Рибозивирус
| Колмиовирусиды | |
|---|---|
 | |
| Схема дельтавируса вириона | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибозивирус |
| Семья: | Колмиовирусиды |
| Подтаксоны | |
Рибозивирия — это царство сателлитных вирусы нуклеиновых кислот — инфекционных агентов, которые напоминают , но не могут реплицироваться без вируса-помощника . [1] Область , созданная в ICTV TaxoProp 2020.012D, названа в честь присутствия геномных и антигеномных рибозимов типа дельтавируса . Агенты рибозивирии представляют собой сателлитные нуклеиновые кислоты , которые отличаются от сателлитных вирусов тем, что они не кодируют все свои собственные структурные белки, а для сборки требуют белков из своих вирусов-помощников. [2] Дополнительные общие черты включают палочковидную структуру, РНК-связывающий «дельта-антиген», закодированный в геноме, и животных-хозяев. [3] Кроме того, диапазон размеров геномов этих вирусов составляет около 1547–1735 нт, они кодируют рибозим «головка молотка» или рибозим вируса гепатита дельта , а их кодирующая способность включает только один консервативный белок. Большинство линий этой области плохо изучены, заметным исключением является род Deltavirus , включающий возбудителей гепатита D у человека. [4]
Царство рибозивирий имеет неясное эволюционное происхождение. Было высказано предположение, что они могли произойти от ретрозимов (семейства ретротранспозонов ) или виродоподобных элементов (т.е. вироидов и сателлитов ) с захватом капсидного белка. [4] [5]
Таксономия
[ редактировать ]Историческое развитие
[ редактировать ]Первыми таксонами этой области, получившими признание ICTV, стал вид Hepatitis deltavirus и его род Deltavirus в 1993 году. Дельтавирус оставался неотнесенным к какому-либо более высокому таксону до 2018 года, когда ICTV ошибочно классифицировал дельтавирус в недавно созданной области Riboviria . . В 2019 году эту ошибку исправили и Дельтавирус вернулся в исходное положение. В 2020 году вирус гепатита дельта был упразднен и заменен восемью новыми видами, а таксономия была развита до нынешней формы, подробно описанной ниже. [6]
Текущий статус
[ редактировать ]Рибозивирия содержит одно семейство Kolmioviridae , без промежуточных таксонов между царством и семейством. Это семейство включает восемь родов.
Названия всех родов в этом царстве отсылают к букве D. в разных языках Фамилия происходит от финского kolmio «треугольник», еще одной отсылки к греческой букве «Δ» (дельта). [3]
Эта таксономия показана ниже: [1]
- Область: Рибозивирия
- Семейство: Колмиовирусиды.
- Род: Daazvirus (из готского алфавита ).
- Виды: Daazvirus cynopis [вирус китайского огнебрюшного тритона 1 (CFBNV-1), ранее amHDV] (хозяин: Cynops orientalis ) [7]
- Род: Дагазвирус (из Старшего Футарка ).
- Виды: Dagazvirus schedorhinotermitis [ринотермитидный вирус 1 (RTV-1), rHDV] (хозяин: Schedorhinotermes intermedius ). [7]
- Род: Daletvirus (от еврейского алфавита ).
- Вид: Daletvirus boae [вирус 1 колонии швейцарских змей (SwSCV-1), ранее sHDV] (хозяин: Boa constrictor , Liasis mackloti savuensis ) [8]
- Род: Dalvirus (от арабского алфавита ).
- Виды: Dalvirus anatis [вирус ревущей утки 1 (DabDV-1), ранее avHDV] (хозяин: Anas gracilis , A. castanea , A. superciliosa ) [9]
- Род: Deevirus (от английского алфавита )
- Виды: Deevirus actinopterygii [вирус лучепёрых рыб 1 (RFFV-1), ранее fHDV] (хозяин: различные виды Actinopterygii ). [7]
- Род: Дельтавирус. [1] (из греческого алфавита )
- Вид: Deltaviruscameroonense [вирус гепатита дельта человека 7 (HDV-7)] (хозяин: Homo sapiens ).
- Виды: Deltavirus carense [вирус гепатита дельта человека 6 (HDV-6)] (хозяин: H. sapiens ).
- Виды: Deltavirus italiense [вирус гепатита дельта человека 1 (HDV-1)] (хозяин: H. sapiens ).
- Виды: Deltavirus japanense [вирус гепатита дельта человека 2 (HDV-2)] (хозяин: H. sapiens ).
- Виды: Deltavirus peruense [вирус гепатита дельта человека 3 (HDV-3)] (хозяин: H. sapiens ).
- Виды: Deltavirus senegalense [вирус гепатита дельта человека 8 (HDV-8)] (хозяин: H. sapiens ).
- Виды: Deltavirus taiwanense [вирус гепатита дельта человека 4 (HDV-4)] (хозяин: H. sapiens ).
- Виды: Deltavirus togense [вирус гепатита дельта человека 5 (HDV-5)] (хозяин: H. sapiens ).
- Род: Добровирус (из ранней кириллицы ).
- Виды: Dobrovirus bufonis [вирус жабы острова Чусан 1 (CITV-1), ранее tfHDV] (хозяин: Bufo gargarizans ). [7]
- Род: Thurisazvirus (из Старшего Футарка ).
- Виды: Thurisazvirus myis [вирус колючей крысы Тома 1 (TSRV-1), ранее RDev] (хозяин: Proechimys semispinosus ) [10]
- Род: Daazvirus (из готского алфавита ).
- Семейство: Колмиовирусиды.
См. также
[ редактировать ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 10 мая 2021 г.
- ^ Баэз Дж . «Субклеточные формы жизни» . Калифорнийский университет, Риверсайд . Проверено 4 июня 2020 г.
- ^ Jump up to: а б Хепойоки Дж., Хетцель У., Параскевопулу С., Дростен С., Харрах Б., Зербини М., Кунин Е.В., Крупович М., Доля В., Кун Дж.Х. (6 декабря 2020 г.). «Создать одно новое царство ( Ribozyviria ), включающее одно новое семейство ( Kolmioviridae ), включающее род Deltavirus и семь новых родов, всего 15 видов» (docx) . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . Проверено 27 мая 2021 г.
- ^ Jump up to: а б Ли Б.Д., Кунин Е.В. (12 января 2022 г.). «Вироиды и вироидоподобные кольцевые РНК: происходят ли они от первичных репликаторов?» . Жизнь . 12 (1): 103. Бибкод : 2022Life...12..103L . дои : 10.3390/life12010103 . ISSN 2075-1729 . ПМЦ 8781251 . ПМИД 35054497 .
- ^ Неттер Х.Дж., Барриос М.Х., Литтлджон М., Юэнь Л.К. (2021). «Дельта-вирус гепатита (HDV) и дельта-подобные агенты: понимание их происхождения» . Границы микробиологии . 12 : 1448. дои : 10.3389/fmicb.2021.652962 . ISSN 1664-302X . ПМЦ 8256844 . ПМИД 34234753 .
- ^ «История таксономии – Таксономия – ICTV» . talk.ictvonline.org . Проверено 8 октября 2021 г.
- ^ Jump up to: а б с д Чанг В.С., Петтерссон Дж.Х., Ле Лэй С., Ши М., Ло Н., Вилле М., Иден Дж.С., Холмс Э.К. (июль 2019 г.). «Новые агенты, подобные гепатиту D, у позвоночных и беспозвоночных» . Эволюция вирусов . 5 (2): vez021. дои : 10.1093/ve/vez021 . ПМК 6628682 . ПМИД 31321078 .
- ^ Хетцель У, Шировича Л, Смура Т, Прахаузер Б, Вапалахти О, Кипар А, Хепойоки Дж (апрель 2019 г.). «Идентификация нового дельтавируса у удавов» . мБио . 10 (2). дои : 10.1128/mBio.00014-19 . ПМК 6445931 . ПМИД 30940697 .
- ^ Вилле М., Неттер Х.Дж., Литтлджон М., Юэнь Л., Ши М., Иден Дж.С., Клаассен М., Холмс Э.К., Хёрт AC (декабрь 2018 г.). «Дивергентный агент, подобный гепатиту D, у птиц» . Вирусы . 10 (12): 720. дои : 10.3390/v10120720 . ПМК 6315422 . ПМИД 30562970 .
- ^ Параскевопулу С., Пирцер Ф., Гольдманн Н., Шмид Дж., Корман В.М., Готтула Л.Т., Шредер С., Раше А., Мут Д., Дрекслер Дж.Ф., Хени А.С., Эйбнер Г.Дж., Пейдж Р.А., Джонс Т.К., Мюллер М.А., Зоммер С., Глебе Д. , Дростен С. (июль 2020 г.). «Дельтавирус млекопитающих без коинфекции гепаднавирусом у неотропических грызунов Proechimys semispinosus » . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (30): 17977–17983. Бибкод : 2020PNAS..11717977P . дои : 10.1073/pnas.2006750117 . ПМЦ 7395443 . ПМИД 32651267 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]
- Уорд CW (1993). «Прогресс к более высокой систематике вирусов» . Исследования в области вирусологии . 144 (6): 419–53. дои : 10.1016/S0923-2516(06)80059-2 . ПМЦ 7135741 . ПМИД 8140287 .