Нуклеопорин 214

НУП214
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 2OIT, 3FHC, 3FMO, 3FMP, 5DIS
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP214 , CAIN, CAN, D9S46E, N214, p250, нуклеопорин 214 кДа, нуклеопорин 214, IIAE9
Внешние идентификаторы	Опустить : 114350 ; МГИ : 1095411 ; Гомологен : 38008 ; Генные карты : NUP214 ; ОМА : NUP214 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 9 (human) Band 9q34.13 Start 131,125,573 bp End 131,234,663 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2 B|2 21.97 cM Start 31,864,448 bp End 31,943,987 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in left testis right testis monocyte granulocyte testicle epithelium of colon blood bone marrow cells sural nerve spleen Top expressed in zygote tail of embryo secondary oocyte genital tubercle blastocyst morula embryo endocardial cushion spermatid ventricular zone More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function nuclear export signal receptor activity protein binding nuclear localization sequence binding structural constituent of nuclear pore Cellular component cytosol intracellular membrane-bounded organelle focal adhesion nucleoplasm nucleus cytoplasmic side of nuclear pore nuclear pore nuclear basket nuclear pore central transport channel nuclear pore nuclear envelope host cell Biological process mRNA transport regulation of mRNA stability regulation of cell cycle protein export from nucleus protein transport viral process protein import into nucleus RNA export from nucleus mRNA export from nucleus regulation of nucleocytoplasmic transport mitotic cell cycle regulation of glycolytic process tRNA export from nucleus protein sumoylation viral transcription regulation of gene silencing by miRNA intracellular transport of virus regulation of cellular response to heat Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 8021 227720 Вместе ENSG00000126883 ENSMUSG00000001855 ЮниПрот P35658 Q80U93 RefSeq (мРНК) НМ_005085 НМ_001318324 НМ_001318325 НМ_172268 RefSeq (белок) НП_001305253 НП_001305254 НП_005076 НП_758472 НП_001395026 Местоположение (UCSC) Чр 9: 131,13 – 131,23 Мб Chr 2: 31,86 – 31,94 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Нуклеопорин 214 ( Nup2014 ) — белок , который у человека кодируется NUP214 геном .

Функция

Комплекс ядерных пор представляет собой массивную структуру, которая простирается через ядерную оболочку, образуя ворота, регулирующие поток макромолекул между ядром и цитоплазмой . Нуклеопорины являются основными компонентами комплекса ядерных пор в эукариотических клетках. Этот ген является членом нуклеопоринов, содержащих FG-повтор. Белок, кодируемый этим геном, локализован на цитоплазматической поверхности комплекса ядерных пор, где он необходим для правильного развития клеточного цикла и нуклеоцитоплазматического транспорта. 3'-часть этого гена образует слитый ген с геном DEK at(6,9), на хромосоме 6 при транслокации связанной с острым миелолейкозом и миелодиспластическим синдромом .

Структура

Структура N-концевого домена Nup214 представляет собой складку бета-пропеллера из семи лопастей, за которой следует С-концевой расширенный пептидный сегмент (CTE) из 30 остатков. CTE складывается обратно на бета-пропеллер и прикрепляется к его нижней поверхности. Структура Nup214 NTD, связанного с хеликазой Ddx19 в его ADP-связанном состоянии, раскрывает молекулярную основу взаимодействия между двумя белками. Показано, что консервативный остаток Ddx19 имеет решающее значение для образования комплекса in vitro и in vivo. Поразительно, что поверхности взаимодействия демонстрируют сильно противоположные поверхностные потенциалы: поверхность геликазы заряжена положительно, а поверхность Nup214 отрицательно заряжена. Показано, что Ddx19 связывает РНК только в ее АТФ-связанном состоянии, а связывание РНК и Nup214 NTD является взаимоисключающим.

Взаимодействия

Было показано, что NUP214 взаимодействует с:

• ДДХ19 ,
• CRM1
• НХФ1 , и
• НХФ2 , и
• ЗФП36 .

Дальнейшее чтение

• Стоффлер Д., Фаренкрог Б., Эби У. (июнь 1999 г.). «Комплекс ядерных пор: от молекулярной архитектуры к функциональной динамике». Современное мнение в области клеточной биологии . 11 (3): 391–401. дои : 10.1016/S0955-0674(99)80055-6 . ПМИД   10395558 .
• фон Линдерн М., Форнерод М., ван Баал С., Джегл М., де Вит Т., Буйс А., Гросвельд Г. (апрель 1992 г.). «Транлокация (6;9), связанная со специфическим подтипом острого миелолейкоза, приводит к слиянию двух генов, dek и can, и экспрессии химерной, специфичной для лейкемии мРНК dek-can» . Молекулярная и клеточная биология . 12 (4): 1687–97. дои : 10.1128/mcb.12.4.1687 . ПМЦ   369612 . ПМИД   1549122 .
• Номура Н., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Каварабаяси Ю., Сато С., Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Табата С. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. I. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0001-KIAA0040), полученные путем анализа случайно выбранных клонов кДНК из линии незрелых миелоидных клеток человека KG-1» . Исследование ДНК . 1 (1): 27–35. дои : 10.1093/dnares/1.1.27 . ПМИД   7584026 .
• Номура Н., Миядзима Н., Сазука Т., Танака А., Каварабаяси Ю., Сато С., Нагасе Т., Секи Н., Исикава К., Табата С. (1995). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. I. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0001-KIAA0040), полученные путем анализа случайно выбранных клонов кДНК из линии незрелых миелоидных клеток человека KG-1 (дополнение)» . Исследование ДНК . 1 (1): 47–56. дои : 10.1093/dnares/1.1.47 . ПМИД   7584028 .
• Пильц А., Вудворд К., Пови С., Эбботт С. (январь 1995 г.). «Сравнительное картирование 50 локусов 9 хромосомы человека у лабораторной мыши». Геномика . 25 (1): 139–49. дои : 10.1016/0888-7543(95)80119-7 . ПМИД   7774911 .
• Штутц Ф., Изаурральде Э., Маттай И.В., Росбаш М. (декабрь 1996 г.). «Роль повторяющихся доменов нуклеопорина FG в экспорте белка Rev вируса иммунодефицита человека типа 1 и РНК из ядра» . Молекулярная и клеточная биология . 16 (12): 7144–50. дои : 10.1128/mcb.16.12.7144 . ПМК   231718 . ПМИД   8943370 .
• Форнерод М., ван Дёрсен Дж., ван Баал С., Рейнольдс А., Дэвис Д., Мурти К.Г., Франсен Дж., Гросвельд Г. (февраль 1997 г.). «Человеческий гомолог дрожжевого CRM1 находится в динамическом подкомплексе с CAN/Nup214 и новым компонентом ядерной поры Nup88» . Журнал ЭМБО . 16 (4): 807–16. дои : 10.1093/emboj/16.4.807 . ПМК   1169681 . ПМИД   9049309 .
• Ясин Н.Р., Блобель Дж. (апрель 1997 г.). «Клонирование и характеристика кариоферина бета3 человека» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (9): 4451–6. Бибкод : 1997PNAS...94.4451Y . дои : 10.1073/pnas.94.9.4451 . ПМК   20743 . ПМИД   9114010 .
• Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (май 1997 г.). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт белка, связывающего мРНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 94 (10): 5055–60. Бибкод : 1997PNAS...94.5055B . дои : 10.1073/pnas.94.10.5055 . ПМК   24630 . ПМИД   9144189 .
• Бастос Р., Рибас де Пуплана Л., Энарсон М., Бодур К., Берк Б. (июнь 1997 г.). «Nup84, новый нуклеопорин, который связан с CAN/Nup214 на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор» . Журнал клеточной биологии . 137 (5): 989–1000. дои : 10.1083/jcb.137.5.989 . ПМК   2136229 . ПМИД   9166401 .
• Бур Дж., Бонтен-Суртель Дж., Гросвельд Г. (март 1998 г.). «Сверхэкспрессия нуклеопорина CAN/NUP214 вызывает остановку роста, дефекты нуклеоцитоплазматического транспорта и апоптоз» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (3): 1236–47. дои : 10.1128/mcb.18.3.1236 . ПМЦ   108836 . ПМИД   9488438 .
• Богерд Х.П., Эчарри А., Росс Т.М., Каллен Б.Р. (ноябрь 1998 г.). «Ингибирование функции вируса иммунодефицита человека Rev и вируса Т-клеточного лейкоза человека Rex, но не активности конститутивного транспортного элемента вируса обезьяны Мейсона-Пфайзера, с помощью мутантного нуклеопорина человека, нацеленного на Crm1» . Журнал вирусологии . 72 (11): 8627–35. doi : 10.1128/JVI.72.11.8627-8635.1998 . ПМЦ   110274 . ПМИД   9765402 .
• Золотухин А.С., Фельбер Б.К. (январь 1999 г.). «Нуклеопорины nup98 и nup214 участвуют в ядерном экспорте вируса иммунодефицита человека типа 1 Rev» . Журнал вирусологии . 73 (1): 120–7. doi : 10.1128/JVI.73.1.120-127.1999 . ПМЦ   103815 . ПМИД   9847314 .
• Шмитт С, фон Коббе С, Бачи А, Панте Н, Родригес ЖП, Бошерон С, Риго Г, Вильм М, Серафин Б, Кармо-Фонсека М, Изаурральде Е (август 1999 г.). «Dbp5, белок DEAD-box, необходимый для экспорта мРНК, рекрутируется в цитоплазматические фибриллы комплекса ядерных пор посредством консервативного взаимодействия с CAN/Nup159p» . Журнал ЭМБО . 18 (15): 4332–47. дои : 10.1093/emboj/18.15.4332 . ПМЦ   1171509 . ПМИД   10428971 .
• Бачи А., Браун И.С., Родригес Ж.П., Панте Н., Риббек К., фон Коббе С., Кутай У., Вильм М., Герлих Д., Кармо-Фонсека М., Исаурральде Е. (январь 2000 г.). «С-концевой домен TAP взаимодействует с комплексом ядерных пор и способствует экспорту специфических CTE-несущих РНК-субстратов» . РНК . 6 (1): 136–58. дои : 10.1017/S1355838200991994 . ПМЦ   1369901 . ПМИД   10668806 .
• Херольд А., Суяма М., Родригес Х.П., Браун И.С., Кутай У., Кармо-Фонсека М., Борк П., Изаурральде Э. (декабрь 2000 г.). «TAP (NXF1) принадлежит к мультигенному семейству предполагаемых факторов экспорта РНК с консервативной модульной архитектурой» . Молекулярная и клеточная биология . 20 (23): 8996–9008. дои : 10.1128/MCB.20.23.8996-9008.2000 . ПМК   86553 . ПМИД   11073998 .
• Хофманн В., Райхарт Б., Эвальд А., Мюллер Э., Шмитт И., Штаубер Р.Х., Лоттспайх Ф., Йокуш Б.М., Шеер У., Хаубер Дж., Дабаувалле М.С. (март 2001 г.). «Требования к кофакторам для ядерного экспорта ретровирусных РНК, содержащих Rev-ответный элемент (RRE) и конститутивный транспортный элемент (CTE). Неожиданная роль актина» . Журнал клеточной биологии . 152 (5): 895–910. дои : 10.1083/jcb.152.5.895 . ПМК   2198816 . ПМИД   11238447 .