Jump to content

PSMC3

PSMC3
Идентификаторы
Псевдонимы PSMC3 , TBP1, субъединица протеасомы 26S, ATPase 3, RPT5, DCIDP
Внешние идентификаторы Омим : 186852 ; MGI : 1098754 ; Гомологен : 2097 ; GeneCards : PSMC3 ; OMA : PSMC3 - ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Набор
Uniprot
Refseq (мРНК)

NM_002804

NM_008948

Refseq (белок)

NP_002795

NP_032974

Расположение (UCSC) Chr 11: 47.42 - 47,43 МБ Chr 2: 90,88 - 90,9 МБ
PubMed Search [ 3 ] [ 4 ]
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

26S Протеаза регулирующая субъединица 6A , также известная как 26S Proteasome AAA-ATPase Subunit RPT5 , является ферментом , который у людей кодируется PSMC3 геном . [ 5 ] [ 6 ] Этот белок является одной из 19 важных субъединиц полного собравшегося 19S -протеасомного комплекса [ 7 ] Шесть 26-х протеасомных субъединиц AAA-ATPase ( RPT1 , RPT2 , RPT3 , RPT4 , RPT5 (этот белок) и RPT6 ) вместе с четырьмя неатпазными субъединицами ( RPN1 , RPN2 , RPN10 и RPN13 ) образуют базовый субэссплекс из 19S. частица для протеасомного комплекса. [ 7 ]

Ген PSMC3 кодирует одну из субъединиц АТФазы, члена семейства Triple-A ATPases, обладающих чапероноподобной активностью. Эта субъединица может конкурировать с PSMC2 за связывание с ВИЧ -белком, чтобы регулировать взаимодействие между вирусным белком и транскрипционным комплексом. Псевдоген был идентифицирован на хромосоме 9. [ 8 ] Человеческий ген PSMC3 имеет 12 экзонов и расположена в диапазоне хромосом 11p11.2.

Регуляторная субъединица протеазы белка человека 26S 6A составляет 49 кДа по размеру и состоит из 439 аминокислот. Рассчищенный теоретический ИП этого белка составляет 5,68. [ 9 ]

Сложная сборка

[ редактировать ]

26S Комплекс протеасомы обычно состоят из частицы ядра 20S (CP или 20S протеасома) и одной или двух регуляторных частиц 19S (RP или 19S протеасома) на одной стороне или обеих сторонах 20-х годов в форме ствола. CP и RPs относятся к различным структурным характеристикам и биологическим функциям. Вкратце, субтерплекс 20S представляет три типа протеолитической активности, в том числе каспазоподобная, трипсиноподобная и химотрипсин-подобная активность. Эти протеолитические активные участки, расположенные во внутренней стороне камеры, образованной 4 сложенными кольцами из субъединиц 20S, предотвращая случайное встречу с белком и неконтролируемая деградация белка. Регуляторные частицы 19S могут распознавать, меченный убиквитином белок в качестве субстрата деградации, разворачивать белок в линейный, открыть затвор частицы 20S ядра и направлять субстрат в протеолитическую камеру. Чтобы соответствовать такой функциональной сложности, регуляторная частица 19S содержит как минимум 18 конститутивных субъединиц. Эти субъединицы могут быть классифицированы на два класса, основанные на АТФ-зависимости субъединиц, АТФ-зависимых субъединиц и АТФ-независимых субъединиц. Согласно белковому взаимодействию и топологическим характеристикам этого мультисубнитного комплекса, регуляторная частица 19S состоит из основания и подкомплекса крышки. База состоит из кольца из шести ААА-АТФаз (субъединица RPT1-6, систематическая номенклатура) и четырех непазных субъединиц ( RPN1 , RPN2 , RPN10 и RPN13 ). Таким образом, 26S Протеаза регуляторная субъединица 4 (RPT2) является важным компонентом формирования базового подкомплекса регуляторной частицы 19S. Для сборки базового субэкомплекса 19S четыре набора шаперонов ключевой сборки (HSM3/S5B, NAS2/P27, NAS6/P28 и RPN14/PAAF1, номенклатура у дрожжей/млекопитающих) были выявлены четырьмя группами самостоятельно. [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] Эти 19S регуляторные частицы, связанные с основанием частиц, все связываются с отдельными субъединицами АТФазы через С-концевые области. Например, HSM3/S5B связывается с субъединицей RPT1 и RPT2 (этот белок), NAS2/P27 с RPT5 (этот белок), NAS6/P28 до RPT3 и RPN14/PAAAF1 до RPT6 соответственно. Впоследствии три модуля промежуточных сборок образуются следующим образом, модуль NAS6/P28-RPT3-RPT6-RPN14/PAAF1, модуль NAS2/P27-RPT4-RPT5 и модуль HSM3/S5B-RPT1-RPT2-RPN2. В конце концов, эти три модуля собираются вместе, чтобы сформировать гетерогексамерное кольцо из 6 атласов с RPN1. Окончательное добавление RPN13 указывает на завершение сборки базовых субэксплексов 19S. [ 7 ]

Как механизм деградации, который отвечает за ~ 70% внутриклеточного протеолиза, [ 16 ] Протеасомный комплекс (26S Proteasome) играет критическую роль в поддержании гомеостаза клеточного протеома. Соответственно, неправильно свернутые белки и поврежденный белок должны быть непрерывно удалены для переработки аминокислот для нового синтеза; Параллельно некоторые ключевые регуляторные белки выполняют свои биологические функции посредством селективной деградации; Кроме того, белки расщепляются в пептиды для презентации антигена класса I MHC. Чтобы удовлетворить такие сложные требования в биологическом процессе посредством пространственного и временного протеолиза, белковые субстраты должны быть распознаны, рекрутированы и в конечном итоге гидролизованы хорошо контролируемым образом. Таким образом, регуляторная частица 19S относится к ряду важных возможностей для решения этих функциональных проблем. Чтобы распознать белок в качестве обозначенного субстрата, 19S комплекс имеет субъединицы, которые способны распознавать белки со специальной деградативной меткой, убиквитинилирование. У него также есть субъединицы, которые могут связываться с нуклеотидами (например, ATP), чтобы облегчить связь между частицами от 19 до 20 лет, а также вызывают изменения подтверждения альфа-субъединиц C-концевых, которые образуют вход подложки комплекса 20S.

Субъединицы ATPases собираются в кольцо с шестьючковых с последовательности RPT1-RPT5-RPT4-RPT3-RPT6-RPT2, которая взаимодействует с семичленным альфа-кольцом из частицы 20S и устанавливает асимметричный интерфейс между 19S и RP. 20 с. [ 17 ] [ 18 ] Три С-концевые хвосты с мотивами HBYX различных RPT ATPases вставляют в карманы между двумя определенными альфа-субъединицами CP и регулируют отверстие затвора центральных каналов в альфа-кольце CP. [ 19 ] [ 20 ] Свидетельство показало, что субъединица ATPase RPT5, наряду с другими Ubuiqintinated 19S-протеасовыми субъединицами ( RPN13 , RPN10 ) и деубиквитинирующим ферментом UCH37, может быть убиквитинированным in Situ с помощью протеасом-ассоциационных ферментов. Убиквитинирование субъединиц протеасомы может регулировать протеасомную активность в ответ на изменение уровней клеточной убиквитинирования. [ 21 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что PSMC3 взаимодействует с PSMC5 [ 22 ] и фон Хиппель-Линдау-супрессор опухоли . [ 23 ]

  1. ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000165916 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000002102 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  4. ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  5. ^ Хойл Дж., Тан К.Х., Фишер Эм (март 1997 г.). «Локализация генов, кодирующих двух доменных членов семейства AAA: PSMC5 (белок-вмешивающий рецептор щитовидной железы, Trip1) и PSMC3 (TAT-связывающий белок, TBP1)». Hum Genet . 99 (2): 285–8. doi : 10.1007/s004390050356 . PMID   9048938 . S2CID   29818936 .
  6. ^ Говорят Н., Сузуки М., Фудзива Т., Шимбара Ч., ребенок (Марк 1998). Хросомалемаломальный локальный аннализ Biophy Biophhys Res Communic 243 (1): 229–3 doi : 10.1006/brc . PMID   9473509 .
  7. ^ Jump up to: а беременный в Gu Zc, Enenkel C (Dec 2014). «Сборка протеасома» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 71 (24): 4729–45. doi : 10.1007/s00018-014-1699-8 . PMC   11113775 . PMID   25107634 . S2CID   15661805 .
  8. ^ «Ген Entrez: PSMC3 Протеасома (Prosome, Macropain) 26S субъединица, АТФаза, 3» .
  9. ^ "Uniprot: P17980 - PRS6A_HUMAN" .
  10. ^ Le Tallec B, Barrault MB, Guérois R, Carré T, Peyroche A (февраль 2009 г.). «HSM3/S5B участвует в пути сборки регуляторной частицы 19S протеасомы» . Молекулярная клетка . 33 (3): 389–99. doi : 10.1016/j.molcel.2009.01.010 . PMID   19217412 .
  11. ^ Funakoshi M, Tomko RJ, Kobayashi H, Hochstrasser M (май 2009 г.). «Многочисленные шапероны сборки регулируют биогенез основания регуляторной частицы протеасом» . Клетка . 137 (5): 887–99. doi : 10.1016/j.cell.2009.04.061 . PMC   2718848 . PMID   19446322 .
  12. ^ Park S, Roelofs J, Kim W, Robert J, Schmidt M, Gygi SP, Finley D (Jun 2009). «Гексамерная сборка протеасомных АТФаз шаблон через их C -концерты» . Природа . 459 (7248): 866–70. Bibcode : 2009natur.459..866p . doi : 10.1038/nature08065 . PMC   2722381 . PMID   19412160 .
  13. ^ Roelofs J, Park S, Haas W, Tian G, McAllister FE, Huo Y, Lee BH, Zhang F, Shi Y, Gygi SP, Finley D (Jun 2009). «Опосредованный шапероном путь сборочной сборки регуляторной частицы протеасом» . Природа . 459 (7248): 861–5. Bibcode : 2009natur.459..861r . doi : 10.1038/nature08063 . PMC   2727592 . PMID   19412159 .
  14. ^ Saeki Y, Toh-E A, Kudo T, Kawamura H, Tanaka K (май 2009 г.). «Многочисленные протеасомные белки помогают сборке регуляторной частицы дрожжей 19S» . Клетка . 137 (5): 900–13. doi : 10.1016/j.cell.2009.05.005 . PMID   19446323 . S2CID   14151131 .
  15. ^ I Neko T, Hamazaki J, Iemura S, Sasaki K, Furuyama K, Natsume T, Tanaka K, Murata S (май 2009 г.). «Путь сборки подкомплекса базы млекопитающих протеасмеров опосредован множеством специфических шаперонов » Ячейка 137 (5): 914–2 Doi : 10.1016/ j.cell.2009.05.0 PMID   19490896 S2CID   18551885 .
  16. ^ Rock KL, Gramm C, Rothstein L, Clark K, Stein R, Dick L, Hwang D, Goldberg AL (сентябрь 1994). «Ингибиторы протеасомы блокируют деградацию большинства клеточных белков и генерацию пептидов, представленных на молекулах класса I MHC». Клетка . 78 (5): 761–71. doi : 10.1016/s0092-8674 (94) 90462-6 . PMID   8087844 . S2CID   22262916 .
  17. ^ Tian G, Park S, Lee MJ, Huck B, McAllister F, Hill CP, Gygi SP, Finley D (ноябрь 2011). «Асимметричный график между регуляторными и основными частицами протеасомы» . Природа структурная и молекулярная биология . 18 (11): 1259–67. doi : 10.1038/nsmb.2147 . PMC   3210322 . PMID   22037170 .
  18. ^ Ландер GC, Estrin E, Matyskiela ME, Bashore C, Nogales E, Martin A (февраль 2012 г.). «Полная архитектура субъединицы регуляторной частицы протеасомы» . Природа . 482 (7384): 186–91. Bibcode : 2012natur.482..186L . doi : 10.1038/nature10774 . PMC   3285539 . PMID   22237024 .
  19. ^ Джилетт Т.Г., Кумар Б., Томпсон Д., Слоутер С.А., Демартино Г.Н. (ноябрь 2008 г.). «Дифференциальные роли COOH -терминов субъединиц AAA PA700 (регулятор 19 с) в асимметричной сборке и активации протеасомы 26 с» . Журнал биологической химии . 283 (46): 31813–31822. doi : 10.1074/jbc.m805935200 . PMC   2581596 . PMID   18796432 .
  20. ^ Смит Д.М., Чанг С.К., Парк С., Финли Д., Ченг Й, Голдберг А.Л. (сентябрь 2007 г.). «Док -санитарная стыковка карбоксильных терминах протеасомных АТФаз в альфа -кольце протеасомы 20S открывает ворота для входа подложки» . Молекулярная клетка . 27 (5): 731–744. doi : 10.1016/j.molcel.2007.06.033 . PMC   2083707 . PMID   17803938 .
  21. ^ Jacobson AD, Macfadden A, Wu Z, Peng J, Liu CW (Jun 2014). «Авторегуляция протеасомы 26S с помощью убиквитинирования in situ» . Молекулярная биология клетки . 25 (12): 1824–35. doi : 10.1091/mbc.e13-10-0585 . PMC   4055262 . PMID   24743594 .
  22. ^ Ишизука Т., Сато Т., Монден Т., Шибусава Н., Хашида Т., Ямада М., Мори М (август 2001 г.). «Вирус вируса иммунодефицита человека типа 1 TAT-связывающий белок-1 является транскрипционным коактиватором, специфичным для TR» . Мол Эндокринол . 15 (8): 1329–43. doi : 10.1210/mend.15.8.0680 . PMID   11463857 .
  23. ^ Кукуруза PG, McDonald ER, Herman JG, El-Deiry WS (ноябрь 2003 г.). «TAT-связывающий белок-1, компонент протеасомы 26S, способствует функции убиквитиновой лигазы E3 в белке фон Хиппель-Линдау». НАТ Генет . 35 (3): 229–37. doi : 10.1038/ng1254 . PMID   14556007 . S2CID   22798700 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: dbe2dad907cde4b7d186e45bb2e71801__1717404120
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/db/01/dbe2dad907cde4b7d186e45bb2e71801.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
PSMC3 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)