Фосфокетолаза
| Фосфокетолаза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 4.1.2.9 | ||
| Номер CAS. | 9031-75-8 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
Фермент фосфокетолаза 4.1.2.9 ( КФ . ) катализирует химические реакции
- D-ксилулозо-5-фосфат + фосфат ацетилфосфат + D-глицеральдегид-3-фосфат + H 2 O ( EC 4.1.2.9 ) [1]
- D-фруктозо-6-фосфат + фосфат ацетилфосфат + D-эритрозо-4-фосфат + H 2 O ( КФ 4.1.2.22 ) [2]
- D-седогептулозо-7-фосфат + фосфат ацетилфосфат + D-рибозо-5-фосфат + H 2 O [3]
Фосфокетолаза считается беспорядочным ферментом, поскольку было продемонстрировано, что она использует в качестве субстратов три различных сахарофосфата . В недавнем генетическом исследовании более 150 предполагаемых генов фосфокетолазы, проявляющих различные каталитические свойства, были обнаружены в 650 проанализированных бактериальных геномах. [4]
Этот фермент принадлежит к семейству лиаз , в частности альдегидлиаз, которые расщепляют углерод-углеродные связи. Он участвует в трех метаболических путях : пентозофосфатном пути , метаболизме метана и фиксации углерода . В нем используется один кофактор – дифосфат тиамина . Фосфокетолаза ранее использовалась в биотехнологических целях. [5] [6] [7] поскольку это позволяет создавать синтетические пути, которые позволяют полностью сохранить углерод без выработки восстанавливающей энергии . [8]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Гленн, Кэти; Смит, Керри С. (20 января 2015 г.). «Аллостерическая регуляция ксилулозо-5-фосфата/фруктозо-6-фосфатфосфокетолазы Lactobacillus plantarum (Xfp)» . Журнал бактериологии . 197 (7): 1157–1163. дои : 10.1128/jb.02380-14 . ISSN 0021-9193 . ПМЦ 4352667 . ПМИД 25605308 .
- ^ Ракер, Е. (1962), [29d] Фруктозо-6-фосфатфосфокетолаза из Acetobacter xylinum , Methods in Enzymology, vol. 5, Elsevier, стр. 276–280, doi : 10.1016/s0076-6879(62)05219-2 , ISBN. 9780121818050
- ^ Круземанн, Ян Л.; Линднер, Стеффен Н.; Демпфл, Мэриан; Видмер, Джулиан; Арриво, Стефани; Дебакер, морской пехотинец; Он, Хай; Кубис, Армин; Чайо, Ромен (2018). «Появление искусственных путей в центральном метаболизме в результате трех рекурсивных реакций фосфокетолазы» . Журнал ФЭБС . 285 (23): 4367–4377. дои : 10.1111/февраль 14682 . ISSN 1742-4658 . ПМИД 30347514 .
- ^ Санчес, Борха; Суньига, Мануэль; Гонсалес-Канделас, Фернандо; де лос Рейес-Гавилан, Клара Г.; Маргольес, Абелардо (2010). «Бактериальные и эукариотические фосфокетолазы: филогения, распространение и эволюция». Журнал молекулярной микробиологии и биотехнологии . 18 (1): 37–51. дои : 10.1159/000274310 . ISSN 1464-1801 . ПМИД 20068356 .
- ^ Зондереггер, М.; Шумперли, М.; Зауэр, У. (1 мая 2004 г.). «Метаболическая инженерия фосфокетолазного пути катаболизма пентоз у Saccharomyces cerevisiae» . Прикладная и экологическая микробиология . 70 (5): 2892–2897. Бибкод : 2004ApEnM..70.2892S . дои : 10.1128/aem.70.5.2892-2897.2004 . ISSN 0099-2240 . ПМК 404438 . ПМИД 15128548 .
- ^ Анфельт, Жозефина; Качмажик, Данута; Шабестары, Киян; Ренберг, Медведь; Рокберг, Джон; Нильсен, Йенс; Улен, Матиас; Хадсон, Элтон П. (16 октября 2015 г.). «Генетическая и питательная модуляция уровня ацетил-КоА у Synechocystis для производства н-бутанола» . Заводы по производству микробных клеток . 14 (1):167.doi : 10.1186 /s12934-015-0355-9 . ISSN 1475-2859 . ПМК 4609045 . ПМИД 26474754 .
- ^ Медоуз, Адам Л.; Хокинс, Кристи М.; Цегайе, Йозеф; Антипов, Евгений; Ким, Ённюн; Раец, Лорен; Даль, Роберт Х.; Тай, Анна; Махатдейкул-Медоуз, Тина (сентябрь 2016 г.). «Переписывание центрального углеродного метаболизма дрожжей для промышленного производства изопреноидов». Природа . 537 (7622): 694–697. Бибкод : 2016Natur.537..694M . дои : 10.1038/nature19769 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 27654918 .
- ^ Богорад, Игорь В.; Линь, Цзы-Шян; Ляо, Джеймс К. (29 сентября 2013 г.). «Синтетический неокислительный гликолиз обеспечивает полное сохранение углерода». Природа . 502 (7473): 693–697. Бибкод : 2013Natur.502..693B . дои : 10.1038/nature12575 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 24077099 .
- ХИТ ЕС, ГУРВИЦ Дж., ХОРЕКЕР Б.Л., ГИНЗБУРГ А. (1958). «Ферментация пентозы Lactobacillus plantarum. I. Расщепление ксилулозо-5-фосфата фосфокетолазой» . Ж. Биол. Хим . 231 (2): 1009–29. дои : 10.1016/S0021-9258(18)70463-8 . ПМИД 13539033 .
- Шрамм М., Клибас В., Рэкер Э. (1958). «Фосфолитическое расщепление фруктозо-6-фосфата фруктозо-6-фосфатфосфокетолазой из Acetobacter xylinum» . Ж. Биол. Хим . 233 (6): 1283–1288. дои : 10.1016/S0021-9258(18)49327-1 . ПМИД 13610828 .
