ПСМЕ3

ПСМЕ3
Идентификаторы
Псевдонимы	PSME3 , HEL-S-283, Ki, PA28-gamma, PA28G, PA28gamma, REG-GAMMA, субъединица 3 активатора протеасомы
Внешние идентификаторы	Опустить : 605129 ; МГИ : 1096366 ; Гомологен : 2111 ; Генные карты : PSME3 ; ОМА : PSME3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 17 (human) Band 17q21.31 Start 42,824,385 bp End 42,843,760 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 11 (mouse) Band 11 D|11 64.67 cM Start 101,207,039 bp End 101,214,363 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in islet of Langerhans monocyte stromal cell of endometrium rectum gastrocnemius muscle appendix mucosa of esophagus ganglionic eminence mucosa of transverse colon epithelium of colon Top expressed in blood tail of embryo ascending aorta yolk sac aortic valve genital tubercle epiblast ventricular zone spermatocyte seminiferous tubule More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function p53 binding MDM2/MDM4 family protein binding endopeptidase activator activity protein binding identical protein binding Cellular component membrane proteasome activator complex nucleoplasm proteasome complex nucleus cytoplasm cytosol Biological process regulation of proteasomal protein catabolic process regulation of cellular amino acid metabolic process antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent regulation of mRNA stability positive regulation of canonical Wnt signaling pathway negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway protein polyubiquitination stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway tumor necrosis factor-mediated signaling pathway MAPK cascade Fc-epsilon receptor signaling pathway regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle NIK/NF-kappaB signaling cell cycle anaphase-promoting complex-dependent catabolic process T cell receptor signaling pathway negative regulation of canonical Wnt signaling pathway positive regulation of endopeptidase activity proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process apoptotic process Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle protein deubiquitination SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process transmembrane transport regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia post-translational protein modification regulation of hematopoietic stem cell differentiation interleukin-1-mediated signaling pathway regulation of mitotic cell cycle phase transition Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 10197 19192 Вместе ENSG00000131467 ENSMUSG00000078652 ЮниПрот P61289 P61290 RefSeq (мРНК) НМ_001267045 НМ_005789 НМ_176863 НМ_001330229 НМ_011192 RefSeq (белок) НП_001253974 НП_001317158 НП_005780 НП_789839 НП_035322 Местоположение (UCSC) Чр 17: 42,82 – 42,84 Мб Чр 11: 101,21 – 101,21 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 3 комплекса активатора протеасом представляет собой белок , который у человека кодируется PSME3 геном .

Функция

26S протеасома представляет собой мультикаталитический протеиназный комплекс с высокоупорядоченной структурой, состоящий из двух комплексов: ядра 20S и регулятора 19S. Ядро 20S состоит из 4 колец по 28 неидентичных субъединиц; 2 кольца состоят из 7 альфа-субъединиц, а 2 кольца состоят из 7 бета-субъединиц. Регулятор 19S состоит из основания, содержащего 6 субъединиц АТФазы и 2 субъединицы, не относящиеся к АТФазе, и крышки, которая содержит до 10 субъединиц, не являющихся АТФазой. Протеасомы распределяются по эукариотическим клеткам в высокой концентрации и расщепляют пептиды в АТФ/убиквитин-зависимом процессе нелизосомальным путем. Существенной функцией модифицированной протеасомы, иммунопротеасомы, является процессинг пептидов MHC класса I. Иммунопротеасома содержит альтернативный регулятор, называемый регулятором 11S или PA28, который заменяет регулятор 19S. Идентифицированы три субъединицы (альфа, бета и гамма) регулятора 11S. Этот ген кодирует гамма-субъединицу регулятора 11S. Шесть гамма-субъединиц объединяются, образуя гомогексамерное кольцо. Были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.

Взаимодействия

Было показано, что PSME3 взаимодействует с P53. и Мдм2 .

Дальнейшее чтение

• Ку О, Танака К, Голдберг А.Л. (1996). «Структура и функции 20S и 26S протеасом». Анну. Преподобный Биохим . 65 : 801–47. дои : 10.1146/annurev.bi.65.070196.004101 . ПМИД   8811196 .
• Гофф СП (2003). «Смерть от дезаминирования: новая система ограничения хозяина для ВИЧ-1» . Клетка . 114 (3): 281–3. дои : 10.1016/S0092-8674(03)00602-0 . ПМИД   12914693 . S2CID   16340355 .
• Никайдо Т., Симада К., Сибата М., Хата М., Сакамото М., Такасаки Ю., Сато С., Такахаси Т., Нисида Ю. (1990). «Клонирование и нуклеотидная последовательность кДНК Ki-антигена, высококонсервативного ядерного белка, обнаруженного в сыворотке крови пациентов с системной красной волчанкой» . Клин. Эксп. Иммунол . 79 (2): 209–14. дои : 10.1111/j.1365-2249.1990.tb05180.x . ПМЦ   1534747 . ПМИД   1968796 .
• Мики Й., Свенсен Дж., Шаттук-Эйденс Д., Фуреал П.А., Харшман К., Тавтигян С., Лю Кью, Кокран С., Беннетт Л.М., Дин В. (1994). «Сильный кандидат на ген предрасположенности к раку молочной железы и яичников BRCA1» . Наука . 266 (5182): 66–71. Бибкод : 1994Sci...266...66M . дои : 10.1126/science.7545954 . ПМИД   7545954 .
• Харшман К., Белл Р., Розенталь Дж., Катчер Х., Мики Ю., Свенсон Дж., Голами З., Фрай С., Дин В., Даянант П. (1995). «Сравнение методов позиционного клонирования, использованных для выделения гена BRCA1». Хм. Мол. Жене . 4 (8): 1259–66. дои : 10.1093/hmg/4.8.1259 . ПМИД   7581362 .
• Джейкоб А., Кандпал Г., Патанджали С.Р., Кандпал Р.П. (1995). «Молекулярное клонирование и характер экспрессии генов из области размером 470 КБ рядом с локусом BRCA1 на хромосоме 17q21». Онкоген . 11 (5): 981–6. ПМИД   7675458 .
• Сигер М., Феррелл К., Фрэнк Р., Дубиэль В. (1997). «ВИЧ-1 tat ингибирует 20S-протеасому и ее активацию, опосредованную регулятором 11S» . Ж. Биол. Хим . 272 (13): 8145–8. дои : 10.1074/jbc.272.13.8145 . ПМИД   9079628 .
• Кандил Э., Кода К., Исибаши Т., Танака К., Касахара М. (1997). «Субъединицы PA28 протеасомы мыши: первичные структуры и хромосомная локализация генов». Иммуногенетика . 46 (4): 337–44. дои : 10.1007/s002510050281 . ПМИД   9218537 . S2CID   22101213 .
• Маккаскер Д., Джонс Т., Шир Д., Троусдейл Дж. (1998). «Генетические взаимоотношения генов, кодирующих бета-субъединицы протеасом человека и комплекс протеасом PA28». Геномика . 45 (2): 362–7. дои : 10.1006/geno.1997.4948 . ПМИД   9344661 .
• Ноултон-младший, Джонстон С.С., Уитби Ф.Г., Реалини С., Чжан З., Рехштайнер М., Хилл С.П. (1998). «Структура протеасомного активатора REGalpha (PA28alpha)». Природа . 390 (6660): 639–43. Бибкод : 1997Natur.390..639K . дои : 10.1038/37670 . ПМИД   9403698 . S2CID   4309279 .
• Кода К., Исибаши Т., Шимбара Н., Танака К., Мацуда Ю., Касахара М. (1998). «Характеристика семейства генов комплекса активатора PA28 мыши: полная организация трех генов-членов и физическая карта области размером примерно 150 т.п.н., содержащей гены альфа- и бета-субъединиц» . Дж. Иммунол . 160 (10): 4923–35. дои : 10.4049/jimmunol.160.10.4923 . ПМИД   9590240 .
• Мадани Н., Кабат Д. (1998). «Эндогенный ингибитор вируса иммунодефицита человека в лимфоцитах человека преодолевается вирусным белком Vif» . Дж. Вирол . 72 (12): 10251–5. doi : 10.1128/JVI.72.12.10251-10255.1998 . ПМК   110608 . ПМИД   9811770 .
• Войчик С., Танака К., Павелец Н., Нааб У., Уилк С. (1999). «Субъединицы активатора протеасом (PA28), альфа, бета и гамма (антиген Ki) в клетках-предшественниках нейронов NT2 и клетках HeLa S3». Евро. Дж. Клеточная Биол . 77 (2): 151–60. дои : 10.1016/s0171-9335(98)80083-6 . ПМИД   9840465 .
• Саймон Дж. Х., Гэддис Н. К., Фушье Р. А., Малим М. Х. (1998). «Доказательства недавно открытого клеточного фенотипа анти-ВИЧ-1». Нат. Мед . 4 (12): 1397–400. дои : 10.1038/3987 . ПМИД   9846577 . S2CID   25235070 .
• Малдер Л.К., Мюзинг М.А. (2000). «Деградация интегразы ВИЧ-1 по пути правила N-конца» . Ж. Биол. Хим . 275 (38): 29749–53. дои : 10.1074/jbc.M004670200 . ПМИД   10893419 .
• Арайя Р., Такахаши Р., Номура Ю. (2002). «Двугибридный скрининг дрожжей с использованием конститутивно-активной каспазы-7 в качестве приманки для идентификации PA28gamma в качестве субстрата эффекторной каспазы» . Гибель клеток отличается . 9 (3): 322–8. дои : 10.1038/SJ.CDD.4400949 . ПМИД   11859414 .
• Шихи А.М., Гэддис Н.К., Чой Дж.Д., Малим М.Х. (2002). «Выделение человеческого гена, который ингибирует инфекцию ВИЧ-1 и подавляется вирусным белком Vif». Природа . 418 (6898): 646–50. Бибкод : 2002Natur.418..646S . дои : 10.1038/nature00939 . ПМИД   12167863 . S2CID   4403228 .
• Хуанг X, Зайферт Ю, Зальцманн Ю, Хенкляйн П, Прейсснер Р, Хенке В, Сейтс А.Дж., Клёцель П.М., Дубиэль В. (2002). «Сайт RTP, общий для белка Tat ВИЧ-1 и субъединицы альфа-регулятора 11S, имеет решающее значение для их влияния на функцию протеасом, включая процессинг антигена». Дж. Мол. Биол . 323 (4): 771–82. дои : 10.1016/S0022-2836(02)00998-1 . ПМИД   12419264 .

Внешние ссылки

• PSME3 Расположение человеческого гена в браузере генома UCSC .
• Подробности о гене человека PSME3 в браузере генома UCSC .