Jump to content

BPIFA1

(Перенаправлено из графика )

BPIFA1
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы BPIFA1 , LUNX, NASG, Lullunc, Splunc1, Sprt, 49G10.5, BPI Fol
Внешние идентификаторы Омим : 607412 ; MGI : 1338036 ; Гомологен : 7895 ; GeneCards : BPIFA1 ; OMA : BPIFA1 - ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Набор
Uniprot
Refseq (мРНК)

NM_001243193
NM_016583
NM_130852

NM_011126

Refseq (белок)

NP_001230122
NP_057667
NP_570913

NP_035256

Расположение (UCSC) Chr 20: 33,24 - 33,24 МБ Chr 2: 153,98 - 153,99 МБ
PubMed Search [ 3 ] [ 4 ]
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

BPI, содержащий семейство A, член 1 (BPIFA1), также известный как небо, легкое и клон эпителия носа (DACK), [ 5 ] является белком , который у людей кодируется геном BPIFA1 . [ 6 ] [ 7 ] Он также был известен как «секреторный белок в верхних дыхательных путях» (SPRT). Последовательность гена BPIFA1 предсказывает 4 транскрипта ( варианты сплайсинга ); 3 варианты мРНК были хорошо охарактеризованы. Полученный BPIFA1 является секретируемым белком, экспрессируемым на очень высоких уровнях в слизистой оболочке дыхательных путей (обонятельный и дыхательный и эпителий ) и слюнные железы; на высоких уровнях в ротоглоточном эпителии, включая язык и миндалины; и на умеренных уровнях многие другие типы тканей и железы, включая гипофиз, яичко, легкое, мочевой пузырь, кровь, простату, поджелудочную железу, уровни в пищеварительном тракте (язык, желудок, эпителий кишечника) и поджелудочную железу. [ 8 ] Белок может быть обнаружен на апикальной стороне эпителиальных клеток и в поверхностной жидкости дыхательных путей, слизистой оболочке и мокроты. [ 9 ]

Суперсемейство

[ редактировать ]

BPIFA1 является членом суперсемейства белка сгиба BPI , определяемой присутствием бактерицидной/проницаемости белковой складки (складка BPI), которая образуется двумя схожими доменами в форме «бумеранга». [ 10 ] Эта суперсемейство также известна как семейство BPI / LBP / DACLUNC или семейство BPI / LPB / CETP . [ 11 ] Склад BPI создает аполярные карманы связывания, которые могут взаимодействовать с гидрофобными и амфипатическими молекулами, такими как ацильные углеродные цепи липополисахарида, обнаруженные на грамотрицательных бактериях , но члены этого семейства могут иметь много других функций.

BPIFA1 является членом семейства генов BPI-рамки и суперсемейства белка BPI/LBP/DAC

Гены для суперсемейства BPI/LBP/DACLER обнаружены во всех видах позвоночных, включая отдаленные гомологи у невзвешенных видов, таких как насекомые, моллюски и круглые черви. [ 12 ] [ 13 ] широкой группировки находится семейство генов BPIF, члены которых кодируют BPI структурный мотив В рамках этой сгиба в корову. Семейство генов BPIF разделено на две группы: BPIFA и BPIFB. У людей BIPFA состоит из 3 белка, кодирующих гены BPIFA1 , BPIFA2 , BPIFA3 и 1 псевдогена BPIFA4P ; В то время как BPIFB состоит из 5 белков, кодирующих гены BPIFB1 , BPIFB2 , BPIFB3 , BPIFB4 , BPIFB6 и 2 Pseudogenes BPIFB5P , BPIFB9P . То, что кажется псевдогенами у людей, может показаться как полностью функциональные гены у других видов.

У людей ген BPIFA1 был впервые идентифицирован как ортолог DACK мыши гена [ 7 ] который был ранее идентифицирован на экране дифференциального дисплея эмбрионального неба мыши . [ 14 ] Впоследствии, используя методы анализа микрочипов человеческих эпителиальных тканей, был идентифицирован ген Spropt и, отдельно, ген Splunc1 был идентифицирован. [ 15 ] [ 16 ] Все они были признаны, на самом деле, тем же геном в семье BPI/LBP/PLUNC.

BPIFA1 имеет несколько функций, но, возможно, его наиболее заметные из них связаны с локализацией BPIFA1 в носовом, обонятельном, пероральном и дыхательном эпителии и слизистой/жидкости, которые их покрывают. BPIFA1/Splunc1 связывается с высокой аффинностью и специфичностью с дипальмитоилфосфатидилхолином , одним из основных и наиболее важных фосфолипидов поверхностно -активного вещества в дыхательных путях и легких. [ 17 ] Понижая поверхностное натяжение в слизистых жидкостях, BPIFA1/SPLUNC1 ингибирует бактерии, такие как Klebsiella, пролиферируя в качестве биопленки на эпителии. [ 18 ] Белок физически взаимодействует с патогенами, вызывая «бактериальное покрытие», которое ингибирует эпителиальный натриевый канал бактерий, делает бактерии, такие как псевдомона, более проницаемыми, и привлекает макрофаги и нейтрофилы для бактерицидного эффекта. [ 19 ] [ 20 ] Таким образом, BPIFA1 играет роль в врожденной иммунной защите в дыхательных путях.

Способность BPIFA1/PACLUNC регулировать ENAC является чувствительной к pH и не удается в кислого фиброзе в дыхательных путях. [ 21 ] Таким образом, дефектная функция гена BPIFA1/PLUNC1 , как полагают, способствует развитию патологии легких у пациентов с муковисцидозом.

Он также может служить потенциальным молекулярным маркером для обнаружения микрометастаза при немелкоклеточном раке легких . [ 22 ]

  1. ^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000198183 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000027483 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  4. ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  5. ^ Гафури Б. (2003). «Протекание (небо, легкое и носовое эпителиальное клон) белки в жидкости для носа на носовом языке человека». Biochem Soc Trans . 31 (4): 810–4. doi : 10.1042/bst0310810 . PMID   12887311 .
  6. ^ «BPIFA1 BPI -складка, содержащая семейство, член 1 [Homo Sapiens (Human)] - Gene - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov .
  7. ^ Подпрыгнуть до: а беременный Bingle CD, Bingle L (октябрь 2000). «Характеристика гена графика человека, генного продукта с верхними дыхательными путями и носоглоточной схемой экспрессии». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - структура и экспрессия гена . 1493 (3): 363–7. doi : 10.1016/s0167-4781 (00) 00196-2 . PMID   11018263 .
  8. ^ «Ген: BPIFA1 - ENSG00000198183» . bgee.org . Набор BGEE: интегрированная атлас экспрессии и сравнительная транскриптомика у животных.
  9. ^ "Q9NP55 - BPIA1_HUMAN" . www.uniprot.org .
  10. ^ Бимер Л.Дж., Кэрролл С.Ф., Эйзенберг Д. (апрель 1998 г.). «Семейство белков BPI/LBP: структурный анализ консервативных областей» . Белковая наука . 7 (4): 906–914. doi : 10.1002/pro.5560070408 . PMC   2143972 . PMID   9568897 .
  11. ^ «CDD Consected Protein Domain Family: BPI» . www.ncbi.nlm.nih.gov .
  12. ^ Бимер Л.Дж., Фишер Д., Эйзенберг Д. (июль 1998 г.). «Обнаружение отдаленных родственников LPS-связывающих и липидных белков LPS-связывания млекопитающих» . Белковая наука . 7 (7): 1643–1646. doi : 10.1002/pro.5560070721 . PMC   2144061 . PMID   9684900 .
  13. ^ Bingle CD, Seal RL, Craven CJ (август 2011 г.). «Систематическая номенклатура для белков DACL/PSP/BSP30/SMGB в качестве подсемейства суперсемейства, содержащего сгибание BPI» . Биохимическое общество транзакций . 39 (4): 977–983. doi : 10.1042/bst0390977 . PMC   3196848 . PMID   21787333 .
  14. ^ Weston WM, Leclair EE, Trzyna W, McHugh LM, Nugent P, Lafferty CM, Ma LL, Tuan RS, Greene RM (май 1999). «Дифференциальная идентификация дисплея DACK, нового гена, экспрессируемого в эмбриональном небе, эпителии носа и легких взрослых» . Журнал биологической химии . 274 (19): 13698–13703. doi : 10.1074/jbc.274.19.13698 . PMID   10224143 .
  15. ^ Di YP, Harper R, Zhao Y, Pahlavan N, Finkbeiner W, Wu R (январь 2003 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика всплеска, нового гена человека, который является ретиноевой кислотой, индуцируемым и кодирует секреторный белок, специфичный в верхних дыхательных путях» . Журнал биологической химии . 278 (2): 1165–1173. doi : 10.1074/jbc.m210523200 . PMID   12409287 .
  16. ^ Zhang B, Nie X, Xiao B, Xiang J, Shen S, Gong J, et al. (Сентябрь 2003 г.). «Идентификация тканеспецифичных генов в эпителиальной ткани с носоглотом и дифференциально экспрессируемых генов при карциноме носоглотки путем подавления субтрактивной гибридизации и микрочипа кДНК». Гены, хромосомы и рак . 38 (1): 80–90. doi : 10.1002/gcc.10247 . PMID   12874788 . S2CID   24805514 .
  17. ^ Ning F, Wang C, Berry KZ, Kandasamy P, Liu H, Murphy RC, et al. (Декабрь 2014). «Структурная характеристика легочного врожденного иммунного белка Splunc1 и идентификация липидных лигандов» . Журнал FASEB . 28 (12): 5349–5360. doi : 10.1096/fj.14-259291 . PMC   4232288 . PMID   25223608 .
  18. ^ Liu Y, Bartlett JA, Di ME, Bombergerjm, Chan YR, Gakharl, et al. (Май 2013). «Splunc1/BPIFA1 способствует защите легочной хозяина от дыхательной инфекции Klebsiella pneumoniae» . Американский журнал патологии . 182 (5): 1519–1531. doi : 10.1016/j.ajpath.2013.01.050 . PMC   3644735 . PMID   23499554 .
  19. ^ Гарсия-Кабаллеро А., Расмуссен Дж., Гайярд Е., Уотсон М.Дж., Олсен Дж.С., Дональдсон Ш., Штуттс М.Дж., Тарран Р. (июль 2009). «Splunc1 регулирует объем поверхностной жидкости дыхательных путей, защищая ENAC от протеолитического расщепления» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (27): 11412–7. Bibcode : 2009pnas..10611412G . doi : 10.1073/pnas.0903609106 . PMC   2708735 . PMID   19541605 .
  20. ^ Sayeed S, Nistico L, St Croix C, Dip, et al. (Январь 2013). «Многофункциональная роль человеческого Splunc1 в инфекции Pseudomonas aeruginosa» . Инфекция и иммунитет . 81 (1): 285–291. doi : 10.1128/iai.00500-12 . PMC   3536124 . PMID   23132494 .
  21. ^ Гарленд А.Л., Уолтон В.Г., Коакли Р.Д., Тан К.Д., Гилмор Р.К., Хоббс К.А., Трипати А., Клунес Л.А., Скарит С., Штуттс М.Дж., Беттс Л., Рединбо М.Р., Тарран Р (октябрь 2013 г.). «Молекулярная основа для pH-зависимой слизистой оболочки в дыхательных путях муковисцидоза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (40): 15973–8. BIBCODE : 2013PNAS..11015973G . doi : 10.1073/pnas.1311999110 . PMC   3791714 . PMID   24043776 .
  22. ^ "Entrez Gene: DACK" .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: f0426569be713b39e8afe82f6466eb41__1711054260
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/f0/41/f0426569be713b39e8afe82f6466eb41.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
BPIFA1 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)