 23 августа 2009 г.
- ^ Сересо, Мария; и др. (2011). «Новые данные о структуре населения бассейна озера Чад, полученные с помощью высокопроизводительного генотипирования митохондриальной ДНК, кодирующей SNP» . ПЛОС ОДИН . 6 (4): e18682. Бибкод : 2011PLoSO...618682C . CiteSeerX 10.1.1.291.8871 . дои : 10.1371/journal.pone.0018682 . ПМК 3080428 . ПМИД 21533064 .
- ^ Jump up to: а б с д Мохамед, Хишам Юсиф Хасан. «Генетические закономерности вариаций Y-хромосомы и митохондриальной ДНК, имеющие значение для заселения Судана» . Хартумский университет. Архивировано из оригинала (PDF) 10 ноября 2020 года . Проверено 16 апреля 2016 г.
- ^ Jump up to: а б Асмахан Бекада; Лара Р. Арауна; Тахрия Деба; Франческ Калафель; Сорая Бенхамамуш; Дэвид Комас (24 сентября 2015 г.). «Генетическая гетерогенность в человеческой популяции Алжира» . ПЛОС ОДИН . 10 (9): e0138453. Бибкод : 2015PLoSO..1038453B . дои : 10.1371/journal.pone.0138453 . ПМЦ 4581715 . ПМИД 26402429 . ; Таблица S5
- ^ Jump up to: а б с Виктор Черный; Конни Дж. Маллиган; Вероника Фернандес; и др. (январь 2011 г.). «Внутренняя диверсификация митохондриальной гаплогруппы R0a свидетельствует о максимальном демографическом расширении после последнего ледникового периода в Южной Аравии». Молекулярная биология и эволюция . 28 : 71–78. дои : 10.1093/molbev/msq178 . ПМИД 20643865 .
- ^ GenBank Номер доступа : HM185263.1.
- ^ GenBank Инвентарный номер : KP407023.1.
- ^ GenBank Номер доступа : KX499665.1
- ^ Мухаммад Хасан Сиддики; Аллах Ракха; Хушбухат Хан; Танвир Ахтар (2021). «Текущий пул окончательной коллекции митохондриальной ДНК из остатков Калаша» . Митохондриальная ДНК Часть B. 6 (8): 2412 (табл. 1). дои : 10.1080/23802359.2021.1952119 . ПМЦ 8284132 . ПМИД 34345711 .
- ^ GenBank Номер доступа : KM245132.1.
- ^ Фатма А. Продажи; Ранджит Виджаян; Наганесваран Судалаимутуасари; Абдул-Кадер Юг; и др. (август 2020 г.). «Геномный ландшафт митохондриального генома коренного населения Объединенных Арабских Эмиратов» . Гены . 11 (8):876.doi : 10.3390 /gene11080876 . ПМЦ 7464197 . ПМИД 32752197 .
- ^ GenBank Номер доступа : KP407060.1.
- ^ GenBank Номер доступа : KP407059.1.
- ^ Фатма А. Продажи; Ранджит Виджаян; Наганесваран Судалаимутуасари; Абдул-Кадер Юг; и др. (август 2020 г.). «Геномный ландшафт митохондриального генома коренного населения Объединенных Арабских Эмиратов» . Гены . 11 (8):876.doi : 10.3390 /gene11080876 . ПМЦ 7464197 . ПМИД 32752197 .
- ^ GenBank Номер доступа : KP407061.1.
- ^ GenBank Номер доступа : HM185243.1.
- ^ GenBank Номер доступа : HM185246.1.
- ^ GenBank Номер доступа : KY410137.1.
- ^ GenBank Номер доступа : HM185244.1.
- ^ Брук, Кевин Алан (2022). Материнские генетические линии евреев-ашкенази . Пресса академических исследований . п. 86. ИСБН 978-1644699843 .
- ^ Джоанна Ф. Феррагут; Кристиан Рамон; Хосе А. Кастро; Энтони Аморим; Л. Альварес; А. Пикорнелл (8 декабря 2020 г.). «Ближневосточное генетическое наследие в отцовском и материнском генофондах чуэтасов» . Научные отчеты 10 (1): Бибкод : 2020NatSR..1021428F 21428. дои : 10.1038/ s41598-020-78487-9 hdl : 10216/145245 . ПМЦ 7722846 . ПМИД 33293675 .
- ^ GenBank Номер доступа : ON155501.1 .
- ^ Брук, Кевин Алан (2022). Материнские генетические линии евреев-ашкенази . Пресса академических исследований . п. 87. ИСБН 978-1644699843 .
- ^ Брук, Кевин Алан (2022). Материнские генетические линии евреев-ашкенази . Пресса академических исследований . стр. 86–87. ISBN 978-1644699843 .
- ^ GenBank Номер доступа : OR678686.1.
- ^ Брук, Кевин Алан (2022). Материнские генетические линии евреев-ашкенази . Пресса академических исследований . п. 87. ИСБН 978-1644699843 .
- ^ GenBank Инвентарный номер : KP407062.1.
- ^ GenBank Номер доступа : MK217175.1.
- ^ Хушбухат Хан; Мухаммад Хасан Сиддики; и др. (февраль 2020 г.). «Анализ вариантов контрольной области митохондриальной ДНК в популяции Бельц в Гилгит-Балтистане, Пакистан». Мета Джин . 23 . дои : 10.1016/j.mgene.2019.100630 . S2CID 209561126 .
- ^ GenBank Номер доступа : KP407063.1.
- ^ GenBank Номер доступа : KP407064.1.
- ^ GenBank Номер доступа : HM185223.1.
- ^ GenBank Номер доступа : KC911556.1.
- ^ GenBank Инвентарный номер : KY797195.1 .
- ^ GenBank Инвентарный номер : KP407075.1.
- ^ Брук, Кевин Алан (2022). Материнские генетические линии евреев-ашкенази . Пресса академических исследований . стр. 88–89. ISBN 978-1644699843 .
- ^ GenBank Номер доступа : KT272407.1.
- ^ GenBank Номер доступа : KT272406.1.
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Яна Логана Сайт митохондриальной ДНК
- Манниса ван Овена PhyloTree
- Гаплогруппа R0
- Распространение гаплогруппы pre-HV , от National Geographic.