PSME2

PSME2
Идентификаторы
Псевдонимы	PSME2 , PA28B, PA28BETA, Regbeta, субъединица активатора протеасомы 2
Внешние идентификаторы	Омим : 602161 ; MGI : 1096365 ; Гомологен : 86889 ; GeneCards : PSME2 ; OMA : PSME2 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	24,147,570 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	55,828,570 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	granulocyte; ; duodenum; ; appendix; ; spleen; ; right adrenal cortex; ; mucosa of transverse colon; ; lymph node; ; pituitary gland; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex;
	Top expressed in
	jejunum; ; duodenum; ; ileum; ; colon; ; adrenal gland; ; ovary; ; uterus; ; epiblast; ; spleen; ; white adipose tissue;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	endopeptidase activator activity; protein binding; identical protein binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; membrane; proteasome activator complex; nucleoplasm; proteasome complex; extracellular exosome;
Biological process	positive regulation of endopeptidase activity; regulation of proteasomal protein catabolic process; regulation of cellular amino acid metabolic process; antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; regulation of mRNA stability; positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; protein polyubiquitination; stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; MAPK cascade; Fc-epsilon receptor signaling pathway; regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; NIK/NF-kappaB signaling; anaphase-promoting complex-dependent catabolic process; T cell receptor signaling pathway; negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway; negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; protein deubiquitination; SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; transmembrane transport; regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; post-translational protein modification; interleukin-12-mediated signaling pathway; regulation of hematopoietic stem cell differentiation; interleukin-1-mediated signaling pathway; regulation of mitotic cell cycle phase transition;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	5721
	19188
	ENSG00000100911 ; ENSG00000284889
	EMSMUSM000000799197
	Q9UL46
	P97372
	NM_002818
	NM_001029855 ; NM_011190
	NP_002809
	NP_001268401
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Субъединица 2 активатора протеасомы - это белок , который у людей кодируется PSME2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Протеасома 26S представляет собой мультикаталитический протеиназный комплекс с высоко упорядоченной структурой, состоящей из 2 комплексов, ядра 20S и регулятора 19S. Ядро 20S состоит из 4 колец из 28 неидентичных субъединиц; 2 кольца состоит из 7 альфа -субъединиц, а 2 кольца состоят из 7 бета -субъединиц. Регулятор 19S состоит из основания, которая содержит 6 субъединиц ATPase и 2 субъединиц, не являющихся АТФазой, и крышка, которая содержит до 10 не АТФазных субъединиц. Протеасомы распределяются по всем эукариотическим клеткам при высокой концентрации и расщепляют пептиды в АТФ/убиквитин-зависимом процессе в неайзосомном пути. Основной функцией модифицированной протеасомы, иммунопротеасомы, является обработка пептидов MHC класса I. Иммунопротеасом содержит альтернативный регулятор, называемый регулятором 11S или PA28, который заменяет регулятор 19S. Были идентифицированы три субъединицы (альфа, бета и гамма) регулятора 11S. Этот ген кодирует бета-субъединицу регулятора 11S, одной из двух субъединиц 11S, которая вызвана гамма-интерфероном. Три бета и три альфа -субъединицы объединяются, образуя гетерогексамерное кольцо. Шесть псевдогенов были идентифицированы на хромосомах 4, 5, 8, 10 и 13. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PSME2 взаимодействует с PSME1 . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000284889 GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000100911, ENSG00000284889 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000079197 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Ан Дж.Ю., Танахаши Н., Акияма К., Хисамацу Х, Нода С., Танака К., Чунг Ч., Шибмара Н., Вилли П.Дж., Мотт Д.Д. (июль 1995). «Первичные структуры двух гомологичных субъединиц PA28, индуцируемого гамма-интерфероном активатора протеасомы 20S» . Фебс Летт . 366 (1): 37–42. doi : 10.1016/0014-5793 (95) 00492-r . PMID 7789512 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PSME2 Протеасома (Prosome, Macropain) субъединица 2 (PA28 Beta)» .
^ Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смоляр А., Босак С., Прочтенность Р, Поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid of FP Roth, Vidal M (октябрь 2005 г.). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
^ Ahn K, Erlander M, Leturcq D, Peterson PA, Früh K, Yang Y (июль 1996). «Характеристика in vivo регулятора протеасомы PA28» . Дж. Биол. Химический 271 (30): 18237–42. doi : 10.1074/jbc.271.30.18237 . PMID 8663520 .

Дальнейшее чтение

Кукс О., Танака К., Голдберг А.Л. (1996). «Структура и функции протеасомов 20 и 26S». Анну. Преподобный Биохим . 65 : 801–47. doi : 10.1146/annurev.bi.65.070196.004101 . PMID 8811196 .
Sijts A, Sun Y, Janek K, Kral S, Paschen A, Schadendorf D, Kloetzel PM (2002). «Роль активатора протеасомы PA28 в обработке антигена MHC класса I». Мол Иммунол . 39 (3–4): 165–9. doi : 10.1016/s0161-5890 (02) 00099-8 . PMID 12200048 .
Гофф С.П. (2003). «Смерть путем дезаминирования: новая система ограничения хозяина для ВИЧ-1» . Клетка . 114 (3): 281–3. doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 00602-0 . PMID 12914693 .
Dubiel W, Pratt G, Ferrell K, Rechsteiner M (1992). «Очистка регулятора 11 с мультикаталитической протеазы» . Дж. Биол. Химический 267 (31): 22369–77. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 41681-x . PMID 1429590 .
Mott JD, Pramanik BC, Moomaw CR, Afendis SJ, Demartino GN, Slaughter CA (1995). «PA28, активатор протеасомы 20 с, состоит из двух неидентичных, но гомологичных субъединиц» . Дж. Биол. Химический 269 (50): 31466–71. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 31717-4 . PMID 7989312 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-капитализация: простой метод замены структуры крышки эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119 (94) 90802-8 . PMID 8125298 .
Ан К., Эрландер М., Летурк Д., Петерсон П.А., Фрюх К., Ян Ю (1996). «Характеристика in vivo регулятора протеасомы PA28» . Дж. Биол. Химический 271 (30): 18237–42. doi : 10.1074/jbc.271.30.18237 . PMID 8663520 .
Seeger M, Ferrell K, Frank R, Dubiel W (1997). «ТАТ ВИЧ-1 ингибирует протеасому 20 с и ее регуляторную опосредованную активацию 11 с» . Дж. Биол. Химический 272 (13): 8145–8. doi : 10.1074/jbc.272.13.8145 . PMID 9079628 .
McCusker D, Jones T, Sheer D, Trowsdale J (1998). «Генетические отношения генов, кодирующих бета -субъединицы протеасомы человека, и комплекс протеасомы PA28». Геномика . 45 (2): 362–7. doi : 10.1006/geno.1997.4948 . PMID 9344661 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). «Строительство и характеристика обогащенной полной длиной и библиотекой кДНК с 5'-эндом». Ген . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/s0378-1119 (97) 00411-3 . PMID 9373149 .
Хендил К.Б., Хан С., Танака К. (1998). «Одновременное связывание активаторов PA28 и PA700 с 20 с протеасомов» . Биохимия. Дж . 332 (Pt 3) (Pt 3): 749–54. doi : 10.1042/bj3320749 . PMC 1219536 . PMID 9620878 .
Мадани Н., Кабат Д. (1998). «Эндогенный ингибитор вируса иммунодефицита человека в лимфоцитах человека преодолевается вирусным белком VIF» . J. Virol . 72 (12): 10251–5. doi : 10.1128/jvi.72.12.10251-10255.1998 . PMC 110608 . PMID 9811770 .
Wójcik C, Tanaka K, Pawletz N, Naab U, Wilk S (1999). «Активатор протеасомы (PA28) субъединиц, альфа, бета и гамма (Ki антиген) в клетках предшественника нейронов NT2 и клетках HeLa S3». Евро. J. Cell Biol . 77 (2): 151–60. doi : 10.1016/s0171-9335 (98) 80083-6 . PMID 9840465 .
Саймон Дж. Х., Гаддис Н.К., Фушер Р.А., Малим М.Х. (1998). «Свидетельство о недавно обнаруженном клеточном фенотипе анти-ВИЧ-1». НАТ Медик 4 (12): 1397–400. doi : 10.1038/3987 . PMID 9846577 . S2CID 25235070 .
McCusker D, Wilson M, Trowsdale J (1999). «Организация генов, кодирующих активаторы протеасомы человека PA28ALPHA и бета». Иммуногенетика . 49 (5): 438–45. doi : 10.1007/s002510050517 . PMID 10199920 . S2CID 40575791 .
Tanahashi N, Murakami Y, Minami Y, Shimbara N, Hendil KB, Tanaka K (2000). «Гибридные протеасомы. Индукция интерфероном-гамма и вклад в АТФ-зависимый протеолиз» . Дж. Биол. Химический 275 (19): 14336–45. doi : 10.1074/jbc.275.19.14336 . PMID 10799514 .
Mulder LC, Muesing MA (2000). «Разложение интеграции ВИЧ-1 по пути правила N-END» . Дж. Биол. Химический 275 (38): 29749–53. doi : 10.1074/jbc.m004670200 . PMID 10893419 .
Sheehy AM, Gaddis NC, Choi JD, Malim MH (2002). «Выделение гена человека, который ингибирует ВИЧ-1 инфекцию и подавляется вирусным белком VIF». Природа . 418 (6898): 646–50. Bibcode : 2002natur.418..646S . doi : 10.1038/nature00939 . PMID 12167863 . S2CID 4403228 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 14 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000284889 GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000100911, ENSG00000284889 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000079197 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid7789512-5] Ан Дж.Ю., Танахаши Н., Акияма К., Хисамацу Х, Нода С., Танака К., Чунг Ч., Шибмара Н., Вилли П.Дж., Мотт Д.Д. (июль 1995). «Первичные структуры двух гомологичных субъединиц PA28, индуцируемого гамма-интерфероном активатора протеасомы 20S» . Фебс Летт . 366 (1): 37–42. doi : 10.1016/0014-5793 (95) 00492-r . PMID 7789512 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PSME2 Протеасома (Prosome, Macropain) субъединица 2 (PA28 Beta)» .

[pmid16189514-7] Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смоляр А., Босак С., Прочтенность Р, Поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid of FP Roth, Vidal M (октябрь 2005 г.). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .

[pmid8663520-8] Ahn K, Erlander M, Leturcq D, Peterson PA, Früh K, Yang Y (июль 1996). «Характеристика in vivo регулятора протеасомы PA28» . Дж. Биол. Химический 271 (30): 18237–42. doi : 10.1074/jbc.271.30.18237 . PMID 8663520 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v Т и Субъединицы комплекса протеасомы эндопептидазы ( EC 3.4.25.1)
A (альфа -субъединицы)	PSMA1 PSMA2 PSMA3 PSMA4 PSMA5 PSMA6 PSMA7 PSMA8
B (бета -субъединицы)	PSMB1 PSMB2 PSMB3 PSMB4 PSMB5 PSMB6 PSMB7 PSMB8 PSMB9 PSMB10
С (АТФАзы)	PSMC1 PSMC2 PSMC3 PSMC4 PSMC5 PSMC6
D (неатфазы)	PSMD1 PSMD2 PSMD3 PSMD4 PSMD5 PSMD6 PSMD7 PSMD8 PSMD9 PSMD10 PSMD11 PSMD12 PSMD13 PSMD14
E (субъединицы активатора)	PSME1 PSME2 PSME3 PSME4
F (субъединица ингибитора)	PSMF1