Гаплогруппа №1

Гаплогруппа №1
Гаплогруппа №1
Возможное время происхождения	Образован около 45 400–45 840 лет назад. ; (NO/NO1, по данным YFull 2017, и предыдущие оценки: 41 500 [95% ДИ 37 400 <-> 45 600] лет назад, 48 871 [95% ДИ 37 095 <-> 58 831] лет назад, и 50 800 или 43 500 лет назад. )
Возраст слияния	Примерно 41 500–40 067 лет назад (NO/NO1, по данным YFull 2017, и предыдущие оценки: 36 800 [95% ДИ 34 300 <-> 39 300] лет назад, 41 900 [31 294 <-> 51 202] лет назад, и 44 700 или 38 300 лет назад в зависимости от скорости мутации. )
Возможное место происхождения	Юго-Восточная Азия или Восточная Азия ( Северный Китай )
Предок	К-М2313 (М2313/Z4858)
Потомки	Н (М231) и О (М175).
Определение мутаций	М214/Стр.39; Ф176/М2314; CTS5858/M2325/F346; CTS11572

Гаплогруппа NO1 (M214/Page39; F176/M2314; CTS5858/M2325/F346; CTS11572), ^{[ 8 ]} также известный как NO-M214 , ^{[ 8 ]} Гаплогруппа ДНК Y-хромосомы человека . NO1 — единственный подтвержденный субклад гаплогруппы K-M2313 (также известный как NO-M2313, K2a1), ^{[ 9 ]} который является единственным субкладом гаплогруппы K2a (K-M2308). ^{[ 6 ]} NO является доминирующей гаплогруппой Y-ДНК в большинстве частей восточной и северной Евразии , включая Восточную Азию , Сибирь и северную Фенноскандию .

Расположение NO1 в SNP M214 соответствует таксономии, установленной Кармином и др. 2022, ^{[ 9 ]} и соответствует структуре, показанной ISOGG (2022). ^{[ 8 ]} (Однако ни Кармин, ни ISOGG не интегрировали ни один из выводов Позника и др., 2016 г.: ^{[ 6 ]} что существовало поколение субклада как над гаплогруппой NO1 (M214), так и под K-M2308. То есть и ISOGG, и Karmin et al. продолжал отождествлять K2a с гаплогруппой NO.)

До 2016 года субклады, компрометирующие как NO, так и NO1, не были распознаны и считались синонимами K2a. ^{[ 6 ]} Такие исследователи, как Дэвид Позник (Позник и др., 2016), задокументировали примеры ранее неизвестных субкладов гаплогруппы K2 как в древних останках, так и в живых людях, которые: (во-первых) имели несколько различных наборов SNP, которые ранее считались однозначно определяющими K2a и НЕТ, но также (во-вторых) отсутствовали какие-либо SNP, конкретно идентифицирующие гаплогруппы : гаплогруппу N (M231) и гаплогруппу O (M175). ^{[ 6 ]} Это убедительно продемонстрировало, что несколько стадий развития отделили K2a от NO, которые, следовательно, составили «прародительские» и «внучатые» клады. Позник и др. В 2016 году использовалось название «K2a1» (также известное как K-M2313 ) для Y-ДНК некоторых людей, принадлежавших к K2a(xK2a*,NO), а также упоминалось, что K-M2313 не включал все примеры K2a(xK2a *,НЕТ).

С 2022 года Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) называет NO-M214 «NO1», а K2a (M2308)/K-M2313 — «NO». ^{[ 8 ]} Может существовать по крайней мере еще одна первичная ветвь NO: в официальном дереве гаплогрупп Y-ДНК ISOGG указана гаплогруппа, известная как «NO1~» [ sic ] (CTS707/M2306), рядом с NO-M214 (которую ISOGG называет «NO1»). ). ^{[ 8 ]} Тильда (~) указывает на то , что точное положение NO1~ в филогении неизвестно. Это может быть первичная ветвь или брат NO, это может быть первичная ветвь или брат K2a, K-M2313, или вместо этого это может быть первичная ветвь K2a.

Судя по предполагаемому происхождению K2a, K-M2313 и базальных гаплогрупп N* и O* соответственно, NO*, вероятно, возник в Восточной Азии . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Распределение

Хотя есть некоторые свидетельства обнаружения NO* у живых людей, эти примеры недостаточно изучены. Вместо этого дальнейшие исследования могут идентифицировать их как принадлежащие к N* (M231), N1 или предварительному субкладу N2 (F3373/M2283/Page56/S323). ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} К таким случаям относятся:

5,7% (2/35) мужчин буэй в Китае или Вьетнаме; ^{[ 12 ]}
пул из четырех выборок японских мужчин - 2,9% (6/210), особенно в префектуре Токусима - 5,7% (4/70), ^{[ 11 ]} и;
небольшие порции образцов от Yizu , ^{[ 11 ]} Малайцы , ВС , монголы , ^{[ 11 ]} Даурс , ^{[ 12 ]} маньчжурские эвенки , ^{[ 12 ]} Хежес , ^{[ 12 ]} дом , ^{[ 12 ]} Яос , ^{[ 12 ]} южнокорейцы , ^{[ 12 ]} Фиджи (1/107 = 0,9%), Футуна 5%, Ниуэ 3,5%, Тувалу 3,6% и Самоа 3%.

Члены гаплогруппы NO* включают телугу индийского происхождения, отобранного в Соединенном Королевстве, и малайца, отобранного в Сингапуре. ^{[ 6 ]}^{[ 1 ]}

Два набора древних останков, ранее считавшиеся возможно принадлежащими NO, с тех пор были переклассифицированы выше по течению в K2a. ^{[ нужна ссылка ]}

Усть-Ишимский человек датируется примерно 45 000 лет назад и был найден в Омской области , Россия. ^{[ 13 ]} (До 2016 года эти останки ошибочно относились к категории К2*.)
Оазис 1 : останки мужчины, жившего 37 000–42 000 лет назад, найденные в Румынии. ^{[ 14 ]}

Аналогичным образом, случаи, ранее считавшиеся возможными примерами NO* или NO1*, а теперь исключенные, включают:

у двух ханьских мужчин-китайцев, ранее признанных отрицательными по M175 (т.е. гаплогруппе O) и LLY22g (устаревшему, возможно неточному маркеру N1), впоследствии было обнаружено, что они принадлежат к N* (N-M231), ^{[ 15 ]} и;
клада, впервые идентифицированная в Южной Индии, определенная SNP M147 и помеченная, среди других названий, «pre-NO» и «Гаплогруппа X», оказалась родственным братом NO (K2a) в гаплогруппе K2 (K-M526); новая клада была переименована в K2e . ^{[ нужна ссылка ]}

Субклады

Филогенетическое дерево

Эта филогения гаплогрупп K2a, K2a1 и NO основана на YFull 2018, ^{[ 1 ]} Poznik 2016, ISOGG 2018, Karafet 2008. ^{[ 6 ]}^{[ 8 ]}^{[ 16 ]}

К2а К-М2308 ( М2308 ) Встречается только в древних останках « Усть-Ишимский человек » (ок. 45 000 л.н.) и « Оазис 1 » (ок. 39 500 л.н.). ^{[ 6 ]}

К2а1 К-М2313 ( М2313/Z4858 ) ^{[ 6 ]} Назван Позником в 2016 г.; ранее не отличался от К2а.
- НЕТ K-M214 ( M214/страница39; F176/M2314; CTS5858/M2325/F346; CTS11572 ) ^{[ 1 ]}^{[ 6 ]}^{[ 8 ]} Poznik 2016 и ISOGG 2018 различают NO1 (M214), N и O.
  - - Н М231; CTS2947/M2175; Z4891; CTS10118 ^{[ 1 ]}
    - О М175/П186/П191/П196; Ф369/М1755; Ф380/М1757/С27659 ^{[ 1 ]}

Положение NO1~ ( CTS707/M2306 ), субклада K2a1 или NO, в этой филогении неясно. ^{[ 8 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час YFull YTree v5.08 , 2017, «K-M2335» (9 декабря 2017 г.); PhyloTree , 2017, «Подробная информация о маркерах Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (9 декабря 2017 г.); GeneticHomeland.com , 2016, Индекс ДНК-маркера хромосомы Y V4208 (9 декабря 2017 г.).
^ Jump up to: ^а ^б YFull Haplogroup YTree v5.06 от 25 сентября 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б Кармин, Моника; Сааг, Лаури; Висенте, Марио; и др. (2015). « », «Недавнее ограничение разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальными изменениями в культуре» . Геномные исследования . 25 (4): 459–466. дои : 10.1101/гр.186684.114 . ПМЦ 4381518 . ПМИД 25770088 .
^ Jump up to: ^а ^б Г. Дэвид Позник, Яли Сюэ, Фернандо Л. Мендес и др., 2016, «Периодические всплески демографии мужского пола, выявленные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру». Природная генетика, том. 48, нет. 6 (июнь): стр. 593–599. doi:10.1038/ng.3559.
^ Jump up to: ^а ^б Рутси, Сирия; Животовский Лев А; Бальдович, Мариан; Кайзер, Манфред; Кутуев, Ильдус А; Хусаинова, Рита; Бермишева Марина А; Губернатор Марина; Федорова, Сардана А; Илумяэ, Анне-Май; Хуснутдинова, Эльза К; Воевода Михаил I; Осипова Людмила П; Стоункинг, Марк; Лин, Алиса А; Ферак, Владимир; Парик, Юрий; Кивисилд, Томас; Андерхилл, Питер А; Виллемс, Ричард; и др. (2007). «Северный маршрут гаплогруппы N Y-хромосомы против часовой стрелки из Юго-Восточной Азии в Европу» . Европейский журнал генетики человека . 15 (2): 204–211. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201748 . ПМИД 17149388 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л Дж. Дэвид Позник и др., 2016, «Периодические всплески демографии мужского пола, выведенные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру», Nature Genetics , no. 48, стр. 593–599.
^ «Новая история Японского архипелага, раскрытая в результате междисциплинарных исследований ДНК, археологии и языка: история становления японского населения и японского языка»
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ISOGG, Дерево гаплогрупп Y-ДНК 2018 (17 января 2018 г.).
^ Jump up to: ^а ^б Моника Кармин и др., 2022, «Эпизоды диверсификации и изоляции мужских линий островной Юго-Восточной Азии и Ближнего Океании», Molecular Biology and Evolution , vol. 39, и. 3 (март). (Доступ: 25 января 2023 г.)
^ Ван, Чуан-Чао; Ли, Хуэй (3 июня 2013 г.). «Выводы об истории человечества в Восточной Азии на основе Y-хромосом» . Исследовательская генетика . 4 (1): 11. дои : 10.1186/2041-2223-4-11 . ISSN 2041-2223 . ПМЦ 3687582 . ПМИД 23731529 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Хаммер и др. (2005) «Двойное происхождение японцев: общая основа для Y-хромосом охотников-собирателей и фермеров», Архивировано 4 марта 2009 г. в Wayback Machine Японское общество генетики человека, 2005 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Сюэ, Яли; Зержал, Татьяна; Бао, Вэйдун; Чжу, Сулин; Шу, Цюньфан; Сюй, Цзюджин; Ду, Руофу; Фу, Сонбин; Ли, Пу; и др. (2006). «Мужская демография в Восточной Азии: контраст между севером и югом во времени роста населения» . Генетика . 172 (4): 2431–2439. doi : 10.1534/genetics.105.054270 . ПМЦ 1456369 . ПМИД 16489223 .
^ «Архивная копия» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 24 марта 2016 г. Проверено 10 марта 2017 г. {{cite web}}: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка )
^ Позник, Г.Д.; Сюэ, Ю; Мендес, Флорида; Виллемс, Т.Ф.; Домохозяйка, А; Уилсон Сейрес, Массачусетс; Аюб, К; Маккарти, SA; Наречания, А; Кашин С; Чен, Ю; Банерджи, Р; Родригес-Флорес, JL; Сересо, М; Шао, Х; Гимрек, М; Малхотра, А; Лузада, С; Десаль, Р; Ричи, GR; Сервейра, Э; Фицджеральд, TW; Гаррисон, Э; Маркетта, А; Миттельман, Д; Романович, М; Чжан, К; Чжэн-Брэдли, X; Абекасис, Греция; МакКэрролл, С.А.; Фличек, П; Андерхилл, Пенсильвания; Монета, л; Зербино, Д.Р.; Ян, Ф; Ли, К; Кларк, Л; Аутон, А; Эрлих, Ю; Handsaker, RE; Бустаманте, CD; Тайлер-Смит, C (2016). «Периодические всплески демографии мужского пола, выявленные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру» . Нат Жене . 48 (6): 593–9. дои : 10.1038/ng.3559 . hdl : 11858/00-001M-0000-002A-F024-C . ПМЦ 4884158 . ПМИД 27111036 .
^ Татьяна М. Карафет, Брайан Холлмарк, Мюррей П. Кокс и др. , «Основное разделение Восток-Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы по всей Индонезии», MBE Advance Access, опубликовано 5 марта 2010 г.
^ Карафет; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, СЛ; Хаммер, МФ; и др. (2008). «Новые абстрактные бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 .

Внешние ссылки

[vanOven2014-17] Van Oven M, Van Geystelen A, Kayser M, Decorte R, Larmuseau HD (2014). "Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome". Human Mutation. 35 (2): 187–91. doi:10.1002/humu.22468. PMID 24166809. S2CID 23291764.

[ISOGG2015-18] International Society of Genetic Genealogy (ISOGG; 2015), Y-DNA Haplogroup Tree 2015. (Access date: 1 February 2015.)

[A0-T-19] Haplogroup A0-T is also known as A-L1085 (and previously as A0'1'2'3'4).

[A1-20] Haplogroup A1 is also known as A1'2'3'4.

[F-Y27277-21] F-Y27277, sometimes known as F2'4, is both the parent clade of F2 and F4 and a child of F-M89.

[LT-22] Haplogroup LT (L298/P326) is also known as Haplogroup K1.

[K2-23] Between 2002 and 2008, Haplogroup T-M184 was known as "Haplogroup K2". That name has since been re-assigned to K-M526, the sibling of Haplogroup LT.

[K2b-24] Haplogroup K2b (M1221/P331/PF5911) is also known as Haplogroup MPS.

[K2b1-25] Haplogroup K2b1 (P397/P399) is also known as Haplogroup MS, but has a broader and more complex internal structure.

[P-26] Haplogroup P (P295) is also klnown as K2b2.

[K-M2313-27] K-M2313*, which as yet has no phylogenetic name, has been documented in two living individuals, who have ethnic ties to India and South East Asia. In addition, K-Y28299, which appears to be a primary branch of K-M2313, has been found in three living individuals from India. See: Poznik op. cit.; YFull YTree v5.08, 2017, "K-M2335", and; PhyloTree, 2017, "Details of the Y-SNP markers included in the minimal Y tree" (Access date of these pages: 9 December 2017)

[S-28] Haplogroup S, as of 2017, is also known as K2b1a. (Previously the name Haplogroup S was assigned to K2b1a4.)

[M-29] Haplogroup M, as of 2017, is also known as K2b1b. (Previously the name Haplogroup M was assigned to K2b1d.)

[M2335-1] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час YFull YTree v5.08 , 2017, «K-M2335» (9 декабря 2017 г.); PhyloTree , 2017, «Подробная информация о маркерах Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (9 декабря 2017 г.); GeneticHomeland.com , 2016, Индекс ДНК-маркера хромосомы Y V4208 (9 декабря 2017 г.).

[YFull-2] Jump up to: ^а ^б YFull Haplogroup YTree v5.06 от 25 сентября 2017 г.

[Karmin2015-3] Jump up to: ^а ^б Кармин, Моника; Сааг, Лаури; Висенте, Марио; и др. (2015). « », «Недавнее ограничение разнообразия Y-хромосомы совпадает с глобальными изменениями в культуре» . Геномные исследования . 25 (4): 459–466. дои : 10.1101/гр.186684.114 . ПМЦ 4381518 . ПМИД 25770088 .

[Poznik-4] Jump up to: ^а ^б Г. Дэвид Позник, Яли Сюэ, Фернандо Л. Мендес и др., 2016, «Периодические всплески демографии мужского пола, выявленные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру». Природная генетика, том. 48, нет. 6 (июнь): стр. 593–599. doi:10.1038/ng.3559.

[Rootsi-5] Jump up to: ^а ^б Рутси, Сирия; Животовский Лев А; Бальдович, Мариан; Кайзер, Манфред; Кутуев, Ильдус А; Хусаинова, Рита; Бермишева Марина А; Губернатор Марина; Федорова, Сардана А; Илумяэ, Анне-Май; Хуснутдинова, Эльза К; Воевода Михаил I; Осипова Людмила П; Стоункинг, Марк; Лин, Алиса А; Ферак, Владимир; Парик, Юрий; Кивисилд, Томас; Андерхилл, Питер А; Виллемс, Ричард; и др. (2007). «Северный маршрут гаплогруппы N Y-хромосомы против часовой стрелки из Юго-Восточной Азии в Европу» . Европейский журнал генетики человека . 15 (2): 204–211. дои : 10.1038/sj.ejhg.5201748 . ПМИД 17149388 .

[poznik-6] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л Дж. Дэвид Позник и др., 2016, «Периодические всплески демографии мужского пола, выведенные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру», Nature Genetics , no. 48, стр. 593–599.

[7] «Новая история Японского архипелага, раскрытая в результате междисциплинарных исследований ДНК, археологии и языка: история становления японского населения и японского языка»

[isogg2018-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ISOGG, Дерево гаплогрупп Y-ДНК 2018 (17 января 2018 г.).

[Karmin-9] Jump up to: ^а ^б Моника Кармин и др., 2022, «Эпизоды диверсификации и изоляции мужских линий островной Юго-Восточной Азии и Ближнего Океании», Molecular Biology and Evolution , vol. 39, и. 3 (март). (Доступ: 25 января 2023 г.)

[10] Ван, Чуан-Чао; Ли, Хуэй (3 июня 2013 г.). «Выводы об истории человечества в Восточной Азии на основе Y-хромосом» . Исследовательская генетика . 4 (1): 11. дои : 10.1186/2041-2223-4-11 . ISSN 2041-2223 . ПМЦ 3687582 . ПМИД 23731529 .

[Hammer2005-11] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Хаммер и др. (2005) «Двойное происхождение японцев: общая основа для Y-хромосом охотников-собирателей и фермеров», Архивировано 4 марта 2009 г. в Wayback Machine Японское общество генетики человека, 2005 г.

[Xue2006-12] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час Сюэ, Яли; Зержал, Татьяна; Бао, Вэйдун; Чжу, Сулин; Шу, Цюньфан; Сюй, Цзюджин; Ду, Руофу; Фу, Сонбин; Ли, Пу; и др. (2006). «Мужская демография в Восточной Азии: контраст между севером и югом во времени роста населения» . Генетика . 172 (4): 2431–2439. doi : 10.1534/genetics.105.054270 . ПМЦ 1456369 . ПМИД 16489223 .

[nature-13] «Архивная копия» (PDF) . Архивировано из оригинала (PDF) 24 марта 2016 г. Проверено 10 марта 2017 г. {{cite web}}: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка )

[14] Позник, Г.Д.; Сюэ, Ю; Мендес, Флорида; Виллемс, Т.Ф.; Домохозяйка, А; Уилсон Сейрес, Массачусетс; Аюб, К; Маккарти, SA; Наречания, А; Кашин С; Чен, Ю; Банерджи, Р; Родригес-Флорес, JL; Сересо, М; Шао, Х; Гимрек, М; Малхотра, А; Лузада, С; Десаль, Р; Ричи, GR; Сервейра, Э; Фицджеральд, TW; Гаррисон, Э; Маркетта, А; Миттельман, Д; Романович, М; Чжан, К; Чжэн-Брэдли, X; Абекасис, Греция; МакКэрролл, С.А.; Фличек, П; Андерхилл, Пенсильвания; Монета, л; Зербино, Д.Р.; Ян, Ф; Ли, К; Кларк, Л; Аутон, А; Эрлих, Ю; Handsaker, RE; Бустаманте, CD; Тайлер-Смит, C (2016). «Периодические всплески демографии мужского пола, выявленные на основе 1244 последовательностей Y-хромосомы по всему миру» . Нат Жене . 48 (6): 593–9. дои : 10.1038/ng.3559 . hdl : 11858/00-001M-0000-002A-F024-C . ПМЦ 4884158 . ПМИД 27111036 .

[Karafet2010-15] Татьяна М. Карафет, Брайан Холлмарк, Мюррей П. Кокс и др. , «Основное разделение Восток-Запад лежит в основе стратификации Y-хромосомы по всей Индонезии», MBE Advance Access, опубликовано 5 марта 2010 г.

[Karafet-16] Карафет; Мендес, Флорида; Мейлерман, МБ; Андерхилл, Пенсильвания; Зегура, СЛ; Хаммер, МФ; и др. (2008). «Новые абстрактные бинарные полиморфизмы изменяют форму и увеличивают разрешение дерева гаплогрупп Y-хромосомы человека» . Геномные исследования . 18 (5): 830–8. дои : 10.1101/гр.7172008 . ПМК 2336805 . ПМИД 18385274 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ х 1 ]

[ х 2 ]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]