✖


Jump to content

Буддийское воскресенье

Недилько «Нед» Будиса
Нед в лаборатории Берлинского технического университета в 2012 году.
Рожденный ( 1966-11-21 ) 21 ноября 1966 г. (57 лет)
Шибеник , СР Хорватия , СФР Югославия
Национальность хорватский
Альма-матер Факультет естественных наук Загребского университета
Научная карьера
Поля Биохимия , биоорганическая химия , синтетическая биология
Учреждения Технический университет Берлина , Университет Манитобы

Недилько « Нед » Будиша ( хорватский : Nediljko Budiša ; родился 21 ноября 1966 года) — хорватский биохимик, профессор и руководитель Канадской исследовательской кафедры первого уровня (CRC) химической синтетической биологии в Университете Манитобы . Будучи пионером в области инженерии генетического кода и химической синтетической биологии ( ксенобиологии ), его исследования имеют широкий спектр приложений в биотехнологии и инженерной биологии в целом. Будучи высоко междисциплинарным , он включает в себя биоорганическую и медицинскую химию , структурную биологию , биофизику и молекулярную биотехнологию , а также метаболическую и биоматериальную инженерию. Он является автором единственного учебника в своей области исследований: «Инженерия генетического кода: расширение репертуара аминокислот для конструирования новых белков». [1]

Молодость, образование и карьера

[ редактировать ]

Нед Будиса получил диплом учителя средней школы по химии и биологии в 1990 году, степень бакалавра молекулярной биологии и магистра биофизики в 1993 году в Загребском университете . Он получил докторскую степень в 1997 году в Техническом университете Мюнхена , где его руководителем диссертации был профессор Роберт Хубер . Он также учился в Мюнхенском техническом университете в 2005 году, а затем работал руководителем младшей группы («Молекулярная биотехнология»). [2] в Институте биохимии Макса Планка в Мюнхене. С 2007 по 2010 год он был членом CIPS. М в Мюнхене. [3] В 2010 году он был назначен профессором биокатализа в Берлинском техническом университете. [4] до конца 2018 года, когда он принял должность CRC уровня 1 в области химической синтетической биологии в Университете Манитобы . [5] Нед Будиса также является членом кластера передового опыта «Объединение систем в катализе» (UniSysCat). [6] и сохраняет статус адъюнкт-профессора Берлинского технического университета. В 2014 году он основал первую берлинскую iGEM . команду [7]

Исследовать

[ редактировать ]

Нед Будиса применяет метод селективного давления (SPI). [8] что позволяет одиночное и множественное [9] включение in vivo синтетических (т.е. неканонических) аналогов аминокислот в белки, предпочтительно путем переназначения смысловых кодонов . [10] Его методология позволяет проводить тонкие химические манипуляции с боковыми цепями аминокислот, в основном пролина , триптофана и метионина . Эти эксперименты часто сопровождаются простой метаболической инженерией. [11] [12] Целью исследования Неда является передача различных физико-химических свойств и биоортогональных химических реакций (хемоселективное лигирование, такое как клик-химия ), а также особых спектроскопических особенностей (например, синего [13] и золотой [14] перенос энергии флуоресценции или вибрации [15] ) в белки живых клеток. Кроме того, его метод позволяет внести специфические свойства элементов ( фтора , селена и теллура ). в биохимию жизни [16]

Нед Будиса хорошо известен благодаря использованию селенсодержащих неканонических аминокислот для рентгеновской кристаллографии белков. [17] и фторсодержащие аналоги для ЯМР-спектроскопии 19F и исследований сворачивания белков. [18] Он был первым, кто продемонстрировал использование инженерии генетического кода в качестве инструмента для создания терапевтических белков. [19] и рибосомально синтезированные пептиды-лекарства. [20] Он добился успеха в разработке инновационных биоматериалов , в частности, фотоактивируемых подводных клеев на основе мидий . [21] Нед Будиса внес важный вклад в наше понимание роли окисления метионина в прионных белков. агрегации [22] и обнаружил роль пролина конформаций боковой цепи ( эндо-экзоизомерия ) в трансляции , сворачивании и стабильности белков. [23] [24]

Вместе со своим коллегой Владимиром Кубышкиным новый в природе гидрофобник [25] полипролина-II спиральный фолдамер Разработан . Наряду с предыдущей работой Будисы по биоэкспрессии с использованием аналогов пролина, результаты этого проекта способствовали созданию гипотезы Аланинового мира . [26] Это объясняет, почему природа выбрала генетический код [27] с «всего» 20 каноническими аминокислотами для синтеза рибосомального белка. [28]

В 2015 году команда под руководством Неда Будиса сообщила об успешном завершении долгосрочного эволюционного эксперимента, который привел к полной замене всех 20 899 остатков триптофана на тиенопиррол-аланин в генетическом коде бактерии Escherichia coli . [29] Это прочная основа для эволюции жизни с использованием альтернативных строительных блоков, фолдамеров или биохимии . [30] В то же время этот подход может стать интересной технологией биобезопасности для создания биосодержащих синтетических клеток. [31] оснащены «генетическим брандмауэром», который предотвращает их выживание за пределами искусственно созданной неестественной среды. [32] Подобные эксперименты с фторированными триптофана аналогами [33] в качестве ксенобиотических соединений (в сотрудничестве с Беате Кокш из Свободного университета Берлина ) привело к открытию исключительной физиологической пластичности микробных культур в ходе адаптивной лабораторной эволюции , что делает их потенциальными экологически чистыми инструментами для новых биоремедиации стратегий .

Нед Будиса также активно участвует в дебатах о возможных социальных, этических и философских последствиях радикальной инженерии генетического кода в контексте синтетических клеток и жизни , а также технологий, полученных на их основе. [34]

Награды и звания (выборка)

[ редактировать ]
  • 2004: Премия БиоБудущего [35]
  • 2017: Премия за публикацию по химии фтора [36]

См. также

[ редактировать ]

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Будиса, Недилько (2005). Книга в онлайн-библиотеке Wiley . дои : 10.1002/3527607188 . ISBN  9783527312436 .
  2. ^ «Молекулярная биотехнология» . Институт Макса Планка. Архивировано из оригинала 10 июня 2007 года . Проверено 10 августа 2017 г.
  3. ^ «Список ЦИПС М профессоров» . Проверено 10 августа 2017 года .
  4. ^ «Сайт группы Биокатализ» . Проверено 10 августа 2017 г.
  5. ^ «Университет Манитобы приветствует Неда Будису» . 16 октября 2018 г. Проверено 17 августа 2019 г.
  6. ^ «Кластер передового опыта UniSysCat» . Проверено 17 августа 2019 г.
  7. ^ «Команда iGEM Берлин» . Проверено 10 августа 2017 г.
  8. ^ Будиса, Н. (2004). «Пролегомены к будущим усилиям по инженерии генетического кода путем расширения репертуара аминокислот». Angewandte Chemie, международное издание . 43 : 3387–3428. doi : 10.1002/anie.20030064 (неактивен 31 января 2024 г.). {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на январь 2024 г. ( ссылка )
  9. ^ Лептиен, С.; Меркель, Л.; Будиса, Н. (2010). «Двойное и тройное мечение белков in vivo с использованием синтетических аминокислот». Angewandte Chemie, международное издание . 49 (32): 5446–5450. дои : 10.1002/anie.201000439 . ПМИД   20575122 .
  10. ^ Болке, Н.; Будиса, Н. (2014). «Освобождение смысловых кодонов для включения неканонических аминокислот по всему протеому: редкий изолейциновый кодон AUA как мишень для расширения генетического кода» . Письма FEMS по микробиологии . 351 (2): 133–44. дои : 10.1111/1574-6968.12371 . ПМК   4237120 . ПМИД   24433543 . S2CID   5735708 .
  11. ^ Фёллер, Ж.-С.; Будиса, Н. (2017). «Сочетание расширения генетического кода и метаболической инженерии синтетических клеток». Современное мнение в области биотехнологии . 48 : 1–7. дои : 10.1016/j.copbio.2017.02.002 . ПМИД   28237511 .
  12. ^ Экснер, член парламента; Куэнцль, С.; Швагерус, С.; К, Т.; Оуян, З.; Хёсл, МГ; Ленсен, MC; Хакенбергер, КНР; Панке, С.; Будиса, Н. (2017). «Разработка системы производства и внедрения S-аллилцистеина in situ на основе нового варианта пирролизил-тРНК-синтетазы». ХимБиоХим . 18 (1): 85–90. дои : 10.1002/cbic.201600537 . ПМИД   27862817 . S2CID   23006925 .
  13. ^ Лептиен, С.; Хёсл, МГ; Меркель, Л.; Будиса, Н. (2008). «Азатриптофаны наделяют белки собственной синей флуоресценцией» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 105 (42): 16095–16100. Бибкод : 2008PNAS..10516095L . дои : 10.1073/pnas.0802804105 . ПМК   2571030 . ПМИД   18854410 .
  14. ^ Бэ, Дж.; Рубини, М.; Юнг, Г.; Виганд, Г.; Зайферт, MHJ; Азим, МК; Ким, Дж.С.; Зумбуш, А.; Холак, Т.А.; Мородер, Л.; Хубер, Р.; Будиса, Н. (2003). «Расширение генетического кода позволяет создать новый «золотой» класс зеленых флуоресцентных белков» . Журнал молекулярной биологии . 328 (5): 977–1202. дои : 10.1016/s0022-2836(03)00364-4 . ПМИД   12729742 .
  15. ^ Бауманн, Т.; Хауф, М.; Шильдхауэр, Ф.; Эберл, К.; Дуркин, премьер-министр; Дениз, Э.; Леффлер, Дж.Г.; Асеведо-Роча, CG; Ярич, Дж.; Мартинс, Б.М.; Доббек, Х.; Бреденбек, Дж.; Будиса, Н. (2019). «Наблюдение на месте передачи колебательной энергии с использованием генетически закодированного сверхбыстрого нагревателя». Angewandte Chemie, международное издание . 58 (9): 2527–2903. дои : 10.1002/anie.201812995 . ПМИД   30589180 . S2CID   58584644 .
  16. ^ Агостини, Ф.; Фёллер, Дж.С.; Кокш, Б.; Асеведо-Роча, CG; Кубышкин В.; Будиса, Н. (2017). «Биокатализ неприродными аминокислотами: энзимология встречается с ксенобиологией». Angewandte Chemie, международное издание . 56 (33): 9680–9703. дои : 10.1002/anie.201610129 . ПМИД   28085996 .
  17. ^ Будиса, Н.; Стейпе, Б.; Деманж, П.; Экерскорн, К.; Келлерманн, Дж.; Хубер, Р. (1995). «Высокоуровневое биосинтетическое замещение метионина в белках его аналогами 2-аминогексановой кислотой, селенометионином, теллурометионином и этионином в Escherichia coli». Евро. Дж. Биохим . 230 (2): 788–796. дои : 10.1111/j.1432-1033.1995.0788h.x . ПМИД   7607253 .
  18. ^ Зайферт, Миннесота; Ксязек, Д.; Смеловский, П.; Азим, МК; Будиса, Н.; Холак, Т.А. (2002). «Медленные конформационные процессы обмена в вариантах зеленых флуоресцентных белков, подтвержденные данными ЯМР-спектроскопии». Дж. Ам. хим. Соц . 124 (27): 7932–7942. дои : 10.1021/ja0257725 . ПМИД   12095337 .
  19. ^ Будиса, Н.; Минкс, К.; Медрано, Ф.Дж.; Лутц, Дж.; Хубер, Р.; Мородер, Л. (1998). «Остаточно-специфическое биоинкорпорирование неприродных биологически активных аминокислот в белки как возможные носители лекарств. Структура и стабильность мутанта пертиапролина или аннексина V» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 95 (2): 455–459. дои : 10.1073/pnas.95.2.455 . ЧВК   18441 . ПМИД   9435213 .
  20. ^ Будиса, Н. (2013). «Расширенный генетический код для создания рибосомально синтезированных [ sic ] и посттрансляционно модифицированных пептидных натуральных продуктов (RiPP)». Современное мнение в области биотехнологии . 24 (4): 591–598. дои : 10.1016/j.copbio.2013.02.026 . ПМИД   23537814 .
  21. ^ Хауф, М.; Рихтер, Ф.; Шнайдер, Т.; Файдт, Т.; Мартинс, Б.М.; Бауманн, Т.; Дуркин, П.; Доббек, Х.; Джейкобс, К.; Моеглич, А.; Будиса, Н. (2017). «Фотоактивируемые подводные адгезивные белки на основе мидий с расширенным генетическим кодом». ХимБиоХим . 18 (18): 1819–1823. дои : 10.1002/cbic.201700327 . ПМИД   28650092 . S2CID   4919816 .
  22. ^ Вольшнер, К.; Гизе, А.; Кречмар, Х.; Хубер, Р.; Мородер, Л.; Будиса, Н. (2009). «Разработка вариантов анти- и проагрегации для оценки эффектов окисления метионина в прионном белке человека» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 106 (19): 7756–7761. Бибкод : 2009PNAS..106.7756W . дои : 10.1073/pnas.0902688106 . ПМК   2674404 . ПМИД   19416900 .
  23. ^ Штайнер, Т.; Хесс, П.; Бэ, Дж. Х.; Мородер, Л.; Будиса, Н. (2008). «Синтетическая биология белков: настройка сворачивания и стабильности GFP с помощью фторпролина» . ПЛОС ОДИН . 3 (2): e1680. Бибкод : 2008PLoSO...3.1680S . дои : 10.1371/journal.pone.0001680 . ПМК   2243022 . ПМИД   18301757 . S2CID   10089602 .
  24. ^ Дорфель, ЛК; Вольгемут, И.; Кубышкин В.; Староста, Алабама; Уилсон, Д.Н.; Будиса, Н. (2015). «Энтропийный вклад фактора элонгации P в позиционирование пролина в каталитическом центре рибосомы». Дж. Ам. хим. Соц . 137 (40): 12997–13006. дои : 10.1021/jacs.5b07427 . hdl : 11858/00-001M-0000-0028-E3C7-1 . ПМИД   26384033 .
  25. ^ Кубышкин В.; Грейдж, СЛ; Бюрк, Дж.; Ульрих, А.С.; Будиса, Н. (2018). «Трансмембранная полипролиновая спираль». Дж. Физ. хим. Летт . 9 (9): 2170–2174. doi : 10.1021/acs.jpclett.8b00829 . ПМИД   29638132 .
  26. ^ Кубышкин В.; Будиса, Н. (2019). «Ожидание инопланетных клеток с альтернативными генетическими кодами: прочь от мира аланина!» . Современное мнение в области биотехнологии . 60 : 242–249. дои : 10.1016/j.copbio.2019.05.006 . ПМИД   31279217 . S2CID   195820138 .
  27. ^ Кубышкин В.; Асеведо-Роча, CG; Будиса, Н. (2017). «Об универсальных кодирующих событиях в биогенезе белков» . Биосистемы . 164 : 16–25. doi : 10.1016/j.biosystems.2017.10.004 . ПМИД   29030023 .
  28. ^ Кубышкин В.; Будиса, Н. (2019). «Мировая модель аланина для развития репертуара аминокислот в биосинтезе белка» . Межд. Дж. Мол. Наука . 20 (21): 5507. doi : 10.3390/ijms20215507 . ПМК   6862034 . ПМИД   31694194 . S2CID   207936069 .
  29. ^ Хёсл, МГ; Оем, С.; Дуркин, П.; Дармон, Э.; Пейл, Л.; Аэрни, Х.-Р.; Раппсилбер, Дж .; Райнхарт, Дж.; Лич, Д.; Зёлль, Д.; Будиса, Н. (2015). «Химическая эволюция бактериального протеома» . Angewandte Chemie, международное издание . 54 (34): 10030–10034. дои : 10.1002/anie.201502868 . ПМЦ   4782924 . ПМИД   26136259 . НИХМСИД: NIHMS711205
  30. ^ Кубышкин В.; Будиса, Н. (2017). «Синтетическое отчуждение микробных организмов с помощью инженерии генетического кода: почему и как?». Биотехнологический журнал . 12 (8): 1600097. doi : 10.1002/biot.201600097 . ПМИД   28671771 .
  31. ^ Диво, К.; Будиса, Н. (2019). «Альтернативная биохимия инопланетной жизни: основные концепции и требования для создания надежной системы биосдерживания в условиях генетической изоляции» . Гены . 10 (1): 17. doi : 10.3390/genes10010017 . ПМК   6356944 . ПМИД   30597824 . S2CID   58570773 .
  32. ^ Асеведо-Роча, CG; Будиса, Н. (2011). «На пути к химически модифицированным организмам, наделенным генетической защитой». Angewandte Chemie, международное издание . 50 (31): 6960–6962. дои : 10.1002/anie.201103010 . ПМИД   21710510 .
  33. ^ Агостини, Ф.; Синн, Л.; Пятрас, Д.; Шипп, CJ; Кубышикин, В; Бергер, А.А.; Доррестейн, ПК; Раппсилбер, Дж.; Будиса, Н.; Кокш, Б. (2019). «Лабораторная эволюция Escherichia coli обеспечивает жизнь, основанную на фторированных аминокислотах». bioRxiv   10.1101/665950 .
  34. ^ Шмидт, М.; Пей, Л.; Будиса, Н. (2018). Ксенобиология: современное состояние, этика и философия новых для природы организмов . Том. 162. С. 301–315. дои : 10.1007/10_2016_14 . ISBN  978-3-319-55317-7 . ISSN   0724-6145 . ПМИД   28567486 . {{cite book}}: |journal= игнорируется ( помогите )
  35. ^ «Профиль премии BioFuture Award» . Архивировано из оригинала 30 июня 2007 года . Проверено 10 августа 2017 г.
  36. ^ «UniCat – Премия за публикацию в области химии фтора» . Проверено 16 октября 2017 г.
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Nediljko_Budisa&oldid=1228918918"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 0015a9b35be2bab0dc8fd45da3320ef5__1718308200
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/00/f5/0015a9b35be2bab0dc8fd45da3320ef5.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Nediljko Budisa - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)