PSME1

PSME1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
показывать Список кодов идентификаторов PDB
	1AVO
Идентификаторы
Псевдонимы	Psme1 , ifi5111, pa28a, pa28alpha, regalpha, hel-s-129m, субъединица активатора протеасомы 1
Внешние идентификаторы	Омим : 600654 ; MGI : 1096367 ; Гомологен : 4560 ; GeneCards : PSME1 ; OMA : PSME1 - ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 14 (human)
End	24,138,967 bp
показывать Местоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	55,818,986 bp
показывать РНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	granulocyte; ; monocyte; ; lymph node; ; spleen; ; right adrenal gland; ; duodenum; ; right adrenal cortex; ; appendix; ; left adrenal gland; ; rectum;
	Top expressed in
	spleen; ; mesenteric lymph nodes; ; duodenum; ; right ventricle; ; thymus; ; right lung lobe; ; jejunum; ; blood; ; left lung; ; subcutaneous adipose tissue;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Джин Онтология
Molecular function	endopeptidase activator activity; protein binding;
Cellular component	proteasome complex; cytoplasm; nucleoplasm; proteasome activator complex; cytosol; extracellular exosome;
Biological process	tumor necrosis factor-mediated signaling pathway; protein polyubiquitination; T cell receptor signaling pathway; positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; anaphase-promoting complex-dependent catabolic process; regulation of proteasomal protein catabolic process; regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; regulation of mRNA stability; antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; antigen processing and presentation of exogenous antigen; regulation of cellular amino acid metabolic process; NIK/NF-kappaB signaling; Fc-epsilon receptor signaling pathway; negative regulation of canonical Wnt signaling pathway; MAPK cascade; stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway; positive regulation of endopeptidase activity; proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process; Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway; negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; protein deubiquitination; SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process; transmembrane transport; regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia; post-translational protein modification; regulation of hematopoietic stem cell differentiation; interleukin-1-mediated signaling pathway; regulation of mitotic cell cycle phase transition;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	5720
	19186
	ENSG00000092010 ; ENSG00000284916
	Ensmusg00000022216
	Q06323
	P97371
	NM_176783 ; NM_001281528 ; NM_001281529 ; NM_006263
	NM_011189
	NP_001268457 ; NP_001268458 ; NP_006254 ; NP_788955
	NP_035319
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Субъединица 1 -протеасома -активатора 1 - это белок , который у людей кодируется PSME1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Протеасома 26S представляет собой мультикаталитический протеиназный комплекс с высоко упорядоченной структурой, состоящей из 2 комплексов, ядра 20S и регулятора 19S. Ядро 20S состоит из 4 колец из 28 неидентичных субъединиц; 2 кольца состоит из 7 альфа -субъединиц, а 2 кольца состоят из 7 бета -субъединиц. Регулятор 19S состоит из основания, которая содержит 6 субъединиц ATPase и 2 субъединиц, не являющихся АТФазой, и крышка, которая содержит до 10 не АТФазных субъединиц. Протеасомы распределяются по всем эукариотическим клеткам при высокой концентрации и расщепляют пептиды в АТФ/убиквитин-зависимом процессе в неайзосомном пути. Основной функцией модифицированной протеасомы, иммунопротеасомы, является обработка пептидов MHC класса I. Иммунопротеасом содержит альтернативный регулятор, называемый регулятором 11S или PA28, который заменяет регулятор 19S. Были идентифицированы три субъединицы (альфа, бета и гамма) регулятора 11S. Этот ген кодирует альфа-субъединицу регулятора 11S, одной из двух субъединиц 11S, которая индуцируется гамма-интерфероном. Три альфа и три бета -субъединицы объединяются, образуя гетерогексамерное кольцо. Были идентифицированы две транскрипты, кодирующие разные изоформы. ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что PSME1 взаимодействует :

Эмери ^{[ 7 ]} и
PSME2 . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000284916 GRCH38: ENSEMBL Release 89: ENSG00000092010, ENSG00000284916 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000022216 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Honoré B, Leffers H, Madsen P, Celis Je (февраль 1994 г.). «Интерферон-гамма усиливает уникальный набор белков в кератиноцитах человека. Молекулярное клонирование и экспрессия кДНК, кодирующей RGD-последовательность, содержащий белок Igup I-5111» . Eur J Biochem . 218 (2): 421–30. doi : 10.1111/j.1432-1033.1993.tb18392.x . PMID 8269930 .
^ Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PSME1 Протеасома (Prosome, Macropain) субъединица 1 (PA28 Alpha)» .
^ Уилкинсон Ф.Л., Холаска Дж.М., Чжан З., Шарма А., Манилал С., Холт И., Стамм С., Уилсон К.Л., Моррис Г.Е. (июнь 2003 г.). «Emerin взаимодействует in vitro с сплайсингом, связанным с фактором, YT521-B» . Евро. J. Biochem . 270 (11): 2459–66. doi : 10.1046/j.1432-1033.2003.03617.x . PMID 12755701 .
^ Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смоляр А., Босак С., Прочтенность Р, Поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid of FP Roth, Vidal M (октябрь 2005 г.). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .
^ Ahn K, Erlander M, Leturcq D, Peterson PA, Früh K, Yang Y (июль 1996). «Характеристика in vivo регулятора протеасомы PA28» . Дж. Биол. Химический 271 (30): 18237–42. doi : 10.1074/jbc.271.30.18237 . PMID 8663520 .

Дальнейшее чтение

Кукс О., Танака К., Голдберг А.Л. (1996). «Структура и функции протеасомов 20 и 26S». Анну. Преподобный Биохим . 65 : 801–47. doi : 10.1146/annurev.bi.65.070196.004101 . PMID 8811196 .
Sijts A, Sun Y, Janek K, Kral S, Paschen A, Schadendorf D, Kloetzel PM (2002). «Роль активатора протеасомы PA28 в обработке антигена MHC класса I». Мол Иммунол . 39 (3–4): 165–9. doi : 10.1016/s0161-5890 (02) 00099-8 . PMID 12200048 .
Гофф С.П. (2003). «Смерть путем дезаминирования: новая система ограничения хозяина для ВИЧ-1» . Клетка . 114 (3): 281–3. doi : 10.1016/s0092-8674 (03) 00602-0 . PMID 12914693 .
Расмуссен Х.Х., Ван Дамм Дж., Пуйп М., Гессер Б., Селис Дж., Вандекеркхоув Дж. (1993). «Микроязывания из 145 белков, зарегистрированных в двумерной базе данных гелевых белков нормальных эпидермальных кератиноцитов человека». Электрофорез . 13 (12): 960–9. doi : 10.1002/elps.115013011199 . PMID 1286667 . S2CID 41855774 .
Ан Дж.Ю., Танахаши Н., Акияма К., Хисамацу Х, Нода С., Танака К., Чунг Ч., Шибмара Н., Вилли П.Дж., Мотт Д.Д. (1995). «Первичные структуры двух гомологичных субъединиц PA28, индуцируемого гамма-интерфероном активатора протеасомы 20S» . Фебс Летт . 366 (1): 37–42. doi : 10.1016/0014-5793 (95) 00492-r . PMID 7789512 .
Realini C, Dubiel W, Pratt G, Ferrell K, Rechsteiner M (1994). «Молекулярное клонирование и экспрессия гамма-интерферона, индуцируемого активатором многокаталитической протеазы» . Дж. Биол. Химический 269 (32): 20727–32. doi : 10.1016/s0021-9258 (17) 32052-5 . PMID 8051173 .
Ан К., Эрландер М., Летурк Д., Петерсон П.А., Фрюх К., Ян Ю (1996). «Характеристика in vivo регулятора протеасомы PA28» . Дж. Биол. Химический 271 (30): 18237–42. doi : 10.1074/jbc.271.30.18237 . PMID 8663520 .
Бональдо М.Ф., Леннон Г., Соарс М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов» . Геном Res . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Seeger M, Ferrell K, Frank R, Dubiel W (1997). «ТАТ ВИЧ-1 ингибирует протеасому 20 с и ее регуляторную опосредованную активацию 11 с» . Дж. Биол. Химический 272 (13): 8145–8148. doi : 10.1074/jbc.272.13.8145 . PMID 9079628 .
Soza A, Knuehl C, Groettrup M, Henklein P, Tanaka K, Kloetzel PM (1997). «Экспрессия и субклеточная локализация комплекса активатора протеасомы мыши 20S PA28» . Фебс Летт . 413 (1): 27–34. doi : 10.1016/s0014-5793 (97) 00864-8 . PMID 9287111 .
McCusker D, Jones T, Sheer D, Trowsdale J (1998). «Генетические отношения генов, кодирующих бета -субъединицы протеасомы человека, и комплекс протеасомы PA28». Геномика . 45 (2): 362–7. doi : 10.1006/geno.1997.4948 . PMID 9344661 .
Johnston SC, Whitby FG, Realini C, Rechsteiner M, Hill CP (1998). «Рег -регламентальный субъединица Proteasome 11S Alpha (PA28 Alpha) - гепамер» . Белок Sci . 6 (11): 2469–73. doi : 10.1002/pro.55600611123 . PMC 2143584 . PMID 9385652 .
Wang X, Omura S, Szweda Li, Yang Y, Bérard J, Seminaro J, Wu J (1998). «Рапамицин ингибирует экспрессию активатора протеасом и активность протеасом». Евро. J. Immunol . 27 (11): 2781–6. doi : 10.1002/eji.1830271106 . PMID 9394799 . S2CID 23525256 .
Ноултон младший, Джонстон С.К., Уитби Ф.Г., Реалини С., Чжан З., Рехштейнер М., Хилл К.П. (1998). «Структура активатора протеасомы Regalpha (PA28Alpha)». Природа . 390 (6660): 639–43. Bibcode : 1997natur.390..639K . doi : 10.1038/37670 . PMID 9403698 . S2CID 4309279 .
Кохда К., Исибаши Т., Шимбара Н., Танака К., Мацуда Ю., Касахара М. (1998). «Характеристика мышиного комплекса Activator Complex Семейство генов: полные организации трех генов членов и физическая карта области приблизительно 150 т. Д., содержащую гены альфа и бета-субъединицы». J. Immunol . 160 (10): 4923–35. doi : 10.4049/jimmunol.160.10.4923 . PMID 9590240 .
Мадани Н., Кабат Д. (1998). «Эндогенный ингибитор вируса иммунодефицита человека в лимфоцитах человека преодолевается вирусным белком VIF» . J. Virol . 72 (12): 10251–5. doi : 10.1128/jvi.72.12.10251-10255.1998 . PMC 110608 . PMID 9811770 .
Саймон Дж. Х., Гаддис Н.К., Фушер Р.А., Малим М.Х. (1998). «Свидетельство о недавно обнаруженном клеточном фенотипе анти-ВИЧ-1». НАТ Медик 4 (12): 1397–400. doi : 10.1038/3987 . PMID 9846577 . S2CID 25235070 .
McCusker D, Wilson M, Trowsdale J (1999). «Организация генов, кодирующих активаторы протеасомы человека PA28ALPHA и бета». Иммуногенетика . 49 (5): 438–45. doi : 10.1007/s002510050517 . PMID 10199920 . S2CID 40575791 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 14 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в ENSG00000284916 GRCH38: ENSEMBL Release 89: ENSG00000092010, ENSG00000284916 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000022216 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid8269930-5] Honoré B, Leffers H, Madsen P, Celis Je (февраль 1994 г.). «Интерферон-гамма усиливает уникальный набор белков в кератиноцитах человека. Молекулярное клонирование и экспрессия кДНК, кодирующей RGD-последовательность, содержащий белок Igup I-5111» . Eur J Biochem . 218 (2): 421–30. doi : 10.1111/j.1432-1033.1993.tb18392.x . PMID 8269930 .

[entrez-6] Подпрыгнуть до: ^а ^{беременный} «Ген Entrez: PSME1 Протеасома (Prosome, Macropain) субъединица 1 (PA28 Alpha)» .

[pmid12755701-7] Уилкинсон Ф.Л., Холаска Дж.М., Чжан З., Шарма А., Манилал С., Холт И., Стамм С., Уилсон К.Л., Моррис Г.Е. (июнь 2003 г.). «Emerin взаимодействует in vitro с сплайсингом, связанным с фактором, YT521-B» . Евро. J. Biochem . 270 (11): 2459–66. doi : 10.1046/j.1432-1033.2003.03617.x . PMID 12755701 .

[pmid16189514-8] Rual JF, Vengate K, Hao T, Hirth-Christ-Christ, Dricot A, Li N, Berriz GF, FD Gibbons, Dress M, Ayvi-gedehossou N, Click N, Simon C, Boxem M, Silthern S, Roenberg J, Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Лим Дж., Книги Дж., Фротон С., Уэлш Е., Севик С., Бекс С., Сирорски Р.С., Ванденхаут Дж., Зогби Х. Х., Смоляр А., Босак С., Прочтенность Р, Поддержка- Stander L, Cusick ME, Hid of FP Roth, Vidal M (октябрь 2005 г.). «На пути к протеому белково-белок-белковой сетевой белок. Природа . 437 (7062): 1173–8. Bibcode : 2005 Natur . doi : 10.1038/nature04209 . 16189514PMID S2CID 4427026 .

[pmid8663520-9] Ahn K, Erlander M, Leturcq D, Peterson PA, Früh K, Yang Y (июль 1996). «Характеристика in vivo регулятора протеасомы PA28» . Дж. Биол. Химический 271 (30): 18237–42. doi : 10.1074/jbc.271.30.18237 . PMID 8663520 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

v Т и Субъединицы комплекса протеасомы эндопептидазы ( EC 3.4.25.1)
A (alpha subunits)	PSMA1 PSMA2 PSMA3 PSMA4 PSMA5 PSMA6 PSMA7 PSMA8
B (beta subunits)	PSMB1 PSMB2 PSMB3 PSMB4 PSMB5 PSMB6 PSMB7 PSMB8 PSMB9 PSMB10
C (ATPases)	PSMC1 PSMC2 PSMC3 PSMC4 PSMC5 PSMC6
D (non-ATPases)	PSMD1 PSMD2 PSMD3 PSMD4 PSMD5 PSMD6 PSMD7 PSMD8 PSMD9 PSMD10 PSMD11 PSMD12 PSMD13 PSMD14
E (activator subunits)	PSME1 PSME2 PSME3 PSME4
F (inhibitor subunit)	PSMF1