PSMF1

PSMF1
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB showСписок кодов идентификаторов PDB 2VT8, 4OUH
Идентификаторы
Псевдонимы	PSMF1 , PI31, Субъединица ингибитора протеасомы 1
Внешние идентификаторы	Омим : 617858 ; MGI : 1346072 ; Гомологен : 38231 ; GeneCards : PSMF1 ; OMA : PSMF1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 20 (human) Band 20p13 Start 1,113,240 bp End 1,189,415 bp
showМестоположение гена ( мышь ) Chr. Chromosome 2 (mouse) Band 2|2 G3 Start 151,557,732 bp End 151,586,106 bp
showРНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in sperm left testis right testis muscle of thigh blood gastrocnemius muscle popliteal artery tibial arteries monocyte islet of Langerhans Top expressed in seminiferous tubule spermatid secondary oocyte zygote primary oocyte blood sciatic nerve interventricular septum fetal liver hematopoietic progenitor cell spermatocyte More reference expression data BioGPS More reference expression data
showДжин Онтология Molecular function proteasome binding protein binding endopeptidase inhibitor activity protein homodimerization activity protein heterodimerization activity Cellular component cytoplasm cytosol membrane nucleoplasm endoplasmic reticulum proteasome complex proteasome core complex perinuclear region of cytoplasm Biological process regulation of cellular amino acid metabolic process antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent ubiquitin-dependent protein catabolic process regulation of mRNA stability positive regulation of canonical Wnt signaling pathway protein polyubiquitination stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway tumor necrosis factor-mediated signaling pathway MAPK cascade Fc-epsilon receptor signaling pathway NIK/NF-kappaB signaling negative regulation of proteasomal protein catabolic process anaphase-promoting complex-dependent catabolic process T cell receptor signaling pathway negative regulation of canonical Wnt signaling pathway proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway negative regulation of endopeptidase activity negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle protein deubiquitination SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process transmembrane transport regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia post-translational protein modification regulation of hematopoietic stem cell differentiation interleukin-1-mediated signaling pathway regulation of mitotic cell cycle phase transition Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 9491 228769 Набор ENSG00000125818 Ensmusg00000032869 Uniprot Q92530 Q5QPM9 Q8BHL8 Refseq (мРНК) showNM_006814 NM_178578 NM_178579 NM_001323407 NM_001323408 NM_001323409 NM_001323410 NM_144889 NM_212446 NM_001305244 Refseq (белок) showNP_001310336 NP_001310337 NP_001310338 NP_001310339 NP_006805 NP_848693 NP_001292173 NP_997611 Расположение (UCSC) Chr 20: 1,11 - 1,19 МБ Chr 2: 151,56 - 151,59 МБ PubMed Search
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Ингибитор протеасомы PI31 - это белок , который у людей кодируется PSMF1 геном .

Функция

26S Протеасома представляет собой мультикаталитический протеиназный комплекс с высоко упорядоченной структурой, состоящей из 2 комплексов, ядра 20S и регулятора 19S. Ядро 20S состоит из 4 колец из 28 неидентичных субъединиц; 2 кольца состоит из 7 альфа -субъединиц, а 2 кольца состоят из 7 бета -субъединиц. Регулятор 19S состоит из основания, которая содержит 6 субъединиц ATPase и 2 субъединиц, не являющихся АТФазой, и крышка, которая содержит до 10 не АТФазных субъединиц. Протеасомы распределяются по всем эукариотическим клеткам при высокой концентрации и расщепляют пептиды в АТФ / убиквитин -зависимом процессе в не лизосомальном пути. Основной функцией модифицированной протеасомы, иммунопротеасомы, является обработка MHC пептидов класса I. PSMF1 кодирует белок, называемый PI31, который связывается с протеасомами 20 -х и 26S. PI31 был первоначально идентифицирован по его способности ингибировать гидролиз мелких синтетических пептидов в свободном анализе, но он стимулирует 26S -активность протеасом как in vitro, так и in vivo. PI31 может способствовать сборке 26-х протеасомов из подраздел 19S и 20S, а также служит адаптером для пары протеасомов с моторными белками для опосредования быстрого аксонального транспорта в нейронах. Инактивация PMSF1 у дрожжей, растений, плодовых мух и мышей ослабляет деградацию белка и стимулирует накопление убиквитинированных белковых агрегатов. Кроме того, потеря функции PSMF1 у мышей вызывает прогрессирующую дисфункцию нейронов, синаптическую дегенерацию и в конечном итоге гибель нейрональных клеток. Альтернативные варианты транскрипта были идентифицированы для этого гена.

Дальнейшее чтение

• CHO-PARK PF (APR 2013). «Регуляция протеасом путем АДФ-рибозилирования» . Клетка . 153 (3): 614–27. doi : 10.1016/j.cell.2013.03.040 . PMC   3676968 . PMID   23622245 .
• Ян Б.Дж. (апрель 2016 г.). «Регулятор Proteasom Arabidopsis требуется для ауксин-опосредованного подавления активности протеасом и регулирует передачу сигналов ауксина» . Nat Commun . 7 (3): 11388. DOI : 10.1038/ncomms11388 . PMC   4848511 . PMID   27109828 .
• Goff SP (август 2003 г.). «Смерть путем дезаминирования: новая система ограничения хозяина для ВИЧ-1» . Клетка . 114 (3): 281–3. doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 00602-0 . PMID   12914693 . S2CID   16340355 .
• Minghetti L, Visentin S, Patrizio M, Franchini L, Ajmone-Cat MA, Levi G (май 2004 г.). «Множественное действие вируса вируса иммунодефицита человека типа 1 на функции микроглиальных клеток». Нейрохимические исследования . 29 (5): 965–78. doi : 10.1023/b: nere.0000021241.90133.89 . PMID   15139295 . S2CID   25323034 .
• Liou Ly, Herrmann CH, Rice AP (сентябрь 2004 г.). «ВИЧ-1 инфекция и регуляция функции TAT в макрофагах». Международный журнал биохимии и клеточной биологии . 36 (9): 1767–75. doi : 10.1016/j.biocel.2004.02.018 . PMID   15183343 .
• Bannwarth S, Gatignol A (январь 2005 г.). «ВИЧ-1 TAR РНК: мишень молекулярных взаимодействий между вирусом и его хозяином». Текущее исследование по ВИЧ . 3 (1): 61–71. doi : 10.2174/1570162052772924 . PMID   15638724 .
• Gibellini D, Vitone F, Schiavone P, Re MC (апрель 2005 г.). «ВИЧ-1 белок ТАТ и пролиферация клеток и выживание: краткий обзор». Новая микробиологика . 28 (2): 95–109. PMID   16035254 .
• Hetzer C, Dormeyer W, Schnölzer M, Ott M (октябрь 2005 г.). «Декодирование TAT: биология посттрансляционных модификаций ВИЧ -тат» . Микробы и инфекция / институт Пастера . 7 (13): 1364–9. doi : 10.1016/j.micinf.2005.06.003 . PMID   16046164 .
• Перуцци Ф. (2006). «Множественные функции ВИЧ-1 ТАТ: пролиферация в сравнении с апоптозом» . Границы в биологии . 11 : 708–17. doi : 10.2741/1829 . PMID   16146763 .
• Andersson B, Wendland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (апрель 1996 г.). «Метод" двойного адаптера "для улучшения строительства библиотеки ружья». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID   8619474 .
• Seeger M, Ferrell K, Frank R, Dubiel W (Mar 1997). «ТАТ ВИЧ-1 ингибирует протеасому 20 с и ее регуляторную опосредованную активацию 11 с» . Журнал биологической химии . 272 (13): 8145–8. doi : 10.1074/jbc.272.13.8145 . PMID   9079628 .
• Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wendland MA, Lennon G, Gibbs RA (апрель 1997). «Крупномасштабное секвенирование кДНК конкатенации» . Исследование генома . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC   139146 . PMID   9110174 .
• Мани Н., Кабат Д (декабрь 1998). «Конечный ингибитор вируса иммунодефицита человека в лимфоцитах человека преодолевается вирусным протестом VIF » Журнал вирусологии 72 (12): 10251–5 Doi : 10.1128/ jvi.72.12.10251-10255.1  110608PMC  9811770PMID
• Саймон Дж. Х., Гаддис Н.К., Фушер Р.А., Малим М.Х. (декабрь 1998). «Свидетельство о недавно обнаруженном клеточном фенотипе анти-ВИЧ-1». Природная медицина . 4 (12): 1397–400. doi : 10.1038/3987 . PMID   9846577 . S2CID   25235070 .
• McCutchen-Maloney SL, Matsuda K, Shimbara N, Binns DD, Tanaka K, Slaughter CA, Demartino GN (Jun 2000). «Клонирование кДНК, экспрессия и функциональная характеристика PI31, пролинового ингибитора протеасомы» . Журнал биологической химии . 275 (24): 18557–65. doi : 10.1074/jbc.m001697200 . PMID   10764772 .
• Mulder LC, Muesing MA (сентябрь 2000). «Разложение интеграции ВИЧ-1 по пути правила N-END» . Журнал биологической химии . 275 (38): 29749–53. doi : 10.1074/jbc.m004670200 . PMID   10893419 .
• Sheehy AM, Gaddis NC, Choi JD, Malim MH (август 2002 г.). «Выделение гена человека, который ингибирует ВИЧ-1 инфекцию и подавляется вирусным белком VIF». Природа . 418 (6898): 646–50. Bibcode : 2002natur.418..646S . doi : 10.1038/nature00939 . PMID   12167863 . S2CID   4403228 .
• Zaiss DM, Standera S, Kloetzel PM, Sijts AJ (октябрь 2002 г.). «PI31 является модулятором формирования протеасомы и обработки антигена» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (22): 14344–9. Bibcode : 2002pnas ... 9914344Z . doi : 10.1073/pnas.212257299 . PMC   137886 . PMID   12374861 .
• Huang X, Seifert U, Salzmann U, Henklein P, Preissner R, Henke W, Sijts AJ, Kloetzel PM, Dubiel W (ноябрь 2002 г.). «Сайт RTP, разделенный белком TAT ВИЧ-1 и субъединицей регулятора 11S, имеет решающее значение для их влияния на функцию протеасом, включая обработку антигена». Журнал молекулярной биологии . 323 (4): 771–82. doi : 10.1016/s0022-2836 (02) 00998-1 . PMID   12419264 .