BPIFA1
| BPIFA1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | BPIFA1 , LUNX, NASG, Lullunc, Splunc1, Sprt, 49G10.5, BPI Fol | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Омим : 607412 ; MGI : 1338036 ; Гомологен : 7895 ; GeneCards : BPIFA1 ; OMA : BPIFA1 - ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викидид | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
BPI, содержащий семейство A, член 1 (BPIFA1), также известный как небо, легкое и клон эпителия носа (DACK), [ 5 ] является белком , который у людей кодируется геном BPIFA1 . [ 6 ] [ 7 ] Он также был известен как «секреторный белок в верхних дыхательных путях» (SPRT). Последовательность гена BPIFA1 предсказывает 4 транскрипта ( варианты сплайсинга ); 3 варианты мРНК были хорошо охарактеризованы. Полученный BPIFA1 является секретируемым белком, экспрессируемым на очень высоких уровнях в слизистой оболочке дыхательных путей (обонятельный и дыхательный и эпителий ) и слюнные железы; на высоких уровнях в ротоглоточном эпителии, включая язык и миндалины; и на умеренных уровнях многие другие типы тканей и железы, включая гипофиз, яичко, легкое, мочевой пузырь, кровь, простату, поджелудочную железу, уровни в пищеварительном тракте (язык, желудок, эпителий кишечника) и поджелудочную железу. [ 8 ] Белок может быть обнаружен на апикальной стороне эпителиальных клеток и в поверхностной жидкости дыхательных путей, слизистой оболочке и мокроты. [ 9 ]
Суперсемейство
[ редактировать ]BPIFA1 является членом суперсемейства белка сгиба BPI , определяемой присутствием бактерицидной/проницаемости белковой складки (складка BPI), которая образуется двумя схожими доменами в форме «бумеранга». [ 10 ] Эта суперсемейство также известна как семейство BPI / LBP / DACLUNC или семейство BPI / LPB / CETP . [ 11 ] Склад BPI создает аполярные карманы связывания, которые могут взаимодействовать с гидрофобными и амфипатическими молекулами, такими как ацильные углеродные цепи липополисахарида, обнаруженные на грамотрицательных бактериях , но члены этого семейства могут иметь много других функций.
Гены для суперсемейства BPI/LBP/DACLER обнаружены во всех видах позвоночных, включая отдаленные гомологи у невзвешенных видов, таких как насекомые, моллюски и круглые черви. [ 12 ] [ 13 ] широкой группировки находится семейство генов BPIF, члены которых кодируют BPI структурный мотив В рамках этой сгиба в корову. Семейство генов BPIF разделено на две группы: BPIFA и BPIFB. У людей BIPFA состоит из 3 белка, кодирующих гены BPIFA1 , BPIFA2 , BPIFA3 и 1 псевдогена BPIFA4P ; В то время как BPIFB состоит из 5 белков, кодирующих гены BPIFB1 , BPIFB2 , BPIFB3 , BPIFB4 , BPIFB6 и 2 Pseudogenes BPIFB5P , BPIFB9P . То, что кажется псевдогенами у людей, может показаться как полностью функциональные гены у других видов.
У людей ген BPIFA1 был впервые идентифицирован как ортолог DACK мыши гена [ 7 ] который был ранее идентифицирован на экране дифференциального дисплея эмбрионального неба мыши . [ 14 ] Впоследствии, используя методы анализа микрочипов человеческих эпителиальных тканей, был идентифицирован ген Spropt и, отдельно, ген Splunc1 был идентифицирован. [ 15 ] [ 16 ] Все они были признаны, на самом деле, тем же геном в семье BPI/LBP/PLUNC.
Функция
[ редактировать ]BPIFA1 имеет несколько функций, но, возможно, его наиболее заметные из них связаны с локализацией BPIFA1 в носовом, обонятельном, пероральном и дыхательном эпителии и слизистой/жидкости, которые их покрывают. BPIFA1/Splunc1 связывается с высокой аффинностью и специфичностью с дипальмитоилфосфатидилхолином , одним из основных и наиболее важных фосфолипидов поверхностно -активного вещества в дыхательных путях и легких. [ 17 ] Понижая поверхностное натяжение в слизистых жидкостях, BPIFA1/SPLUNC1 ингибирует бактерии, такие как Klebsiella, пролиферируя в качестве биопленки на эпителии. [ 18 ] Белок физически взаимодействует с патогенами, вызывая «бактериальное покрытие», которое ингибирует эпителиальный натриевый канал бактерий, делает бактерии, такие как псевдомона, более проницаемыми, и привлекает макрофаги и нейтрофилы для бактерицидного эффекта. [ 19 ] [ 20 ] Таким образом, BPIFA1 играет роль в врожденной иммунной защите в дыхательных путях.
Способность BPIFA1/PACLUNC регулировать ENAC является чувствительной к pH и не удается в кислого фиброзе в дыхательных путях. [ 21 ] Таким образом, дефектная функция гена BPIFA1/PLUNC1 , как полагают, способствует развитию патологии легких у пациентов с муковисцидозом.
Он также может служить потенциальным молекулярным маркером для обнаружения микрометастаза при немелкоклеточном раке легких . [ 22 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000198183 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000027483 - Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
- ^ Гафури Б. (2003). «Протекание (небо, легкое и носовое эпителиальное клон) белки в жидкости для носа на носовом языке человека». Biochem Soc Trans . 31 (4): 810–4. doi : 10.1042/bst0310810 . PMID 12887311 .
- ^ «BPIFA1 BPI -складка, содержащая семейство, член 1 [Homo Sapiens (Human)] - Gene - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Bingle CD, Bingle L (октябрь 2000). «Характеристика гена графика человека, генного продукта с верхними дыхательными путями и носоглоточной схемой экспрессии». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - структура и экспрессия гена . 1493 (3): 363–7. doi : 10.1016/s0167-4781 (00) 00196-2 . PMID 11018263 .
- ^ «Ген: BPIFA1 - ENSG00000198183» . bgee.org . Набор BGEE: интегрированная атлас экспрессии и сравнительная транскриптомика у животных.
- ^ "Q9NP55 - BPIA1_HUMAN" . www.uniprot.org .
- ^ Бимер Л.Дж., Кэрролл С.Ф., Эйзенберг Д. (апрель 1998 г.). «Семейство белков BPI/LBP: структурный анализ консервативных областей» . Белковая наука . 7 (4): 906–914. doi : 10.1002/pro.5560070408 . PMC 2143972 . PMID 9568897 .
- ^ «CDD Consected Protein Domain Family: BPI» . www.ncbi.nlm.nih.gov .
- ^ Бимер Л.Дж., Фишер Д., Эйзенберг Д. (июль 1998 г.). «Обнаружение отдаленных родственников LPS-связывающих и липидных белков LPS-связывания млекопитающих» . Белковая наука . 7 (7): 1643–1646. doi : 10.1002/pro.5560070721 . PMC 2144061 . PMID 9684900 .
- ^ Bingle CD, Seal RL, Craven CJ (август 2011 г.). «Систематическая номенклатура для белков DACL/PSP/BSP30/SMGB в качестве подсемейства суперсемейства, содержащего сгибание BPI» . Биохимическое общество транзакций . 39 (4): 977–983. doi : 10.1042/bst0390977 . PMC 3196848 . PMID 21787333 .
- ^ Weston WM, Leclair EE, Trzyna W, McHugh LM, Nugent P, Lafferty CM, Ma LL, Tuan RS, Greene RM (май 1999). «Дифференциальная идентификация дисплея DACK, нового гена, экспрессируемого в эмбриональном небе, эпителии носа и легких взрослых» . Журнал биологической химии . 274 (19): 13698–13703. doi : 10.1074/jbc.274.19.13698 . PMID 10224143 .
- ^ Di YP, Harper R, Zhao Y, Pahlavan N, Finkbeiner W, Wu R (январь 2003 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика всплеска, нового гена человека, который является ретиноевой кислотой, индуцируемым и кодирует секреторный белок, специфичный в верхних дыхательных путях» . Журнал биологической химии . 278 (2): 1165–1173. doi : 10.1074/jbc.m210523200 . PMID 12409287 .
- ^ Zhang B, Nie X, Xiao B, Xiang J, Shen S, Gong J, et al. (Сентябрь 2003 г.). «Идентификация тканеспецифичных генов в эпителиальной ткани с носоглотом и дифференциально экспрессируемых генов при карциноме носоглотки путем подавления субтрактивной гибридизации и микрочипа кДНК». Гены, хромосомы и рак . 38 (1): 80–90. doi : 10.1002/gcc.10247 . PMID 12874788 . S2CID 24805514 .
- ^ Ning F, Wang C, Berry KZ, Kandasamy P, Liu H, Murphy RC, et al. (Декабрь 2014). «Структурная характеристика легочного врожденного иммунного белка Splunc1 и идентификация липидных лигандов» . Журнал FASEB . 28 (12): 5349–5360. doi : 10.1096/fj.14-259291 . PMC 4232288 . PMID 25223608 .
- ^ Liu Y, Bartlett JA, Di ME, Bombergerjm, Chan YR, Gakharl, et al. (Май 2013). «Splunc1/BPIFA1 способствует защите легочной хозяина от дыхательной инфекции Klebsiella pneumoniae» . Американский журнал патологии . 182 (5): 1519–1531. doi : 10.1016/j.ajpath.2013.01.050 . PMC 3644735 . PMID 23499554 .
- ^ Гарсия-Кабаллеро А., Расмуссен Дж., Гайярд Е., Уотсон М.Дж., Олсен Дж.С., Дональдсон Ш., Штуттс М.Дж., Тарран Р. (июль 2009). «Splunc1 регулирует объем поверхностной жидкости дыхательных путей, защищая ENAC от протеолитического расщепления» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (27): 11412–7. Bibcode : 2009pnas..10611412G . doi : 10.1073/pnas.0903609106 . PMC 2708735 . PMID 19541605 .
- ^ Sayeed S, Nistico L, St Croix C, Dip, et al. (Январь 2013). «Многофункциональная роль человеческого Splunc1 в инфекции Pseudomonas aeruginosa» . Инфекция и иммунитет . 81 (1): 285–291. doi : 10.1128/iai.00500-12 . PMC 3536124 . PMID 23132494 .
- ^ Гарленд А.Л., Уолтон В.Г., Коакли Р.Д., Тан К.Д., Гилмор Р.К., Хоббс К.А., Трипати А., Клунес Л.А., Скарит С., Штуттс М.Дж., Беттс Л., Рединбо М.Р., Тарран Р (октябрь 2013 г.). «Молекулярная основа для pH-зависимой слизистой оболочки в дыхательных путях муковисцидоза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (40): 15973–8. BIBCODE : 2013PNAS..11015973G . doi : 10.1073/pnas.1311999110 . PMC 3791714 . PMID 24043776 .
- ^ "Entrez Gene: DACK" .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Гарсия-Кабаллеро А., Расмуссен Дж., Гайярд Е., Уотсон М.Дж., Олсен Дж.С., Дональдсон Ш., Штуттс М.Дж., Тарран Р. (июль 2009). «Splunc1 регулирует объем поверхностной жидкости дыхательных путей, защищая ENAC от протеолитического расщепления» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 106 (27): 11412–7. Bibcode : 2009pnas..10611412G . doi : 10.1073/pnas.0903609106 . PMC 2708735 . PMID 19541605 .
- Zhang BC, Zhu SG, Xiang JJ, Zhou M, Nie XM, Xiao Bo, Li XL, Li Gy (май 2003 г.). «[Анализ вариантов сплайсинга в NASG 3'UTR, понижаемый при карциноме носоглотки, и его экспрессия в множественных раковых тканях]». Ai Zheng = aizheng = китайский журнал рака . 22 (5): 477–80. PMID 12753706 .
- Дагл Дж. М., Лепп Н.Т., Купер М.Е., Шаа К.Л., Келси К.Дж., Орр К.Л., Капрау Д., Циммерман К.Р., Штеффен К.М., Джонсон К.Дж., Маразита М.Л., Мюррей Дж.С. (апрель 2009 г.). «Определение генетической предрасположенности к артерии патентного протока у недоношенных детей» . Педиатрия . 123 (4): 1116–23. doi : 10.1542/peds.2008-0313 . PMC 2734952 . PMID 19336370 .
- Брайборн М., Холлден С., Салл Т., Карделл Ло (февраль 2010 г.). «CLC- новый ген восприимчивости для аллергического ринита?». Аллергия . 65 (2): 220–8. doi : 10.1111/j.1398-9995.2009.02141.x . PMID 19650845 . S2CID 29636426 .
- Ченг М., Чен Ю, Ю Х, Тянь З, Вей Х (2008). «Диагностическая полезность мРНК LUNX в периферической крови и плевральной жидкости у пациентов с первичным немелкоклеточным раком легких» . BMC Рак . 8 : 156. DOI : 10.1186/1471-2407-8-156 . PMC 2424066 . PMID 18513434 .
- Zhou HD, Li GY, Yang YX, Li XL, Sheng Sr, Zhang WL, Zhao J (апрель 2006 г.). «Внутриклеточная совместная локализация белка Splunc1 с нанобактериями в клетках hne1 эпителии карциномы носоглотки зависит от бактерицидной проницаемости, увеличивающей домен белка». Молекулярная иммунология . 43 (11): 1864–71. doi : 10.1016/j.molimm.2005.10.021 . PMID 16364440 .
- Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (май 2006 г.). «Белковая сеть взаимодействия для унаследованных человеческих атаксий и расстройства дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
- Zhou HD, Fan SQ, Zhao J, Huang DH, Zhou M, Liu Hy, Zeng ZY, Yang YX, Huang H, Li XL, Shen Sr, Li Gy (март 2006 г.). «Распределение тканей секреторного белка Splunc1, у плода человека». Гистохимия и клеточная биология . 125 (3): 315–24. doi : 10.1007/s00418-005-0070-4 . PMID 16195890 . S2CID 20600762 .
- Sentani K, Oue N, Sakamoto N, Arihiro K, Aoyagi K, Sasaki H, Yasui W (апрель 2008 г.). «Профилирование экспрессии генов с помощью микрочипов и шалфея идентифицирует график как маркер гепатоидной аденокарциномы желудка» . Современная патология . 21 (4): 464–75. doi : 10.1038/modpathol.3801050 . PMID 18204429 .
- Кампос М.А., Абреу А.Р., Нленд М.К., Кобас М.А., Коннер Г.Е., Уитни П.Л. (февраль 2004 г.). «Очистка и характеристика графика от человеческих трахеобронхиальных выделений». Американский журнал респираторных клеток и молекулярной биологии . 30 (2): 184–92. doi : 10.1165/rcmb.2003-0142oc . PMID 12920053 .
- Он Y, Ding YQ, Huang ZX, Yao KT (Jun 2007). «[Ассоциация отдельных нуклеотидных полиморфизмов в кодирующей области в гене графика с носоглоточной карциномой]». Zhonghua Yi Xue Za Zhi . 87 (22): 1553–5. PMID 17785110 .
- Wang WB, Cui YG, Yao Sy (февраль 2008 г.). «[Экспрессия РНК сообщения Gesse RNA генов LUNX, CK19 и CEA в NSCLC с микрометастазисом в лимфатических узлах] Zhonghua Zhong Liu Za Zhi [китайский журнал онкологии ] 30 (2): 121–4 18646695PMID
- Bartlett JA, Hicks BJ, Schlomann JM, Ramachandran S, Nauseef WM, McCray PB (май 2008). «Парцы - это секретируемый продукт нейтрофильных гранул» . Журнал биологии лейкоцитов . 83 (5): 1201–6. doi : 10.1189/jlb.0507302 . PMID 18245229 . S2CID 19196781 .
- Zhou HD, Li XL, Li Gy, Zhou M, Liu Hy, Yang YX, Deng T, Ma J, Sheng Sr (февраль 2008 г.). «Влияние белка Splunc1 на вирус Pseudomonas aeruginosa и Epstein-Barr». Молекулярная и клеточная биохимия . 309 (1–2): 191–7. doi : 10.1007/s11010-007-9659-3 . PMID 18049866 . S2CID 23343796 .
- Bingle L, Barnes FA, Cross SS, Rassl D, Wallace WA, Campos MA, Bingle CD (2007). «Дифференциальная эпителиальная экспрессия предполагаемой врожденной иммунной молекулы Splunc1 при муковисцидозе» . Респираторные исследования . 8 (1): 79. doi : 10.1186/1465-9921-8-79 . PMC 2203987 . PMID 17988392 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Местоположение генома BPIFA1 в и BPIFA1 страница гена браузере генома UCSC .
- Печать+белок,+человек в Национальной библиотеке медицины Медицинской библиотеки США (Mesh)