Онтология RXNO
Онтология RXNO — это формальная онтология химических реакций с именами . [1] [2] Первоначально он был разработан в Королевском химическом обществе (RSC) и связан с Open Biomedical Ontologies Foundry . Онтология RXNO объединяет несколько предыдущих попыток систематизировать химические реакции, включая индекс Мерка и иерархию Кэри, Лаффана, Томсона и Уильямса. [3] [4]
Основные категории реакций
[ редактировать ]Двенадцать категорий реакций верхнего уровня, предложенные Кэри, Лаффаном, Томпсоном и Уильямсом, приведены в таблице ниже вместе с их онтологическими идентификаторами RXNO и эквивалентными категориями Википедии, где это применимо. [3]
| Индекс | Категория реакции | идентификатор RXNO | Категория Википедии |
|---|---|---|---|
| 1 | Гетероатомное алкилирование и арилирование | Категория: Реакции образования связи углерод-гетероатом | |
| 2 | Ацилирование и родственные процессы | ||
| 3 | Образование углерод-углеродной связи | RXNO: 0000002 | Категория: Реакции образования углерод-углеродных связей |
| 4 | Реакции образования гетероциклов | RXNO: 0000349 | Категория: Реакции образования гетероциклов |
| 5 | Защитные реакции | RXNO: 0000078 | |
| 6 | Реакции снятия защиты | RXNO: 0000203 | |
| 7 | Скидки | Категория: Реакции органического восстановления | |
| 8 | Окисления | Категория: Реакции органического окисления | |
| 9 | Взаимное преобразование функциональных групп (FGI) | RXNO: 0000011 | Категория: Реакции замещения |
| 10 | Добавление функциональных групп (FGA) | ||
| 11 | Реакции разрешения | ||
| 12 | Разнообразный | Категория:Органические реакции |
Имя Реакции
[ редактировать ]В следующей таблице перечислены идентификаторы RXNO для некоторых примеров реакций на имя .
- RXNO:0000003 Реакция Перкина
- RNXO:0000006 Реакция Дильса-Альдера
- RXNO:0000014 Реакция Гриньяра
- RXNO:0000015 Реакция Виттига
- RXNO:0000021 Реакция Сандмейера
- RXNO:0000024 Чертова реакция
- RXNO:0000026 Перегруппировка Бекмана
- RXNO:0000028 Перестановка копера
- RXNO:0000031 Окисление Байера-Виллигера
- RXNO:0000042 Уменьшение березы
- RXNO:0000043 Конденсат Клайзена
- RXNO:0000056 Реакция Хорнера-Уодсворта-Эммонса
- RXNO:0000062 Реакция Скраупа
- RXNO:0000064 Синтез индола Фишера
- RXNO:0000074 Реакция Вюрца
- RXNO:0000081 Конденсат Ульмана
- RXNO:0000084 Реакция Барбье
- RXNO:0000088 Муфта Негиши
- RXNO:0000090 Синтез эфира Вильямсона
- RXNO:0000098 Муфта Глазера
- RXNO:0000103 Синтез Габриэля
- RXNO:0000106 Реакция Хунсдикера
- RXNO:0000140 Реакция Сузуки
- RXNO:0000147 Деградация Эмде
- RXNO:0000148 Перегруппировка Клайзена
- RXNO:0000156 Разгрузочное заднее расположение
- RXNO:0000157 Реакция Нефа
- RXNO:0000183 Реакция Перкова
- RXNO:0000193 Муфта Хияма
- RXNO:0000210 Окисление Флеминга-Тамао
- RXNO:0000218 Реакция Канниццаро
- RXNO:0000288 Реакция Розенмунда – фон Брауна
- RXNO:0000369 Реакция Фриделя-Крафтса
- RXNO:0000444 Перестановка картофеля фри
- RXNO:0000550 Окисление Коллинза
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Шнайдер, Надин; Лоу, Дэниел; Сэйл, Роджер; Тарселли, Майкл; Ландрам, Грегори (2016). «Большие данные из фармацевтических патентов: вычислительный анализ хлеба с маслом медицинских химиков». Дж. Мед. хим. 59 (9): 4385–4402. doi : 10.1021/acs.jmedchem.6b00153 . ПМИД 27028220 .
- ^ Шнайдер, Надин; Лоу, Дэниел; Сэйл, Роджер; Ландрам, Грегори (январь 2015 г.). «Разработка нового метода химических реакций и его применение для классификации и подобия крупномасштабных реакций». Журнал химической информации и моделирования . 55 (1): 39–53. дои : 10.1021/ci5006614 . ПМИД 25541888 .
- ^ Jump up to: а б Кэри, Дж. С.; Лаффан, Д; Томсон, К; Уильямс, Монтана (май 2006 г.). «Анализ реакций, используемых для получения молекул-кандидатов в лекарственные средства». Органическая и биомолекулярная химия . 4 (12): 2337–2347. дои : 10.1039/B602413K . ПМИД 16763676 .
- ^ Раули, Стивен Д.; Джордан, Аллан М. (май 2011 г.). «Набор инструментов фармацевта: анализ реакций, используемых при поиске кандидатов на лекарства». Журнал медицинской химии . 54 (10): 3451–79. дои : 10.1021/jm200187y . ПМИД 21504168 .