Гаплогруппа E (мтДНК)

Гаплогруппа Е
Гаплогруппа Е
Возможное время происхождения	35,000 до 8000 YBP
Возможное место происхождения	восточный Сундаленд или Фуцзянь побережье
Предок	М9
Потомки	Е1, Е2
Определение мутаций	3027, 3705, 7598, 13626, 16390

В митохондриальной генетике человека гаплогруппа E представляет собой гаплогруппу митохондриальной ДНК (мтДНК) человека, типичную для Малайского архипелага . Это подгруппа гаплогруппы М9 .

Источник

Было сделано два противоположных предположения о месте и времени происхождения гаплогруппы E. Одна из точек зрения состоит в том, что клада образовалась более 30 000 лет назад, примерно во времена Последнего ледникового максимума , на северо-восточном побережье Сундаленда (недалеко от современного Борнео ). В этой модели гаплогруппа была рассеяна из-за повышения уровня моря в позднеледниковый период. ^{[ 1 ]}^{[ 4 ]}

В 2014 году было обнаружено, что митохондриальная ДНК скелета возрастом 8000 лет, найденного на острове Лян , одном из островов Мацу у юго-восточного побережья Китая, принадлежит к гаплогруппе E, с двумя из четырех мутаций, характерных для подгруппы E1. Исходя из этого, Ко и его коллеги утверждают, что гаплогруппа E возникла 8000–11 000 лет назад недалеко от северного побережья Фуцзянь , отправилась на Тайвань с неолитическими поселенцами 6000 лет назад и оттуда распространилась в Приморскую Юго-Восточную Азию с распространением австронезийских языков . ^{[ 2 ]} Соарес и др. предостерегают от чрезмерного акцента на одном образце и утверждают, что постоянные молекулярные часы подразумевают, что более ранняя дата (и более южное происхождение) остается более вероятной. ^{[ 5 ]}

Распределение

Гаплогруппа Е встречается по всей территории Приморской Юго-Восточной Азии . ^{[ 4 ]} Он почти отсутствует в материковой части Восточной Азии, где распространена его родственная группа M9a (также обнаруженная в Японии). ^{[ 4 ]}^{[ 6 ]} В частности, он встречается среди носителей австронезийских языков и редок даже в Юго-Восточной Азии среди носителей других языковых семей. Он был обнаружен в популяциях Тайваня , Филиппин , Индонезии , Малайзии (включая Сабах на Борнео , но не у оранг-асли на полуострове Малайзия), прибрежной Папуа-Новой Гвинеи и особенно у чаморро на Марианских островах . ^{[ 4 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Из четырех основных субкладов E1b и E2a встречаются в основном в Приморской Юго-Восточной Азии, тогда как только E1a и E2b также встречаются на Тайване. ^{[ 12 ]} E2b имеет небольшое разнообразие на Тайване, что позволяет предположить, что он прибыл туда около 5000 лет назад. ^{[ 12 ]} Самый распространенный субклад E, E1a1a, имеет наибольшее разнообразие на Тайване, за ним следуют Филиппины и Сулавеси. Более того, другие ответвления E1a1 в основном ограничены Тайванем. ^{[ 13 ]}

Частоты гаплогруппы E мтДНК
Население	Частота	Считать	Источник	Подтипы
Чаморро (85 Гуам , 14 Сайпан и 6 Рота )	0.924	105	Вилар и др., 2013 г.	Е2а=68, Е1а2=29
Восточно-индонезийский ( Сулавеси , включая 89 Манадо , 64 Тораджа , 46 Уджунг Паданг и 38 Палу )	0.266	237	Хилл и др. 2007 г.	E1a=42, E1b=9, E2=7, E1(xE1a, E1b)=5
Филиппинский ( Минданао )	0.214	70	Таббада и др. 2010 , с. 24	E1a1a=10, E2(xE2b)=4, E1b=1
Филиппинский ( Висайские острова )	0.214	112	Таббада и др. 2010 , с. 24	E1a1a=18, E2(xE2b)=5, E1(xE1a1a, E1a2, E1b)=1
Восточно-индонезийский ( Амбон )	0.163	43	Хилл и др. 2007 г.	E1(xE1a, E1b)=3, E1a=2, E2=2
Восточно-индонезийский ( Вайнгапу , Сумба )	0.160	50	Хилл и др. 2007 г.	Е1b=6, Е1а=1, Е2=1
Индонезийский ( Бангка )	0.147	34	Хилл и др. 2006 г.	Е=5
Борнео ( Банджармасин, , 68 89 и Кота-Кинабалу )	0.146	157	Хилл и др. 2007 г.	E1a=14, E2=5, E1b=3, E1(xE1a, E1b)=1
Филиппинский	0.125	64	Таббада и др. 2010 , с. 24	E1a1a=5, E2(xE2b)=2, E1a2=1
Филиппины ( Лусон )	0.124	177	Таббада и др. 2010 , с. 24	E1a1a=14, E1b=5, E2(xE2b)=2, E2b=1
Тайвань (абориген)	0.120	640	Пэн и др. 2011 г.	Е=77
Восточно-индонезийский ( алор )	0.111	45	Хилл и др. 2007 г.	Е1а=3, Е1b=2
Восточно-индонезийский ( Матарам , Ломбок )	0.091	44	Хилл и др. 2007 г.	Е1б=3, Е1а=1
Индонезийский ( Паданг , Суматра )	0.083	24	Хилл и др. 2006 г.	Е=2
Индонезийский ( Медан , Суматра )	0.071	42	Хилл и др. 2006 г.	Е=3
Индонезийский ( Пеканбару , Медан , Бангка , Палембанг и Паданг )	0.067	180	Хилл и др. 2007 г.	E1a=6, E1b=4, E1(xE1a, E1b)=1, E2=1
Индонезийский ( Бали )	0.061	82	Хилл и др. 2007 г.	E1a=3, E1b=1, E1(xE1a, E1b)=1
Филиппинский ( Палаван )	0.050	20	Школы и др. 2011 г.	Е1а=1
Индонезийский ( Палембанг , Суматра )	0.036	28	Хилл и др. 2006 г.	Е=1
Туцзя ( уезд Яньхэ , Гуйчжоу )	0.034	29	Ли и др. 2007 г.	Е=1
Гелао (уезд Даочжэнь, Гуйчжоу)	0.032	31	Ли и др. 2007 г.	Е=1
Индонезийский ( Ява , вкл. 36 из Тенгера )	0.022	46	Хилл и др. 2007 г.	Е1б=1
Индонезийский ( Пеканбару , Суматра )	0.019	52	Хилл и др. 2006 г.	Е=1
Чам ( Биньтхуан , Вьетнам )	0.012	168	Пэн и др. 2010 г.	Е1а1а=1, Е2а=1
Каролинский ( Сайпан )	0.000	17	Вилар и др., 2013 г.	-
И ( уезд Хэчжан , Гуйчжоу )	0.000	20	Ли и др. 2007 г.	-
Дун ( уезд Тяньчжу, Гуйчжоу )	0.000	28	Ли и др. 2007 г.	-
Один ( Малайзия )	0.000	29	Хилл и др. 2006 г.	-
Также ( Хайнань	0.000	30	Пэн и др. 2011 г.	-
Батак ( Палаван )	0.000	31	Школы и др. 2011 г.	-
Лингао ( Хайнань )	0.000	31	Пэн и др. 2011 г.	-
Министр ( Малайзия )	0.000	32	Хилл и др. 2006 г.	-
Выводы ( Малайзия )	0.000	33	Хилл и др. 2006 г.	-
Данг ( Хайнань )	0.000	40	Пэн и др. 2011 г.	-
Джахай ( Малайзия )	0.000	51	Хилл и др. 2006 г.	-
Сеной ( Малайзия )	0.000	52	Хилл и др. 2006 г.	-
Семелаи ( Малайзия )	0.000	61	Хилл и др. 2006 г.	-
Гелао (уезд Даочжэнь, Гуйчжоу)	0.000	102	Лю и др. 2011 г.	-
Ли ( Хайнань )	0.000	346	Пэн и др. 2011 г.	-

Субклады

Это филогенетическое древо субкладов гаплогруппы E основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое древо глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека. ^{[ 3 ]} и последующие опубликованные исследования.

И
- Е1
  - Е1а
    - Е1а1
      - Е1а1а
        Е1а1а1
    - Е1а2
  - Е1б
    - E1b1
- Е2
  - Е2а
  - Е2б
    - E2b1
    - Е2б2

См. также

Филогенетическое древо гаплогрупп митохондриальной ДНК (мтДНК) человека

Митохондриальная Ева ( L )

Л1–6

М

Н

Чехия

Д

И

Г

вопрос

ТО

А

С

Р

я

В

Х

И

С

Б

Ф

Р0

до JT

П

В

К

V

Т

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Соарес и др. 2008 , с. 1215.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Ко и др. 2014 .
^ Jump up to: ^а ^б Ван Овен и Кайзер, 2008 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Хилл и др. 2007 .
^ Соарес и др. 2016 .
^ Трежо и др. 2005 .
^ Табада и др. 2010 , стр. 24, 28
^ Пэн и др. 2010 .
^ Хилл и др. 2006 .
^ Вилар и др. 2013 .
^ Пэн и др. 2011 .
^ Jump up to: ^а ^б Соарес и др. 2008 , с. 1213.
^ Таббада и др. 2010 , с. 29.

Хилл, Кэтрин; Соарес, Питер; Мормина, Облака; Маколей, Винсент; Михан, Уильям; Блэкберн, Джеймс; Кларк, Дуглас; Король Джозеф Марипа; Измаил, Патима; Бульбек, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Ричардс, Мартин (2006). «Филогеография и этногенез аборигенов Юго-Восточной Азии» . Молекулярная биология и эволюция . 23 (12): 2480–2491. дои : 10.1093/molbev/msl124 . hdl : 1885/23220 . ПМИД 16982817 .
Хилл, Кэтрин; Соарес, Питер; Мормина, Облака; Маколей, Винсент; Кларк, Дуги; Блюмбах, Петя Б.; Визуэте-Форстер, Мэтью; Форстер, Питер; Бульбек, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Ричардс, Мартин (2007). «Митохондриальная стратиграфия островов Юго-Восточной Азии » Американский журнал генетики человека . 80 (1): 29–43. дои : 10.1086/510412 . ПМЦ 1876738 . ПМИД 17160892 .
Ко, Альберт Мин-Шан; Чен, Чунг-Ю; Фу, Цяомэй; Дельфин, Фредерик; Ли, Минкун; Чиу, Хун-Лин; Стоункинг, Марк; Ко, Ин-Чин (2014). «Ранние австронезийцы: на Тайвань и обратно» . Американский журнал генетики человека . 94 (3): 426–436. дои : 10.1016/j.ajhg.2014.02.003 . ПМК 3951936 . ПМИД 24607387 .
Ли, Бинбин; Чжун, Фугуан; Йи, Хуншэн; Ван, Сяньрань; Ли, Лянфан; Ван, Лилан; Ци, Сяолань; Ву, Лифу (2007). «Генетический полиморфизм митохондриальной ДНК в этнических популяциях Донг, Гелао, Туцзя и И из Гуйчжоу, Китай». Журнал генетики и геномики . 34 (9): 800–811. дои : 10.1016/S1673-8527(07)60091-5 . ПМИД 17884690 .
Лю, Чанг; Чжао, Миан; Ху, Юй-Хуа; Чжан, Жуань-Чжан; Гао, Го-Фэн; проживающей на юго-западе Китая». гелао , группы Цин-Пэн (2011). «Полиморфизмы митохондриальной ДНК у этнической (1): PE4–E10. doi : 10.1016/j.fsigen.2010.04.007 . PMID 20494640 .
Пэн, Минь-Шэн; Куанг, Хай Хо; Данг, Хоа Фам; Трие, Ан Ву; Ван, Хуа-Вэй; Яо, Юн-Ганг; Конг, Цин-Пэн; Чжан, Я-Пин (2010). «Отслеживание австронезийского следа в материковой части Юго-Восточной Азии: взгляд на митохондриальную ДНК» . Молекулярная биология и эволюция . 27 (10): 2417–2430. дои : 10.1093/molbev/msq131 . ПМИД 20513740 .
Пэн, Минь-Шэн; Он, Джун-Донг; Лю, Хай-Синь; Чжан, Я-Пин (2011). «Прослеживание наследия первых жителей острова Хайнань – взгляд с точки зрения митохондриальной ДНК» . Эволюционная биология BMC . 11 (46): 46. Бибкод : 2011BMCEE..11...46P . дои : 10.1186/1471-2148-11-46 . ПМК 3048540 . ПМИД 21324107 .
Скоулз, Кларисса; Сиддл, Кэтрин; Дюкурно, Аксель; Кривелларо, Федерика; Жарве, Мари; Корни, Сирия; Беллатти, Мэгги; Таббада, Кристина; Мормина, Облака; Рейдла, Маере; Виллемс, Ричард; Кивисилд, Томас; Лар, Марта Миразон; Мильяно, Андреа Бамберг (2011). «Генетическое разнообразие и доказательства смешения популяций батак-негритос из Палавана» Американский журнал физической антропологии . 146 (1): 62–72. дои : 10.1002/ajpa.21544 . ПМИД 21796613 .
Соарес, Питер; Трежо, Жан Ален; Лоо, июнь-июнь; Хилл, Кэтрин; Мормина, Облака; Ли, Цзянь-Лян; Чен, Яо-Мин; Худжашов, Георгий; Форстер, Питер; Маколей, Винсент; Бульбек, Дэвид; Оппенгеймер, Стивен; Лин, Мари; Ричардс, Мартин Б. (2008). «Изменение климата и постледниковое расселение людей в Юго-Восточной Азии» . Молекулярная биология и эволюция . 25 (6): 1209–1218. дои : 10.1093/molbev/msn068 . ПМИД 18359946 .
СОАРЕС, Педро А.; Трежо, Жан А.; РИТО, Тереза; Кавадас, Бруно; Хилл, Кэтрин; Энг, Кен Хонг; МОРМИНА, Мару; БРАНДИО, Андрея; Фрейзер, Росс М.; Ван, Цзе-И; Лоо, Джун-Хун; Снелл, Кристофер; Ко, Цанг-Минг; АМОРИМ, Антониу; Пала, Мария; Маколей, Винсент; Бульбек, Дэвид; Уилсон, Джеймс Ф.; ГУСМИО, Леонор; Перейра, Луиза; Оппенгеймер, Стивен; Лин, Мари; Ричардс, Мартин Б. (2016). «Выяснение происхождения австронезийского населения» . Генетика человека . 135 (3): 309–326. дои : 10.1007/s00439-015-1620-z . ПМЦ 4757630 . ПМИД 26781090 .
Таббада, Кристина А.; Трежо, Жан; Лоо, июнь-июнь; Чен, Яо-Мин; Лин, Мари; Миразон-Лар, Марта; Кивисилд, Томас; Де Хунгри, Мэри Харт А. (2010). «Разнообразие митохондриальной ДНК Филиппин: населенный виадук между Тайванем и Индонезией?» . Молекулярная биология и эволюция . 27 (1): 21–3 дои : 10.1093/molbev/msp215 . ПМИД 19755666 .
Трежо, Жан А.; Кивисилд, Тоомас; Лоо, Джун Хун; Ли, Цзянь Лян; Он, Чун Линь; Сюй, Цзя Юнг; Ли, Чжэн Юань; Лин, Мари (2005). «Следы архаических митохондриальных линий сохраняются в австронезийскоязычных популяциях Формозы» . ПЛОС Биология . 3 (8). е247. дои : 10.1371/journal.pbio.0030247 . ПМЦ 1166350 . ПМИД 15984912 .
ван Овен, Маннис; Кайзер, Манфред (2008). «Обновленное комплексное филогенетическое древо глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Человеческая мутация . 30 (2): E386–E394. дои : 10.1002/humu.20921 . ПМИД 18853457 . S2CID 27566749 .
Вилар, Мигель Г.; Чан, Чим В.; Сантос, Дана Р.; Линч, Дэниел; Спатис, Рита; Гарруто, Ральф М.; Лам, Дж. Кодзи (2013). «Происхождение и генетическая особенность чаморро Марианских островов: взгляд на мтДНК» . Американский журнал биологии человека . 25 (1): 116–122. дои : 10.1002/ajhb.22349 . ПМЦ 4335639 . ПМИД 23180676 .

Внешние ссылки

Общий
- Манниса ван Овена Филодерево
Гаплогруппа Е
- Яна Логана Гаплогруппа E
- Яна Логана Гаплогруппа E1
- Яна Логана Гаплогруппа E1a1b
- Яна Логана Гаплогруппа E1a2
- Яна Логана Гаплогруппа E2
- YFull MTree Гаплогруппа E
- MITOMAP Гаплогруппа E
- МтДНК FamilyTreeDNA Гаплодерево: гаплогруппа E
- Баллинджер, Юго-Запад; Шурр, Т.Г.; Торрони, А.; Ган, ГГ; Ходж, Дж.А.; Хасан, К.; Чен, К.Х.; Уоллес, округ Колумбия (1992). «Анализ митохондриальной ДНК Юго-Восточной Азии показывает генетическую преемственность миграций древних монголоидов» . Генетика . 130 (1): 139–152. дои : 10.1093/генетика/130.1.139 . ПМЦ 1204787 . ПМИД 1346259 .
- Херрнштадт, К.; Элсон, Дж.Л.; Фэхи, Э.; и др. (2002). «Анализ уменьшенной медианной сети полных последовательностей кодирующих областей митохондриальной ДНК для основных африканских, азиатских и европейских гаплогрупп» . Американский журнал генетики человека . 70 (5): 1152–1171. дои : 10.1086/339933 . ПМЦ 447592 . ПМИД 11938495 .
- Ингман, М.; Кассманн, Х.; Паабо, С.; Джилленстен, У. (2000). «Вариации митохондриального генома и происхождение современного человека». Природа . 408 (6813): 708–713. Бибкод : 2000Natur.408..708I . дои : 10.1038/35047064 . ПМИД 11130070 . S2CID 52850476 .
- Стоункинг, М.; Джорде, LB; Бхатия, К.; Уилсон, AC (1990). «Географические вариации митохондриальной ДНК человека из Папуа-Новой Гвинеи» . Генетика . 124 (3): 717–733. дои : 10.1093/генетика/124.3.717 . ПМК 1203963 . ПМИД 1968873 .

[FOOTNOTESoares_et_al20081215-1] Jump up to: ^а ^б ^с Соарес и др. 2008 , с. 1215.

[FOOTNOTEKo_et_al2014-2] Jump up to: ^а ^б ^с Ко и др. 2014 .

[FOOTNOTEvan_OvenKayser2008-3] Jump up to: ^а ^б Ван Овен и Кайзер, 2008 г.

[FOOTNOTEHill_et_al2007-4] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Хилл и др. 2007 .

[FOOTNOTESoares_et_al2016-5] Соарес и др. 2016 .

[FOOTNOTETrejaut_et_al2005-6] Трежо и др. 2005 .

[FOOTNOTETabbada_et_al201024,_28-7] Табада и др. 2010 , стр. 24, 28

[FOOTNOTEPeng_et_al2010-8] Пэн и др. 2010 .

[FOOTNOTEHill_et_al2006-9] Хилл и др. 2006 .

[FOOTNOTEVilar_et_al2013-10] Вилар и др. 2013 .

[FOOTNOTEPeng_et_al2011-11] Пэн и др. 2011 .

[FOOTNOTESoares_et_al20081213-12] Jump up to: ^а ^б Соарес и др. 2008 , с. 1213.

[FOOTNOTETabbada_et_al201029-13] Таббада и др. 2010 , с. 29.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]