Международное общество генетической генеалогии
 | |
| Аббревиатура | ИЗОГГ |
|---|---|
| Формирование | 2005 |
| Цель | Пропагандировать и обучать использованию генетики в качестве инструмента генеалогических исследований, а также продвигать сеть поддержки специалистов по генетической генеалогии. |
Членство | 8,000 |
Директор | Кэтрин Борхес |
| Веб-сайт | www |
| Часть серии о |
| Генетическая генеалогия |
|---|
| Концепции |
| Связанные темы |
Международное общество генетической генеалогии ( ISOGG ) — независимая некоммерческая некоммерческая организация специалистов по генетической генеалогии, управляемая добровольцами . Он был основан группой администраторов проекта ДНК по фамилиям в 2005 году для продвижения тестирования ДНК на генеалогию . Он пропагандирует использование генетики в генеалогических исследованиях , предоставляет образовательные ресурсы для специалистов по генеалогии, заинтересованных в тестировании ДНК, и способствует налаживанию связей между специалистами по генетической генеалогии. [1] [2] [3] По состоянию на июнь 2013 г. [update], в его состав входят более 8000 членов в 70 странах. [4] По состоянию на июль 2013 г. [update]Региональные встречи координируются 20 региональными координаторами-добровольцами, расположенными в США , Австралии , Бразилии , Канаде , Англии , Египте , Ирландии и России . [5] [6]
ISOGG размещает ISOGG Wiki , бесплатную онлайн-энциклопедию, поддерживаемую членами ISOGG, которая содержит широкий спектр образовательных ресурсов и рекомендаций для потребителей генетической генеалогии и администраторов проектов ДНК. [7] Wiki ISOGG содержит этические рекомендации для администраторов проектов ДНК, а члены ISOGG проводят экспертную оценку веб-сайтов проектов ДНК других участников по запросу, после чего на веб-сайтах может отображаться изображение «Проверено экспертами ISOGG». [8] [9]
Отраслевое регулирование и стандарты
[ редактировать ]В 2008 году ISOGG поддержала принятие Закона о недискриминации генетической информации, призванного запретить ненадлежащее использование генетической информации при медицинском страховании и трудоустройстве в Соединенных Штатах . [10] [11] На открытом заседании FDA по надзору за лабораторными тестами ISOGG выступила против правил FDA, запрещающих доступ потребителей к тестам DTC. [12] [13]
Статья, опубликованная в журнале «Генетика в медицине» в марте 2012 года, представляет собой обзор разнообразного набора тестов и практик в развивающейся индустрии генетической генеалогии DTC. В статье авторы подчеркивают потенциальную роль ISOGG в разработке рекомендаций по передовой отраслевой практике и рекомендаций для потребителей:
Мы призываем Международное общество генетической генеалогии (ISOGG) взять на себя ведущую роль в (i) формулировании этического кодекса для руководства практикой отрасли, которую оно защищает, и (ii) разработке руководства для потребителей, чтобы предоставить потенциальным потребителям ДНК-предков. тестирование отрасли с помощью надежных средств сравнения продуктов и компаний на предмет их различных потребительских мотиваций и интересов. [14]
Растущая доступность и популярность генетического генеалогического тестирования DTC также вызвали этические опасения по поводу специалистов по генеалогии, проверяющих ДНК других людей без согласия . [15] Wiki ISOGG содержит подборку внешних ресурсов по этике для специалистов по генетической генеалогии. [16]
Номенклатура Y-STR
[ редактировать ]ISOGG способствует принятию добровольных отраслевых стандартов номенклатуры Y-STR , разработанных NIST и опубликованных в Журнале генетической генеалогии в 2008 году. [10] [17] [18]
Гражданская наука
[ редактировать ]Члены ISOGG, такие как Лео Литтл, [19] [20] Роберта Эстес, Ребекка Канада и Бонни Шрак участвовали в важных открытиях гражданской науки, касающихся филогении человека и этнического происхождения. [21] [22] [23] [24] Более широкий состав членов ISOGG участвовал в Генографическом проекте , генетическом антропологическом исследовании, в котором использовался краудсорсинг для облегчения новых открытий в генетической истории человека, а также в других генетических базах данных, где все более и более крупные базы данных помогают идентифицировать наследственное происхождение участников. [4] [25] [26]
Филогенетическое дерево Y-хромосомы
[ редактировать ]С 2006 года ISOGG размещает регулярно обновляемое онлайн- Y-хромосомы филогенетическое дерево ISOGG . [3] [27] ISOGG стремится поддерживать дерево как можно более актуальным, включая новые SNP . часто обнаруживаемые [28] Дерево ISOGG было описано учеными как использующее принятую номенклатуру гаплогрупп ДНК Y-хромосомы человека и субкладов , поскольку оно соответствует номенклатуре Консорциума Y-хромосомы, как описано в Karafet et al. 2008, [28] [29] [30] Дерево ISOGG широко цитируется в рецензируемой академической литературе. [31] [32] [33] [34] [35] [36] [37]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Международное общество генетической генеалогии» . ИЗОГГ . Проверено 1 июля 2013 г. См. домашнюю страницу, нашу миссию и информацию об ISOGG.
- ^ «Дерево гаплогрупп Y-ДНК ISOGG 2013» . ИЗОГГ . Проверено 10 июля 2013 г.
ISOGG (Международное общество генетической генеалогии) не связано с какими-либо зарегистрированными торговыми марками и/или защищенными авторским правом названиями компаний, веб-сайтов и организаций.
- ^ Jump up to: а б Кинг, Тури Э.; Джоблинг, Марк А. (2009). «Что в имени? Y-хромосомы, фамилии и революция в генетической генеалогии» . Тенденции в генетике . 25 (8): 351–60. дои : 10.1016/j.tig.2009.06.003 . hdl : 2381/8106 . ПМИД 19665817 .
Международное общество генетической генеалогии (www.isogg.org) выступает за использование генетики в качестве инструмента генеалогических исследований и обеспечивает сеть поддержки специалистам по генетической генеалогии. Здесь находится дерево Y-гаплогрупп ISOGG, которое регулярно обновляется.
- ^ Jump up to: а б «Семейная история и ДНК: генетическая генеалогия в 2013 году» . Генеалогическое общество Южной Калифорнии. Архивировано из оригинала 10 июля 2013 года . Проверено 7 июля 2013 г.
- ^ «Региональные координаторы ISOGG» . ИЗОГГ. Архивировано из оригинала 22 октября 2013 года . Проверено 9 июля 2013 г.
- ^ «Встречи ISOGG» . ИЗОГГ . Проверено 9 июля 2013 г.
- ^ «Международное общество генетической генеалогии - Wiki» . ИЗОГГ . Проверено 8 июля 2013 г.
- ^ «Вики-сайт Международного общества генетической генеалогии (Руководство администратора проекта ISOGG)» . ИЗОГГ . Проверено 9 июля 2013 г.
- ^ «Международное общество генетической генеалогии – экспертная оценка членов» . ИЗОГГ . Проверено 8 июля 2013 г.
- ^ Jump up to: а б Смоленяк, Меган (20 июля 2010 г.). «Не «защищайте» нас от нашей собственной генетической информации» . Хаффингтон Пост . Проверено 7 июля 2013 г.
- ^ Борхес, Кэтрин (1 марта 2008 г.). «От директора» . Информационный бюллетень ISOGG . 1 (1) . Проверено 7 июля 2013 г.
- ^ «Открытое собрание FDA/CDRH: надзор за лабораторными тестами (LDT), 19–20 июля 2010 г.» . FDA . Проверено 7 июля 2013 г.
- ^ Форхаус, Дэн (22 июля 2010 г.). «Разговор продолжается: итоги второго дня заседания регулирующего органа FDA» . Отчет о законе о геномике . Проверено 8 июля 2013 г.
У генетического тестирования DTC также были свои сторонники, в том числе соосновательница 23andMe Энн Войжитски и Кэтрин Борхес, директор Международного общества генетической генеалогии (ISOGG), которые выдвинули один из самых страстных аргументов в пользу приоритета индивидуального доступа над регулированием FDA. Борхес прозвучал знакомым рефреном, утверждая, что FDA не должно ограничивать доступ потребителей к генетической информации «без достоверных, убедительных научных данных, подтверждающих» такое регулирование.
- ^ Вагнер, Дженнифер К.; Купер, Джилл Д.; Стерлинг, Рене; Роял, Чармейн Д. (2012). «Больше не играть с ветряными мельницами: основанное на данных обсуждение тестов ДНК-предков DTC» . Генетика в медицине . 14 (6): 586–93. дои : 10.1038/gim.2011.77 . ПМЦ 8339991 . ПМИД 22382803 .
- ^ Хармон, Эми (2 апреля 2007 г.). «Преследование ДНК незнакомцев для заполнения генеалогического древа» . Нью-Йорк Таймс . Проверено 7 июля 2013 г.
- ^ «Вики Международного общества генетической генеалогии (Этика)» . ИЗОГГ . Проверено 8 июля 2013 г.
- ^ Джон М. Батлер; Маргарет К. Клайн; Эми Э. Декер (2008). «Обращение к номенклатуре аллелей с короткими тандемными повторами Y-хромосомы» (PDF) . Журнал генетической генеалогии . 4 (2): 125–148 . Проверено 8 июля 2013 г.
- ^ «Фонд молекулярной генеалогии Соренсона первым принял новый отраслевой стандарт генетической генеалогии для отчетности о профилях Y-ДНК» (пресс-релиз). Деловой провод. 17 августа 2009 года . Проверено 8 июля 2013 г.
- ^ Беттингер, Блейн (27 мая 2008 г.). «Памяти Лео Уильяма Литтла» . Генетический генеалог . Проверено 16 июля 2013 г.
- ^ «Некролог Лео В. Литтлу-младшему» . Орландо Сентинел . 23 июня 2008 года . Проверено 16 июля 2013 г.
- ^ Эстес, Роберта (10 апреля 2013 г.). «Анализ ДНК своими руками, GenomeWeb и Citizen Scientist 2.0» . Объяснение ДНК . Проверено 16 июля 2013 г.
- ^ Эстес, Роберта Дж.; Джек Х. Гоинс; Пенни Фергюсон; Джанет Льюис Крейн (2011). «Меланджоны, многоэтническое население» (PDF) . Журнал генетической генеалогии . 7 (2) . Проверено 17 июля 2013 г.
- ^ Лоллер, Трэвис (24 мая 2012 г.). «Исследование ДНК в Мелунджеоне раскрывает родословную и расстраивает «многих людей» » . Хаффингтон Пост . Проверено 17 июля 2013 г.
«Многие люди были расстроены этим исследованием», — сказала ведущий исследователь Роберта Эстес… Эстес и ее коллеги-исследователи предполагают, что различные линии Меланджона могли возникнуть в результате союзов черных и белых наемных слуг, живущих в Вирджинии в середина 1600-х годов, до рабства... Чтобы провести более масштабное исследование ДНК, Гойнс и его коллеги-исследователи – специалисты по генеалогии, но не ученые – должны были определить, кто такой Меланджон.
- ^ «Исследовательский центр геномики генеалогического древа ДНК способствует открытию чрезвычайно древнего корня филогенетического дерева Y-хромосомы человека» (пресс-релиз). Джин за Джином. 26 марта 2013 года . Проверено 17 июля 2013 г.
Оказавшись в базе данных ДНК Семейного древа, давний администратор проекта Бонни Шрак заметила, что образец очень уникален, и предложила провести дальнейшее тестирование. «На самом деле все это открытие началось с гражданского ученого – человека, очень похожего на многих наших клиентов, которые заинтересованы в том, чтобы узнать больше о своих семейных корнях с помощью одного из наших генеалогических продуктов», – сказал президент Gene By Gene Беннетт Гринспен.
- ^ Каллауэй, Юэн (5 июня 2012 г.). «Тестирование предков обеспечивает высочайшую точность» . Природа . 486 (7401): 17. Бибкод : 2012Natur.486...17C . дои : 10.1038/486017a . ПМИД 22678260 .
Коммерческое тестирование предков, когда-то являвшееся областью ограниченной информации сомнительной точности, теперь использует преимущества сканирования всего генома, сложного анализа и все более глубоких баз данных генетического разнообразия человека, чтобы помочь людям ответить на простой вопрос: откуда я?
- ^ Вергано, Дэн (13 июня 2013 г.). «Детективы ДНК выясняют ваше происхождение» . США сегодня . Проверено 16 июля 2013 г.
- ^ «Дерево гаплогрупп Y-ДНК ISOGG 2006» . ИЗОГГ . Проверено 8 июля 2013 г.
Группа ISOGG была сформирована в ноябре 2005 года для создания веб-документа, который можно было бы обновлять, чтобы идти в ногу с быстрым развитием в этой области.
- ^ Jump up to: а б Эти, Уит (2008). «Уголок редактора: новое филогенетическое древо Y-хромосомы» (PDF) . Журнал генетической генеалогии . 4 (1): i–ii. Архивировано из оригинала (PDF) 5 марта 2014 года . Проверено 8 июля 2013 г.
ISOGG стремится к созданию дерева с минимальной путаницей для пользователей, поэтому, естественно, с публикацией нового дерева в Карафете (2008 г.) ISOGG изменит несколько названий гаплогрупп, чтобы они соответствовали выбору, сделанному Карафетом... Между тем, новые SNP объявляются или публикуются почти каждый месяц. Роль ISOGG будет заключаться в поддержании как можно более актуального дерева, позволяющего нам видеть, где находится каждый новый SNP.
- ^ Ван Холст Пелекаан, Шейла (2013). «Генетические доказательства колонизации Австралии». Четвертичный интернационал . 285 : 44–56. Бибкод : 2013QuInt.285...44В . дои : 10.1016/j.quaint.2011.04.014 .
Классификация линий мтДНК имеет историческое значение после наименования гаплогрупп A, B, C и D коренных американцев (Torroni et al., 2006). Это положило начало общепринятой номенклатуре, в соответствии с которой африканские линии были названы L, а одна из них, L3, по-видимому, дала начало некоторым африканским и всем неафриканским гаплотипам mt (матрилиниям), которые группируются в «суперсемействах» или макрогаплогруппах, называемых «M» и «M». «Н». В настоящее время существуют неафриканские гаплогруппы мтДНК, названные в честь всех остальных букв алфавита (кроме L), которые являются подразделениями больших суперсемейств M и N (van Oven and Kayser, 2010). Принятая система наименования подгрупп была изложена Ричардсом и др. (1998) и совсем недавно рассмотренные Torroni et al. (2006). Исследования Y-хромосомы также привели к принятию номенклатуры (см. Karafet et al., 2008; ISOGG, 2010).
- ^ Редмондс, Джордж; Король, Тури; Привет, Дэвид (2011). Фамилии, ДНК и семейная история . Оксфорд: Издательство Оксфордского университета. п. 196. ИСБН 9780199582648 .
Рост интереса к генетической генеалогии вдохновил группу людей за пределами академической области, которые увлечены этим предметом и обладают впечатляющим пониманием проблем исследования. Двумя координаторами этой группы являются Международное общество генетической генеалогии и Журнал генетической генеалогии . ISOGG — это некоммерческая некоммерческая организация, которая предоставляет ресурсы и поддерживает филогенетические деревья гаплогрупп Y-хромосомы.
- ^ Ли, Донна; Ли, Хуэй; Оу, Цайин; Лу, Ян; Сунь, Юаньтянь; Ян, Бо; Цинь, Чжэндун; Чжоу, Чжэньцзянь; Ли, Шилин; Джин, Ли Цзинь (2008). Маколей, Винсент (ред.). «Отцовская генетическая структура аборигенов Хайнаня, изолированных на въезде в Восточную Азию» . ПЛОС ОДИН . 3 (5): е2168. Бибкод : 2008PLoSO...3.2168L . дои : 10.1371/journal.pone.0002168 . ПМЦ 2374892 . ПМИД 18478090 .
- ^ Чжао, Чжунмин; Хан, Фейсал; Боркар, Минал; Эррера, Рене; Агравал, Суракша (2009). «Наличие трех разных отцовских линий среди жителей Северной Индии: исследование 560 Y-хромосом» . Анналы биологии человека . 36 (1): 46–59. дои : 10.1080/03014460802558522 . ПМЦ 2755252 . ПМИД 19058044 .
- ^ Регейру, Мария; Ривера, Луис; Дамнянович, Татьяна; Лукович, Лиляна; Миласин, Елена; Эррера, Рене Дж. (2012). «Высокий уровень палеолитических линий Y-хромосомы характеризует Сербию». Джин . 498 (1): 59–67. дои : 10.1016/j.gene.2012.01.030 . ПМИД 22310393 .
- ^ Аль-Захери, Надя; Пала, Мария; Батталья, Винченца; Грюни, Виола; Хамод, Мохаммед А; Кашани, Бахарак; Оливьери, Анна; Торрони, Антонио; Сантакьяра-Бенерекетти, Августа С (2011). «В поисках генетических следов шумеров: исследование вариаций Y-хромосомы и мтДНК у болотных арабов Ирака» . Эволюционная биология BMC . 11 : 288. дои : 10.1186/1471-2148-11-288 . ПМК 3215667 . ПМИД 21970613 .
- ^ Амбросио, Б.; Дюгужон, Ж.М.; Эрнандес, К.; Де Ла Фуэнте, Д.; Гонсалес-Мартин, А.; Фортес-Лима, Калифорния; Новеллетто, А.; Родригес, JN; Кальдерон, Р. (2010). «Андалузское население Уэльвы демонстрирует высокую диверсификацию отцовских линий Y-ДНК от гаплогруппы E: выявление человеческих мужских движений в средиземноморском пространстве». Анналы биологии человека . 37 (1): 86–107. дои : 10.3109/03014460903229155 . ПМИД 19939195 . S2CID 1667431 .
- ^ Вагнер, Дженнифер К.; Вайс, Кеннет М. (2011). «Отношение к тестам ДНК на происхождение». Генетика человека . 131 (1): 41–56. дои : 10.1007/s00439-011-1034-5 . ПМИД 21698460 . S2CID 14757236 .
- ^ Федорова, Сардана А; Рейдла, Маере; Мецпалу, Эне; Мецпалу, Мейт; Роотси, Сиири; Тамбетс, Кристина; Трофимова, Наталья; Жаданов Сергей И; Кашани, Бахарак (2013). «Аутосомные и однородительские портреты коренного населения Саха (Якутии): Значение для заселения Северо-Восточной Евразии» . Эволюционная биология BMC . 13 : 127. Бибкод : 2013BMCEE..13..127F . дои : 10.1186/1471-2148-13-127 . ПМЦ 3695835 . ПМИД 23782551 .
