Минимальная информация об эксперименте на микроматрице
 | Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( январь 2015 г. ) |
Минимальная информация об эксперименте с микрочипами ( MIAME ) — это стандарт, созданный Обществом FGED для отчетности об экспериментах с микрочипами . [1]
MIAME предназначен для указания всей информации, необходимой для однозначной интерпретации результатов эксперимента и потенциального воспроизведения эксперимента. Хотя стандарт определяет содержание, необходимое для отчетов, соответствующих требованиям, он не определяет формат, в котором эти данные должны быть представлены. MIAME описывает минимальную информацию, необходимую для обеспечения легкой интерпретации данных микрочипов и независимой проверки результатов, полученных в результате их анализа. [2] Для представления этих данных используется ряд форматов файлов , а также общедоступные репозитории и репозитории на основе подписки для таких экспериментов. [2] Кроме того, существует программное обеспечение, помогающее готовить отчеты, соответствующие стандарту MIAME.
MIAME вращается вокруг шести ключевых компонентов: необработанные данные , нормализованные данные , аннотации образцов, план эксперимента , аннотации массивов и протоколы данных.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Главная страница MIAME» . Сайт Общества FGED . Проверено 13 сентября 2012 г.
- ^ Jump up to: а б Бразма, Алвис; Хингамп, Паскаль; Квакенбуш, Джон; Шерлок, Гэвин; Спеллман, Пол; Стокерт, Крис; Аах, Джон; Ансорж, Вильгельм; Болл, Кэтрин А.; Костон, Хелен С.; Гаастерланд, Терри; Глениссон, Патрик; Холстеге, Фрэнк КП; Ким, Ирен Ф.; Марковиц, Виктор; Матезе, Джон К.; Паркинсон, Хелен; Робинсон, Алан; Сарканс, Угис; Шульце-Кремер, Штеффен; Стюарт, Джейсон; Тейлор, Рональд; Вило, Яак; Вингрон, Мартин (декабрь 2001 г.). «Минимум информации об эксперименте на микрочипах (MIAME) — к стандартам данных на микрочипах» . Природная генетика . 29 (4): 365–371. дои : 10.1038/ng1201-365 . ISSN 1061-4036 . ПМИД 11726920 . S2CID 6994467 .
